2FFCA

Crystal structure of plasmodium vivax orotidine-monophosphate-decarboxyl ump bound
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
332
structure length
318
Chain Sequence
NLKIKLQKRRDEVNTCLCIGLDPDEADIKSFMQSEKQNGYQSVKKNLSNSGELFAPQMGGQMLLATPPKEAQEKDEFFYFFNHFCFYIINETKEYALAYKMNFAFYLPYGSLGVDVLKNVFDYLHHLNVPTILDIKMNDIGNTVKHYRKFIFDYLRSDSCTANIYMGTQMLRDICLDEECKRYYSTFVLVKTTNADSHIFQNRLSLDGKEAYVVIAEEVQKMAKQLHLEENGEFVGFVVGANCYDEIKKIRELFPDCYILAPGVGAQKGDLRKMLCNGYSKNYEKVLINVGRAITKSGSPQQAAREYHQQIKEVLAEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Plasmodium vivax
publication title Genome-scale protein expression and structural biology of Plasmodium falciparum and related Apicomplexan organisms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords orotidine 5-monophosphate decarboxylase
total genus 125
structure length 318
sequence length 332
ec nomenclature ec 4.1.3.23: Transferred entry: 2.3.3.2.
pdb deposition date 2005-12-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ffcA00
2H8XA 4MZ1A 3W76A 3IGSA 4OU1A 3E9AA 1KV5A 2NXGA 4ZQCA 3NZRA 4HHPA 3BLFA 3TQ0A 2VKZG 5FF4A 3L2IA 2OCZA 3P81A 1DJNA 2VELA 3MBDA 3MO7A 3NQ6A 5FEXA 1H7OA 5HWJA 2EGZA 2JK2A 3LHZA 2C6QA 4JYEA 3EX4A 4MJZA 3LRKA 1PS9A 2FPVA 3SFKA 1EP2A 1A5CA 3LGEA 3G1XA 3LDVA 1S3HA 3QMTA 3WJXA 5LNRA 4ZQMA 3SIZA 2WNNA 5HR6A 2A7RA 1G4SA 2V82A 1FCVA 5FESA 2F84A 5LGZA 5J5RA 1U83A 4JN6A 3A5FA 2QCCA 1SO6A 2Y7DA 1H62A 1NF7A 1GVSA 1JUKA 4DBEA 2VFIA 4XQ6A 1I8JA 4WXYA 4MY1A 3FKRA 1SZFA 4JTIA 4GRSA 4NNBA 2J24A 4BWLA 1ME7A 1YYAA 1SO5A 3QH2A 1TSIA 5LZLA 4FIQA 3W1TA 2Q8ZA 4HNTA 3M5ZA 3Q94A 3EXSA 5F1UA 3B0VC 3EXRA 3ZWTA 4IMEA 1GT8A 3TC7A 1TTIA 3TSDA 5LNVA 3L66A 5EPDA 4KKXA 1Z48A 1L9WA 3W1XA 4NJJA 3DKJA 4HPJA 1WOAA 1OFOA 3NDOA 4NNCA 1F6PA 4JTKA 2BTMA 3WFAA 1UBSA 3W2JA 3Q2DA 1ADOA 1K7EA 3PVFA 5AFDA 4Z08A 3FJ6A 4CNNA 4FNSA 4HPXA 4IOTA 4ORMA 3F4NA 3OVQA 3W7MA 5TBOA 3HJZA 1O95A 3UQNA 3PSWA 4R34A 1VYRA 5LSMA 4HNNA 1GYNA 3LI1A 1RQHA 4MKNA 1QWGA 2C14A 2VXNA 2TRSA 3RU6A 3SSJA 3W2UA 4FX6M 4DF0A 1FCQA 2Y85A 4DXVA 1RQEA 2E5DA 3TUUA 3D0CA 4XWUA 3GKAA 