2DZWA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (e244a) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVDGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEALLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 91
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzwA00
3E96A 4R34A 3TFCA 3GDTA 1BWKA 1OYBA 5CKSA 5A5WA 3KRZA 5CGQA 2A85A 2BLEA 1XI3A 2PRLA 2FDSA 2J24A 1XL9A 1VHNA 5ABTA 1KA9F 5J5RA 3FLUA 4A21A 2A6LA 3UPBA 1X6UA 3CQ0A 2B4GA 1TYGA 2V81A 6TIMA 3GNNA 1PVNA 4O54A 3P8JA 4N02A 2HS6A 3SW6A 3NPVA 3TMQA 2C19A 2WNQA 3PSVA 2Z0IA 1JCJA 1ZAIA 3IV3A 1OFEA 3GX9A 4MJZA 1NF7A 1EUAA 5LGZA 1YTKA 4NNBA 4AWUA 1FWRA 5AB3A 4O4WA 5I3JA 4N4PA 3MI6A 4JR5A 1TREA 3HPSA 1JCYA 3DKLA 4MZ1A 3GYEA 2DZSA 1VYRA 2FIQA 3OVQA 4JTHA 2NUWA 1RR2A 3B4UA 4A2RA 1B4KA 3LHWA 3SR7A 5G1TA 1LCOA 3CIXA 4TU1A 3TJLA 1CW2A 3N34A 4TMCA 1W3IA 1ZNNA 5FF0A 1LTDA 4GUGA 3HO8A 5HJLA 3M44A 1EX5A 5E93A 4XTIA 2TMDA 1O95A 3L0GA 4DF0A 4XBSA 1IXQA 4BWLA 2X30A 3KVJA 2CZEA 2CW6A 4WQ6A 3DHDA 4ZL1A 1T99A 1L2UA 1LRNA 3IVSA 1X8FA 2Y6ZA 4UFHA 4M6PA 3CIWA 3QM3A 3W85A 4N9EA 4KFPA 2B7NA 2WPBA 1Z44A 2NV2A 3TMLA 1Q45A 3G8EA 1LLZA 3TH6A 3FA5A 3GR8A 3EWZA 3TUUA 3O15A 4Z1DA 4JTKA 3GB6A 3DH7A 4HNVA 3Q94A 1UUMA 1RVGA 1FDYA 3G1FA 3NDOA 1NF0A 1D3GA 3IIVA 4ADSA 5FF7A 3GDMA 4LUIA 2Y61A 1PHWA 4OE7A 4X9SA 4QAIA 3NZ1A 4LOCA 1H7PA 3B0VC 4YCPA 1O5XA 1F74A 1A53A 4CCCA 3CHVA 3EWBX 4ZQNA 3FEMA 1OFRA 5E1QA 3NNTA 1F2JA 3STEA 4UR8A 3L67A 4Y90A 4UR7A 3KVLA 3M47A 3UY8A 3LLDA 3GXTA 2Q3OA 3TV8A 2QCGA 4DF2A 3KRSA 3GKFA 1K02A 4EVZA 4AH7A 4O14A 2WSRA 4NJGA 1H62A 4CNNA 2ZYFA 5BMXA 3MW7A 1I4NA 2UV8G 4RJEA 3EEGA 3NEVA 3PBWA 1TPVA 1ME9A 3G3MA 2WKJA 1SQ7A 2ZRVA 3BW3A 4ZVJA 4GUFA 1H51A 2OX1A 5L9FA 5F4SA 1GQNA 5IBXA 1ZHAA 5FF4A 3W7LA 2H90A 3WK3A 4UTIA 4TO8A 3NL6A 1VH7A 4FIQA 3NPUA 5AHIA 2V0TA 3QFEA 3CU2A 3MMTA 3W7OA 2YYTA 1VLIA 1LZOA 1WDWA 4N6EA 1P5BA 1EEPA 2ISSA 5I3KA 5HQEA 2Y62A 3IEBA 