2E5B | Genus

Total Genus 161

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	161
sequence length	476
structure length	466
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structure and reaction mechanism of human nicotinamide phosphoribosyltransferase pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus	161
structure length	466
sequence length	476
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-12-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2e5bA02

1QDSA 4NX5A 3SGZA 1T8XA 2J9YA 2C6QA 3O6CA 1KLYA 1HO4A 2WOQA 3GNNA 4HNNA 4XTDA 4LV4A 5E93A 1LBMA 1XBXA 4PODA 4TR9A 4GXMA 2A5HA 3O16A 3O06A 2E6YA 3CLMA 1RV8A 2JKAA 1VH7A 4DF0A 1YXYA 3SJ3A 1EB3A 2YPIA 3CTLA 2VKZG 1OFPA 5G4EA 2NV1A 3P82A 3CEUA 1O5XA 3NG3A 3N73A 2QCGA 5AHEA 2J88A 4LV9A 4AWSA 8TIMA 3W2KA 1R30A 3I7SA 1GPWA 3TJXA 4UTKA 3YPIA 3ZWSA 1MXSA 3F1QA 2IQTA 2EPHA 3PBUA 4UFKA 3MYOA 2BZNA 1PVNA 3ZS4A 3TJLA 1L9WA 2DZWA 1H63A 1OG0A 3DFQA 4NZJA 5KSWA 1SU5A 1O5KA 4XUGA 3H55A 2JKPA 1FCUA 1XFBA 3C3NA 3SIZA 3HOJA 4YL2A 3M44A 4YWIA 1ML1A 1VCVA 2P0OA 2B7QA 3TE9A 1FWWA 3EWWA 3NQ6A 3L5AA 1KM1A 1X1ZA 4R53A 4BWLA 5AC7A 4UTTC 5GVJA 1DL3A 3TAOA 2B7NA 3TR2A 4XZ9A 3KRSA 3DH7A 2NXIA 3IV3A 4LS0A 2Z1BA 3NQMA 3TW7A 4UFJA 2NV2A 3NPVA 1SO5A 2JGYA 5KZDA 1HL2A 4JN6A 3LLFA 3TQ0A 4O15A 4MKNA 2D73A 2PE4A 2ZA2A 1WA3A 2QF7A 3ABRA 1G4TA 3GZ3A 5C55A 1TPFA 3QQ0A 1XCFA 1GYLA 2Y63A 5CZJA 1OK4A 2QCCA 1W5OA 2YR1A 2YZRA 1L2UA 4PH6A 4GFSA 5D09A 2V81A 3QSRA 1GEQA 2ISVA 2H3DA 1FDYA 3L0GA 3PB2A 1LRQA 5IBXA 1PL9A 4LY8A 2EHHA 4FXSA 1I45A 4NJGA 2V9DA 2CLKA 1NEYA 3P8JA 4FB7A 3MP4A 3C2VA 3UWVA 4UTUA 4N2YA 1D9EA 1OFOA 4Z1DA 4ZMGA 1OFBA 3A21A 4AB4A 2H3BA 1JCNA 2VOMA 5J5RA 1SSDA 3QH2A 5LGXA 5TIMA 3LLDA 2NXGA 4KFPA 1F6PA 1S5WA 1TPEA 4OU1A 4JXCA 2GPTA 3KX6A 3EX6A 4MZYA 3O63A 3EXTA 3W7KA 4OGZA 3GIYA 3LV6A 4BI7A 3NZ1A 1Q45A 1DJQA 4DF2A 4P61A 3BK0A 4DO4A 4I7UA 3UPBA 1SSGA 4XBSA 3PC0A 3ZWTA 1AW5A 4Y9AA 1H1ZA 1QFEA 3C6CA 3W1TA 2ZA1A 2ZRUA 1BEUA 