2EGZA

Crystal structure of the 3-dehydroquinate dehydratase from aquifex aeolicus vf5
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
219
structure length
216
Chain Sequence
MLIAVPLDDTNFSENLKKAKEKGADIVELRVDQFSDTSLNYVKEKLEEVHSQGLKTILTIRSPEEGGREVKNREELFEELSPLSDYTDIELSSRGLLVKLYNITKEAGKKLIISYHNFELTPPNWIIREVLREGYRYGGIPKIAVKANSYEDVARLLCISRQVEGEKILISMGDYGKISRLAGYVFGSVITYCSLEAPGQIPLEEMVELRKKFYRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Aquifex aeolicus
publication title Crystal structure of the 3-dehydroquinate dehydratase from Aquifex aeolicus VF5
rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
total genus 86
structure length 216
sequence length 219
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2007-03-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2egzA00
2WSRA 3F4NA 1D9EA 3RF9A 2YYTA 4UFMA 2DZSA 3GDKA 4JTHA 3TQKA 2Q3OA 3UWUA 3EWUA 3LXCA 3DHFA 1TTQA 4EIVA 1HUVA 4UTWC 2VOMA 4CQ8A 1DOSA 1W3IA 4NQ1A 4IXXA 3GXNA 2CWNA 1H62A 3TDFA 4NXSA 3CTLA 4N6FA 4CCEA 2E6FA 1ZNNA 2PRMA 4FNUA 4ALDA 4CCDA 2J24A 1K7EA 1S5WA 4S2BA 1FDYA 1TIMA 1TPEA 2A0NA 4N4QA 4M19A 2ZRZA 4HKPA 5KMYA 4AF0B 5AHNA 1OFRA 5FF3A 4QQ3A 2VEIA 3HPZA 1TV5A 3IGXA 3MP5A 3QMSA 2ZRWA 4MUZA 2ZBTA 2VEKA 5D04C 2FDSA 1P0NA 4PCFA 3NPUA 4R7JA 1ALDA 1IF2A 3W2MA 1UUOA 3TUUA 4U28A 3R5EA 4J9JA 5F4WA 3P5ZA 2E09A 3WJSA 5DXXA 2QR6A 1H63A 1OYAA 2BSLA 3FJLA 4TIMA 3W74A 1KM4A 3M7WA 4RK8A 4JICA 3EWXA 1A5AA 4UTJA 5F2MA 3R13A 2WNNA 4Z1AA 5AC8A 1KFJA 3EKLA 1FDJA 1QCWA 2CLMA 3G1DA 2QUVA 4I9AA 1RQEA 2CLLA 1VS1A 3B0PA 3FEMA 4N4PA 2NXIA 4BF9A 5HWMA 1TO3A 3NA8A 1RQBA 4NVTA 3O16A 4UXDA 1YPIA 4KKXA 3W1MA 1JCNA 1K8XA 4GUGA 5HULA 2GQ8A 3QQ0A 1GPWA 3INPA 4RR4A 5G5IA 1TRDA 4H6KA 4UTWA 4ML9A 3BG5A 1I2PA 1V5XA 4FIRA 1VLIA 3STGA 3NNTA 4NNAA 4YCPA 3STFA 3CPRA 1IGSA 4LS1A 2DORA 3HG4A 4FXSA 2BXVA 1EUAA 5L6UA 3QEZA 2BLEA 2G95A 5U7SA 1L9WA 3D0CA 3HF3A 1VCVA 1EUNA 4TX9A 1NF0A 3IGUA 3QSRA 3B4UA 5F4XA 3EX4A 4MLRA 4UCGA 4LOCA 3OHIA 1W5PA 4UFHA 3G8EA 4NX5A 2V81A 2NV1A 1IXOA 3L21A 3NZRA 5I3IA 5LNVA 