6TIMA 2Z2UA 5KINA 3AO0A 3WJWA 4DF1A 1OYCA 1THFD 1RPXA 1UUOA 4LW7A 3STCA 2I1OA 5AOUA 1ZJIA 1S5WA 4OV9A 1TJRA 2CZEA 2E5BA 1Z44A 1EEPA 3A5VA 4RXFA 5BNKA 3G1YA 1GJPA 5G4EA 3GXTA 4TMBA 4AHOA 2QAPA 3KRUA 4IMDA 4CQAA 3W2KA 2GJLA 1TIMA 4ZL1A 5DN1A 4AEOA 1XDMA 1WDWA 5G2IA 4UTMA 5E93A 4Z1BA 4RKAA 4RR4A 3DFPA 3NQ2A 3LXCA 3CU2A 1G67A 1O5KA 4WOQA 2BSLA 3F4WA 4HSOA 3WK2A 1EA0A 2G96A 2Z1BA 1GVQA 2P0OA 3NAVA 5U7SA 3TJLA 3WK3A 1X7FA 4MFDA 3OIXA 8TIMA 1OVDA 4UTIA 2P1FA 5F4WA 3NGJA 5AYYA 2WNZA 2Y7FA 4A21A 4MJMA 1AL7A 4BK9A 1SU5A 3N9RA 2CLHA 1VCVA 5I3IA 5D03A 1OF6A 4MVAA 3QQ0A 3DENA 2H3DA 2UV8G 1NAL1 4ZZ9A 1Q6OA 1OFAA 4RX0A 3S9YA 4ALDA 3W86A 4UMAA 3GR7A 4O12A 4A2RA 3MI3A 4QM1A 4QQ3A 3NL6A 3NQDA 1F74A 4JIQA 4ORIA 1RZMA 3HQ1A 3IGUA 5DELA 3KOFA 3WK1A 1ZENA 3S42A 4FHAA 3HG4A 1QNVA 3GXPA 3CIWA 3DKLA 2R8WA 4K7YA 1WV2A 3PS7A 3W1MA 4OHQA 3W88A 5F1VA 2V2DA 4FX8A 4LS2A 1Q3NA 1OFEA 3G1SA 3C2RA 4CNPA 3K30A 3EB2A 3KVKA 4OT7A 3NG3A 3SW6A 4IPJA 1TQXA 3ZS4A 2NX3A 2QCDA 4NJKA 5CKSA 1CW2A 3A22A 4JICA 4WOZA 4B5NA 3YPIA 3W7IA 3FEMA 4NT0A 3RF9A 4LNYA 4MLJA 1WOBA 3TSMA 3S0CA 1FWNA 2NV1A 4FXRA 1UASA 4X9SA 4JEQA 3THQA 5HR7A 1W56A 1AG1O 3OG3A 4FB7A 1XKYA 4PODA 1EWDA 3IIZA 4BF9A 1ICSA 3ABRA 3W1PA 3Q37A 3FYOA 4RK8A 1NF0A 3O06A 3S5ZA 3C0JA 2PURA 1D3HA 4IXXA 2GOUA 1TQJA 4JTJA 3UWWA 4UTUA 1H5YA 3G1HA 1ME9A 4K39A 3LHWA 2RHGA 3N14A 3CWNA 5SWUA 2Y89A 3BK0A 5EYWA 3IGXA 3LRLA 1XC4A 1ZHAA 1PCWA 2QCMA 3BVJA 3CQ0A 4JX4A 3TU9A 1LBFA 2DZTA 3L21A 3NL5A 4K8EA 3DHFA 4MUZA 4PH6A 1K8YA 5D2VA 2W79A 3W84A 1H7NA 1LLZA 3UWVA 1OFPA 1ZAHA 1AK5A 3B4UA 1XXXA 2WPBA 3QZEA 4H4IA 1CI1A 3P80A 4LY8A 1KLZA 4GJ1A 5DBUA 3CPRA 3WJYA 3PB0A 3W7EA 1Q6QA 3G0UA 2A7PA 3NQ7A 1ALDA 2ABAA 4JTHA 3G1VA 1ME8A 1RVGA 1MXSA 5D32A 4O1BA 3IIPA 1LRNA 5HJLA 1MEWA 2E77A 2HTMA 3EX6A 2J6XA 1PE1A 3HBLA 3QF0A 3W7CA 2YCEA 1R2RA 3P60A 4O8RA 2A4AA 1RD5A 3L9CA 3NO5A 3PG9A 4GUIA 3NL3A 4O0KA 4GUFA 4LRTA 4Z1DA 3BG3A 1XL9A 1PCKA 1PHQA 2B7PA 1P4CA 3L67A 4UFLA 3DFQA 1LBLA 2ZRYA 3U2OA 1H7PA 1W5QA 5CPNA 1GZGA 3O6DA 1FY6A 2A21A 3R2GA 1S5TA 1F05A 1TPUA 1L6YA 3W1UA 1G4PA 3W2MA 1TJPA 2JKPA 3OA3A 3CC1A 1FCBA 