2DZUA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (d110n) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVNGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 93
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzuA00
3HBLA 4LVGA 3NR0A 5D2TA 4FNTA 1X1OA 3KOFA 4JEQA 4ZQMA 3G3DA 3W1XA 1W54A 4DF0A 2DZTA 3LXCA 1W5NA 3NVTA 3P8JA 1J5TA 1AK5A 2VKZG 3TKFA 4FX6M 1LLZA 2X30A 3MP4A 3EWWA 3PR2A 4JTJA 5HMSA 5I3HA 1IXOA 4M5PA 3JRKA 1PHWA 3ATYA 3BG5A 4RCXA 4QJ1A 3DFQA 3TJXA 4QISA 4AHQA 2OMAA 1Z48A 3KRZA 1BEUA 3KVKA 2AQWA 1O5XA 1QPQA 1KTBA 4IXXA 1WV2A 3C2RA 2KZHA 1FWTA 3TC7A 1F73A 3TXVA 1VHCA 1RZMA 4IMDA 3TA6A 1B3OA 3LBMA 2BTMA 1QO5A 4JTGA 4LOCA 1AL8A 3Q2DA 3CM4A 4FNQA 5CZSA 4E2BA 3SI9A 3MHGA 5IM51 3C56A 5F2LA 3JS3A 3R2GA 3P5YA 4Q4KA 3TR2A 4LUIA 3HGSA 3BG3A 4BR1A 1KTNA 2RDUA 4AVFA 2CZFA 3N14A 4DO6A 2PURA 3W1RA 3IIOA 4K6AA 3NQCA 3SIZA 2ZTKA 2BZNA 3UD6A 3EX2A 2FPYA 4K37A 1JR1A 1KFLA 1QMLA 1K8ZA 5FEWA 4O52A 4MIMA 2A7PA 4UR8A 4RLIA 4QIUA 1LRTA 4AMAA 1U5JA 5K3VA 1H7OA 2PRMA 2D73A 4HIBA 3EWUA 3G24A 1A53A 5EKYA 4X3ZA 3WK1A 1IIGA 3O07A 1DHPA 5AOUA 4O1BA 3FIGA 4GUFA 4GFSA 1SFJA 1KM0A 3T55A 3H53A 3W2NA 1X7FA 2QCCA 2RKXA 1KTCA 4IX2A 5C5YA 5G1TA 2A4AA 3R12A 4K7VA 1YTEA 4UMAA 1KM5A 1EIXA 1RPXA 2NUWA 4WXYA 1YYAA 3NEVA 1WOBA 3LCXA 3IVUA 5D04C 4LNYA 5AYYA 3W84A 5HR6A 4NNCA 4IXHA 2ATMA 1XBVA 3OVPA 1LM1A 1KLZA 4MPQA 1FWSA 3NG3A 2Y7DA 4LW7A 1Y0EA 2JKPA 4TIMA 3C3NA 1KW1A 3QPZA 3W1QA 1ME8A 1R47A 3EWBX 4U28A 2E6DA 3VE9A 1GJPA 3HPSA 4FIQA 2BLEA 4JD4A 3W7GA 3W7RA 3N9SA 3UZJA 4RX0A 1FXPA 4YCPA 3KAOA 4ZQNA 3PBWA 2WKJA 3WFAA 4S1FA 4B5NA 4A2RA 3QQ0A 1I45A 1XDLA 3A22A 3W1NA 4BWLA 3TX9A 4NQ1A 4XTDA 2ZDRA 4O1CA 4RV8A 3UWZA 2RH9A 1N7KA 3G1AA 1D3HA 4LT9A 4YL2A 3NQFA 2FQIA 