2G3IA

Structure of s.olivaceoviridis xylanase q88a/r275a mutant
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSAQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWASGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-based engineering of glucose specificity in a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
doi rcsb
molecule keywords Xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 124
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2006-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2g3iA00
3UG3A 1C8YA 2ZUTA 1UOKA 1NH6A 2VOTA 5A69A 1TA3B 3CO4A 4L4OA 2V3EA 1QBBA 1E4MM 5I23A 4WF7A 5AC4A 3B9AA 2VZOA 5M5DA 3L4TA 1VENA 2GFTA 2VL4A 2YDSA 1UD3A 3VIMA 3W26A 2OYKA 3CIVA 2NT1A 3EYPA 3L4YA 4DWSD 1C92A 5M17A 1VBRA 5BRPA 3RO8A 3A4XA 1G9HA 2VMFA 4AYSA 1GONA 1E56A 1C93A 1KCLA 2A3AA 3ARRA 3GH5A 4W87A 4IM4A 2VZVA 4HOWA 1MFUA 3WEMA 3WMCA 2WVTA 1UQZA 2NSXA 1UA7A 5HOSA 3N11A 4OOZA 3A47A 1MW3A 2WVVA 1V6XA 3ZJKA 1W3HA 3WNLA 1XSIA 5ABFA 3M46A 4KRTA 2PWGA 3BCFA 2JEQA 4UQAA 5JBDA 3LPFA 1GORA 1UD6A 3VGFA 2BHYA 4V27A 1QI5A 4P7NA 4EE9A 2VRJA 1AQ0A 4M8UA 4D6EA 4ACZB 5AYIA 4CKQA 5EB8A 1ZBVA 1DWFM 2MANA 4OZOA 5IDIA 4TXEA 1D2KA 1Y7VA 1MQPA 4Q22A 1PZ2A 3AYRA 1JDCA 3CHEA 1E6QM 1GVYA 3GTNA 3CLWA 1UR1A 2E9MA 5HNNA 3A6OA 1B3WA 3L4VA 4IPLA 3VD9A 1CEOA 4H8UA 3BGAA 2YBTA 1UR0A 1E1FA 5A6BA 2CBVA 5E09A 3WQ8A 4GKLA 1JZ6A 1H2JA 1W9BM 3MUIA 3UEQA 3N18A 4UFHA 1E73M 4WSKA 1HJQA 1ZB5A 3RPMA 1P6WA 2ZUVA 1OCQA 3WD3A 2J7BA 2VX7A 5HPCA 1V3IA 3VD7A 1GHSA 1J0ZA 3AZSA 2BNJA 4AD2A 3W29A 2ZIDA 1JZ3A 2YA1A 3NIYA 3SCUA 2WMIB 2YIHA 4OIFA 3RDKA 1MQQA 4HZ7A 3AISA 3NDYA 1L0PA 2CCRA 2GJPA 1BVNP 2BXZA 2J47A 1KCKA 1WDSA 2X0YA 5I0DA 3WNOA 4X9YA 5EBAA 2XWEA 4PSPA 2GJRA 1J0KA 1JFHA 3BXWA 1V6VA 1WZAA 4LYPA 2YDRA 2O9TA 1GQLA 1QI3A 5DO8A 