2E09A

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (e74a) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKAFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVDGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 94
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e09A00
3IGUA 4UCGA 3RLUA 1XCFA 2DZUA 3I65A 3W71A 2ZA2A 1FUYA 4L4LA 5FF0A 1FWSA 3S5YA 3NAVA 3W86A 2PRLA 3HF3A 2BZNA 2Y89A 1VCGA 1ZY9A 3G0SA 2GUUA 4K7VA 3SY5A 4QITA 1I2OA 2A7RA 2TMDA 2NXHA 1G67A 2PRMA 4JYEA 4UTIA 4JYFA 2FPYA 3NQGA 5FF4A 4ZQNA 1H7PA 4Z1CA 5LHFA 2E77A 3G1AA 3BW2A 1JQXA 4O8RA 3KRZA 3N3MA 3B4UA 4QIUA 3O15A 3DKLA 3UZJA 3KVLA 1LM1A 2C6QA 5EY5A 3DHFA 1K8YA 4N9EA 3T4CA 2YW4A 3BG5A 3DFPA 5D04C 1JVNA 1G7VA 3HO8A 4UC5A 2ABBA 5EPDA 3CM4A 4ICNA 4HNVA 2E5CA 3N73A 4GUIA 2ISWA 2NX9A 4ZQCA 2X16A 3NL6A 2XN1A 1EWEA 2VKZG 3A5FA 3ANYA 5BMXA 5F2IA 3NR0A 1I2PA 3BG3A 3UWVA 1PCWA 2A2IA 1BTMA 4UMAA 1XBXA 4BI7A 3GXNA 1MEWA 4UTHA 1QPOA 1VHCA 2GVLA 2YX0A 5U7SA 5D37A 4N9CA 3W75A 4NJHA 1V7YA 3SFKA 3G8RA 3MHUA 5AHMA 1YDOA 3DKJA 2LLEA 5DLCA 2WJZA 2VFIA 1UJPA 2WNNA 1OYCA 3HQ1A 1F6PA 2Q3OA 3LCIA 5AN7A 4UXDA 4IGHA 5AYYA 2JGQA 4NZJA 1OX6A 3W7GA 3EWUA 3KX6A 1EX5A 3EXSA 4FHAA 3DU0A 3LRKA 3LXBA 3GDMA 4LY8A 5CZ0A 4GBUA 3BW3A 5CZTA 4EIVA 3P81A 3Q37A 4I7WA 1LRNA 4O50A 5DBUA 4TX9A 5KZEA 3HGRA 1TPDA 2X1UA 1OX5A 3IRDA 5CZSA 5E93A 3FA5A 1SSGA 3B0VC 2Z1BA 5AHEA 3C61A 2Y85A 2FTPA 1TV7A 1KBIA 4CCDA 1Z42A 3HG5A 3FJ6A 5AC8A 5LHEA 2ZYFA 1S5VA 1SO6A 1TREA 2Y7DA 4LNYA 5K9XA 4UUIA 3QW4B 2Y61A 2QUTA 4ORIA 1THFD 1A5SA 5G2IA 4AEOA 4JR5A 2DZXA 5AOUA 4FIRA 2PRHA 1SW7A 4LOCA 1ZAIA 1DJNA 3TCEA 4UTWA 2R91A 4Y9AA 4FXRA 1RVGA 4HT3A 1GVRA 1W31A 2GQ8A 3THAA 4YXGA 3E0IA 2OT0A 2C16A 3KRSA 3LLFA 5HNRA 2H90A 4MYAA 3DZ1A 4I7UA 1SFJA 3PVFA 3BLIA 5LKYA 1GTEA 1JULA 1SZEA 4NJKA 3GDLA 3NQDA 3CU2A 1P0NA 5L6UA 1OX4A 2BSLA 2V2DA 1VR6A 5FF7A 2WSRA 1XDMA 1W54A 4NXKA 3VE9A 2JK2A 4GXMA 4NZFA 1FCVA 