2E5BA

Crystal structure of human nmprtase as free-form
Total Genus 161
50100150200250300350400450020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
476
structure length
466
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLN
50100150200250300350400450400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure and reaction mechanism of human nicotinamide phosphoribosyltransferase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 161
structure length 466
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2006-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e5bA02
1L2UA 5CPMA 4W9TA 1R2RA 2QJIA 3M43A 2X1SA 2J24A 4NT0A 1GZGA 2CLHA 2Q3OA 5EY5A 1AW1A 4UTTC 4DELA 3EWZA 2CLOA 3L66A 3W87A 3P60A 1XBVA 4PFMA 2ZRVA 1WBHA 4A22A 1JR1A 4IMFA 2E09A 2H8ZA 1LBLA 3NDOA 1GOXA 1TTJA 3LOTA 4O1BA 3UXDA 1KLZA 3DKJA 5TIMA 4R53A 2J27A 1V5XA 3RLVA 2ZA1A 1SO5A 5I3JA 4IMDA 5D2WA 3HPXA 1MO0A 3DXIA 1TQXA 4IXHA 1JQVA 2J6XA 4TR9A 1XC4A 2NUXA 4ALDA 4K6AA 1P0KA 3G1VA 2J9YA 3DHFA 1H7WA 4WJEA 4AHQA 4I7VA 1YPIA 1KM2A 3R13A 3L5MA 3E0IA 2VC6A 1K8XA 1KM3A 2B4GA 2VELA 4JXCA 1R2TA 2Y88A 5BNKA 5KMYA 1QPNA 1F2JA 1R30A 3DBPA 1KV8A 4KKXA 4HSOA 4KFPA 2ZZ6A 5TQLA 2CZ5A 3F03K 3IIOA 4LVDA 3FYPA 3W1AA 3PR2A 1TPDA 2CW6A 1OX4A 1GG1A 4YMZA 1QPQA 4WY0A 1H61A 4UFMA 1NF7A 2X16A 1LORA 3SIZA 4K36A 3TFCA 2PC4A 1TV8A 2ZRXA 3W7DA 3B06A 1S3HA 4N9DA 3L0KA 3LCWA 4JTHA 2C0AA 1PHWA 3O6YX 4E2DA 1SO4A 1GYLA 3TKFA 3VKJA 3USBA 1XFBA 3C4UA 2CZDA 3PB0A 4HT3A 3W2MA 2C3ZA 1GT8A 1XCFA 5AHEA 5GVJA 1VYSX 1W56A 1JRBA 5HWJA 2JKPA 4WOZA 1SSGA 2ZRWA 3HG5A 2WJZA 1EP3A 4XBSA 4N4PA 2A6LA 2TMDA 5EBUA 2H8XA 5L9FA 3OVPA 4O4VA 4FNUA 3T40A 3EX3A 1JULA 4N9BA 2VFIA 3GIYA 1Q3NA 1EA0A 4UTKA 2QCEA 1QFEA 2C16A 3I6RA 3BPWA 3LTSA 1TO3A 5F1UA 4NX5A 2AAMA 3VCRA 3DFQA 4O28A 4MVAA 4LY8A 1Z44A 4M6QA 3UD6A 4IMEA 3PY2A 1JVNA 2IQTA 1NEYA 4AWUA 1HUVA 1GVRA 1PV8A 3W88A 4Y96A 1X8FA 4WUIA 2BWGA 3B04A 4H6KA 4AVFA 5K2ZA 3A9IA 3G18A 4FX7A 1A53A 4UNKA 4A29A 3BLEA 3HPSA 1IXPA 