2E9LA

Crystal structure of human cytosolic neutral beta-glycosylceramidase (klotho-related prote:klrp) complex with glucose and fatty acids
Total Genus 192
50100150200250300350400450050100150200
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
466
structure length
466
Chain Sequence
MAFPAGFGWAAATAAYQVEGGWDADGKGPCVWDTFTHQGGERVFKNQTGDVACGSYTLWEEDLKCIKQLGLTHYRFSLSWSRLLPDGTTGFINQKGIDYYNKIIDDLLKNGVTPIVTLYHFDLPQTLEDQGGWLSEAIIESFDKYAQFCFSTFGDRVKQWITINEANVLSVMSYDLGMFPPGIPHFGTGGYQAAHNLIKAHARSWHSYDSLFRKKQKGMVSLSLFAVWLEPADPNSVSDQEAAKRAITFHLDLFAKPIFIDGDYPEVVKSQIASMSQKQGYPSSRLPEFTEEEKKMIKGTADFFAVQYYTTRLIKYQENKKGELGILQDAEIEFFPDPSWKNVDWIYVVPWGVCKLLKYIKDTYNNPVIYITENGFPQSDPAPLDDTQRWEYFRQTFQELFKAIQLDKVNLQVYCAWSLLDNFEWNQGYSSRFGLFHVDFEDPARPRVPYTSAKEYAKIIRNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Klotho-related protein is a novel cytosolic neutral beta-glycosylceramidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cytosolic beta-glucosidase
total genus 192
structure length 466
sequence length 466
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2e9lA00
3GZAA 3IANA 5E6ZA 2VZUA 2JEPA 3FAXA 4MJ2A 4JZ5A 3ZT7A 4BF7A 3ARQA 1Y7VA 3JUGA 3EDJA 5A8NA 1V6YA 3WDPP 3B8SA 3GDBA 1TMQA 2FDMA 4QP0A 4AWEA 3RO8A 1XSKA 2WLZA 3MUAA 3N13A 2CNCA 5M5DA 1WZKA 1UD8A 2BNJA 1B9ZA 2Y5EA 3G6LA 2GJXB 1JI1A 3GXDA 1N82A 1BYDA 1KGUA 1XH2A 1EH9A 2A3CA 2ZUTA 4Z2KA 3W6MA 3M6DA 3ZMRA 1Q6EA 1BF2A 1IZKA 2HVMA 1NH6A 1OWQA 1K9TA 1E1EA 4MPKA 3WQ4A 1BPLB 1VRXA 3WUFA 4JFWA 4JKKA 2E40A 2ZUNA 3WL0A 4AD1A 4UR9A 1M53A 3AS0A 1XCWA 1H0IA 2YJQA 1GHRA 3BLKA 1CGTA 1W2VA 1MW0A 4BCEA 3AYRA 3O2LA 4WKAA 3GTNA 4B3KA 2W91A 2YA0A 2J25A 3KL3A 3WH5A 4J3XA 1OCQA 5D4YA 1K6AA 1JXJA 4Q22A 2CXGA 2XSBA 2QV4A 3AQUA 3SUVA 3ARYA 4Q7NA 2XSAA 3AIVA 3PZOA 4UOQA 3W53A 3PBGA 2Y4SA 1W1YA 4AEFA 1KCLA 4PTXA 1E9LA 2J74A 2WMJA 3VKKA 3WNPA 3UERA 1ISVA 5M17A 1OSEA 3WF1A 1V6VA 2WANA 4M8UA 