2FB3A

Structure of moaa in complex with 5'-gtp
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
EQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ligand binding protein
source organism Staphylococcus aureus
publication title Binding of 5'-GTP to the C-terminal FeS cluster of the radical S-adenosylmethionine enzyme MoaA provides insights into its mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Molybdenum cofactor biosynthesis protein A
total genus 106
structure length 327
sequence length 327
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.99.22: GTP 3',8-cyclase.
pdb deposition date 2005-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF06463 Mob_synth_C Molybdenum Cofactor Synthesis C
A PF13394 Fer4_14 4Fe-4S single cluster domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2fb3A00
1EP1A 3W7OA 5K3VA 5KSWA 2RKXA 3VI2A 3G1XA 2HMCA 3PBVA 3MHFA 1ICQA 1VPXA 2AAMA 1GQNA 1W5OA 2YXGA 3K30A 3DAQA 3NAVA 1TO3A 3W2LA 2V30A 3FLUA 4MPQA 3DI1A 2WSRA 3GYEA 1KFLA 1QOQA 3W7NA 3MP3A 3UD6A 3QF0A 4Y9AA 2Q3OA 3C56A 4N9CA 4EVZA 4JNMA 4LU0A 4RX0A 3RNDA 2ZTKA 5K4ZA 3O07A 1Z41A 3CM4A 3WJSA 3MYOA 5I3JA 3BG9A 1LROA 4M19A 1Q6QA 1E51A 2WNZA 1H51A 5HINA 3W3OA 5H91A 4JTLA 1K8YA 4UMAA 1K02A 1BTMA 5FEZA 2WV8A 2JKEA 3JRKA 4Z08A 3G1HA 4OU1A 1QPOA 3W84A 4CCDA 1VJIA 4TIMA 3O05A 2A85A 1FWWA 2FTPA 2NXHA 1BEUA 3TW6A 5KZMA 3B04A 3GAKA 1G69A 1B4EA 4HNVA 3W86A 3W7KA 3U8GA 6ALDA 1IIHA 1MEHA 3LHYA 3DFQA 3MBDA 1N7KA 4AF0B 4CLMA 2QCLA 2QCDA 1OX5A 3WFAA 4MYXA 1Q45A 3GVGA 1QO2A 2VEIA 3P67A 3SIZA 3PR2A 1DJNA 2WKJA 3C8FA 3IIPA 2O7SA 2CZEA 2VEPA 5D2TA 1DV7A 1LBFA 4DQWA 4JTFA 1DJQA 2OZ0A 2P10A 4KKXA 3BGGA 3NPXA 3S5ZA 4QSHA 4HPXA 4UFKA 1LLWA 3DZ1A 4JTEA 1PHQA 1WQ5A 1TREA 1WOAA 2CW6A 1OJXA 3DU0A 3LCWA 3UY7A 5G4WA 1HO4A 1SZFA 3E02A 4DO6A 1G4TA 4I7WA 3DFTA 1PL9A 3W71A 5ABTA 1RPXA 2JGQA 3CB8A 3GR8A 3EWZA 1OFQA 6TIMA 3LCGA 4O4VA 2CLEA 1WYIA 2QKFA 1OG0A 3TW7A 3ABQA 1MO0A 4NXSA 1NF0A 1F74A 3L5AA 1VHNA 1WBHA 4NX0A 1PHWA 3UPBA 1VR6A 2C0AA 1WOBA 2A7NA 2H6RA 3UNDA 3C2EA 4WXZA 