2VEIA 3TQ0A 4DO5A 4S2CA 4Z0SA 1LBLA 3W7EA 1EP2A 3ABOA 3R5EA 3TDFA 1K7FA 4MY1A 1Q6LA 4RZ4A 2NWRA 4NNAA 1AL8A 4BF9A 1OK6A 2VFHA 1L6SA 1GWJA 1I2OA 1KM2A 3DBPA 2GOUA 3N14A 3STFA 1ZCOA 2CLEA 3OVPA 5TBOA 2Q8LA 2Y89A 1L6WA 4KFOA 3W3OA 2QUTA 2ZA2A 3RMJA 2G5WA 2W79A 3C8FA 3KOFA 4DF1A 2HSAA 3GDKA 2CFFA 3S42A 3P7YA 3W2NA 1GVOA 3DENA 4LU0A 1QCWA 1FCBA 1FX6A 3PB2A 4UTUA 3A22A 3A21A 3G18A 2VELA 4CQAA 2E6DA 2Q3RA 3P61A 3H55A 2NX3A 2Y7DA 1HFBA 1G4SA 4JTSA 2NX9A 3W2MA 1AG1O 2X1UA 1GYLA 4MIMA 2Z6IA 1LM1A 2V2CA 1W5NA 3CB8A 3NXFA 4Y9AA 5CG7A 1ALDA 4EF9A 3L68A 1ONRA 3DI0A 2FPVA 1G7UA 4ICNA 1GPWA 3HMJG 3TQKA 3KVKA 4N4QA 1A5BA 2C15A 2CLLA 1SFJA 4MKNA 3W1NA 1EWDA 3O07A 4PC8A 1EP1A 3BLIA 2NZLA 3BW4A 3JS3A 1PE1A 4U28A 5AHLA 1G67A 1KM1A 3HG3A 1AW2A 1VPXA 4ZZ9A 3UZJA 3WJYA 1S5WA 3M16A 4GUHA 1F76A 1R2TA 4PCFA 2G95A 4JIQA 3DU0A 1XBVA 3NQMA 2EF9A 1PCWA 1OF8A 4POCA 1ZY9A 3L0KA 2QKFA 5D38A 3B05A 3KHJA 3MP4A 5K4XA 2Y63A 3G1YA 3RNDA 3VFLA 3W7MA 2V30A 3HPXA 1G4TA 1KFBA 3TAOA 5EY5A 5D2VA 4DBEA 3QF0A 4X3ZA 1TPB1 1H61A 3IGUA 3QQ1A 4Z1CA 3F1QA 5HWMA 3IIZA 1K7XA 4Y96A 3L0NA 5CZSA 3RU6A 4M7TA 1M7PA 5EKYA 1JCLA 1JCXA 4HHPA 1Q6RA 1X1ZA 4UNKA 2ZZ5A 3W73A 2XN0A 1W54A 1YXYA 2DJXA 3PBVA 4FNQA 4GUJA 1EA0A 3P62A 3DFNA 2Y85A 3IGXA 4O52A 3THQA 1LBFA 3BGGA 3W74A 3LI1A 2PRHA 4DBDA 4IXXA 1XBZA 1YDVA 4A2SA 1WYIA 1H7RA 2DJLA 3LV6A 4CLMA 3ZR4A 1G6CA 4WJEA 5L6UA 1LORA 2F7FA 3W86A 5AYXA 4MZ8A 1QO5A 2NUYA 2EPHA 1BTMA 4LS0A 5D32A 2PURA 4YWIA 1LOQA 3NQ2A 1RQEA 2DORA 4EIVA 1FUYA 4G1KA 1XKYA 3NPWA 4JTIA 1LRTA 4MPQA 4LC8A 3UWWA 1W3NA 5DCDA 4X22A 1FQ0A 5D04C 3S9YA 2RFGA 4H6KA 3C3NA 1QPNA 1TRIA 1OX4A 2OT1A 2C18A 3OVRA 1O5KA 1W0MA 4JTFA 2V82A 1W31A 3L2IA 3S1UA 4UMCA 5LHFA 3O16A 2C3ZA 4TR9A 2ZZ1A 4WD0A 4S2BA 4UC5A 4HNTA 2QJGA 2VFIA 3OEXA 2Y7GA 4ADTA 1THFD 4UTWC 3N2MA 2PCQA 1DV7A 2CZ5A 4QNEA 2OMAA 2NUXA 3SJ3A 4ZQMA 3HPZA 4LVGA 4AAJA 3W1TA 3CWOX 4NZJA 4UIOA 3RLUA 1SZFA 3NQVA 4KWVA 