2E9LA

Crystal structure of human cytosolic neutral beta-glycosylceramidase (klotho-related prote:klrp) complex with glucose and fatty acids
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
466
structure length
466
Chain Sequence
MAFPAGFGWAAATAAYQVEGGWDADGKGPCVWDTFTHQGGERVFKNQTGDVACGSYTLWEEDLKCIKQLGLTHYRFSLSWSRLLPDGTTGFINQKGIDYYNKIIDDLLKNGVTPIVTLYHFDLPQTLEDQGGWLSEAIIESFDKYAQFCFSTFGDRVKQWITINEANVLSVMSYDLGMFPPGIPHFGTGGYQAAHNLIKAHARSWHSYDSLFRKKQKGMVSLSLFAVWLEPADPNSVSDQEAAKRAITFHLDLFAKPIFIDGDYPEVVKSQIASMSQKQGYPSSRLPEFTEEEKKMIKGTADFFAVQYYTTRLIKYQENKKGELGILQDAEIEFFPDPSWKNVDWIYVVPWGVCKLLKYIKDTYNNPVIYITENGFPQSDPAPLDDTQRWEYFRQTFQELFKAIQLDKVNLQVYCAWSLLDNFEWNQGYSSRFGLFHVDFEDPARPRVPYTSAKEYAKIIRNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Klotho-related protein is a novel cytosolic neutral beta-glycosylceramidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cytosolic beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 192
structure length 466
sequence length 466
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2e9lA00
2ZX5A 4HOXA 4WSKA 1C8QA 1MW2A 1HVQA 4GZEA 3VGBA 3VIHA 3W6LA 4JL1A 1DP0A 1OWQA 1V0NA 2YJQA 1E71M 3FHQA 2CPUA 3FAXA 2DIJA 2XUCA 3L4ZA 2W66A 3FW6A 5E09A 1E5NA 3AYRA 2PI6A 1HX0A 2VVNA 3CZKA 4J3WA 1BQCA 4DWSB 1ISXA 3CUJA 2V3EA 1VJSA 5A6SA 1JAKA 4J28A 1JF5A 2DGAA 4E8DA 3OGVA 1AQ0A 2GJPA 2PC8A 5I23A 3AICA 1TA3A 2CKSA 1CPUA 1E0XA 1UQYA 2UWFA 2YKKA 4Y7EA 7A3HA 4X9YA 3OIHA 1JIBA 4X0NA 3VD9A 2ZWYA 1QNRA 2WC3A 1V6XA 5D9PA 2DQXA 2Y4SA 4UZUA 4Z2HA 4C7GA 1XV8A 4DUVA 2DSZA 2E9LA 1B0IA 1UWQA 3N11A 2E8ZA 3MV11 4OZOA 3W82A 3A4AA 2FH6A 4D1IA 3BH4A 4D6IA 2ZX7A 2Z1SA 2EPKX 3AIUA 4GQRA 2JFEX 1JZ7A 1EO5A 3UEQA 3AS1A 1J0JA 4U31A 2MANA 4PMVA 1QVBA 1M04A 2BV9A 1GZJA 1CXFA 4S3JA 1C7SA 5C70A 1JNDA 4HOZA 2WMIB 3KEHA 2WLZA 1CXHA 3ZR6A 2VL4A 4MJ4A 1GQLA 4JL2A 2J4GA 3N12A 4BCEA 4F66A 1UHVA 5D8ZA 1B1YA 5E9AA 