2FPTA

Dual binding mode of a novel series of dhodh inhibitors
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
367
structure length
364
Chain Sequence
MATGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Dual binding mode of a novel series of DHODH inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase, mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 137
structure length 364
sequence length 367
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2006-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2fptA00
4EWND 1TRDA 4FNTA 3LM7A 1DL3A 4IPIA 5HR6A 1MXSA 2XN2A 4O16A 6TIMA 1G7UA 3ABSA 1IXPA 1I2RA 1AW5A 3EXSA 1HTIA 2YYUA 2NX9A 1WV2A 1IXOA 2ZA3A 3G1YA 4S1FA 3DU0A 3KVLA 3V1PA 2PC4A 1AG1O 4I7VA 4OV9A 4M6QA 1VRDA 3P67A 5DELA 1C8VA 4LOCA 3M5XA 1I2NA 2X1UA 1F5ZA 4IX2A 4Y96A 4WQ6A 1A53A 1XC4A 3PSWA 1A5BA 1JQXA 3M1ZA 4YLWA 2B0MA 1DJQA 3W1XA 4NX5A 4PFMA 4QM1A 3DFTA 1I2OA 2GUUA 3W88A 3TK7A 1EEPA 1P0KA 1W31A 1U5JA 2Z1BA 1ZY9A 1H7XA 2H3DA 3W74A 1Z44A 4JXCA 4TO8A 2Y70A 2CLEA 3G3DA 1TTJA 2ZRVA 5CPLA 3M5YA 2FB2A 1EB3A 1Q3NA 2C13A 2CLFA 1FWSA 3LERA 3TCEA 5AYZA 1K7EA 3KOFA 3W7IA 4Y6GA 1LROA 1HUVA 1R2SA 4AWSA 1RD5A 2HTMA 1OVDA 1LZOA 2CWNA 3UZJA 3KFTA 2HS6A 1KA9F 5A8GA 1QOPA 3G1XA 3VI2A 3I68A 4O0KA 3VFLA 1L9WA 4Z1AA 4XUGA 4WY0B 5U7SA 3VE7A 1OG0A 3QPYA 2A0NA 1SO6A 4S2BA 2Z6IA 3IVSA 2OJPA 3KX6A 3G1VA 1TQJA 5K9DA 3C8FA 3G1SA 4IQLA 5KINA 2J88A 1GVFA 3MI6A 4FF7A 3S1UA 3UWQA 5BW6A 3L2IA 3OVQA 1XBZA 3UY8A 2Y63A 3TC7A 2O7SA 2VFHA 2FFCA 1AL8A 3GDLA 1CX9A 4N9BA 4H6KA 3C4UA 4JX4A 1L6SA 3LCXA 1W1ZA 3NQDA 3B0VC 2ISVA 2YW3A 2V5BA 1KV5A 2VFIA 3PF3A 3GXTA 4QSHA 4HSOA 2NWRA 2NXIA 2B7OA 3CIXA 3ATZA 4MVAA 3UPBA 2C1HA 2Z0IA 1EUNA 3M41A 4K8HA 1PS9A 1ZNNA 2YFNA 2X2GA 1VQTA 3BO9A 3GXNA 2VENA 4M6VA 3NOEA 2O7QA 1F74A 3W9ZA 