2E9LA

Crystal structure of human cytosolic neutral beta-glycosylceramidase (klotho-related prote:klrp) complex with glucose and fatty acids
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
466
structure length
466
Chain Sequence
MAFPAGFGWAAATAAYQVEGGWDADGKGPCVWDTFTHQGGERVFKNQTGDVACGSYTLWEEDLKCIKQLGLTHYRFSLSWSRLLPDGTTGFINQKGIDYYNKIIDDLLKNGVTPIVTLYHFDLPQTLEDQGGWLSEAIIESFDKYAQFCFSTFGDRVKQWITINEANVLSVMSYDLGMFPPGIPHFGTGGYQAAHNLIKAHARSWHSYDSLFRKKQKGMVSLSLFAVWLEPADPNSVSDQEAAKRAITFHLDLFAKPIFIDGDYPEVVKSQIASMSQKQGYPSSRLPEFTEEEKKMIKGTADFFAVQYYTTRLIKYQENKKGELGILQDAEIEFFPDPSWKNVDWIYVVPWGVCKLLKYIKDTYNNPVIYITENGFPQSDPAPLDDTQRWEYFRQTFQELFKAIQLDKVNLQVYCAWSLLDNFEWNQGYSSRFGLFHVDFEDPARPRVPYTSAKEYAKIIRNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Klotho-related protein is a novel cytosolic neutral beta-glycosylceramidase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cytosolic beta-glucosidase
total genus 192
structure length 466
sequence length 466
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2e9lA00
5JIPA 1SR0A 3WDJA 2TAAA 2WVUA 2J79A 4HPHA 1MQPA 1KB3A 3EDFA 3AFBA 4ZXOA 2W61A 1WZMA 4AZ6A 2YIHA 1ZBVA 2IXUA 3ALFA 4ZE5A 1VJSA 1H41A 1L8NA 4IPNB 1B31A 3AMCA 3SCWA 1EDTA 4CD8A 1JZ2A 1JZ4A 3ZT7A 5A6BA 2Z1SA 2O9OA 2YL5A 4WKFA 3ZIZA 4BS0A 2VZVA 1KCKA 4NSBA 1LWHA 2RGLA 1C8YA 5BXTA 1H11A 4AD0A 4AZGA 1E6ZA 1UA7A 1WB0A 2ZX5A 2VUYA 3BC9A 2E0PA 3VNZA 2XVPA 4LYRA 1DTUA 1UR2A 4DWSB 2GFTA 3CGTA 3DYMA 5FCZA 4U33A 2BY0A 1UWTA 2VZOA 1ECEA 4W85A 2QPSA 1UD4A 1V6WA 1JIBA 3T08A 5ABFA 2VT0A 2E8YA 3OLIA 3WUBA 1M01A 3VM7A 1UD3A 4MAZA 4M56A 1PPIA 4HA4A 4F79A 1UOKA 2J77A 1EQPA 4W89A 3KE0A 5LA0A 3II1A 5A1AA 2D23A 3SCQA 4ATWA 3K8KA 5GNXA 3AISA 2Y5EA 1E72M 5IHSA 4D72A 1RP8A 1BG9A 3MV01 2FH8A 4UNIA 5BRPA 3EDKA 3CZJA 5CGTA 4D6EA 5AY7A 2ZUNA 3EDJA 1GNXA 1W9DM 4C7GA 2DSVA 1E73M 3IJ9A 1R7OA 3OZOA 2WC4A 3VNYA 2XTKA 2VR5A 3WUFA 3VGFA 