2E6FA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with oxonate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with oxonate
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 108
structure length 312
sequence length 312
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2006-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2e6fA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e6fA01
3H53A 4N6EA 4O19A 3M5VA 3W7LA 5D32A 4E38A 5AHIA 4XUGA 1IIHA 5AHLA 4Y6GA 2IQTA 4UTUA 4HSOA 1SUXA 2ZZ6A 1Q3NA 3GIYA 3E02A 4HNVA 1FDJA 1K03A 4QQ3A 3UXDA 5J5RA 5CZ0A 4MZ1A 3F4WA 2FLIA 4QIUA 3CEPA 2C14A 3GX9A 4UUIA 2NZLA 3GK0A 1FWWA 2Y85A 3M5YA 5H91A 2WJZA 2Y61A 1Q6RA 3W1AA 4FIQA 5FEWA 1OVDA 4HNTA 3TX9A 2E77A 2V0TA 4N4PA 3KVJA 3FJLA 3HGRA 4IMGA 1YXYA 4K36A 3MMTA 2B0MA 3SW6A 4FX8A 3YPIA 3LI1A 4UIOA 3EXRA 3HGOA 1D9EA 5D02A 2E6DA 4RKAA 3WFAA 3SJ3A 4AB4A 3TE9A 1S5VA 1W3NA 2WKJA 2XN0A 1DJNA 1G67A 4QISA 4JDYA 2CWNA 3WJYA 3CWNA 2WSRA 1FCUA 3W7OA 4NX5A 3G22A 3UWVA 3M7WA 3PBWA 3F03K 5KZEA 4HKPA 4GNJA 3LGEA 2DZXA 2Y70A 4ZVJA 3OBKA 1RPXA 3TKFA 1W5MA 3NQFA 4DF1A 3TC6A 1EUAA 4B5NA 1VQTA 4YCOA 3S1VA 3A9IA 1XDLA 4R53A 1O5XA 1PE1A 4Y96A 1QPQA 2VEMA 1X6UA 4PTNA 1IXPA 1W3IA 3P82A 4LRSA 2C0AA 3G8EA 4UCGA 4GFSA 3W7CA 3PBVA 3A24A 1AW1A 1I8JA 4GC4A 2DZVA 4OE7A 4NNCA 4JYDA 4LVFA 3O05A 1G4PA 3L65A 2J27A 1H1YA 5EYWA 4XWUA 2A5HA 4XZ9A 3E12A 2PRHA 4EF9A 1W56A 4UR8A 4K7YA 1QPRA 5BRBA 5BW6A 4ZZ9A 1EB3A 2X16A 2LLEA 2B7QA 5CZJA 1GTHA 4ZQMA 3R8RA 3NL3A 1JCJA 1FDYA 3G1YA 3TSDA 2WSYA 1RQHA 3U6WA 4XKYA 4O28A 4PFMA 4JDBA 3R2GA 1W37A 1XBXA 2J88A 3LTPA 1BTMA 1FY6A 2NWRA 3LDVA 4GUFA 1TV5A 1XC4A 3LXAA 4HNUA 4JTSA 5I3GA 3SGUA 1M7OA 4OBTA 3W72A 5A8GA 4UTTA 2RHGA 4DELA 5LNRA 3E0IA 3ABSA 1Z41A 3G1XA 1KBJA 4LC8A 2G96A 3W6YA 