2G3JA

Structure of s.olivaceoviridis xylanase q88a/r275a mutant
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSAQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWASGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based engineering of glucose specificity in a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
doi rcsb
molecule keywords Xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 126
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2006-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2g3jA00
1HJQA 2XWEA 2Y2WA 2J8FA 5I77A 4PMRA 2IXUA 4DWSC 4AEFA 2CHNA 5F7UA 5IDIA 4AY1A 3POCA 1G01A 2WC4A 3GZAA 1UA3A 3ZR6A 4AZCB 4UNIA 5A6BD 3BAWA 3BMWA 1OSEA 3AXXA 4MJ4A 1CTNA 4PMUA 3PBGA 1EIBA 3WDJA 3ARXA 5HOSA 4AZGA 4NZCA 1FH9A 2HVMA 1E55A 3ZJKA 4Z2IA 1BYCA 1EDQA 2VOTA 2A3BA 3GBEA 1Q6FA 2VRKA 1GW1A 3VNYA 1UD4A 5M5DA 1JZ3A 4D6EA 4AZ6A 2X2YA 5JBEA 4DM1A 2F61A 2J77A 3RILA 4P8VA 2J7FA 1HKJA 1JF6A 1EQPA 1NARA 3N15A 3WNNA 3OLIA 4GZJA 5FKYA 3WFLA 1XH0A 1V08A 4LYQA 2XSBA 2EBNA 1BGGA 1ISWA 4V2XA 3WIJA 2WMGA 3SUSA 1E43A 2WVVA 2W91A 3WQ5A 2YBUA 3PZMA 3WY1A 1UUQA 1MFVA 4P7OA 1KGUA 1FHLA 4H04A 1VF8A 3WH6A 4EK7A 2VNCA 1QPKA 3VMOA 3BSHA 3W81A 5BXSA 1GJWA 2O92A 1JYNA 3PTMA 1H0GA 3W28A 4IPNB 1V6WA 4P7LA 2JE8A 3VGGA 1E6NA 4W8AA 7A3HA 4GINA 3M07A 5HNNA 1JXKA 4QLJA 1OGSA 3WDIA 1CWYA 4ZE5A 1NWRA 4JCMA 2JALA 1WDRA 2J7EA 3TTYA 3W37A 2NT0A 5AY7A 2VX4A 4X0NA 2EPOA 3K1DA 3IJ7A 3U5UA 1AMYA 1XYZA 3PN8A 5A8MA 5A8QA 2CYGA 3WQVA 1XH1A 4ACYA 5I24A 2DSWA 4UQAA 4UQBA 3AJ7A 1KXTA 2ZX9A 1J01A 1WZAA 1GQJA 1GJUA 4E2OA 2OWCA 3IJ8A 4FLQA 2BHYA 3WELA 3AIBA 1GCYA 1JGIA 2CESA 3EDJA 3FHQA 1Q6DA 4M29A 4AZHA 2OYMA 3SCWA 2DH2A 1B1YA 3WMCA 2FHFA 5A8OA 2G4FA 5A8PA 2VQUA 4AISA 2V3FA 2XG9A 5E09A 3GXFA 3T2OA 3W26A 1GNXA 1KBBA 3ZIZA 2XVLA 