2F8QA

An alkali thermostable f/10 xylanase from alkalophilic bacillus sp. ng-27
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
QPFAWQVASLADRYEESFDIGAAVEPHQLNGRQGKVLKHHYNSIVAENAMKPISLQPEEGVFTWDGADAIVEFARKNNMNLRFHTLVWHNQVPDWFFLDEEGNPMVEETNEAKRQANKELLLERLETHIKTVVERYKDDVTAWDVVNEVVDDGTPNERGLRESVWYQITGDEYIRVAFETARKYAGEDAKLFINDYNTEVTPKRDHLYNLVQDLLADGVPIDGVGHQAHIQIDWPTIDEIRTSMEMFAGLGLDNQVTELDVSLYGWPPRPAFPTYDAIPQERFQAQADRYNQLFELYEELDADLSSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNDGVGKDAPFVFDPNYRVKPAFWRIID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
publication title Crystal structures of native and xylosaccharide-bound alkali thermostable xylanase from an alkalophilic Bacillus sp. NG-27: structural insights into alkalophilicity and implications for adaptation to polyextreme conditions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords alkaline thermostable endoxylanase
total genus 139
structure length 353
sequence length 353
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2005-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2f8qA00
2PB1A 1FH7A 5JIPA 2BY2A 2DIEA 1E73M 3WF0A 4A3YA 4M29A 5HPOA 4GXPA 1J0IA 2A3AA 5A6BD 3N9KA 1XYZA 4BCEA 4UR9A 3CHDA 2BVTA 2B31A 2VX5A 3DYOA 5I23A 1J0ZA 2WWCA 3M46A 2X0YA 4HZ7A 3PZQA 4E2OA 3WF1A 3GXIA 4CD8A 2GDVA 3WH7A 3ARUA 1VFOA 1LL7A 2VQTA 4GI6A 3GM8A 4UFJA 3VILA 4WKAA 2QPSA 1BVNP 1F4HA 2BVDA 4AD3A 3AROA 4ML4A 3L4XA 1OBAA 4WF7A 2CKRA 1IV8A 2J62A 2G8ZA 2G3IA 1U30A 2BVYA 1UOKA 1JGIA 1H5VA 4MTVA 1OWQA 3G6MA 3W6LA 4JCMA 4ATWA 4TTGA 5IXEA 1UH4A 1GHRA 1EDGA 1UG6A 4E8DA 2CITA 3UERA 5A2BA 1V0NA 2GJPA 3VD3A 2C8NA 4DM2A 1WB0A 4PMQA 3OG2A 2XPKA 1M01A 3T0BA 1WAWA 3OB8A 2ZXQA 2J77A 2E4TA 1FH9A 1PX8A 3SCPA 3OA5A 1VAHA 4W93A 2D3LA 2GJRA 4P8WA 2VX4A 2V3FA 4MNJA 1JZ5A 2FGLA 1FH8A 1HJQA 1K9EA 4P8VA 4ZXLA 3TP4A 4B9ZA 1UH3A 4P7NA 3PTQA 1CENA 1W1VA 2VVNA 1BAGA 3N13A 3CMJA 