2EAWA

Human ump synthase (c-terminal domain- orotidine 5'-monophosphate decarboxylase)
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Human UMP Synthase (C-terminal Domain - Orotidine 5'-Monophosphate Decarboxylase)
rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2eawA00
3MHUA 3G18A 1B4KA 4UTJA 2FFCA 3B04A 4UNLA 4O14A 1KBJA 4R34A 1I2NA 3GDLA 4WY0A 2CLKA 3PS7A 5F2LA 1OHLA 1OFRA 4CNNA 1YTKA 2DZXA 3FKKA 4FNPA 1S3HA 1GTHA 3DH7A 4GUJA 3HQ1A 2QJIA 2A0NA 6ALDA 2A85A 4CQAA 3P7YA 2ZRXA 3NM1A 1IXQA 2FIQA 5A5WA 3DZ1A 4EF9A 4FIQA 2FPYA 5C54A 1Q6OA 3VKJA 4UR7A 5AHMA 3T78A 2A1YA 4ICNA 3G1YA 5K3VA 4GNJA 4I7VA 2QUVA 1H7NA 1P0KA 2QAFA 5SWUA 1Z48A 1KFKA 3IIXA 1VR6A 2CFFA 3E0IA 3EX3A 3OBKA 4DEFA 4CQ8A 1GWJA 4AHQA 2E6DA 1GOXA 4ZQMA 4EOUA 3LCWA 3QM3A 3M5ZA 2Y7FA 4NU7A 1YPIA 1W54A 3DHDA 3TIMA 4HNUA 5J5DA 4O1BA 4S2BA 3QPZA 3GXPA 5HUOA 2NXHA 4O53A 4AH7A 4RCXA 1KM0A 3ABSA 3L65A 1QAPA 5G2WA 1GVFA 1G4SA 1ZENA 1H5YA 3ANYA 4FNQA 3IRDA 3W22A 3Q58A 1KM1A 4TO8A 3W1MA 2ZRVA 3G3DA 4IQLA 4I7UA 4M5PA 5G1TA 4N4PA 3GNNA 1Q6QA 4QQ3A 3R12A 2YSWA 3RMJA 1FWRA 1PCWA 4X3ZA 1YXYA 4WY0B 3PSWA 1BKSA 1OABA 3EWYA 5HINA 1JCXA 3M7WA 3THQA 3UZ5A 4KWWA 1GT8A 3RU6A 3SGZA 3DFTA 3NR0A 3C2OA 3HO8A 3W7HA 4PFMA 1PVNA 2RDTA 1XXXA 4AAJA 5LNRA 1YTDA 3JS3A 3ATZA 1A53A 4XTDA 5CKSA 4PC8A 1VPXA 1RZMA 1KM2A 4MJMA 1A5CA 3LI1A 5D37A 1RQBA 3W70A 3EWZA 1KM4A 1KFEA 2C18A 5D05A 4N02A 3R5EA 3KRSA 4GBUA 2Q8ZA 3I7QA 4LUIA 3LI0A 1MEHA 1F7BA 3LV5A 2DP3A 3RLUA 2WV8A 3NNTA 2QJGA 4PL2A 3P60A 4NNCA 2P0OA 2VEIA 3NVTA 4DO5A 2I1OA 4JTUA 3GNDA 4BFAA 3IIPA 1OF8A 3Q94A 4IUOA 2J88A 4NJJA 4O1CA 1A5BA 3M5VA 4NJHA 4GC4A 4GJ1A 4FX6M 4IJBA 1TPUA 3QF0A 4WXZA 3NGJA 3TE9A 2CWNA 3AJXA 1IGSA 1T96A 3GR7A 1I8JA 1XBVA 3P61A 1IIHA 4FXRA 4PEKA 1VLIA 2QUUA 3A23A 1WX0A 3G1DA 3NQ8A 5LNWA 5IM51 5CZJA 3LERA 4OT7A 2FTPA 2R14A 3W88A 2JGYA 5KMYA 1K7XA 2VFFA 4RZ4A 4JIQA 4P2VA 2W79A 3SJ3A 4ADUA 1LM1A 4DELA 