1MW2A 4L4PA 3AHTA 1HKKA 1CYGA 4P7QA 5E9AA 3FAXA 3KWXA 1OIFA 2D20A 8CGTA 2ZIDA 4W7WA 1OGBA 4HZ7A 4IM4A 3EBVA 3O9NA 1TR1A 3K8KA 1UQZA 2WZEA 4MB3A 3ARYA 3PTQA 2J78A 1WB0A 5DEZA 3OZPA 2G3IA 2J47A 1V6YA 5ABFA 1LLOA 1HVQA 5ABEA 3LMYA 3F5LA 1TA3A 2VJXA 3VMPA 1E3XA 1UR0A 4TX8A 4D6JA 3CMGA 4P8WA 3AIQA 5LYRA 2ZUVA 2WXDM 1C91A 1LJYA 2ZX5A 3QHNA 4UOZA 3VM5A 4ACZB 3AMLA 2GSJA 2W67A 4GZEA 1FFQA 3QOKA 4JL2A 2BHUA 4PCSA 4QAWA 3AS2A 4V27A 4K68A 1HNYA 1OT2A 4QCEA 3VX1A 3WN6A 1E40A 5A2CA 3AZRA 1KQYA 1U33A 1U30A 4F9JA 2VX7A 2WHLA 4UQDA 3UETA 1UQYA 3SUWA 3LPFA 1C90A 1QI0A 4CD5A 3WH9A 5DT7A 5E6YA 4B9YA 1VBRA 3WQ8A 1EDTA 3VGHA 1DHKA 3BLPX 3CPUA 1V3JA 1V02A 3L4YA 2WHKA 3WNKA 5A8NA 3DYMA 3U7BA 3CHDA 4AD4A 1ISYA 2X8RA 1E73M 3NJ3A 5D9MA 2C8NA 4WSJA 4U3CA 4D6CA 4TX6A 2XVPA 5I6SA 4S3KA 1GOMA 4GO9A 3RIKA 1HJWA 1LL6A 3ZSTA 1E6XM 1W9VA 1ITXA 1XGZA 1RH9A 2ZX6A 3GYCA 3ZR5A 1QNQA 4OBSA 4AC1X 4BZYA 1TVPA 2WHJA 3NYDA 1BGAA 2W61A 1CXFA 3WDRA 3LPOA 3MUZ1 2EPKX 4TTUA 3WUBA 2ZX8A 3THCA 4M82A 1W1PA 2BY0A 3VD4A 4JFTA 4GQRA 4KRTA 2WVUA 5EMYA 1EO5A 3OB8A 2EPLX 2OYKA 5HBFA 1U2YA 5EFFA 3OBAA 3WDPP 1PPIA 4UFIA 5A94A 4HMCA 1BVNP 3EDEA 4XB3A 3IJ9A 2GJPA 1QNSA 3CUHA 5BYWA 4L4OA 2WKLA 1KWGA 2GJXA 1UZ4A 1NQ6A 4GI6A 3WF3A 1UYQA 3I3BA 2XGIA 1E5NA 3VIJA 5ABHA 4F9DA 4CN6A 1UWTA 3VDAA 2WC7A 2ZUMA 4OJYA 1ISVA 2BXZA 2BY3A 4QFUA 2WCSA 3GH7A 1XD1A 1R86A 1B3ZA 3WNPA 3OIHA 2O9OA 2EEXA 2PI6A 2V3EA 2YDRA 1MW3A 2PBGA 1H49A 1E3ZA 3IANA 4OUEA 3PZOA 4JAWA 3MSGA 3VTRA 1HJUA 1HX0A 1EQCA 1W9PA 2WMHA 2J7HA 3K46A 1B3XA 2XM1A 2J8GA 1XCXA 3WUEA 4XX6A 1V3KA 3WUFA 4DWSB 1JDCA 3VIIA 1H1NA 2QF8A 4XZBA 3VD3A 1UR4A 1J0KA 3ARVA 4OIFA 1BTCA 1C7TA 1EHNA 4W86A 3G6LA 3SURA 1TG7A 1EO7A 1JAEA 2ZWZA 5C70A 4OBRA 2EPNA 1JXJA 4KH2A 4M80A 1MW1A 2FHCA 3CIVA 4RE4A 3AHYA 1KBKA 5HXMA 2V3GA 4GI9A 4HZ6A 