2Y62A 4NJJA 1ONRA 3W7MA 5KITA 1ZAHA 1KV8A 4GC4A 1OF8A 1O5XA 3A23A 4QSHA 4RZ6A 3LRLA 8TIMA 1XC4A 3CQ0A 1F7BA 3S8HA 4NJGA 3LRKA 5AHEA 3W7GA 3GIYA 1THFD 3B0UX 3DU0A 3HB9A 4JYFA 1LBFA 4UR7A 3NVTA 3NM3A 2JKEA 3PSVA 4R53A 2ZA3A 2BWGA 2A4AA 1KFKA 3WK0A 1L2UA 1OX4B 4B5NA 4FNTA 3PVFA 4X22A 2TMDA 3I6RA 2NX9A 2QUUA 4DO5A 2E6AA 3MHFA 3HGJA 3M5XA 4GNJA 2CZDA 4MY8A 3P61A 2X2GA 4MLJA 5AB3A 1G4SA 4XTIA 3NPXA 4JDYA 1SPQA 2VFHA 3L2IA 3L9CA 3BLFA 1FWRA 1PCKA 3PS7A 4LVAA 3T44A 3O05A 3T78A 2OZ0A 3DFPA 3DXIA 5FI8A 2C3ZA 4DBDA 1SU5A 1H7PA 4O54A 2JKAA 5D37A 4UMCA 3TKFA 4S1FA 4UMBA 4O13A 1M6JA 3NXFA 3UXDA 2TYSA 3W84A 4WXYA 1EA0A 4K36A 2A1YA 3R2GA 2QJIA 1FXPA 4JNMA 5CSRA 1BTMA 1EWEA 2H8ZA 3RU6A 2LLEA 2ALDA 4WY0B 3C2VA 2ZZ2A 3QZEA 1AL7A 5DLCA 1EPXA 1DL3A 4IWWA 1LP6A 4ZVJA 3A5FA 3E0IA 2DZPA 1UJPA 4C1KA 3LTSA 4IJBA 3UD6A 4TU1A 3ATYA 4ZL1A 3N9SA 3UWYA 3IVTA 5CPLA 4NJKA 1KM0A 3HGSA 4DF0A 4JEQA 3ZR4A 5LNRA 2J9ZA 3O6YX 4H4IA 4MOZA 3TJLA 1EWDA 3LCGA 2Y7GA 1TTJA 1A53A 1NAL1 1TPWA 5F2LA 3HIJA 1LRQA 2C14A 4QJ1A 3VKJA 1LZOA 2YX0A 1BWLA 2JGQA 5CGQA 2QCEA 4MKNA 4OGZA 1CX9A 5AOUA 3F03K 1A5CA 3W6YA 3GLCA 2TSYA 3PBUA 3BW3A 4UMAA 4RJEA 4QM1A 1QMLA 5HR7A 1EEPA 3EX1A 4HSNA 3QMRA 4NJIA 4UIOA 3TR2A 3P81A 3Q94A 1PV8A 3DH7A 5EA9A 5K3VA 2B0MA 3EWBX 3QF0A 4PEKA 4FX6M 4JD4A 1GEQA 3TIMA 2Y88A 2Z0IA 3CWOX 1R30A 3PG9A 1QOQA 1ZFJA 3W70A 4WJEA 2VFDA 4CNPA 3TMQA 4NNCA 4FIQA 4MZ1A 3L66A 1YADA 3A24A 3W07A 3P62A 5LHFA 2CLHA 4BI6A 4GJ1A 2NX1A 1J5TA 2P1FA 3KAOA 5LNUA 1YXDA 3PSWA 4Z0SA 3QMTA 2PRHA 3QPZA 2R91A 1R2TA 4A29A 4LVDA 2ZRXA 4LUIA 3NYZA 3W1RA 4I7VA 5CPNA 4EWND 3E12A 1YTDA 3N34A 4C1LA 3EX6A 4M7SA 3LCWA 1O4UA 1TMHA 3S0CA 4JIQA 3FLUA 3W22A 2EGZA 4FNQA 3BARA 5KSWA 3O6DA 3GDMA 2B4GA 4M5PA 3N19B 2JK2A 3U6WA 1GYLA 1ADOA 3M1ZA 2TPSA 1ZCOA 4YWIA 2WNQA 1TPDA 3TCEA 3ABOA 3BLEA 3KRUA 1P4CA 2GOUA 3W7NA 5HWJA 3W85A 4XKYA 2XN2A 2ZZ7A 5E1QA 4IQLA 4GUIA 5C55A 4X9SA 2A7PA 3DHDA 2OMAA 3WJWA 3W7HA 1OFQA 1Z42A 3IIZA 4JTFA 3ZWSA 3FOKA 2HS8A 1RD5A 4A2SA 4OU1A 1GZGA 4WOQA 4JY9A 4AMAA 3W2KA 3HQ1A 2ZA1A 3I7QA 4RXFA 