3PN8A 2WCAA 1B90A 2V3DA 4AIEA 5LA2A 3SUUA 4D71A 4CU8A 1GJWA 3CZJA 4P8XA 1XCWA 3IAPA 1ZBCA 4AZBA 4TVCA 2WBGA 1NWSA 3BLKA 2J4GA 4CCDA 5HBFA 2XGBA 2DSZA 2XVNA 1PBGA 4NI3A 5CPTA 2UY5A 4MNKA 1OB0A 2E8YA 2WCSA 3NSXA 1VFFA 4YHEA 1QNPA 2WVVB 3RJYA 3HJEA 1ECEA 5CGTA 1FFQA 3VX0A 5ABFB 3BLPX 2EPNA 4U2YA 2DGAA 1ZBKA 3FHAA 5I24A 2FHFA 3GDBA 4BS0A 2WXDM 1Q6FA 4PMVA 5ABGA 1WPCA 5M3WA 4PCSA 3AHZA 1TZ7A 1EQCA 2VCCA 3UG5A 3NJ3A 5GNZA 1GNXA 4CU6A 3PZUA 2D0HA 3D3AA 3M7SA 4IPNB 3OB8A 1CYGA 4BQ4A 2F2HA 2CPUA 4AZ6A 4BCEA 3CUHA 1XSKA 1CIUA 3WBAA 1G94A 3K46A 1WZMA 2ZXQA 2J75A 1ODUA 1WDRA 5CLTA 1PAMA 3GBDA 3SCNA 1GW1A 5BROA 4MAZA 1H4PA 3VMNA 5IFPA 3HU7A 4F9JA 2YA0A 3ZQ9A 4NZCA 1XH0A 2Q8XA 1WZLA 2CESA 1BGGA 4EAMA 1CENA 2XIIA 2G3MA 1UKSA 2J74A 3AJ7A 3MMUA 5HPOA 1J10A 1K9FA 4K68A 2BHZA 3T09A 1HNYA 1A47A 3F4VA 4HPHA 5A8OA 1QW8A 3T08A 1FP8A 4KRUA 2JF6A 1E1EA 1NARA 3W6LA 2WKGA 1QI2A 1JYXA 3GXMA 5JIWA 5ECUA 1V6YA 3PBGA 1EXPA 3VMOA 3QHOA 3SCVA 4MNMA 4H04A 4GZJA 3N1AA 1HF6A 1B1YA 2DH3A 3ZOAA 1MWOA 1HVQA 2GK1A 1SFSA 3II1A 2WHKA 2AAAA 2ZXDA 1VIWA 1JXJA 2F61A 5AC5A 4D1JA 1EOKA 3PZTA 3BAKA 3AIVA 4U5KA 1NP0A 2G8ZA 2J25A 5CJ5A 4F66A 3AMCA 2W67A 3RIKA 1C8XA 1UKPA 4FF5A 4D6GA 2WHLA 4U3CA 2WLYA 2JALA 1R7AA 2DH2A 4J3VA 1JDAA 2W91A 3A4AA 3BCDA 3L4XA 2VT0A 1R7OA 3PTKA 1LWHA 1SMDA 1O7AA 2JIWA 1ZU8A 4IISA 1XD1A 2Z1KA 2BVDA 3DYOA 1C8QA 3IJ9A 3VUPA 3M6DA 3UCQA 1LG1A 1X6NA 1BSIA 2VVSA 3TTSA 2D3NA 3N12A 4HZ6A 3ZSTA 4F9DA 4ZE5A 1HIZA 4W84A 2ZUUA 1V3HA 2WMKA 3VIGA 1WDQA 1CNVA 1UA3A 3THCA 1E6XM 1QNQA 3EMQA 4CN4A 3PZQA 1QOXA 2W61A 4FMVA 3WUBA 3WD1A 4AZCA 1IZKA 1UWIA 1V02A 4AZGA 3KEHA 4IUGA 3CGTA 5BCAA 1K6AA 3A4WA 5A95A 3AROA 1TG7A 3AFBA 3IJ7A 3WIJA 2QV4A 1J18A 4YHGA 3AHVA 1HP4A 1NOWA 3AXXA 2J7GA 3U7VA 4GQRA 1FH7A 4KGJA 5C71A 3WDHA 4GPNA 2Y2WA 3SCQA 1U33A 4FLOA 