2G3JA

Structure of s.olivaceoviridis xylanase q88a/r275a mutant
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSAQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWASGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
publication title Structure-based engineering of glucose specificity in a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
doi rcsb
molecule keywords Xylanase
total genus 126
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2006-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2g3jA00
3AJ7A 2Y2WA 2D23A 2WXDM 2VOTA 2ZIDA 4MNJA 3CO4A 4Z2IA 1BVNP 1NOWA 5IFTA 3SUVA 3WBAA 1V3HA 4JFSA 3WFZA 1FOBA 5GNXA 1AQMA 1KQZA 1O6IA 2EQDA 3CUHA 2CKRA 3KEHA 1GOWA 4CCCA 1KGUA 3T08A 4W93A 5BCAA 3WNPA 4QAWA 3WDJA 2J7HA 3L4XA 3TOPA 1TE1A 1G5AA 1C92A 4CN4A 1E6XM 1X1NA 1I1XA 4AZ7A 4U3CA 4D6FA 3U7BA 4B9YA 4MDPA 1HF6A 3OG2A 4BQ5A 2VRJA 2VX6A 4AXNA 4IUGA 2AOSA 2YL5A 1LL6A 3T0AA 3VIJA 2E8ZA 1CLVA 4TVDA 1GOQA 1XSJA 3SUUA 1DWIM 1LL7A 1AMYA 1J0ZA 2XSAA 1CDGA 2RGMA 1W1YA 4K68A 1KXQA 3BAJA 2J4GA 1OINA 5ABEA 1VRXA 4H8HA 3GXDA 4AZIA 1W2PA 1BF2A 4DWSA 3WDHA 1ISWA 3RM9A 4AIUA 2VZTA 2EXOA 1QNOA 1GW1A 5A8MA 4UQBA 2WPGA 1VENA 1XSKA 1E43A 3BMWA 4AZCA 2YOCA 4C7GA 4PUEA 2CCRA 4CVWA 3CZLA 2NSXA 1DP0A 2A3HA 2XIIA 3AFBA 4HZ7A 4J3XA 1F4HA 4D1IA 4JCLA 3CH9A 2V38A 1SFSA 3W82A 3WNOA 1VAHA 1X6NA 2ZX6A 4ACYA 3DC0A 1ODZA 2D20A 5CG0A 1UKQA 1CXKA 5CQ1A 2CPUA 4Z2JA 1D7FA 3ZR5A 1ITCA 3RMEA 1V3JA 3N11A 1VJZA 4NI3A 3HU7A 2XFYA 3BCDA 3PZIA 1TZ7A 3AICA 4IPNB 2WAGA 3PTQA 2WC7A 2EPKX 4GQRA 2JIWA 2XSBA 1VFUA 5I77A 1ITXA 1RP8A 5M03A 3AIBA 5I3DA 2UY5A 5FCZA 1JF6A 2F8QA 5LA2A 1GOMA 1HJUA 1PPIA 2VR4A 4UOZA 3PTMA 3VDBA 4UQDA 2XUCA 1V02E 1JI2A 2GFTA 3SURA 3UESA 2XJ7A 5A8OA 1NWRA 4MAZA 3WQWA 1V6WA 2O9PA 4JFVA 3KWXA 4GIAA 2PBOA 3IJ8A 