2G4FA

Structure of s.olivaceoviridis xylanase q88a/r275a mutant
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSAQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWASGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
publication title Structure-based engineering of glucose specificity in a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
doi rcsb
molecule keywords Hydrolase
total genus 130
structure length 302
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2006-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2g4fA00
4URIA 2XVKA 4FLRA 3PTKA 4UQ9A 2YBTA 2EQDA 2VVSA 4HMEA 2WMIA 5BRPA 2QMJA 1GVIA 5DF0A 4D6EA 1W9DM 3PN8A 2VZVA 2VZSA 2A3CA 2WCAA 1MFVA 1LWHA 2DGAA 2E3ZA 5D9OA 4AY1A 4CD6A 4AZIA 1DEDA 2EPKX 2JF6A 4W7VA 4GIAA 1E4LA 3E1F1 3ZIZA 4TVCA 2BXYA 2E9MA 3PTMA 2YL6A 3I3BA 5D8WA 1QNSA 1XSJA 5AYBA 5E09A 4WKHA 1EQCA 4W87A 3DC0A 2BNJA 3PZMA 3WEOA 1V3JA 3VIHA 3NYDA 3U7VA 1GQLA 1BQCA 1FFRA 3N1AA 4WKFA 1JI1A 3BAYA 1V3KA 3ZM8A 5EB8A 1ZU8A 1DWFM 3VU2A 3FHQA 5M3WA 4AIUA 2C0HA 3VIKA 5GNZA 4A4AA 4GXPA 1VJSA 3O2LA 2XM1A 4QCEA 5A6KA 3AROA 2WNWA 4GO8A 3WFLA 3TP4A 2YJQA 5ABFB 1GCYA 5LA2A 3AZRA 2AAAA 3MMWA 1ISYA 1B3WA 4U2ZA 2XM2A 1US3A 1WZMA 3T0BA 1XH0A 3WF2A 2E40A 4FMVA 2CHOA 3DYMA 3UG3A 3BSGA 1LLOA 3BH4A 1CGYA 3W0KA 2GUYA 3B9EA 4UZUA 7CGTA 2DIJA 5A2BA 3CO4A 4MJ4A 3LPOA 4UCFA 2WMJA 1ZBKA 3U5UA 1KWGA 1OT2A 2BY1A 2VRKA 2J7EA 1JZ4A 2YLAA 5D9MA 3WNNA 4J3TA 1ZBCA 1ISWA 3SUVA 3VMOA 5E9AA 1KBKA 5A6BA 4UQBA 4D6DA 1U2YA 3NSNA 2OYLA 2UY2A 3VDBA 2QPUA 3K46A 1E6RA 3L2LA 5E0CA 3ZOAA 1HVQA 1UD2A 2ZX5A 3PZOA 2WZEA 4AEEA 1B3XA 9CGTA 2PWGA 3G6LA 4CD5A 5BXTA 1G0CA 2VC9A 4JFSA 1B3YA 1OD0A 2DEPA 2OSWA 2O92A 1UKPA 2DT1A 1PX3A 2D20A 2GK1A 2WKGA 2OYKA 3ZJ8A 2EO7A 1JAEA 4C7GA 2BVDA 3BAIA 4PMVA 1HKMA 4AZ5A 3S6TA 4Z2IA 