4L4PA 1I1XA 2CITA 4J3TA 2VVNA 3WDIA 3VX1A 5A6AA 3VNYA 1E5JA 2EXOA 1E4LA 4J3UA 5A2CA 3FXYA 4EANA 3IAQA 2XUCA 5I2UA 2DT0A 3QR3A 3VMPA 3J7HA 1FOBA 1I1WA 2RGMA 2PWDA 1BHGA 1MYRA 1JZ7A 2W92A 4S3KA 2DIEA 1WKYA 2PBOA 4HA4A 5GQBA 3WH8A 1QHZA 1F4AA 2V3GA 2GK1B 1HJSA 5TD4A 1UKOA 4JKKA 3KE0A 2D23A 4GI6A 4F8XA 1HX0A 3WBEA 8A3HA 2JF7A 3AIEA 3DC0A 4UQDA 1TA3A 1OGSA 3K4DA 5I5RA 1W2VA 3AIRA 3T2OA 4B16A 1NWTA 1E6ZA 3AIUA 3CUIA 3WDPP 1V6UA 2CETA 3PZGA 3VD3A 3EBVA 5BRQA 3ZR6A 3VGHA 7CGTA 1R86A 2ESCA 3NDZA 4BF7A 4J3XA 4W86A 2X8RA 3UR8A 1NM9A 1JD7A 2YL9A 3PTQA 1UH4A 2BVYA 4PSRA 4TTUA 4D6CA 1FP9A 2GUYA 2NT0A 2XVPA 2ZX5A 3KZSA 4J28A 5D9PA 1Q6EA 1W1VA 3WDJA 4J3SA 4UQ9A 4A3HA 4MJ2A 2WHMA 1E4NA 1SMAA 1Q4NX 3T2QA 2VR4A 3CZKA 1G0CA 3SUSA 1JNDA 2O92A 5DF0A 2GDUA 1BVZA 4GI8A 4KH2A 3AMKA 1B3ZA 2WSPA 4JFTA 2DT1A 3W25A 1JZ5A 2ZWZA 3CUJA 4V28A 4UZSA 1W9UA 3QGVA 1UD5A 3VIFA 2CIPA 2WLZA 2E0PA 1WAWA 1L8NA 3QOMA 4PTVA 1FH8A 2EBNA 2DT3A 1V02E 1VAHA 1UWSA 3LPGA 1QI0A 2VX6A 2JEPA 4JHOA 1E3ZA 3ZO9A 4GIAA 2QMJA 3GXIA 1C91A 1KR1A 4KMQA 1H1NA 3PHAA 1MW0A 3O9NA 2BY3A 1CXIA 1CGWA 1W32A 3UG4A 2CNCA 2EPLX 4PMQA 1JZ8A 2XIBA 1K9EA 2VI0A 2WMIA 1C3FA 2ZUSA 2UY2A 4AC1X 4E8DA 4RE4A 3WNKA 2QMKA 4HA3A 1UWUA 3WF1A 2W62A 1BAGA 2WW5A 1W3JA 2E9LA 4JFSA 2VZTA 3OBAA 5IHSA 3WFZA 3E1F1 3AHYA 2FDMA 3WH6A 2WVSA 2XWDA 2W4XA 3SIMA 4M82A 1DHKA 2ZX9A 4H8VA 3VIHA 4B3KA 5GNXA 5I77A 3VO0A 1RP9A 3T0AA 2D3LA 1PX4A 1EO7A 5CSUA 1ESWA 5DEZA 3DYMA 1HXJA 1BTCA 3WMSA 4LX4A 1KWKA 4QP0A 1LG2A 4PTMA 4PMNA 2WKLA 4DWSB 1V0LA 4NSBA 3GXDA 1GVIA 4M29A 4GZEA 3MV01 3BC9A 4LGXA 1ITXA 1E0WA 1V3MA 3MMDA 4CVUA 2ZWYA 3BMWA 4ATWA 4QAWA 4EK7A 1UWQA 1WNOA 2A3EA 4JZ5A 4ZENA 3SEPA 4BQ5A 2XJ7A 3CZEA 1UD8A 2WC7A 3CUFA 4PYSA 4JKMA 1V0MA 2CKSA 2NW0A 3EDJA 1JFXA 2QF8A 2D0FA 1CGVA 5DT5A 3EDKA 2BXYA 4URIA 