4HZ6A 1XHGA 2ZX9A 2WSKA 2QPUA 5BROA 4D6JA 3BC9A 3VMPA 2YL8A 4DUXA 3WNMA 1HXJA 2BHYA 1E6RA 1QHZA 3LPPA 4AIOA 1MQRA 3L2LA 3NJ3A 2J74A 3ARPA 1CXFA 3CUIA 3VDCA 4H04A 1KBBA 3AISA 4URIA 5GQBA 4AZBA 2A3EA 1PX4A 2G41A 3EDFA 5ABFB 1G94A 3WD4A 3W29A 3HJEA 4HA1A 2XYLA 2JF6A 3ZSSA 4JL1A 4UCFA 1C91A 1DP0A 3WKZA 1CXEA 3L4WA 3AIUA 3MSDA 1V6WA 7CGTA 3DECA 4Z2HA 4OIFA 1GVIA 1E0VA 4P8UA 1BPLB 1WPCA 2XVKA 3ARSA 3AIVA 3AFBA 5CGTA 3WQ6A 3OGVA 1VEPA 4JZ5A 1ZJBA 3PBGA 3ARRA 3VGGA 3OGSA 1SFSA 4LYQA 5LYRA 1LQ0A 2G4FA 2Y8VA 5DT7A 2EO7A 5FIPA 2CPUA 2DSKA 1HX0A 3N1AA 5CLTA 4U3CA 4JFTA 1UHVA 2CKSA 1TFVA 5A6KA 1O6IA 2D0HA 2F2HA 1V08A 2O9PA 2XIBA 3WSUA 1FHLA 1OD8A 4MB5A 1CPUA 4KWUA 1CTNA 1NWTA 1GJUA 1OSEA 2XG9A 3PZUA 4CVWA 1VFUA 4TVUA 2EQDA 4H7VA 2WMGA 1D7FA 2BNJA 4QCFA 3VPLA 3WD0A 3RMEA 4PMRA 1J11A 1KB3A 4WJXA 3FW6A 9CGTA 3QHMA 1E6NA 1BSIA 3BAJA 1W1PA 3AIWA 2EJ1A 3ZR5A 2VVSA 4CD4A 4XZWA 1BYCA 1E4IA 1BYDA 3RM9A 2J8FA 2XIIA 2WMIB 3J7HA 1BF2A 4MDOA 3MKKA 5DO8A 3GNPA 3WH6A 3WDHA 5AC4A 1H4PA 4F9JA 3PN8A 5A1AA 1CXHA 1TA3A 1E6XM 1ZBKA 4OZOA 3ZJ6A 1XC6A 4S3JA 3UEQA 2OSWA 1PJ9A 3A4AA 4A4AA 3I3DA 3AXXA 8A3HA 3II1A 3UR8A 4W85A 2BY1A 4TX8A 4J3TA 4CVUA 4QCEA 4HOXA 4P7RA 1SMAA 2BXYA 1ISYA 2J7BA 5D9OA 2YA1A 2OSXA 3CO4A 1HIZA 1NOFA 3VIKA 2W67A 1CLVA 3TTYA 1XD1A 3AHVA 1E6QM 1CNVA 3GDBA 3BAXA 1QNSA 3AMKA 1BFNA 5E9AA 1C8YA 4BQ4A 3SUTA 4F8XA 2BXZA 1C7SA 1MVYA 3VIOA 3WQWA 3VDBA 1OB0A 3N18A 1BGGA 2JALA 1I1WA 2CBJA 3BAWA 3LPOA 5A8QA 2D3NA 2W91A 3RM8A 3L4TA 5CGMA 1G01A 4PSPA 2DT1A 2VR5A 2XFFA 1XH2A 3CUGA 2DSUA 2PWFA 2W61A 3VNYA 4PUDA 1E43A 4JHZA 5FD0A 1ZB5A 2WVSA 3A6OA 4OBRA 1NM9A 4D1JA 1I75A 3GXDA 4D6IA 3W81A 4GZIA 4DWSC 3FN9A 1US3A 3SEPA 1TUXA 1EO7A 4BQ3A 5IHSA 4CUCA 2WK2A 3W24A 3NCOA 1U33A 3SCVA 1H1NA 4UOJA 4AY1A 1OCQA 1GOIA 1VENA 4V27A 1E6SM 2XHYA 3VIFA 3SCRA 5A2AA 3UG3A 2WM0A 1JD9A 4PCTA 2WLYA 1GVYA 1EH9A 2BHZA 2WBGA 4HMDA 4KRUA 3VINA 4JL2A 4W84A 5D9NA 4H8HA 