4AZCA 3VO0A 3PN8A 3SUVA 1EO7A 2X2YA 3AIQA 4XZBA 2VRKA 3W53A 2WMIB 1I75A 4P7RA 2D1ZA 4D6FA 2E9LA 1A3HA 1KBBA 1TFVA 1QNOA 2VC9A 3VM5A 3ZT5A 3T09A 5M17A 4Z2LA 2RGMA 1LLOA 3CZGA 4PUEA 4LPCA 4OUEA 1W3KA 2PBGA 4J3TA 3VDCA 2JF7A 4D6HA 1J0ZA 3WDPP 1ZBWA 3KL5A 3CMJA 2WYSA 2EPMX 1CXIA 4OIFA 3ZO9A 3MSDA 1DEDA 4C7DA 3QOKA 4ACZB 4UFLA 4DUWA 3OBAA 4EANA 3B8SA 4Q22A 3EDDA 4J3WA 1UUQA 3ARRA 4L4OA 2DGAA 1XD1A 4HA3A 1NM9A 4D71A 1CGVA 1EHNA 4LX4A 4AIEA 3MV11 1XSIA 2WHJA 1KXVA 2EEXA 3OB8A 1V0LA 3K46A 4UQDA 1R7AA 1F4HA 4PN2A 2JFEX 1QBAA 3PZVA 3VIGA 3WD4A 4JKLA 5CQ1A 1H2JA 3ARWA 3WEZA 2OWXA 1BAGA 1YQ2A 2VX7A 3PZTA 2OWCA 3WD0A 4CD5A 5CLTA 3GDBA 3GBEA 4CCDA 2A3HA 3PZUA 1V0NA 3TTSA 2WANA 2W62A 1E5JA 1EDQA 4GZIA 4KRTA 4UOZA 3SUSA 1KCLA 2D3NA 5CGMA 1E56A 4AIOA 2A3CA 2ZUMA 2WVVA 3PTQA 2ESCA 3CUGA 2E8ZA 2G3IA 3G6MA 4AD4A 3WDHA 4JFTA 3BLPX 4OOZA 3APGA 2GJXB 1KGWA 2DH3A 3OLGA 1GZJA 4FLSA 3UETA 3CLWA 1E6QM 3FAWA 4BQ4A 3ZJKA 4W7WA 1GQIA 4W7UA 5DO8A 1LL6A 5D9OA 1OCQA 2YBUA 6A3HA 3BSHA 2GSJA 4HPGA 1ZU8A 2CBJA 3VVGA 3QGVA 3T2QA 2UY3A 5FOOA 1TA3B 3UG4A 1UHVA 1VENA 1MW2A 3AICA 3WFZA 4AXNA 3LPGA 4B3KA 2J74A 3CIVA 1LG1A 2ZX9A 4ZENA 3POHA 1C7SA 2ZX7A 5D4YA 5ABFB 3VD4A 1MW3A 4PMXA 5E0CA 4DM2A 1TMQA 4QDMA 5C8BB 3CZEA 3WF2A 1GQKA 3BAJA 2WHKA 1E3ZA 3W25A 3SUTA 5EMYA 4JCLA 3WKZA 1KQZA 3UG3A 4OBSA 1VF8A 1HJXA 5DF0A 2YL9A 4HTYA 3THDA 3UR8A 5I78A 2W63A 1M04A 3K4AA 1C8QA 3WF3A 3TA9A 2J7EA 5A2CA 3W26A 3K1DA 1CNVA 1UWUA 2V38A 3L4VA 4M24A 3T2PA 1L0PA 3VKKA 2XYLA 2J8GA 2VURA 2YOCA 1EXPA 1FHDA 1E6SM 1HJWA 2PBOA 1M03A 3CBWA 4TOQA 3KL0A 1KFWA 1W3JA 5GNYA 3BMWA 3CUIA 4Z2IA 4CGTA 2PC8A 2WMJA 5GQBA 3VGHA 3B9EA 4WSJA 3F5JA 4JKKA 1H0GA 2DIJA 2DT2A 2AAAA 1VEMA 1DWFM 1XH1A 2OYKA 5A6JA 4RE2A 1VFOA 4GO8A 3WDRA 1SFSA 3VIOA 3IJ7A 3L2LA 1EOMA 1FH9A 6TAAA 5I23A 3PZNA 1WDQA 1V6YA 4TVDA 3MS8A 4IM4A 3M7SA 5LYRA 4OJYA 4WKHA 1UH3A 1H0IA 4WSKA 1BVNP 3SCTA 2X05A 1FFQA 4JFVA 