3I6RA 1YDNA 3C2RA 2X1TA 5GVJA 1W3IA 1QWGA 1VH7A 1D3GA 3BW2A 3SJ3A 1GWJA 1TJRA 3S1WA 1TTIA 1IF2A 3VKJA 5LNUA 1SW7A 4UNKA 1KM6A 4NJJA 2DP3A 4M6PA 4UIOA 5IBXC 1H7OA 4JTJA 1V7YA 1SR9A 5T26A 2E5DA 4N4QA 2E09A 1W3TA 2TRSA 3TAKA 4FHAA 4O15A 3LCLA 1IXOA 1ICPA 3PAJA 4QISA 1KFJA 3IVTA 5DCDA 3C3NA 1B3OA 4IMCA 1QNVA 2CLOA 1OFEA 2WO5A 3NA8A 3PBYA 1C9DA 1ZENA 5BRBA 4GE8A 3W7DA 2A1YA 1LORA 2X1UA 1LOLA 3RFAA 4QIUA 5C6MA 1AW2A 3QQ1A 1W5NA 2B7OA 1FBAA 3OIXA 3NQAA 4B5NA 5AYYA 1CI1A 3TR2A 3KVLA 4L4LA 2NV2A 1R30A 3W7MA 4WUIA 1P0KA 2YW4A 3HPZA 2B4GA 3PWAA 3Q94A 5E1QA 5AHFA 3ABSA 4NJKA 3LOTA 2C3ZA 4OV9A 5EMUA 1FCUA 2Q8LA 5BMXA 3PY2A 4LW7A 3H55A 1XBZA 1TCDA 3S42A 1K03A 2J9YA 5EA9A 3E9AA 4UTWC 2QCFA 2Y6ZA 2RDWA 2QAFA 4H3DA 4ZZ9A 3DFOA 3QW3A 4LC8A 5F4WA 3LBMA 3KAOA 1VZWA 2NUWA 5L9FA 2OT0A 1HTIA 3DFSA 4UTMA 1PV8A 2RFGA 4L4MA 3HG3A 2C13A 3R12A 3B0UX 4UNLA 5DY2A 3TKFA 3GZ3A 2QDGA 4PTNA 4GXMA 1MXSA 4YL2A 1JJKA 4HIBA 2GUUA 3NQDA 4K36A 4ZQNA 4NT0A 4BF9A 2ZZ2A 4IMDA 5AHNA 4Q32A 1OFPA 3MO7A 2E6FA 4ALDA 2BLEA 2GOUA 2NXIA 3BLFA 3FYPA 3HO8A 1TRDA 3L2IA 4MIMA 4JTUA 5F4SA 5KTLA 1TYGA 5K9XA 3EKZA 3NO5A 2V9DA 3EXTA 4PFMA 5D2VA 4ORMA 4LC6A 2C14A 4BI7A 1O94A 2ZA1A 2BSLA 2J88A 1KV5A 1O60A 2VFEA 4O17A 3EEGA 3FEMA 4J9JA 4IPIA 2Y7FA 3ZR4A 2DZTA 4OWGA 1VYPX 3O15A 2YZRA 3QEZA 5FEWA 1FXPA 4C1KA 2HS6A 4MY1A 4LRSA 3D0CA 3O06A 3HG4A 2DU2A 3P8IA 4MFEA 3G3MA 2WSYA 3GKFA 1H50A 1DVJA 3SSJA 4RKAA 2H90A 2QCHA 3LM7A 5AYZA 1W0MA 3PB0A 1UB3A 3G0XA 4RXGA 3EKLA 3LHZA 3O6CA 3A5VA 4LVBA 4AXKA 3MP5A 3STCA 2LLEA 1O95A 3B03A 3W07A 1PIIA 2NUYA 1LP6A 3N73A 4A21A 1EWEA 3A5FA 4GUGA 3VNDA 2QUUA 2ZZ3A 4AHPA 2Y61A 3G18A 3O1NA 3M9YA 1FWTA 3BW4A 1ONRA 1OHLA 2TPSA 3FYOA 4UMCA 1I2QA 5LNVA 1YXDA 8TIMA 4IGHA 2PRLA 1SW0A 2B7PA 3INPA 2ZDRA 4C1LA 5I3GA 3LRMA 4ADUA 4MOZA 3SW6A 3DFNA 1NVMA 1OF8A 2R94A 4R53A 1OYAA 2YYUA 3A22A 5FEPA 3U6WA 4P2VA 1M5WA 1R2TA 5I3KA 3GKAA 2TMDA 2NX3A 3NL5A 3M44A 4LS1A 5EBUA 1P0NA 4O1AA 4UFIA 3EWWA 1XXXA 3RMJA 3HOJA 3G3DA 4ORIA 1LOSA 2A6LA 1ICSA 3EX2A 1HL2A 3CIXA 5CGQA 3P5ZA 4MLJA 4UFMA 4AMAA 4FX7A 1RQHA 