2E9LA

Crystal structure of human cytosolic neutral beta-glycosylceramidase (klotho-related prote:klrp) complex with glucose and fatty acids
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
466
structure length
466
Chain Sequence
MAFPAGFGWAAATAAYQVEGGWDADGKGPCVWDTFTHQGGERVFKNQTGDVACGSYTLWEEDLKCIKQLGLTHYRFSLSWSRLLPDGTTGFINQKGIDYYNKIIDDLLKNGVTPIVTLYHFDLPQTLEDQGGWLSEAIIESFDKYAQFCFSTFGDRVKQWITINEANVLSVMSYDLGMFPPGIPHFGTGGYQAAHNLIKAHARSWHSYDSLFRKKQKGMVSLSLFAVWLEPADPNSVSDQEAAKRAITFHLDLFAKPIFIDGDYPEVVKSQIASMSQKQGYPSSRLPEFTEEEKKMIKGTADFFAVQYYTTRLIKYQENKKGELGILQDAEIEFFPDPSWKNVDWIYVVPWGVCKLLKYIKDTYNNPVIYITENGFPQSDPAPLDDTQRWEYFRQTFQELFKAIQLDKVNLQVYCAWSLLDNFEWNQGYSSRFGLFHVDFEDPARPRVPYTSAKEYAKIIRNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Klotho-related protein is a novel cytosolic neutral beta-glycosylceramidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cytosolic beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 192
structure length 466
sequence length 466
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2e9lA00
1HN1A 2V38A 5M5DA 2IXVA 2G4FA 1WZKA 3MUAA 2CCRA 3VD9A 1US2A 3LPPA 2E8ZA 1KGWA 4PCTA 3BCDA 5A2AA 3WDHA 4AY1A 4MTVA 2BS9A 4AIEA 5AC5A 1OT2A 3AHXA 1CECA 1VEPA 3WH6A 3VU2A 4URIA 1EHAA 1UR0A 4XZWA 4P8UA 1D3CA 5CPSA 5E70A 2XFFA 4LQ1A 4GZEA 3RCNA 4MB1A 4AZ6A 3A3HA 4GO9A 2GDUA 1H41A 3WF3A 2VX6A 4H8HA 2YL8A 1CTNA 3B9AA 1R85A 3EYPA 3DHUA 2QV4A 3W24A 5CGMA 2X05A 4AZCB 5CLTA 1MW3A 1UWTA 3F4VA 2BNJA 3AIWA 3GYCA 5JBEA 3U7VA 1LWHA 2CERA 5A6SA 4U31A 1W9VA 5FD0A 4F9JA 3VIKA 1UD6A 3DYMA 1JXKA 2VZVA 5CXPA 1JAKA 2QHAA 1MWOA 4ML4A 3VIPA 1GQJA 1GNXA 1HT6A 1E5NA 4PMUA 4TVDA 2WMKA 3POHA 5CGTA 1OWQA 4KMQA 2DPEA 2EPLX 4LYQA 4HP5A 2F8QA 4UOJA 1ZBVA 3EDJA 4W85A 1WCGA 2WVTA 5LA0A 4M82A 4AZCA 1ISZA 1E56A 1BYBA 4XZBA 3W4RA 2YLLA 2QLYA 4ZENA 2XG9A 1B3YA 4CD7A 2YA0A 1E0VA 4W86A 5D8WA 4PTWA 2E8YA 3K8KA 