4MB3A 3AZRA 5CLTA 4PN2A 2XWEA 5DT5A 4M82A 2QMJA 3U57A 2BY3A 3K4DA 2WVTA 1DEDA 2WNWA 3PZQA 4NZCA 1W1PA 2A3EA 4WF7A 1KXQA 2YLLA 1R8LA 4P7QA 2VZUA 5HDRA 3RMEA 4AIUA 1EOKA 3I3EA 4PUEA 2DH2A 1G5AA 1LL4A 1WDPA 2W92A 3AZSA 4J3XA 4HZ8A 3WUEA 1EGZA 1GVIA 5CGTA 2YL6A 3A47A 3KL5A 3RM4A 1UH2A 3BCDA 5EFFA 1Q6GA 3ARVA 4OJYA 4JFWA 1MVYA 2WANA 2EBNA 7TAAA 1EHNA 2NW0A 2J8FA 2IXVA 2ZXQA 1CDGA 1V3MA 2FGLA 3APGA 2CBIA 4GXPA 2X0HA 3PTKA 4AC1X 2XGBA 2YDRA 5I79A 2C0HA 2GFTA 2J62A 4IISA 5D9MA 3U7BA 1W9XA 5ABHA 2YLAA 2WKGA 3AOFA 4CVUA 4W5ZA 3M07A 3PZGA 1CXKA 2NSXA 1ISYA 4M8UA 3TTSA 1KGWA 2CCRA 3AZTA 1E55A 3CUGA 3MUY1 5D9NA 2WAGA 4U5IA 1PZ2A 1B3XA 1GOIA 1FOBA 2XFYA 3UESA 3MV01 1E4LA 1FH9A 5A8QA 5C71A 1E6ZA 2WHKA 3AMLA 2G4FA 2UY5A 3ARXA 5D4YA 3VKKA 3WL1A 4IPNB 4KGJA 2O92A 3OGSA 3WL0A 4TX6A 5JBEA 4UOJA 1Q4NX 2XWDA 3MU7A 2CEQA 3ZOAA 2JE8A 4EANA 3VIJA 3OLEA 2GSJA 1OCQA 2E0PA 1NM9A 3W38A 1JZ3A 4OOZA 2DH3A 2VMFA 1GW1A 1OM0A 3PBGA 1JL8A 4W8AA 3AXHA 4CCEA 4UTFA 4IPLA 4CD7A 3U5YA 1RPKA 3WEZA 3VX1A 4YHGA 1ZJAA 2E4TA 3WQVA 5BCAA 3WEOA 3WH5A 1XH2A 1E15A 3LPGA 3O2LA 3ZJKA 3M46A 4Q22A 5CZKA 3VU2A 2EPOA 5I6SA 1NOUA 1KBKA 4M1RA 5A6MA 2GJXA 4GZIA 4W7VA 2J7DA 1VFMA 3WF3A 3WD0A 5A8OA 1OINA 1E9LA 1DWGM 2WC7A 3VPLA 5IHSA 1UUQA 1D3CA 1A47A 1WDRA 5HPOA 1FFQA 1EH9A 4D71A 1EDTA 1UR1A 1TR1A 2W91A 1Q6CA 1GJWA 3IAQA 4RL3A 4D6HA 4AZCB 3RJYA 6A3HA 3CBWA 1HJUA 5BXTA 2X0YA 2ZUMA 3VD4A 1H0IA 4M29A 4EKJA 2J74A 2F2HA 1MQQA 2WWDA 6CGTA 1VBUA 4PSRA 4E2OA 2XM1A 3PZTA 2XFRA 2FHFA 4F9DA 1BHGA 2JALA 4MNJA 3VD7A 1JZ2A 3GNPA 4R27A 4D6CA 3VDBA 2Q8XA 1VAHA 1K6AA 1OB0A 3AHXA 1XC6A 3BMVA 3BC9A 4QCFA 2J7FA 1E56A 3WN6A 3OA5A 3WF4A 4NSBA 1GQKA 1GOQA 1B3WA 2CBJA 3RILA 1JYXA 5BXSA 2QPSA 3WNPA 1Q6FA 4D6JA 3TOPA 2YBUA 5E0FA 3AISA 5ABEA 1FFRA 1E6XM 5A6LA 4Z2GA 3M6DA 2GK1A 1VF8A 1V02A 2WHLA 3CZEA 2QLYA 2WMJA 2W62A 3NSMA 5EB8A 4W5UA 1CGYA 2BS9A 3ARTA 5E6YA 4C7DA 1Q6EA 4GIAA 2OWXA 1E73M 