2DZXA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (e131-132a) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVDGILVVDLPVFHAKEFTEIARAAGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 95
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzxA00
3LGEA 3M5YA 1L9WA 2Y7EA 4X2RA 1SO3A 3DFTA 3N73A 2A21A 5AHEA 1C9DA 2A6LA 4EWND 2GUUA 1VLIA 3L0KA 3DKJA 1TJRA 3BVJA 3P67A 3SZ8A 3RLUA 4LT9A 3T44A 5HWNA 2OCZA 3PUOA 5CSSA 3GDMA 1Z41A 4GUJA 4XTDA 4E38A 2CLMA 4H6KA 4N6EA 2VKZG 2QCHA 1W5PA 3IV3A 2FFCA 3CU2A 2GJLA 4IPIA 4ZQMA 5EY5A 3I6RA 4H4IA 2VFDA 1OK6A 1GTHA 5AC7A 4DO4A 3SGZA 2V30A 1KM1A 4PTNA 3EWYA 3NL6A 1U5JA 1KFCA 3WJZA 1LTDA 5DN1A 1F74A 2GQAA 1IXOA 1FUYA 1O60A 3G1DA 1WXJA 2Q8ZA 3SFKA 3VNDA 2TYSA 1FQ0A 1IXNA 3HG2A 3LV6A 3O05A 4JR5A 3SW6A 1K02A 3B06A 3T55A 5LZLA 2FIQA 1OFEA 3HPXA 3EWUA 3QPYA 1OF8A 1K7XA 3W2UA 2OMAA 1WDWA 2VEPA 4YXGA 1VH7A 2HSAA 3NQ8A 5D30A 3STCA 4MY8A 2FB3A 4OE7A 1SO5A 1XBVA 5BMXA 1FDJA 1M7PA 1L6YA 3N9SA 3YPIA 3AJXA 4Z1BA 3P74A 5CPMA 5AHNA 4AB4A 5HWMA 3LBCA 3NVTA 4FXSA 1P5BA 3HGRA 4K7YA 4FF7A 5AC6A 3CT7A 5KSWA 3N19B 4PODA 2RHGA 4LV4A 1W5QA 1H61A 3PAJA 2FQIA 1WOAA 4O16A 2OT0A 1GPWA 4K7VA 2Y62A 3FEMA 3JRKA 4DO5A 5A5WA 4BFAA 4C1LA 3P8JA 1XDMA 1QOQA 4I7UA 3IIVA 5DY2A 1V5XA 2A6NA 3THQA 1OG0A 3NZ1A 1D3HA 1HO4A 1KV8A 3C61A 5HULA 3LX9A 1BTMA 2VEMA 1ICSA 3MI3A 1KBJA 4LU0A 3NM1A 4Z08A 1VHNA 4XBSA 1Q3NA 3ZWTA 1VYRA 1FCVA 4UTIA 5C6MA 1TTIA 3VFLA 4G1KA 2Y7DA 3MUXA 1R2SA 1W56A 1Z44A 3L9CA 1JJKA 3W74A 3WK3A 5HUOA 3P8IA 4N2YA 2VENA 3I7QA 2E68A 1EUNA 4UTHA 3WJWA 4NX5A 3EX4A 1WA3A 3S9YA 5KMYA 2CLIA 4OV9A 4K37A 4ZQPA 4UNKA 3FOKA 4L4LA 4JTUA 3FFSA 5E93A 5U7SA 1L6WA 1SPQA 1IXPA 1GZGA 3BW3A 3RFAA 2WOQA 2YSWA 3QFEA 4CQAA 4LVFA 2GQ9A 1VRDA 3QW4B 2H90A 