1ZJIA 1H7WA 3W2JA 3IIPA 2DJXA 3INPA 4LW7A 3PWAA 3TIMA 5AC7A 2RH9A 4AWTA 2P1FA 4RK8A 3IEBA 3QMSA 1YTEA 3NQGA 4FX6M 1TV8A 1L6WA 2OT0A 2BZNA 1RVGA 1OF8A 2CLEA 3NQ7A 3TCEA 1BWKA 1OFEA 3TSBA 1VCGA 5DCDA 3I68A 1TJRA 1DOSA 5LSMA 3P62A 4NJHA 3MBDA 3ANYA 4D2JA 1K3UA 3SI9A 1EWEA 5LHEA 2DJLA 4IPJA 2E6FA 4JTJA 1EEPA 4RV8A 4MIMA 1O95A 2ZCGA 3S9YA 4L4LA 3CLMA 3NG3A 2VEIA 1M6JA 1DHPA 5LNSA 3SIZA 5HNRA 1GYNA 4CQAA 2Y62A 5KMYA 3UD6A 2V81A 1DKWA 1LCOA 1WBJA 2G97A 1W8SA 4IX2A 1CX9A 2A2IA 1GVQA 5GVJA 3W71A 2FFCA 3LBMA 3QM3A 4MPQA 5LGZA 3ABRA 1K8ZA 1XKYA 3C4UA 3TJLA 2V82A 3C3NA 2GQ9A 3ABQA 4O1DA 4Z0JA 2ABBA 3KRZA 2ZZ5A 1F76A 4UNKA 2ZZ4A 4O15A 2NV1A 2WSQA 3GXPA 3NVTA 4JY8A 3G1VA 5I3HA 1TO3A 3W7IA 3THAA 4UFKA 4LV9A 4MFDA 2QCDB 2ZRZA 3BPWA 5DXYA 2A21A 1R30A 5HUOA 2FPVA 2E5DA 3W2LA 1UB3A 2I1OA 5FEPA 5FF0A 3HPXA 4CCDA 1EP3A 1W5PA 3ZFHA 2G5WA 3TUUA 4LVBA 1QPNA 3S5NA 3EWXA 4IMEA 4RXFA 1UJPA 1MEWA 4AF0B 1AL8A 4JD4A 3DFOA 4RZ5A 2VELA 5D33A 4CLMA 3LLDA 3DAQA 2A7RA 3O16A 1ME7A 1Z48A 4I7VA 2DU2A 2H8XA 3R5EA 4Q32A 2EHHA 3NQ2A 3LCXA 3TJXA 2G95A 4PH6A 1G7VA 3EX2A 1AG1O 3OEXA 2GVGA 4N9BA 3NQVA 1WA3A 1TPWA 3DH7A 3BO9A 1PIIA 5CPNA 3P84A 3GDLA 4GE8A 2WPBA 3C0JA 3DZ1A 4K37A 1K8XA 4UC5A 1TQXA 3GDTA 1LLZA 1YDVA 3LB0A 4W9TA 3OA3A 4UXDA 1VYPX 4DBDA 3TK7A 1MEHA 3RLVA 3Q58A 5D03A 2QCHA 4H6KA 4ORIA 1YADA 3O07A 3OG3A 2YFOA 4Z1CA 3LBCA 1NF0A 5K4XA 1EP2A 1SSDA 4UFJA 2GVJA 4DO4A 3HBLA 3LI0A 3UWZA 3OVPA 1XBYA 3QRHA 4O54A 1A5AA 4JX6A 6ALDA 1QPOA 1TTQA 2VFHA 2BX7A 3UXAA 5G1TA 4CNOA 3DFQA 4UFHA 3MBFA 2VFIA 2ISWA 3EX6A 3USBA 2FPYA 3CIXA 1P4CA 2E09A 1OYAA 2NWSA 4MVAA 2WNNA 4RX0A 4YLWA 3MHGA 4O0KA 1KV5A 3A5FA 3QEZA 4C1LA 4JY9A 2OX1A 1W5QA 4WXZA 2QCFA 2Z2UA 3LHWA 3LV6A 3N14A 3M9YA 3W7PA 3MJYA 4I7UA 4MZ8A 3HQ1A 3W7NA 1H7RA 4JIQA 3O06A 1SU5A 