5A8NA 1R85A 1WO2A 3KL0A 1I75A 2VX5A 3WNNA 3WL0A 1M01A 2IXVA 4FLQA 2YKKA 1UWRA 4UOQA 4P7QA 2FH8A 1D3CA 1ZJBA 2XPKA 3ZJ8A 2V38A 2PC8A 4W88A 1WCGA 5CXPA 4AD1A 1JXKA 2WYSA 4HOZA 2J77A 2VO5A 4QDMA 1DWAM 1S46A 5A6LA 5E0FA 3WMBA 3EDFA 1MW2A 5IXEA 1TCMA 1AQHA 1JDDA 1XRVA 4D72A 5E9AA 3WH7A 2G3NA 2YBUA 3F5LA 5D9NA 1M7XA 1OD0A 1KGUA 2X2YA 5CGMA 1CGTA 4W8AA 2J7EA 3ARTA 5A3HA 1W9PA 2WANA 4H7VA 3ZR5A 2XFFA 3VDCA 1BPLB 3RILA 3VGDA 3IJ8A 2XFRA 2FHBA 1QI4A 1V3JA 4JIEA 3SCTA 1V0NA 1UZ1A 4W5ZA 4UFJA 4PRWA 2O9RA 2D1ZA 4WSJA 1JZ4A 1KGXA 4AWEA 3AIWA 5EFFA 1UWTA 4JFVA 2WZHA 4Y7EA 1J0IA 1LL7A 4P7OA 3WH9A 3DHUA 1HKJA 1OIFA 3T0BA 4B9YA 4XUYA 4AMCA 3PZIA 4DWSC 1XD0A 4MPKA 4MNLA 5I79A 2X09A 1XHGA 3VU2A 4E4PA 1B31A 5LA1A 1H49A 4R27A 4OBRA 4W8LA 5D9MA 1ISWA 2Z1SA 3TA9A 4HTYA 4UFMA 1FA2A 1ZL1A 5I78A 1E6PA 2ZX7A 3VM7A 5GNYA 1V3LA 3VILA 2X1IA 4PTXA 4H2CA 3VINA 2BY2A 3AS2A 3CBWA 4CD5A 1E6NA 2DIJA 3LPOA 3WY1A 1EDGA 3EDDA 3F5JA 3PZNA 1TMQA 2OYLA 4F79A 5FL0A 5AY7A 3GBEA 1FHLA 4UOZA 3WKZA 3ZT6A 4CN6A 1QVBA 3VIIA 5F7UA 4XB3A 1X6LA 3I3EA 1H0IA 3OLGA 5A6BD 1C90A 1PPIA 1Q6CA 3W38A 2CYGA 2XGIA 4W8BA 3W82A 4MB5A 2W5FA 3WUEA 1X1NA 4TVDA 1J0HA 4MDPA 3D5HA 3UETA 4TOQA 3WDRA 1ISXA 4TX8A 1PJ9A 3WF0A 1NOUA 1NOFA 1BLIA 1DEDA 1E70M 1HVXA 4HU8A 4HP5A 3WFLA 3GZAA 2D22A 3OA5A 4U2ZA 2O9PA 1QW9A 1UZ4A 4WJXA 3I3BA 3FNDA 2EPOA 4JFUA 5FKYA 4JAWA 3KL3A 4W85A 3FAXA 1JYWA 5A2BA 3CUGA 2E8ZA 1BGAA 5D8ZA 3WD4A 5EFDA 4D6HA 3AQUA 3MMWA 4TTGA 1EDQA 3HN3A 2ZUMA 2FH6A 4MDOA 5D8WA 1B0IA 1RP8A 5EMYA 3SCWA 3VD4A 1OGBA 2OSWA 3ARWA 3FN9A 2J79A 4UFKA 4R5EA 3S6TA 2DSUA 5BXPA 3OGRA 4XZWA 4CN1A 1H5VA 1XCXA 4C7FA 3HMCA 1TUXA 2E3ZA 1KGWA 1UD4A 1M04A 4H41A 4NF7A 3WSUA 1OGGA 3VDHA 4M1RA 5JIPA 1U2YA 6TAAA 7A3HA 1E71M 1QNOA 2ZOXA 1KXQA 1Q6DA 2YL6A 5E6YA 1JG9A 2XVGA 8CGTA 3BMVA 4QCFA 1PIGA 