4BQ4A 2VURA 1UA7A 2ZXQA 4W84A 3ZM8A 4AWEA 3WQWA 4CN1A 3AIRA 3GNPA 1GZJA 4P7NA 1QI2A 4CVUA 3AS0A 1JZ6A 1ZL1A 1J9YA 2C0HA 4HA3A 3OZOA 3UG5A 9CGTA 3GDBA 1CGYA 2Y24A 2CXGA 4BQ5A 1OM0A 1MXDA 2W63A 3WQ6A 2ZUWA 3BXWA 3I3EA 1JI2A 1OB0A 1J0IA 4HTYA 4MTVA 3AHVA 1EDGA 3N9KA 5D8ZA 4CD6A 5I79A 3SCQA 4EANA 1LL7A 4W87A 3M6DA 5AC5A 3A3HA 1MW0A 5FD0A 5JBDA 2BNJA 3QR3A 1D7FA 1R85A 2O9PA 4E8DA 1L8NA 2OSWA 1CXLA 1BSIA 4C7FA 5TD4A 1DWIM 3WD4A 4Z2HA 4FLSA 4AD1A 2DH3A 5IHSA 4MB1A 1LQ0A 1RPKA 2FGZA 1EH9A 1V0NA 4OKDA 4LYPA 2ZOXA 4KMQA 5A6SA 2J7CA 1HF6A 4HZ8A 4MNJA 3ZT7A 4NRSA 4BQ2A 3AHZA 3AMGA 1UOKA 4CCDA 1QI3A 1VBUA 3WKZA 1K9EA 2J7BA 2X05A 4MDOA 2Y8VA 5JIWA 5FL1A 2RGMA 3WMBA 4B15A 1GQKA 1VEOA 4Y7EA 3WBEA 4HMEA 4U31A 3IK2A 4WK9A 2EO7A 4GI8A 1PX8A 3OA5A 2ZXAA 3A4XA 3PTKA 3AXHA 2WWCA 2GVYA 1Q6CA 3DYPA 3PZ9A 1E6ZA 1AQ0A 2WNWA 1QHZA 2PWDA 3WF1A 5I5RA 3T0AA 2GUYA 1KGXA 4JZ5A 5C8BB 3SCNA 1UWRA 2ZE0A 4CU6A 3N1AA 2D23A 2YA1A 1JDDA 4HPGA 2V5DA 4OOZA 3WH8A 2VZSA 2DT1A 1NWUA 1KB3A 2WB5A 3SCUA 3HJEA 3VIKA 2WZHA 1KXQA 1M7XA 1UKQA 4UFHA 4UZSA 1K6AA 2X1IA 1Z32X 1VENA 3TP4A 1YQ2A 3RDKA 5JIPA 3GH5A 4BF7A 1ZB5A 3O6AA 2V3DA 3CUGA 4JHOA 4UTFA 1B9ZA 2O9RA 3AROA 4BS0A 1OBAA 1QNRA 1ZJAA 1FP8A 3VIMA 1GOQA 2VCBA 3UR8A 1V6VA 4HOZA 2E8YA 1RP9A 1BQCA 5EB8A 2XFRA 1NM9A 3B8SA 2ZUSA 2BFGA 3BAYA 2NSXA 3IAPA 2QMJA 4AD3A 5A95A 5A6KA 1H3GA 1XSIA 3WEZA 1CECA 5A3HA 4UQEA 1Q4NX 1SMDA 2E0PA 3UG4A 2F2HA 1B2YA 5I3DA 1ESWA 5D9OA 2TAAA 4CGTA 2WMIA 3AIWA 3DHUA 4URIA 1Q6EA 2CNCA 1PBGA 1CGTA 2UY4A 4MNKA 1XYFA 3WD1A 1QBAA 5GQBA 4F8XA 3MO4A 1TVNA 4WIWA 3AMCA 3MS8A 1XC6A 2OYLA 4PN2A 4U5IA 1DWHM 3VD7A 1E0VA 3TTSA 2E3ZA 1X1NA 4IISA 4M8UA 4Z2KA 4CU8A 4A3YA 3W6LA 4RE3A 1GOWA 5EBAA 3CBWA 3WFZA 5CG0A 4H7VA 2WZIA 1QHOA 2V5CA 1MVYA 1WDQA 2PWGA 4AW7A 1CGWA 4Z2JA 1ITCA 2YA0A 1A47A 2FH8A 