3WUBA 2ZUTA 3CHEA 3AIVA 2VR4A 1EDQA 4AISA 1OWQA 3NDYA 5CZKA 3SURA 1UOKA 2XVNA 1V6VA 4TTGA 1HL9A 1E1EA 1FHLA 3ZO9A 3VMPA 1E4NA 3SCNA 2WHJA 2BVYA 4J27A 3W82A 3A6OA 1XSKA 3VINA 4ZE4A 1E15A 1UWSA 2VRJA 4PMZA 1W3JA 3BSHA 3CUFA 1OGBA 6TAAA 1K9DA 8CGTA 4R5EA 1ECEA 2PWHA 3GBEA 1KQYA 4Z2JA 3LPGA 3UG4A 4W8BA 3OLIA 4UZSA 2WWCA 4AIEA 2QV4A 3GNRA 3PBGA 1CENA 3GNOA 1NP2A 1E0VA 4HZ6A 1UG6A 2WMFA 5CG0A 1DWHM 5JBDA 2YA0A 1K9TA 3MV01 1QHPA 1E6QM 4QLJA 4U33A 5A6MA 1WPCA 1JDAA 1E4MM 4MDOA 2J74A 3WH6A 4PSRA 3AIEA 2C7FA 4UFJA 1G9HA 2WCSA 1US2A 1QI3A 2ZWYA 2ZWZA 2W4XA 1EQPA 3WH8A 3PZQA 1HKJA 2YL9A 1PAMA 4PTXA 5CSYA 5E6YA 3A3HA 2CYGA 1WZAA 3S2CA 3F5KA 5IFPA 1HNYA 3CUHA 4TX6A 5BWFA 1JDCA 2J77A 1UWUA 2CKSA 2JALA 1WB0A 3KL0A 4W5ZA 2D24A 1MXDA 4DWSD 3WMCA 4UQDA 3SCRA 3OG2A 4PTVA 3FAWA 1WE5A 3W28A 1GOQA 1TZ7A 2WC3A 1Q4NX 2XFYA 4D71A 4B16A 1JD9A 3ARTA 1XD1A 3KEHA 2EEXA 1WP6A 5A6BD 5F7UA 3WDJA 1CEOA 4NZCA 1SMAA 3CLWA 3ARVA 4H41A 1TUXA 5FIPA 2YL5A 2DH3A 2YKKA 3VDHA 2UY4A 3PZNA 4AZ6A 2G3NA 1CYGA 2WCGA 2FGLA 3CIVA 3KE0A 1XH2A 3CZGA 3SIMA 3AIUA 1R86A 2DSWA 1U30A 1CXEA 4JL2A 5CQ1A 4DUXA 4LXFA 4PMUA 4FLSA 2Z1SA 4PMQA 2XIBA 2PI6A 1NOUA 3EMQA 5BXSA 4DUWA 3THCA 1XSIA 1FP8A 1HP5A 4GQQA 4CN6A 4TOQA 1UA3A 4UFLA 4JHOA 1MVYA 3WF3A 3ARQA 4F9JA 1W2PA 4P7LA 2GSJA 2BXZA 3AXIA 1CGUA 2DSKA 3OGVA 1NOWA 1H1NA 3GXFA 5CPSA 3VGBA 3EMCA 1LQ0A 5AC5A 1V08A 5DT5A 4GZJA 4J7RA 1BGAA 3WDRA 4HOXA 2XHYA 2TAAA 3DECA 1NWRA 1PJ9A 1Y7VA 1OCQA 3APGA 2VMFA 4TVUA 5I79A 4PMNA 4ATLA 5HBFA 2Y5EA 3T2PA 2J8GA 4AMCA 1EO5A 4ZXOA 4BF7A 4D6CA 1PX4A 2DT0A 2WHKA 5DFAA 3OIHA 1JAKA 1QI0A 3ZMRA 2EPOA 2VZUA 2WKLA 4BCEA 1CPUA 1BG9A 1UR4A 2CHNA 1GQIA 2OWCA 1TA3B 1CLXA 2OSXA 2FHCA 3WEZA 3WD3A 3AIQA 5CLTA 1V3HA 4M1RA 1VFOA 4CCDA 1TG7A 2YLLA 4HZ8A 4MB1A 1JNDA 1R87A 4H8UA 2D3LA 2X0HA 1W3LA 1BVNP 1EHAA 