2UY4A 1VB9A 1EDTA 3N15A 3O2LA 2C0HA 2ZUNA 3GH4A 2VCAA 4BZYA 3N9KA 3GNRA 1W9DM 2JIEA 4UNIA 1GQIA 3WL1A 1B3YA 1G5AA 4MTVA 4QLJA 1GOIA 1EO5A 4JL1A 3W4RA 4U3AA 1VBUA 4TVUA 1J12A 3KWXA 3W53A 2Y4SA 3VVGA 1JGIA 2W66A 1XV8A 5D9OA 2D20A 1NWUA 2J7CA 2C8NA 2ZXAA 3CMGA 2EQDA 4S3JA 1W3KA 3ARPA 2Y8KA 3ZM8A 5AYBA 3BAJA 4B15A 2PWHA 1WB0A 1OBAA 2G41A 2PBGA 3G6MA 3MUZ1 4UCFA 1H0GA 4Z2HA 5FL1A 3WD2A 3RM8A 3KL5A 3T2PA 2VRKA 1V03A 1JYNA 1AVAA 2Y24A 1UHVA 3ZJ7A 3DHPA 1MFVA 5DFAA 3W6MA 4PEEA 3AIBA 4P8WA 1Q6GA 3MUY1 4JCMA 1HT6A 3OLIA 4GI9A 2CHNA 1N82A 3NCOA 5BXRA 1VJZA 3OZPA 1KXHA 2A3CA 3A3HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3UG3 A;  1C8Y A;  2ZUT A;  1UOK A;  1NH6 A;  2VOT A;  5A69 A;  1TA3 B;  3CO4 A;  4L4O A;  2V3E A;  1QBB A;  1E4M M;  5I23 A;  4WF7 A;  5AC4 A;  3B9A A;  2VZO A;  5M5D A;  3L4T A;  1VEN A;  2GFT A;  2VL4 A;  2YDS A;  1UD3 A;  3VIM A;  3W26 A;  2OYK A;  3CIV A;  2NT1 A;  3EYP A;  3L4Y A;  4DWS D;  1C92 A;  5M17 A;  1VBR A;  5BRP A;  3RO8 A;  3A4X A;  1G9H A;  2VMF A;  4AYS A;  1GON A;  1E56 A;  1C93 A;  1KCL A;  2A3A A;  3ARR A;  3GH5 A;  4W87 A;  4IM4 A;  2VZV A;  4HOW A;  1MFU A;  3WEM A;  3WMC A;  2WVT A;  1UQZ A;  2NSX A;  1UA7 A;  5HOS A;  3N11 A;  4OOZ A;  3A47 A;  1MW3 A;  2WVV A;  1V6X A;  3ZJK A;  1W3H A;  3WNL A;  1XSI A;  5ABF A;  3M46 A;  4KRT A;  2PWG A;  3BCF A;  2JEQ A;  4UQA A;  5JBD A;  3LPF A;  1GOR A;  1UD6 A;  3VGF A;  2BHY A;  4V27 A;  1QI5 A;  4P7N A;  4EE9 A;  2VRJ A;  1AQ0 A;  4M8U A;  4D6E A;  4ACZ B;  5AYI A;  4CKQ A;  5EB8 A;  1ZBV A;  1DWF M;  2MAN A;  4OZO A;  5IDI A;  4TXE A;  1D2K A;  1Y7V A;  1MQP A;  4Q22 A;  1PZ2 A;  3AYR A;  1JDC A;  3CHE A;  1E6Q M;  1GVY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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