2E6DA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with fumarate
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase complexed with substrates and products: atomic resolution insights into mechanisms of dihydroorotate oxidation and fumarate reduction
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 105
structure length 312
sequence length 312
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2006-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2e6dA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e6dA01
3O07A 4O28A 4LVFA 1ICQA 1NEYA 1UJPA 4XUGA 2VFFA 4GWEA 2VEMA 1W5NA 2QAFA 4OGZA 3W2UA 1UUMA 4IPJA 4OWGA 1W5MA 5A5WA 4O1BA 3TFXA 1D3HA 1W1ZA 3IIVA 5LHEA 5DBUA 1GJPA 5I3IA 3B06A 4KFPA 3DFSA 1TO3A 5AHLA 5DCEA 3N2MA 2J9XA 1XI3A 4OU1A 4LY8A 4AWTA 4FX6M 2ZDRA 3B04A 4AF0B 1VCVA 2VOMA 5U7SA 3EWWA 4NZJA 5K2ZA 1WYIA 3TQKA 5DXXA 3MP3A 3L2IA 3LBMA 4UIOA 3LHYA 3PG9A 3EXRA 3HGSA 5D30A 1H1ZA 1VYPX 3QSRA 3IIXA 2QUUA 1QWGA 3M5VA 4ZQPA 2DZPA 4NJJA 4C1LA 4CQ9A 1NSJA 1VS1A 2EHHA 3L66A 5KSWA 1L9WA 2QDGA 3PY2A 1RQBA 1ZALA 3CU2A 4BI5A 4YXGA 1VQTA 3HGRA 1GT8A 2GUUA 2GJLA 5DCDA 2RFGA 3L0GA 4UFIA 3TFCA 3A5VA 4GJ1A 1K8XA 2HSAA 5FF2A 3MI2A 4DBDA 5HQEA 4Z1DA 1R47A 1FDYA 2Z1BA 1MZHA 2PCQA 5AC8A 3CM4A 4A2RA 3LM7A 3W7HA 2A5HA 1H7XA 4AH7A 3L21A 2NLIA 1MEIA 3IIOA 3EWUA 1Q6QA 2W79A 3A9IA 3BK0A 1QNVA 3HG5A 1ZCOA 1GG1A 3GYEA 4JNMA 5A8GA 3W22A 3W71A 2Y70A 3H55A 1FY6A 3TX9A 3A24A 1L2UA 3V1PA 3A23A 3G1AA 3QMSA 4KKXA 3EX6A 3P62A 3SFKA 1I4NA 5DY3A 3HPXA 2B7PA 3LCFA 4JX5A 3QMTA 4OT7A 3TSMA 4K8HA 3S1WA 5D05A 1ME7A 1A5AA 3USBA 4BF9A 3W7EA 2VELA 2A6LA 3KX6A 1UUOA 2H3BA 4GUJA 4Y96A 3DHFA 1U83A 3ATYA 2RDWA 1IF2A 3GR7A 3DFQA 5LNVA 4NJGA 5AHFA 1JCYA 2QJHA 1XDLA 1OG0A 5LNRA 3DFOA 5FF7A 3IIPA 2ZRUA 2LLEA 3FJLA 1K7FA 2CLEA 3W7GA 3MI3A 5K4ZA 1G7UA 4WQ6A 2DZSA 1OK4A 1TPH1 3RK8A 1FXQA 2NXGA 3GR8A 3VKJA 3T55A 3B05A 1VLWA 3ABRA 4RV8A 1OFOA 4ORMA 4WXYA 1WXJA 1ME9A 1XBVA 1C29A 4UNKA 2WQPA 2WSYA 4FX7A 4P61A 