2G95 | Genus

Total Genus 153

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	153
sequence length	476
structure length	456
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKVKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVSENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVSKKGRLSLHRTPAGTFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of Visfatin/Pre-B Cell Colony-enhancing Factor 1/Nicotinamide Phosphoribosyltransferase, Free and in Complex with the Anti-cancer Agent FK-866 pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Rattus norvegicus
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus	153
structure length	456
sequence length	476
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-03-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2g95A02

3NOEA 2C14A 3VI2A 3EX1A 3GAYA 1WX0A 1KBJA 5CPLA 4JXCA 2FLIA 3TW7A 1GQNA 3VFLA 4L4MA 4WUIA 4WJEA 4ZL1A 4XTDA 2A5HA 3NDOA 1GZGA 3TDFA 2LLEA 1TPH1 6TIMA 5FF2A 2ZZ4A 2Q8LA 5LKYA 4UTKA 5AYZA 5FF4A 5D30A 3O05A 4JDYA 3HG4A 3GVGA 3LERA 2Y63A 3TKFA 3OVQA 3WJSA 4POCA 2J9YA 4AAJA 1TTIA 3CIWA 3NL2A 3RMJA 1ZAHA 2QUVA 3LCFA 2GQ9A 3LOTA 1OF8A 2Y70A 4GWEA 1SPQA 1DKWA 1FDJA 3ATZA 5CGQA 3TNOA 1MEWA 4A21A 1LRTA 3NQCA 3TW6A 1JVNA 3LM7A 4KFOA 3LI0A 1W54A 4IGHA 1M7OA 1TPWA 2AGKA 2PE4A 4HNVA 4PA8A 1ADOA 3VE7A 1ICQA 5DBTA 4N9CA 3WK2A 1GEQA 1TV7A 1ZHAA 5C2XA 1YLVA 1VH7A 3L21A 3C2EA 5MHBA 4WY0F 5BOOA 4MYXA 1QPNA 2I9EA 3P81A 4PL1A 1QDSA 3LBCA 3NQFA 1KV8A 5FF7A 3WJYA 4IMFA 3RLUA 2BTMA 5F1UA 2FPVA 3PY2A 4MY1A 2P0OA 3EX6A 2XN1A 1KFCA 3IRDA 1GVRA 2B7NA 5SWUA 3Q2DA 5E93A 4JIPA 3O1NA 1IIHA 5I3FA 3UQNA 2NX3A 2A21A 3BW2A 2OX1A 3UZJA 2R91A 3ZWTA 4Q33A 4WD0A 3MWAA 1I45A 4QAIA 1KA9F 1OABA 2O7QA 3T55A 1TYGA 1JRBA 4GJ1A 4PTNA 3W1XA 2TPSA 1B4EA 4IMGA 1IXPA 1JQXA 2VC6A 2ZBTA 4IPJA 1Q6QA 4TO8A 1TRDA 1JCLA 1SW7A 