3WFLA 3OLDA 1B30A 3IK2A 3FAXA 2VMFA 4PTXA 2X0YA 3M46A 4R27A 3AS1A 1W3HA 3BCDA 5CSYA 3TONA 1JNEA 1OM0A 1JYXA 4DWSC 2VCBA 1G9HA 3O9NA 4F66A 1W9UA 2A3BA 4UQ9A 3N17A 2ZUUA 3ARQA 1CZ1A 3N15A 2F8QA 1E71M 1ODZA 4D1IA 2W4XA 4W8BA 4WLCA 2XSBA 2BNJA 1XYFA 5C71A 2W92A 5FKYA 3BLKA 9CGTA 1KR0A 4U5IA 2UY2A 1UD6A 5A2BA 5A69A 2XVNA 4AZHA 1CXHA 5BXRA 3AIBA 4AYSA 4MNMA 2VQTA 1UWQA 3VGGA 2VX4A 5A8QA 4P8WA 3N13A 4B9YA 1HKKA 1ODUA 5AYBA 2C7FA 4AD2A 1HN1A 2XM2A 4JCMA 4P7OA 3RILA 4UFHA 3TOPA 2VVNA 3VGDA 3WNOA 1DWHM 4GI9A 2YA0A 2FGZA 2V3EA 2C0HA 2Y8KA 2YDSA 3VGBA 4ZXLA 2V5DA 3KZSA 4BZYA 5M03A 2JIEA 1E70M 3PBGA 4HZ6A 3W37A 2J78A 1Q6EA 4D6GA 1ZL1A 2E9BA 1V08A 2OLHA 4JHOA 3K4DA 3WH9A 5JIWA 4QLJA 1P6WA 3T0BA 2JALA 2EPOA 1RD6A 1E43A 2Q8XA 4V2XA 1VBUA 2QMKA 3ZSSA 4MDPA 1SMAA 4Z2KA 1JDCA 1BQCA 1W9PA 5I2UA 4KGLA 2XM1A 1QHOA 3GNRA 4W93A 1KWGA 1Q6CA 1E6NA 1JAEA 3N04A 1HP5A 1HJVA 1QI0A 5KZ6A 3AMLA 1HJSA 1X6LA 3PZIA 3AZRA 2EXOA 1HKIA 3DHPA 3PTKA 5A6BD 3W29A 1XYZA 2VQUA 1JZ7A 3AMDA 1GHRA 1RP9A 4EKJA 5BXPA 3AIVA 3FHAA 1UKQA 3LPFA 1MFVA 4R5EA 2BS9A 4D6IA 1V3LA 5EFFA 1LF1A 2AOSA 3ARTA 4ZE4A 1UKSA 1H5VA 4FLQA 2UWFA 3CPUA 1UZ4A 2F61A 3WN6A 1NOWA 2G3MA 3WNLA 1U30A 1B3WA 3K8LA 1U2YA 3PHAA 4ZFMA 4UTFA 4GIAA 1W1PA 3ZMRA 1JNDA 4WJXA 1OGBA 3WDIA 4QCFA 3L4WA 2QHAA 1X6NA 4D6DA 5TD4A 3UG5A 7CGTA 1VIWA 2E40A 3WDQA 2YDQA 2GDVA 1UG6A 4UQEA 1J11A 1XSKA 4XV0A 3MANA 5A6KA 1V03A 4HU0A 1KXHA 1NP2A 2CERA 5ECUA 1KQYA 2PWDA 1AQ0A 5I0DA 3VDAA 3NSMA 2DIEA 5I5RA 5CLWA 3SCOA 2G41A 4MNLA 3AQUA 4PMOA 1WDRA 1QBBA 2O9TA 2PWHA 4UOJA 2XIBA 3GNOA 4D6CA 1E0VA 1EH9A 1R87A 4DUXA 3RJXA 4MAVA 2FGLA 3UESA 1XCXA 2WB5A 1G01A 1QNRA 1JGIA 2BY2A 2EPKX 1PIFA 3IJ8A 3AMKA 2GUYA 3JUGA 1JF5A 4HA1A 3WD1A 1V6VA 3BAYA 4AEFA 4PCSA 3WEOA 5CPTA 1LQ0A 5A8OA 3PZOA 4Z2HA 4W8LA 2G3JA 4BQ5A 1CBGA 4J3VA 2YA1A 3TTOA 5C70A 3GXFA 5I79A 1OD8A 3W6LA 2D3LA 3B9DA 3RM8A 1UD8A 3AHVA 3VIPA 2D0HA 1HVQA 4UFMA 