2DZUA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (d110n) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVNGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 93
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzuA00
1RD5A 1GYNA 1WQ5A 1GVSA 1P4CA 5BNKA 1KFEA 4UFIA 3TR2A 4JIPA 4OT7A 3PBUA 2V2DA 5DBUA 4BWLA 4OV9A 2PCQA 1K03A 4M19A 3TQVA 5DLCA 1G4SA 1M7PA 3VE7A 1T96A 4RXGA 4C1LA 3HG4A 3LCLA 4M7SA 3LCWA 5C5YA 2WOQA 2PRLA 8TIMA 1QPRA 1F73A 1P0KA 3CQ0A 3S8HA 1MEWA 2C18A 3O63A 1GYLA 3HPSA 1YLVA 1LLZA 2ALDA 4XBSA 4HIBA 4CQ9A 3IIZA 2QKFA 3QM3A 1X1OA 2BXVA 3RFAA 1EWEA 5HINA 3U2OA 1VJIA 1OG0A 3QJAA 3W7KA 1DQWA 4WJEA 4UCGA 1KW1A 4MLJA 4PL1A 2QCGA 3TAKA 4K8HA 5CSRA 5FF4A 2H8XA 3WK3A 4ZQOA 3TC6A 4QAIA 2EAWA 3DI1A 1O5KA 1Q6LA 3OBKA 1CI1A 1Z44A 1TMHA 5LHEA 4LNYA 2PE4A 3CU2A 3NOEA 2ISSA 3W88A 4AF0A 2DJXA 1SW3A 3NPXA 5EYWA 4Y8FA 3SFKA 1ICPA 2OZ0A 4HNNA 1LOQA 4I7VA 3WJSA 1LM1A 4AWTA 4O17A 5LKYA 1XBXA 4WY0F 1KFJA 1ML1A 4LC6A 1DJQA 1BTMA 3LTPA 3MYOA 4ZL1A 3STGA 5L9FA 5HR6A 5LNWA 1FCBA 3Q58A 1G4PA 4LWWA 5F2GA 3QMTA 4Q33A 4XBKA 4FXRA 4IXXA 1OABA 5IM51 2Y7EA 4LC8A 1F74A 3VNDA 3S0CA 3KFTA 1LBLA 3IVSA 3PR2A 3W6YA 5AN7A 4FNQA 3IIPA 3C4UA 1T99A 3W7DA 1L6SA 2Z6IA 3P67A 2G95A 3OVPA 2A7RA 1GVOA 3TMQA 5ABTA 3LLDA 1XUZA 3G8EA 3TC7A 1W54A 5DXXA 3W71A 1G67A 1YXDA 3W84A 1XXXA 3GK0A 4NJHA 3NEVA 2V2CA 3QF0A 2GJLA 1H7WA 1GOXA 4UMBA 2VC6A 4BFAA 1GTEA 5HUPA 2E1DA 5G1YA 5SWUA 1EUAA 1XUUA 3L65A 1SZNA 4CCEA 4AXKA 5FF7A 3A9IA 2YCEA 1G7VA 1VYSX 3RNDA 2NXIA 2NWRA 2WJZA 3S6DA 2Q8LA 5U4NA 1JR1A 1W5QA 4HNUA 2ZA1A 1SU5A 2QCCA 4X22A 2Y7FA 3FYPA 1Z42A 1OFBA 1AL7A 2XN1A 1AMKA 3QYQA 4DF0A 3KVMA 3M7WA 3LV5A 1EB3A 4GUFA 5LNUA 2ATSA 2ZRUA 1DJNA 4K39A 3WK1A 1VHNA 3P80A 5K9CA 4UNKA 1OJXA 3NL5A 3FOKA 1XL9A 3BG3A 1L2UA 4A21A 3G1AA 1H7PA 3DXIA 2A6NA 3FJLA 4YL2A 1RPXA 2Y85A 3LTYA 3UWQA 2J9XA 1H7OA 2X30A 2Y7GA 1ZNNA 1QNVA 2QUTA 3QEZA 3C6CA 