3EEGA 4U28A 1TTPA 3G3DA 4BFAA 4O4WA 4DPPA 3PSWA 4QNWA 4WY0F 4TIMA 1J5TA 2KZHA 3NQMA 3TA6A 3RFAA 1XUZA 4M7TA 4UNLA 1YDOA 2DZWA 3B05A 1ZALA 4X3ZA 2AQWA 3S0CA 1MSSA 2X30A 3W70A 1ZJIA 3M5VA 1JCJA 1LYXA 3LRLA 4RKAA 3NQVA 2YSWA 4N9EA 3TROA 2VFEA 2DZXA 4H3DA 2WNZA 4O14A 3UY7A 3P80A 3THAA 3TSDA 3PUOA 2DJXA 5AC6A 3SY5A 3F1QA 2NZLA 4N02A 2YXGA 4NQ1A 5BOOA 3CC1A 3T44A 3SECA 2VKZG 3QMRA 4TMCA 4GC4A 3FS2A 3GXPA 3R8RA 4WX2A 2JGQA 2W79A 2E6YA 1B4KA 1GJPA 2XN0A 4PA8A 5CZ0A 3B0PA 1WOBA 1YYAA 1SPQA 1TPWA 3FKRA 4G1KA 3PUDA 1KFBA 2WQPA 4S1FA 2Y7DA 4N2YA 2R8WA 3A21A 1C9DA 2NX3A 3JS3A 3OEXA 1DBTA 3BARA 4PH6A 1FWTA 1LRQA 1I2NA 3Q37A 2YR1A 2G95A 5FF2A 3QMSA 4QAIA 4KWVA 3MYPA 5KZMA 3O1NA 3LDVA 1PCWA 1NAL1 4M7SA 3O6CA 4MLJA 2RHGA 2D73A 3MYOA 1X1OA 3LLDA 1O94A 3PBVA 4M5PA 3HGRA 1AMKA 1WDWA 3I7QA 3T55A 2TRSA 5K9CA 5D2XA 3DFTA 3TXZA 5D2TA 3PBYA 1W8SA 3EWYA 3B4UA 2V2CA 4GWEA 1AK5A 2V81A 2V9DA 2E6AA 3CT7A 5U7SA 4RZ5A 2F84A 3PBUA 3S5ZA 2E5BA 3LBMA 1XL9A 4UR8A 2Q8ZA 2VEKA 3W7LA 1LOSA 4Q33A 3C52A 3NZRA 1I4NA 4MFDA 4PL1A 3UQNA 4U4MA 1FDJA 2QAFA 3VI2A 5G2IA 1JQXA 3GX9A 3PWAA 5CGQA 2A0NA 2QCHA 1ZENA 3LERA 3M5ZA 3R2GA 1KBJA 2P10A 3O16A 1SFLA 3C56A 4JD4A 3NL2A 4LRTA 5D02A 1Y0EA 3Q58A 2V82A 3C3NA 3G0UA 4UC5A 1TB3A 2YYUA 1D3HA 2ZA3A 1GVQA 1O5KA 4GUGA 4LS0A 3ZR4A 4Y9AA 5AHMA 4JTUA 4EVZA 5HMSA 4BK9A 4AWTA 1LTDA 2VOMA 3W7JA 1YXDA 4C1LA 2DZPA 3FJLA 3N34A 4MJMA 5E1QA 1G7VA 4P2VA 3BO9A 3MW7A 4UXDA 3W7MA 4R34A 1X7FA 3TFXA 3M16A 3E12A 4GFSA 1KTNA 1G4SA 1JUEA 3GB6A 5FF4A 3LHTA 3BW2A 1LP6A 3MI3A 3CU2A 1H51A 1ADOA 3FIGA 2HMCA 2A85A 1PVNA 4ZMGA 3P61A 1EX5A 4O57A 4BI5A 1WBJA 2CU0A 4LNYA 4DO5A 2FB3A 3MP3A 1OX6A 3G1FA 4YCOA 2DZVA 2VFHA 5FEWA 1SO3A 2RDUA 4QSHA 5HNRA 3KVMA 3M1ZA 1C8VA 2E5CA 1SZFA 1F6PA 4DF1A 1BWLA 1EP1A 3SFKA 1EIXA 5C6MA 4IPJA 3TIMA 2PRHA 3O8AA 5AC8A 3FJ6A 1PHQA 2VFGA 1KM5A 5DY2A 1LOLA 3VE9A 4LVBA 3TDFA 3HF3A 4HN4A 3S6DA 3HGJA 1LRTA 4AMAA 1IF2A 4IPIA 1ZY9A 4YCPA 4WZHA 4K7YA 1Q6QA 2P0OA 3LBCA 4UFHA 3BV4A 3TC6A 4O54A 2GVLA 1SZEA 