1GYLA 2V81A 5F4SA 2ZQ0A 4QNEA 3B8DA 2RDUA 4R33A 2WSRA 3QSTA 3A5VA 3LLFA 3NG3A 2NV1A 5D32A 1G7UA 1OFAA 5TQLA 2Y7FA 1QNVA 2YW3A 3GZ3A 3NZRA 1FWTA 1BWKA 3CWOX 3NPVA 4O54A 4PH6A 4DF0A 3I65A 1YADA 4KFOA 4WQ6A 3HO8A 3M5XA 4MY1A 2CZ5A 4PCFA 1T8XA 1NFBA 2TPSA 1TSIA 1G67A 2V2HA 1GVFA 1OX4A 1K03A 5FEWA 3BLEA 4CNOA 4ADSA 4WOQA 3LDVA 1FX6A 1K7FA 3UWQA 1F76A 5K3VA 1F73A 1TB3A 3QEZA 5EL1A 1ICPA 4NNAA 1S5TA 1W3NA 3PBUA 1GVSA 4K6AA 1W54A 1XCFA 3TX9A 4HNNA 1FBAA 3MYOA 3ZR4A 2WNZA 3W7MA 4DELA 3QSRA 1YTKA 3HPSA 3GKAA 1X1OA 3TSMA 1PV8A 1TQXA 3W2LA 1SFLA 4NNCA 1HG3A 1TPVA 3P80A 5KZMA 3EWWA 3UXAA 2RDWA 2QCGA 3MI6A 1K8XA 3HOJA 4OHQA 2EKCA 1RZMA 3P7YA 4JTFA 2HS8A 2TMDA 4FIQA 5EA9A 4MFEA 1ME8A 5F2IA 2BX7A 5G1YA 1GG1A 2ABBA 4JTKA 2BXVA 4HNVA 1J5TA 1BKSA 2Y63A 4MVAA 5D33A 3UWVA 5CZSA 4A2SA 2ZRXA 1RQHA 1SU5A 4YWIA 1TO3A 1Z48A 2QEZA 5CSRA 4IQLA 3RNDA 2QAFA 3M5ZA 3L5AA 1VPXA 1RV8A 3GX9A 1FDYA 1WAUA 5F1UA 1I2OA 3LCGA 5BW6A 1EEPA 5HMSA 1K7EA 2GOUA 3RU6A 2NXHA 5DY3A 4ONVA 4UMAA 3CLMA 1SW7A 4JICA 4S1FA 3S6DA 4LVBA 3DI1A 3NOEA 1KM2A 1QCWA 4L4MA 3QC3A 1TMHA 3I7RA 4UFKA 4WZHA 2ZA2A 5E0KA 4TMBA 2QUTA 4QISA 3W1QA 1XFBA 4NJHA 1P0NA 2FB2A 3M1ZA 4M7SA 1YXCA 3IVUA 1TV5A 3B04A 4Z0SA 2DJLA 2JK2A 3BLFA 3STGA 1XC4A 3PC0A 1I2NA 4O1BA 2NXIA 3TW6A 2ZTKA 3LHVA 3EX1A 3NQEA 4GFSA 1R47A 4P2VA 3P81A 5IM51 4JTHA 1C8VA 2YYUA 1EUAA 2J88A 4Y90A 5LHEA 2FTPA 1XBXA 2R94A 3UYCA 2W6RA 3MHUA 5C2XA 1TPH1 5L9FA 4GWEA 3UWUA 4EF9A 3OVPA 4BWLC 3LRMA 3NQFA 1LOLA 4LWWA 1LLZA 5C54A 1SSDA 5FF0A 3TIMA 3TV8A 4IUOA 4S2BA 3GR8A 1LP6A 3TAKA 5D09A 3GYEA 1XL9A 3M43A 2H8XA 4ADUA 3RMJA 2X1TA 4KFPA 4IMDA 4EF8A 1ZAJA 2B4GA 5DLCA 3O06A 3TQKA 3DU0A 1DV7A 1KM4A 4E2BA 1PHQA 5AB3A 4P61A 4DEFA 3W7EA 3C3NA 4UXDA 1JRCA 4R7JA 5I3JA 2Y70A 4U28A 