2E40A

Crystal structure of intracellular family 1 beta-glucosidase bgl1a from the basidiomycete phanerochaete chrysosporium in complex with gluconolactone
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
459
structure length
459
Chain Sequence
AKLPKSFVWGYATAAYQIEGSPDKDGREPSIWDTFCKAPGKIADGSSGDVATDSYNRWREDVQLLKSYGVKAYRFSLSWSRIIPKGGRSDPVNGAGIKHYRTLIEELVKEGITPFVTLYHWDLPQALDDRYGGWLNKEEAIQDFTNYAKLCFESFGDLVQNWITFNEPWVISVMGYGNGIFAPGHVSNTEPWIVSHHIILAHAHAVKLYRDEFKEKQGGQIGITLDSHWLIPYDDTDASKEATLRAMEFKLGRFANPIYKGEYPPRIKKILGDRLPEFTPEEIELVKGSSDFFGLNTYTTHLVQDGGSDELAGFVKTGHTRADGTQLGTQSDMGWLQTYGPGFRWLLNYLWKAYDKPVYVTENGFPVKGENDLPVEQAVDDTDRQAYYRDYTEALLQAVTEDGADVRGYFGWSLLDNFEWAEGYKVRFGVTHVDYETQKRTPKKSAEFLSRWFKEHIEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of intracellular family 1 beta-glucosidase BGL1A from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 190
structure length 459
sequence length 459
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2e40A00
1MXGA 2CBJA 1XC6A 5M5DA 5IFPA 4Q7NA 1MFVA 2A3EA 2JEQA 3VGHA 4HU8A 2ZIDA 3AS3A 1W32A 1ZU8A 3GNPA 2D1ZA 3VDAA 4L4OA 1BLIA 2BS9A 1MW3A 4ZE5A 1VB9A 2YBUA 1EGZA 2D2OA 1C7SA 1UD5A 4LGXA 3U7VA 2DSZA 3GYCA 2XM1A 5ABFB 1MWOA 2EQDA 1UKOA 1A3HA 1E4MM 4J3WA 2CITA 1EHAA 1B3VA 5DF0A 4AZBA 4PMUA 1TMQA 4KRTA 1KCLA 3NSXA 1UH2A 3NDZA 2WHKA 2PB1A 2V5CA 2MANA 1EQCA 2XWDA 3AYSA 1E1EA 5AYBA 4D6DA 3M6DA 1MFUA 1PPIA 2NT0A 3AHZA 1TE1A 2J4GA 1LWHA 2JALA 4V28A 4YHGA 1CWYA 1JDDA 2EPOA 4PN2A 3VO0A 2ZWZA 4J27A 3SEPA 2BY1A 4EE9A 3E1F1 4Z2JA 4AWEA 1C8YA 1J0ZA 4L4PA 4QAWA 3SCPA 5D9MA 2D0GA 3EBVA 3EDKA 1E70M 1W2PA 3W4RA 3B9DA 4U5KA 4WLCA 1BG9A 3WELA 1US3A 2OSWA 4QCFA 4W87A 1W2VA 5EMYA 3WH8A 1PX4A 2W62A 4GI8A 2XFFA 1J01A 4M29A 4NRSA 1BGGA 2CEQA 2NSXA 2A3AA 1UR8A 2YLLA 1TA3A 4P7OA 2BXYA 2VR5A 1UD4A 1E40A 2QPUA 4GIAA 2G3IA 4QLLA 1KGUA 1OGSA 3CGTA 3FHQA 5I6SA 5CPTA 1G5AA 