4K6AA 4DPQA 2VFEA 1GOXA 4DF2A 1GVRA 2H3BA 1V7YA 4O18A 1A5SA 2YX0A 3G1FA 1OYCA 1UASA 3NR0A 4ZQCA 4NUWA 2DZTA 1UCWA 3GDKA 3IIOA 1I2OA 5DBTA 3C2OA 4GJ1A 2DZUA 3QW3A 2DORA 3A23A 4IMCA 4ZMGA 3W1UA 2D73A 3SY5A 2HS8A 5CPOA 4OV9A 3CWOX 2GVLA 5LHFA 4NJIA 3W1LA 2NX9A 4XQ6A 2NUYA 5EA9A 1VYRA 5K2ZA 5F1UA 3LHTA 4NQ1A 1Q45A 2R94A 4KFPA 3R13A 3NL6A 1G69A 1R2RA 1FUYA 4WQ6A 3NM1A 3DFSA 3LTSA 3NXFA 4JGDA 4ICNA 1XUZA 4O10A 4G1KA 3SECA 2EKCA 3M5ZA 4YL2A 3V1PA 1H61A 1LDCA 3A5VA 3HG4A 3IGXA 1JULA 3RU6A 1KFJA 1JQXA 1SFJA 4HNNA 3W7JA 3NPUA 1L2UA 2PCQA 4R7JA 3IIXA 3NL5A 3KFTA 5FI8A 5CZTA 4M7TA 5DBUA 1G6CA 4JS3A 4ML9A 3STFA 3HF3A 1R46A 4HN4A 5D2VA 4RJEA 2A7PA 2Y63A 4N9EA 5K9XA 3TA6A 5KSWA 2W0UA 2A85A 2QAPA 1G4EA 5DELA 2V9DA 1VGAA 2RKXA 4NVTA 2ZTJA 3DHFA 1RQEA 1LOQA 1YPIA 5KITA 3H54A 1SR9A 1TPB1 1TTIA 4PL2A 5DLCA 3T44A 2ZYFA 1LRNA 3EWBX 3LM7A 6TIMA 3SSJA 4DEFA 3W1TA 4FNRA 3KVLA 1ZAJA 2C3ZA 4MJMA 1EWDA 3C2EA 5D2WA 2A4AA 5KINA 1LRTA 1DORA 4TO8A 1H7PA 3ZWTA 5HINA 1YTDA 4N02A 2JKPA 2QEZA 4KFNA 1F05A 4H3DA 3QSRA 5FF7A 4O13A 2H90A 2CLMA 5D2TA 3G18A 3TROA 5K9CA 1FXPA 1MZHA 1XM3A 4JTKA 4H4IA 1FWNA 3LCLA 5K7JA 5BOOA 2CLFA 1H63A 4O16A 4FNUA 3M6YA 3W2NA 2HTMA 1XDMA 5I3FA 3W84A 2OT1A 4ADUA 1RZMA 3KOFA 4JYEA 3W2UA 3DGRA 2XFWA 3I7SA 4O53A 4A2SA 1JQVA 3B0PA 4UTHA 1J4EA 4NNBA 3UWQA 4ZQRA 1GVSA 3W76A 5DCEA 1SQ7A 4LU0A 2QCCA 3FKKA 3LV5A 4BK9A 2EAWA 3C2RA 3S5OA 1Z42A 1TSIA 4IPIA 1PL9A 2FQIA 1FDZA 3STGA 3B0UX 4MJZA 3DFTA 1TPEA 3MYOA 4XBKA 3JS3A 4K39A 1NFBA 1WDWA 1S3HA 4M7SA 2NXIA 3N73A 4MKNA 3GXTA 3MW7A 5DY2A 4CCEA 4RZ6A 1YDOA 5D2XA 3DENA 3Q37A 3C8FA 3TU9A 1LLWA 1I2NA 3UPBA 3BG9A 4ONVA 2VFDA 3QPYA 3Q2DA 1AMKA 2C19A 2QCLA 2ZA3A 4IJBA 1X1ZA 3KXQA 4JTIA 1YXDA 2CLHA 2ATMA 4I7WA 5FF3A 3L0GA 3TQ0A 2TPSA 2NLIA 2DZPA 1TRIA 1X7FA 2YDAA 