4KWWA 3W70A 2QCFA 2WJZA 3L5LA 4NX0A 3PBYA 3EXSA 3A9IA 2R94A 3EKLA 4CQ9A 4UFIA 3AJXA 4Q32A 1LCOA 4O11A 4O14A 4XUGA 4O28A 4TMBA 3KAOA 3STCA 4UNLA 1S5WA 5GVJA 3DI1A 1I2RA 3O06A 3P5ZA 2BWGA 5KSWA 4LC8A 4K7VA 1KLZA 1TQJA 1PIIA 1TPDA 4BK9A 2HS6A 4RK8A 4CCDA 5AHNA 1A5CA 4QITA 3B8DA 5C5YA 1F73A 3GDKA 3EX2A 4UTMA 4GUHA 1YDNA 4JNMA 4FIRA 2QUTA 1AG1O 2DU2A 2NV1A 3W1PA 3TFCA 3EWYA 1LRNA 2H6RA 1G4TA 1K8ZA 5HR7A 4PL2A 1EIXA 5G2HA 3S1XA 4OE7A 1H7NA 1FXPA 4JTTA 3W75A 4MIMA 4ZZ9A 5D2XA 3DH7A 3UWUA 4PC8A 3PWAA 2H3DA 3W6YA 4O0KA 1LROA 3TSMA 5FEZA 2BXVA 4CNNA 2YFOA 4DEFA 3PR2A 5DBUA 3GDTA 5DLCA 1FY6A 2ISVA 3LCXA 4DO5A 5F4XA 4GUIA 4DBDA 2QDGA 3MHUA 1FWNA 2RFGA 1Z41A 1JQVA 1V5XA 3GR8A 4O1DA 1BTMA 2Z0IA 1GPWA 3QSTA 4K39A 2VEKA 3L65A 1W5OA 5EYWA 1SO4A 2VFHA 1VCFA 4DXVA 2GVLA 3CC1A 4O15A 4JY9A 3TUUA 4EOUA 1I2NA 2XN2A 2E6AA 3USBA 1RPXA 2I1OA 3JRKA 4XKYB 1OFEA 2FB3A 4IWWA 4RV8A 3W7PA 5AYXA 1H7WA 3RNDA 4O57A 2E09A 1LLWA 4A3UA 3KOFA 4MKNA 5C6MA 3H53A 3P67A 2YYTA 3GXTA 3MYOA 1M5WA 4O53A 3T7VA 1ICSA 5EMUA 3QM3A 3STFA 1R2SA 4JTHA 3GDMA 2R14A 4FEZA 3NYZA 3PBUA 4EVZA 2X16A 2Y89A 4JTGA 4D2JA 2QJHA 3NR0A 1GWJA 1BWLA 1DV7A 2QCNA 3NQAA 3TSDA 1HL2A 1DHPA 2HSAA 3G1SA 1VHNA 4NJHA 4Z1AA 4OWGA 1A5SA 2A2IA 1TPUA 2QJGA 5F2MA 4JDBA 5HJLA 1BKSA 1LP6A 3DI0A 4ZMGA 4X3ZA 3TAOA 3TC7A 1YPFA 3UY8A 1H63A 1QOQA 3IV3A 4L4LA 2ZZ6A 1RR2A 3QQ0A 5BRBA 2X1SA 1GVQA 3MHGA 3UD6A 1YPIA 4I7UA 1L9WA 1XCFA 1MEIA 2E6YA 3OHIA 3W72A 3QQ1A 4TMCA 3W76A 3WJXA 4NNBA 3PBWA 3ELFA 3TQVA 2EAWA 4FX8A 4WQ6A 5L9FA 2EGZA 1LLZA 1UB3A 3HJZA 3DHDA 2NX1A 5CG7A 5AHLA 3SGUA 1J2WA 1QR7A 3M47A 4N02A 3VKJA 4DBEA 3HB9A 3PUOA 1K8XA 3CQ0A 2E6FA 1RZMA 1FWWA 1ZJIA 1OFPA 2RDTA 5D2VA 1SR9A 3I6RA 3C8FA 2HTMA 1YTEA 2ABAA 1GJPA 5AHEA 4BWLC 2DJXA 2W0UA 5FF3A 2JBMA 1O5XA 3KVLA 3M6YA 4UMAA 4JYDA 5H2ZA 3NM3A 1WBJA 5EA9A 3C0JA 1VQTA 3LGEA 4PODA 3V75A 3MI2A 1ME7A 