2J7DA 1UWQA 4A4AA 1UZ4A 2WC7A 1EOKA 1FHLA 4HTYA 1CEOA 8CGTA 2XGBA 1PZ2A 1E1FA 3SCSA 4HA4A 2C7FA 5I2UA 4AIUA 2ZWYA 1N82A 1KFWA 3ZSSA 1C92A 4PMVA 2BY1A 3EDDA 1HJWA 3BMWA 4FLOA 3N12A 3TTQA 1ZL1A 2D1ZA 3IAQA 2XTKA 3N13A 5F7UA 5CJ5A 1CXFA 3ECQA 4LPCA 3PTQA 3NSMA 4W5UA 5DT7A 2IUZA 2C8NA 3AZTA 4GZJA 3AMGA 1C91A 3WUFA 3ALFA 1AQ0A 4CN1A 2XFYA 1TZ7A 3WF0A 5I24A 2WVUA 1HKKA 1UR9A 1E4LA 1UR8A 3CZEA 4PCSA 2XSBA 3M07A 1PX8A 4BZYA 2WSKA 2A3CA 1OGSA 4PBGA 2DSKA 3K8LA 1AQHA 3GXIA 4QAWA 3TONA 4UZSA 1H5VA 1GOMA 4WSKA 1DEDA 1J18A 2O9PA 1B9ZA 3WN6A 3GH4A 4UQ9A 4AD3A 2VC9A 1B3VA 1LL6A 1V03A 3SCPA 3MSDA 4GPNA 1O6IA 2VQTA 4UFJA 1U30A 4D72A 2NSXA 1W9PA 4AW7A 1GPFA 5M3WA 3UR7A 5GNXA 3A47A 4J3XA 4CU7A 3OLIA 2BHUA 4BCEA 4AZHA 5A8MA 1ISWA 3AIUA 5I5RA 1GOKA 4CCEA 2WLYA 2ZWZA 3M7SA 1R7AA 3B9EA 3VGDA 1JGIA 2YDRA 5DT5A 3FHQA 2WCSA 3W29A 2W66A 5HXMA 3SCWA 3A4XA 1V6WA 3BAYA 1NM9A 4PUEA 3AMKA 1UD8A 3CZGA 2ZUMA 5A95A 3F5KA 3UCQA 3VILA 4HA3A 1TA3B 3OG2A 1UWRA 3T2QA 1HJQA 5IXEA 3I3BA 3OGRA 1V0LA 1C90A 2D2OA 2F2HA 2DH2A 4JHOA 4AD0A 2GJXB 4LXFA 2GJPA 3AIBA 2J47A 1EA9C 2G3JA 4WKHA 3QOMA 1E4IA 2FDMA 3T09A 1H49A 4HPHA 1QNQA 1H11A 1JYWA 1GOIA 2VUYA 3BSGA 2Y24A 2JIEA 3ZJ8A 1WDPA 1ESWA 2DT0A 1G01A 4IPNB 2V5CA 1UQYA 4MJ4A 4LGXA 3EDEA 1E40A 1UD2A 4Z2GA 1MW1A 2VRKA 1LJYA 3OB8A 1TA3A 1WPCA 2YBTA 3BAWA 2CHNA 3OLEA 2VCCA 1E15A 1XH0A 3A4AA 3AROA 1WDQA 4JL1A 1D2KA 5AY7A 1HL9A 3VX1A 2GJXA 2PBGA 1Q6EA 2QMKA 1VFOA 1TG7A 1PZ3A 1KGXA 3RPMA 1Q6FA 2GDVA 3AQUA 1SFSA 2GJRA 3SUWA 4UQDA 1NWUA 2VOTA 1AQMA 4M81A 2XVLA 1BYAA 5ABEA 2XVNA 5A6AA 4MNMA 1QW9A 2Z1SA 2ESCA 2DT3A 1RP8A 3SCNA 2DEPA 4Q22A 7TAAA 3ZJ6A 1QHOA 1UKQA 4W89A 3VDCA 5A6KA 3FW6A 1CGYA 1KCKA 1V02E 2CBVA 1E0WA 3RJYA 1JXJA 3WEMA 2FH8A 3WH8A 2OYKA 1XCXA 4U5KA 1PBGA 2WW5A 4Z2LA 3GNRA 5A8NA 1VIWA 2WAGA 1GHRA 4PMZA 3GXMA 5BXTA 4V28A 4GXPA 4MB3A 4P8WA 3WEZA 3PBGA 3UG4A 2FGLA 4K68A 5A8PA 2WBGA 3THCA 1JNDA 