4JIPA 4KWVA 4BR1A 2CLKA 3PG8A 4JEQA 4GUGA 4WX2A 3RFAA 3NPVA 3LERA 5DXXA 3GAKA 3ATZA 4JN6A 3GKAA 4IOTA 3EB2A 3FYOA 2ZRUA 1LROA 5AC8A 1H50A 3MYPA 3F1QA 4OT7A 5T26A 3A21A 3CTLA 3BLFA 1QO2A 3MI6A 4O1AA 5L6UA 4NXSA 3W1XA 2FJKA 3W70A 3BGJA 1OFAA 1XL9A 2Q3OA 5F4SA 4JTUA 4QSHA 3HMJG 4Q33A 2TMDA 5HR7A 1A5BA 4JTLA 3N3MA 1MXSA 2VENA 3CIWA 5F4WA 1W5OA 2WOQA 4O17A 2X1RA 2CZEA 1OX5A 1GWJA 3WK3A 4OQVA 3P80A 3EWWA 5LNVA 5IM51 1KFLA 2A6NA 3G0XA 4AEOA 2V8ZA 1L6SA 1IXNA 5H2ZA 4ADTA 1JCMP 3PSVA 3KHJA 1KTBA 3TAKA 3QW4B 3R12A 3H55A 3IVSA 3LHVA 3ZS4A 1C8VA 1OABA 1OFDA 3W1PA 3EX3A 3PM6A 3C2FA 5G5IA 1JUBA 5E0KA 2E5CA 4LVDA 5A5WA 5LKYA 3N9SA 3NQAA 2VFFA 1A50A 1LBMA 2F84A 5FEXA 2HS6A 2AAMA 3ELFA 1T8XA 5AOUA 2YGYA 2YZRA 2CW6A 1ALDA 1LBLA 3C2VA 4UR7A 4UFIA 5CPMA 1LM1A 2NX3A 3S8HA 1ZALA 2V5BA 3UWUA 1JVNA 3W7DA 5E93A 4GXMA 1M7PA 3G0SA 1IXOA 2B7OA 2ZZ3A 3W87A 4NJKA 1DQWA 4O11A 4AHQA 3O6YX 5KZDA 4Z1AA 3GXNA 3QYQA 4UNLA 3PSWA 2ATSA 2A1YA 1VR6A 1U83A 3ABOA 1I2RA 2YSWA 1JCLA 4LV4A 3TQKA 4MLJA 1TV7A 4FIRA 4MZYA 1DBTA 2PURA 4AHOA 1XCFA 5F2GA 1TB3A 3L5MA 3PUEA 1X8FA 2Q8LA 3ATYA 1WBHA 5CPLA 1OX4A 3FOKA 1H62A 3C61A 2RDWA 2CLOA 4WY0F 4DF0A 3NO5A 4GUHA 1FWRA 2X30A 5HJLA 1VPXA 1HG3A 2CFFA 4XTDA 3MP5A 1AW2A 2R91A 2ZA1A 3FEMA 1JCXA 3RF9A 4A3UA 2V5LA 1A5CA 5HWNA 3L67A 4Z0SA 5G2WA 5L9FA 4DQWA 4QAIA 3QQ1A 2QCEA 3I7RA 2YXGA 2YW3A 3L21A 3QH2A 5AYZA 3TMQA 5MHBA 1NSJA 1YXCA 4S2CA 5SWUA 1PCKA 1VHCA 1F2JA 1ZAHA 2ZZ1A 4NU7A 2Q8ZA 5DN1A 5D09A 4LT9A 3M47A 3MP4A 1TRDA 5U4NA 2DZSA 3IIZA 5HWJA 1DJQA 4BI7A 4E2BA 4A29A 2Y89A 3NQCA 4FEZA 5IBXA 3P5ZA 4DO5A 3MUXA 3W9ZA 1FCBA 1ZY9A 3WJXA 1MEIA 1C29A 2XN1A 4ALDA 1WX0A 3JR2A 2VXNA 1CI1A 3WK1A 1HO4A 2NXHA 3MO7A 4NXKA 1KFCA 1OHLA 2OZ0A 2ALDA 2PRLA 4WD0A 3IGSA 5C6MA 3CU2A 4PL1A 3G1DA 2BTMA 2C16A 4QM1A 