3QOKA 3ARYA 2WB5A 2VRKA 3CO4A 1LL7A 2A3BA 4AZ5A 3IK2A 3OZPA 2E9MA 1W91A 5A69A 3ARUA 3TONA 4DWSD 3GBEA 4JHOA 1JZ4A 2WMFA 1W9PA 2DSUA 2VX5A 1SFSA 2OYMA 3ARQA 2DT0A 4KGLA 4GO9A 1BLIA 2WSPA 1CENA 1CBGA 1W1VA 5KZ6A 2ZUNA 2VCBA 3SUVA 2XIBA 1N82A 5IFTA 1PIGA 1O6IA 4P8UA 1QI5A 4P7RA 2CYGA 4AD1A 2EQDA 1CYGA 3WFZA 4AISA 4F8XA 3PZNA 3TTYA 1OGGA 3W6MA 5A6BD 3ZSSA 1X1NA 1EQCA 1JYVA 4M24A 4PTVA 3UERA 1W1TA 5A6JA 1V0MA 2XSBA 4V28A 1E1EA 5IFPA 3W37A 3SCPA 2NT1A 1VFFA 1NOFA 3ZT5A 5I3DA 1HJVA 5I0DA 1ISVA 1ZL1A 2ZXAA 1HL9A 1DTUA 3N1AA 2Y8KA 4AZGA 1HKJA 4PMXA 2CHNA 4B15A 1TVPA 1CNVA 1KXHA 1EDGA 3PZVA 1BPLB 1E6NA 4UCFA 4PMOA 1DWIM 4PYSA 4RE4A 2TAAA 1JXKA 4M56A 1GQJA 1B3VA 4CD5A 1V3KA 1QPKA 2VCAA 5I77A 3WY1A 1GVYA 3AMGA 1ZBVA 2V3FA 3WDJA 3FY1A 2CKRA 4D72A 4WKHA 1J9YA 1JDAA 5I78A 1H5VA 1UQZA 2O9RA 1GOWA 3BAJA 1JYNA 2VOTA 4QLKA 3RDKA 4FLSA 1UYQA 1W9UA 2D20A 2OYLA 4LYPA 3WQ4A 2VURA 4UNIA 3SUTA 3U7VA 2CXGA 4UOQA 3UG5A 1NWSA 4PRWA 3CZJA 2CETA 4UOZA 1W2PA 1W1YA 3K4AA 1UKPA 3AIVA 1MXDA 3UG3A 1H2JA 3CUFA 4HZ7A 3CIVA 1XD0A 4S3KA 9CGTA 3DYMA 2WYSA 1WZLA 2CHOA 4AEEA 3QHMA 4XZWA 2PWDA 4JKMA 1VB9A 2X09A 1LLOA 4H7VA 2DSKA 2O9OA 1BYAA 3WD3A 1OT2A 4MPKA 4H8UA 4Z2IA 4MDOA 1JXJA 4XX6A 1QI3A 4ACZB 3ZM8A 2ZE0A 3BLKA 2GDVA 2XPKA 3TTOA 3WQ6A 3VIFA 1C8XA 1V0LA 2VVSA 1GJUA 1KGUA 1J12A 3MKKA 1TVNA 4AY1A 1DWFM 4WLCA 3GXIA 3AMKA 1HKKA 1NWRA 2X8RA 1O7AA 3L4VA 3AFBA 1B31A 3SCVA 4QFUA 1G0CA 4PUDA 4BF7A 2ZOXA 4L4OA 1GOMA 2DT3A 2PWFA 4AIEA 1LF1A 1J0ZA 1UKTA 4ZE5A 2FGZA 1KR1A 1PZ3A 4JCLA 4P8WA 3UCQA 1TMQA 1NWTA 5GNYA 2EO7A 2WMGA 1AQHA 1JD9A 4BQ3A 4JKKA 1J0YA 3KL3A 5A8PA 1PX4A 8A3HA 3T2OA 5CPTA 4PMYA 4DWSA 2XFFA 1US3A 3GBDA 2VRQA 2ZUUA 1QBAA 3RM9A 5JIPA 3EBVA 1AMYA 1K9FA 3PZUA 4OBSA 3ECQA 1W3KA 3CHEA 3DYPA 3KE0A 4JFUA 1ZU8A 2QPUA 5M3WA 3RPMA 1V02E 1FP9A 4WJXA 1ECEA 2CBVA 3EDJA 4MNKA 1V6YA 3FXYA 3NUKA 4FK9A 2Y5EA 4AZ7A 4QLLA 1J11A 4ATDA 3SUSA 3MMWA 5CGMA 1UWUA 