3AO0A 4NJKA 3FS2A 3L5LA 4MUZA 5G4EA 1I8JA 1QAPA 2J9ZA 4IGHA 3RK8A 4RCXA 3E0IA 4J9JA 3W23A 2QUTA 2Y62A 5AFDA 1O5XA 2NXGA 1TPFA 1SSGA 1ICQA 1TREA 5EA9A 2FPTA 5AHMA 3VKJA 3F1QA 2EHHA 2V5LA 2VC6A 4FXSA 3NQFA 1M7PA 4TMCA 5LNSA 1ML1A 3C52A 3P80A 3M16A 2QJHA 1LM1A 1OK6A 5HWNA 1EP3A 5D2VA 3FJLA 3HPSA 4K36A 4PCFA 1G67A 2CLKA 3EWBX 3LCWA 2YGYA 5DXYA 4ORIA 1PCKA 1W5PA 1FDZA 2PCQA 4O50A 2QCFA 1GWJA 3EX4A 1B3OA 1H7NA 3G1HA 5HR7A 3EX1A 1MEIA 5MHBA 4LW7A 4MJMA 1IGSA 1G69A 2Q3RA 1QPOA 5HWJA 1KBIA 4JD4A 1GYNA 4NJIA 4HHPA 3LXCA 2EKCA 3LHWA 3O05A 4BR1A 2DU2A 3KHJA 3NNTA 4CQAA 3GAKA 3FYPA 1WBHA 1H7OA 2B7PA 4CNOA 3TU9A 3LHYA 4DPPA 4NJGA 3NL3A 3CC1A 5FEZA 3VNDA 4O4VA 3W1TA 2Y7GA 4O52A 2E6YA 1NFBA 1LCOA 5HMSA 1W54A 3UXDA 4UCGA 2V2DA 3N34A 1IIHA 1KW1A 1VYSX 2A7RA 1T96A 2FB3A 3JS3A 5C2XA 5C55A 2ATSA 3FIGA 4PL1A 5BOOA 3W73A 3C3NA 2A7PA 2PE4A 3L66A 3GIYA 4Q4KA 5K3VA 3N73A 3UWUA 3QC3A 4FHAA 4M7SA 4RZ4A 1H1ZA 1WBJA 2TRSA 5K4ZA 3NL5A 3ZS4A 3EWUA 4RXFA 1OX6A 2QUUA 2R8WA 4ZQRA 3KVKA 5G2IA 5EMUA 1LOSA 3WK2A 4CCEA 1SFJA 4EVZA 3K30A 1QDSA 3G0UA 4XWUA 3MP4A 5D38A 4FX8A 3LOTA 5HJLA 1TYGA 3GNDA 3T40A 3TDFA 3PM6A 3VCRA 2PRLA 5D2XA 2QUVA 4AWTA 1Q6RA 1Q6QA 5FF4A 2FLIA 4LV9A 5FEWA 1FXQA 2VEKA 5LSMA 1G4EA 3CLMA 2F84A 1TQXA 4WJEA 5AC8A 3OHIA 3CHVA 4HNNA 4UTTC 1NF0A 2H3BA 3NQAA 3I7QA 4LRSA 3LCGA 1XFBA 3S42A 2CLIA 1SO5A 5J5RA 4I7UA 1TPB1 4AHOA 2E6DA 2EGZA 1KFBA 3LXAA 1WAUA 4AEOA 1VYPX 3IGUA 1ALDA 3NYZA 1H51A 5LNUA 3OA3A 2Y89A 2W79A 5AB3A 2Q8ZA 4WD0A 4N02A 4H3DA 1LOQA 3U6WA 3W85A 1QCWA 1FDYA 1ME7A 1YPIA 3PR2A 3GAYA 1BWKA 3LLDA 5CKSA 4JYFA 2W6RA 3H54A 4LUIA 1TV8A 4UTTA 1JCXA 5G2HA 4AMAA 1RZMA 3LRMA 5E1QA 4A22A 1W56A 5F2GA 1H50A 3G18A 1QO2A 3M5VA 3P5YA 1PIIA 3NQCA 3EEGA 3L21A 5LHEA 5F4SA 1KFCA 5FF2A 3SECA 3LBMA 1GEQA 3W7NA 5TQLA 5LGZA 3S0CA 2Z2UA 3L5MA 