1OFPA 4Z1CA 3EEGA 2C6QA 1SSGA 1IIHA 1VCFA 1DBTA 2XN2A 4GNJA 2P0OA 3W2KA 3PWAA 4MYXA 3CEUA 5D38A 3L5MA 1YDVA 3TKFA 1CW2A 5HWJA 2GPTA 1WOBA 2X1UA 1ZHAA 2Q8LA 2Y61A 2RFGA 1J4EA 3HGJA 4H3DA 2CU0A 3NAVA 3LCWA 2J27A 4DPPA 4HHPA 2NX3A 5AOUA 2E09A 4LRTA 4EOUA 3TC6A 4Y96A 3HJZA 3PG8A 1G4TA 5HR6A 2A4AA 4UFMA 3ANYA 4Z1AA 4UUIA 1NVMA 3S1WA 3UQNA 3IVSA 1XM3A 3G8EA 5AHLA 1TPDA 3BK0A 3M5VA 3MHFA 4BF9A 4FX6M 3W7CA 1DHPA 1P0KA 2UV8G 5CGQA 3O15A 3O07A 4I7VA 3CHVA 4N6FA 1WX0A 4UR7A 1MEHA 3LLDA 1DL3A 3EKZA 3TQVA 1O95A 5G5IA 4Y6GA 1SZGA 2F84A 3NPXA 3LOTA 3M16A 4KWWA 4HSNA 3DFNA 4UMBA 5C5YA 2I9EA 3S8HA 4BWLA 1YTEA 1G4EA 3W3OA 3M7WA 4Y9AA 3CPRA 4BI7A 2CLOA 4GUIA 3QMTA 3NPUA 1Q6QA 4BK9A 1A5AA 1KFKA 2ZZ1A 4NXSA 4NNBA 3W75A 4UCGA 2DU2A 1OFBA 1T99A 1WBJA 2HMCA 4IMGA 3NL3A 3UZ5A 3N2MA 1H60A 3G1XA 2YDAA 1KM6A 3NL2A 1JQVA 3DXIA 1A5CA 3LI0A 2ZA1A 2XFWA 3B0UX 2V2DA 3O1NA 3DGRA 3GAKA 1BEUA 3UWYA 1YLVA 3W71A 3BG3A 4JTSA 4BR1A 2GVLA 4KWVA 5G2HA 1ZCOA 3IGXA 3R5EA 2I1OA 3LXAA 3LERA 1VGAA 4I9AA 2QCDA 3BG5A 1LOSA 4O15A 3PBVA 1QR7A 4JTIA 3L2IA 5LHFA 4GUGA 2QUUA 4IOTA 3GKFA 1RD5A 3TSBA 4NUWA 2WNQA 3NQMA 5LGXA 4ZL1A 1DOSA 1B4KA 3UWWA 4CQ9A 4RLIA 3TROA 2CZDA 1QDSA 2X30A 3W87A 1H7RA 2B0MA 1B3OA 3LCFA 3PR2A 4XTIA 2V0TA 1H51A 3LHYA 1YPFA 4O28A 1KFBA 2ATMA 2JGQA 4M19A 2ZRWA 4LRSA 3ATZA 3W83A 4UR8A 3NQ7A 4RJEA 2NUWA 4HPJA 2V5LA 3CEPA 4LUIA 3O6YX 1LBFA 1M5WA 4JD4A 4QAIA 2QAPA 3F03K 4IJBA 1K3UA 2WV8A 5FEXA 1QPOA 3W1AA 2BTMA 1QO2A 3DFPA 3PB0A 4Z0JA 2DZSA 1OK4A 4OBTA 2QCLA 4LV9A 1KV5A 1W5NA 1SFJA 2OZ0A 2VFIA 2YYTA 1FCUA 3GDRA 4WY0A 5FI8A 4QJ1A 5TBOA 3MMTA 2J6XA 5DBUA 3V1PA 3G0UA 3BPWA 1LDCA 3LHZA 5HUPA 4YLWA 4AVFA 3BGJA 2CLLA 5F1VA 3N3MA 1XBYA 2FPVA 2C14A 2PC4A 1JULA 1FWWA 1H63A 4UFJA 4O12A 3EKLA 3F1QA 