4ATLA 2VI0A 1QNPA 1VBRA 3RIKA 3BAKA 3GTNA 4U2ZA 3GH7A 4LGXA 1UWSA 3WF0A 3AS2A 1UKPA 3EMCA 4F9JA 4N42A 1ZBKA 4KGJA 1K9FA 1DWGM 2OYLA 1XC6A 3F5LA 3VD3A 4F9DA 1E5NA 4MB3A 4CN4A 3D5HA 1BGGA 1QVBA 4E2OA 1FH8A 4AISA 1EIBA 1XSJA 3ZJ6A 3W27A 4LQ1A 4NZCA 3ZJ7A 2CBVA 1GONA 8A3HA 1FH7A 3ZR6A 4B9ZA 2IUZA 3FHQA 4J27A 3AI0A 3NUKA 2V3GA 1V0MA 4WF7A 1E4NA 2YBTA 3AHYA 2VRQA 1J18A 5A8MA 2J8FA 4YN5A 3RMEA 1LL4A 2XGIA 3VIMA 3IANA 2WHLA 4GQQA 3ARXA 4QFUA 2WM0A 3WQ4A 2J7DA 1IZJA 4NRRA 5CJ5A 1UZ1A 1XD0A 4CD6A 2J4GA 2XIIA 2PWGA 2XGBA 1GJWA 4QP0A 2J62A 5A6LA 1UD2A 3AROA 2WWDA 2AMGA 1W9XA 3DC0A 5E6ZA 4AD3A 2VL4A 1CEOA 1EHAA 1QW8A 2PWEA 3RPMA 3VMNA 2GK1A 5M5DA 4MDOA 3VX1A 3BMVA 3A4AA 3AZSA 4GXPA 2HVMA 4UR9A 5D9MA 3VOCA 2WAGA 2VCCA 2WW5A 2DDXA 2MANA 4P8UA 1US3A 5KEZA 3WF1A 5HBFA 1FFRA 3MU7A 3RM9A 2WCAA 4BCEA 1R8LA 2WKGA 3WBEA 4AMCA 1KR1A 2DSZA 4PMYA 1J0YA 1TUXA 2O9RA 5A3HA 1ISXA 1H3GA 5BXSA 3DECA 1FP9A 1UR1A 4NRSA 4UCFA 1W9BM 1E4MM 1HT6A 5DFAA 4BF7A 1US2A 4TX6A 3WMBA 3AIEA 5DEZA 2XFYA 1UKTA 5HDRA 3ARPA 2WMKA 3EBVA 5JBDA 1ZBCA 4OZOA 1C92A 2CITA 5FIPA 4Z2GA 1KGXA 4W7VA 4GKLA 3EDEA 3HJEA 4B16A 3T0DA 1CGYA 1W2PA 3M6DA 5A8PA 2WLZA 2J7CA 5CPSA 5CPQA 1FA2A 1V3IA 1Q6DA 2IXVA 3FNDA 1Q6GA 3OA5A 4C7FA 5IFTA 3BSGA 3W81A 3ZSTA 1JF6A 2DSKA 3AOFA 4KRUA 2V5CA 3WH5A 1W1TA 2A3AA 2D2OA 3VMOA 2UY4A 5AC5A 1ISWA 1D7FA 4IUGA 2BXZA 2J75A 4XZWA 3WL0A 1QW9A 4CD4A 4HMEA 4UQAA 3WBAA 3AIWA 3WMCA 2DT3A 5IDIA 3CZKA 1JXJA 3WENA 1JAKA 1ISYA 2ZE0A 2EJ1A 3CZLA 2CPUA 1X1NA 2E4TA 2CKRA 1WDSA 4PMVA 3ZM8A 1C3FA 3OLEA 4HOXA 1D2KA 4CN1A 2CHOA 3A4WA 1GVYA 1EDGA 1E6PA 1UD5A 2VZSA 5D8WA 1KXTA 5GNZA 3W0KA 1MXGA 3WY1A 1B90A 4M82A 1MQQA 4ZEPA 1HJQA 3AXXA 4ATDA 4W8AA 4AY1A 5DMYA 2EO7A 4IISA 1QPKA 4FF5A 3U5YA 3FY1A 1W1VA 1JXKA 4GQRA 1TVPA 1VFFA 2NT1A 4AZCB 4CN6A 1NWUA 3DYPA 2VZUA 3TP4A 5E09A 5JBFA 1XHGA 2WC7A 5HOSA 1PAMA 3QOMA 4JIEA 4QLKA 3U5UA 2Y2WA 1DWAM 4TX8A 1BPLB 3N18A 