2DZWA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (e244a) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVDGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEALLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 91
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzwA00
3W74A 2V30A 2CZ5A 2QCEA 4PTNA 1MO0A 2TYSA 3CQ0A 3KAOA 1W5PA 3DI0A 2NUXA 4L4LA 1OFEA 2LLEA 3C61A 3PR2A 3W88A 3G8EA 3M1ZA 2C6QA 1ML1A 5FF3A 4TU1A 2YDAA 2NX3A 4UIOA 1AW2A 1TB3A 3W7HA 1SW3A 4LV9A 3W6YA 2DZUA 4XUGA 1RQBA 3HQ1A 4MZ8A 2C18A 2OT0A 4DO4A 1OFAA 3G1YA 3GKFA 4C1LA 3A5VA 1SFLA 1DJQA 1ICSA 4ADUA 2RDTA 4QNWA 4DELA 3TQVA 4GWEA 4MLJA 4IWWA 5BNKA 5J5DA 2VEMA 3G3DA 1QOQA 2BLEA 4JTUA 4LS1A 1O60A 2RFGA 2DORA 4LVFA 3CLMA 1L6YA 3L68A 3W84A 3USBA 3SW6A 3ATYA 4O57A 4D2JA 3LTPA 1LBFA 1QDSA 4O8RA 2AQWA 3L2IA 4UTMA 2FJKA 3TROA 2BZNA 3BLFA 3OVRA 1XDLA 3UY7A 1VH7A 3BLEA 4K7VA 3LV5A 1GVOA 4UMAA 3P8IA 4JDYA 4MKNA 3S0CA 5IBXA 4O0ZA 4G1KA 4UFIA 5K7JA 1LLWA 5FEZA 4OV9A 3S8HA 2ZZ4A 4MVAA 3BGGA 1GTEA 3M7WA 4NJIA 4HSOA 4JTIA 2YX0A 5D38A 1X6UA 2GVGA 3UPBA 4BI6A 1SO3A 1W3TA 3PB0A 3T78A 5LHFA 1HFBA 5H2ZA 1RV8A 3NQGA 4ML9A 3TC6A 5HWNA 5I3JA 4JEQA 3P82A 3LXAA 3ABQA 4XBSA 3TW7A 5F2IA 4JTFA 4O53A 4TR9A 1TPH1 5AHLA 1BTMA 1GYNA 5I3FA 5BMXA 1OK6A 1B3OA 4IPJA 2V82A 5LKYA 1R30A 1ZAHA 3TA6A 1OHLA 4EVZA 5IM51 4LVGA 3DFPA 4QITA 3S9YA 1A53A 3UXDA 4GUJA 1PCWA 2X16A 3RU6A 3MP4A 4WZHA 1W3IA 3QJAA 1F76A 5FEXA 3B03A 3W9ZA 1K7XA 1C8VA 1JQVA 4UTHA 1B57A 4A3UA 1SSGA 3PY2A 3TDFA 5EBUA 4IMCA 5TBOA 1QPRA 3BPWA 3W1RA 1YDVA 3EWZA 5G5IA 1RVGA 2FB3A 3WJZA 3STEA 3E96A 2A6LA 1EPXA 3CPRA 3QFEA 4UTJA 1EP2A 1TPEA 4DO5A 4LVBA 3V75A 3G3MA 3W7CA 4AB4A 1H7NA 4RXGA 4UTTA 5CPLA 3W2UA 1I45A 1YADA 2A5HA 3KVMA 4MY9A 4JTLA 