1OD8A 4J7RA 2D3NA 3VIGA 4AEFA 4IUGA 1E73M 2WKGA 1DP0A 5I77A 1VEMA 4X0VA 1NWSA 3MU7A 3THCA 2JIWA 3AXIA 4DUVA 5DFAA 4DWSB 3WBAA 3KEHA 4GQQA 3WN6A 7CGTA 5A6LA 3VGDA 1GQIA 3F5JA 2VX7A 1U30A 3I3DA 1HL8A 2XFRA 5DT7A 3A4XA 1JDAA 4XZWA 4QDMA 2IXUA 2DH3A 4F9DA 1J0YA 4UOQA 1DWFM 1JYNA 1SYTA 4R5EA 1W1YA 3ARRA 3WQ5A 4S3JA 1KQYA 4BQ4A 5ABGA 2DT1A 1GUVA 1KWGA 2UWFA 2BHUA 1AMYA 3WL0A 3WF3A 3ZMRA 1LF1A 3W24A 1OWQA 2E8ZA 4J28A 2VC9A 1QHZA 3DYMA 1FHDA 1VAHA 3VU2A 2O9PA 4YPJA 1KXQA 4U3AA 2YDSA 2WM0A 4TOQA 4OOUA 4DUXA 3ZT6A 1UKSA 3BAIA 4LYQA 3FAWA 3W6MA 1E15A 2E0PA 1HL9A 1E0XA 1PJ9A 1JFHA 1QNSA 2Y8KA 3APGA 1CLVA 3VMPA 1FH8A 3S6TA 1EIBA 1CGXA 2EEXA 4U5IA 3BCDA 4FLSA 4PRWA 4CUCA 1JGIA 3AFBA 1HKJA 1ZB5A 2J25A 4TX8A 2VTFA 1I1XA 1XD1A 4ATLA 1QHOA 1BGAA 4E8CA 3F5KA 2YL9A 1FP9A 1JZ3A 1GJWA 4PMOA 4V2XA 2TAAA 3RMEA 1W1VA 4PMZA 2ZUSA 4TVUA 3AMGA 1R86A 2DT0A 1LQ0A 4PSRA 1WDRA 2VL4A 3NYDA 3KE0A 3VD7A 4AZHA 5HDRA 3NIYA 4PTVA 3NSMA 4PUDA 3VNYA 4Y7EA 1R87A 1K9TA 4A4AA 2EJ1A 1OGBA 1OIFA 2IXVA 1U2YA 3MSDA 6CGTA 1J18A 5DO8A 3VGBA 4D1JA 1JYXA 1B9ZA 1E5NA 2X05A 4MADA 4JFWA 2PI6A 1Z32X 3TTYA 2Y5EA 1VFMA 2ZXBA 1FH7A 1E4IA 4PTXA 1DWJM 1JF6A 3W37A 4X0NA 3U7BA 3CZKA 2WWDA 3KL3A 1QNPA 5A8PA 2VNCA 4FLRA 4M1RA 3EYPA 1UUQA 3WFLA 1DWGM 1X1NA 3SCWA 3ZIZA 1K6AA 4W93A 3BH4A 1GVIA 3OGSA 3WMSA 2D24A 2PWHA 3GH7A 1HX0A 5A2BA 3AHXA 4EK7A 3J7HA 2WMFA 4WSJA 3RM9A 2GJXB 2D3LA 2DIEA 5IDIA 4M82A 3VIIA 1GOKA 5FCZA 1E71M 3POHA 1CXEA 3AOFA 4CKQA 5A69A 2YA2A 4ATDA 9CGTA 3WENA 3ZJKA 1JNEA 2PWFA 3PZ9A 1WO2A 1QVBA 4HA1A 2C0HA 1DHKA 2FGZA 2ZUNA 1W9XA 1XSKA 1BAGA 3AJ7A 3VTRA 4CN6A 4MB1A 2JE8A 3WNMA 1ODUA 1W3LA 3VIJA 2F61A 2PC8A 3T08A 1ZJBA 5HXMA 2V3FA 5I5RA 5I0DA 3SCUA 4AD4A 5E9AA 1W9VA 3N12A 5C71A 2C8NA 3CUGA 2YJQA 2ZXDA 4F9JA 3ALFA 1DWAM 4JL1A 5CPSA 2PWGA 4JCLA 3RCNA 3L4TA 4CD6A 1VJZA 1WZLA 1TCMA 1C7TA 4KH2A 1A47A 1E6SM 3CHFA 1J9YA 1K9DA 2BNJA 1HNYA 2WZHA 4ZFMA 