4POCA 4PODA 4MJMA 4ZZ9A 3S1VA 1K02A 1LDCA 1TQXA 1GG0A 2QKFA 5AYXA 3TAKA 2E5DA 5AC6A 2B7QA 1N55A 4JTJA 1DORA 1K8ZA 4RV8A 3C2RA 3FKRA 2VELA 2PE4A 4ZQMA 3EX2A 1JCXA 3S5ZA 4IPIA 4LVGA 5D32A 1W0MA 1O94A 1G69A 5FEXA 3LDVA 3M9YA 3Q2DA 2EF9A 2ZRVA 1F6PA 1GT8A 2QCLA 3HPSA 2C18A 4DPQA 3E96A 2Y61A 4O16A 1DHPA 1X1ZA 1NSJA 1KV5A 1SZFA 2ABBA 1X8FA 3UXAA 4HNNA 2QJGA 3N3MA 1PCWA 5FF4A 5DBUA 2VEMA 3GX9A 4YLWA 3HGRA 2WJZA 1DQWA 1SQ7A 3P5YA 3V75A 3GXPA 2P10A 2Z6JA 2ABAA 5LGZA 1T8XA 3MBDA 1NF7A 2QEZA 3KVJA 3IGSA 3ABRA 2HTMA 1ML1A 2WPBA 2YXGA 1LOSA 4GUHA 4FB7A 2ATSA 4FNRA 4Z1BA 1WBHA 2I9EA 5U4NA 3FYPA 4EF9A 1JRCA 2OCZA 4XWUA 2GJNA 3NQ8A 5ABTA 3PBYA 4QITA 5EKYA 1H7OA 5K9CA 1H7RA 3MHUA 4JYEA 5K7JA 3LTPA 3G18A 2RDWA 5D33A 2KZHA 3LLFA 3SIZA 3G1FA 3TXVA 3W1QA 3EX3A 4QIUA 3LCLA 3W2LA 2RHGA 2C16A 2XN1A 4WZHA 2G97A 2QF7A 4JTTA 1N7KA 5EPDA 4CLMA 2WV8A 3OVRA 3QH2A 4BWLC 1SFJA 2F84A 2FPTA 1F76A 4EF8A 5HWNA 4K6AA 4AWUA 3DFOA 2DZWA 2P0OA 3DKJA 3PBVA 1H7XA 2G96A 4Z1CA 3TFCA 2WO5A 4CQ9A 1QOPA 3GDTA 5BRBA 5HQEA 4X3ZA 4L4MA 3EB2A 3BLIA 1F2JA 5HNRA 2H3BA 5E0KA 4IMGA 4WUIA 2J9XA 4HNUA 1G67A 7TIMA 3NQEA 4JX6A 1VQTA 4LNYA 1TPFA 4Z0JA 3TX9A 2JGYA 2NWSA 4NU7A 4Y96A 1H7WA 2OT1A 5A8GA 3W87A 4CNOA 3NL2A 3W1NA 3W9ZA 3LHZA 3S9YA 2XFWA 1XDLA 2DP3A 5FEZA 2V2HA 4JS3A 2VEPA 1F5ZA 3OG3A 1OF6A 3THQA 4KWWA 3W2NA 2YFNA 3ABQA 3NQMA 5F1UA 1H1ZA 5F2GA 3TQ0A 1I2RA 5DCEA 3LLDA 1DV7A 3LHTA 1XUUA 4KFNA 1T96A 3TFXA 4KFPA 4HPXA 3NO5A 1X6UA 4DPPA 4O53A 3W1TA 3N9RA 2C15A 2GPTA 1VCGA 1P1XA 5LZLA 1W54A 5LNWA 2BX7A 3FIGA 1HFBA 1VHNA 4MYXA 4O57A 4UNKA 1UCWA 4QNEA 3N2XA 2E5CA 4OWGA 4FF7A 1QPOA 4IMEA 3QJAA 3IIPA 4O4WA 3SGUA 3ABSA 3T55A 3MYOA 1XI3A 1VC4A 2DZUA 1DJQA 1JJKA 4HN4A 4WY0F 3PC0A 3NPVA 3PWAA 4BWLA 1LROA 2W0UA 1M7PA 2CLIA 3KOFA 3EWWA 2NLIA 1R2RA 2V9DA 1R46A 4UTLA 3W7QA 1JRBA 3QYQA 3PF3A 1SZEA 4FEZA 2YFOA 1RVGA 3PG8A 3WK1A 3G0UA 3LI1A 5D2XA 1Y0EA 2RDTA 5BW6A 5K9XA 3I65A 3CB8A 1W1ZA 2AGKA 1W37A 3VCRA 1OYCA 3PM6A 2DU2A 3GKFA 2DZTA 4K38A 1KM2A 1S3HA 4AXKA 4WX2A 1TV8A 4JTKA 3WFAA 1AMKA 1VH7A 1KTCA 4O28A 