2DORA 3LCHA 2A7NA 4UMBA 4DO4A 3T78A 5LNUA 1OFQA 2E77A 3EWUA 3NPVA 2DZPA 1TPB1 3GR7A 4P61A 2RHGA 4HNUA 5D33A 4ZQMA 3O07A 1K7XA 3I68A 3W87A 2C1HA 3W7GA 2ZZ1A 3PG9A 4ONVA 2X1TA 1OYAA 2ISWA 3HOJA 1D3GA 4QNEA 2PRHA 5IBXC 3RK8A 1OHLA 1U5JA 2VELA 4QNWA 1P0KA 2OMAA 5AHIA 3R12A 2Y62A 3CB8A 1HO1A 1XDMA 2CLKA 1G4EA 1WOAA 1KLYA 2FJKA 3V1PA 2YYUA 5D2TA 1TPEA 3M5XA 1KM2A 3LHZA 3VE9A 1C8VA 2VENA 3LHVA 5LGXA 4Z1DA 2NLIA 3TE9A 4HT3A 1K8YA 2YDAA 1H1ZA 3CHVA 2OZ0A 1J4EA 5D2WA 3N19B 3PB2A 3W2NA 2ATSA 3W7EA 3WFAA 2A7RA 3MBDA 3E96A 4JYEA 2ZRZA 1OVDA 2PRMA 3EX3A 1NAL1 4NUWA 3W3OA 2NXGA 3CM4A 3IVSA 2P1FA 3HIJA 1GYNA 2RH9A 3EKZA 1WBHA 5IM51 7TIMA 2V2HA 3BARA 3GAKA 1W3IA 3NQMA 1H7OA 1FX6A 1VCGA 2WO5A 3P80A 2YCEA 1IXNA 4CCEA 5HINA 1QPQA 3MJYA 1IIGA 3A23A 1A50A 5K4XA 2ZYFA 4K38A 4MLJA 1OF6A 3YPIA 2PRLA 1TMHA 3LTYA 1SZFA 4YMZA 3C3NA 2WNNA 2GVGA 5F4WA 1PVNA 4YCPA 5LNSA 5HNRA 1LORA 1NVMA 3LRLA 4FXSA 3BK0A 3TH6A 3P7YA 1JUBA 2Y61A 4GUGA 2CLMA 3NL5A 1YXCA 1K02A 2B7OA 2JK2A 3W1LA 3NAVA 4NX5A 4UTLA 3HO8A 1D3HA 3F4NA 4JTIA 3QW4B 4S2CA 2YR1A 4OV4A 1XC4A 3UWQA 1KM4A 4UTHA 1XXXA 2ZZ2A 4GXMA 3TXVA 1W56A 4UTIA 1WAUA 5AC8A 2CLIA 3EXTA 1Q3NA 3QPZA 2WSYA 1EEPA 3DAQA 4E2BA 3W7JA 5KZMA 4MZ8A 2Q3OA 4UC5A 4JX4A 5A5WA 3LXBA 3LLFA 4FNPA 3R89A 2QCLA 4LRSA 2NUWA 3LDVA 4RLIA 1B57A 1E51A 4UTTC 3TROA 1F7BA 1W37A 4XBKA 3B05A 1SSDA 5DY3A 3W1QA 3GDLA 2D73A 3ABRA 4DPQA 2VFGA 3S6DA 3W1RA 2B4GA 4P2VA 4MFEA 4ORMA 2Y88A 1SQ7A 1I2PA 3UNDA 3LV6A 3PSVA 3W7LA 4QQ3A 1H5YA 1F5ZA 4Y9AA 2V2DA 3PF3A 3TJLA 4XZ9A 1MZHA 5TQLA 3HG2A 1XFBA 3NQ8A 4WY0A 2YXGA 4JTSA 2G96A 3TQKA 1I2QA 4O4WA 3PUDA 1PHWA 4FNQA 1GVSA 4Z1CA 4JS3A 4O0ZA 1ZCOA 5U7SA 1P5BA 1ZY9A 1JRCA 1Y0EA 1QO2A 2E1DA 3DGRA 3S1VA 4YCOA 5G5IA 5HULA 3FJLA 1Z48A 4O1BA 2A4AA 5D2YA 1H50A 4WZHA 1HO4A 5CZSA 4WX2A 3NQEA 1PL9A 2QAPA 4AWSA 5K4ZA 1FCQA 1JUKA 2X30A 4K6AA 4ZQNA 4ML9A 3W71A 