1DWFM 2HISA 4UFHA 3B9DA 1UD2A 4V27A 3UEQA 2WKLA 1E56A 2OSYA 4P8XA 1JZ4A 3APGA 1J0HA 4CD5A 3FNDA 4M82A 3VD4A 2DGAA 1UH2A 3A3HA 1C92A 1B1YA 4KRTA 4W86A 3WMCA 3ARVA 1TUXA 3CGTA 2VURA 4QDMA 1XD1A 1YQ2A 3CH9A 1FP8A 3SCVA 3WUGA 1CIUA 5C70A 3NIYA 2CESA 1AVAA 2A3BA 5IXEA 4HZ6A 5DT7A 4JKLA 1ZBKA 3RCNA 4X9YA 2PB1A 2VT0A 4PCSA 4UCFA 1UWTA 1PX3A 4KRUA 1WP6A 5HNNA 2XG9A 2O9OA 2E0PA 1E5JA 5IFTA 4CD7A 1UR0A 1PIGA 2WBGA 3U7BA 2O92A 2OWCA 3VTRA 1UR4A 2W62A 4PMUA 3OLEA 3E1F1 1E3XA 3T2OA 3EMZA 5DT5A 2XIBA 2VTFA 1AMYA 5BXSA 1B3ZA 1X6LA 4ACZB 4PYSA 5A1AA 3VOCA 2YL5A 4J7RA 2CITA 3CZKA 1QI2A 4P8WA 1UZ4A 3VD5A 3QOMA 3ARTA 4PCTA 3WQ5A 1VAHA 3T09A 4BQ3A 4HP5A 1HP4A 4UFKA 2QMKA 4F9DA 4CVWA 1KBBA 2EBNA 2VZTA 3T0DA 5EFFA 3WELA 2WCGA 5LA2A 1E4MM 3VDAA 5GPRA 4JL1A 1EQCA 4M29A 1C8QA 4K68A 2WMIA 2EPNA 1EQPA 1B30A 4D72A 5FCZA 3AXIA 1FHLA 1HKKA 3VIOA 4LX4A 3WIJA 5CGMA 3S6TA 2WYSA 1ITXA 1WZMA 5IDIA 1HF6A 3AICA 1BAGA 1H5VA 1BLIA 1ZL1A 4M80A 1FFRA 2XWEA 4N42A 1WO2A 4QLKA 2VR5A 2BY0A 4PRWA 1XHGA 2WAGA 5CPSA 2YLLA 3ZT5A 3L4WA 2VI0A 4HMEA 1JYNA 4TX8A 2XFFA 3AISA 2W67A 2XUCA 1CXLA 4ML4A 1W3HA 4PMVA 1B3WA 1E55A 1F4HA 1WB0A 3SCSA 2OSXA 3UCQA 3IJ8A 5A6BA 1TR1A 3POHA 4OZOA 3WENA 1WE5A 2J8FA 4MJ4A 4L4PA 1HJXA 4B9YA 1W1TA 1UKQA 1W1PA 4FLRA 1UA7A 4TVUA 1QI0A 4GQQA 4MAZA 3PZVA 2WB5A 1TFVA 3U57A 2XVLA 1UKPA 3WD1A 2WW5A 1R7AA 2YL9A 1VIWA 1KFWA 1JF6A 4PSRA 2YA1A 1V3HA 4JHZA 5HBFA 1PIFA 4J3VA 3VGGA 2B31A 3WD4A 4HPHA 3S2CA 3UESA 3WMSA 4ZE5A 2AMGA 3W6LA 2RGMA 4JHOA 4RE2A 1GQKA 1UKTA 3N17A 3THDA 3CZJA 3QHNA 4OBSA 4GI8A 2J47A 1K9FA 3PZTA 1HXJA 1FP9A 4PMNA 3MO4A 2A3AA 2WHKA 4FK9A 4F79A 1EGZA 3MANA 3OA5A 4U2ZA 2YBUA 4MNLA 1HJUA 1E0VA 3AI0A 1DTUA 1VENA 1VJZA 2CBJA 3MS8A 4JIEA 5E09A 3ZT6A 3K4DA 4GO8A 5IHRA 1BYBA 2WVVB 3L4TA 3F5LA 4XB3A 3BAYA 3WEOA 3VIIA 4U3AA 1R7OA 3OGRA 1E1FA 3K46A 2QF8A 2VCCA 1V02E 2W61A 1J0ZA 1QW8A 1V02A 5A8PA 2ZX7A 1GNXA 3F5KA 3NCOA 2ZOXA 3ZIZA 3WY1A 