4RR4A 2WPBA 3LHUA 4N2YA 4AMAA 3LOTA 3C8FA 4JD4A 1OF6A 5AN7A 1WV2A 2PRHA 4UR7A 4JTSA 3SY5A 2CFFA 3HIJA 3KVJA 1PHQA 3LCIA 3G0UA 3L65A 5DY2A 1Y0EA 1IF2A 2ZRYA 1I2RA 1PHWA 4GJ1A 3L0NA 2FFCA 2WNNA 3G0SA 3H54A 4UMCA 3EX1A 4WY0F 3M44A 3HPZA 2J24A 2P10A 4QAIA 3QMRA 4ZVJA 1S5VA 5LHEA 3DKLA 1KLZA 4GE8A 1BWLA 2FB2A 3NXFA 3PAJA 1TPWA 3UWUA 3RLUA 3TC7A 1SR9A 1IXNA 4MUZA 2YFOA 1E51A 4Y96A 3IIPA 2NWSA 1OJXA 2CW6A 1KM3A 3NZRA 2ZZ7A 1OX5A 4BR1A 3Q94A 4FIQA 3I6RA 3R89A 2VKZG 2OZ0A 1ME8A 2ZTJA 5TIMA 3GXTA 2QCDA 4GC4A 1QO2A 4JXCA 1N7KA 1F05A 3N9SA 5LGZA 3VE9A 2RDUA 4R7JA 5HWMA 5I3GA 3PUDA 3W7LA 3W7GA 1LRTA 1VHCA 2A7PA 5HQEA 4M6VA 5KSWA 4A2RA 3TFXA 1VC4A 2NV2A 5E1QA 3ABRA 2DZWA 4PA8A 1OK4A 3DFSA 1FCQA 5D2TA 4BWLC 3STCA 2VFFA 1QWGA 2A6NA 2WOQA 5AYYA 2Y7DA 1OFRA 1Q6RA 4ZQRA 3WK2A 1S3HA 1ZAJA 4CQ8A 4QIUA 2DU2A 1OFOA 3E9AA 3IIXA 5G1YA 2GQ9A 2X2GA 1VLIA 1R2RA 3MBDA 4CCDA 1I2PA 3F4NA 3IV3A 3PS7A 3HBLA 1VJIA 3YPIA 3HGRA 4IPIA 4MJZA 3MJYA 2R8WA 4HNTA 2VENA 2CZFA 3M0ZA 3E12A 2VFEA 3TSMA 4O1CA 1TPFA 1TRIA 2J27A 3G1FA 5DCEA 1EWEA 3O63A 5E0KA 2RH9A 3ABOA 1TIMA 1QO5A 3W1LA 2CU0A 2ZZ6A 2QCMA 3LRMA 3S5OA 3TE9A 5I3IA 1LCOA 3G0XA 3R5EA 3KFTA 1DQXA 4KFNA 1WBHA 3QC3A 2F84A 5U4NA 1KFCA 5L9FA 3W22A 3CM4A 3U2OA 1FDZA 1VCVA 4JTTA 1X7FA 3H53A 2CLKA 3M43A 4O0KA 3UZJA 2Y62A 4XKYB 4RK8A 3S1XA 1XBYA 1QAPA 1ALDA 4FNPA 3BK0A 4BI7A 1XL9A 1B4KA 3DHFA 3TXZA 3LHTA 1WAUA 4JX4A 5CZTA 1PV8A 3O16A 2JGQA 4H6KA 4BF9A 5D02A 1M7PA 1F74A 1F73A 5T26A 5FF2A 3JRKA 3S1WA 1HTIA 3W1TA 2QCLA 4LT9A 3L0GA 4FNTA 1C9DA 1JCMP 4IOTA 1KFBA 1LDCA 1SU5A 1ZALA 4OE7A 2B7PA 3FYOA 5D2WA 3STFA 2GQ8A 2QR6A 2OCZA 4AF0A 5F2GA 3W7OA 1KM1A 2E5DA 3Q58A 1TTIA 4P2VA 3TAKA 1SZGA 3W2LA 3UD6A 1VQTA 4AHQA 2ZZ3A 1PVNA 2OMAA 3LCHA 1A5SA 2CZEA 