1A53A 5C55A 4JY8A 1EUAA 1P4CA 1LOQA 2X2GA 1R2TA 3TA6A 3HBLA 1S5VA 1XI3A 3MMTA 2QUUA 1EB3A 1OX5A 3G1DA 1EWEA 3EXRA 4AHPA 3B0VC 5TBOA 1Z42A 1TB3A 4GUFA 3UXDA 2G97A 2VFDA 3M1ZA 4WOQA 4RXFA 3UPWA 1KW1A 3IIOA 4MLRA 1YDVA 1GVFA 1PE1A 1KTNA 3DFSA 1XBZA 1KM0A 5J5RA 3EWBX 2DZXA 2OT0A 3QW3A 4RZ4A 4MPQA 2Z1BA 3EWZA 2Q3RA 4GUJA 1DJQA 4LS0A 4R53A 4UTUA 3B0UX 1W1ZA 3HG5A 3G1HA 4FNRA 2NXIA 3B06A 5LZLA 4LVDA 4LS2A 3EB2A 2Y6ZA 1O5KA 4WOZA 2GQ8A 1DQXA 1QMLA 5AYYA 3QRHA 2EKCA 3FA5A 1KFEA 2FQIA 4KWVA 4AEOA 2CZEA 3L67A 2P10A 5K9CA 4RKAA 4BF9A 1OYCA 4EF9A 1D9EA 4H4IA 1O95A 4LVGA 3HPXA 4LV9A 1FXQA 3BW3A 2ZCGA 4JX6A 2NV2A 3P8IA 3QSRA 4KFPA 5FF0A 3UZ5A 3MP3A 5D05A 3LBMA 2IQTA 4IMCA 4UXDA 4DELA 1N7KA 4N4PA 5ABTA 3NXFA 1G6CA 3LX9A 2H8XA 5AC7A 3ABSA 2CZFA 2FTPA 3N14A 3S1UA 1WA3A 3QC3A 3QPYA 1B9BA 2QCMA 3RFAA 3SW6A 4R34A 3TXZA 2F84A 3DFOA 4OQVA 3S5OA 2W79A 1VHCA 1HFBA 4A29A 5KITA 1JUEA 2ZZ5A 3QEZA 5G4WA 3NZ1A 2VEMA 5CZJA 3GYEA 3QMSA 4BI5A 3GNDA 4LVAA 1Q6RA 1H1YA 1YDOA 3W2KA 4NXSA 3G18A 3HMJG 3G0UA 2W6RA 2ZTKA 1EPXA 1FWTA 3TU9A 4MY9A 2C19A 4O13A 3W7DA 4C1KA 2WSQA 2Q8ZA 2H3BA 1O4UA 1AW1A 3SECA 2C3ZA 2WNZA 2QR6A 3GZ3A 4JD4A 3M43A 5G4EA 1LBLA 2OJPA 2EHHA 4BI6A 3D0CA 1SUXA 4O54A 3TMQA 3TQ0A 3PVFA 3A22A 5G1TA 4JICA 3O16A 4JTFA 1VYRA 2ABBA 2B7QA 3MP4A 4GRSA 1RVGA 1ZAIA 3FFSA 4YLWA 1K7EA 2E5BA 8TIMA 4Z1BA 4IX2A 4X9SA 3O6YX 1AK5A 4N9BA 3W7IA 1YTKA 1FCVA 1TPC1 2E68A 2C15A 3NQ2A 1GOXA 4MYAA 3PULA 5CZTA 4C1LA 3PG8A 1YTDA 1M6JA 2QF7A 3KVJA 4QIUA 3NA8A 3W07A 1PS9A 2FIQA 1M7PA 4HNTA 3FOKA 2C18A 2J27A 4JTEA 3N9RA 4JEQA 1VGAA 4AHQA 4DF2A 4EF8A 3IIPA 2FPTA 1O60A 2WV8A 2C6QA 1WXJA 5U4NA 3W2LA 3NL6A 1P1XA 3GNNA 1TPFA 3IGXA 5HUOA 3KRSA 1AMKA 3LTSA 3ZFHA 2ZA1A 2CZ5A 5D04C 4AF0B 1VC4A 5H91A 4H3DA 3CPRA 1U83A 3NPWA 2VKZG 4CCCA 4NU7A 4CQAA 1F76A 3ANYA 1NEYA 1TV8A 1VLIA 3P74A 4WXZA 3JS3A 1PV8A 4RZ5A 1T99A 3R8RA 