4O12A 1LOQA 1J5TA 1GQNA 3DGRA 3G1YA 2Q3RA 3BV4A 5FEXA 3UD6A 4JTFA 3TIMA 4XTDA 1VYSX 3B8DA 4H4IA 1A5CA 1SPQA 1PIIA 1PVNA 3NEVA 4QNEA 4WJEA 2VXNA 3U8GA 4WOQA 1NSJA 3NA8A 2ZZ4A 4ML9A 2ZFAA 4OU1A 3L0NA 3M7WA 3EX3A 1FDZA 3UY7A 2OMAA 1YLVA 2DORA 2C15A 1UASA 1Y0EA 2YYTA 2Y63A 3E49A 1KTCA 3WJYA 4Z0JA 3C2FA 4O0KA 3TSMA 2X2GA 1O60A 3IV3A 1XBYA 2EAWA 3L9CA 5G1TA 1Q45A 2V82A 5G4WA 2FB2A 1D3GA 2R94A 3SIZA 4MZ1A 1JJKA 1K8XA 1VLWA 3GDTA 1OFRA 3UPWA 4RCXA 3B04A 2BLEA 4JX5A 4ZVJA 4HSOA 3BW4A 3TAOA 4MPQA 5DCDA 3BARA 2JKPA 2QCFA 4HPXA 4JTEA 1QFEA 3LBMA 2WNQA 1R2TA 4WUIA 2DJLA 5C6MA 3W7KA 4LVBA 3OHIA 4A2SA 2QJHA 3I6RA 2E1DA 2FLIA 4PC8A 3BLFA 2UV8G 5CG7A 4O53A 3V1PA 3S5NA 5KTLA 1DQXA 3MBDA 3HPZA 1TTQA 2VEPA 2PC4A 4IMCA 3QPYA 1EEPA 1TV8A 3A23A 3QRHA 1H7OA 3JRKA 3GDRA 2B7PA 1HFBA 4K7YA 4O0ZA 5HR6A 1EUAA 3W1MA 3K30A 3NQ6A 4LVGA 1H60A 3BG9A 1H1ZA 1IXPA 3EX2A 1F6KA 2VFGA 1TRDA 1GWJA 3T44A 1T96A 1AL8A 3FFSA 1SO4A 4UTUA 2E5DA 3W7MA 1F5ZA 1MEHA 5KZMA 4MJMA 1LLZA 1SU5A 4O57A 2V81A 4N4QA 3MI6A 5D2YA 3LV5A 3O6YX 3TFCA 2VOMA 5HR7A 4CNNA 4IMGA 1X1OA 3B05A 3P5YA 4FNQA 5HWJA 2WSQA 3PBVA 2TYSA 3W3OA 5G1YA 3B06A 1D9EA 3R8RA 2WNZA 3GXTA 2DZWA 2C18A 3PULA 4DF1A 3WJZA 3C2VA 1F05A 4N6FA 1K7EA 2E6DA 4RK8A 2A7PA 3TAKA 4IX0A 5FF2A 3LOTA 4O11A 1F2JA 5E1QA 4ZQRA 5IBXC 1EIXA 2OCZA 2HTMA 5KZDA 2DZPA 1H62A 2WKJA 1DV7A 1WQ5A 1QOPA 4O28A 5AHFA 1YXDA 3S1XA 3BLEA 3PY2A 1PS9A 2J27A 1SO3A 2GQ9A 4JTHA 1W3IA 1XM3A 4IJBA 1QDSA 1MO0A 4XTIA 4Q33A 3N2MA 1VS1A 1KFEA 1YTEA 1EWDA 3THQA 3VE7A 4HNTA 3GNNA 3HG3A 3NZ1A 3GR8A 1HG3A 5H91A 3U2OA 1FCQA 2OJPA 4IMEA 1TYGA 1TMHA 5DXXA 1LYXA 3TDFA 3MI2A 2YR1A 2ABAA 4Z1AA 3NQCA 2FPTA 3RU6A 2KZHA 5FEPA 1NF0A 4JDYA 3L68A 3EB2A 3M16A 5LNWA 2QJGA 1KBJA 3FYOA 3M5ZA 1WDWA 1Z48A 1LLWA 1FWWA 4YCOA 2FPVA 1IXQA 5C54A 5CPOA 2E09A 1LOSA 1TB3A 4DBDA 3KFTA 5DY3A 4IWWA 3L21A 2RH9A 3I7SA 3LTPA 3Q94A 3TC7A 1W3NA 3TMQA 4X3ZA 3M6YA 1GG0A 4GWEA 4LS2A 1FDYA 