2E6FA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with oxonate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with oxonate
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
total genus 108
structure length 312
sequence length 312
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2006-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2e6fA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e6fA01
1R2TA 1Y0EA 1IGSA 5LNUA 4CQ9A 1NAL1 2X30A 1XUZA 2GOUA 1A5AA 2Y6ZA 4HNUA 3PULA 3E02A 3W83A 5C54A 1YTDA 4IX0A 4H4IA 4OGZA 2QUTA 3DHFA 4PTNA 2HMCA 1IXQA 4YLWA 1ICPA 2X16A 4R33A 1IIGA 2RKXA 1OYCA 2QCCA 5LKYA 2E6YA 5T26A 1VQTA 3W7EA 4TU1A 3L68A 2ZRXA 2DP3A 3O05A 4NJJA 2WV8A 2JKAA 5HUPA 5D30A 1W54A 3M7WA 3S5OA 1QOQA 2Y62A 3M41A 3QMSA 1IXOA 4HHPA 1KM5A 3C2OA 2PRHA 1JCJA 5FF2A 2G96A 3NQAA 4IOTA 4DELA 4JICA 1WV2A 3W7GA 3W7HA 1KLYA 2NV1A 3MP4A 3STEA 1C29A 1KM3A 4LV9A 5K3VA 3T7VA 1QMLA 3W2KA 3TAOA 3LI1A 5DCBA 3KVMA 5HR7A 5AHIA 1YDNA 1O95A 2CLFA 3MBFA 4AVFA 4ZMGA 4GE8A 3O1NA 3W72A 4LVGA 2Q8LA 3W7LA 3NQ7A 4O1BA 3LM7A 4NX5A 1NEYA 1ZAJA 1K02A 4NJGA 5CZSA 2TRSA 4UFIA 4WJEA 1FY6A 3S9YA 4I7UA 2BZNA 3WK0A 3EWUA 3UWWA 2PURA 1JRBA 3CWOX 3PC0A 4JTLA 1H7PA 3C61A 3TSMA 4MFDA 3IRDA 4HNTA 3BG9A 3HGRA 2FLIA 2VFEA 3W88A 5IBXC 3CEUA 2TPSA 1ZAHA 3QW3A 1GQNA 1EUNA 3T4CA 1XDMA 4UTTA 1OFBA 2W0UA 3EXTA 2JGQA 1LBMA 5DN1A 5D2XA 3ABSA 2H8ZA 3L2IA 5C6MA 1ZHAA 3Q94A 4ZVJA 3LGEA 1MO0A 1KTBA 4FXRA 4O14A 5K4XA 1N8FA 2A1YA 2A4AA 2C0AA 3C0JA 5D32A 4JY9A 4J9JA 3DFOA 2E6AA 3VE9A 1AW5A 1W8SA 3CPRA 4XBKA 1G67A 4XUGA 1OHLA 3NQ2A 3P61A 1CI1A 3G8EA 4BI7A 4HNVA 1NFBA 5HMSA 1QWGA 2ZZ2A 2WO5A 5FF4A 3TC6A 1S5TA 1GYNA 1ML1A 3AJXA 3TNOA 1KLZA 1OFEA 5D2TA 1H61A 5DY3A 3TX9A 3W85A 2J9ZA 3DFTA 3MI2A 1TPB1 3CLMA 4OV9A 