4PH6A 4HPJA 1R30A 3GKAA 4BI7A 2WQPA 4CNPA 3W1NA 1LRQA 3DKLA 4O16A 1TQXA 1UUMA 2ALDA 2WSRA 1TTJA 4NJJA 5LNRA 3NG3A 1SW0A 3M7WA 3OIXA 3TX9A 3ZR4A 2J6XA 1OX4A 4IUOA 1DJNA 3SR7A 5CZ0A 2Z2UA 5HWJA 4BWLA 1R2RA 2V9DA 1KTCA 1SO6A 5EY5A 3A5VA 3KRUA 5CPNA 3L0KA 4FF7A 2CLHA 3ZS4A 2WPBA 3MBFA 1VPXA 1UASA 1C9DA 5BW6A 1R46A 3OG3A 4E0CA 3W22A 4UNKA 1BEUA 4MZ1A 2ZRVA 1LYXA 2WKJA 2X1UA 3G22A 1UJPA 1XM3A 1OK6A 2ATMA 2YFNA 3W2JA 3S42A 1FQ0A 1WOBA 2ZTJA 3FKKA 3S1WA 4G1KA 1XL9A 4Z0JA 3QMRA 2JKPA 4I7VA 4TIMA 1ZFJA 5KINA 3W83A 2A85A 3R13A 2J24A 3KRZA 4ADUA 4A22A 1LTDA 5IBXA 4I7WA 3C2VA 2V81A 4FX7A 3HG3A 4HN4A 2OCZA 4NVTA 5D37A 4FNTA 5EBUA 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2DZTA 3PC0A 1OFRA 4HKPA 2ZRWA 4UTTA 2Z6JA 2CLFA 5DCBA 1W5PA 5F1VA 3EEGA 2QKFA 1B3OA 1K7FA 3LXCA 3GKFA 6ALDA 2PURA 4JTKA 5I3KA 3SFKA 4RXGA 2FB2A 1EP3A 2V30A 3DHFA 2A1YA 3IIXA 1XBVA 1EWDA 4XWUA 2Y85A 3C2FA 3T44A 1A5BA 1NF0A 1V7YA 1W8SA 4IXHA 3BO9A 4RJEA 2GOUA 3S5YA 1SSGA 3W9ZA 4YL2A 4O8RA 3I7SA 3WK0A 4BR1A 1JULA 1TREA 1QNVA 2G95A 4OHQA 5BNKA 4ADSA 4MVAA 4ICNA 1LZOA 2YW3A 2DZSA 3S8HA 4O50A 4J9JA 3TC6A 4HSOA 1UBSA 1J5TA 5F4SA 1GTHA 3LXAA 5K3VA 2YGYA 4FIQA 1RV8A 4UFHA 1LBFA 4UUIA 1HUVA 4IQLA 5DCDA 5LNVA 3FJ6A 4QSHA 2GJNA 3BLFA 2NZLA 3LLDA 2PC4A 1X8FA 3GB6A 3OA3A 3NQDA 3TIMA 4RR4A 2X1RA 5G2WA 1T96A 4FNSA 2VEIA 1OFOA 5KTLA 1G4SA 3DFTA 4NNCA 1DORA 1RD5A 4GFSA 3F03K 4O1CA 4NZJA 3NM1A 4S2BA 1K3UA 4ZQRA 2CZDA 5AHFA 4K37A 2RDWA 3Q58A 1NF7A 3G8EA 4XBSA 3W7QA 1A5AA 5DN1A 1QO5A 3GIYA 1DOSA 3L2IA 4UTJA 5D32A 1LOSA 1ALDA 3M41A 4Y6GA 4ZQPA 5DXYA 4E38A 3O6DA 1ONRA 3W1UA 2C16A 1EUNA 3I7RA 1H62A 1H51A 2GUUA 4YWIA 1W0MA 2B7PA 2TMDA 3UXAA 3INPA 3DU0A 2KZHA 3F1QA 3UPBA 2O7SA 5BMXA 4HNNA 5G2IA 3PM6A 4N6FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2G95A

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