3L66A 3HJZA 1AK5A 3UWYA 2R8WA 4O1AA 4BFAA 2DP3A 3SI9A 3MWAA 3E9AA 1K7XA 2QAPA 3KVMA 3L65A 1LDCA 3G1DA 3HIJA 3LHVA 3O8AA 1W5MA 1PV8A 1M7PA 2IQTA 3IIZA 4JYDA 3BK0A 4GC4A 4LV4A 1QAPA 3NQAA 1YTDA 1TPB1 3PBUA 3SECA 1KLYA 4P2VA 5K2ZA 1BEUA 1PCKA 4MKNA 2W6RA 5LGXA 1YDNA 1OJXA 3VCRA 2B7QA 3WJXA 4AHOA 5EBUA 4DO6A 2RKXA 3R89A 5F2MA 4YLWA 3P8JA 1OFEA 3S5ZA 3DHDA 1TV5A 3CIWA 3LRLA 3W2LA 1AG1O 1LBLA 3EWZA 4W9TA 4XUGA 2QDHA 3UWUA 4HKPA 5BNKA 4OWGA 3PB0A 3PAJA 5K9DA 4IUOA 4Q32A 1ADOA 1M7OA 2J88A 2CWNA 4IPJA 2CZ5A 3FS2A 4IXHA 5LNUA 4OQVA 3UWZA 3LXAA 3TQVA 1N7KA 4NT0A 1KTNA 3S5OA 4JTUA 2VELA 4RJEA 3S1VA 3N34A 1JUBA 1TTPA 2AGKA 1OABA 1L6YA 4R53A 4G1KA 3TX9A 2Q8LA 3PR2A 3HPXA 3TJLA 2NUXA 2CLLA 1H7XA 3W83A 3LDVA 3DFOA 3SJ3A 2Z0IA 1TQXA 2GPTA 4NNCA 2P0OA 4UR8A 1T0OA 3I7QA 4EWND 3P60A 1FQ0A 1SQ7A 2ZTJA 3DXIA 1TJPA 2VFHA 2J9XA 2V30A 3NQ8A 4M6VA 1ZALA 5EMUA 4Q4KA 2ZA1A 1TO3A 1C8VA 1Q6RA 3IIXA 2H8XA 1KM0A 2QCMA 1SW0A 3BPWA 1GG1A 1R30A 1L6SA 3W7LA 2VEMA 4A21A 4WQ6A 5CKSA 4A22A 1LBMA 1RPXA 2J9ZA 4FNTA 3G0UA 4JIPA 3OVQA 3TXVA 4AWUA 1I2RA 3GK0A 3HPSA 1X8FA 3I7RA 4TU1A 1OFBA 1KFKA 4JICA 3NQVA 1FXPA 1TPEA 4MVAA 1KLZA 1WBJA 3LTSA 3W7NA 5C2XA 3W7DA 3O6CA 1LZOA 4Y96A 3WK1A 1LCOA 3LERA 4K39A 1Q6LA 5D02A 1K3UA 3TA6A 4JNMA 1KM3A 4FNPA 3DBPA 1DKWA 1LRQA 4QM1A 4U28A 3TK7A 5ABTA 3M43A 3FOKA 2A7NA 3KAOA 1ZHAA 4YWIA 4BI6A 1KM4A 1ME8A 1GOXA 2ZZ5A 3LGEA 2DZVA 3G1FA 4ZQPA 2XN2A 1S5TA 4EF8A 3W7CA 4JTTA 1FX6A 3NQEA 2Y7GA 2V5BA 3F1QA 4LS1A 5MHBA 2BTMA 2ZCGA 1VRDA 2Z2UA 1W56A 3M5VA 4UFIA 2A85A 2B7NA 1XDLA 2ZBTA 4R34A 4MZ8A 2RHGA 2TSYA 3ZWTA 3H54A 5HMSA 1OHLA 2YSWA 4LV9A 4UTTA 1O5KA 1EP3A 1JQVA 1R2RA 4JX6A 1QMLA 4H6KA 3CEUA 1DVJA 4QSHA 2D73A 1YPIA 3W1QA 2CLFA 4DQWA 2PURA 4UTKA 5DBTA 2J6XA 4GRSA 3LV6A 1KTBA 1LOLA 5AYZA 1SFLA 3RF9A 4R33A 3NQMA 5AHLA 4PA8A 4CQ9A 3PC0A 3PUOA 4U4MA 1NVMA 1KM6A 3IVSA 4O54A 1OFQA 1H50A 1O95A 3EKZA 4K8EA 4LW7A 3FLUA 2B4GA 3DFNA 5DY2A 