1U33A 4CD6A 2DIEA 3G6MA 1KB3A 2BVDA 3THCA 3W81A 1UZ4A 1WAWA 3NSXA 4XUYA 3THDA 3BAXA 1W3JA 2AOSA 3W25A 1UR0A 1H49A 4PCSA 4D6EA 1AVAA 1E72M 4YPJA 3ZJ7A 4E4PA 4H04A 2WZHA 3ARPA 3L4YA 2D3NA 3OLDA 2WMIA 4BS0A 3KWXA 1OD8A 1FA2A 1BVZA 4XB3A 4UQCA 1ODZA 4UQ9A 2BVTA 2ZUWA 5GNXA 1R7AA 1DWAM 4LGXA 2ZX8A 4URIA 3A3HA 2W67A 3QR3A 1C90A 4TTGA 2J7HA 2YL5A 5AC5A 2VR5A 2BVYA 1UD2A 2XGIA 3ZJ6A 1B3ZA 3VDCA 2C8NA 3VX0A 2FH8A 3N17A 1MW3A 2DPEA 1ITXA 1BG4A 2G8ZA 3CHCA 3NDYA 4UFLA 1E6PA 1JFHA 1VRXA 1CXIA 3VM7A 1MXGA 2XVPA 3VIMA 3WDIA 4GI8A 4BZYA 4LXFA 3WNNA 1QI2A 1VEOA 3CH9A 4E8CA 1H0GA 4MNMA 4TXEA 2DT1A 3WBAA 2JIEA 3GXFA 2VI0A 4MADA 4CD8A 4V27A 3FNDA 2W63A 4WKFA 2WLYA 1AQMA 2EPNA 2W5FA 5A3HA 3W28A 4Z2LA 1XD1A 2CERA 3N04A 1LQ0A 1CGVA 4D6DA 1BTCA 4QCEA 5CPQA 1B90A 5BXRA 3AMCA 1JI1A 1V3LA 3ZQ9A 4U2YA 3T0BA 2G3IA 2PBOA 3WUBA 1PBGA 3DHUA 4LYRA 1H09A 2A3AA 1WZMA 3SCUA 1WDQA 4W8BA 1JDDA 3MMDA 1BFNA 1WNOA 1QOXA 3CUIA 1C93A 4LX4A 1SMAA 1U2YA 4GKLA 2WCGA 2ZX6A 3SCRA 3W26A 4M81A 3WD4A 3GYCA 4AWEA 3F5LA 4FLRA 3WFLA 1J0IA 5A94A 3MSDA 3SUUA 4Z2KA 3SCNA 5M17A 3T2QA 3NCOA 5I5RA 2D22A 3BAWA 3S6TA 2BHYA 4XZBA 2D0FA 3AXIA 1GHSA 1ZB5A 2J47A 5DT7A 4FLOA 1BAGA 1E3ZA 4OKDA 1G9HA 1KBBA 2CNCA 3KL0A 4B9ZA 1LWJA 2QHAA 1HJWA 2WCSA 4CCCA 1HF6A 5ECUA 2CITA 3PZMA 2G3NA 5AYBA 3E1F1 2WXDM 2O9TA 1C92A 1NH6A 1UD5A 3OLGA 5EBAA 4JIEA 3MUAA 1GPFA 1QI4A 2FHCA 4HPGA 1US2A 3LPFA 3BXWA 4TVUA 2X1IA 1RP8A 3VM5A 1CGUA 1J10A 2VT0A 1QNSA 4MB1A 4N0RA 7CGTA 4GZJA 4AYSA 1B2YA 4BQ5A 1GHRA 3ALGA 4GQQA 1IT0A 4OBRA 4B3KA 1UWRA 2JEQA 2X2YA 4AZCA 4FF5A 5A8NA 1V6WA 3A4WA 3NDZA 4W93A 3PN8A 2YL8A 4KWUA 3WDHA 3ZJ8A 2WBKA 3PZOA 3ZT7A 1FH8A 3EYPA 5CQ1A 4W86A 3VD3A 2J25A 1QBBA 5JBFA 1VEMA 1MQPA 2JIWA 2YL9A 1GOOA 4OUEA 5AC4A 2ZXDA 2D23A 3BCFA 2D3LA 1W3LA 3WD2A 1PX8A 3WQ8A 5FCZA 1UD4A 3B9EA 3O6AA 2ZUTA 4FMVA 3VIPA 1KXVA 1J0HA 3VGDA 1WO2A 2JEPA 1KXTA 2DSVA 3SCWA 3VMNA 1HIZA 3SCTA 1RD6A 4ZFMA 