2VX4A 2ZUSA 1H5VA 1JZ2A 1OINA 3AIWA 1E6PA 2CITA 3BMVA 4BQ5A 3B9AA 1B30A 4HU0A 3CTTA 3I3DA 4IISA 5HDRA 4MB5A 4UOQA 3UCQA 3WDPP 1GORA 4GPNA 1LG2A 1EHNA 4DWSC 3KL5A 3OB8A 1UD3A 2W62A 3T09A 1UA7A 2VQUA 4PN2A 1V02E 1JZ8A 1E1FA 2WHLA 1UWRA 3VVGA 1M04A 4ACZA 1EXPA 3IANA 2JE8A 1VB9A 2XPKA 2PWEA 3EDFA 5E70A 4WIWA 1E0XA 4M82A 2J7CA 3AHZA 1ESWA 3MMDA 3FXYA 3GBDA 2BV9A 2PWDA 4PMRA 3RM4A 5IFTA 2WVVA 1GONA 1UD4A 3FY1A 4S3KA 1CGWA 2VZTA 1CNVA 3GXIA 1JZ5A 3LPFA 3WQVA 2A3BA 3N11A 1GVYA 1WKYA 4M8UA 2GJXB 3W26A 1HJWA 1BF2A 4NRRA 3D5HA 5I5RA 1WDSA 2HISA 1B9ZA 4JKLA 4LGXA 3MSDA 2QHAA 2WHMA 4AZGA 1WNOA 1BPLB 2XJ7A 3I3EA 1XH1A 4PYSA 1SMDA 1UR9A 5HXMA 3WNOA 1QNPA 1BTCA 3WNPA 1R7AA 3BLPX 5JIWA 1PX8A 4TUFA 1KR0A 1OGGA 3ZSTA 1BGGA 3PZTA 3T2OA 1VEPA 4ZFMA 3L4ZA 3AXXA 4GI9A 4Z2KA 4EE9A 3CUIA 5FOOA 1XYZA 3VGEA 4LX4A 1GZJA 1O7AA 5FL0A 2J7GA 4AZCA 4DWSB 5BCAA 1TMQA 2CETA 5A8MA 3WH9A 1KCLA 1ODUA 4JCLA 4TTUA 2A3AA 1KR1A 3II1A 2CKRA 4CU8A 3CHFA 4Z2GA 3D3AA 3N12A 3KZSA 3AIBA 1QBAA 3FAXA 5BXRA 3WL1A 2J7BA 2Z1KA 1ISZA 5A2AA 4V28A 2WVUA 1C7TA 1CXLA 1GNXA 5A94A 4JZ5A 4WKAA 1TR1A 4J3VA 1PZ3A 2A3EA 5JBEA 5DT7A 5EFFA 1HN1A 1CZ1A 2J47A 1KCKA 5CGMA 1UKSA 2WWDA 3K8KA 3CZLA 4A3HA 1BFNA 4OOZA 2J7DA 1UD6A 3WD2A 5HNNA 3QR3A 4CVUA 2GK1B 1NP0A 3BLKA 3THDA 1PIFA 1BSIA 1DWAM 2ZUWA 4AC1X 4M56A 1Q6DA 2CESA 2ZX7A 3AS1A 1CXKA 4U5IA 5A2CA 2YBUA 3ARZA 3CUGA 4X9YA 4CCCA 4YHGA 3VMNA 1MQQA 3CZJA 2EBNA 1FH7A 1QI4A 2WPGA 5CPQA 3L4WA 2E8ZA 1HIZA 3VIFA 4WSJA 4HU8A 4CN4A 1FOBA 3GDBA 1JD7A 1GJUA 3AISA 1UKTA 2VR5A 4FLQA 3VIJA 3OBAA 3QHNA 3AHVA 1HJUA 1W9BM 4IM4A 4PTMA 5D8ZA 1YHTA 4OOUA 3WUEA 2E9BA 5EFDA 4AD2A 2XGIA 1A3HA 4AZ7A 1GJWA 4JFUA 2ZXAA 3AOFA 1V03A 1QNOA 2IXVA 2WBKA 3GH5A 3VO0A 1AVAA 3K1DA 3L4TA 1R85A 3EYPA 4R27A 4H8VA 1UH3A 1W32A 2VCCA 4M29A 3MUAA 4CD7A 5A8QA 2AMGA 