3FHAA 3NYDA 1V0MA 3GNOA 4ZE5A 1UUQA 1E70M 4JKLA 4UFIA 3SURA 3OLEA 4N0RA 2XSBA 1H41A 1A3HA 3WNLA 1CXIA 1V6XA 4H8UA 1V3KA 2D22A 3DYPA 3M6DA 2FHFA 1ZJAA 3BSGA 3AXIA 3W27A 4C7DA 2Y8KA 3PZNA 1W3JA 1LJYA 3WQ4A 3WY1A 4XB3A 1NH6A 3A4XA 5I3DA 1J0YA 4PMNA 2XSAA 5I0DA 2DSVA 3KWXA 1UYQA 3EDEA 4PUEA 2XUCA 1Q4NX 3AICA 2PBOA 5HOSA 1HJUA 2PWGA 3L4UA 5GPRA 2ZUMA 2YKKA 3CZGA 1W1YA 1JD7A 3IAPA 1WNOA 1LWJA 4J27A 5HPCA 2AMGA 2VC9A 1MWOA 3L4YA 1UWRA 2G3MA 4YHEA 1DWIM 1XCWA 3M7SA 2WBKA 3SIMA 4TX6A 3W6MA 1Y7VA 2PF0A 2Y4SA 1QI3A 3ZO9A 1R7OA 1WZMA 2VTFA 1UR2A 2XM2A 3BMVA 4X9YA 1V6VA 4AW7A 5DMYA 5I79A 4PSRA 4UFKA 2EEXA 2QMJA 5M03A 3D3AA 2X0HA 2ZXBA 1HL9A 3U5UA 4M56A 2W63A 1HKJA 2VNCA 4NSBA 3N17A 4P7QA 2DGAA 1KXVA 1B3VA 3CBWA 5FOOA 2IXUA 2ZOXA 3QGVA 5HXMA 1HP5A 3AOFA 4A3HA 4JKMA 1XV8A 3GBDA 4XUYA 3NSMA 3GZAA 5A69A 1XCXA 2VL4A 4EAMA 3U57A 5E6YA 1UH2A 4AD0A 3WH8A 4TXEA 1W9UA 3NDYA 4V2XA 4JFSA 6A3HA 4MJ2A 1RD6A 2ZX5A 5E0CA 4RE3A 4OOUA 4MB4A 1J10A 1KQYA 1MQQA 2BV9A 1B2YA 3KL5A 4W7WA 1LF1A 4D72A 1V6UA 1CGYA 1E55A 2VZOA 1KCLA 1KR1A 1QI5A 3VIGA 2XVLA 3MUY1 1PX3A 3BLKA 2XJ7A 2ESCA 1ISWA 5LA2A 1WO2A 5E0FA 1AVAA 2TAAA 1B30A 3IJ8A 4X0NA 4AZ5A 3W37A 4UQEA 3RCNA 3WMSA 2JEQA 1WKYA 1F4AA 3ZM8A 1EHAA 1B3WA 1K9TA 3AIQA 3MV11 3VKKA 2WC4A 4FF5A 1E15A 1DTUA 3CUFA 2OSYA 4J3VA 2F8QA 5I78A 1VFMA 3EMZA 3UG5A 1XSIA 4PMOA 2EBNA 3CZEA 3B8SA 3ARWA 4AEFA 4U3AA 2ZUVA 1EDQA 5A8PA 3EDDA 1MQPA 4AZHA 1VBRA 3CZLA 1YHTA 4X0VA 1J18A 3MU7A 1GPFA 2JFEX 2D24A 4W89A 1LWHA 1E0XA 3IJ7A 4D6DA 2EPKX 4QDMA 2PBGA 4CCCA 1GUVA 3W4RA 3DYMA 5LA0A 1E5NA 3ECQA 4H2CA 1GCYA 2ZUWA 4HA3A 3TTOA 2QF8A 1W3HA 3OLGA 4NZCA 3ZJ8A 1CGTA 5A6MA 3W25A 4YPJA 3TTSA 4BQ5A 3K8MA 3TA9A 2D20A 4UFHA 2XWDA 1PAMA 2A3CA 1OGSA 3U5YA 1HVQA 4HMCA 4YHGA 3VUPA 1QI0A 4W8BA 1G0CA 3HMCA 1JIBA 2C7FA 3WF4A 2BS9A 2J7FA 3ARVA 1GW1A 1ESWA 3B9DA 1VF8A 1C8XA 2VCCA 4IPLA 2OYKA 4UZSA 3UG4A 4BA0A 3BGAA 4LYPA 4PMYA 4W86A 4DM1A 3GYCA 