1NOUA 3ARPA 4BA0A 2G8ZA 4J27A 3CUGA 5IFPA 4PMNA 1V03A 1MQPA 4PSRA 4C7DA 1ISZA 4MB5A 1B2YA 2X8RA 1CXEA 1B3WA 3CTTA 1H49A 4HOZA 3OZPA 1JXKA 3IJ7A 1UKSA 4W7UA 4PMVA 3QGVA 5E09A 1B3VA 5JUVA 3ZMRA 1OIMA 5C70A 1UQZA 1B90A 4RE3A 1MW2A 1UKPA 4WKFA 3POHA 1LQ0A 4FF5A 2XWEA 5LA0A 5A6AA 4H04A 1UOKA 4XUYA 1HJQA 4CD7A 1EA9C 2JALA 5CSYA 2BV9A 2X2YA 3CZ8A 3AYRA 5AYIA 2WMGA 2Z1KA 1PZ3A 1US2A 4PMUA 3GH5A 2WNWA 4P7RA 1F4AA 3CMJA 4L4OA 2YL6A 2Y4SA 1EO5A 3T09A 1J0YA 5A69A 4ZXLA 2BHYA 5ABHA 3HMCA 2G3NA 3HN3A 4PMYA 3SUSA 1KXHA 4EKJA 3PTKA 3PZNA 1JAEA 2F2HA 5A2AA 2WW5A 1XHGA 1KBKA 2VRQA 3AS2A 4AD5A 5C71A 4WKHA 1G94A 5E70A 3UR8A 3SCPA 1JDCA 2XFRA 1VIWA 3NDYA 3M7SA 3WH7A 1KB3A 5CJ5A 1U33A 1V0MA 4CU7A 3THDA 1K9TA 2WVTA 1H0GA 1OBAA 2Q8XA 4PMOA 1HJXA 3WENA 3S6TA 3W29A 5JBFA 4U33A 3QR3A 4OJYA 2XVGA 3TA9A 2J7GA 2NT0A 1W1PA 4GKLA 1LLOA 1GOKA 4GI9A 5IHRA 2XVPA 1GZJA 2QHAA 2WHLA 2V3EA 2BS9A 1E56A 1UKOA 5D9OA 1KWKA 5A1AA 2DT1A 2WZIA 2WHJA 4GI8A 3UERA 2J75A 1RP9A 1K9EA 3BAIA 2WZHA 2WHMA 1SMAA 5A6BA 1JXJA 1JZ4A 3ARRA 5ABFA 1V3MA 1CZ1A 4DUVA 4CD6A 2J78A 1UYQA 2O9OA 3CUFA 3OBAA 3VM7A 3WIJA 4Z2KA 3VUPA 2VT0A 2J77A 5DEZA 2V3FA 1FFRA 3U7VA 4OBSA 5HDRA 4CU8A 1LJYA 1CXLA 5BXTA 1J0KA 3VGHA 4BZYA 2YDQA 3SCVA 1CGXA 3OZOA 3OLGA 3VDHA 1JGIA 4H8VA 3W28A 1UA7A 1HKKA 3IANA 3PZGA 1CECA 3ZR6A 4D71A 3QHOA 1R85A 2GK1A 1G0CA 3EMQA 3VIHA 2VZOA 2E8YA 5EBAA 3UG5A 4ACZA 2D22A 3N17A 5HPOA 2WVVB 3J7HA 3A4AA 3MV01 3M6DA 2VX7A 2V5CA 2WCGA 1W9DM 1HN1A 3WQ5A 4CD4A 3WQ8A 1UR0A 5A8QA 4W89A 3WF1A 1QNQA 4AZBA 1P6WA 2WMHA 5HPCA 2DPEA 2OYKA 1KCKA 1R8LA 4U31A 1E70M 3ARTA 4MJ2A 2D3LA 1WCGA 3AHYA 4GXPA 1OT2A 1CGVA 3WSUA 3WEOA 3ARZA 9CGTA 1E6NA 4MB3A 7TAAA 1QI3A 3MSDA 4W86A 1OD0A 1ZJAA 3OGRA 1JZ2A 1HJSA 2VC9A 1AVAA 1O7AA 3EDDA 3GZAA 4HA1A 3T0BA 4UQCA 4TXEA 1WPCA 5GNYA 5I24A 4NRSA 