3M5XA 5DXXA 1ZCOA 5G4WA 3I7QA 5K4ZA 3HB9A 5HJLA 1DQWA 2H8ZA 2EKCA 1FX6A 1H7XA 2XN0A 1H51A 2AAMA 4LVAA 1OYAA 1T8XA 4UTIA 5DXYA 1RQHA 5D33A 1K8XA 4RCXA 1TO3A 3QEZA 3C2OA 3C6CA 3W87A 4PH6A 1SO6A 4O12A 3WK3A 1AW5A 1TREA 3IIZA 4Z1AA 4JTHA 4NZJA 2YFNA 2E6AA 5LNUA 1FCBA 3TKFA 1Q6OA 5D37A 3TJXA 2J88A 3W72A 1WXJA 3W1UA 1LROA 2JKEA 5K3VA 3G1DA 3ZS4A 1EIXA 3W2KA 1ICPA 3EXTA 2V8ZA 4YCPA 3GDKA 2TSYA 3BVJA 1S5WA 3STGA 3BW3A 4O14A 1TSIA 5CZ0A 3GLCA 2ZZ5A 4HNVA 3LLDA 4FNUA 4IMGA 3G22A 1SW0A 3BO9A 2C19A 4NX0A 1WDWA 3EWBX 3EWYA 2JKPA 2YGYA 1TYGA 5F4XA 1I2NA 3GXNA 3UYCA 3S5NA 1XUUA 5FF0A 2NV1A 1FBAA 3W1MA 4LW7A 1JCLA 4HKPA 4E0CA 4MFDA 1VHNA 3NL5A 4LVDA 1G67A 2G95A 4O1AA 3TXVA 2QAFA 3QH2A 5AC7A 3C2VA 5AHEA 3TJLA 3BG5A 2H90A 1QFEA 2WSRA 3W85A 5BMWA 1FQ0A 1ZY9A 3OHIA 3NQAA 4NQ1A 1KM0A 4K38A 1CX9A 2BTMA 3LCWA 2A85A 2Z6IA 3P80A 4JIQA 3P5ZA 4ZMGA 5HR6A 1VCFA 3LXBA 2A0NA 1P0NA 2QCGA 3Q2DA 5LSMA 4R53A 4N9DA 2BWGA 4YL2A 3LXCA 3P5YA 3LRLA 3SR7A 3EWUA 3W7MA 2YZRA 4IMFA 4N9BA 2Y6ZA 4O1DA 2Q8LA 1SFJA 4FNRA 2V5BA 2Y7FA 2F7FA 2B0MA 2Y70A 2E6FA 1M7OA 1SZEA 4AAJA 5HNRA 4I7VA 3G1XA 3HG5A 3PSWA 2HS8A 3GR8A 3OA3A 2VFIA 1W8SA 3F4WA 4MIMA 3QW4B 3UQNA 3VE7A 1QNVA 4Q4KA 3T7VA 1EB3A 1XUZA 3P7YA 1VRDA 4RXFA 3FYPA 3C52A 2CLMA 1AW1A 4R34A 2Z0IA 3O15A 4NX5A 5LNVA 3GIYA 1Z42A 2QUUA 5EPDA 2WQPA 1DVJA 3CEPA 3MWAA 1KW1A 3HGOA 4RZ6A 3PB2A 5KZDA 1CI1A 2QJIA 2VFGA 3DAQA 4WXYA 4AEOA 1H5YA 4M19A 5D30A 3QPYA 4GUIA 1HO1A 3GXPA 3IEBA 4UFJA 3P81A 1TPUA 2YCEA 5HUPA 5HUOA 5DN1A 5KINA 4NXKA 4CQAA 1L6WA 4TX9A 5DCDA 2DZVA 2NZLA 4DO6A 4MJMA 1I8JA 3GVGA 4RX0A 4XQ6A 4N6EA 3HG2A 2YYTA 4OGZA 4JS3A 3WFAA 3CWNA 5G2IA 3FJLA 4ZL1A 4TIMA 4JX6A 3RF9A 1K03A 4QQ3A 4JDBA 4GUFA 5LGXA 1HL2A 2NLIA 4UCGA 5LZLA 3N73A 1H7OA 4N6FA 