1ZAHA 1O5XA 1ICQA 4IMGA 1QDSA 5AFDA 3CIWA 3NQEA 1A50A 3TMLA 5EYWA 4A21A 3M5YA 1WXJA 2ZA2A 1TPB1 3UWVA 2Z2UA 1EUNA 1OF8A 4NU7A 3L9CA 2NWSA 4O13A 4UTWC 3TW7A 1TRDA 1GVFA 3MUXA 1LROA 3QMTA 1W5QA 1VCFA 1EEPA 1WQ5A 3NA8A 3LHYA 1GTEA 3T4CA 1A5CA 2V2HA 3NG3A 4ICNA 5AB3A 1MEIA 3LCIA 5AYXA 4JN6A 1TJRA 6ALDA 3EKZA 2Y7EA 1CI1A 3H53A 3S1XA 3W1RA 3L67A 1RZMA 3G8RA 1DQXA 1M5WA 1OHLA 1G6CA 4RK8A 3SGZA 5DLCA 1B9BA 4LW7A 1W1ZA 1PL9A 2X1TA 4ZQMA 2A1YA 4LUIA 5CZSA 3L5AA 2Z6IA 2ISVA 5G4EA 4MJZA 5AHFA 1H7OA 4JTEA 3W7PA 2FB2A 4I9AA 3QPYA 4MZ8A 2BXVA 3LB0A 5EL1A 2QJHA 3GDMA 1W5MA 4N9CA 5G2HA 4AF0B 1TV5A 1DKWA 1L6WA 3NYZA 3NOEA 3E96A 3HPZA 5E0KA 1OK6A 4MFEA 3TUUA 2JKEA 1G7UA 4DO6A 2OMAA 1FWNA 3D0CA 3HG2A 1H63A 1SFJA 1G69A 2ZZ2A 5F2LA 3QC3A 3O15A 3L0GA 5LNSA 4JEQA 4NNBA 1W0MA 2ZZ4A 3DH7A 5D2YA 3DKLA 1D3GA 3EWBX 4Y8FA 3EKLA 1B4EA 5G2WA 1A5SA 4WXZA 3G1DA 2QDHA 3M47A 1E51A 2A6NA 3HIJA 1TV7A 1K8YA 4BWLA 2VEPA 5AYZA 4DPQA 4AB4A 3LCGA 3E9AA 2CFFA 2A7RA 5LNRA 1DL3A 3HMJG 3HB9A 3WK3A 3WJYA 4ADUA 1KFLA 5HUOA 3PG8A 3IVTA 1SW0A 3FFSA 3LCHA 4PTNA 4NJKA 3LGEA 4NNAA 3PC0A 1W37A 3PSVA 5LHFA 1QPRA 1N55A 3G8EA 1TPC1 3S8HA 2DJLA 2F7FA 2OT1A 1ICSA 3O06A 4ZL1A 1K03A 3UWZA 5HJLA 1TQJA 1ZAIA 4MZYA 5MHBA 4O8RA 3GAKA 1DVJA 4MLRA 3INPA 3G1HA 4O18A 5DBUA 3VE7A 3CTLA 1AW2A 1VS1A 3W86A 3IVUA 2QCMA 4XBKA 1QOQA 3P8JA 5BRBA 1AG1O 2TYSA 5DCBA 1F6KA 3G1SA 3ABOA 1ML1A 4TU1A 3GXNA 3M41A 3ELFA 3ZWSA 4DBEA 4O15A 1B3OA 3M6YA 4AAJA 2B7QA 5D09A 3B0VC 3UWQA 2QUTA 3IV3A 4IX2A 2G5WA 1XUUA 5FI8A 1ME7A 2E6DA 3WJXA 4CQ9A 2G96A 5H91A 1FCBA 5IBXC 1VCVA 1GTHA 5L6UA 4RX0A 4RR4A 4UFJA 5T26A 2PE4A 3TV8A 3O6DA 2QCDB 1UJPA 3NR0A 1KA9F 1XBYA 3B0UX 3W2KA 4DQWA 1ME8A 3HGOA 1VJIA 2VFDA 3GZ3A 4AF0A 2QEZA 3KXQA 3GNNA 4IMCA 1N8FA 1TTIA 2Y70A 4MOZA 5H2ZA 3TE9A 4JY8A 5AHLA 1TPUA 1DJNA 3NQFA 3TX9A 3Q94A 2QCGA 5D37A 3AO0A 5EPDA 4MYXA 1F05A 5CPOA 2FPYA 2Q3RA 4LVGA 3W71A 1OX5A 3S5YA 1ZNNA 1J2WA 3O63A 4NJGA 3A24A 3NQGA 5BMWA 3DU0A 5C54A 1T99A 2NXHA 3GXTA 1QO5A 1NFBA 2NXGA 