2FJKA

Crystal structure of fructose-1,6-bisphosphate aldolase in thermus caldophilus
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
MLVTGLEILRKARAEGYGVGAFNTNNMEFTQAILEAAEEMKSPVILALSEGAMKYGGRALTRMVVALAQEARVPVAVHLDHGSSYESVLKALREGFTSVMIDKSHEDFETNVRETKRVVEAAHAVGVTVEAELGRLAGIEEHVAVDEKDALLTNPEEARIFMERTGADYLAVAIGTSHGAYKGKGRPFIDHPRLARIAKLVPAPLVLHGASAVPQELVERFRAAGGEIGEASGIHPEDIKKAISLGIAKINTDTDLRLAFTALVRETLGKNPKEFDPRKYLGPAREAVKEVVKSRMELFGSVGRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Stereoselectivity of fructose-1,6-bisphosphate aldolase in Thermus caldophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Thermus caldophilus
total genus 102
structure length 305
sequence length 305
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2fjkA00
5C55A 3QW3A 5DXXA 4AF0A 1TO3A 3P74A 5CKSA 1TCDA 2B7PA 2HS6A 3U8GA 3UPWA 4MZ8A 2YFOA 4X22A 1S3HA 3W1RA 3QC3A 2AQWA 2Y63A 3C2EA 3DKJA 4NZJA 1IXNA 3W73A 4MJZA 4HKPA 1YDNA 4MKNA 3HF3A 5H2ZA 4ICNA 3N34A 3DI1A 5U7SA 1OX4A 5K2ZA 5D04C 3GNNA 3TH6A 5L6UA 2JBMA 2NZLA 4HNNA 2ATMA 2PRLA 3IVTA 1WOBA 1TTPA 2C3ZA 3EXSA 3H54A 1OJXA 4A29A 3A22A 2GVLA 3P80A 4UMAA 3A24A 4AF0B 2BX7A 5HQEA 3C56A 2FIQA 3HG5A 1HG3A 3O16A 1GJPA 2X30A 2CZFA 3RK8A 2ZA3A 3O05A 1DL3A 2W6RA 7TIMA 1OFDA 4R34A 1IXOA 4DF2A 5CZTA 1OX4B 1SSDA 4OV9A 1H63A 4JNMA 4O57A 4AH7A 3N14A 3PBWA 1V7YA 3STCA 3W07A 2VFIA 3KRUA 4LWWA 1OF8A 1THFD 3EEGA 4OWGA 5FF0A 3M5YA 3GAYA 5F2GA 3C3NA 5EYWA 1PL9A 2ZRZA 5CGQA 4O10A 3L9CA 1I2RA 3W1PA 4NX5A 1IIGA 2ZZ1A 3P81A 2ZDRA 2C18A 2J9ZA 4LRSA 1H60A 5LHFA 3OG3A 4BWLA 2A7RA 3TW6A 2IQTA 4Z0SA 3M6YA 1H5YA 2NXHA 2WOQA 3LI1A 4QNEA 5CZJA 3KVKA 1QO5A 5C2XA 3OHIA 4IQLA 5BMXA 4LVFA 1J2WA 3WK3A 4BI7A 2YR1A 3E96A 4LW7A 1G7UA 2WKJA 1OYBA 1J5TA 3IIXA 3W85A 2WQPA 3A5FA 2Y6ZA 4HNTA 3FA5A 2GQ9A 5FF3A 2QCFA 3HOJA 2PRMA 3FS2A 4Y9AA 4RKAA 1VRDA 2FDSA 3BLIA 3W2UA 3KOFA 1I2NA 1QAPA 5IBXC 3FJLA 1KFKA 4UUIA 4PODA 3JR2A 1KM5A 5CPNA 2I9EA 2B7NA 3W23A 4NVTA 1TSIA 5D37A 3DFPA 1Y0EA 2A4AA 1LBLA 4JIQA 2CLIA 3UYCA 3S9YA 3NQFA 4FNRA 4IMEA 