1KM6A 2NX3A 3DU0A 5I3KA 3I7SA 4FB7A 3HGRA 3M16A 2PCQA 4W9TA 1H7RA 2ZRWA 3P80A 5AYYA 5J5RA 4LVFA 1TPH1 2NV2A 2GJNA 1KLZA 4RKAA 2A21A 3W7IA 1SQ7A 3V75A 1XM3A 4LS0A 1RQHA 3C4UA 3EX6A 5DELA 3OG3A 3QYQA 3W1LA 4JX4A 2WSRA 1C29A 3HPSA 3DXIA 1SR9A 4ORMA 1OX4A 2CZ5A 2EKCA 4N9BA 3D0CA 3DI1A 2A6NA 4O28A 3LOTA 1A5AA 3LCLA 3CB8A 4CCDA 3NDOA 4B5NA 1H50A 2VENA 1SO3A 3UD6A 1RR2A 1JQVA 3GDTA 4LC6A 5EYWA 1LYXA 3W84A 2QDHA 1JRBA 3STCA 5DXYA 1LORA 1SSDA 3CTLA 4GRSA 2AAMA 2ZZ3A 1DL3A 5K9DA 1IXOA 1FDZA 3P81A 3NEVA 2ZZ6A 3IVTA 4NNBA 3WJYA 1DBTA 3O6CA 2UV8G 2CLLA 1R2RA 3CQ0A 4JX6A 4S2CA 4KWVA 3C2VA 5CSRA 4UTTA 4JX5A 3IEBA 3W6YA 2PRLA 4X2RA 3MWAA 4M6PA 3C52A 3W1TA 3LXCA 1TV8A 2X16A 3TQ0A 1VYPX 3TCEA 1HFBA 1KW1A 1YXDA 3G24A 2B7NA 5HR7A 3G1AA 3CEUA 4UTTC 3GKFA 3OEXA 1DORA 2CZDA 5EA9A 3KFTA 4JTKA 4R7JA 3KVLA 5A8GA 4FO4A 2DZPA 4MJZA 5T26A 3I65A 1OX4B 1DJNA 4EVZA 4O15A 2TSYA 1AW1A 3SI9A 1FXQA 3B03A 1QPQA 3LDVA 3W7GA 1G6CA 1TRDA 5KZEA 3L9CA 1F76A 3QW3A 2WKJA 3NL5A 5DBUA 1TYGA 5EMUA 1JCLA 1KFBA 1M6JA 4JYDA 4UNKA 1GEQA 1E51A 4WY0F 3UQNA 2FLIA 4GUFA 1H7PA 3P8IA 4Y96A 5G5IA 4K38A 1SO5A 5G4WA 3PB0A 2NZLA 5HJLA 5H2ZA 8TIMA 1TV5A 2DORA 3QQ1A 1FBAA 1O94A 2BLEA 2AQWA 3Q37A 4GFSA 2R91A 4DBDA 5C5YA 5F2GA 1VS1A 3W7LA 3MP3A 1OYAA 3MYOA 4XUGA 3QEZA 2FPTA 1B57A 4M6QA 2YGYA 5D09A 3CM4A 3F4NA 5KINA 1BWKA 1XL9A 2B0MA 1VLWA 4WJEA 1PS9A 3HG5A 2OMAA 3H55A 3KX6A 3NYZA 4WZHA 1FCQA 5G4EA 1MEIA 2H3DA 2ZRUA 2ZDRA 4Z0SA 3FFSA 5D2XA 1T8XA 4AXKA 4MFDA 2JKPA 5KSWA 2XN1A 1VRDA 4IMDA 4O8RA 2FDSA 3L0NA 3MW7A 1W5QA 1QDSA 3TX9A 3NA8A 3P84A 1XUUA 2EAWA 4MUZA 4DF0A 2QCLA 1F73A 1F74A 1H51A 3ATYA 3QQ0A 4BI6A 1G7VA 2ZTJA 3MMTA 1SFLA 4LU0A 4OV4A 1HG3A 2YX0A 3L68A 3PG9A 1OX6A 3N9RA 3PR2A 4BK9A 4ZQOA 2TMDA 3IGXA 5D2TA 4BI5A 5BRBA 3TXZA 2X2GA 2ZYFA 4CNOA 3IVSA 4E2DA 1TRIA 4ZQPA 1I2PA 1K8ZA 4GXMA 7TIMA 4CNPA 3TSDA 1QCWA 4RLIA 1TTIA 1SW0A 1ICSA 3CPRA 4RV8A 4K7YA 5HUPA 4JY9A 1K3UA 3HGSA 