5F4SA 2WPBA 5A8GA 4AWSA 1ML1A 1K02A 3OBKA 2XN1A 4WY0F 1SZFA 1EX5A 2P0OA 5F2MA 2PRLA 4FX8A 2ZA2A 2C13A 4I7UA 3TV8A 2V2HA 1DJQA 1DL3A 1F6KA 4K36A 1C29A 4MLJA 3PG8A 4O12A 3IGXA 1IXQA 1W5OA 4O0KA 1VJIA 3P81A 5EPDA 3TCEA 2FB3A 4EIVA 1PV8A 3EX3A 5F4WA 3TQKA 3MI6A 1VHNA 3S1VA 3O1NA 6TIMA 4IMFA 4GJ1A 3M43A 3N73A 3M1ZA 3PSWA 2W0UA 1ADOA 2VXNA 1SW3A 2V81A 2YW4A 4KFPA 3NGJA 3C8FA 1V7YA 3LLFA 3W7JA 4O16A 3BLFA 2C3ZA 3PULA 4JTHA 3GR8A 3TUUA 3I7RA 3LBCA 1HUVA 3DZ1A 2H8ZA 1NEYA 4ADTA 2PCQA 1PE1A 1A50A 3T40A 3W7LA 2ZQ0A 3R89A 3SSJA 1O94A 3G18A 4DF1A 3EWZA 1BTMA 3GK0A 4NXKA 3WJWA 5HUPA 2Z6JA 4OT7A 2CWNA 1S5VA 2OT1A 3KX6A 4JIPA 3GNDA 2V8ZA 1EB3A 3OG3A 1MEHA 3CWOX 3W7NA 1HO4A 3BW2A 1TREA 1VPXA 4FIRA 1H63A 1H5YA 4IQLA 5K4ZA 1HTIA 1B4EA 1I2PA 3B0VC 2WV8A 3NQ7A 4NUWA 3PS7A 1PCKA 2QCDA 2ZTJA 3QMSA 5FI8A 1PHQA 2DJLA 1L9WA 5D32A 3GVGA 2QUTA 3W74A 5KMYA 3VKJA 3EWYA 3PB2A 3U8GA 1DORA 4JIQA 1QNVA 2ISVA 4ZQPA 2QDGA 1ZHAA 2YPIA 2O7QA 2CW6A 2FFCA 1W37A 3I68A 1L6YA 3BGJA 1KFJA 3WJXA 4O17A 3QW3A 3QJAA 3G1HA 3RLVA 3M7WA 3O15A 3ABOA 1SSGA 5D2VA 4RXFA 4FX7A 1XCFA 3MYOA 1SFLA 2YSWA 5E93A 3ZS4A 4ML9A 4XQ6A 4GC4A 3LLDA 2QDHA 2P1FA 4NJIA 4AF0B 2A7NA 3EXRA 1Z44A 4ZL1A 1FCBA 1FQ0A 4QQ3A 3FJ6A 1WXJA 3GXNA 5HULA 3CWNA 3B8DA 1J4EA 3LCFA 1TRDA 2QCFA 4NZJA 3W2JA 1R2RA 3P67A 4UTKA 1IXNA 3WK0A 4MJMA 4HSNA 1TJPA 2CLOA 5D38A 3IGUA 5KZDA 4G1KA 3UPBA 3FKRA 1BWLA 2Z1BA 2YGYA 3FYOA 3QZEA 1E51A 2H8XA 3NL6A 3E9AA 5BMWA 1VCFA 4TMCA 1ZAIA 4O18A 4POCA 1SZNA 2EGZA 1H51A 3NQVA 3C2EA 2ABBA 4UFMA 2ZRUA 1TPEA 2QCHA 4N4PA 3G8RA 5CPLA 4PL2A 2A5HA 1GT8A 1Z42A 1AMKA 3G1FA 2VFGA 2QJGA 1OVDA 4R34A 1JUKA 2BX7A 1IF2A 4NZFA 2I14A 3GDLA 1OFBA 1YADA 3CU2A 4WD0A 3D0CA 5GVJA 5AHFA 3G1SA 4C1LA 3MJYA 3LTSA 3W1MA 4UFHA 3DBPA 