3I3BA 1JF6A 1R7AA 4YN5A 3WD1A 5HBFA 2G3JA 1LL6A 1U2YA 2UY3A 2O92A 3WF3A 3RJXA 1GQKA 2XGIA 3AIEA 4Z2JA 3RM4A 3VO0A 2D2OA 1JFHA 1M04A 1QHOA 2JIWA 5A6LA 1UWIA 2O9RA 1NOUA 1TVPA 2WVVB 4Y7EA 1D3CA 3VGFA 4FMVA 1W9XA 4M8UA 3WDIA 3PZTA 6CGTA 1SMDA 1VJSA 4W5UA 4V28A 4CCEA 5D8WA 1UZ4A 5ABGA 3K8LA 4PMUA 3VIMA 1BVZA 4H41A 3SUVA 1ITCA 1AQ0A 3AXHA 1VBUA 1CGXA 5EFFA 4HTYA 3S6TA 1XSKA 2J7EA 3SCOA 1OINA 5A8NA 4R27A 4MB3A 1ISXA 4MPKA 3F5LA 4QLKA 4AD5A 4D6CA 2WCGA 1V02E 7A3HA 5IFPA 4OJYA 4XZBA 3WELA 1EGZA 5JBEA 5CXPA 3FHQA 2CNCA 4CU6A 1CGUA 4P8XA 3WF2A 4PTMA 2XVNA 1KR0A 1W9PA 4UQBA 4L4PA 5A6SA 5F7UA 5AYIA 4UOQA 3VIPA 2WAGA 1W32A 2DQXA 2WLZA 3ARTA 3MSGA 2QHAA 2JE8A 1J9YA 1E6PA 2J25A 1EQCA 3CUHA 3PHAA 1HKIA 1PEZA 1GORA 4Z2LA 3AHTA 4JFVA 4AZIA 2VX7A 3NUKA 3ZT7A 1NWUA 2FHCA 3KL0A 4UQAA 1G5AA 4HU0A 3GH4A 2ZE0A 2EXOA 1OGGA 5CLWA 4IM4A 4MADA 1M7XA 3RIKA 2NSXA 2BHUA 3CPUA 7TAAA 1PPIA 4W8LA 5GNZA 4HMEA 4JAWA 1NP0A 2WYSA 3WDPP 3EYPA 5EB8A 3SCTA 4PYSA 3WL1A 1HJWA 1MFUA 1J0HA 2YDRA 1E3ZA 4AISA 2V3DA 3A3HA 2YL6A 3MMWA 3BSHA 1E4MM 1J01A 1JZ4A 1GJWA 1EQPA 1UA7A 2VRKA 2NW0A 3ZJKA 4U31A 1LLOA 5DEZA 1QNRA 1QPKA 1LG2A 2ZWYA 3CIVA 1O7AA 1UD5A 1ITXA 2ZUTA 2WZEA 4AD4A 4ZFMA 4H8VA 1E3XA 4DWSA 3BMWA 1HKKA 8CGTA 3SUWA 5KEZA 1DWGM 1EHNA 2WMKA 1VJZA 3T0DA 4OKDA 4EKJA 6TAAA 2V5CA 1TR1A 2QMKA 2CBVA 1B31A 1UQYA 5A94A 1QOXA 1OD0A 4ZENA 3T2OA 2XFYA 4AMCA 4N42A 3A4WA 3K1DA 3VM7A 5BWFA 4AWEA 4U5IA 4UFMA 1KGWA 4F79A 2OWXA 1UA3A 1YQ2A 3AHZA 1H11A 1UD6A 3U7BA 2WZIA 3WNNA 3GXFA 2J4GA 1WZLA 3NSNA 3AIBA 4GZJA 3WEZA 4P7LA 4LGXA 1W9DM 1A47A 2OWCA 3O6AA 3ZMRA 4J3WA 1E5JA 3AS3A 4M1RA 1E1FA 1XSJA 3VIJA 2QLYA 2V3EA 5M5DA 4MNMA 3ZOAA 5FL0A 2YL9A 3K4AA 1XH0A 1TCMA 1HP4A 2J78A 1V3MA 3BXWA 1JYVA 2ZUNA 3POHA 4C7FA 2GVYA 2XTKA 3GH7A 1QVBA 1TVNA 4HPHA 1CDGA 1VEOA 2PI6A 5BYWA 4MAZA 5EMYA 2EPNA 1KGXA 4PCSA 2BFGA 4JIEA 1KGUA 2J8GA 4W88A 3AS0A 4AC1X 4NRSA 1W2VA 2J7CA 3UCQA 3VIIA 5I2UA 