2W92A 2ZUSA 3ZSSA 3VD3A 4WKHA 1XGZA 3GYCA 3VNZA 3VD7A 1DWIM 2OYLA 1JZ6A 1H41A 1E6XM 2QLYA 3CZEA 4Z2IA 2ZICA 5JIWA 2WHMA 4HU0A 4HOZA 1HKMA 5AYBA 1GVYA 1UOKA 3UR8A 2AAAA 2BVYA 4UQEA 1RD6A 1DWHM 4MADA 1I1WA 1W9DM 1GONA 8CGTA 1EOKA 1LL4A 5CGTA 4Z2LA 3CUIA 2Z1KA 2ZXDA 4D71A 2XGIA 1VEOA 1R8LA 4PMQA 5A8QA 1EXPA 2VX5A 2E8ZA 3GXMA 2EPMX 2VNCA 4PTMA 1W32A 2VOTA 1FFQA 4P7OA 4A3YA 4WF7A 2BVDA 1C7SA 1JD9A 2VRJA 3VIJA 4AZCB 1GCYA 4U5KA 1JFXA 4AZ5A 1VFUA 3MMWA 1GVIA 1D7FA 1WZAA 4XV0A 1WDQA 1XH0A 1HP5A 3GH7A 1JDCA 2WSKA 5ABGA 2JALA 1G9HA 4IPLA 2JF7A 2OSWA 5CJ5A 3DYOA 3VM7A 5HDRA 1X1NA 3L4ZA 4JCMA 3LPOA 2DIEA 4HA3A 4AZ7A 2J78A 2BV9A 1UWIA 2G8ZA 1A3HA 1JDDA 5BYWA 1FOBA 3KWXA 1Q4NX 2X8RA 5A95A 2DSKA 1BGGA 1HVXA 2WHJA 2VCAA 3CMJA 2YIHA 3W24A 2CIPA 3AZRA 3PHAA 4UQBA 3K8LA 3BLPX 5LA1A 2WXDM 2XJ7A 1BVNP 2V3EA 2IUZA 3WH9A 3BMWA 2JIEA 4TOQA 1QHOA 1SFSA 1LF1A 4JFTA 3AMGA 1GZJA 4MNKA 1V3IA 1UR8A 4CD6A 1G0CA 2ZXQA 3ZQ9A 1ZS2A 2DEPA 5BXPA 4HMDA 3SCUA 3B9AA 3I3EA 4CD8A 1VBRA 2NSXA 4F8XA 2J77A 2WCAA 5JBEA 4D1JA 2E9MA 1E71M 5DMYA 3AJ7A 3A6OA 2J79A 3PZMA 3VIGA 4HOWA 1E4LA 3OZOA 4URIA 2J7BA 2BY2A 1QBAA 4U5IA 3AHXA 4JFVA 2W63A 3BXWA 2GK1A 2VMFA 4W5ZA 4J3WA 2UWFA 4TVCA 4Y7EA 2YL6A 5EFDA 2WCSA 1ISYA 5FL0A 1V6UA 1YHTA 2QPSA 5I24A 1QW9A 4HMCA 1ESWA 4PTVA 1V6XA 1GOQA 1I1XA 5GNXA 3RM9A 1E5NA 5CPQA 4PMZA 1ZBVA 1GOWA 4P7NA 1CXFA 1JIBA 2JE8A 1NARA 4MDPA 5E0CA 1B3XA 3MMUA 3PZNA 1C8YA 5AY7A 2W5FA 1JNDA 3SCQA 3VGBA 1IV8A 1NWUA 1MXDA 2YL8A 4D6CA 2J75A 1H49A 1CGVA 2V3DA 3GNPA 4PMDA 3RMEA 1UR1A 4RL3A 1QBBA 5ABFA 3FN9A 5CSUA 1B3VA 2XYLA 4CU8A 1O6IA 4GZEA 3VIKA 3AMCA 3PTMA 2J7GA 3CZLA 2JFEX 4E8CA 1H2JA 3MSDA 1UR9A 3ZM8A 1J0IA 2WKGA 4H41A 1WDRA 1V3MA 5M3WA 3AMDA 3N1AA 1JZ3A 3BMVA 2ZUMA 1MWOA 3LMYA 3BAXA 2PWHA 1FH7A 1R85A 3DC0A 2VX4A 4YHGA 5A6AA 3DYPA 5I0DA 3CBWA 1V0LA 4W7VA 1WKYA 3HU7A 3BCFA 1CTNA 4E2OA 3MUY1 3CUGA 4WK9A 1A47A 4WSKA 3BAIA 1B2YA 1US2A 3AZTA 