2V3GA 1UA3A 3SCUA 4WJXA 1NOFA 1UQZA 3POCA 2JF7A 3F5LA 1KQYA 1V3KA 2XM2A 1LF1A 3W26A 1WZAA 4EAMA 4J7RA 1VENA 3WF4A 2VJXA 4V2XA 2JIWA 3AOFA 1CXKA 3RIKA 5ABGA 3WBEA 3WNLA 1QNSA 3SCOA 1MQRA 2ZUVA 3VDBA 1WB0A 2WHKA 2WNWA 1OGBA 3U57A 2GK1B 1V0KA 4XUYA 1UH2A 4NSBA 2VZSA 3WD4A 3HJEA 3IAPA 4KWUA 4AD2A 6CGTA 3DC0A 5KEZA 2YL9A 1Q4NX 2XYLA 1PIGA 2OLHA 3AHTA 1JL8A 4KRTA 3BCFA 1B0IA 1XCWA 1JZ8A 3GBEA 3LPFA 2WC3A 1V0MA 4W7UA 3WKZA 1JG9A 2CKRA 1UD3A 3AMCA 3PZGA 3SEPA 4P7QA 3AISA 1QI3A 1HVQA 3WF1A 3WD2A 3BAIA 4JFWA 2CNCA 4QLJA 4IUGA 1HIZA 2E4TA 4AZ5A 2ZXQA 2GK1A 4EE9A 1R87A 1XD0A 1NP2A 2D20A 1KGUA 1J0HA 4NRRA 3CPUA 3WFLA 2CYGA 3KL0A 5CQ1A 2WMFA 5IDIA 4ZEPA 2DSUA 5BRPA 1E0XA 1FH7A 3ARPA 2PWHA 1W91A 4QP0A 1NWRA 2J62A 4JFSA 2WHJA 4E2OA 3WENA 2J7HA 3ZQ9A 4EK7A 1VJZA 1G5AA 4MAZA 1C93A 1J0YA 2XVPA 4Z2IA 3UESA 5A8QA 3WFZA 1E6QM 4TVUA 2VI0A 2DSZA 1M03A 2VVSA 1K6AA 4J3TA 4JIEA 3EMCA 1XSKA 1NH6A 2OSXA 2JE8A 1GZJA 5FIPA 4ACZB 3WUGA 1CGTA 5BWFA 1HKJA 4AEEA 5KZ6A 1CXLA 3ZJ7A 2D0FA 2DT1A 5I79A 1ZU8A 3GNPA 3TP4A 3M46A 4P7NA 3WQ8A 1BG4A 1I1XA 3CUFA 4M80A 9CGTA 1PPIA 4FK9A 1HP5A 1XRVA 2FHCA 3SURA 4PMRA 1DWJM 4D6FA 2ZUUA 1H4PA 2DT2A 3IANA 3K46A 1GW1A 4QFUA 5FOOA 1G9HA 3NSNA 3O2LA 3T08A 4X0NA 5BROA 4S3KA 1BAGA 1W1PA 4JKMA 3MMDA 2VCAA 3WQ6A 4ACZA 3A6OA 4M29A 1XHGA 3GTNA 2PWFA 2WKGA 2A3AA 4HMDA 1VFFA 3TTSA 5ECUA 2E3ZA 4TUFA 4WKFA 3LMYA 3PZUA 3L4UA 5I0DA 3VD4A 1W1VA 1B3WA 1PX3A 2YIHA 4EKJA 3N18A 2XJ7A 3PZTA 2AMGA 2EQDA 3WD1A 1BG9A 1HF6A 4DWSC 4ATDA 3AYSA 3AXHA 1ITXA 3ARVA 3QOKA 1V6YA 3L2MA 3W37A 2VVNA 4FF5A 4MNKA 4OBRA 4D6CA 1CXIA 2WHLA 1FFQA 1GCYA 4JKKA 1SMAA 1UYQA 5BXSA 3CLWA 2CXGA 4AEFA 1RD6A 2WVVB 5BXRA 2GVYA 2J7GA 5A1AA 1X6NA 1CENA 1UH3A 2A3EA 3U5YA 3PZIA 4GI6A 2VR4A 1EO5A 1UD4A 4TTUA 4N0RA 2VX5A 4XX6A 4Z2KA 1B30A 3ZJKA 2YBUA 1GORA 3MMUA 4H04A 4IPLA 1EHNA 4C7FA 1H0GA 1JFXA 1KXVA 3MANA 5E6ZA 3W28A 2ZX7A 4PTMA 3N1AA 1I75A 1UZ1A 