2HS6A 4LVAA 4N9CA 1XDMA 3LCLA 3IGXA 5FI8A 5IM51 1P1XA 3C56A 2V8ZA 1JQVA 4JYDA 4Y90A 2RKXA 4WOQA 3S0CA 4LT9A 3EWBX 3KHJA 3LB0A 5CPNA 1OF6A 1T0OA 1W31A 2CZEA 3S8HA 4UFHA 3KXQA 4UMBA 3W7NA 1FDZA 1W56A 1PCKA 3QMRA 1I2PA 3IIXA 3QFEA 1TPUA 3THQA 4UTLA 2V2DA 1QO2A 3TUUA 1IXPA 4RR4A 1QPQA 3GLCA 1VHNA 4CCCA 3EWZA 4M7TA 1U83A 5CZ0A 4UXDA 1TTJA 4NVTA 1JCMP 1H7RA 2YSWA 3W88A 1QO5A 3MI6A 2QCNA 3LTPA 5I3GA 3R5EA 2ZZ1A 1H62A 2DU2A 1WYIA 4IMFA 2A0NA 3WK2A 3UY7A 4Y8FA 1TYGA 1OFDA 2ALDA 3UPWA 4LC8A 1KA9F 3ZR4A 1JUBA 1DV7A 3NA8A 4O18A 1GVFA 1K3UA 1WXJA 3M5YA 4Q4KA 3HPSA 2VEMA 3FYOA 3I7QA 3GKFA 1TSIA 3LV5A 4CQ9A 4LTSA 1QR7A 3W2MA 2OMAA 3MI2A 5CGQA 1FUYA 1LORA 1AW1A 3MO7A 3RK8A 3TIMA 4O16A 2RHGA 1EWEA 2Z6JA 1KLZA 1PV8A 3S1UA 3NQDA 3W1UA 3C2OA 3ATZA 3PS7A 3WK0A 3DXIA 2TRSA 1JJKA 5I3HA 4AF0B 5LNSA 2QEZA 5AYZA 3QMSA 4O10A 4ONVA 1GWJA 4PFMA 3W7JA 3DFTA 1QWGA 3W7HA 2ZCGA 4I7VA 4UCGA 1OYCA 2VXNA 3R12A 3WK3A 1THFD 1VQTA 3GB6A 2CZ5A 5BOOA 3LBMA 2NXHA 1ICSA 3N9SA 4U28A 5D2YA 2EKCA 4IMGA 1H50A 1MSSA 1CI1A 4ZZ9A 2QUUA 1ZENA 2VFIA 4XQ6A 3C61A 3MHUA 4Y6GA 3N34A 5HNRA 3D0CA 3A22A 5F1VA 3LHWA 3HBLA 3W7DA 3B0PA 3EEGA 3S5NA 1VR6A 1TPVA 3T7VA 4IOTA 1GOXA 1ZNNA 3O8AA 1B57A 3CM4A 3HG3A 4LVFA 3BG5A 3KVJA 1TJPA 3MUXA 3C2RA 1GVSA 4MFDA 2ATMA 2TSYA 1KM5A 5K9DA 1OHLA 4E2DA 2FJKA 1Q6QA 2PRHA 5CPMA 4MY9A 1TV8A 2DJLA 3EKLA 1LCOA 4MOZA 1FXPA 1BWLA 4ZQCA 1VYPX 3FS2A 5H91A 1IXOA 3HG2A 1E51A 1EPXA 4KFOA 5ABTA 4ZQRA 4HNUA 3P84A 4E0CA 1JVNA 3BG9A 5AHNA 3ABQA 4QAIA 2V0TA 1W5PA 1ICPA 5KINA 4EWND 4JTTA 5KZMA 3BLIA 3V1PA 1K7XA 1A5BA 2OT0A 3FJLA 4FHAA 3GR7A 4GBUA 1TREA 3TV8A 3EXRA 2DORA 3HPXA 5G4WA 1XI3A 2HTMA 4A2RA 5CZTA 1A53A 1O4UA 1B4EA 2B7PA 1WOBA 2ZZ6A 2FB3A 4HPJA 3GXPA 2CW6A 3EWXA 3W7QA 1M5WA 3KRUA 5U7SA 2ZRXA 2C18A 3EX4A 4AMAA 3LHVA 4DPPA 3W2LA 1G6CA 3UYCA 1LM1A 2FLIA 4JIPA 4LOCA 3EXSA 2O7QA 1FWTA 5DLCA 1MEHA 2Y88A 4FNUA 1A5AA 2WSRA 2NX1A 3L66A 3LXBA 4R34A 2QJIA 2ZZ4A 3CIWA 5D2TA 4AWUA 4WOZA 5E0KA 3CIXA 1ZAIA 