1CXIA 4GQRA 3LPGA 4J28A 4UQCA 4OOZA 5HXMA 1H4PA 1VFFA 2PI6A 4J3TA 1ZJBA 3CUJA 1TG7A 4OUEA 4D6EA 3RIKA 3KE0A 1ZU8A 4AEEA 1V3KA 4AXNA 2UY4A 5A69A 1TVPA 1G01A 4UOZA 1WCGA 3QGVA 2WC3A 1Q6CA 3WNNA 4H2CA 1JD7A 3VDCA 1UD3A 1EIBA 4M24A 2XVNA 1CLVA 1XYFA 2D2OA 3F5JA 1XCXA 3GH5A 3ALFA 2E9LA 1JI2A 1QHZA 3VX0A 1SMDA 2XFRA 1HJSA 1CZ1A 3BGAA 1ZBWA 3WDRA 1XH1A 4PMYA 2J4GA 1JAEA 3CO4A 2EPOA 3SCTA 2GDVA 4TX6A 5BROA 2PBGA 4OIFA 1OM0A 2YOCA 1IT0A 1GHSA 1G5AA 4TTUA 6TAAA 1E6QM 2EJ1A 3EMQA 1Z32X 1J11A 1JZ5A 1LG2A 4LXFA 4HPGA 1MW2A 2YKKA 1QNSA 2GJXA 1G1YA 2V3GA 1EHAA 2Y24A 1OIFA 2YLAA 2F2HA 2WK2A 2EPLX 3QHMA 1JL8A 3CLWA 3VIMA 5D9NA 1U33A 3L2LA 1MFVA 1E0XA 3AMLA 3BC9A 2OYKA 3GM8A 3TONA 1E0WA 4UNIA 4BQ4A 3VPLA 3VMPA 3NUKA 2VUYA 1UD5A 3TA9A 1CDGA 1WDPA 1HJVA 2BHUA 1DWAM 3NDYA 1GPFA 4CCEA 2YDRA 4ATWA 1M01A 1CECA 1CXKA 1EA9C 4MB5A 1VJSA 2CCRA 2VQUA 2WZEA 1WAWA 5CQ1A 5JBFA 1KR1A 4UFMA 3THCA 3PZQA 4GXPA 5AC4A 1PBGA 4U2YA 3CMGA 3AIEA 4S3JA 5HPOA 1BVZA 2PBOA 2X0YA 4NI3A 5GNYA 5DEZA 1KR0A 2E9BA 3WD3A 2FH8A 2JIWA 3PZUA 1QHPA 1NOUA 2D0FA 1WZLA 1LL7A 2WVUA 4CGTA 4HA1A 2WZIA 4KWUA 3CZGA 3NYDA 4LYPA 3VX1A 5BRQA 5DFAA 2DPEA 4ZXLA 4D6HA 3HMCA 2GSJA 3W26A 3MUZ1 1V6WA 2BHYA 3J7HA 3RPMA 1EO7A 4KGLA 2G3JA 4CD4A 1W2PA 3AIUA 3L4VA 1D2KA 4DWSB 2BFGA 3ZR5A 1J12A 1UH3A 1MW1A 2Y8VA 2AOSA 1W1VA 1KGXA 4HZ7A 4UZUA 3L4YA 1CYGA 2PC8A 1UQYA 1OD8A 3NSNA 3LPFA 2DT1A 1E72M 3AIWA 4ZFMA 4HTYA 1MXGA 1X6NA 3WKZA 1U30A 2VCBA 3FAWA 4Z2HA 5BXRA 1V3LA 1WPCA 3QR3A 4QCEA 5EMYA 4D6IA 3BSHA 4TUFA 3FHAA 4X0VA 2QPUA 3VMNA 4U31A 3WNOA 2GJRA 2J7DA 3I3DA 3DHPA 3OB8A 3IJ7A 4AD0A 3W38A 1OT1A 2ZUWA 3OBAA 1DWJM 1VB9A 4ACZA 6CGTA 2WM0A 3AROA 3CUHA 3VMOA 2FHBA 4DM1A 2V38A 3OGSA 4JFUA 4J27A 3GBEA 1NWTA 3VD9A 1Q6GA 3WQWA 3ARUA 3PZGA 4RE3A 1MFUA 5I77A 1RP9A 3VGHA 1NP0A 4HA4A 2E4TA 3EDDA 1UD4A 2WZHA 4LYQA 2CKRA 2GJPA 3OGVA 3MKKA 3HN3A 1HIZA 2WPGA 3BAJA 2VVNA 1KXHA 5FL1A 3RM8A 3K8MA 5ABHA 3HJEA 