2ISVA 4JXCA 1WXJA 5LGXA 3EXTA 3TFCA 1PE1A 3IIZA 1BKSA 3N3MA 2VOMA 4UTTA 3L5MA 3S1XA 3FYOA 4GRSA 3SY5A 4QNWA 3GDTA 3R8RA 4MUZA 1PVNA 3MP3A 4GNJA 2QAFA 3PY2A 1O95A 1VCFA 3OVQA 3MP5A 3STGA 5HMSA 3TQKA 4JGDA 1Z41A 1YXCA 5DLCA 4O28A 1D3GA 1UUMA 2P1FA 1VGAA 3STFA 3TIMA 1W5MA 3LTPA 2ZZ6A 3LERA 3E49A 4JYEA 4RJEA 3S0CA 4XBSA 1VQTA 1XI3A 3GZ3A 1HTIA 4Q4KA 4MY9A 1YXDA 3EX4A 3MHUA 4A22A 5CPMA 3G22A 5D2TA 3LHTA 3GXTA 3WJXA 1LOSA 2NX3A 5AHLA 4XUGA 1XBXA 3QQ0A 1NVMA 3E0IA 2ABAA 2GQAA 2QUVA 2YX0A 1KM0A 3EX2A 3A21A 1N55A 4NJKA 2A85A 4HPXA 4ML9A 4KFOA 3B8DA 4AWSA 3DFNA 1WOAA 4N9CA 3B05A 4XTIA 5GVJA 2ZRVA 5CZ0A 2V5BA 3PG8A 3W75A 3W7LA 4FEZA 4ZQPA 3CEUA 4O19A 4TO8A 3PUOA 1YPIA 3RMJA 4NUWA 4U4MA 4FNQA 1ICPA 2V81A 3KFTA 1GT8A 3M9YA 2QDHA 4Z1AA 2ZZ2A 4A3UA 1ZALA 3GK0A 1OYAA 2DZSA 4JN6A 3S1WA 4JD4A 3BV4A 5G1TA 1A5SA 4O54A 4UFMA 4JTSA 6TIMA 1RVGA 4LTSA 1EP2A 2EAWA 3V1PA 4OBTA 3CLMA 4X9SA 3UWZA 1WAUA 3Q94A 2Y85A 1JCMP 4AHPA 3S5OA 3HG2A 2PC4A 3PM6A 2JGYA 3LHZA 3G0UA 3PWAA 1O5XA 3CB8A 5KZDA 1W5PA 3W7GA 2ZZ7A 4MIMA 4WY0F 3HQ1A 1K8YA 4AAJA 1PHWA 4FIRA 2Y7DA 5DY2A 3CIXA 3ZFHA 2NXGA 1SO6A 5C54A 3W22A 1OF6A 1AG1O 1ZCOA 2JKPA 4CCCA 1M7PA 5G2IA 3BG9A 2RHGA 2QR6A 1OFOA 1ZY9A 4ALDA 1XXXA 1CW2A 3ABRA 3W7PA 4DF0A 1YYAA 1QO2A 1X1OA 4PEKA 4U28A 3I7RA 3LLDA 2E68A 1RPXA 2WNNA 4Q33A 3EXRA 4NQ1A 4UIOA 2WNQA 1EIXA 3C61A 3PSWA 1YTDA 3EWWA 3GB6A 1RQEA 3HO8A 4IMCA 5F2LA 5E1QA 1FDZA 2NUYA 1K02A 4RXFA 4S2CA 2QF7A 1FWRA 5CZSA 2QEZA 4FNSA 2FPVA 1W5OA 1KM2A 3QEZA 2J9YA 1K7XA 3QMSA 4O12A 3DXIA 2FPYA 3R5EA 3P60A 3HG3A 3NQGA 1EP3A 1LYXA 2V30A 1WV2A 2BWGA 2V8ZA 2VFFA 4Z1DA 4Z1CA 3EX1A 4CNOA 1SUXA 3TKFA 3DKLA 3ELFA 4M6QA 3G1AA 1VYPX 1KM4A 2DZWA 4O4WA 2ISSA 3GDRA 1R2TA 1ICSA 4O1BA 4MY8A 4Z0JA 2Q3OA 5TBOA 1SR9A 4HNVA 2BXVA 3T4CA 1JCYA 1U83A 2DZXA 1TPVA 2QAPA 2ZQ0A 2G5WA 4LC6A 1TPB1 3W87A 3FLUA 3B0PA 4MFEA 4ORMA 3R89A 1H1YA 2VEPA 3U6WA 3P5YA 3PS7A 2WSYA 1UUOA 3GKFA 1JR1A 1ZJIA 1VZWA 2R91A 4N2YA 4WJEA 5A5WA 3I68A 3G1DA 3GIYA 4DXVA 2NUXA 1HFBA 3GX9A 1OVDA 3M43A 4JTIA 4O11A 1LLZA 3NPWA 