2NV2A 1XFBA 3EWBX 4HN4A 3MUXA 4UMAA 3W1RA 3BVJA 5FF3A 1ALDA 5DCDA 2ZZ1A 1Q6RA 2CLEA 2VFIA 1KBJA 3QZEA 3G0SA 5AYZA 3DENA 4FX6M 2HS8A 3QRHA 3UPWA 3LV6A 2KZHA 1LRQA 4RLIA 1OHLA 4TMCA 2GQAA 1LCOA 3EEGA 3MP3A 4JTHA 3BARA 3KX6A 4PC8A 4WY0A 1ZJIA 2HTMA 3N3MA 1FWNA 3KRZA 5AYYA 4FXSA 4FNPA 1VLIA 1VRDA 1YPIA 3HGJA 3GR7A 4JTTA 1ZENA 3FFSA 2IQTA 3N9RA 1Q6QA 3TJXA 2PRHA 4UNLA 3CHVA 4MKNA 4O1AA 3QMSA 5CKSA 4YCOA 3HGRA 2Z2UA 3QSTA 1L9WA 4BI6A 3KOFA 2DZXA 3BPWA 4QSHA 2VXNA 3B0VC 3UWYA 4O10A 1VCVA 4RKAA 5KSWA 1LROA 3SGZA 3NQGA 3T7VA 5AFDA 4UTKA 3MI2A 2GVGA 5U7SA 4LUJA 4TMBA 3G24A 3NM3A 4AMAA 3EX4A 1IGSA 3NZ1A 2QCNA 3W7RA 4H6KA 3G3DA 3C2VA 1XBZA 3KXQA 3W2KA 2ISVA 4JTKA 2RDTA 1A50A 5K2ZA 3NPWA 4W9TA 1TJRA 2RHGA 1SSDA 2A21A 1HFBA 3P82A 2NUXA 3W23A 2R14A 3S5OA 1JUBA 2HMCA 1EUNA 1KFKA 4WXYA 2BX7A 2E6FA 2NWSA 1I2RA 1PE1A 1RR2A 4DPPA 1JCLA 2Q8ZA 3PULA 3CB8A 5F4WA 1L6YA 3IIOA 3OA3A 4N4PA 5K3VA 3NYZA 1K8ZA 4U4MA 5LGZA 5FEPA 3L2IA 3Q2DA 3TH6A 2X16A 2CLFA 4JYDA 5K9DA 4IUOA 3S1VA 4DXVA 4RXFA 4HPJA 5T26A 3CIXA 4UTHA 3SI9A 1A53A 2XN0A 4CCCA 4FEZA 1SO6A 4RZ5A 3GDTA 3MI6A 4OBTA 2Y6ZA 5H91A 3TJLA 1NVMA 4JY9A 4CQ8A 3TFXA 2QAFA 5DELA 1H51A 5IBXA 4E38A 4UTLA 4UTJA 2AGKA 5CPMA 1QR7A 1KA9F 3LRLA 5C2XA 3C0JA 3CTLA 3O06A 4Y96A 1AW5A 3B0UX 3JR2A 2RFGA 2ZZ3A 1YTEA 2QDGA 2VFDA 4J9JA 5L6UA 3O07A 3TW6A 2AQWA 4X2RA 5AHIA 1OFDA 3ELFA 3MI3A 4KWWA 3T55A 1NF7A 5F1UA 4DF1A 2QUVA 5AHLA 4DEFA 1PV8A 5G2WA 1ZAHA 3G1DA 2DP3A 3LHUA 3VI2A 5AC6A 4ONVA 1FWSA 3DFQA 1YTDA 5TQLA 2V81A 3I6RA 4Y9AA 4ALDA 3TIMA 4O8RA 3PF3A 5I3JA 4BF9A 4JXCA 3WK2A 2C0AA 4BR1A 1LYXA 4HNTA 4R7JA 2PC4A 2V82A 1Q45A 2QCDA 3QQ1A 3MYPA 3NL2A 1FUYA 4RV8A 4XZ9A 4CQAA 1FWTA 1Z48A 3NNTA 2WNNA 3EX3A 4UUIA 5HMSA 5DCBA 1O94A 1C29A 5F2LA 1KV5A 1I45A 3H54A 4OGZA 2CLOA 2PURA 5HWMA 4JN6A 3TSMA 1X6UA 3UXDA 5KMYA 1KM5A 1NFBA 3NQ2A 1IXPA 3N19B 4RX0A 2H6RA 4NZFA 1A5SA 1PHWA 3CLMA 2JGYA 2YDAA 1U5JA 1W0MA 