1QO5A 1YPFA 2CFFA 3GNNA 4WQ6A 5DBUA 3QMTA 2CZFA 2EPHA 3GXTA 3WJYA 4ZQMA 4JS3A 5F2GA 2ZA3A 4ZQRA 2DZSA 4KFOA 4Z1DA 1OVDA 3HPSA 1TIMA 3QM3A 4K7VA 5HJLA 4IOTA 4LVGA 4FIRA 3SGZA 3P61A 3W9ZA 1XL9A 3THQA 4LV9A 2KZHA 5DLCA 1KFCA 2BXVA 1PCKA 3CHVA 4MLRA 4A22A 1TPVA 2P1FA 4OQVA 5KINA 5K4XA 4HT3A 1VC4A 1ZAIA 3RU6A 4ZQOA 3TQVA 4KFNA 1EPXA 1TPEA 1KM5A 3TDFA 4K8HA 2NUXA 5FF4A 4UTJA 4NX5A 1LOQA 3C0JA 3KFTA 3I65A 3HGJA 3HB9A 1GYLA 3GXNA 3R2GA 5EYWA 2WOQA 4RV8A 1F76A 2Y70A 1M7OA 1S5WA 5AHIA 1G4PA 1X6UA 3UWYA 3SY5A 2AQWA 4HHPA 4IQLA 4TU1A 2ZTJA 3MUXA 3PG8A 3TROA 4ML9A 1KTBA 4N9DA 3DH7A 4OGZA 2E5CA 3G22A 1EUNA 4IX2A 2CZ5A 1XBYA 1EP3A 3TX9A 1EIXA 2ISSA 3TSBA 3VE9A 2QCNA 2V2HA 4MFDA 2DJXA 3PSVA 1OYCA 1QMLA 1F05A 1TRIA 1A5CA 1JQVA 3E12A 3LXAA 3BW3A 1YXYA 2ZZ6A 3W1AA 2E6YA 1A50A 3IV3A 2DZWA 2PE4A 1KFBA 3G24A 2TYSA 3G0UA 5FESA 2QAPA 3NZ1A 1DBTA 3F4NA 4WY0F 3R8RA 3NZRA 3TV8A 1ZAHA 3B0VC 3A9IA 1TPWA 3HGRA 3MYPA 3A24A 4MY9A 3KRZA 2ZRZA 2JKPA 1NAL1 5G2IA 4DEFA 2JBMA 3M0ZA 1XBXA 4TMBA 3UWVA 3DKJA 1QCWA 4GUHA 3IVUA 5F2MA 2BZNA 1S5TA 2V82A 3TXVA 4CQ9A 1AW5A 3ANYA 5EL1A 3BARA 2PRHA 2QJIA 4FXSA 4OT7A 3HIJA 2NZLA 3W1UA 2FIQA 1OFBA 3GLCA 4KFPA 3LRKA 4K38A 4NJHA 2I14A 3ATYA 2EAWA 2X1RA 2Z1BA 2Z6JA 4ONVA 5FF3A 3A23A 2IQTA 2ZBTA 4IMGA 4JICA 2VELA 3L5LA 4HKPA 1JUEA 2GQ8A 4XKYA 3L0GA 3OVPA 1Q6LA 3UY8A 3S9YA 3F1QA 4FNPA 3TCEA 4YXGA 3W2KA 3WJXA 4YCPA 1H60A 3F03K 2VFIA 3L21A 4Z0JA 4TMCA 3HQ1A 1UCWA 2ZZ1A 3LERA 2A5HA 1K3UA 3LCHA 5F2LA 3M43A 1SO6A 3B05A 5F2IA 2YCEA 2YR1A 5D04C 5AHMA 4Z1CA 4MYAA 1G7UA 3NPUA 4A2SA 4XUGA 4FX8A 5U7SA 5LGZA 4ICNA 3W7PA 3GAYA 2JGYA 3LCFA 3L5MA 4FXRA 4OBTA 3T4CA 4LS2A 5SWUA 2PURA 4N9EA 5AN7A 3OVRA 5U4NA 4UR8A 3KOFA 2ISVA 1QFEA 3BVJA 1SO4A 5CKSA 1V5XA 2YX0A 3UPWA 3W7IA 3QMRA 1JCXA 4N6EA 1ZAJA 2ZRYA 4K6AA 4XTIA 2VC6A 1TJPA 2E68A 5LNWA 1W5MA 4AF0A 3M5VA 4S2BA 1LYXA 2J27A 3FKRA 4BK9A 1RQBA 1RQEA 4JTIA 4XBKA 1Z48A 3TJLA 1OF6A 4QAIA 2RH9A 1T0OA 3W2JA 3LDVA 3NVTA 3IEBA 3LHWA 1UUOA 1GG0A 4IMEA 2NX9A 4FF7A 5DN1A 4ZQCA 2V2DA 3ZWSA 3HG2A 2H8ZA 2PRMA 3KXQA 4AAJA 1WDWA 3NQFA 