1M5WA 3U8GA 3RU6A 4N9EA 5LGXA 3GKAA 4GUIA 2D73A 1L6YA 5T26A 3W7CA 4Z0SA 5C54A 5H91A 1O60A 4HPJA 3GNNA 4S2CA 4JDBA 4GC4A 2GJLA 3NQGA 1X6UA 3CM4A 1ZAIA 4P2VA 4UTHA 1QMLA 1I2PA 5D03A 4UUIA 1ME8A 4DPQA 3ABQA 1RQHA 1EWDA 2X1RA 1XDLA 3T4CA 2QEZA 5D37A 3OG3A 3HF3A 3QMTA 4QITA 5LHFA 4A3UA 2H8ZA 1VC4A 3SSJA 1TJPA 4QQ3A 3DFNA 3P61A 1ONRA 4JIPA 4I9AA 4MKNA 1P0NA 2QAPA 1SZGA 1SW3A 3F4WA 1P5BA 5HUOA 3DI1A 2QCDB 2RDUA 2X1SA 1LBFA 3BG3A 2ZRXA 3NM3A 1FWTA 4LVBA 3C61A 3EKZA 1F7BA 3NPXA 5F2MA 4KWWA 3BLEA 2VELA 4OHQA 1YTKA 3FOKA 3QM3A 2OZ0A 3W7EA 3LCLA 5I3JA 3CWOX 4R33A 1FX6A 2I9EA 5CPOA 4RXGA 4UTJA 4MYAA 1SO4A 1KFLA 4JTTA 5D02A 5LNVA 3W2LA 3BW2A 4N6EA 4GJ1A 1BEUA 3MBDA 3W75A 3NA8A 4IUOA 3MP5A 3SZ8A 3LXBA 1OHLA 2QCCA 3ATYA 3TUUA 4ZZ9A 3PWAA 1GVRA 5DCBA 4PL2A 4U4MA 3W7HA 1UB3A 4X22A 2NXHA 5EL1A 3W1PA 3N19B 3NAVA 4UFIA 1KLZA 3O07A 4CNNA 5AHEA 4DXVA 4XTDA 1THFD 5CZ0A 2EF9A 4RZ6A 1XXXA 3OVRA 1K7FA 3W1MA 2VOMA 3A5FA 1MZHA 4AB4A 1R46A 1SR9A 3U2OA 3TIMA 5J5DA 4KKXA 5K2ZA 1EA0A 4M7TA 1EIXA 1FDJA 2H6RA 4UNKA 4PEKA 1N55A 1JULA 2RHGA 4MOZA 3ABOA 1TTPA 2XN1A 1LRTA 3G22A 1KM3A 3WJWA 3G8EA 1JUKA 4TIMA 4HKPA 1SPQA 2JKPA 3NG3A 4DF1A 3P5ZA 3ABRA 1T99A 2H90A 1Z48A 1PL9A 1H1YA 1FXPA 4HIBA 1BTMA 3F03K 3QQ1A 3MBFA 2A6NA 1OABA 2QAFA 3TKFA 4MLJA 1OJXA 2ZRUA 4ZMGA 3ZFHA 3SW6A 3FJ6A 4IX0A 4RK8A 3W1AA 1JUEA 2WSQA 3QW3A 1NSJA 1TV5A 4JTGA 3OIXA 3BPWA 4BI6A 4QIUA 1HL2A 4EOUA 1QFEA 4UFHA 3LHUA 4AWUA 3M44A 3P84A 4WUIA 1GVSA 3HG3A 4DF0A 1RQEA 2A21A 3QSRA 3GVGA 2HS8A 2NWSA 3YPIA 2CLHA 1WDWA 4O18A 3UY7A 1ZENA 4OU1A 2NV2A 3TA6A 1DORA 3DKLA 3QMRA 1UUOA 3NQ8A 1VYRA 4ZL1A 2CZFA 2ZZ6A 1F73A 1EPXA 3SY5A 4AAJA 5AC6A 2GVLA 1B4KA 1CW2A 2VKZG 3RFAA 2AAMA 5AC7A 4E2BA 2WSRA 1JRBA 4UTKA 1TPUA 2TYSA 2E77A 3GK0A 3W86A 3QSTA 2UV8G 1H63A 5DBTA 3PAJA 5H2ZA 5K9XA 4FNUA 1YTDA 