1AMKA 3ZWTA 1UB3A 4LRTA 6ALDA 3NNTA 2WJZA 2GOUA 1YDOA 3GB6A 4AH7A 2XFWA 1XFBA 4JTEA 2QCCA 1JUEA 1GVSA 3HG4A 3MMTA 3EWWA 1S5TA 3SI9A 4H4IA 2R91A 5K4XA 4UMBA 3IIVA 4RZ4A 3GDMA 1F2JA 1JCXA 3NQFA 3SSJA 3G1SA 4FNQA 2GVJA 3HMJG 1ZAIA 4OBTA 2RDWA 3B06A 3NL3A 3KVLA 1KTNA 1KV8A 3GNDA 4BK9A 3PG8A 4IX0A 4LRSA 2G96A 3EX6A 3KXQA 4CCCA 1NF7A 3QZEA 5CSRA 2OT1A 1KFKA 1VGAA 2XN1A 4NNCA 3HJZA 2WNZA 2H8XA 2C13A 1W0MA 1KBIA 4UTLA 1SZNA 2QJGA 3RK8A 2HS6A 4DEFA 3OBKA 1G6CA 3IIOA 5D09A 3FA5A 3MP5A 3LBCA 3G8RA 4ADTA 1AG1O 4M6QA 1XC4A 2YW3A 1JVNA 4I7UA 3NL6A 4X9SA 2P0OA 4K39A 2CLHA 3LCFA 5KZMA 1Q45A 2G5WA 2CLFA 3BLIA 5F2MA 5IBXC 4N9EA 2E68A 4O19A 4UTUA 1NVMA 3SZ8A 2H3BA 3TW6A 4Y90A 2QKFA 4X22A 1DKWA 1TV8A 2H3DA 2VXNA 2BSLA 2GQAA 4BI5A 1P0KA 1W5OA 4PL1A 4Q32A 1DORA 4WUIA 1GOXA 4DF0A 1YPFA 3N3MA 5I3HA 2CLLA 3MO7A 1KV5A 1XKYA 4OU1A 3KVKA 2Z6JA 1U5JA 3B0PA 1EX5A 1EUNA 3PBYA 2Z2UA 1YLVA 3UPWA 1ONRA 3NQ2A 2JGYA 4K36A 4GNJA 4Z1CA 2FPVA 5H91A 3C2RA 4Z1BA 4J9JA 3GKAA 1GVRA 3T55A 3DI1A 3W75A 2ZRVA 3C4UA 3DENA 1TTJA 1OX4B 3W1AA 4BWLA 2CLIA 3R12A 2NX9A 2E77A 2ZRXA 3EXRA 1PL9A 4NNBA 2Q3RA 5HWJA 2A1YA 4HHPA 1H7PA 3B04A 1FWTA 2ABBA 3W83A 2ZQ0A 4EIVA 3M9YA 3WJYA 2CLEA 4I9AA 3LTSA 4O15A 1SUXA 1XBXA 1RZMA 2Y63A 3HGJA 2WO5A 4ONVA 1XI3A 2QEZA 4PEKA 4E2DA 1DJNA 2A21A 4KKXA 4NZFA 4JTKA 3A24A 1A5BA 5D2XA 1TV7A 3T40A 3RNDA 3IGSA 1G7VA 3W23A 1OFPA 3L0KA 1B9BA 5CPOA 4ADSA 1KBJA 1H1ZA 4N02A 4MFEA 4QJ1A 2A7NA 1JUKA 4N4PA 4IXXA 3GZ3A 1L2UA 3LHVA 3W7PA 4XKYA 1ADOA 1O5KA 5DBTA 2QDHA 3L5AA 1NEYA 1F6KA 3BG9A 2E6DA 3DZ1A 1W1ZA 3BV4A 3I7RA 1GG1A 2EAWA 4AWTA 3KRSA 1VR6A 5TQLA 4HPXA 3NZ1A 3G24A 3H55A 2BXVA 3DXIA 4AHOA 3WJXA 1NSJA 4ZZ9A 4Y9AA 1VS1A 2HTMA 2VC6A 3C2FA 1SQ7A 1UJPA 4MOZA 3O6DA 4LNYA 3WJSA 2ATMA 3OIXA 