3G1VA 4AF0B 5FF0A 1OX6A 4ZQPA 2E5DA 4GJ1A 3NPUA 4UFJA 4CLMA 2JKPA 5EKYA 3ABRA 5D32A 1WBHA 1H7XA 1OK6A 3BG5A 3GB6A 1T0OA 4OV4A 5CZJA 5FEXA 1OF8A 4Z0SA 1JCJA 1SO4A 4GRSA 3I68A 3W7LA 3C52A 4DBDA 1DV7A 4N2YA 3HG2A 5D2WA 1IXOA 3HOJA 3C2FA 4O28A 1PCKA 2B7PA 3EXRA 2WSQA 2YYUA 4KFPA 3DFNA 1FDJA 3W1TA 5D37A 3IV3A 2VOMA 3GAYA 3W7NA 1LOSA 1XBVA 5DBTA 1V7YA 1IIHA 1MO0A 1QAPA 2V0TA 4N9EA 3EXSA 2DZPA 1ZHAA 1O5XA 3N73A 4MFDA 4FIQA 3WFAA 4K38A 4MY8A 3E0IA 3MP4A 4PH6A 3DZ1A 1PVNA 4BWLC 3GR8A 4TO8A 5KZEA 1X1ZA 4JTGA 3UZ5A 4O14A 3FKRA 1DVJA 1KFBA 3LBCA 2ABAA 3KVKA 1GWJA 4JYEA 1K3UA 4Z1AA 1QMLA 3HPXA 3MHGA 4Y6GA 1G6CA 3WJYA 4K7VA 3CT7A 1WX0A 2QCFA 2QCHA 5EL1A 2D73A 2ZTKA 3Q37A 3HMJG 3LM7A 1ICQA 1DKWA 3DAQA 4AEOA 2NX3A 2WNZA 2P0OA 5DN1A 1XC4A 2FPYA 1ME7A 4A3UA 3LX9A 4FNRA 4FNTA 1LLWA 3N14A 1N55A 3T4CA 3MMTA 1UASA 3R8RA 3LCFA 3W85A 3W2MA 3OVRA 4ORMA 1VQTA 2WKJA 3LGEA 4P2VA 1W37A 1OX4A 5AHFA 5AB3A 2I14A 2VFEA 4NXKA 4ZQMA 3NQFA 5D2XA 2FB2A 4GWEA 4EF9A 5AOUA 4CCDA 4O1BA 2PRMA 3DHFA 2YYTA 4TX9A 3W1PA 2YZRA 4JICA 3M47A 3P60A 1M5WA 3W9ZA 3NA8A 1XM3A 2FPVA 3V75A 4XUGA 3THQA 3VKJA 3NZRA 4HSOA 1W3NA 4UFKA 2X1TA 3DFOA 3FKKA 2CW6A 1BWLA 4WD0A 2CZ5A 1VS1A 1OYAA 3HGOA 4RK8A 2BZNA 3CIWA 2ISWA 3ZS4A 3TK7A 5FEZA 3PG9A 3TE9A 3EX2A 1TTJA 1THFD 3T40A 4KFNA 4WY0B 4UTIA 1Q6OA 1TTIA 4JDBA 5K4ZA 1J4EA 2A6LA 3LXAA 3S1XA 1GTHA 3TXZA 3L5MA 4ADUA 5F1VA 1EX5A 4JY8A 5CZSA 4HSNA 1XDLA 2WQPA 2DORA 2FTPA 4AWSA 3NVTA 4FF7A 1N7KA 3STCA 1G4TA 1AG1O 1QPQA 2ZBTA 3NR0A 5C54A 2VEIA 1OK4A 2B7QA 2A85A 4FHAA 5K7JA 3NM1A 1TO3A 1T8XA 2A2IA 1M7OA 5D02A 4L4MA 5D05A 1FXPA 5AHMA 5E1QA 3F4WA 4GFSA 3GKAA 2FFCA 2JKEA 4NZJA 3GDRA 3ABOA 4M7TA 5EA9A 3NQCA 4WZHA 3GVGA 3W7IA 1JRBA 4CNNA 1Y0EA 1H61A 1HUVA 4N6FA 4UXDA 2E77A 2ZZ2A 3IGSA 2DZTA 4OE7A 1QCWA 2I1OA 4MZYA 3QQ0A 1RQBA 3C61A 3L66A 4JYFA 4IX2A 3BG9A 3P7YA 1JCXA 1I2QA 4K6AA 3IVTA 3MWAA 1JCNA 4DO4A 2LLEA 4WQ6A 5C55A 1OYCA 