5LA1A 1CGXA 3WMSA 2YA2A 1W3HA 2V3EA 2VT0A 4BA0A 1KXQA 2DH2A 3WENA 1CBGA 4M24A 3EBVA 4JCMA 3CPUA 3UERA 1KQZA 2YDRA 3UEQA 4FLOA 4WLCA 1R7OA 5FD0A 1UUQA 3UR7A 2Y8KA 5A6SA 1MYRA 1JFHA 4TVDA 4YHEA 3VIIA 3A4AA 2FHFA 1VFUA 1UR0A 4W8AA 4X0VA 3RM9A 5ABGA 2BY0A 4JHZA 1UWTA 1HVXA 4HZ7A 4MTVA 5BROA 1C8XA 3ARSA 1RP8A 1QW9A 3AYSA 4P7OA 1EA9C 1J0ZA 1NH6A 4CN1A 5BYWA 1MW0A 4QP0A 4D6GA 2PB1A 1M01A 1MW2A 1ZJBA 3NJ3A 1JYWA 2EXOA 1J0YA 1DWIM 3GH4A 5M5DA 3WUGA 1QHOA 4OJYA 3IJ9A 2UY3A 4F66A 5CPTA 4BS0A 4EANA 3W27A 1KGWA 4K68A 1E40A 3WH5A 5C71A 3BAJA 4D6FA 1VJZA 4V2XA 5C8BB 4J3XA 3W6MA 1WZLA 1CWYA 3W6LA 1MWOA 4Z2LA 1S46A 1JFXA 4Q7NA 4HOZA 1V3MA 3SUWA 3ARUA 3BAKA 3GXMA 1RH9A 3MUY1 1IV8A 3WQ4A 1J10A 4RE2A 5JIPA 1JYXA 4MJ2A 5D4YA 4UR9A 1OIFA 1GOIA 2WB5A 2XG9A 4U3CA 1WZKA 1W91A 1FP9A 5GNYA 1DHKA 4J28A 4H7VA 3WELA 3QGVA 3VGHA 1E5NA 2X09A 5LA0A 3A4WA 1IZJA 5EMYA 1PEZA 3WMBA 4ATWA 4PUDA 3UETA 4OBRA 3ALGA 3IK2A 1J12A 4NSBA 1QNRA 2VL4A 3FNDA 1W9PA 1O6IA 1W1YA 4QAWA 2YA1A 3WBAA 4CD4A 4WF7A 1KWKA 4W8LA 4HA1A 3RCNA 2UY5A 2VVNA 3ECQA 3B9DA 4GZIA 1LF1A 3K4DA 1HJQA 3HU7A 1W2VA 1FH8A 2HVMA 1E4IA 4P7QA 3ARYA 1ISXA 5EBAA 2VTFA 3SCOA 5CGTA 3RJXA 3TA9A 4GI6A 1JGIA 1XHGA 3MV11 1C8QA 1L0PA 2G3IA 1E73M 2ZUUA 3WNLA 3WQ6A 2BHZA 1EOKA 4P8WA 3NIYA 3MUIA 1OB0A 5E6ZA 2J4GA 2J62A 1C93A 2J7HA 2QF8A 3AI0A 4D6HA 2OSYA 2E8YA 5I24A 2XUCA 3MKKA 1KFWA 3WD0A 3RM8A 1GOWA 4TXEA 3BCDA 1E6XM 5AYIA 4W86A 5A69A 3VD7A 3BAXA 4GQRA 3RDKA 3RILA 1E6SM 2CBIA 4RE4A 5A6JA 4KGLA 1W3KA 1NOFA 1CTNA 1Q6FA 2WAGA 5I3DA 1E6NA 1AQ0A 2Y2WA 1GQKA 1V3IA 4GKLA 4P7NA 1OM0A 2ZE0A 4B3LA 5I2UA 1EO7A 1W1VA 1HXJA 5E0FA 1WDPA 2D1ZA 5HPCA 4ACZB 3CUJA 1BAGA 1E43A 4RE3A 4J3UA 2WSPA 5IDIA 3AS2A 2F8QA 5BRQA 1JZ6A 1W1PA 2ESCA 2PBOA 1E55A 2GFTA 2J7FA 3UR8A 5A6LA 3ZT5A 4ATDA 3AMKA 2JIEA 3ZT7A 2CBVA 2WVVB 4GO9A 