3NQ6A 3W7JA 4UTWC 4O1BA 5FEXA 1VJIA 2WNNA 5KZEA 4JNMA 3H55A 3UNDA 3N9RA 1H5YA 1DV7A 1EUAA 3M43A 3HPZA 4UNLA 2A5HA 3W87A 4LC8A 4WY0F 4O8RA 3GYEA 2E5DA 1FQ0A 1DKWA 1VHCA 4NZJA 5CG7A 3BV4A 1M7OA 2BZNA 2A1YA 3JR2A 3ZWSA 3GKFA 3PSVA 3PUOA 3TH6A 1EP1A 2BX7A 4HNUA 4Q32A 3SIZA 4AVFA 4KFOA 5I3GA 3LI0A 3BGGA 4LVGA 2ZZ1A 4ORMA 1XBVA 2CFFA 1H61A 1N7KA 4HNTA 3RLVA 1SW0A 3MYPA 3E96A 4LY8A 1QR7A 2GQ9A 2A6LA 3W3OA 4ZQCA 4LWWA 2J27A 2QJIA 3O16A 2V82A 2ZA2A 1AK5A 1OX4A 3B0PA 5DY2A 1JCNA 1HG3A 1PE1A 4DEFA 3UYCA 1A5SA 4JGDA 4OT7A 5CPMA 2Y85A 3O6DA 2J6XA 1JUBA 2YYTA 4X2RA 1YLVA 3O06A 1VS1A 4X3ZA 3M9YA 2P0OA 3UD6A 5CZSA 3I6RA 5DXXA 2Q3OA 1QOQA 4LS2A 1V5XA 4CQ9A 5E0KA 3PBUA 4O53A 1KM6A 1DOSA 3EB2A 1IXNA 1CI1A 2J9XA 1Z41A 3GXPA 4QISA 3PUDA 3GZ3A 5KTLA 1QPQA 1GVQA 2WOQA 2AQWA 1D3HA 4JDYA 4LV4A 3TSBA 2EAWA 2JGQA 1FCUA 4XTIA 3LCHA 2QCMA 2ZRZA 4JTFA 1DQWA 2Y7EA 2ISWA 3QJAA 2DORA 2A2IA 3PB0A 3N2XA 4E0CA 1OYBA 3W2KA 3QEZA 5G1TA 4O1CA 1VZWA 4O10A 1KTNA 4G1KA 2V30A 4A2SA 2Y7FA 3HO8A 3TX9A 4D2JA 5D32A 1C29A 3NO5A 3Q2DA 5I3FA 3CT7A 5HQEA 4C1LA 1GT8A 5TIMA 1JRCA 4UTUA 1WYIA 1SU5A 2WO5A 3KRSA 5D2TA 3GDTA 2ZZ7A 3NVTA 2Y6ZA 3B05A 3IIVA 3Q94A 4R53A 3F4NA 5FESA 3CPRA 3P82A 3TW7A 2FDSA 4KFPA 2WQPA 4DBEA 3P7YA 4JICA 3V75A 2DZVA 1ZAJA 1W3TA 3HJZA 4O19A 4OWGA 3NEVA 1H7RA 3G1AA 5D33A 3W7PA 4LT9A 3QF0A 1KV8A 3A22A 4WY0A 4Y8FA 3WFAA 4NQ1A 4ADUA 1AW1A 4N9CA 2DZUA 3WJYA 3S5OA 4NZFA 3M6YA 4GUGA 4TU1A 3W70A 3NM1A 1LRQA 3DI0A 2Q8LA 2GQAA 3I7SA 3QW4B 2J24A 3E49A 3C2VA 1YYAA 3L67A 1Z42A 3W1NA 1O95A 5SWUA 3T44A 3W22A 4NVTA 4AHQA 1OFEA 1XUZA 3MP3A 1DQXA 5KZDA 2AGKA 3W1UA 1PVNA 1SQ7A 1PHQA 5CSSA 2BWGA 1FY6A 4RX0A 2YX0A 4L4MA 3B4UA 5EBUA 1F2JA 3A24A 4O11A 3WK3A 4UMCA 4KFNA 4OGZA 3WK1A 2KZHA 3HPXA 2QJGA 4BI5A 3LRKA 3W7GA 3OBKA 5IBXC 4RZ5A 4LNYA 5LKYA 2FPYA 2Y7DA 