3ZR6A 2OSXA 1WNOA 2X2YA 3OZPA 3B8SA 3A4AA 1CYGA 3FAXA 3VILA 2XJ7A 3VDHA 3CUJA 2WW5A 5CZKA 2QPSA 1TA3B 1E4LA 4MNLA 1WDSA 2WVVA 2VX6A 4UFMA 4J3VA 1B31A 1VIWA 4W8AA 5JUVA 5A95A 5A6KA 2XHYA 3LPPA 1WB0A 4LXFA 4QP0A 1RP8A 5JBFA 1V6WA 1W3KA 2WLZA 3T2PA 3U5UA 3MV01 5HPOA 1W91A 3DHPA 2XYLA 3DYPA 3PTQA 5LA0A 1EDQA 3NUKA 3MKKA 3QR3A 4CU8A 4CD5A 5A6BD 1WAWA 3T0DA 2ZX8A 4DWSC 5BRPA 3PZOA 4D71A 3SCRA 3WD3A 2EPMX 4UR9A 3THDA 4E2OA 1JZ7A 1CXHA 3WBEA 3GXDA 4PMYA 3W6LA 3WUEA 5A94A 4LQ1A 1JD7A 3WH5A 1V3LA 2YL8A 3K8KA 4AZ6A 1EH9A 3T2OA 4M81A 2VZSA 1YHTA 3AYRA 3AZSA 5CXPA 5C70A 1ESWA 3AIRA 3CZ8A 1XGZA 2YDRA 2D0HA 3ZOAA 3HN3A 4AW7A 1H11A 3MUAA 2VZUA 5AC4A 1G0CA 4JFUA 8A3HA 1DTUA 1LL7A 5A1AA 3UCQA 3CZLA 3UG3A 2O92A 1JNDA 4HA4A 3ZO9A 4MB4A 3WUFA 4AYSA 1JI1A 4MDOA 1CDGA 1BFNA 1MW0A 4YHEA 4DM2A 2Y4SA 4CD4A 3LPGA 1C90A 1VFOA 1GHSA 2EXOA 2WMHA 3VDBA 3IK2A 1KQZA 4MDPA 1IV8A 2AOSA 1C92A 4WF7A 4UZSA 1IZJA 3K8MA 4HOZA 3M7SA 1MVYA 4MPKA 3CZEA 3WD4A 1KXTA 5GPRA 3GM8A 2G3MA 3WF2A 4H41A 3EDDA 1ZL1A 2A3CA 4H8HA 3WDJA 1VBUA 3UETA 4PEEA 3W27A 3N18A 3RPMA 5CGTA 4D72A 3T2QA 4RL3A 1TR1A 2RGMA 2ZX9A 4HMCA 4J3UA 4OZOA 3ZJ6A 1CLXA 2OYKA 2BHYA 1E43A 4AZGA 3ARSA 2WMJA 5BXPA 4F79A 1XRVA 3ARXA 1KWKA 1QW8A 1E56A 1OSEA 3MO4A 2V38A 4JFSA 3S2CA 2O9TA 5M17A 2G3JA 2ZUMA 4UFJA 4HZ8A 5LA2A 1XD0A 4JL2A 1E6PA 4IPNB 1DWHM 2DPEA 3AISA 3AXXA 4Q22A 3OA5A 5A6JA 4QLJA 4AD1A 2UY3A 1HJVA 2UY4A 2E9MA 1GQJA 2XTKA 1LJYA 4UFIA 1OINA 2YA0A 5IHRA 2XSAA 3AHYA 3SUWA 5FL0A 5A6MA 2F8QA 2UY5A 2DQXA 1KXVA 3PZQA 2JF6A 2BV9A 4IISA 3MMUA 2BY3A 1V3IA 1OD0A 1JFXA 4OBSA 3GXMA 4BQ2A 4OBRA 5GQBA 1VFFA 2FHFA 3IANA 4UFKA 1Q6GA 3QHMA 3OLGA 2QF8A 3UR7A 2OSYA 3WUGA 2WMIA 3WF4A 4TXEA 1HJXA 3AIBA 5KZ6A 1CNVA 1OIMA 1HT6A 2UY2A 2E3ZA 1HN1A 1OB0A 2GDUA 2WAGA 5CPQA 1JZ5A 2ZE0A 1ZBCA 1BYBA 5ECUA 3WQ4A 3RIKA 3U5YA 5A6AA 1PBGA 3II1A 3VGGA 2OLHA 3AS2A 2W63A 3RJXA 4U2ZA 4UOJA 1AQMA 4R27A 