2WSYA 1OG0A 3CTLA 1EPXA 4UMAA 4B5NA 3W88A 3W7RA 4O18A 2GUUA 4W9TA 2NXHA 1GVQA 4MFEA 4LV9A 3QPZA 2YR1A 4N6FA 3TXZA 3EWXA 4FHAA 3EKLA 4HT3A 5FF2A 4BFAA 4IPJA 4YCOA 1QOPA 3TAKA 1T96A 3R89A 5AHMA 3B0UX 2NXGA 3O63A 3PUEA 4XQ6A 4C1KA 3FYOA 1K8YA 4UUIA 1IXOA 1FXPA 2E6AA 2GQ9A 3L65A 5KTLA 1SUXA 3PULA 5KINA 2FPYA 3D0CA 3CLMA 4MZYA 2VXNA 5HNRA 1MEIA 1HUVA 2CZFA 1KFKA 3KX6A 1WOBA 1QMLA 1LBMA 1Z41A 2YGYA 1M7OA 2BX7A 3E49A 4FX6M 3KFTA 2RDUA 3MO7A 2VENA 4LC6A 1OF6A 2JGYA 1TTQA 1QPRA 1FDZA 2C13A 2QCNA 3DFTA 4LVFA 3W7NA 1GTHA 1I8JA 3W7GA 5LNSA 3QEZA 4UXDA 4CCDA 1PV8A 4ZMGA 3PR2A 1UJPA 1FCVA 2YPIA 5F4XA 1CX9A 4M6VA 3N9RA 2WJZA 2ATSA 1YXCA 4O8RA 2BXVA 1FWWA 3CM4A 4RK8A 1G4PA 3EWYA 1KLYA 3I7QA 2TPSA 2P0OA 4MY8A 1TMHA 1W5OA 1DOSA 2E5CA 3L9CA 1LLWA 1WV2A 3QW4B 4YMZA 2J9ZA 3O6YX 2ZZ6A 4JTTA 1OYCA 2H8XA 2RKXA 1SW0A 3W7HA 4EOUA 1GTEA 1GVRA 1VZWA 4CNOA 5D33A 3C6CA 3U6WA 1WA3A 3PG8A 1YTDA 3LHUA 2QUVA 3EWUA 3P8IA 4DPQA 5LSMA 3ZWSA 1KBIA 1OK4A 4LRSA 5I3IA 5HINA 1OHLA 3W07A 1MO0A 4QITA 1VC4A 1TV8A 1TV5A 4MYAA 3G0UA 1QO2A 5G2IA 3THAA 1YDOA 3H53A 4K8HA 4NNCA 1DVJA 3DFOA 4PTNA 5EBUA 5AHNA 2ISWA 3C61A 1KFCA 1R46A 4BR1A 4UTMA 3PF3A 3C56A 5AOUA 3NL2A 3QSRA 4RR4A 2PC4A 5DY3A 3RLVA 4M7SA 3VNDA 5C6MA 1ZFJA 3MYOA 1H7NA 1KM6A 3W2JA 4LVAA 4LUJA 2ZA1A 5FESA 1O94A 3PM6A 4ALDA 5EPDA 4GFSA 4IWWA 4O19A 2CU0A 3BLEA 3C2OA 4BWLC 4K7VA 3E02A 4O13A 1ICSA 2GJLA 3FKKA 4Z0JA 3YPIA 1JQVA 4O17A 1WX0A 1TJRA 1FCQA 1QAPA 4RZ6A 4OT7A 3DFQA 1I2RA 4RKAA 1SO3A 3DFPA 5HMSA 5F2LA 4JY8A 3HBLA 3BK0A 1SPQA 2FJKA 2E68A 2QCCA 3P84A 5D30A 3W2KA 1BKSA 2QJHA 3P5YA 4QIUA 4AHQA 1HO1A 3LM7A 4RXGA 5F2MA 5K9CA 3VE9A 4RZ5A 4JYFA 1TIMA 3MBFA 4YXGA 1A5SA 2Z1BA 1WAUA 2NV1A 4IOTA 4WOZA 4XKYB 4Q32A 2QF7A 2E5BA 3ABRA 3SFKA 3LCGA 1JQXA 3NQ8A 5A8GA 3TE9A 5D2XA 3EXRA 3L66A 4JS3A 4MJMA 4LV4A 2JKAA 3GDRA 4NQ1A 3LLFA 1OX5A 2C1HA 4NZFA 5EA9A 1J5TA 1I2NA 3PS7A 2Q8ZA 3NAVA 1TV7A 4LT9A 2J6XA 3TK7A 1TJPA 