3C6CA 3PBVA 3UZ5A 5K7JA 3H55A 2P10A 1W0MA 4PC8A 1FY6A 5D30A 4HNNA 3SECA 1H7NA 1XDMA 4LVFA 1Q45A 1LDCA 3PF3A 1WBJA 2Q3OA 3PM6A 3QW4B 2C1HA 5LGZA 3W23A 2A2IA 1QO2A 3K30A 2GOUA 3PBUA 1KBIA 3LHYA 3SGZA 4O4VA 2EPHA 3RU6A 2X1TA 2V9DA 2E68A 3G0SA 5T26A 3LV6A 3TAKA 2ZRXA 1VYPX 3HF3A 5F2IA 3VI2A 4XKYA 4JTSA 1TTPA 2NXIA 1C8VA 1X6UA 2E5DA 2O7SA 1Q6QA 4FO4A 5TIMA 1FXQA 4IWWA 4DPQA 4O1DA 1EUAA 2JGQA 2YYUA 4N9BA 1WDWA 4MY1A 1K3UA 4HT3A 4JX4A 3DXIA 2E09A 4N6FA 3TU9A 3NNTA 2QEZA 5U4NA 4JDBA 4NJHA 3ABSA 1PVNA 1F76A 3T7VA 4XTIA 5EYWA 2CLLA 2JKAA 3A21A 1WA3A 5AC8A 1JUEA 1SO3A 1T8XA 3IIZA 3PC0A 4JTIA 4JNMA 1DVJA 2YDAA 5LNRA 1G7UA 4XUGA 3W9ZA 3KFTA 3TSBA 3NQ2A 4DBEA 2CZDA 4M7TA 3VE7A 3B0UX 1K03A 1QPNA 3A24A 1GVOA 1KFBA 1TPDA 1FBAA 2H6RA 3NPVA 3BGGA 2CU0A 5D05A 1GVFA 2B0MA 4ORIA 5I3KA 1OFAA 4ZMGA 3AJXA 4FB7A 2Q8ZA 3QPYA 2GJNA 1OFOA 3MUXA 2YX0A 2A6LA 1B57A 2CLHA 4AH7A 4UXDA 3W2LA 2Y89A 5D2XA 3N19B 3W7KA 1H7RA 2C15A 3ZWTA 2C14A 1D9EA 3W86A 3QC3A 4Z1CA 1QOQA 2ZZ4A 1PIIA 1WOAA 3RK8A 2V2CA 1OJXA 1W3IA 1TMHA 1VCGA 3HO8A 5H2ZA 1GG0A 2IQTA 1SSDA 2DJXA 2VOMA 3TMQA 1WAUA 1EWEA 1JCLA 4YWIA 2VEIA 5C2XA 4LVDA 3NQMA 4MZ8A 3CT7A 2GVJA 3S1UA 4FNSA 4CCCA 4O28A 5DCDA 1FX6A 1KM4A 3O16A 3LCHA 1H7PA 3HG4A 3N2MA 5CKSA 1SO6A 3P74A 4JTUA 4YCOA 4MYAA 2CLFA 4UTJA 4W9TA 4DEFA 1UBSA 3G1XA 4XBSA 3VFLA 2X16A 3PY2A 3UWQA 4JY9A 3IIXA 4NJKA 1L6SA 2RFGA 2ISWA 3BPWA 3EKLA 3M5ZA 3WK3A 5DBTA 4O13A 4CNOA 2J24A 3P62A 2TYSA 3MI3A 4I9AA 5CZ0A 1ZCOA 1H50A 4CQ9A 1I2OA 4FNRA 3LB0A 3EX4A 4YXGA 1O4UA 2B7PA 3CPRA 1R46A 4R53A 3RF9A 5G2WA 1ME9A 5AFDA 4ZQOA 3DI0A 3IRDA 4JS3A 5G5IA 5DBUA 1OK4A 1VS1A 4LTSA 2RHGA 4ZQCA 3SY5A 4R33A 4IMEA 5K2ZA 4QAIA 4OHQA 3HQ1A 4PA8A 3NM3A 1JULA 4UTUA 3IV3A 1EPXA 3CHVA 5F4XA 1LOLA 2WOQA 