4BCEA 3EMCA 4HZ7A 3AI0A 5E0FA 1HP5A 3M46A 3EMZA 1ISWA 4D6HA 1ITXA 3BAKA 3MUY1 5A2AA 1R8LA 1B90A 1JI2A 1C91A 5HBFA 3RDKA 1LL6A 3CHCA 2J62A 4KRUA 2WANA 1ZBKA 2GJPA 2ZWYA 1GOQA 4MNKA 2GSJA 3WD2A 1CXLA 2JFEX 3ZQ9A 3NJ3A 2DSVA 3BLKA 2VRKA 1UG6A 1J0HA 3UR8A 2PBOA 3K1DA 3WUBA 2E8YA 1WZMA 3VM5A 3GXFA 3WDIA 1UD8A 3PZTA 4IPLA 3CPUA 1V0KA 2HISA 2DEPA 4OJYA 4P7RA 1CTNA 1EOMA 2J79A 2WVVB 2ZX7A 3BSHA 3GH5A 1Y7VA 3BLPX 1KBBA 4LYPA 1NM9A 1CGTA 4MB3A 1U33A 1XCXA 3AIWA 4Z2IA 3EDJA 3ZR5A 4W7VA 3BMVA 4C7FA 2GDVA 1J0JA 3WIJA 1SMDA 4W8BA 3GH4A 3DECA 2WCGA 3CIVA 4C7DA 5CLWA 2VT0A 4MNMA 3W28A 1SMAA 5I78A 2VI0A 1L8NA 3SCOA 1YQ2A 4KGJA 4MAVA 3PZIA 4ACZA 5AC5A 2DH2A 1GOWA 3WEOA 1GOMA 2ZXQA 4TTUA 3SUUA 3HU7A 4WKAA 4WKHA 4PCTA 4E8DA 1Q6FA 4JZ5A 3TTOA 1UD2A 1TZ7A 3ZT5A 4ZENA 1MQQA 3I3EA 3WH7A 3WY1A 1B3YA 3WMCA 4D6GA 1UZ1A 3AMCA 3GBDA 3N9KA 3WDPP 1E5JA 3D5HA 3OGRA 1VEOA 3WNKA 2FGLA 1DEDA 3VIPA 1C8QA 1E6NA 2ZOXA 3OIHA 5A6BA 1E9LA 2GJRA 4D6JA 1R85A 1H4PA 4BA0A 1UR2A 1PAMA 1ISVA 2D22A 4W84A 4CN4A 4UFLA 3W53A 2XVKA 3NDYA 4HPGA 2YBTA 1XYZA 4Z2GA 1EOKA 3FW6A 1M03A 1VJSA 4H2CA 2CHOA 1CPUA 1R7AA 3TA9A 3VIHA 1E4NA 5CLTA 4KWUA 3GNOA 3VD3A 1ZBWA 2W61A 1B0IA 1UZ4A 3QOMA 1PEZA 4CU6A 3U57A 4JKKA 5AY7A 3MSGA 1XV8A 1TG7A 3GNRA 5EB8A 1NH6A 4B16A 2CBVA 3CHEA 3K46A 2ESCA 2CKSA 3PZUA 1HJUA 4Z2HA 3UESA 3B9AA 1W9BM 2G3NA 4GO8A 4CVUA 1G1YA 4J3TA 3L4VA 2OYMA 1MQRA 5GNYA 4HZ6A 3UERA 3WD1A 4B9YA 3AMLA 5CSUA 5AYIA 2ZICA 2EPKX 1JYVA 3VIOA 2BXZA 1AQHA 1RD6A 1SR0A 3KL0A 4FMVA 2XWEA 3OLEA 1QI3A 1W9PA 3NSNA 2QMKA 3TP4A 2EBNA 1E6ZA 1HJSA 1D3CA 2DSUA 2GUYA 4JKMA 3BCFA 1UWRA 2FHBA 4M80A 4W7WA 4TTGA 1KB3A 1B1YA 1J0IA 1V3JA 3B9EA 4N42A 4AIOA 4J3XA 1MYRA 2XGIA 2VZTA 2WCAA 3FNDA 1GOIA 5D9PA 3K4AA 1Q6EA 4ATWA 3AZTA 2WNWA 5I23A 2XUCA 4OIFA 1OCQA 1HIZA 2G41A 4AISA 2XIBA 1QI4A 3N04A 4P8UA 1NWUA 2WC7A 1HKMA 4MJ2A 4B3LA 1UWQA 1O7AA 3GXIA 1UA7A 3RO8A 3MANA 3BMWA 4NZCA 