3TDFA 3W73A 3PUDA 4LT9A 4POCA 5LNVA 2H90A 3LBCA 1XI3A 4MZ8A 2ZA2A 4QAIA 1ZALA 3GKAA 1LBMA 1D9EA 4OE7A 5DLCA 4RK8A 2YFNA 1UCWA 1VGAA 3M41A 3ELFA 2GUUA 4DF1A 1TO3A 4HNTA 3A24A 1EEPA 2Z1BA 1LOSA 2YXGA 3HBLA 4U4MA 2CZFA 5AC6A 4IMCA 1EX5A 1ML1A 2VFEA 2VXNA 3BV4A 4RZ6A 4Y90A 3L5LA 5DCDA 1QPNA 2YDAA 2G96A 1OJXA 1QR7A 3NL3A 1JR1A 2E77A 4LNYA 3S1VA 3NQAA 4UTWA 4O10A 1GQNA 1S5TA 1WYIA 4IMGA 3W2NA 4CCCA 1KFLA 1NSJA 4NNAA 3S5NA 4YCOA 3DAQA 4BR1A 3NQMA 4QSHA 4O1DA 4AVFA 1K7FA 2V5LA 4FX8A 1TSIA 4UTWC 1LRNA 2YZRA 3DKLA 4O50A 2ABBA 3FIGA 2ZZ2A 3NQVA 3CC1A 4OGZA 4MPQA 1QWGA 4Z1DA 5D38A 3TAKA 4Y6GA 5CGQA 3CHVA 4LS1A 4O12A 1LBLA 3NAVA 3FLUA 1W5MA 5L9FA 3N73A 1QOQA 3PBYA 4MVAA 1B4EA 4IX2A 4NJKA 3W7DA 3PG8A 4IMFA 4GUIA 4JTEA 1Y0EA 5FEXA 3BW4A 5LHEA 3PULA 3FKRA 4KFPA 3MI6A 3LXBA 4YWIA 1I2RA 1K8XA 1CX9A 1A50A 3G3MA 3C2RA 3W7PA 4E0CA 4UFHA 1LLWA 4Z1AA 2P10A 4JTGA 1OG0A 4LVBA 2BWGA 3SFKA 1HUVA 3ZS4A 2VFGA 4FEZA 3UXAA 3EX2A 3WK0A 2ZRYA 1R2TA 4Y9AA 5AYZA 3SW6A 3NQCA 2CLOA 1UUOA 4MZ1A 2QCDB 5BOOA 5LKYA 5BMXA 1P0NA 2A5HA 4NUWA 3MJYA 1QMLA 1JCMP 3UNDA 3EXSA 3QC3A 2Y63A 2TYSA 1H7WA 3HOJA 1SZFA 3EWBX 3WK1A 3S6DA 5C6MA 1FWWA 5BW6A 2QUTA 1VQTA 2E5DA 3DFOA 3STGA 1SFJA 5DY2A 1LLZA 3W74A 4TMCA 3BW3A 2ZCGA 1FY6A 2FB2A 4DQWA 5K2ZA 3I68A 1DJQA 3NPWA 3P82A 3GK0A 3O15A 4UFKA 1GVSA 1DOSA 2X1UA 1FWSA 2BX7A 4NX5A 5K9XA 3OHIA 3S8HA 2Y6ZA 1YPFA 2WNNA 1W37A 2QCNA 1IF2A 3TNOA 1K8YA 3HJZA 4DO4A 4N6FA 3WK2A 4JYEA 1WA3A 3V1PA 2BTMA 3FEMA 3LCHA 4N6EA 4OU1A 1JCYA 2ZA1A 2YPIA 3FA5A 3LGEA 2NUWA 2DZWA 1TCDA 3THAA 1KFJA 3HG2A 3HGOA 2Y61A 4OQVA 1C8VA 3R89A 4MLRA 1BTMA 4HN4A 4EF8A 2CLHA 3LCIA 2FPVA 1ZY9A 2FJKA 2RDUA 2CLFA 1P4CA 1AL7A 3L5MA 2QCHA 4PH6A 5BNKA 3G1VA 5F2MA 5AHIA 3BG9A 3R8RA 4KFOA 1SZEA 1KLYA 3L67A 4ADTA 3SSJA 3VE9A 3VNDA 4CQ9A 2C0AA 1EWEA 3TK7A 3LHYA 5HWJA 5MHBA 5E0KA 1F6KA 4KFNA 4M19A 2QCEA 2PURA 1SZGA 4G1KA 2E6AA 4ORIA 4X22A 3W2JA 3P62A 4Z1BA 1UASA 3LRMA 