2Y63A 1MZHA 2H3DA 2Y70A 5J5DA 5G2WA 3OIXA 5I3HA 2DJLA 3TE9A 4O1DA 1BEUA 3TNOA 3LGEA 1TYGA 3L5LA 4WXZA 1JCJA 1JCMP 3PB2A 3FS2A 3BO9A 3GR7A 3G1XA 4HSOA 2ZRYA 5AHFA 2DZVA 1Z48A 2E6DA 2HS6A 4K39A 3M47A 2HMCA 1QAPA 3W2UA 1ZHAA 3S1XA 3G0SA 1GQNA 4FHAA 1W5OA 4R34A 3THAA 2AAMA 1GG1A 4UTKA 5LHEA 3L0KA 4GWEA 3B06A 2OX1A 1AG1O 1H60A 3EXTA 4LC6A 3TAOA 4N9DA 1ZENA 3E02A 3C2FA 2WKJA 1Q3NA 2A5HA 3A21A 3TK7A 1GVQA 1XCFA 1MO0A 2DJXA 1HL2A 2R8WA 4UR8A 3LHUA 3NQGA 4UTUA 3SI9A 3PY2A 2J9YA 4JN6A 5CPOA 3GAYA 1F74A 1QWGA 3QRHA 2WNZA 1YDNA 3M16A 5HMSA 4AHPA 3LHWA 1I2NA 3L5AA 1TREA 4O12A 2NXHA 1EB3A 5AN7A 1QPNA 4IMFA 4CQAA 1KTNA 5C2XA 3P82A 2X30A 3Q58A 4O0ZA 4JTIA 1KLYA 2YDAA 1G4TA 2QCDA 4RZ5A 1VYPX 5AHMA 4LVFA 2A7NA 2Z6IA 2W6RA 3CIXA 4BR1A 1WA3A 2VC6A 5D2TA 3P80A 5CZ0A 1XXXA 4M6PA 3CEUA 4MYAA 3NPWA 3G3MA 3OBKA 4GBUA 3NQ2A 1XM3A 1D3HA 4RZ4A 5EY5A 3CIWA 3LM7A 3NR0A 3KVKA 3GR8A 3HG2A 4BK9A 1SW7A 1TTIA 2YZRA 4ORMA 3UWQA 3SFKA 3MO7A 4XQ6A 2O7SA 1A5BA 4FNPA 3GZ3A 1AW1A 5D2VA 1B3OA 2V30A 3I7RA 4O14A 3B05A 3TW6A 1LORA 3W3OA 3H53A 4AWSA 3B04A 5I3GA 1BKSA 2JKPA 3F1QA 5TQLA 2QDGA 5G1YA 4M6QA 4K37A 1SZNA 1C8VA 3DZ1A 2ZRUA 5C5YA 2QCFA 3A22A 3FKKA 3NQ7A 3GAKA 3L67A 1FBAA 3L68A 5EBUA 5C54A 1LTDA 3NDOA 5D05A 2YYUA 2TRSA 2J6XA 2X16A 1BWKA 4HT3A 5EL1A 2R14A 3L5MA 1F05A 2VENA 3SW6A 2QAFA 4Y90A 4RX0A 3B8DA 4LY8A 2Y6ZA 2PRLA 1K8YA 1EX5A 4MVAA 5DY2A 2NUWA 5EYWA 3IVUA 1LOQA 4DEFA 1FCVA 1YXCA 1FQ0A 4O1AA 3DGRA 3RLVA 4NXKA 4YCOA 5H2ZA 3VNDA 3Q37A 2A85A 4G1KA 3GNNA 4K8EA 4JYDA 1GTHA 1H7NA 3LOTA 5K2ZA 1K3UA 5F4SA 1LRNA 1CI1A 4FX8A 4I7UA 3AO0A 5K9DA 3S1UA 2CLEA 3W7JA 3W75A 4N9EA 4IOTA 1FWSA 4UUIA 5D38A 1WAUA 2CZFA 4XTDA 1V7YA 1YXYA 3A5VA 1IIGA 2YSWA 3IIOA 1C29A 3W86A 2V5LA 2VFIA 2WQPA 3NG3A 4NUWA 3EKZA 1R47A 2ZZ5A 3TJXA 1ZAJA 4DQWA 1KM3A 1M7OA 3G22A 3DAQA 4Q32A 4KFOA 1ZJIA 3M0ZA 3NOEA 2CU0A 4JTEA 3TSMA 1HO1A 2YW3A 3W72A 1W31A 1OX5A 1DVJA 1QNVA 1FXQA 1SSGA 2ZZ3A 4QNWA 5G1TA 2CLFA 2J88A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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