1ZS2A 3VGGA 2YJQA 1ZBCA 6A3HA 3EDFA 1JZ5A 2YDSA 3FY1A 4FLOA 4UTFA 4HTYA 2PWHA 1UWSA 3OLDA 5BXSA 2NW0A 4E8DA 3RCNA 4JZ5A 3VINA 4FLQA 1U30A 3MSGA 3AHVA 1HP4A 2WC4A 1XYFA 2X09A 1J18A 3WEMA 3ZT7A 2WCAA 4W5ZA 2FGLA 1LWJA 1CLXA 4F79A 1GJUA 4NF7A 1JYXA 4P8VA 2WYSA 2PI6A 1G01A 4LGXA 3GYCA 1CXIA 3ARXA 1PJ9A 1E15A 3VNYA 4LYQA 2WVSA 3L2MA 3VPLA 2ZUTA 3I3EA 1V3IA 3VU2A 1UH4A 5M5DA 4DM1A 5BYWA 4W7VA 5BRQA 5A6SA 1X6LA 2EPOA 1DWFM 4GQQA 3ARWA 4J28A 1UWUA 4TX6A 2WWDA 1CTNA 1KR1A 3CLWA 3CZKA 3M46A 2WKGA 5CLWA 8CGTA 4W8AA 4F8XA 4AZCB 2E40A 4U5IA 2V3GA 1TCMA 2A3AA 2F61A 2ZXAA 3HJEA 3NIYA 4UZUA 3VGFA 3B9DA 4GPNA 1L0PA 3ALGA 1XGZA 2VCCA 1K9DA 2X1IA 1WP6A 4KRUA 3SIMA 2XPKA 4XB3A 3CZGA 4LX4A 1UD4A 1GVYA 5FOOA 1BLIA 1GORA 1OWQA 3PHAA 4FLSA 4JL2A 3POCA 1ZU8A 1JNDA 5EB8A 5I0DA 1BVZA 5GPRA 5E9AA 4UFIA 1DWAM 1UR8A 3O6AA 3ARSA 3WF4A 8A3HA 4AD2A 4EE9A 2BY3A 1HL9A 2GJPA 1JAKA 3VM5A 1HT6A 4W8LA 5FL0A 3W53A 1EOMA 1J0HA 4BCEA 3T2QA 5HBFA 1HXJA 4D6DA 1WDRA 3ZT5A 2UY2A 2QF8A 1KXTA 4Q7NA 3BH4A 3ZM8A 2WB5A 1OIFA 1MFUA 3F5JA 3VX1A 1QI0A 3ZSSA 2W67A 1FH8A 1E6RA 3NSMA 3AMCA 2BY2A 2VX4A 3MMWA 4B15A 4L4PA 3K8LA 2PF0A 1XYZA 4M82A 2WMFA 1A3HA 4GZJA 4DUWA 1CGUA 1QHZA 2VCAA 5DMYA 2CHOA 2DH2A 2ZXBA 3I3DA 2O9RA 2YL8A 3L4ZA 5JIWA 2G4FA 4UFHA 3ZIZA 2BXYA 1MYRA 3LPFA 3NSXA 4UQ9A 1UR9A 3JUGA 2JE8A 4HA4A 3WEZA 2VNCA 3DYMA 1V6XA 1FHDA 2YA0A 4M56A 3AZSA 1W2VA 3FHAA 3CHDA 2VUYA 3VVGA 1QI5A 1XH0A 4CN1A 3VIMA 4RE4A 4MAVA 3PZOA 4FMVA 1BG4A 4PMRA 4U2ZA 1EQCA 3VIIA 1M04A 5KEZA 4XZWA 5I5RA 2GUYA 1QNPA 2BHZA 1WO2A 4QLJA 3WQ4A 1UH3A 4GINA 4ZFMA 3CUIA 2BY0A 2WLZA 3U5YA 2OYLA 2ZUUA 2XTKA 3VD3A 3VGEA 3O2LA 5CXPA 2CESA 1ECEA 1EO7A 4KMQA 4X0VA 1FFQA 4GO8A 4JAWA 1H41A 1XH1A 1W3HA 3AXXA 5CPTA 3FAWA 4NSBA 5D8WA 4UOQA 4AEEA 1B30A 3WY1A 5FKYA 2W5FA 1LF1A 3WD2A 1CPUA 4AD1A 3MANA 