3O1NA 3QPYA 1J4EA 1GJPA 1TPDA 3G1DA 2AGKA 5FF7A 1N55A 4DF1A 3JRKA 1XKYA 1A50A 1K02A 2BX7A 2GQAA 1K7FA 3OVQA 1LTDA 2VFFA 2CWNA 3F03K 4JGDA 2QCLA 2R8WA 4MJMA 4RXGA 2VENA 3C2EA 3W2NA 3W85A 4RCXA 4O57A 2VEIA 3G22A 1X8FA 1B4KA 5TQLA 3GR8A 4WZHA 3KRZA 1LRTA 3CEPA 1UUOA 3ELFA 1G4SA 4DPQA 4FEZA 3LRMA 3M9YA 1KM3A 3NQFA 3PWAA 4YLWA 4UC5A 4K8HA 1PCWA 4GNJA 2JKEA 2ZDRA 4RJEA 3NNTA 4NNCA 2PCQA 1F73A 1KFCA 2WKJA 7TIMA 5HR6A 1SW3A 4KKXA 5EYWA 2Y6ZA 4A29A 3IIVA 2A7RA 3LRKA 3BGJA 4X22A 2FTPA 2JGQA 3A9IA 2E5DA 4UFLA 3V75A 3G0UA 3BV4A 1H7OA 3SGUA 2TYSA 1G4EA 3HGRA 2YYTA 4O4WA 4HPXA 3OIXA 1OFAA 1XL9A 2AQWA 3C52A 4HHPA 1LP6A 3S5OA 3G1VA 3MBDA 3NM3A 3HIJA 5BMWA 4LNYA 1TPWA 1Q6OA 4CCDA 1X7FA 1RQEA 5K4ZA 3QQ1A 2ZZ7A 1G4PA 2QUVA 3RU6A 1K8YA 4FX7A 1OX5A 4POCA 4RK8A 1F7BA 4BF9A 4IMDA 1VCFA 1NAL1 4YMZA 3R8RA 3M5VA 4JEQA 3TNOA 3NZRA 5LKYA 2Y62A 3R2GA 4EF9A 3NQEA 3L5MA 3IVSA 2NLIA 2Z0IA 4CQ8A 3QZEA 1RQBA 4S2BA 4W9TA 5K9XA 2QDHA 4FNSA 5CSRA 3OG3A 1OABA 2E5BA 3P62A 2DJXA 1ALDA 3W1NA 3W75A 3L0KA 3MHFA 1ZY9A 5KMYA 4BK9A 2BXVA 3OHIA 1HTIA 1N7KA 2B7OA 3PSWA 1O60A 3B03A 3PULA 2DZSA 3DAQA 3EX1A 2QCEA 2Z2UA 3LHUA 4HSNA 1KW1A 2CLFA 4PA8A 1L6YA 2V5LA 4GUFA 1SO6A 5FF0A 2PRMA 1K8ZA 1U5JA 3L5LA 4HNTA 3BLFA 3QW3A 2YW4A 5D33A 1SUXA 3PBYA 5F4WA 1LROA 2ISWA 1EEPA 3HG4A 5L6UA 1LBFA 2QJGA 3I7RA 3LGEA 2HMCA 3O15A 2CZFA 4O54A 3L67A 2WQPA 4TMBA 5DY3A 2A21A 3HF3A 1GVQA 2H6RA 1JCXA 5DCEA 3WJZA 4UNLA 2KZHA 4JD4A 2QR6A 1ONRA 3RNDA 4NJIA 3N2XA 1VGAA 5G1YA 4QNEA 3T40A 1EUAA 4TU1A 3UZ5A 2R14A 2WNZA 2JK2A 3IVTA 4JS3A 3MMTA 4LS1A 1TPH1 4IX2A 5AHLA 3BARA 3H54A 3GDMA 3WJYA 3Q94A 4WY0F 3DHFA 3NR0A 1IXNA 1F2JA 3DU0A 4Z0SA 4Z1AA 1EWDA 4WXYA 1GG0A 3G1YA 1N8FA 2VFGA 3W71A 1DVJA 1JULA 1DBTA 3W6YA 1JCJA 5J5DA 1NVMA 5K9CA 2A1YA 4UTTA 5F2MA 5K3VA 2QAPA 1AL8A 5FEXA 1NSJA 2PRLA 2WPBA 5D2VA 3NL5A 2NZLA 1DJNA 4N4PA 3P7YA 3GDLA 3QMTA 3L9CA 3GNDA 2X2GA 3UZJA 3QW4B 2CFFA 3W07A 2A7PA 2WV8A 2HSAA 1O95A 4O28A 2C14A 3RF9A 2I14A 1EA0A 3W7GA 