4FNTA 4JX4A 2XN1A 5CZJA 4K7YA 3L68A 1A5BA 1THFD 5CSRA 2VFDA 4M6VA 4O16A 3TUUA 2H3DA 4UFJA 4XWUA 3W6YA 2VOMA 4MJZA 1RVGA 4DELA 2FQIA 2ZZ7A 3RLUA 4GUIA 1H7WA 5DCBA 4UTTA 3PC0A 2EF9A 3S5YA 3I7SA 2CLHA 4HSOA 3L0NA 3QFEA 3CPRA 3NG3A 3PUOA 2YFOA 5D02A 3TFXA 1Q6OA 3BLEA 4XTDA 3PUEA 1EWDA 5G2WA 2ZRVA 4AEOA 1AL8A 4N4PA 1OK4A 2F84A 1I2NA 4EIVA 1LZOA 1GVOA 1MEIA 1VGAA 1DQXA 2QCMA 1N55A 3SECA 3THAA 4DF1A 5J5DA 2A2IA 4ZQPA 2VFGA 4DBDA 3EX3A 4FO4A 3CEUA 3W88A 3CEPA 4NVTA 3KRSA 5F4XA 3ATZA 1XKYA 3S1XA 4UUIA 3TQKA 1SZEA 4UTKA 3LLDA 1ZNNA 1UASA 2VEMA 2B7NA 4WJEA 1WX0A 2RDUA 4OHQA 1LDCA 1DORA 1XFBA 5TBOA 5AB3A 2YW3A 3H53A 2A0NA 1L6WA 1W56A 2DZXA 1NSJA 3W23A 1QPQA 1ZJIA 3EX1A 4NXKA 1H7XA 1NFBA 1EX5A 3LBCA 3NPWA 4Y96A 2PCQA 1TTJA 4FEZA 3P8JA 2NV1A 4O54A 3C52A 2ZA2A 4DF0A 1L2UA 4I7UA 1RR2A 1T96A 1M7PA 5FEXA 3LCIA 3MI3A 1H63A 5BW6A 4HN4A 2J9ZA 1GJPA 3C2OA 1VCGA 3B4UA 2Y88A 5I3HA 4PH6A 3LCXA 4HNNA 1Z44A 2G95A 1SO5A 3EX4A 3P84A 1WA3A 1HUVA 3CTLA 3UWQA 1YTKA 2CLMA 4HNTA 1GTEA 4I9AA 1R46A 3UQNA 3E0IA 4RZ5A 1GTHA 4WOQA 3R89A 4LTSA 5AOUA 4HSNA 1KBIA 2OJPA 3GB6A 4JYDA 1I4NA 4JR5A 3A21A 1NF7A 1QPNA 3W74A 4AH7A 3EXRA 4E2DA 1FXQA 5CPNA 1GZGA 3S5NA 1DKWA 3T44A 3NL6A 3N19B 3ZFHA 4UXDA 4JIQA 3P60A 3OVQA 5FF2A 1KBJA 2XFWA 2W6RA 4RR4A 3O8AA 3ELFA 5G4EA 5DCEA 1ZALA 3IIZA 1BWLA 4K8EA 3TIMA 4LT9A 2E5BA 4NZFA 4RK8A 4QNEA 1ME8A 2QJGA 4AWUA 4QM1A 5BOOA 2GVGA 3MJYA 2C19A 1S3HA 1X1ZA 5HUOA 3DGRA 1YYAA 3NNTA 3NEVA 4Y6GA 3SFKA 2FJKA 4RLIA 4O1CA 1IXQA 4JY8A 4NUWA 3C6CA 2E6AA 3LXCA 4PODA 2QR6A 4FNRA 4X9SA 5HQEA 2ZCGA 4RXFA 1SZGA 1Q6RA 2FB3A 1TPUA 3PVFA 4O52A 3QRHA 1IIGA 1T99A 1JCYA 1MZHA 1Y0EA 4IUOA 3M6YA 1H7NA 2YGYA 1Z42A 4Y8FA 4WXYA 5HR7A 3TQ0A 4HPJA 3S1UA 4GRSA 1OABA 2A7RA 3UWWA 4R7JA 2WSQA 3P81A 5CZSA 1XDMA 5G1TA 4JY9A 1XDLA 2NLIA 4LV4A 5G5IA 1LRTA 4MUZA 5FI8A 1ML1A 1D3HA 1H61A 3IIOA 4O13A 3LI0A 3C2FA 4WOZA 3BPWA 1KLZA 2E6DA 1K7FA 2ALDA 3QSTA 3N3MA 5LNRA 1RV8A 5LHEA 3N34A 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 3OG3 A;  1RD5 A;  3FA5 A;  5C5Y A;  1W54 A;  5FF7 A;  3C2V A;  1J5T