1DBTA 3PB2A 3E12A 1ADOA 3EKLA 3AJXA 3NL6A 5A5WA 2G5WA 3FYOA 1VLWA 4NT0A 2B7QA 2ZDRA 3IIOA 4IMEA 3W1LA 2WNQA 4N9DA 4K7VA 1YXDA 1YXYA 4JS3A 5TBOA 4K8EA 5G4WA 4GUHA 4CCCA 1W3IA 3INPA 1GZGA 3KRZA 5AHLA 3ZR4A 4WXYA 2QCLA 4FB7A 1D3GA 3R8RA 3UQNA 1P4CA 2RH9A 4UFJA 5C5YA 1KTBA 3W7LA 4HPXA 1I2QA 5IBXA 3PG8A 3SJ3A 4TX9A 5D04C 5HULA 2C6QA 2A85A 1LLZA 5AYXA 1LRNA 3HIJA 3P8JA 4N4QA 3THAA 3PG9A 1VCVA 3L9CA 4FNPA 1XBYA 4MJZA 4BK9A 4Y90A 1OK4A 3W83A 3I65A 3QRHA 4K37A 2NX3A 4PODA 3SGZA 1UASA 3DFPA 4WXZA 3MO7A 1YADA 3A23A 3C2RA 1RPXA 3G24A 3W2UA 4MLRA 4UTMA 3LCFA 1L6WA 3O15A 4UFKA 1KM5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4EWN D;  3REQ B;  4W87 A;  1TRD A;  4FNT A;  2QZR A;  4O16 A;  4AVN A;  1OIN A;  3N04 A;  4AZ6 A;  5M2F X;  1EOM A;  1AW5 A;  2YYU A;  2NX9 A;  4HK6 A;  4JFT A;  4DM2 A;  3LSC A;  1VIW A;  4KEV A;  4S1F A;  2PDW A;  2PC4 A;  3SCW A;  3H2O A;  4M6Q A;  4HPH A;  4LYR A;  3P67 A;  1ZSX A;  1C8V A;  2QPS A;  1K9T A;  1E6Z A;  1AH4 A;  4ZEN A;  1F5Z A;  4Y96 A;  2ALR A;  4HPN A;  4IT1 A;  1A5B A;  5A8P A;  1DJQ A;  3W1X A;  4NX5 A;  4TTG A;  4PFM A;  3FVD A;  1V6V A;  2EO7 A;  1XRF A;  4D1I A;  4ZE5 A;  1I2O A;  3GWQ A;  3UVA A;  1IR2 A;  1TCM A;  1H7X A;  3WX7 A;  1VEN A;  3VM7 A;  3G2G A;  3DC8 A;  1S5N A;  1WUF A;  3RCY A;  3UT0 A;  4TO8 A;  2ACR A;  3G3D A;  2VWT A;  1G5A A;  1TTJ A;  3M5Y A;  2C13 A;  5HPO A;  4P8V A;  3AHT A;  3FK4 A;  4MDO A;  4QGC A;  3K5X A;  1R2S A;  4CCZ A;  2NQH A;  1LZO A;  4LAN A;  5T8G A;  1MUC A;  1QOP A;  3I68 A;  4O0K A;  3VFL A;  3QHO A;  5U7S A;  3A47 A;  4S2B A;  3IVS A;  2E3Z A;  3KX6 A;  3L4X A;  3DGB A;  1J93 A;  3G1V A;  1V3M A;  4LYQ A;  3U7B A;  4Z2L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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