5BXPA 2G3JA 4LX4A 4B3KA 1DEDA 4AZCA 3M46A 4GQQA 1VJSA 3VO0A 4BCEA 1TFVA 2DPEA 3ZQ9A 1KR0A 1VFUA 4HPHA 3LPGA 5IHRA 3ECQA 3T09A 3PZNA 3WL1A 3CZGA 4ZE4A 4NF7A 3KL3A 2XTKA 3BC9A 3DHPA 1C92A 3TTOA 1B3WA 4W88A 5D8WA 1H41A 3KEHA 4U5KA 1VFFA 2CKRA 1OD0A 2YDQA 1JG9A 4XZWA 2YL5A 2WM0A 3TTQA 1FP9A 2D1ZA 1JFHA 1PZ3A 1PZ2A 1E72M 1NP2A 2D24A 1E0WA 4GKLA 1SR0A 4QP0A 1J10A 1KCKA 4PTWA 2CHOA 2WANA 2JEQA 2J62A 1WPCA 3ARUA 1NOWA 5A6MA 1EHAA 1D3CA 3PZUA 1ZBCA 5GNYA 1HIZA 5M03A 1UD6A 2ZUUA 3CZJA 4LXFA 4J3WA 2IUZA 3CUIA 1G5AA 4AIUA 3U57A 2DIJA 2BHZA 1UD5A 1JZ5A 3MMUA 1QVBA 2G41A 2GK1B 3SCSA 3QOMA 1BFNA 2XYLA 3WNLA 2E9MA 5KZ6A 5A6AA 1WP6A 3WNOA 2DSZA 3ZT5A 4UFJA 1QI5A 1XHGA 1J11A 1B0IA 4R27A 4U33A 4MPKA 4CUCA 3ARZA 1CENA 3MANA 4GZIA 3TOPA 4CN4A 1WDPA 4JKMA 3WD0A 2ZUNA 3U7VA 4B3LA 1VIWA 2XHYA 5CLTA 1E5JA 3RPMA 4PYSA 3U5YA 1UWQA 3AQUA 3QHMA 3N13A 1AVAA 1NWTA 3W4RA 1JL8A 1AQHA 3D5HA 1V6XA 3FNDA 1E6SM 1E4NA 5A6LA 2CBUA 1HT6A 1G94A 2WSKA 5IXEA 2DT3A 4KGJA 2ZX7A 4KGLA 2WSPA 1CBGA 4ATLA 2G8ZA 3CH9A 5ABGA 5BRQA 3A4WA 6CGTA 1EGZA 2BVTA 4HU8A 1IZKA 2VX6A 1JZ8A 2WVSA 4W89A 1W1TA 3WUGA 4TVCA 5BRPA 3VM7A 4HA4A 4PSPA 1ZBKA 3PZGA 1CXIA 1PEZA 1W32A 2QMKA 4D6GA 1JF5A 1EOKA 4WKFA 1SYTA 4UOJA 4TTGA 5I23A 2VZTA 5KEZA 4ZXLA 2PWEA 2DSKA 3VD9A 3PHAA 1H4PA 3KE0A 3VILA 1G9HA 4W5ZA 1VEMA 5LA1A 5DO8A 1E1FA 3DC0A 4UFLA 3HU7A 1UD3A 2BS9A 3WBAA 3F5KA 2XM2A 1B3VA 1H2JA 3OLGA 3OG2A 3VMNA 3W38A 3VINA 1GOIA 2J4GA 4PRWA 5LA2A 1QW8A 2PF0A 5CLWA 1X6LA 3MUIA 1GORA 1W9UA 4ATWA 1DWGM 3K8MA 2Q8XA 1E6QM 5CPSA 4Z2GA 3TA9A 2WC3A 3M7SA 4ZFMA 3VD5A 3ZJ7A 3ARRA 1JAKA 2XFFA 2V38A 1ZBWA 4ZENA 1UKSA 1J0ZA 3GNRA 1BPLB 1FFRA 3AXIA 4ACZA 4TXEA 3ZO9A 2WBKA 4V28A 1GONA 4UCFA 1UR8A 4PMYA 1VB9A 2JF6A 1XV8A 1J0YA 3T0BA 3EDFA 3CUJA 1I75A 1LG2A 4HOWA 5JBFA 1UR2A 3CZEA 4CD8A 4W7VA 