3MI3A 2NXIA 4NU7A 3E0IA 4AF0B 3THQA 1SU5A 3EWXA 3VFLA 1VCFA 2OJPA 3GIYA 3N73A 1K7EA 4LRTA 5D38A 5K4ZA 3IGXA 1KM2A 5G2HA 4BK9A 1OF8A 1LROA 1TPWA 4K36A 2CLLA 1KV8A 3L5LA 4PCFA 2VENA 5LNRA 1KM0A 1RQEA 3CM4A 4JNMA 4ONVA 1X6UA 3TXZA 3R89A 4PEKA 1ICSA 5MHBA 2VELA 1XUUA 1QNVA 1H5YA 2H3DA 1RR2A 2WJZA 2PE4A 3KRUA 2ALDA 3NQVA 3O63A 4JS3A 1JCMP 1JCNA 2YCEA 4QISA 4ALDA 2EAWA 3LBMA 2QDHA 3GDMA 2XN0A 2NZLA 4AWUA 3W1RA 5FEPA 4NX0A 5D02A 2X1UA 3GXTA 3IIPA 4D2JA 1T99A 1ICQA 2FTPA 2C16A 4MZ1A 4AF0A 3MMTA 2EKCA 4IMGA 5K2ZA 3EX6A 1IXNA 1UUMA 3L5MA 4MZ8A 4LV4A 1TRDA 4ZQMA 4KKXA 4TMCA 1H50A 3LTSA 3O15A 2WSYA 3CWNA 3NOEA 4LVFA 2ABAA 2J9XA 1H60A 2ZTJA 3T78A 1GG0A 3TU9A 5LGZA 1PCWA 3O06A 4FNQA 3IV3A 4O15A 4JTHA 3NM3A 2CWNA 3PB2A 1SZNA 3I7QA 2WNZA 3F4NA 3GXNA 4RZ5A 1TREA 4YCOA 2QAPA 4ZQRA 4O1AA 1G4SA 4ADUA 4RXFA 3LCFA 3MWAA 1J4EA 3WJXA 2NLIA 1L6SA 5EKYA 1L2UA 1GPWA 4N02A 1MEWA 3GVGA 5CPLA 2VEIA 5AN7A 4A22A 4O57A 3OVPA 2DZXA 2YZRA 3LTPA 5AYZA 3LV6A 5DY2A 4IWWA 5LGXA 1UB3A 4KWWA 2ZRVA 5G1YA 4M6QA 2QAFA 3LLDA 2ZQ0A 4IMCA 5BOOA 1NF0A 1XBYA 1RQHA 2QDGA 1SW7A 3HJZA 4GUHA 1G7UA 1QO5A 4MYXA 1P4CA 1TPUA 5AOUA 1EIXA 3UD6A 1KM1A 3W87A 3TA6A 5EA9A 3FEMA 5KZEA 5DCEA 4EOUA 2Z2UA 1FBAA 5EBUA 1ZY9A 1OFAA 2C15A 4MFEA 4LOCA 3GX9A 2GJNA 4FO4A 4IXHA 3VKJA 1SPQA 5AC7A 4QNEA 2Z6JA 5K9XA 5SWUA 3LV5A 3QC3A 2IQTA 3FA5A 4JTUA 3USBA 3LHWA 2PC4A 3QPYA 1J5TA 4Z1AA 4LS2A 3LERA 3L21A 4E2DA 2OT0A 1H7OA 2NWRA 4MLJA 1G4TA 2R8WA 4TO8A 1HG3A 3IGUA 1LOQA 3M16A 1TTQA 3TSBA 3A23A 1XI3A 2CLHA 1NF7A 3QFEA 1JVNA 4Z08A 4DBEA 5I3JA 2QF7A 1EUAA 2OX1A 1WOAA 3GNNA 4BI5A 3GAKA 4NJIA 3C8FA 1QPRA 3QZEA 2G95A 3PWAA 2BSLA 2TMDA 1YLVA 4P61A 3OEXA 1IIHA 1NVMA 3EX2A 3LCWA 4QQ3A 4NNAA 2YFNA 3NPVA 5BRBA 2J88A 2FB3A 1OFQA 3L65A 1TO3A 3G22A 3P81A 1XBZA 1YXYA 