3CIWA 2C6QA 3M5XA 3VFLA 2VKZG 2FLIA 3GIYA 4NQ1A 4RLIA 4A2SA 1KFCA 1OFEA 2E6FA 3TQ0A 3Q94A 2JKPA 3IGUA 3TW7A 1A5CA 3FIGA 4M6PA 2W0UA 3CTLA 5D04C 3GKAA 2R8WA 3OA3A 5E1QA 3VE9A 3W1PA 2BLEA 2FFCA 3LHZA 3MYPA 3W73A 3EWXA 1TQXA 1DORA 4O52A 4E38A 2WV8A 3UWZA 2GVLA 1RQHA 2ISVA 1OX5A 3RLVA 1I2PA 3DZ1A 3NVTA 1TTQA 3QMRA 3I65A 3P8IA 2PRMA 3JR2A 5HNRA 3DHDA 3Q2DA 1O5KA 2EPHA 1VCGA 5CZTA 1MSSA 2CLFA 3TJLA 6TIMA 4NT0A 2V2DA 1TTIA 1KTNA 3OEXA 3W72A 3MHGA 2FJKA 2B7OA 4ZL1A 3FEMA 3W75A 1KFEA 3UY8A 4WY0F 2JKAA 2HS6A 3QPYA 3GLCA 5HR6A 2R91A 3TSBA 4CCCA 3W2LA 5HINA 1ML1A 3E9AA 3DFPA 4PC8A 3P5YA 4DELA 2DU2A 3LERA 4HSNA 4LTSA 2AQWA 4LV4A 3SR7A 4UTLA 3YPIA 3CQ0A 4DEFA 1QOQA 4N9CA 5AYYA 5D32A 4IMDA 4Y8FA 3PWAA 4YCOA 4E2BA 3R5EA 2E6AA 5D38A 4UFMA 1TJRA 1QOPA 4GUGA 4XKYB 5DXYA 3S5NA 1KFBA 1OJXA 4YLWA 4RXGA 1SO5A 5J5RA 3W23A 3SSJA 1SO6A 3G1VA 3CLMA 3E0IA 3GNDA 3PM6A 4A3UA 5HMSA 3NPXA 3O8AA 1OFQA 4LW7A 4JIPA 1PHWA 4O14A 1QFEA 2BWGA 1OK6A 2CLLA 4CQ8A 4JGDA 1AW5A 3CEPA 4MJMA 3WK2A 2E77A 1JULA 1KTCA 2QCDA 2XFWA 5EBUA 3LXBA 4G1KA 5DY2A 3IIZA 1QPQA 4LC6A 3ABOA 1K3UA 1QMLA 3WK3A 3M1ZA 1YPFA 4QIUA 3HBLA 4HHPA 1PL9A 4A29A 4NNBA 1SW3A 3NQEA 4LVGA 4KWVA 2ZA3A 4DPPA 1DJQA 3W07A 1OYCA 4O13A 1GWJA 4MY8A 1P4CA 1YXCA 2Y63A 4Z1AA 1OYAA 2DJLA 4M19A 1XBYA 4O10A 4IMEA 1XKYA 2WNZA 2J9ZA 2GQ8A 1SFLA 3O1NA 3LHWA 2C16A 3W70A 2PURA 3NYZA 1FWWA 2V5BA 4ML9A 4UTHA 1ADOA 5F1UA 5FEXA 1R2RA 4OV9A 3BG5A 1PIIA 3UPBA 4CLMA 3HG2A 1TTJA 2EAWA 3LV6A 4LRTA 2WSQA 4UTMA 1QPNA 3QPZA 1AW2A 5HJLA 3V75A 1XFBA 3NG3A 1VYSX 1G67A 2BTMA 3S8HA 4K7YA 1NAL1 1I2OA 3PC0A 3M0ZA 1LRQA 4YWIA 3TC6A 3C52A 4JY8A 3FKRA 3WJWA 3A22A 3NR0A 2YR1A 3PR2A 4FX8A 1UB3A 4WY0A 3W9ZA 3I6RA 4QITA 4A21A 4ZQRA 1I2QA 4UXDA 4RCXA 2CLMA 2W6RA 5K9DA 1LZOA 1GVRA 4FNUA 5KTLA 2C0AA 2Q3RA 2YCEA 1H7PA 2EGZA 2E09A 4RZ5A 3S5YA 3PBYA 1F5ZA 5EY5A 2B4GA 1H5YA 1TIMA 3EX3A 3UZJA 4KFNA 4GBUA 3GAYA 2PRLA 1G6CA 1SZGA 1PE1A 2CZFA 3PB0A 3O15A 2DZTA 3MO7A 3IRDA 1N7KA 3ABQA 2WNQA 3B4UA 5K9CA 