4MLJA 2WJZA 3PBWA 2BSLA 3E02A 1IGSA 1LLWA 2Z6IA 4I9AA 4TX9A 3L21A 5LSMA 3QPZA 5LZLA 2C0AA 4FNRA 5AHIA 1JCYA 1KFEA 1DORA 3PY2A 5FF2A 4H6KA 1CW2A 1GTHA 1C29A 4EIVA 3W76A 4ORMA 1L6SA 2XN2A 3MW7A 3TX9A 4OBTA 4ZL1A 1RD5A 4AXKA 2GOUA 3NGJA 2I1OA 1H60A 1R47A 4UR8A 2C1HA 2E09A 1UB3A 2C3ZA 1S3HA 1OVDA 2EGZA 3PUOA 1TV7A 1XUZA 3GDKA 1BWKA 3LERA 4C1KA 4IMCA 4JYEA 1K7EA 3E96A 1ADOA 4O52A 3W1RA 2NWRA 4GUGA 2VFDA 3T78A 6ALDA 2Y89A 3BPWA 3TK7A 1V5XA 3CT7A 4O0ZA 2ZZ2A 3W7MA 3DI1A 2G5WA 4FO4A 5G5IA 3NEVA 5MHBA 2I9EA 3GVGA 2CLLA 2QCFA 5A5WA 4NNBA 1VZWA 2E68A 3VI2A 3W1MA 1KFLA 3NQAA 4IUOA 2BTMA 2YXGA 3OVPA 2J9XA 1GZGA 3W84A 2Y7DA 1UBSA 4MYAA 1XBZA 3UWWA 2UV8G 3B04A 3LCFA 3O07A 1I4NA 5F1UA 1WX0A 2J6XA 3W74A 1D3GA 4RZ5A 1YXDA 4ALDA 3B06A 1HO1A 1C8VA 3NQ7A 4WQ6A 3UD6A 1V7YA 1NF0A 1FDJA 4N9BA 4N4QA 1DQXA 3N19B 4MFEA 4WD0A 4YCOA 1PS9A 2PC4A 1B3OA 5H2ZA 3DENA 2FIQA 5HUOA 3KVMA 1KFBA 3M6YA 4ICNA 2GJNA 3M16A 2FB2A 1H51A 3QYQA 1YPFA 3DI0A 3TA6A 2NWSA 3VFLA 4JNMA 3S5YA 2ZTJA 4O17A 4UTHA 3WJXA 4LRSA 4IWWA 3G1HA 3W23A 1OYBA 3QEZA 2CU0A 3P60A 1EIXA 2P10A 4MYXA 3GDTA 4JTFA 1S5TA 1MZHA 1XUUA 3E49A 3LHZA 1ME7A 3EWUA 4IPJA 1XDLA 4GC4A 1XXXA 4UTJA 1JCLA 5HMSA 1LOSA 2LLEA 2J9ZA 1H7PA 2A85A 3A24A 3TQVA 3W7RA 1Z42A 2CZDA 1I2OA 5CZSA 1YPIA 5D2XA 1TRDA 4GUHA 3WJWA 3BG3A 4JIQA 4UTWC 1FQ0A 1EUNA 3OBKA 4OWGA 1Z41A 5D38A 3N3MA 1WDWA 3GKAA 3NQ2A 3TU9A 1VLWA 2W6RA 4AWTA 3M5XA 4XWUA 2OCZA 3DFPA 3GAKA 4KWVA 4CLMA 5KZEA 2DZPA 1L6WA 4JY8A 4JTEA 3W3OA 3U6WA 3LXAA 1Z44A 3CB8A 3NL2A 4CQAA 1KM2A 1K03A 2X30A 3BW4A 3LCGA 1H7WA 2Q3OA 3NL6A 4UUIA 3P5ZA 4O14A 2JBMA 1TJRA 1P4CA 1FCBA 3I68A 4OV4A 2V2HA 3VE7A 4O1DA 4CNPA 1W3IA 1IIGA 4MIMA 3JS3A 1OX4A 3TXVA 5F2IA 4C1LA 4QM1A 4E2BA 3IRDA 3W1AA 1M7OA 4JY9A 2FDSA 5LNRA 3MWAA 1TV5A 4O53A 1UCWA 4X2RA 2YGYA 4FXRA 2FPYA 3LRLA 4O19A 4NU7A 3R13A 1W0MA 5D37A 3NO5A 4FNPA 3TQKA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2E5BA

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