1W31A 1VC4A 4JIPA 4D2JA 4QITA 3C2FA 3W72A 3E02A 4O53A 3B05A 1TPC1 4HNTA 3EWXA 1M7OA 3KRZA 3LTYA 3WK1A 2ATSA 2ISVA 4UTJA 1NF7A 3FKRA 3MBFA 3TC7A 4OWGA 1CX9A 1FXQA 2QCCA 3QQ0A 3TQ0A 1JVNA 4TX9A 1QWGA 1GYNA 4JEQA 1X6UA 2CW6A 4AWSA 2XN1A 1QPQA 3WFAA 4JS3A 3L67A 3T7VA 3TJLA 1TRDA 3P84A 3TFXA 4FNTA 5LGZA 2QJHA 3CC1A 3OHIA 5ABTA 3QZEA 3PUDA 1VLWA 4RK8A 1QOPA 1THFD 4IX0A 4FXRA 4AWUA 1VZWA 4O8RA 4AMAA 1NEYA 2E6DA 3G1FA 3W86A 2NZLA 3HQ1A 3LI1A 2XN0A 3KXQA 2WSQA 3W1UA 1YTDA 2QDHA 1OVDA 1S3HA 2WNNA 3NQDA 4X3ZA 2JKEA 3TW7A 3W6YA 1KTBA 1EWEA 4RZ4A 4MJZA 1WYIA 1UJPA 1JCJA 1XKYA 2PURA 3VI2A 3R89A 3TJXA 3FS2A 1QPNA 3QJAA 1D9EA 5LNVA 5CPOA 2TSYA 3Q58A 3EX2A 1KBIA 3KFTA 2WO5A 3ZFHA 3CQ0A 3TXZA 3VE7A 3PB2A 3R12A 4Y8FA 4DBEA 3O8AA 4MZ1A 4M7TA 1TRIA 4UFLA 3B4UA 2HTMA 4DXVA 1ML1A 4JTGA 5HQEA 3DZ1A 2QKFA 5CPLA 3NQ2A 5G2IA 2NWRA 3W9ZA 1Q6LA 2V2CA 3W07A 3OVRA 2DJXA 4ZMGA 2Q3OA 1KA9F 2Z6IA 4UFHA 3FYOA 3W76A 4J9JA 5D2WA 1IXQA 2E6AA 1I2QA 1I2PA 2H6RA 1LROA 4CNNA 3WJSA 4RV8A 5LNWA 3NQVA 3W7NA 4O0ZA 4ZQCA 3KRUA 1ZJIA 3A9IA 1ZFJA 3TK7A 5IBXC 2VFEA 4RR4A 3TCEA 4MPQA 4FHAA 3QM3A 2Y6ZA 1EX5A 4O11A 7TIMA 3SJ3A 1AMKA 3Q94A 1FWRA 4CCEA 5BOOA 1C29A 3MP3A 4PL2A 2C18A 3LCLA 3H54A 3AO0A 2E5CA 3LHTA 1AK5A 1V7YA 1JCYA 1R2RA 4QNWA 3P62A 2ZZ6A 4R53A 2C3ZA 3PF3A 4AEOA 1LLWA 4M6QA 1H1ZA 2OJPA 3W23A 1YXYA 4O4VA 4JIQA 4CQ8A 1GG0A 4K39A 3C52A 5F2MA 4O13A 2AGKA 1AW2A 4PA8A 1L2UA 3RK8A 3TE9A 2RH9A 2QCFA 1EA0A 1OABA 2CLKA 2Y89A 3W84A 2DORA 5KINA 2R91A 4E0CA 3G1HA 1B4EA 3F4NA 4LUJA 2X16A 1A53A 2F7FA 2PRLA 4IWWA 1OFDA 4JYEA 5K7JA 3MWAA 1AG1O 2NV2A 1G4SA 2J9YA 2YXGA 4HT3A 1OX4B 5C55A 1KFJA 1OYCA 3A22A 1A5SA 2YCEA 5FEZA 3OVQA 3C8FA 8TIMA 4IXHA 1OFQA 1N8FA 4LVAA 1G6CA 2BZNA 1MO0A 1NSJA 3THAA 3A24A 3TNOA 1TV8A 