2FB3A 2ZA2A 4MOZA 2X1RA 4Q4KA 3LHVA 1ZENA 1EIXA 3W6YA 2I14A 4N9DA 3S6DA 4LNYA 1X1ZA 3W7DA 1TPUA 1OX4A 4O8RA 4O1DA 2YXGA 5F1VA 1F76A 1XL9A 1FUYA 1DL3A 5EPDA 3LDVA 3LLDA 4NZFA 4H3DA 3CIXA 4DF2A 1Q45A 5LNSA 2VFDA 3W2MA 3PBVA 3C2OA 1FWNA 1ZFJA 4Z1CA 4EVZA 1H51A 3LCWA 1KV8A 4UTUA 5K7JA 2JK2A 5G5IA 1A50A 1A5SA 4M7SA 1HL2A 1BEUA 2V9DA 3DAQA 5I3KA 1OF8A 4TX9A 3S42A 5LGXA 5LSMA 2J9YA 3P8JA 3ABSA 3NL6A 3S1VA 1ME8A 1WX0A 3DGRA 3QZEA 1YTDA 5D2VA 3E02A 3MW7A 3F1QA 3OIXA 1RZMA 1QPOA 1AL8A 5LGZA 3N73A 2YYUA 2G96A 4XQ6A 1D3GA 3C6CA 4GRSA 5AC6A 2Y62A 5BW6A 1QCWA 5I3GA 1TPFA 2Y61A 4TMCA 3GXPA 2E5DA 4GC4A 1EWDA 1YYAA 4JEQA 2HS8A 4IOTA 5ABTA 1TV8A 1JCJA 3TXVA 2R94A 4ORIA 3HB9A 1IXPA 3BO9A 3GXTA 3O6DA 5CSSA 5FESA 3LHUA 5DCBA 1QPRA 4ZZ9A 1SU5A 4MYAA 5K4XA 2X16A 3TJXA 1YDVA 2C19A 2H8XA 2G95A 3LRKA 2ZRVA 1DBTA 3M5ZA 1TRDA 1OYBA 5D37A 3OVQA 2E5BA 3KRUA 1K7EA 3NZRA 1I8JA 2CFFA 5CPOA 3LB0A 2QCFA 3WK1A 1JUBA 2C15A 5F2IA 4AXKA 1YADA 3P82A 2VC6A 3NOEA 5TBOA 1O94A 3HPSA 1Y0EA 1DHPA 3WJXA 3PB2A 1SZEA 3NQ6A 1UASA 2C14A 1CI1A 3FKKA 1F6PA 3NO5A 1U5JA 4XTIA 3FLUA 1EP2A 1TPEA 3FYPA 4AHOA 1LDCA 2VFHA 4K6AA 1O95A 3D0CA 1RV8A 3IEBA 1SZNA 2VENA 3P81A 4PA8A 4NUWA 3VI2A 4UTWC 1KM3A 1W5PA 5AYXA 2YW4A 5D2TA 1H63A 4PEKA 1O60A 1ZJIA 4WUIA 5F2MA 3W83A 1S3HA 3G0XA 5HUPA 1T99A 1ZHAA 5C6MA 4TO8A 2CWNA 4ZQMA 3BLFA 2ALDA 3NGJA 1JCMP 1B9BA 3KVKA 5AOUA 3PSWA 4LWWA 4HPXA 4FEZA 1R46A 4GNJA 4JTGA 1JUKA 3CEUA 2VEIA 2VEKA 3NQGA 2OT1A 4GE8A 4BFAA 4CNNA 2X30A 3BW3A 4KFOA 4JD4A 3G1FA 1FXPA 3SGZA 4ZQCA 4ICNA 4IPIA 4IMFA 3NQCA 1YPIA 3TQVA 3W2NA 3LRMA 3P74A 4IQLA 3B0UX 2EF9A 1GVOA 1KM2A 1B57A 2Z0IA 4AAJA 2NZLA 1T8XA 3W7QA 4UTIA 3BV4A 2F84A 1KV5A 3NZ1A 1DOSA 1KTBA 1Z41A 1MEWA 4DO6A 1EUNA 5C5YA 4FIQA 3MI6A 4BI7A 4DPQA 4S2CA 1H1YA 1H7OA 4CCDA 3LOTA 1FCUA 3U2OA 5H2ZA 3EEGA 4Z1BA 3G18A 3DI1A 1LM1A 1ZAHA 2X2GA 1KM0A 1Z44A 3BW2A 3W7PA 3UWQA 2FPTA 1YTKA 2PE4A 1JVNA 4O17A 1F73A 3K30A 2V5LA 3LRLA 4K38A 5G2WA 1LBMA 2FB2A 3G1XA 2JBMA 4UR8A 3C2RA 