3DHDA 5AHEA 4N2YA 4PC8A 1RV8A 2YPIA 1FBAA 1WV2A 4RXGA 8TIMA 1B3OA 3RMJA 2P10A 1PVNA 1Z44A 5TBOA 4FO4A 1LBFA 3O15A 3B0VC 3LCIA 3G3DA 3BW4A 4BI5A 4M6PA 1K02A 4JTFA 2QCNA 5D04C 1WAUA 4UTMA 2J6XA 1K7XA 3KX6A 3GAYA 4JX4A 1HTIA 4RR4A 2Z1BA 3L66A 1VH7A 2NXGA 4N9CA 3LRMA 5D38A 3W07A 4R33A 3W74A 2A0NA 3UWYA 1LTDA 1MO0A 1SFLA 3I6RA 1NAL1 4LS2A 3G1HA 3N2XA 4TIMA 4K7VA 5LNWA 3U2OA 2JGQA 4NZJA 2RDTA 2E6AA 1I2PA 3STCA 4IX0A 1DQXA 3QSTA 1GZGA 3W7HA 1DV7A 3CC1A 3W3OA 3N19B 1W3TA 1B9BA 1HL2A 5CGQA 1EA0A 4DBEA 4DXVA 3EWYA 3NA8A 2YCEA 2JKEA 2ZFAA 3NQDA 1FWTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4N6E A;  3M5V A;  1PSC A;  1B0I A;  5AHL A;  1BQC A;  4S3F A;  4XKM A;  4XVD A;  1LL4 A;  3L4Z A;  3H2A A;  1VB9 A;  3ZJ7 A;  3LD5 A;  1FDJ A;  3M0H A;  3ZVH B;  4QIU A;  3CEP A;  1XRS A;  3ENL A;  4UUI A;  4NIR A;  1KBK A;  2NZL A;  3GK0 A;  4XZM X;  1EEX A;  4RNF A;  1NWR A;  4HVX A;  5C7H A;  2Y61 A;  1Q6R A;  3U7V A;  3W1A A;  4FIQ A;  3STP A;  2V0T A;  4Q8O A;  3KVJ A;  4LCQ A;  5C71 A;  1XYB A;  5LIX X;  1UR2 A;  3EOE A;  1E5J A;  5XIM A;  3DN5 A;  1CGY A;  1XIC A;  1DTN A;  3MB9 A;  2QDE A;  1EBG A;  1PDZ A;  3LI1 A;  4XAY A;  2HBV A;  3HGO A;  1Q85 A;  1PEZ A;  4QJ4 B;  3WD4 A;  3UG3 A;  1K6A A;  2WKJ A;  1PIF A;  5IHR A;  2CET A;  2G3N A;  2OEK A;  3RPT A;  3CWN A;  3W7O A;  4NX5 A;  3G22 A;  3M7W A;  3PBW A;  4NAE A;  4B16 A;  4I9J A;  5IRP A;  3LGE A;  2DZX A;  3VIK A;  1VBJ A;  1KXH A;  4FOU A;  3TC6 A;  1EUA A;  4K3Z A;  4C65 A;  1QI4 A;  2R1L A;  5CLW A;  4R53 A;  2FZ9 A;  2Y5J A;  2PD5 A;  1XRF A;  1PWM A;  5HJX A;  4PTN A;  4BS0 A;  2OGY A;  3VIO A;  1XC6 A;  2PA6 A;  4GFS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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