2QCCA 5FF4A 4UNKA 5KSWA 5LNVA 3OVRA 1K3UA 3CTLA 1FY6A 3N9SA 4YCPA 3QPZA 5A8GA 3R2GA 3R13A 5DBUA 5D2YA 5KMYA 3LRKA 3GDLA 1AK5A 3PG9A 3W7HA 4NJGA 1H7XA 1LDCA 3DFOA 1XUUA 5C5YA 4AEOA 4S1FA 5F2IA 2QUTA 1EWDA 1OHLA 4GFSA 3VKJA 5FI8A 4JDYA 4UR7A 3TMLA 1RQBA 4AXKA 4QISA 3TSMA 1W3IA 1KV5A 2YW4A 3LCLA 1BWKA 2DORA 3UD6A 4Y8FA 3TFXA 3UQNA 5HULA 1SPQA 2F7FA 2G95A 5DY3A 5BRBA 1HL2A 3S5YA 4ZVJA 5AFDA 4GWEA 3CM4A 2ZFAA 3QM3A 2VKZG 2H90A 1H7OA 3DFQA 2YGYA 3F4WA 4O0KA 4QAIA 5AC6A 1JULA 3M1ZA 4NJJA 3Q58A 3K30A 1DV7A 4NJIA 1LLWA 3MYOA 3O06A 1JUEA 3SECA 2CLLA 1GEQA 4AWTA 4E38A 5G4WA 2EGZA 1TREA 3UXDA 3DENA 5TQLA 5BOOA 4UMCA 1QPOA 1RD5A 4NX0A 1W56A 4OHQA 4IMFA 2OT0A 3FKKA 1FXQA 4P2VA 3GXPA 1TRDA 4UTUA 1S5TA 5D05A 5F4XA 4DO4A 3LOTA 4K39A 4YL2A 5F2MA 1G4PA 1NFBA 4K8EA 1IXPA 3G3MA 5BMWA 3D0CA 1NSJA 4HIBA 4UTMA 5I3JA 5LNRA 3B06A 3NR0A 4IXXA 4O1DA 4TU1A 5G5IA 4O53A 1EA0A 1SW7A 3LHWA 1GVQA 1FDYA 3EWYA 4NNBA 2AAMA 4KKXA 2NX9A 2H6RA 2YSWA 5L9FA 1VYRA 2V2DA 3EKZA 1NAL1 3LCIA 3NZ1A 1KTCA 1K8ZA 3ABQA 4FIQA 3LCGA 1GTEA 3ATZA 1YDOA 2C1HA 1GVSA 4IWWA 3UWYA 3MI3A 4HT3A 1JRBA 4MZ1A 4WZHA 1EWEA 3HPZA 2Y7GA 3QMRA 2QCEA 1TV8A 3LB0A 5CPOA 3HG4A 3VCRA 3A5VA 1B9BA 3BO9A 3L68A 1LZOA 1AL7A 5AN7A 4A2RA 4Y96A 3NPUA 4ZQNA 2V82A 4UFHA 4K8HA 1O4UA 3BGGA 4KFPA 4UMBA 4HSNA 3W2KA 2B4GA 4NT0A 4X2RA 1GTHA 2KZHA 4O0ZA 2WJZA 1FCBA 1B57A 3M5VA 2ZTKA 4MYXA 3ABSA 4B5NA 4POCA 1LP6A 3DI0A 3STEA 1C8VA 2RDTA 1B3OA 1TJPA 3GYEA 4N6FA 1G67A 3UY8A 5D02A 1YLVA 1EEPA 4EIVA 3LCWA 3NA8A 5HINA 3M0ZA 1OK4A 5DXYA 2JKAA 3G1XA 4O13A 1JVNA 1SZNA 4Y90A 1IXQA 3RFAA 3W7QA 4N9BA 5LGZA 1W3NA 1EP1A 5EBUA 5G4EA 1JJKA 3LXCA 1OFQA 1TPEA 4YLWA 4K36A 4WXYA 3N2XA 4N4PA 4UTHA 1SZEA 1H61A 1OFPA 1IGSA 4JYFA 1VH7A 3LCFA 4IJBA 1TPUA 4LVBA 1SFLA 4RK8A 4R7JA 1F7BA 1H50A 1LTDA 5F4WA 1N7KA 3W7EA 3NOEA 4NXKA 1GPWA 2X1TA 5U4NA 3O07A 5I3KA 4UTWC 4TIMA 4QIUA 4ZQRA 1ZAIA 5K9XA 3CT7A 1JCNA 4NJHA 4PC8A 3ZWTA 2EPHA 4NU7A 1AMKA 4AB4A 5IBXA 1GQNA 1F74A 3CEPA 2X1RA 2CZ5A 4LS1A 4JTTA 3RF9A 3KRZA 3GR7A 3LHYA 3CC1A 2F84A 2WSRA 4JTUA 1Q45A 