3R12A 3B0UX 2CFFA 1XBVA 1YTKA 5F2GA 4UFLA 5HNRA 4N2YA 3W86A 3DXIA 4MZYA 1LRTA 3HGOA 1THFD 3G0XA 2P10A 5F4XA 5CPMA 3TSDA 4E2BA 4WXYA 3WJWA 4QM1A 5D37A 3HGSA 3B8DA 1H7NA 1DQWA 1JJKA 1HTIA 2VEPA 2NXHA 1T96A 4C1KA 4N4QA 3LHZA 5K9DA 1WOBA 5HJLA 3FLUA 3LHVA 3ZR4A 2FDSA 4QAIA 3QW4B 4JYDA 2BTMA 5L9FA 4K38A 3W1UA 2V9DA 3IIOA 2CU0A 4Y9AA 1FWTA 3TAKA 1SFJA 3ABQA 3C2EA 2Y89A 1QPNA 4RK8A 3FS2A 1MXSA 1H51A 2Y63A 1JQVA 1Z48A 3TJLA 2GVJA 2YW4A 1EP1A 2FFCA 4AEOA 3KHJA 4WX2A 1Z42A 2EHHA 3TW7A 1G69A 4LT9A 4GFSA 3ABRA 3NAVA 2ZRYA 3LB0A 2E6DA 3N14A 1E51A 1F76A 4GXMA 4UTUA 1VPXA 1B57A 4UIOA 1I2NA 3QYQA 4Q4KA 1H63A 4RXGA 4FXSA 2XN2A 1XBXA 1DKWA 1H62A 2DU2A 3TQKA 3DHDA 1JQXA 3DI1A 5E93A 3PB0A 3LTYA 5AYXA 3P5ZA 2ISVA 3G1YA 3VE7A 1YPIA 2D73A 4FF7A 4O4VA 5LHFA 1QCWA 3PG9A 4N9DA 5CZ0A 4WOQA 1KTCA 1KBJA 2QKFA 3NPUA 3TC7A 5A5WA 2V2HA 2QUVA 3TMLA 2HSAA 1IXPA 3P84A 2OCZA 4O0ZA 1WBHA 3B04A 4N9BA 1Q6RA 5D03A 3QRHA 4N9CA 1AW2A 4UTIA 4M5PA 4LRSA 3CT7A 2C6QA 3HG2A 4U28A 2NWSA 3WK2A 3KXQA 2JGYA 4BI6A 3P74A 2VFFA 3NPXA 5EY5A 4W9TA 2YDAA 3NXFA 4NJHA 4FNTA 3HMJG 4A3UA 3SR7A 2DZTA 3RU6A 1KFLA 3HG4A 3TV8A 1LZOA 1SQ7A 1DORA 1OFDA 3M43A 3SJ3A 4HPXA 3GK0A 1KFKA 1L6WA 4GUFA 3W7OA 2J9YA 1V7YA 1OVDA 4PA8A 1ZAIA 3UWZA 5KTLA 3LHTA 3N19B 2G97A 1DJNA 4K37A 4RZ6A 4UFHA 2ZA3A 3MI6A 3ATYA 2A7NA 5C2XA 5FI8A 2QCMA 4MPQA 5DBUA 3THAA 4O8RA 1TMHA 1W5PA 3DFQA 3I6RA 3V1PA 3G1VA 2WSRA 4WY0B 3EX3A 2FPYA 3FJ6A 4CCCA 1OG0A 5F2LA 1KFEA 4O52A 3C6CA 3M47A 2QEZA 4JTEA 3BW2A 4DO6A 3NPWA 3H54A 4A29A 4JTTA 1WDWA 3F1QA 3NEVA 2VFGA 4AMAA 3G3MA 3WK3A 1HL2A 4EVZA 2OZ0A 3CQ0A 1RD5A 3MHFA 3MJYA 5AFDA 3UPBA 3QMRA 3C52A 1LLZA 3CC1A 2I9EA 3SY5A 1FQ0A 2DJLA 1DJQA 1KA9F 1A5BA 2A7PA 2V30A 2FB2A 4AHQA 3C2VA 4WY0A 3UWQA 1F05A 3BLFA 3W74A 1TQXA 4N9EA 3HBLA 