3LI0A 2WSYA 4NXKA 1H63A 2Q3OA 3IVTA 2VC6A 1OYAA 4O1DA 1SFLA 2HMCA 2NWRA 4LTSA 4Q32A 5K2ZA 1P0KA 4GWEA 1T8XA 3M43A 4RCXA 5I3KA 3PULA 3QJAA 3Q58A 4Z1CA 3B0UX 1F5ZA 1VGAA 3EKZA 3LBMA 3PSVA 1QAPA 2TPSA 3SGZA 3KRZA 2Q3RA 3ATZA 1GTEA 5K7JA 5F4SA 2WNQA 3DFNA 3CB8A 2NZLA 3C52A 3HIJA 1DV7A 2Z6JA 5F2MA 4P2VA 1KTBA 1T96A 1GQNA 3W87A 2V9DA 1DORA 3EWWA 3CTLA 2WQPA 3U8GA 4HNVA 3MYOA 3NVTA 3TJXA 1I2QA 1ZFJA 3TK7A 1EP1A 1JCJA 4N9BA 4JY9A 1YXYA 1L6SA 2VENA 4IXHA 3VE9A 4ZQNA 1TPH1 4DEFA 4UIOA 1J4EA 3L5AA 2Z6IA 1OK4A 1VPXA 1IXQA 3LCGA 4JTEA 2C3ZA 3SJ3A 5U4NA 4JTTA 2A6LA 3P7YA 5BMXA 4ONVA 1B4EA 1VCFA 3IV3A 1FWSA 2ZA3A 1I2RA 1GVFA 4AXKA 4NX0A 1FBAA 1W5OA 1VHNA 1TPB1 2YYTA 3NEVA 1KM1A 3TMQA 4TX9A 4NQ1A 1N7KA 4JTUA 4WJEA 3TE9A 4DQWA 2ZRVA 3KFTA 2RDWA 1KFCA 1F76A 5G5IA 3GLCA 3E02A 4AAJA 2YR1A 2CU0A 2QCDB 4CNOA 3E12A 3NM3A 2FIQA 4A3UA 3PUEA 3C2FA 1V5XA 4QIUA 5E1QA 1YTEA 2H8ZA 3O63A 1D3GA 3G22A 3NQ8A 5EY5A 3GDMA 1EP3A 3LTPA 1BKSA 1TO3A 2YGYA 4EF8A 2XFWA 1XBYA 4N9CA 2VOMA 3T44A 3FIGA 5D02A 3BG5A 3UYCA 3MHFA 4EVZA 4KWVA 4JXCA 1DKWA 2PCQA 2V0TA 3CM4A 1L6WA 2B0MA 1JCNA 3ABSA 3O8AA 1EUAA 2A5HA 3V1PA 1Q6LA 3M44A 2FPYA 3RMJA 4YCPA 3W7NA 1AL8A 1KA9F 2RH9A 5C2XA 3EWZA 4AWSA 2C18A 1LLWA 3STGA 4E0CA 2J9XA 4LS0A 1P5BA 1JVNA 4NJHA 4UMBA 1TYGA 3UWQA 3W9ZA 2GPTA 1XDLA 3P61A 2CLKA 1LORA 3SZ8A 2FB2A 3PUDA 3VE7A 5FEWA 1XBZA 1OF8A 1OX5A 4JY8A 5I3JA 1TTQA 3PC0A 4Q4KA 1W8SA 1W54A 3EKLA 1GG1A 1JCXA 4EF9A 5FF3A 3JR2A 2ZZ7A 3KXQA 3C6CA 3A24A 1KFKA 2ZTJA 4MZ8A 1Y0EA 5K9XA 3VKJA 2ZZ1A 1VZWA 2H3BA 3GVGA 4RJEA 2EKCA 4UTJA 2VFFA 4N9DA 3T4CA 4O1CA 4QNWA 2NX9A 3TA6A 2VFDA 5D09A 1KBJA 1H7RA 3EX3A 2JGQA 4GUHA 4E2BA 4FX7A 2VEMA 2XN2A 5EL1A 1C9DA 2DJLA 3T78A 1VYSX 1JCYA 1HTIA 4K36A 1JCLA 3HPZA 2Q8LA 3W1LA 3HMJG 4UTTA 1DOSA 3F1QA 3UY8A 2FB3A 3IVUA 2NX1A 1F2JA 4UFMA 1SO4A 4ZMGA 2NUYA 2GVLA 3LCLA 2WV8A 2ZTKA 4TMCA 4X22A 1IGSA 4MPQA 3G8RA 3W7OA 2VFHA 1HG3A 3LCWA 2C1HA 3WK0A 1KM5A 2FDSA 1YDVA 2C19A 1VLIA 4O50A 2PRLA 1RR2A 3NR0A 4UC5A 1JR1A 4OBTA 4UTTC 1YTDA 4GNJA 5H2ZA 1X8FA 3C2VA 4FF7A 1FDZA 2QCGA 2YYUA 3F03K 1M5WA 3SI9A 1V7YA 1LDCA 4LVGA 3UZJA 3GDKA 