3DC0A 1NARA 1H0GA 2A3BA 4KGJA 2CEQA 4JKKA 2YL5A 5AYBA 1JYNA 3WBEA 2WNWA 1CEOA 1QHPA 4DUWA 4M24A 1E9LA 3UETA 2DSZA 2VR4A 3VGDA 1JAEA 3SCSA 1CYGA 2WSPA 1JZ3A 2D1ZA 1JI2A 1K6AA 1IT0A 3PZMA 4P7OA 3WMCA 3HN3A 4W87A 3G6LA 1CECA 2EPMX 1OIMA 3BLPX 1JG9A 5FCZA 2NT1A 4D6GA 1X6LA 3POCA 4JCLA 4PMDA 1C92A 2YBUA 1PBGA 4M82A 3SCQA 3T2QA 3KL3A 4BZYA 4GIAA 3GNRA 3GTNA 2W5FA 1JNEA 3OBAA 1R8LA 3WDRA 3F5JA 3VNZA 4AXNA 4HOWA 3WD2A 2WWDA 3KEHA 5ABFA 1BQCA 3AIRA 5IFTA 3ZJ7A 1QW9A 4HZ8A 4CU7A 1UR1A 3N12A 4QLJA 4AEEA 2WVTA 2X05A 3VMOA 2OLHA 3K46A 1TE1A 3CMGA 2PWDA 1RPKA 1C90A 2CETA 5DF0A 2Z1SA 1QBAA 1LL4A 3PZVA 3QOMA 3WQVA 3BAYA 3ARZA 3VU2A 4KRTA 3SCNA 2RGMA 4CCDA 2IUZA 3CUJA 1HN1A 4WKFA 1E1EA 2WXDM 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2PB1 A;  1FH7 A;  5JIP A;  2BY2 A;  2DIE A;  1E73 M;  3WF0 A;  4A3Y A;  4M29 A;  5HPO A;  4GXP A;  1J0I A;  2A3A A;  5A6B D;  3N9K A;  1XYZ A;  4BCE A;  4UR9 A;  3CHD A;  2BVT A;  2B31 A;  2VX5 A;  3DYO A;  5I23 A;  1J0Z A;  2WWC A;  3M46 A;  2X0Y A;  4HZ7 A;  3PZQ A;  4E2O A;  3WF1 A;  3GXI A;  4CD8 A;  2GDV A;  3WH7 A;  3ARU A;  1VFO A;  1LL7 A;  2VQT A;  4GI6 A;  3GM8 A;  4UFJ A;  3VIL A;  4WKA A;  2QPS A;  1BVN P;  1F4H A;  2BVD A;  4AD3 A;  3ARO A;  4ML4 A;  3L4X A;  1OBA A;  4WF7 A;  2CKR A;  1IV8 A;  2J62 A;  2G8Z A;  2G3I A;  1U30 A;  2BVY A;  1UOK A;  1JGI A;  1H5V A;  4MTV A;  1OWQ A;  3G6M A;  3W6L A;  4JCM A;  4ATW A;  4TTG A;  5IXE A;  1UH4 A;  1GHR A;  1EDG A;  1UG6 A;  4E8D A;  2CIT A;  3UER A;  5A2B A;  1V0N A;  2GJP A;  3VD3 A;  2C8N A;  4DM2 A;  1WB0 A;  4PMQ A;  3OG2 A;  2XPK A;  1M01 A;  3T0B A;  1WAW A;  3OB8 A;  2ZXQ A;  2J77 A;  2E4T A;  1FH9 A;  1PX8 A;  3SCP A;  3OA5 A;  1VAH A;  4W93 A;  2D3L A;  2GJR A;  4P8W A;  2VX4 A;  2V3F A;  4MNJ A;  1JZ5 A;  2FGL A;  1FH8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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