3C2FA 3DH7A 4B5NA 1OYAA 3TIMA 5DELA 1TYGA 3Q58A 3R13A 2CLOA 5BMXA 4IPJA 4IQLA 4Q32A 3G1AA 4DBDA 4NUWA 4OQVA 1VLIA 1UUOA 2A85A 2VEMA 4MLRA 1A50A 4UMBA 1DV7A 1GVOA 4OBTA 2B0MA 1I8JA 3P67A 4NXKA 4QNWA 5D2YA 1WBJA 5HWMA 4UCGA 1A5CA 3ATZA 3KX6A 3W7QA 3GDRA 4UFMA 3W71A 4DQWA 1O94A 2WOQA 4OWGA 3I68A 2E1DA 4FIQA 3LX9A 3W1LA 2HTMA 4TIMA 1EA0A 2YSWA 4UTLA 3DU0A 3GDTA 1ZCOA 3CHVA 3R8RA 5DLCA 3S8HA 2Z1BA 2Q3RA 1U83A 2WKJA 4BR1A 1M6JA 2JKEA 4K39A 1B3OA 2DJXA 3FYOA 5D33A 5U4NA 3LHUA 4BWLA 4ZL1A 1LDCA 3EXSA 1TIMA 3QH2A 3MP5A 1TRIA 3NZRA 2ABBA 4ZZ9A 3NL2A 3G1FA 2Y7EA 3NL3A 1W5OA 4MY9A 5TQLA 5G2IA 2JKPA 1I2RA 4JX4A 2BX7A 3QF0A 4BF9A 3R5EA 5K9CA 3HPSA 3BG5A 3LXCA 3TROA 5G1TA 5DCDA 1XC4A 4BFAA 4L4MA 2A7RA 3U8GA 1EWDA 5EMUA 4M6PA 3EEGA 2DORA 3KOFA 2DZVA 1QO2A 2ZDRA 1AMKA 3LLFA 4IJBA 4UMCA 4PC8A 3L0NA 2VC6A 3CIXA 3N2XA 1GTEA 1PCKA 4CNOA 1OFOA 1P1XA 1WYIA 5D09A 4FIRA 2C13A 1Q45A 1GVQA 1YPFA 3I7SA 4UTTC 3SZ8A 3RLUA 3LXAA 3W7KA 3PG8A 5CSRA 3WJZA 2QCFA 3E96A 3AO0A 3VCRA 4RV8A 4HIBA 3HF3A 3S5NA 2X1TA 4N6FA 4E0CA 1R2RA 3W2JA 2YPIA 4DPPA 4PFMA 3W1NA 1D9EA 3I65A 1KBIA 2E77A 4KFPA 5C5YA 2WSQA 3JS3A 5F2MA 2P0OA 4NXSA 1OX4B 5D2WA 4H6KA 3GYEA 3UNDA 2V2DA 3B4UA 1CW2A 2QUUA 1WQ5A 1XL9A 5KSWA 1SFLA 2OMAA 3NQCA 1GG1A 1BEUA 1YDOA 1LP6A 4CCEA 2ZZ4A 1OK4A 3M5ZA 3M5YA 2B7PA 3L67A 5DXYA 4GNJA 3FIGA 4LWWA 3M5XA 1Z41A 3HQ1A 3MHGA 5AHEA 4JYEA 3MBDA 4HSNA 3KVLA 5D04C 3EWBX 2QCNA 1PE1A 1T8XA 2CLIA 5GVJA 2X1RA 3HGJA 1BWKA 1XM3A 3LOTA 4S2BA 3TW6A 4AXKA 4DEFA 1VCGA 4MOZA 1W31A 1OX4A 1O5XA 4WUIA 1PL9A 3P80A 1CX9A 1ADOA 2C1HA 2GUUA 2BXVA 2VFIA 4ZQPA 1L6YA 1AL7A 4JX6A 2E5CA 2B7OA 1L9WA 3G8RA 1X1ZA 2AGKA 3G1DA 1OFPA 2OT1A 2TYSA 2PRMA 5F1UA 4CLMA 1Z44A 3GDLA 3SW6A 4JN6A 4P2VA 3ZS4A 4GUIA 2A6LA 4ORMA 5G2WA 4Z1CA 3W23A 3KVJA 4MUZA 