5D9NA 3TTQA 1CXLA 4U31A 4M8UA 2QMJA 3VX0A 1RPKA 1GOIA 3WL1A 1PJ9A 4U3CA 3VDHA 1C7TA 1BYCA 2WZIA 4XUYA 1MVYA 5AYIA 3BXWA 1O6IA 1GQJA 1WO2A 1UR9A 2D24A 1V0KA 1J9YA 5A6SA 3PZQA 4PMZA 1B3VA 1CGUA 5DT5A 3S2CA 1C8XA 1OIFA 1WNOA 3VIHA 4TVUA 2BY1A 1W3LA 1CLXA 4U5KA 2OWWA 4MJ2A 2D0FA 4K68A 5GPRA 3CUHA 1GOOA 4AWEA 3VTRA 2XVGA 4PMQA 4GINA 5CG0A 4E4PA 3I3BA 3LPPA 3KL3A 2CEQA 3RCNA 3MUIA 4L4PA 1B1YA 4GI6A 4PSPA 4EAMA 3CUJA 4GZJA 1OD0A 4BQ2A 2DSWA 1JI2A 2WVSA 2WVVB 1LG2A 3KEHA 4H04A 3ARVA 1RH9A 5I24A 4LYPA 1UYQA 2FDMA 1WCGA 4YPJA 1PX3A 1ZJAA 2WSKA 3CUFA 4Z2JA 4U2YA 1EQCA 3VIJA 4TTUA 5M3WA 4OOUA 4FMVA 2DEPA 2ZXDA 3QHOA 1IV8A 5DT7A 1QI4A 4W84A 1BHGA 1CYGA 4JFWA 3ARUA 4H8UA 2Y24A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5JIP A;  1SR0 A;  3WDJ A;  2TAA A;  2WVU A;  2J79 A;  4HPH A;  1MQP A;  1KB3 A;  3EDF A;  3AFB A;  4ZXO A;  2W61 A;  1WZM A;  4AZ6 A;  2YIH A;  1ZBV A;  2IXU A;  3ALF A;  4ZE5 A;  1VJS A;  1H41 A;  1L8N A;  4IPN B;  1B31 A;  3AMC A;  3SCW A;  1EDT A;  4CD8 A;  1JZ2 A;  1JZ4 A;  3ZT7 A;  5A6B A;  2Z1S A;  2O9O A;  2YL5 A;  4WKF A;  3ZIZ A;  4BS0 A;  2VZV A;  1KCK A;  4NSB A;  1LWH A;  2RGL A;  1C8Y A;  5BXT A;  1H11 A;  4AD0 A;  4AZG A;  1E6Z A;  1UA7 A;  1WB0 A;  2ZX5 A;  2VUY A;  3BC9 A;  2E0P A;  3VNZ A;  2XVP A;  4LYR A;  1DTU A;  1UR2 A;  4DWS B;  2GFT A;  3CGT A;  3DYM A;  5FCZ A;  4U33 A;  2BY0 A;  1UWT A;  2VZO A;  1ECE A;  4W85 A;  2QPS A;  1UD4 A;  1V6W A;  1JIB A;  3T08 A;  5ABF A;  2VT0 A;  2E8Y A;  3OLI A;  3WUB A;  1M01 A;  3VM7 A;  1UD3 A;  4MAZ A;  4M56 A;  1PPI A;  4HA4 A;  4F79 A;  1UOK A;  2J77 A;  1EQP A;  4W89 A;  3KE0 A;  5LA0 A;  3II1 A;  5A1A A;  2D23 A;  3SCQ A;  4ATW A;  3K8K A;  5GNX A;  3AIS A;  2Y5E A;  1E72 M;  5IHS A;  4D72 A;  1RP8 A;  1BG9 A;  3MV0 1;  2FH8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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