4S2BA 5CZ0A 3W7QA 4XBKA 5CGQA 3W1AA 2OX1A 4HNUA 3FJLA 2CLMA 5HNRA 3PY2A 3ATYA 3HO8A 3NM1A 4KWWA 4JYDA 1LOLA 5G1TA 2RKXA 2R14A 4LVDA 3W1QA 1M7PA 2YSWA 1VRDA 4GUJA 3V75A 1LP6A 1B57A 4O17A 5I3GA 1ML1A 1FDYA 4S1FA 1VCGA 4O10A 2AGKA 1VS1A 2QUVA 4RV8A 3MI2A 2I9EA 2NUWA 3R89A 1QOQA 5DBTA 5HULA 4EIVA 1TV5A 2NXHA 3OEXA 2PRMA 3SGUA 3TSBA 3L0GA 1YLVA 2C0AA 4WX2A 2RDUA 5C54A 2YFNA 2DJXA 1SSDA 3BARA 3NOEA 3W7RA 5AYXA 3TFXA 4O15A 1H7XA 4UTKA 2BZNA 4A22A 1VR6A 1M6JA 1SSGA 2ZRUA 4U28A 3EX1A 3W83A 3G24A 3B8DA 4MZYA 1YXCA 1D9EA 1YADA 3HPXA 2GUUA 1RV8A 4N6FA 2HS6A 4ZQPA 4UTLA 5D33A 3TW7A 1GTHA 3P8IA 1E51A 2ABBA 1JRCA 2GQ8A 3A23A 3ABQA 1AW2A 1DBTA 4TU1A 1I2OA 1DL3A 4UFKA 5GVJA 1KFLA 2VFEA 4GE8A 5LNUA 3M47A 4N9EA 4K37A 4AMAA 3W7GA 4UTWA 5D05A 3BO9A 1I2PA 5DCDA 4R33A 5CSSA 3HGOA 2WJZA 4KFPA 1P0NA 1EPXA 5EA9A 4A2SA 4PL2A 5BRBA 4R7JA 1P1XA 4OQVA 1XI3A 1ZY9A 2FFCA 3LHUA 5A8GA 1DQWA 2Y62A 4IMCA 5AB3A 3VNDA 5AC7A 3TDFA 4AH7A 5K4XA 3O16A 4UTWC 1F6KA 1EUNA 3QMSA 2G5WA 1IIHA 3HG2A 1I2NA 3LXAA 4K38A 1W37A 5LGXA 3GZ3A 1R30A 5K9DA 2ZFAA 1QOPA 1TRDA 1QPOA 4JTGA 2RDTA 1Z42A 2V5BA 3S1XA 4DO4A 3TAOA 3JS3A 5C5YA 3LCXA 1Q45A 2H90A 2CZ5A 4Z1AA 1YDOA 4JDYA 2QUUA 2GVGA 1TMHA 1G4EA 5FF2A 5DCEA 3USBA 1SW3A 3P5ZA 3BLIA 3NQAA 4MLRA 5KSWA 3G8EA 1AMKA 1OX6A 3VCRA 4DO5A 3H53A 3S5OA 3TW6A 5D2TA 4JTLA 5MHBA 1LBMA 2E6DA 2O7SA 3H54A 1JUBA 3KVLA 4RXGA 1UJPA 3BGGA 4D2JA 4M6QA 1LCOA 3FS2A 1X6UA 1JJKA 3PBUA 3MI6A 3GDTA 4TO8A 1DHPA 1LOQA 3UNDA 5K9CA 3E96A 2CLEA 2QCLA 2V2HA 3LCHA 3QW3A 3I7QA 3N19B 4HT3A 3NPWA 2ZYFA 4G1KA 3HGJA 3C61A 3LERA 2FLIA 3LBCA 4JIPA 4LC8A 5KTLA 1BEUA 4WUIA 5HWMA 5EKYA 3C4UA 3LV5A 2Y6ZA 2DZPA 3MMTA 1XUUA 4E38A 4OGZA 2VEIA 4N2YA 1RQBA 2NLIA 2A85A 4FNUA 4Y96A 2J9YA 2GJNA 2X30A 4O53A 4AB4A 4Y6GA 4XKYA 2R91A 3O6YX 3JRKA 4X2RA 2J9ZA 3LXBA 3R5EA 1S5VA 4BI6A 1VQTA 3DBPA 3M16A 3O6CA 4UFJA 3QC3A 1XBVA 2V2CA 4WY0A 2E5CA 4UFHA 4MY8A 3N9SA 2ZDRA 4RLIA 1T0OA 3QYQA 1OK6A 2BWGA 1C29A 4MOZA 3W73A 4DO6A 2OJPA 3LCFA 3CWOX 1A50A 4UR8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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