3ZS4A 4HNUA 3SIZA 4CCCA 1I2RA 2EAWA 3W1NA 2Y85A 2VELA 3UZJA 4UTTC 3O63A 4KFNA 4JN6A 1IIGA 4NT0A 4IXXA 2GJNA 5AYYA 3C2VA 4MLJA 1XDLA 1E51A 4WXYA 3IEBA 1DORA 3PUEA 1F6PA 3LRKA 2X1SA 4FNPA 1TYGA 2QF7A 3LCIA 4FO4A 2BLEA 2OX1A 1MSSA 4UTUA 1GEQA 2VXNA 3M6YA 4JTLA 2EPHA 2E6FA 2ZA3A 4A21A 3DFOA 1UB3A 1FDZA 2ZCGA 3G0SA 4LS0A 1X1ZA 5AYZA 2DP3A 1N7KA 2FPTA 3W7GA 3HGOA 2ALDA 2J9XA 3FYPA 2A85A 5IBXA 1ICQA 3GK0A 3UWZA 3W7HA 4FNUA 1OF6A 1PL9A 1UBSA 4O10A 3PBWA 5DCBA 3EWBX 3SECA 2E5BA 3A23A 1TPFA 1VQTA 3CIXA 3GNDA 1LYXA 1TPWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VNK A;  2EPM X;  3ZJK A;  3I3B A;  4QR6 A;  1SO3 A;  2ZX9 A;  5DO8 A;  5AHE A;  1ZQ5 A;  1TJR A;  4IFO A;  3UJS A;  3T44 A;  3RLU A;  1BVW A;  4GUJ A;  4E38 A;  4IIF A;  4QCE A;  4TQT A;  4PMJ A;  4UOQ A;  2CLM A;  3N9K A;  3UXK A;  3WLK X;  3MUZ 1;  3N3T A;  2GJL A;  4CKQ A;  2KAU C;  1TR9 A;  4IJR A;  3WUB A;  3I6R A;  4H4I A;  2VFD A;  5AC7 A;  3HTW A;  3U9I A;  4DO4 A;  2V30 A;  3NL6 A;  3MSR A;  2GQA A;  1IXO A;  4ZOD A;  1P6C A;  2WWC A;  2OGY A;  3WY1 A;  1IXN A;  3LV6 A;  3RM4 A;  1CXH A;  4Q7N A;  3UER A;  3T55 A;  3UG8 A;  3QPY A;  1DJH A;  1OF8 A;  3WLI A;  1UC4 A;  3CIV A;  2WQD A;  2VEP A;  3N2B A;  4YXG A;  3NQ8 A;  1I6N A;  1XBV A;  1EKO A;  4GLE A;  3YPI A;  1RAK A;  1IEW A;  3ITO A;  4Z1B A;  3P74 A;  5AHN A;  3ARW A;  2X7V A;  3SQL A;  3KL5 A;  2XIB A;  3IJQ A;  5AC6 A;  5KSW A;  3N19 B;  2RHG A;  3F5K A;  3H2O A;  1E4L A;  1H61 A;  3DHP A;  4O16 A;  4ERG A;  4K7V A;  2Y62 A;  3FEM A;  3JRK A;  4JKM A;  5A5W A;  2PC8 A;  1EOK A;  4DI8 A;  4QLJ A;  1XDM A;  1N2V A;  4S3A A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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