3OVQA 2RKXA 3T55A 1G4TA 2GQ8A 2I9EA 4LS2A 4EIVA 1NVMA 3W1UA 4C1KA 1IXNA 3W1QA 3O6YX 2ISSA 1H7OA 1QFEA 2BSLA 3PC0A 4WOQA 4DPPA 5TBOA 3VI2A 3UPWA 4MY8A 3BGJA 4ZQCA 1ME8A 3DFPA 4GWEA 1N55A 1X1ZA 5LGXA 3HIJA 2ZZ1A 2GOUA 2V0TA 4ADSA 2C13A 5D33A 4LW7A 5F1UA 1KA9F 3QJAA 4IXXA 3HG3A 2HTMA 3TA6A 1FWNA 4DXVA 3NO5A 1Z42A 4QITA 5LHFA 4LVAA 4O57A 3MI2A 3HB9A 2HMCA 3B06A 1OFOA 2VOMA 4YL2A 1ZFJA 4XTIA 4LV4A 1DVJA 2J27A 6TIMA 1Q6RA 4ZQNA 5K7JA 2E6FA 2F7FA 4UFJA 2V5BA 4N9DA 4Y8FA 4RXGA 1EUAA 3KVMA 3IGSA 4RXFA 2J9YA 4TIMA 2NXIA 1AW5A 2F84A 3DGRA 4XBSA 1QPOA 1IIGA 4N2YA 4AF0A 1OVDA 3BLFA 1G4EA 5TQLA 2CLIA 3STEA 3EXRA 4MFEA 1TPFA 4JIPA 5CSSA 3INPA 4A29A 1I45A 4UMAA 1FQ0A 3GDKA 1OFDA 2HS8A 4UIOA 4R33A 4LOCA 2A2IA 2VC6A 4E2BA 3LTPA 4NQ1A 5FF0A 4NZJA 3GAKA 1UBSA 2QCFA 2CZEA 4O54A 5CZ0A 3W7EA 3HMJG 3KAOA 4HKPA 3TSBA 1W5NA 5CZSA 3LRLA 3CIWA 2AGKA 3KVJA 1GPWA 1TTPA 2ZBTA 3MI3A 3BW2A 3F1QA 1LTDA 1SSGA 1T0OA 3EX1A 2WSYA 2V81A 2VFDA 3KRZA 2X1SA 5KZMA 4QISA 3LTSA 2QCGA 1GVQA 1JUKA 1LROA 3A5VA 2HS6A 4FNSA 3LCXA 3R2GA 1I4NA 2E09A 4O11A 5HWMA 4O4WA 1NF7A 3FYOA 1TJPA 4JS3A 3G1SA 3U6WA 1L2UA 1TPEA 1EP3A 2QCCA 1SW7A 3BARA 3TW6A 3L0GA 3P74A 4MIMA 1X7FA 3W71A 4AF0B 1V5XA 2GJLA 2QR6A 4ZZ9A 1ZNNA 2QEZA 3DI0A 3A9IA 2OT0A 2Y70A 5F2IA 3U2OA 4I7WA 2NWRA 3W23A 1O4UA 4FNRA 2Q3OA 1SW3A 4JEQA 1TPC1 1EPXA 4LVDA 4NXSA 2GVGA 1XCFA 4ZQRA 1OFBA 3TC7A 3EWXA 3T7VA 3TMQA 4JICA 2X30A 1DHPA 5FEZA 3O05A 1DQWA 3H54A 2ZZ4A 3G0XA 1QOPA 5D2YA 1I2OA 3E12A 1LBFA 5LNUA 3GDMA 3LTYA 5LZLA 4R53A 2C1HA 3L0KA 2ALDA 1H7XA 2ZZ5A 1RV8A 1W1ZA 3GDRA 4BWLA 1N7KA 3GIYA 3PBUA 4YMZA 5TIMA 4H6KA 5AHFA 1ALDA 2DZUA 3OIXA 3G1FA 3MO7A 1XC4A 1Q45A 1UUMA 3W76A 3B0VC 1JVNA 3DFQA 1PCKA 4BWLC 2YYUA 5AOUA 2VEMA 1N8FA 3L66A 3W87A 4UCGA 4ML9A 3NQEA 5FF3A 3W1PA 1WBJA 4ALDA 2YFOA 1BEUA 3W1XA 1SUXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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