4B3KA 1BPLB 1QHPA 1U33A 2Y5EA 4H2CA 1EOMA 1S46A 1IV8A 4J28A 2ZX9A 1AMYA 3CUGA 3UR8A 2J8GA 1E71M 5DFAA 5FL0A 2WC4A 1VFMA 2EEXA 2VZOA 3L4TA 2CEQA 2WVVA 3W53A 4PTXA 1VFUA 3SCTA 2X0HA 3SUSA 4BA0A 4KRUA 2G8ZA 2W61A 1J10A 3T2PA 5JBFA 2J7EA 4C7DA 4LYPA 3MSGA 1UKPA 1CWYA 1OIFA 4W8BA 3SUVA 1TUXA 3VGEA 3BAKA 1JI2A 3WDJA 5C70A 4AIOA 1UWUA 1MVYA 3F5JA 2VL4A 4YN5A 1HJXA 3AYRA 3WDIA 3BLKA 4PMOA 5IFPA 3BAXA 4HU0A 2HISA 1U2YA 3VD3A 4CVWA 2A3HA 1OGGA 3FHAA 2E9BA 2CIPA 5IHRA 1PIFA 1UUQA 1W9DM 4YPJA 1DHKA 1MXDA 1V3MA 3ZT7A 1TVNA 4CD8A 2W5FA 1XSIA 2D24A 4W5ZA 2V3DA 3WSUA 1M04A 1NQ6A 3AJ7A 1XSJA 3NDZA 4QLKA 3VNYA 3CUIA 1RP9A 2ZXBA 1LL7A 3L4ZA 3VGFA 5TD4A 3UG3A 1HJUA 4W7VA 3HN3A 1O7AA 4PUDA 2W67A 1GHSA 1EDQA 5HPOA 1XYFA 4Z2JA 4L4PA 4P7RA 5C8BB 1W1YA 2TAAA 3LPGA 4GI8A 2WWDA 1KCLA 2EO7A 1GQIA 1QHZA 2QPUA 3QHOA 1W1TA 3GH7A 5CZKA 1L0PA 4QCFA 2PI6A 5GQBA 3ZT5A 4UNIA 4D6EA 4HOXA 4DWSD 1JDDA 3WQ5A 1EDGA 6A3HA 2YL5A 5AC4A 4UQAA 3CZLA 3OLDA 1MXGA 1TVPA 4R27A 3CBWA 3CUJA 1ODZA 5DMYA 1NOWA 5D9MA 3W6MA 1QVBA 3BSHA 1KBBA 4LX4A 4WLCA 2BVTA 1CIUA 1NWTA 2VO5A 2PC8A 5M03A 2OSWA 3VDHA 1MQPA 1JYXA 4KGJA 1OBAA 2X2YA 1GUVA 3ARSA 5A8OA 2EPMX 3MUIA 2VMFA 2DIJA 2BHYA 4CN4A 1C8YA 1FA2A 3IJ7A 3NDYA 1FP9A 1TR1A 4J3UA 1JZ3A 2A3BA 4OOZA 1OD8A 1GONA 1H0IA 2PBOA 5GPRA 3A4WA 3VKKA 1DP0A 1QI2A 1E3ZA 2ZX6A 3WUBA 3WD3A 3N9KA 1UWIA 2FHFA 1KQZA 3GZAA 3N15A 5DO8A 4ZXLA 4HZ8A 4UOZA 2Y8KA 4CD4A 1OT1A 1J11A 1F4HA 3ARZA 3KL5A 3VGBA 3AMLA 4D1JA 5GNYA 3ZT6A 1C3FA 3WNMA 2W62A 5E09A 1A3HA 4J3SA 1G0CA 4DUVA 4UFIA 4PMNA 2G41A 3PZMA 5CLWA 1W3JA 1V0NA 3WUEA 4TX6A 1HNYA 4MPKA 1XH2A 2J79A 1QPKA 2DIEA 3VMPA 3VOCA 3RJXA 4PYSA 2D22A 4A3YA 5D8ZA 3M6DA 3N11A 2JALA 2BHZA 5IFTA 3AXIA 3GM8A 1V3LA 2WPGA 4GO8A 5LYRA 4UZUA 1XV8A 4DUWA 2V3FA 4GQRA 4P7OA 4AZGA 5I77A 1R8LA 1GOQA 2X1IA 1PEZA 2FGZA 5AYIA 2O9RA 3OZPA 3RO8A 1KBKA 5LA2A 3WD0A 7CGTA 4GIAA 4QDMA 4R5EA 2RGMA 1UR4A 5CPQA 1YHTA 