5D2TA 3CWNA 1R46A 5C6MA 4ADTA 4FX8A 4K36A 5K9XA 1GZGA 4IOTA 1KM1A 2DZWA 4WXZA 3WJWA 5FESA 1KM2A 1WAUA 3LERA 4IGHA 2A1YA 3GAKA 3LRKA 1C9DA 4OHQA 3L0KA 2ZYFA 1TQXA 2BLEA 2ABBA 3EXTA 5HR7A 1B9BA 1KFCA 2EGZA 3NQDA 1R2RA 4QNWA 2BWGA 2R94A 3LLFA 1LBMA 2YR1A 3TROA 3L5AA 2EKCA 3K30A 1CX9A 4S2BA 1VH7A 2YFOA 3BV4A 4JTEA 3FEMA 2W0UA 2CFFA 2VELA 3WK0A 4UR8A 1OYBA 1YDOA 3IIXA 4R33A 3LCIA 4LU0A 4TU1A 2V30A 1JULA 3TX9A 1GVQA 2JK2A 1TYGA 3E12A 4LVAA 3DFTA 5KZDA 2VKZG 4O19A 4O13A 5BW6A 2A5HA 3M16A 3B04A 1J5TA 4ZQCA 3HGSA 2HSAA 4MJMA 3S1UA 1UUOA 1UBSA 1OFQA 2QCDB 1S5VA 4RZ4A 2C6QA 1ONRA 4N02A 3EX6A 3R89A 1FWWA 4JTJA 1H5YA 1YPFA 1F76A 1W1ZA 3W7JA 3E02A 2J6XA 3W75A 3HF3A 1YDVA 4EVZA 5GVJA 3ATZA 1RQHA 3VCRA 2DU2A 4PODA 2YX0A 2C13A 4UMCA 1QO5A 3NQMA 3HG5A 3M6YA 3W2UA 4IQLA 3ZFHA 3RK8A 4N6EA 1SW7A 4NT0A 3W7OA 4JTLA 1LOLA 2G5WA 4BI5A 3B8DA 4ZQNA 3NG3A 2YPIA 5F2IA 3T44A 3W70A 1TPUA 2ZA3A 3CEPA 4M6PA 2P1FA 3UWZA 2AAMA 5TIMA 1FXQA 4HKPA 5CZTA 1WV2A 2V8ZA 2TYSA 2ZZ7A 4U28A 1EWDA 4ZZ9A 4JX4A 2E6DA 3W1QA 4LV9A 1SR9A 4E0CA 1QO2A 5A8GA 3HJZA 5E0KA 2ZTJA 3O8AA 1SSGA 4UTMA 3M5VA 1I2PA 3BGJA 3I7SA 2EHHA 1KM4A 1YTKA 1QFEA 1WDWA 3GNNA 3USBA 1S3HA 2V5LA 3DI0A 1ZY9A 3UD6A 3M41A 4KFOA 2C14A 4NJGA 4AB4A 1KLYA 3OEXA 5IBXC 3UXAA 5DXYA 3BW4A 2NUWA 5BMWA 1TRDA 3DH7A 3GX9A 1W3IA 5J5RA 5KTLA 4EIVA 1VR6A 1BWKA 1TSIA 2GQ8A 3EB2A 1LP6A 3I65A 3Q94A 1FCVA 3LTSA 1I2OA 2GJNA 2CLHA 1VCGA 3PSVA 1JQXA 4RR4A 2O7QA 2WSRA 3E49A 2GOUA 2NZLA 3DHDA 4IJBA 3P5YA 3W1LA 1H7NA 3TV8A 2ZA2A 1TPFA 3ANYA 3IVUA 1OX5A 1KTNA 4NJIA 3UQNA 4Z0JA 4M5PA 6TIMA 5D04C 3DKJA 2C15A 4IWWA 4O16A 2CWNA 3QH2A 3W22A 3W7GA 2FQIA 1OX4B 4OWGA 1Z41A 4AVFA 1UJPA 1ZCOA 3O6YX 2FPTA 3O15A 3LI1A 3SGUA 4IPJA 3BW2A 3N34A 2CLKA 4EF8A 1SZGA 4DF2A 4DO6A 4JGDA 3KHJA 3B0PA 3YPIA 4UC5A 3A21A 4FB7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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