2O7QA 1VCGA 3UWVA 3WK0A 2RDUA 4O18A 3NVTA 1JRCA 3IGXA 3MHFA 1TQJA 2VEMA 3TA6A 3O8AA 1X8FA 3DHFA 2Y61A 2J88A 5E93A 1AW2A 2GUUA 2C16A 3QF0A 1ZNNA 3W86A 1F6PA 1FCVA 3DGRA 4Y6GA 2A5HA 4UTIA 1FUYA 1Q6LA 1BEUA 3NO5A 3G8RA 1XFBA 2EF9A 4DBEA 1QOQA 1DOSA 3QMTA 5EPDA 2A7NA 3U2OA 4O14A 4NZFA 5EL1A 2V5LA 4BFAA 3W70A 5CSSA 5FEXA 3EWBX 2G96A 2CU0A 4JICA 4BK9A 4MJMA 1ME9A 1XKYA 2ZCGA 3M5XA 3NEVA 3L0NA 2X1SA 4UC5A 2ALDA 1KBJA 3NYZA 1D3HA 2Z1BA 3DHDA 2J27A 1FCQA 4HNUA 3SSJA 2QCGA 1KFBA 3TAOA 3OIXA 1MSSA 1F73A 3CWOX 1LM1A 2BZNA 1U5JA 3VE9A 3HMJG 1QWGA 3VI2A 3E9AA 4CNNA 1H7WA 1E51A 3NQ2A 3LHVA 2E5DA 1KV8A 5AHIA 3B03A 2E1DA 3W1LA 4IMDA 4XTDA 1YPFA 1A5AA 4AHOA 1S5WA 2FQIA 2CLKA 3QSTA 4P61A 4PA8A 3S8HA 2Y70A 2B7QA 2I1OA 3O1NA 2CLHA 3C4UA 3HPSA 3PR2A 1ALDA 4A21A 5LSMA 3BW4A 2Q3RA 1FWNA 5I3FA 1FCUA 3DBPA 3IGSA 1XM3A 2VFDA 3IIVA 3JRKA 5FF7A 3KVJA 2NWRA 1MO0A 1TJRA 3QSRA 1SO3A 1M6JA 1SO5A 3HIJA 4LNYA 2VC6A 3T44A 3C2RA 3P5ZA 5AC7A 1KTBA 2X1UA 3IGUA 5FEZA 1IIHA 3EX6A 5D03A 1R2SA 3NNTA 3KX6A 2YZRA 3C2VA 4UTTC 3W1XA 1ZAJA 1VLIA 4RZ5A 3DU0A 5F1VA 3UZJA 4JTFA 2ZZ3A 4QSHA 3IIOA 1KTNA 3PB0A 3E12A 3TX9A 1F76A 4DPQA 4GC4A 1LORA 5K9CA 4N9DA 4DBDA 1MEHA 1XUZA 4R33A 5E0KA 1TTQA 5HJLA 3ZR4A 5HWJA 4C1KA 4FNPA 1L6SA 4JEQA 3G3DA 3LI0A 4LY8A 4ZQMA 2YCEA 4E2DA 2E6FA 2E09A 2TRSA 3LCXA 1F6KA 1R2RA 2YPIA 2YDAA 1ZAHA 1GYLA 1WA3A 1OFBA 3UNDA 3L5AA 5CG7A 3RLVA 2XN1A 2ZA2A 5LZLA 1HUVA 2E77A 3NQCA 1G4SA 1H7RA 1W5NA 3NG3A 1SU5A 2A0NA 3G18A 2WNZA 1ME8A 1W37A 5LNSA 3S1VA 3OEXA 1M5WA 4GE8A 3W6YA 5FESA 2NX1A 2HMCA 3NQMA 4UFJA 2E6DA 4JX6A 4I9AA 1SO4A 3P67A 3W7CA 1WDWA 3QH2A 4EVZA 4LC8A 1KA9F 4LVAA 4JTJA 4BI5A 1Q6RA 1LRQA 4WUIA 3NQVA 4ZZ9A 4QJ1A 3FOKA 4GXMA 5EY5A 1FWSA 2R14A 1FXPA 1VLWA 1QPNA 2CFFA 4XQ6A 1QDSA 2OX1A 2V2CA 5TIMA 3TUUA 1SW0A 2ZRUA 1TTJA 4JY8A 1V5XA 1LOQA 1H62A 1ML1A 1S5VA 1KFCA 1DJQA 1KBIA 3QYQA 2ZRWA 2VFEA 2GQ8A 1OFEA 5AYXA 4NNCA 3BPWA 1TPH1 3M44A 3SW6A 4I7UA 2WV8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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