4UCFA 3L4YA 1FFRA 2W92A 5C8BB 3VMNA 3A47A 3NCOA 3IJ7A 3POCA 3D3AA 1QI0A 2WBKA 2WLYA 2WZIA 3G6MA 4GZIA 2CXGA 3SUTA 2DSWA 1CGYA 1D2KA 4XB3A 2XIIA 1D7FA 4JFTA 1EA9C 3O6AA 1OGGA 1PX3A 1JAKA 1KR1A 1W9UA 4M56A 3LPFA 3GBEA 4NSBA 1V08A 3GDBA 2WHMA 1IT0A 2DT2A 1UD6A 2FH6A 1UWIA 1FOBA 3VIMA 2D20A 2QHAA 3OZOA 2O9RA 1ZS2A 1NOUA 2X09A 2XFYA 3IAQA 3WEZA 4PYSA 1I1WA 4JAWA 1UH3A 5CJ5A 1CXIA 4FLQA 4P8XA 2WMKA 4W8LA 4J3SA 2WXDM 4WKFA 2WPGA 1BG4A 8CGTA 3CTTA 5IXEA 1L0PA 5JBEA 1H5VA 2VRQA 2OWWA 1K9FA 1C3FA 4QFUA 2VOTA 2X0HA 2ZUWA 3WMBA 4HMDA 3SCNA 2CYGA 3BXWA 3VNZA 3WQ6A 1JG9A 4H7VA 5JIWA 2WVTA 3N13A 1PIGA 3WNNA 3W26A 3WQVA 3TTSA 1UYQA 4B15A 1GZJA 1CGWA 4FF5A 2WC3A 4X9YA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1MXG A;  2CBJ A;  1XC6 A;  5M5D A;  5IFP A;  4Q7N A;  1MFV A;  2A3E A;  2JEQ A;  3VGH A;  4HU8 A;  2ZID A;  3AS3 A;  1W32 A;  1ZU8 A;  3GNP A;  2D1Z A;  3VDA A;  4L4O A;  1BLI A;  2BS9 A;  1MW3 A;  4ZE5 A;  1VB9 A;  2YBU A;  1EGZ A;  2D2O A;  1C7S A;  1UD5 A;  4LGX A;  3U7V A;  2DSZ A;  3GYC A;  2XM1 A;  5ABF B;  1MWO A;  2EQD A;  1UKO A;  1A3H A;  1E4M M;  4J3W A;  2CIT A;  1EHA A;  1B3V A;  5DF0 A;  4AZB A;  4PMU A;  1TMQ A;  4KRT A;  1KCL A;  3NSX A;  1UH2 A;  3NDZ A;  2WHK A;  2PB1 A;  2V5C A;  2MAN A;  1EQC A;  2XWD A;  3AYS A;  1E1E A;  5AYB A;  4D6D A;  3M6D A;  1MFU A;  1PPI A;  2NT0 A;  3AHZ A;  1TE1 A;  2J4G A;  1LWH A;  2JAL A;  4V28 A;  4YHG A;  1CWY A;  1JDD A;  2EPO A;  4PN2 A;  3VO0 A;  2ZWZ A;  4J27 A;  3SEP A;  2BY1 A;  4EE9 A;  3E1F 1;  4Z2J A;  4AWE A;  1C8Y A;  1J0Z A;  4L4P A;  4QAW A;  3SCP A;  5D9M A;  2D0G A;  3EBV A;  3EDK A;  1E70 M;  1W2P A;  3W4R A;  3B9D A;  4U5K A;  4WLC A;  1BG9 A;  3WEL A;  1US3 A;  2OSW A;  4QCF A;  4W87 A;  1W2V A;  5EMY A;  3WH8 A;  1PX4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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