1FP8A 1I1XA 1A3HA 1DWHM 3II1A 3MUZ1 3WDRA 3L4WA 2PB1A 5E70A 5KEZA 4R5EA 3ZT6A 3FAWA 2NT0A 4W8LA 1G01A 1K9DA 4CD4A 1UKOA 2OSXA 3CTTA 3HMCA 1E4NA 5IDIA 3WBEA 2IXUA 2ZWZA 1IV8A 1QNOA 1H4PA 1UWTA 3WKZA 3RM8A 1UOKA 3AS2A 5E0CA 1NP0A 4EAMA 2D1ZA 2OSYA 3BAYA 4EK7A 3GXMA 4PEEA 3T0AA 4AXNA 1XSJA 2OWCA 4JAWA 2XJ7A 3DC0A 1W3HA 1E70M 1KR0A 1NQ6A 3OLIA 2XYLA 4NF7A 1G94A 1Q6DA 1M53A 1QW8A 2GUYA 4OOUA 1ISWA 1CECA 1BVNP 4ZXOA 1GUVA 3VUPA 1MQRA 1B3YA 4ATWA 1VFUA 2D0GA 5EMYA 1OSEA 1Y7VA 4U33A 3AHTA 1C7TA 3WQWA 1TFVA 4B9YA 2E40A 2JF7A 2OLHA 4HA3A 2E9BA 1HJSA 1PJ9A 4RE3A 3W27A 1XCXA 3DECA 3FN9A 2BY2A 2BY0A 3M7SA 3W4RA 5EFDA 2QV4A 3WUFA 3WSUA 4KRUA 2YBTA 4J3TA 5A6KA 3EMCA 3QHOA 4MB5A 3IJ9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ZX5 A;  4HOX A;  4WSK A;  1C8Q A;  1MW2 A;  1HVQ A;  4GZE A;  3VGB A;  3VIH A;  3W6L A;  4JL1 A;  1DP0 A;  1OWQ A;  1V0N A;  2YJQ A;  1E71 M;  3FHQ A;  2CPU A;  3FAX A;  2DIJ A;  2XUC A;  3L4Z A;  2W66 A;  3FW6 A;  5E09 A;  1E5N A;  3AYR A;  2PI6 A;  1HX0 A;  2VVN A;  3CZK A;  4J3W A;  1BQC A;  4DWS B;  1ISX A;  3CUJ A;  2V3E A;  1VJS A;  5A6S A;  1JAK A;  4J28 A;  1JF5 A;  2DGA A;  4E8D A;  3OGV A;  1AQ0 A;  2GJP A;  2PC8 A;  5I23 A;  3AIC A;  1TA3 A;  2CKS A;  1CPU A;  1E0X A;  1UQY A;  2UWF A;  2YKK A;  4Y7E A;  7A3H A;  4X9Y A;  3OIH A;  1JIB A;  4X0N A;  3VD9 A;  2ZWY A;  1QNR A;  2WC3 A;  1V6X A;  5D9P A;  2DQX A;  2Y4S A;  4UZU A;  4Z2H A;  4C7G A;  1XV8 A;  4DUV A;  2DSZ A;  2E9L A;  1B0I A;  1UWQ A;  3N11 A;  2E8Z A;  3MV1 1;  4OZO A;  3W82 A;  3A4A A;  2FH6 A;  4D1I A;  3BH4 A;  4D6I A;  2ZX7 A;  2Z1S A;  2EPK X;  3AIU A;  4GQR A;  2JFE X;  1JZ7 A;  1EO5 A;  3UEQ A;  3AS1 A;  1J0J A;  4U31 A;  2MAN A;  4PMV A;  1QVB A;  1M04 A;  2BV9 A;  1GZJ A;  1CXF A;  4S3J A;  1C7S A;  5C70 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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