3CZKA 3FAWA 1P6WA 3OGRA 4CVWA 2BV9A 3POHA 2BVDA 1W91A 5D4YA 1HL9A 4W8BA 1XSJA 4JFSA 1UG6A 1W9BM 4B9ZA 3N18A 1WZMA 2XGBA 5ECUA 1DWAM 4P8XA 3II1A 2AMGA 2J7GA 1JNDA 5DFAA 5HPCA 3VOCA 3FW6A 1JD7A 3MU7A 2QPSA 3SCVA 4J7RA 1VAHA 2ZICA 1HL8A 3VKKA 4D1IA 2W66A 2BXYA 4ZXOA 4AXNA 1R87A 3RM8A 2J74A 4FLRA 2GFTA 5GNZA 2YBTA 2VL4A 2WLZA 5IFPA 4JCLA 2YL8A 2VQTA 5CSYA 2D3NA 2DQXA 3PZIA 1Y7VA 3T08A 3CGTA 3QGVA 2J25A 1XSKA 4GIAA 2C7FA 4C7DA 4NRRA 5HDRA 1K9DA 3BGAA 1ZJBA 4UZUA 3RJYA 1B31A 2IXVA 4MNLA 3W0KA 2DT2A 4F79A 1A3HA 2CBVA 3VUPA 3J7HA 4J3SA 3SCTA 3K4DA 4AD5A 1V3HA 2YA2A 1BHGA 2YLAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HJQ A;  2XWE A;  2Y2W A;  2J8F A;  5I77 A;  4PMR A;  2IXU A;  4DWS C;  4AEF A;  2CHN A;  5F7U A;  5IDI A;  4AY1 A;  3POC A;  1G01 A;  2WC4 A;  3GZA A;  1UA3 A;  3ZR6 A;  4AZC B;  4UNI A;  5A6B D;  3BAW A;  3BMW A;  1OSE A;  3AXX A;  4MJ4 A;  1CTN A;  4PMU A;  3PBG A;  1EIB A;  3WDJ A;  3ARX A;  5HOS A;  4AZG A;  4NZC A;  1FH9 A;  2HVM A;  1E55 A;  3ZJK A;  4Z2I A;  1BYC A;  1EDQ A;  2VOT A;  2A3B A;  3GBE A;  1Q6F A;  2VRK A;  1GW1 A;  3VNY A;  1UD4 A;  5M5D A;  1JZ3 A;  4D6E A;  4AZ6 A;  2X2Y A;  5JBE A;  4DM1 A;  2F61 A;  2J77 A;  3RIL A;  4P8V A;  2J7F A;  1HKJ A;  1JF6 A;  1EQP A;  1NAR A;  3N15 A;  3WNN A;  3OLI A;  4GZJ A;  5FKY A;  3WFL A;  1XH0 A;  1V08 A;  4LYQ A;  2XSB A;  2EBN A;  1BGG A;  1ISW A;  4V2X A;  3WIJ A;  2WMG A;  3SUS A;  1E43 A;  2WVV A;  2W91 A;  3WQ5 A;  2YBU A;  3PZM A;  3WY1 A;  1UUQ A;  1MFV A;  4P7O A;  1KGU A;  1FHL A;  4H04 A;  1VF8 A;  3WH6 A;  4EK7 A;  2VNC A;  1QPK A;  3VMO A;  3BSH A;  3W81 A;  5BXS A;  1GJW A;  2O92 A;  1JYN A;  3PTM A;  1H0G A;  3W28 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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