4MZYA 3VNDA 2X1SA 3UYCA 4R34A 1TQJA 5CZJA 5BMXA 1X1OA 2P10A 3S5ZA 4O16A 2X1UA 2E6DA 2Y85A 2Q3OA 2QUTA 3HIJA 1XBZA 5AB3A 4DBEA 1QAPA 1R2TA 3LV5A 4Q33A 1BTMA 5IM51 1H7RA 4U4MA 5AC7A 3G1SA 4MPQA 3Q58A 3MHFA 3CT7A 4ZVJA 2RDUA 4U28A 4AEOA 4OQVA 4PL2A 3LCIA 1WA3A 5CPMA 3CWOX 1C8VA 2VEPA 1KFLA 1PCWA 1TYGA 2QCGA 5G1YA 3GDKA 1TPDA 1L6YA 2ATSA 1HO1A 1VHCA 4AF0A 2DZVA 3IV3A 5C54A 4O0KA 4A22A 1JQXA 1DQWA 4MUZA 4NNAA 3EXSA 1HG3A 2A4AA 3R13A 4WOQA 1SPQA 1FWTA 1RVGA 3TV8A 4I7VA 1EUAA 3SZ8A 5J5DA 2WNNA 2GJNA 3H54A 4KWWA 1N8FA 4WZHA 2V0TA 2B0MA 4AWUA 3EKZA 1K02A 1KM1A 1WBHA 4LS0A 2HMCA 1GOXA 2GVJA 3R2GA 1VGAA 2H90A 2DORA 1AMKA 3T40A 2YYTA 4UTTC 3N9SA 5D2WA 3QW4B 3A5FA 3RFAA 1AG1O 1SSDA 3GX9A 3TA6A 2RH9A 3ZWSA 2BSLA 1SSGA 2GVGA 2ZBTA 1P5BA 3NEVA 3NQ2A 3DH7A 4X2RA 3PF3A 2WO5A 4CCEA 4EF8A 1P0NA 2Z2UA 3GNNA 3CB8A 3L0KA 2QCLA 4QQ3A 1TV5A 2GQAA 3PBUA 1R30A 1H50A 2YGYA 5CSRA 3TK7A 1RQEA 3JS3A 1DJNA 4BWLA 2QCHA 3QM3A 3TUUA 3W1TA 4O53A 4IX2A 3MP4A 5DELA 2NWRA 5KITA 2XN0A 4IGHA 1R2SA 3HMJG 4PL1A 2ZQ0A 1I45A 4DF1A 3UZ5A 1KA9F 5E93A 4QAIA 5D03A 2Y88A 1JCLA 3E96A 2O7SA 4RZ6A 4TR9A 1YTEA 1OFBA 2Z6JA 3P5ZA 4YCPA 3DI0A 4GUFA 3MWAA 5L9FA 2RDTA 4P2VA 2VFIA 4JXCA 5AHNA 4POCA 4DO5A 2OT0A 3P61A 4LVBA 3EKLA 3O06A 2NXIA 1OFAA 3MBDA 2CU0A 4NU7A 1GQNA 5F2LA 3SJ3A 3I7QA 2CLHA 2OMAA 2WKJA 3N19B 4TU1A 5HR7A 3M47A 2A21A 1RPXA 3TIMA 4FNRA 2V2HA 1LRNA 4J9JA 1B3OA 1WV2A 2WSRA 4TMBA 2PC4A 2O7QA 3HG3A 1GVQA 4ADUA 5G2HA 4AMAA 4N9EA 3G3MA 3W1UA 2DP3A 5F4WA 5GVJA 1ZAIA 4L4MA 3HG4A 3KVLA 2CZ5A 2FPYA 3HOJA 1OX6A 3W1QA 3G3DA 5AFDA 4M5PA 2CZEA 1W56A 1QDSA 3OG3A 1WOBA 3PUDA 5C55A 4GUHA 2CW6A 1WBJA 2NWSA 2C1HA 4AHPA 4O18A 3W1MA 1H60A 2G5WA 4UFLA 4UMAA 4YMZA 1IIHA 5SWUA 3B0VC 3INPA 4AHQA 4AWSA 4M6QA 1XC4A 4K39A 3QSTA 3OVRA 4PH6A 5BOOA 1W3IA 1SUXA 4JYDA 5LKYA 1F2JA 2B7NA 3UWUA 4RJEA 1O5XA 3KRZA 2ZZ6A 1IIGA 1HFBA 2E68A 5AN7A 4DXVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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