3VM7A 4JAWA 1QPKA 1ZL1A 3RPMA 3VDAA 3HMCA 3MANA 4FK9A 3HJEA 1VEOA 2DSUA 3VOCA 4W89A 1ISVA 1SYTA 4OUEA 4CUCA 1V0MA 1NM9A 1V0LA 2X0YA 4HA3A 2J75A 1BYBA 3LPPA 2E4TA 3RMEA 4E8CA 4KMQA 3KL3A 1BLIA 1MXGA 1CGVA 1V02A 3OLDA 2VX5A 4UOJA 4WK9A 1HT6A 1TCMA 1UZ4A 4UQCA 4GINA 4HOWA 2OWWA 4C7DA 1PIGA 4KRTA 3W37A 1NWTA 1MW3A 1XD0A 4RL3A 5A3HA 2QMKA 4E2OA 2GDUA 3GM8A 3AZTA 1CLVA 2QLYA 3GH7A 3LMYA 4PSPA 3N18A 4MNKA 4ZXLA 4EK7A 5DMYA 4B9ZA 2ZXBA 4MNJA 1C92A 1TFVA 1JIBA 4F9DA 5CSUA 5AC4A 1ZJAA 3A4XA 1EDTA 5BXPA 3K8MA 3CGTA 2IUZA 5M03A 1FHDA 3O6AA 2VZOA 5FCZA 2EJ1A 3PZIA 2ZUNA 3NSMA 3EMZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4URI A;  2XVK A;  4FLR A;  3PTK A;  4UQ9 A;  2YBT A;  2EQD A;  2VVS A;  4HME A;  2WMI A;  5BRP A;  2QMJ A;  1GVI A;  5DF0 A;  4D6E A;  1W9D M;  3PN8 A;  2VZV A;  2VZS A;  2A3C A;  2WCA A;  1MFV A;  1LWH A;  2DGA A;  2E3Z A;  5D9O A;  4AY1 A;  4CD6 A;  4AZI A;  1DED A;  2EPK X;  2JF6 A;  4W7V A;  4GIA A;  1E4L A;  3E1F 1;  3ZIZ A;  4TVC A;  2BXY A;  2E9M A;  3PTM A;  2YL6 A;  3I3B A;  5D8W A;  1QNS A;  1XSJ A;  5AYB A;  5E09 A;  4WKH A;  1EQC A;  4W87 A;  3DC0 A;  2BNJ A;  3PZM A;  3WEO A;  1V3J A;  3VIH A;  3NYD A;  3U7V A;  1GQL A;  1BQC A;  1FFR A;  3N1A A;  4WKF A;  1JI1 A;  3BAY A;  1V3K A;  3ZM8 A;  5EB8 A;  1ZU8 A;  1DWF M;  3VU2 A;  3FHQ A;  5M3W A;  4AIU A;  2C0H A;  3VIK A;  5GNZ A;  4A4A A;  4GXP A;  1VJS A;  3O2L A;  2XM1 A;  4QCE A;  5A6K A;  3ARO A;  2WNW A;  4GO8 A;  3WFL A;  3TP4 A;  2YJQ A;  5ABF B;  1GCY A;  5LA2 A;  3AZR A;  2AAA A;  3MMW A;  1ISY A;  1B3W A;  4U2Z A;  2XM2 A;  1US3 A;  1WZM A;  3T0B A;  1XH0 A;  3WF2 A;  2E40 A;  4FMV A;  2CHO A;  3DYM A;  3UG3 A;  3BSG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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