3WK2A 2WO5A 4RZ4A 2QCLA 4UFLA 1OYAA 3GVGA 4EF9A 1LCOA 1SU5A 4O1DA 3QM3A 3IRDA 1I8JA 4ONVA 2ABBA 2R14A 4HKPA 1K7FA 3LXBA 2DORA 2CZEA 2PURA 1EPXA 1VYRA 3A22A 1HO4A 1TPVA 5D04C 1I2RA 4UCGA 4B5NA 1WV2A 1ZFJA 4NJIA 2Z6JA 3BK0A 3WJSA 3W75A 2BSLA 5FESA 4E2BA 1SUXA 2QF7A 3I7RA 3C2VA 3CLMA 1DOSA 4Q32A 4FF7A 1LBMA 3G0SA 1QNVA 3GYEA 2FQIA 4EOUA 1LBFA 1X6UA 3G1XA 5F2IA 3GK0A 4AHPA 3M9YA 2ZZ5A 3BG9A 4Q4KA 1MZHA 3MHGA 1K8ZA 2WPBA 3CHVA 3W7IA 2NV2A 3U8GA 2GOUA 3DENA 3MWAA 4MY9A 3STEA 1MEHA 2V8ZA 3G3MA 2GUUA 4Z1AA 1UB3A 5K9XA 4HNTA 1T8XA 1K7XA 5CSRA 1FDZA 3LM7A 2NWRA 2NLIA 4NJHA 2I14A 1I2OA 1FY6A 1GQNA 2NX9A 1LLWA 3GNDA 2ZCGA 4GUFA 2QCDA 1H62A 4O52A 1THFD 4PEKA 2E68A 3W83A 4GUIA 2JBMA 1QR7A 5LKYA 4HNUA 3S1WA 2ZZ3A 2A7PA 4MIMA 4O53A 2OCZA 1U5JA 1ZAJA 2J9ZA 1JJKA 4LT9A 2GQ8A 2V5LA 4S2BA 2Y89A 3SI9A 2GPTA 1K7EA 5C5YA 5DBTA 1OFDA 4JR5A 5FF0A 3P5YA 4X22A 1WAUA 4CNOA 4NZJA 1JCYA 1OJXA 1I2PA 3NM3A 2CLIA 1VH7A 1EUAA 1LRNA 4UTIA 3THQA 3UWYA 1H1ZA 2YW3A 3RF9A 4GBUA 4ORIA 2E6FA 3A5VA 1R2SA 1H7PA 3A23A 3IIVA 3TSMA 1XDMA 1OFOA 3I68A 3L2IA 4HNNA 4Z1DA 4OU1A 3LHWA 3R89A 1HO1A 1I2QA 3GDKA 3CWOX 3KHJA 2H3DA 3PBWA 2Y61A 4UMAA 3G0XA 3PM6A 1WYIA 2Y6ZA 2R94A 4MY8A 4KFOA 5HULA 3IGUA 4XZ9A 5F2GA 4EF8A 2BX7A 5K4ZA 5ABTA 3EX2A 5D05A 2O7QA 1OVDA 4LC8A 1ME9A 3KRZA 4R33A 3I65A 4K39A 3G1AA 3EWWA 1W3NA 4ML9A 3C8FA 1LLZA 2I1OA 3P67A 1RQBA 2C14A 4IX0A 3W22A 5I3IA 1GYNA 4UFKA 3CWNA 1W3TA 2H6RA 1VR6A 3SJ3A 1Q6OA 2ZRZA 4TMBA 1QCWA 4J9JA 5KZEA 1BWKA 1OABA 3QSTA 3GDTA 1MEWA 1XDLA 2ZDRA 3NQ6A 3PUEA 2WV8A 3W1TA 1BEUA 3GDLA 5D03A 3N2MA 3CPRA 5AHNA 1RR2A 1TCDA 2GJLA 4CNNA 4BR1A 4JTGA 5D30A 2C13A 3EWXA 4MPQA 2HTMA 1U83A 3QJAA 2W6RA 3ATYA 4YWIA 2ATMA 4FIRA 5F1VA 1JUBA 4PCFA 3NZ1A 3W6YA 1ONRA 1UUMA 1JCLA 3BGGA 4IJBA 3PG9A 3RU6A 1WOAA 4UTUA 3QSRA 3W76A 2C1HA 2QUVA 5G4WA 2UV8G 5D2VA 3KVKA 2ZRYA 3M7WA 4Y6GA 1YDNA 1QMLA 4XKYB 4PC8A 2RKXA 3C2RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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