5A6BA 2EPOA 4AXNA 1BVZA 4CU6A 2XFRA 2OWWA 1JD9A 3MMWA 4HOWA 1W3HA 4W93A 1TFVA 2YL6A 4NF7A 4XB3A 2WLZA 5D9NA 2WBKA 3NCOA 5A6BD 3WF2A 4NZCA 1R7OA 8A3HA 3VINA 1SR0A 4A3HA 1C7SA 3NIYA 1P6WA 3S2CA 2MANA 1VEMA 5LA1A 2C0HA 3ALGA 4EANA 1KWKA 5EB8A 4D6HA 1WKYA 2BFGA 4BF7A 1J0KA 2B31A 4F8XA 4H8UA 3PTMA 1QI5A 2Q8XA 4UQBA 2J4GA 3SIMA 5CPTA 1UWSA 1CGVA 1FH8A 2AAAA 1H2JA 3CO4A 1OD0A 1ZJBA 1UR1A 3CIVA 4JFUA 2X09A 1EQCA 3MO4A 4M1RA 1JYNA 1V3HA 4H41A 4JHZA 2YKKA 2D0GA 1HJVA 4CVUA 1XD1A 2VT0A 3VM5A 3VDAA 2BVYA 4OBSA 1L8NA 4HA1A 1W2VA 5A69A 5M17A 1LG2A 1HXJA 1WNOA 4ZE5A 1C8QA 1CDGA 3FY1A 3OIHA 3BXWA 3VX0A 4D6JA 4H8VA 4W88A 3VGGA 3QHMA 3VMOA 1WE5A 1BHGA 3WMSA 3E1F1 5A2BA 3QGVA 4MDOA 5FL1A 2ZUWA 1ODUA 3ZO9A 4PRWA 3VVGA 2V3EA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HN1 A;  2V38 A;  5M5D A;  2IXV A;  2G4F A;  1WZK A;  3MUA A;  2CCR A;  3VD9 A;  1US2 A;  3LPP A;  2E8Z A;  1KGW A;  4PCT A;  3BCD A;  5A2A A;  3WDH A;  4AY1 A;  4MTV A;  2BS9 A;  4AIE A;  5AC5 A;  1OT2 A;  3AHX A;  1CEC A;  1VEP A;  3WH6 A;  3VU2 A;  4URI A;  1EHA A;  1UR0 A;  4XZW A;  4P8U A;  1D3C A;  5CPS A;  5E70 A;  2XFF A;  4LQ1 A;  4GZE A;  3RCN A;  4MB1 A;  4AZ6 A;  3A3H A;  4GO9 A;  2GDU A;  1H41 A;  3WF3 A;  2VX6 A;  4H8H A;  2YL8 A;  1CTN A;  3B9A A;  1R85 A;  3EYP A;  3DHU A;  2QV4 A;  3W24 A;  5CGM A;  2X05 A;  4AZC B;  5CLT A;  1MW3 A;  1UWT A;  3F4V A;  2BNJ A;  3AIW A;  3GYC A;  5JBE A;  3U7V A;  1LWH A;  2CER A;  5A6S A;  4U31 A;  1W9V A;  5FD0 A;  4F9J A;  3VIK A;  1UD6 A;  3DYM A;  1JXK A;  2VZV A;  5CXP A;  1JAK A;  2QHA A;  1MWO A;  4ML4 A;  3VIP A;  1GQJ A;  1GNX A;  1HT6 A;  1E5N A;  4PMU A;  4TVD A;  2WMK A;  3POH A;  5CGT A;  1OWQ A;  4KMQ A;  2DPE A;  2EPL X;  4LYQ A;  4HP5 A;  2F8Q A;  4UOJ A;  1ZBV A;  3EDJ A;  4W85 A;  1WCG A;  2WVT A;  5LA0 A;  4M82 A;  4AZC A; 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