3UQNA 1I2OA 2V2CA 4LC8A 4AH7A 3HB9A 1GOXA 5E0KA 2WNNA 4OE7A 1T0OA 1UBSA 1VGAA 2H90A 1PVNA 4ML9A 2H8XA 1AK5A 2GQ8A 4MJMA 4KFNA 2R91A 1GTHA 1TTJA 3N3MA 4UNKA 3TKFA 1F2JA 4DF2A 2A21A 5KMYA 2E5BA 2V0TA 4WOZA 2C3ZA 3LCLA 1GZGA 1QR7A 1OABA 4FB7A 1LOSA 3M1ZA 1QPOA 3QMTA 3M44A 5AC6A 5D05A 5EL1A 3O8AA 3NDOA 3S0CA 3EKLA 1TPC1 5K7JA 2YX0A 4YL2A 3NQGA 2Y70A 1EP2A 3BV4A 1BWLA 1W5MA 1MZHA 4QSHA 5KITA 4YCPA 1ME9A 3GR7A 1S5WA 3GNDA 4JX5A 2VFDA 3W22A 5BMWA 3WJSA 3W70A 4O13A 5G4WA 3C4UA 5FEXA 4UTHA 3NG3A 2F84A 1W56A 3DENA 3KFTA 3W1MA 3W75A 3OHIA 5EYWA 3H53A 2CW6A 4AWTA 3BGJA 2W6RA 4Y90A 4JDYA 4M7TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1R2T A;  4WF7 A;  5LNU A;  4HPG A;  4MNK A;  1XUZ A;  1A5A A;  2Y24 A;  2VT0 A;  1ONE A;  4DBW A;  4IFK A;  4PCS A;  3PUL A;  4IX0 A;  5HMD A;  4PTN A;  7REQ B;  1ICP A;  2RKX A;  5A95 A;  3RCM A;  3ZJ8 A;  1RH9 A;  2YDS A;  5CAH A;  2E8Y A;  3CGT A;  1Q85 A;  1SJA A;  4NJJ A;  3A4W A;  1W3H A;  2VC9 A;  2R1M A;  3GW0 A;  3S5O A;  1QOQ A;  2Y62 A;  1I0D A;  2D2O A;  5H8U A;  1D2K A;  1BVZ A;  3WDP P;  3GHS A;  1V4Y A;  2G96 A;  3F4D A;  4JIC A;  3ITY A;  6ENL A;  1KLY A;  1UH2 A;  4DXK A;  3STE A;  3NQB A;  1C29 A;  2CC0 A;  4HN8 A;  5DCB A;  4C7D A;  3KVM A;  5AHI A;  5H1W A;  1YDN A;  3AHV A;  2V5C A;  4NI8 A;  1QRQ A;  4GE8 A;  5FJT A;  3O1N A;  3VGB A;  3W72 A;  3W7L A;  3NQ7 A;  3PPF A;  1IQ8 A;  1MYR A;  3LM7 A;  1NEY A;  1ZAJ A;  4L6H A;  4NJG A;  5CZS A;  2WHJ A;  4GK8 A;  1ADD A;  1K9T A;  1W6T A;  4UFI A;  3RM9 A;  4GAC A;  3VK5 A;  4S3E A;  3WNN A;  3M07 A;  1KR0 A;  1WAW A;  4UWM A;  4OZO A;  3N9K A;  3TSM A;  1B3Y A;  4MFD A;  1OCB A;  3IRD A;  3BG9 A;  4HA1 A;  1DTN A;  4S3C A; 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