4GINA 3CUFA 3SEPA 4EAMA 3AIQA 4A3HA 1V0KA 4LYRA 1PEZA 2XFYA 1S46A 3K1DA 3WD0A 3ZOAA 2DSWA 1QVBA 2J7CA 1CGXA 1W91A 2D23A 1BFNA 3QHOA 1WNOA 3NJ3A 5ABEA 7CGTA 1QI3A 1F4AA 1CPUA 1ODUA 1QPKA 1J0JA 4NZCA 2OWXA 4Z2JA 5A8MA 1UWRA 3CHDA 4DWSC 4NSBA 1XD0A 4AYSA 2CBIA 4R5EA 3IK2A 2XTKA 4YN5A 3OIHA 1PX8A 4F9JA 2CHOA 3FY1A 4UOJA 1CWYA 3W28A 2ZX6A 1TA3B 4PEEA 4AZIA 5DO8A 5DF0A 1VBUA 5A6KA 1MYRA 3UG5A 1NM9A 2UY3A 3VGDA 2BS9A 3GXIA 2WMFA 4F66A 3ARWA 4OJYA 2G41A 4GZIA 3W0KA 2XM1A 4OBRA 5HOSA 2ESCA 1KQZA 4QFUA 3KEHA 1MW3A 4C7GA 2XPKA 3WFZA 1CXHA 2MANA 1KQYA 4P8UA 1E40A 4IM4A 4CUCA 3MV11 4UZSA 4AISA 2J7EA 5ECUA 1W3JA 4JAWA 1VFOA 3PTKA 5M03A 1B0IA 3W82A 1GOMA 3WNMA 2DSUA 3SCNA 1ISWA 2ZIDA 2QMJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3GZA A;  3IAN A;  5E6Z A;  2VZU A;  2JEP A;  3FAX A;  4MJ2 A;  4JZ5 A;  3ZT7 A;  4BF7 A;  3ARQ A;  1Y7V A;  3JUG A;  3EDJ A;  5A8N A;  1V6Y A;  3WDP P;  3B8S A;  3GDB A;  1TMQ A;  2FDM A;  4QP0 A;  4AWE A;  3RO8 A;  1XSK A;  2WLZ A;  3MUA A;  3N13 A;  2CNC A;  5M5D A;  1WZK A;  1UD8 A;  2BNJ A;  1B9Z A;  2Y5E A;  3G6L A;  2GJX B;  1JI1 A;  3GXD A;  1N82 A;  1BYD A;  1KGU A;  1XH2 A;  1EH9 A;  2A3C A;  2ZUT A;  4Z2K A;  3W6M A;  3M6D A;  3ZMR A;  1Q6E A;  1BF2 A;  1IZK A;  2HVM A;  1NH6 A;  1OWQ A;  1K9T A;  1E1E A;  4MPK A;  3WQ4 A;  1BPL B;  1VRX A;  3WUF A;  4JFW A;  4JKK A;  2E40 A;  2ZUN A;  3WL0 A;  4AD1 A;  4UR9 A;  1M53 A;  3AS0 A;  1XCW A;  1H0I A;  2YJQ A;  1GHR A;  3BLK A;  1CGT A;  1W2V A;  1MW0 A;  4BCE A;  3AYR A;  3O2L A;  4WKA A;  3GTN A;  4B3K A;  2W91 A;  2YA0 A;  2J25 A;  3KL3 A;  3WH5 A;  4J3X A;  1OCQ A;  5D4Y A;  1K6A A;  1JXJ A;  4Q22 A;  2CXG A;  2XSB A;  2QV4 A;  3AQU A;  3SUV A;  3ARY A;  4Q7N A;  2XSA A;  3AIV A;  3PZO A;  4UOQ A;  3W53 A;  3PBG A;  2Y4S A;  1W1Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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