5I3JA 1YDNA 2QCDB 2RDTA 2X1RA 4QNEA 3PBYA 1KV8A 5LKYA 2VELA 3LDVA 4JGDA 3TE9A 3TSMA 1MXSA 5CSSA 1D3GA 1LRQA 2VFEA 2XN2A 5HUOA 3OVQA 2H90A 4O1AA 1SR9A 2E5BA 4OGZA 4S2BA 3GZ3A 1RR2A 3B05A 3EX6A 3SFKA 4H6KA 1TV5A 1PS9A 3P84A 3JR2A 2ZCGA 1PCWA 4E2DA 3NA8A 2A85A 4O14A 1TV8A 3EEGA 1K7FA 3I6RA 1LBLA 3KRUA 5AYZA 2G96A 4OV9A 3I7SA 3DGRA 3UWWA 4EF9A 1IGSA 1GVRA 4O11A 3FA5A 4BI6A 1YTKA 1XBXA 4KWWA 1OFQA 4O19A 3PB0A 5FF7A 1X8FA 1GG1A 4GUHA 1NVMA 4IPIA 4J9JA 3P61A 4YMZA 2ZRZA 3W7MA 4DO5A 1FCQA 4NX5A 1KA9F 4A3UA 3ABQA 1NAL1 1JCXA 3EXTA 4K8EA 3NO5A 7TIMA 4WX2A 1OYBA 2VFFA 5K9CA 4A21A 4IMCA 3LGEA 3Q37A 4UCGA 2ZZ6A 3V1PA 1AW5A 1VCVA 4H4IA 2WQPA 2NV2A 3DI1A 1P4CA 1GVSA 4UR7A 3S5OA 5A5WA 4EOUA 1H61A 2YXGA 4PCFA 4Q33A 2GQAA 4I7WA 4RZ5A 4CNPA 1O5KA 5LSMA 1JVNA 1RQBA 2Y62A 4E0CA 2A21A 3PG9A 3W3OA 3LHUA 1FCVA 3NQAA 1MSSA 3G3MA 2G97A 1F5ZA 1OABA 3N34A 1I8JA 3W7CA 3QF0A 4K39A 1TRIA 1OFEA 3USBA 3GIYA 3P7YA 1ZAHA 1OG0A 1DQWA 1OYCA 1KFEA 1DOSA 1L6WA 5G2IA 2GVGA 4JY8A 3IVSA 1BWKA 3W7QA 3S8HA 3R8RA 1Q3NA 3L0GA 3HG2A 3QH2A 4CCEA 3DAQA 1P0NA 1UASA 3UWYA 3TXZA 1XBZA 2QUUA 3TAOA 3NPWA 3TFCA 1XC4A 3W1TA 2VFDA 3FYPA 5HNRA 4HPJA 2ZRVA 3LRLA 1GPWA 3G1VA 4LV4A 1W3NA 3E49A 1I4NA 2HMCA 4KKXA 1YDOA 1GZGA 1SZEA 2YZRA 4DQWA 4M7SA 3O06A 3PAJA 1HL2A 4N9DA 1EP1A 4FHAA 4MZ1A 1W5MA 3KVMA 4HN4A 1W3TA 2B7QA 1OX5A 1LRNA 3LTPA 3C2FA 4XKYB 2E77A 4FEZA 1JCNA 1LBFA 3PWAA 5KZEA 2V30A 3INPA 4PTNA 1LOQA 3I65A 1U83A 3PSVA 3SZ8A 3F4WA 4Y6GA 1HO1A 3NZ1A 4MZYA 2ZFAA 4LC6A 3LCLA 5EL1A 2DORA 4O0ZA 4OE7A 5I3IA 3N3MA 1NF7A 1W5QA 2UV8G 4IUOA 4UTWC 1OK6A 3TK7A 5D37A 1TO3A 3KRSA 1XFBA 3FOKA 4AWTA 2J9YA 5HWNA 5DLCA 1UUOA 3BV4A 3LRMA 1MEIA 5AB3A 1QPRA 2WSRA 5LNUA 1F7BA 4LWWA 4M19A 3DKJA 3W7DA 1SO5A 2YR1A 2ZZ2A 3DH7A 