2CERA 3WN6A 4PBGA 1NARA 2O9TA 3WMBA 1GNXA 3VMNA 1W91A 1JFXA 3AIWA 2C8NA 2YLLA 3UR7A 4ZEPA 1V3KA 1E40A 1VF8A 3W81A 1QBBA 2Y24A 2JEQA 4ATWA 1TVNA 5CGMA 1QI2A 2WSPA 3VMOA 3W24A 4ML4A 5ABGA 1ISXA 3UG4A 1WE5A 2GSJA 4S3JA 5ABFB 2GDUA 3RJYA 5E6YA 2D24A 3F5LA 2IUZA 1E4MM 4PCSA 1KFWA 2YA1A 3A6OA 4UCFA 3MUAA 4Z2LA 4AEFA 3AS0A 3OGVA 1XSIA 4URIA 5A6BD 5A8PA 2BVYA 1N82A 1E71M 3VILA 4JKKA 2YA2A 3RPMA 1UKTA 4UZSA 1UZ1A 2RGLA 4ZE5A 2WBGA 4OIFA 3VD9A 1XC6A 3VNZA 5D4YA 1LG1A 5M3WA 3AS3A 1V0KA 1EQPA 2GK1B 1JYWA 2BXZA 5AY7A 3GBDA 4ACZB 1EH9A 4BF7A 1A47A 4KGJA 4X0NA 2YL9A 5A2BA 1G1YA 1Q6EA 4D6EA 3VMPA 4TOQA 1V3LA 1PX3A 4WSJA 4JFTA 4JIEA 1B3XA 4KH2A 2JIEA 1VBUA 1E0XA 1QVBA 5KZ6A 3FXYA 1XD1A 1R87A 2B31A 3L4UA 2VVNA 3SCRA 4QCFA 3MMDA 1E4LA 2DGAA 5AC5A 3ARQA 2Y8KA 4HMDA 4QDMA 3CBWA 4PTMA 2A3EA 1C93A 1C91A 1XV8A 3CIVA 5GQBA 2HVMA 4MPKA 1MXDA 1MQRA 2G3IA 1EDTA 1W9BM 1CXHA 4V28A 1Q6FA 3CHEA 4P8WA 2XVNA 3VIPA 2J62A 3UEQA 2CITA 2J7BA 7A3HA 3QOMA 4TUFA 1J11A 3AIQA 1BFNA 3W27A 1CENA 3EYPA 4AW7A 4D1JA 2EPLX 2ZXDA 1C8QA 1TMQA 1HJWA 4J3SA 2DSVA 3VIFA 1E1EA 3QHMA 1SYTA 1W9XA 3K8KA 1TR1A 1HIZA 2DSWA 4J3UA 3M07A 2OWCA 3VTRA 3WDPP 1HP5A 1OM0A 1HNYA 2QPUA 1FH9A 4XV0A 3T2PA 4DM2A 3G6LA 1BGAA 1TG7A 1US3A 3KZSA 2MANA 1XCWA 2CIPA 3CPUA 3MMUA 2ZOXA 1AQ0A 1FH7A 2ZX9A 1HJVA 1WZLA 4JHZA 5A8NA 1QOXA 3PBGA 3BXWA 5LYRA 3ZJ8A 1YQ2A 3A4XA 2DIEA 5CLTA 2W91A 4F9JA 3K46A 2O92A 1FP8A 2W63A 2XVLA 1C7TA 3OLIA 2TAAA 5CSUA 1JI1A 3GNPA 6TAAA 2WSKA 4JCMA 1LG2A 3CZEA 4WJXA 3EMZA 4Z2HA 4LPCA 5HXMA 5JIPA 4AZ5A 2PB1A 3WFLA 4BQ3A 4ATDA 2GJXA 1KXVA 2V3DA 1ISVA 3N12A 1DHKA 5BXPA 1GHRA 1Y7VA 3AMDA 2FHCA 3SCOA 3WBEA 2EEXA 1E6ZA 5CZKA 1JL8A 1JD9A 2OYMA 3VGBA 2YKKA 5DO8A 4PYSA 3WNNA 3AS1A 3WQVA 2ZE0A 1UWQA 2WCSA 3SUTA 4IM4A 5BROA 2X0YA 1ZL1A 3AHZA 4LYPA 3SCQA 1BGGA 3KL0A 