1BKSA 2V2HA 2ZA3A 1GZGA 4GUHA 1J5TA 3NEVA 4NJHA 2NUWA 4JY8A 3QSRA 5AHMA 3P61A 4O13A 4WY0A 2E09A 1WOBA 2B7QA 3NQ8A 1IIHA 3SGZA 2A7RA 4EOUA 4YMZA 3TX9A 3P60A 1VZWA 2CLOA 1FCVA 4NJGA 4JYDA 3A23A 4O10A 3S1VA 4HNUA 1KA9F 5AOUA 2QCHA 4LY8A 3W1PA 1BEUA 5FEWA 5E93A 2H6RA 1MZHA 3O06A 1JCYA 4JIPA 3OG3A 1X8FA 3I7SA 3UXAA 3LGEA 4MLRA 2FQIA 1IXPA 3CU2A 4JGDA 1CW2A 4N9CA 1DHPA 1SO5A 3W7IA 1D3GA 4PC8A 1W31A 2I14A 4CNPA 1N55A 2OJPA 4K8HA 4X3ZA 3LX9A 1FDJA 4NJKA 2QDGA 2ZCGA 3W1XA 3PWAA 4ORMA 2NXGA 3NO5A 1OABA 1TTQA 1R46A 4I7WA 2FLIA 1W54A 4U4MA 2VELA 3M16A 1YPIA 1FUYA 3M5ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Q02 A;  3PWI A;  1QWK A;  4Q8P A;  4PSR A;  2V30 A;  4WDU A;  2TYS A;  2Z1S A;  2C7F A;  4LUT B;  2NUX A;  5FJU A;  3EWC A;  3C61 A;  1ML1 A;  2IMR A;  2OSX A;  2VTF A;  3MZ2 A;  3UYI A;  4TU1 A;  3AHY A;  2NX3 A;  4C5Y A;  4LCR A;  2XIN A;  1TB3 A;  3L2M A;  1CZ1 A;  1CCW B;  3T08 A;  4MZ8 A;  1QW7 A;  4FS9 A;  1SFL A;  4U33 A;  1ICS A;  1SJB A;  3PPF A;  4L4O A;  5FL0 A;  4PUW A;  3T4W A;  5DF0 A;  4R85 A;  5I7G A;  3WNK A;  1Q6F A;  4MLJ A;  5HPC A;  2VD8 A;  2VEM A;  3CYV A;  3G3D A;  1BPL B;  3L4W A;  2RFG A;  4UB9 A;  3VKD A;  2AOS A;  4LVF A;  3WL1 A;  4H2C A;  1S5N A;  3W84 A;  4D6D A;  3ATY A;  2OSW A;  2WBK A;  1NQK A;  5D8Z A;  1QDS A;  3IAQ A;  5HPO A;  4MWA A;  2FJK A;  3UXK A;  2BZN A;  3BLF A;  3OVR A;  3KOZ A;  3PJT A;  4K7V A;  4ZOE A;  1GVO A;  1U1H A;  4JDY A;  4O0Z A;  5K7J A;  1J6O A;  4S3D A;  2FH6 A;  4L1W A;  4HSO A;  4JTI A;  2YX0 A;  3OLE A;  2ZXD A;  1E55 A;  1CGV A;  1X6U A;  3F7J A;  2QPX A;  3H2E A;  4ML9 A;  4GCA A;  3S2C A;  3QR0 A;  1HKW A;  1KNW A;  4JEQ A; 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