4XZ9A 1N8FA 2ZQ0A 3HGRA 2BZNA 2G97A 3IRDA 4XKYA 3QW3A 4OBTA 2C0AA 2ISVA 2YZRA 4ML9A 3G24A 4NUWA 2GQ8A 1G4EA 4I7UA 5TIMA 1PCKA 3LB0A 4WY0B 3ZWTA 3GVGA 3I68A 1Y0EA 1SO6A 3R8RA 3L5AA 5K4ZA 4CNPA 2VFEA 4IUOA 1FY6A 5DXXA 1TTIA 3TR2A 3LDVA 3W7QA 3A23A 3UXAA 5K2ZA 2XN1A 5IBXC 2E77A 3T40A 3LI0A 2TYSA 3S1VA 4FNPA 2VC6A 2ABBA 4WY0A 1VCFA 3TIMA 2F84A 1BWLA 1XFBA 1OYAA 1VCVA 1GEQA 3LHTA 4LS1A 2HS8A 1VS1A 3BLFA 4LVBA 3LV5A 5G2HA 1A5CA 1WBJA 3TW6A 3N3MA 1DHPA 5BRBA 2FB3A 1FDJA 1XBXA 4RX0A 5AC6A 1OX6A 4AMAA 1SZNA 3NZRA 1GVSA 2V2DA 3B03A 1QR7A 1GOXA 1EB3A 2EAWA 5LZLA 2ZCGA 4JICA 1Z48A 2Y88A 4ZQRA 3BW2A 3Q58A 1B9BA 1XBYA 3W1RA 3PSWA 1R47A 4OGZA 1YADA 3W71A 4M19A 2BWGA 3LTSA 2ZTJA 2QR6A 4IPIA 3ATYA 3PUOA 4FXSA 2ZZ2A 3PUDA 4N9CA 2R91A 1F5ZA 3LHYA 3LGEA 1YYAA 1OFOA 5HWNA 2OT0A 4A22A 4BI5A 4FB7A 3MJYA 4GUIA 3M5YA 4UFIA 2YX0A 2RDTA 3WK2A 2DP3A 5EMUA 2P1FA 4KFNA 1XM3A 2J9YA 5J5DA 3S0CA 4MUZA 3W1QA 1TCDA 3U8GA 4HIBA 3BO9A 5BW6A 1ML1A 2XFWA 3UZ5A 5CZ0A 2Y70A 5G1YA 3W1AA 3NQFA 2W6RA 3MHUA 2V5BA 7TIMA 3SIZA 3TA6A 4OHQA 3MP3A 3HQ1A 3F03K 3DXIA 2CLHA 3LHVA 3GXPA 4NJKA 4Y8FA 3W22A 3DFSA 5AC8A 3QJAA 1M6JA 2JKEA 5TQLA 5D02A 1V5XA 5EYWA 2QCDB 1FWTA 4NJIA 5LKYA 3Q2DA 5DBTA 3W7IA 4DO6A 3N73A 4WY0F 3RK8A 1R30A 3BARA 4HSNA 3FKRA 3MHGA 5CSSA 1FCUA 3WJZA 3STGA 3T4CA 1GZGA 4WXZA 3HOJA 3A5FA 3W7DA 4PA8A 3FJ6A 4FXRA 5K3VA 4QNWA 3RF9A 5H2ZA 3FJLA 4LTSA 1JUEA 3W1PA 4HSOA 1ZENA 4QJ1A 3W70A 1A50A 4FNRA 4JD4A 5D09A 4O0KA 2O7SA 2QCDA 4QISA 2AQWA 5GVJA 3P60A 4XUGA 2B0MA 1G69A 1XC4A 4NVTA 1MSSA 2GVLA 5DELA 4ZQOA 4I7WA 3LCHA 4O1CA 3I65A 3INPA 3LERA 3BVJA 1KM4A 4UTHA 2CLFA 2ZTKA 4GBUA 3R12A 1S5TA 4U4MA 1KV8A 4MYXA 3SECA 1DORA 3UPWA 1V7YA 1WQ5A 1XUZA 3JRKA 4JX6A 3BG9A 3SGUA 5FF3A 2IQTA 4WOQA 3NQCA 2C6QA 3P80A 1YPIA 1KM3A 2R94A 1H63A 4UNLA 4LW7A 2WNNA 4JDBA 3UYCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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