3GXMA 4JL1A 4W84A 3GDBA 3L4YA 1I1WA 2VJXA 1UR2A 4B16A 1MW0A 3VO0A 5E0FA 1CXFA 1JNEA 1XRVA 1ZB5A 3EDEA 2QV4A 2ZUMA 4EK7A 3AMKA 2FHFA 1NP0A 4XZBA 5D9PA 4A4AA 4UQAA 3OLEA 1D3CA 4HPHA 4KGLA 1DEDA 4MNMA 5CPSA 3WF0A 3FNDA 3NCOA 1GOIA 3FHQA 2V5DA 3E1F1 4QCEA 2ZWZA 2FH6A 1BSIA 1H3GA 1TUXA 2FHBA 1WAWA 1QHPA 4WK9A 1JFHA 3WKZA 1KWGA 5D8ZA 1IV8A 3LPGA 4P8UA 3NJ3A 3TTSA 3UCQA 1Q6CA 3B9AA 3VD4A 1DWJM 2DT3A 3N15A 2A3BA 1KCLA 3GM8A 3RO8A 4AISA 3DHUA 2QMJA 2GVYA 3ZJ7A 4P7OA 3IAQA 3IJ9A 2XM1A 2E9MA 3MS8A 3BMVA 5A2CA 4UFMA 4HMCA 3G6MA 3WUGA 5JBEA 2WM0A 1BQCA 3SUWA 2IXUA 2WWCA 5A3HA 2PWEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AJ7 A;  2Y2W A;  2D23 A;  2WXD M;  2VOT A;  2ZID A;  4MNJ A;  3CO4 A;  4Z2I A;  1BVN P;  1NOW A;  5IFT A;  3SUV A;  3WBA A;  1V3H A;  4JFS A;  3WFZ A;  1FOB A;  5GNX A;  1AQM A;  1KQZ A;  1O6I A;  2EQD A;  3CUH A;  2CKR A;  3KEH A;  1GOW A;  4CCC A;  1KGU A;  3T08 A;  4W93 A;  5BCA A;  3WNP A;  4QAW A;  3WDJ A;  2J7H A;  3L4X A;  3TOP A;  1TE1 A;  1G5A A;  1C92 A;  4CN4 A;  1E6X M;  1X1N A;  1I1X A;  4AZ7 A;  4U3C A;  4D6F A;  3U7B A;  4B9Y A;  4MDP A;  1HF6 A;  3OG2 A;  4BQ5 A;  2VRJ A;  2VX6 A;  4AXN A;  4IUG A;  2AOS A;  2YL5 A;  1LL6 A;  3T0A A;  3VIJ A;  2E8Z A;  1CLV A;  4TVD A;  1GOQ A;  1XSJ A;  3SUU A;  1DWI M;  1LL7 A;  1AMY A;  1J0Z A;  2XSA A;  1CDG A;  2RGM A;  1W1Y A;  4K68 A;  1KXQ A;  3BAJ A;  2J4G A;  1OIN A;  5ABE A;  1VRX A;  4H8H A;  3GXD A;  4AZI A;  1W2P A;  1BF2 A;  4DWS A;  3WDH A;  1ISW A;  3RM9 A;  4AIU A;  2VZT A;  2EXO A;  1QNO A;  1GW1 A;  5A8M A;  4UQB A;  2WPG A;  1VEN A;  1XSK A;  1E43 A;  3BMW A;  4AZC A;  2YOC A;  4C7G A;  4PUE A;  2CCR A;  4CVW A;  3CZL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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