3A21A 1OF6A 4BI5A 3G24A 3UWWA 1BKSA 4YMZA 5CSSA 4M19A 1MZHA 2YYUA 5CPNA 1X7FA 3OG3A 2RFGA 2YFOA 4ZZ9A 1LBFA 5F1UA 3T55A 2J24A 5TQLA 3HBLA 2X1TA 3P61A 2EGZA 4EF9A 3LBCA 4K6AA 4XKYB 4FIQA 2WSYA 3F03K 3NQ7A 2JGYA 1J4EA 1TPVA 4P61A 4AMAA 1KM2A 2YDAA 4HNNA 3GZ3A 2QCNA 3ATYA 1F7BA 1F74A 2G96A 1OK4A 3C2EA 3OIXA 4UFHA 4AAJA 5EKYA 1H1YA 4K38A 4UFMA 1SUXA 3LCXA 4ADTA 5DELA 2VENA 3WJSA 2RDTA 4KWWA 1H7RA 4N4PA 1KM1A 2V2HA 2QCHA 1G4PA 3UXDA 4O4WA 3O6DA 4NXSA 3TJXA 5BW6A 5KINA 5KMYA 4OT7A 3RMJA 3B0PA 1TPH1 4HHPA 1OF8A 1OFPA 5G2WA 5FEWA 2V8ZA 3G22A 2NX1A 3N19B 3PG8A 4CNPA 4RLIA 2H3DA 3NM3A 3S6DA 4AVFA 1VGAA 4N6EA 3W2UA 3EX4A 3RFAA 4Z08A 2C0AA 5FEZA 2X1SA 3EXTA 1ZAJA 4NQ1A 4LT9A 2JBMA 1FWTA 1ICPA 2I9EA 2WO5A 2CLIA 3QZEA 4HIBA 3F4NA 3O1NA 2FDSA 3GLCA 1JCJA 4ZL1A 5D2WA 2QF7A 1K02A 1TPWA 2XFWA 5I3HA 5HWMA 1XBZA 1QWGA 1W3TA 1FWNA 5C55A 1FCUA 3MO7A 3LHTA 3LHZA 4DO4A 2OZ0A 4UMCA 1QNVA 3NOEA 3GKFA 4I7VA 4E2DA 5BRBA 3STFA 4GUGA 3ZS4A 4M5PA 2FJKA 3CTLA 1H7NA 1ONRA 2QR6A 3HOJA 5D2VA 3TQ0A 1ZAHA 1C29A 2ZA3A 3PSVA 3W87A 1PL9A 3G1HA 1OFOA 3MP4A 1IIGA 3KHJA 4N9DA 2FIQA 3L5LA 4PEKA 4CQAA 2NX3A 4AB4A 5U4NA 4JIQA 3G3DA 5FESA 1SO5A 1VHNA 3IVTA 3TH6A 3A9IA 3M9YA 4Y6GA 2A1YA 1WA3A 4LWWA 1FXQA 3EXRA 5G5IA 3L5MA 2CFFA 3G18A 3O06A 1JCLA 4IXXA 2DJXA 5TIMA 2F7FA 4LC8A 1WAUA 4FNRA 3IIOA 4O16A 4QJ1A 2YXGA 1KV8A 4BK9A 1XUUA 2BWGA 4RKAA 4CNOA 2P10A 5LNRA 4RXFA 3W7IA 4AH7A 2E6FA 2QCLA 4FF7A 2NUWA 4X9SA 3UNDA 4GUFA 1ML1A 1XUZA 4JTJA 3H55A 4XZ9A 1IGSA 4QNWA 1K8ZA 3C3NA 1E51A 1B9BA 1RV8A 3W07A 2QCDB 4OV9A 4H3DA 4FO4A 3TW7A 1XXXA 3STCA 3IVUA 4JS3A 4OE7A 2DZSA 5HINA 1TIMA 1JCXA 3INPA 3GR7A 1C9DA 1ZCOA 3KRUA 1O4UA 4M7SA 4AWSA 5D32A 2ZZ2A 1NF7A 1VYRA 1HO4A 1RQEA 4UFLA 4NX0A 2NWRA 3R2GA 3HG4A 1VCFA 2QKFA 1H51A 5AYXA 4N02A 4K8HA 4LU0A 3RK8A 4S2CA 1ZNNA 1OVDA 2C14A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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