1EP2A 1Q6OA 1M6JA 2DZUA 3L0NA 4LUJA 2GUUA 2ZZ1A 3BLEA 3L65A 4JYEA 2CZEA 1QCWA 2F7FA 3DFNA 2JK2A 4DELA 5C6MA 1JCMP 1ICQA 5IBXC 2J9XA 5D2WA 2ZA1A 3E02A 3L0KA 1KFCA 4N9EA 3S1XA 4WOZA 3W2UA 2J9ZA 1ALDA 3C2VA 1WYIA 1LBMA 4BK9A 1VYRA 5F1VA 1YLVA 3MO7A 3M6YA 3C61A 4H3DA 3HG5A 3B03A 3LOTA 3FJLA 3W6YA 3ZWSA 2OZ0A 1LYXA 4O15A 4IPJA 4Y9AA 4M6PA 3MP3A 3QMTA 1DJNA 1G7VA 5TQLA 3A23A 1H1ZA 4NJGA 4CCDA 1JUBA 3BG9A 4PFMA 4BF9A 5DN1A 4PODA 2Y63A 5H91A 3MW7A 1LROA 1SZGA 3T4CA 1KLYA 3LI0A 1JRCA 3TC6A 1T0OA 1CI1A 4E38A 1F05A 5KZMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3QHN A;  4LBR A;  4FNT A;  3KOF A;  4ZOC A;  5KZ6 A;  3BAY A;  4I9T A;  5LXX A;  4DF0 A;  3IK2 A;  5DML A;  3MDU A;  4UR9 A;  3B0X A;  3AHY A;  4P7L A;  3P8J A;  3ANU A;  3M07 A;  3TKF A;  1R7A A;  2PBO A;  5AYB A;  2WZE A;  4JTJ A;  5I3H A;  4M5P A;  2J62 A;  3JRK A;  4MB5 A;  4QG6 A;  2D3L A;  2FHF A;  2PDQ A;  4AXN A;  1HNY A;  3KBV A;  3VGD A;  2AQW A;  4IXX A;  1CEN A;  4W5U A;  2QYG A;  1C8Q A;  3E38 A;  1VHC A;  4I9M A;  3VPL A;  3VNL A;  2R24 A;  2BTM A;  1QO5 A;  1WDR A;  4QGC A;  1NOU A;  5E0F A;  5C7V A;  3C56 A;  5F2L A;  1RHC A;  3R2G A;  1RBL A;  2X05 A;  4BR1 A;  3NSM A;  4GX8 A;  3N14 A;  1T8Q A;  2PUR A;  3AXM A;  3W1R A;  3IIO A;  3BAW A;  3SIZ A;  5HPO A;  1J12 A;  2XFF A;  1IHI A;  4HYV A;  3UD6 A;  2O9T A;  2QVH A;  1JR1 A;  2OQH A;  3KL0 A;  3R11 A;  3WQF A;  3DFY A;  3TTY A;  1B3Z A;  4US5 D;  3G24 A;  4AWE A;  1A53 A;  5EKY A;  2TOD A;  3O07 A;  1DHP A;  4P8U A;  1MQR A;  5AOU A;  2OYK A;  1F3W A;  5MF5 A;  4GVI A;  3S47 A;  1JPK A;  4GIN A;  2ASH A;  3T55 A;  3H53 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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