A;  3PBW A;  3NQV A;  3NDO A;  3G1A A;  2QJH A;  5BMW A;  3TH6 A;  5D2X A;  4LVA A;  3LV6 A;  3HPX A;  3UXA A;  3W1R A;  1MSS A;  1G6C A;  1PE1 A;  4UTT C;  4WY0 A;  5HWM A;  1ZHA A;  5DEL A;  1S5V A;  3TC6 A;  5K9C A;  1VYS X;  2BTM A;  3VCR A;  2VFH A;  3QSR A;  2FB2 A;  3ZWT A;  4PA8 A;  4IPJ A;  3DHD A;  4JTS A;  4QJ1 A;  1J2W A;  3MBF A;  2GVL A;  1OK6 A;  5D05 A;  2NWR A;  1IXP A;  4UTL A;  1SSD A;  3UWU A;  3T7V A;  5K9D A;  1H5Y A;  1VS1 A;  1W31 A;  2WNN A;  3TK7 A;  2HTM A;  4PL2 A;  3GX9 A;  1HO1 A;  4JEQ A;  3NOE A;  2I1O A;  1F2J A;  1JQX A;  2Z6I A;  4X22 A;  3V1P A;  5MHB A;  3QH2 A;  3QPZ A;  3W70 A;  4AVF A;  3TA6 A;  1SSG A;  3BK0 A;  3AO0 A;  4CNN A;  3W2N A;  2UV8 G;  2QUT A;  4N9B A;  4XKY B;  1K7E A;  1YTE A;  5CZT A;  3EWY A;  1BWK A;  2C16 A;  1K8X A;  3R13 A;  3DI0 A;  1YXC A;  3GXP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VOH A;  2ASH A;  2AL2 B;  5KSW A;  3TTQ A;  9XIM A;  4GVI A;  5A3H A;  5FJO A;  1KXT A;  2ZUT A;  2AAM A;  4M82 A;  1GQN A;  5HQM A;  4GQ0 A;  4KIR A;  2V30 A;  3CV1 A;  3MP3 A;  3UD6 A;  4MB3 A;  2W62 A;  4TX8 A;  4Y9A A;  2GSH A;  3C56 A;  4N9C A;  3RND A;  3O07 A;  3QV9 A;  4Q8M A;  4X60 A;  1Q6F A;  3MB9 A;  3NYD A;  5GJP A;  4DWS B;  4M19 A;  1Q6Q A;  4X0N A;  2WNZ A;  3N1A A;  3PAN A;  3W3O A;  5HIN A;  4CQC A;  4ZGY A;  4L9X A;  1P48 A;  1CXF A;  1BTM A;  3R25 A;  2WV8 A;  3OHM B;  3JRK A;  2DH2 A;  1MNZ A;  1ZLP A;  3W84 A;  3WZ0 E;  1PTA A;  4PMZ A;  5I7G A;  4GME A;  1E4N A;  2XFR A;  2IPG A;  2NXH A;  4FMV A;  3ABX A;  1EFZ A;  3GAK A;  1B4E A;  4O1F A;  3W86 A;  3W7K A;  2FGL A;  3PNU A;  3GSM A;  4RW3 A;  3S9Z A;  1IIH A;  1MEH A;  1PPI A;  1N7K A;  1LJY A;  4AF0 B;  3SRF A;  2QCL A;  4MYX A;  1Q45 A;  1MUM A;  3PR2 A;  1DID A;  4EP8 C;  2VEP A;  5D2T A;  1DV7 A;  1MFV A;  1LBF A;  3RM9 A;  4DQW A;  4XX6 A;  1UD2 A;  5CBI A;  5KEZ A;  3FA4 A;  7REQ B;  2VNC A;  2YXX A;  1EDT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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