2G96 | Genus

Total Genus 151

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	151
sequence length	475
structure length	463
Chain Sequence	FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVSENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGTFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal Structure of Visfatin/Pre-B Cell Colony-enhancing Factor 1/Nicotinamide Phosphoribosyltransferase, Free and in Complex with the Anti-cancer Agent FK-866 pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags	Transferase
source organism	Rattus norvegicus
total genus	151
structure length	463
sequence length	475
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-03-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2g96A02

1M7PA 1W5MA 1QPQA 2V2CA 3GLCA 3L0NA 4YMZA 3PG8A 4X9SA 5I3KA 1EX5A 2YDAA 3H55A 1W5NA 1I8JA 2TMDA 3LTYA 2QCGA 5HR6A 1JCLA 1PVNA 3L5MA 3ANYA 4EF8A 2OJPA 2V2HA 3Q58A 1OF8A 2ATSA 1SFJA 4MOZA 4XBKA 5LKYA 2CLMA 3CIWA 4UXDA 1Q6LA 2C18A 2E6AA 2V8ZA 3P5ZA 4FNRA 3DENA 3B05A 3L0KA 1KTBA 4YXGA 1FCUA 1I45A 5F4SA 4LVBA 3O06A 3DAQA 2NV1A 1FWWA 3DKLA 1HUVA 5CSSA 2V2DA 5G2WA 2RFGA 1L6YA 4UFMA 1KV5A 1QNVA 1HFBA 1VHCA 3KAOA 1FDJA 4K36A 3UPWA 2QKFA 5LHEA 3MP3A 2E09A 2G5WA 4NNBA 1VCVA 4IX0A 3B0UX 1THFD 2ZA3A 3W7JA 4ML9A 1Z41A 2W0UA 3G3MA 1H61A 3EX3A 4O28A 3W71A 2FB3A 3SZ8A 2QUVA 4FXSA 4MIMA 3C4UA 3TFXA 1WQ5A 4UTWC 4MY8A 3FA5A 3SSJA 3BLEA 1BWKA 3GZ3A 3TAOA 5EMUA 3EWXA 3PM6A 3GR8A 1JRBA 1O94A 1XL9A 1SQ7A 2J24A 1TB3A 2QDHA 5F1UA 2JGYA 4UTTA 2YFOA 3PBVA 1DKWA 1SW3A 1C29A 3NO5A 3NL3A 2Y7EA 3GX9A 1F76A 4FNTA 4Z1AA 1XUZA 2WQPA 4GJ1A 4LRSA 1K03A 3PBWA 1LP6A 5CSRA 2YZRA 4S1FA 4PCFA 1ML1A 1JUEA 1VYPX 4IXXA 4GNJA 3HIJA 2TYSA 1DHPA 3TCEA 4JICA 3O16A 1ZHAA 2EF9A 2FDSA 3UWUA 2CLEA 4NX0A 3I7QA 4HSOA 2CW6A 3L5LA 1U5JA 4MYXA 2PE4A 3W7CA 2PRLA 2X1SA 4CCEA 4OBTA 2ATMA 4O18A 1W37A 1L2UA 1LZOA 2VFIA 4NUWA 3W2MA 3BGJA 3PWAA 2ZRVA 1EWDA 2QCFA 4UTJA 1NAL1 2JKEA 3M5VA 2EGZA 5AC7A 3P81A 3M44A 4KWVA 3W1MA 2HMCA 4IMDA 5F4WA 2E77A 2WPBA 4MZ1A 2QCLA 1X1OA 1QPOA 3LBCA 3LOTA 2WJZA 2V9DA 1YXYA 2CLLA 2JKAA 3KVMA 1RR2A 4CNOA 3W1RA 1A50A 1G6CA 4MFEA 1N7KA 3L5AA 2E6YA 3HMJG 3G24A 5GVJA 3N19B 3KVLA 2NX1A 2LLEA 1AW2A 3NPXA 2V0TA 3S8HA 3FJLA 4PEKA 3C56A 4O52A 2XFWA 3FKKA 1YPFA 2RKXA 1SO5A 2CWNA 3EXRA 4O4VA 5IBXA 3NZRA 1T8XA 2CFFA 3Q94A 4DO6A 1OABA 3S1VA 2ALDA 5LSMA 3SGZA 3BW2A 4OV9A 3KXQA 4NU7A 1FWRA 1GVFA 2JK2A 1JCXA 2BZNA 2UV8G 1K7FA 3F1QA 3IGXA 2I1OA 4DO5A 3OBKA 3M5YA 2TSYA 5D32A 1JCMP 2AQWA 4JTGA 5BOOA 3G18A 2YYUA 4ZVJA 2A7RA 4K39A 3TA6A 3W2UA 1S5TA 1XM3A 3KRSA 4GRSA 5HMSA 4EVZA 1HTIA 1KBJA 1GVSA 3G1VA 3Q2DA 4BF9A 2QCMA 4Z1CA 1JQVA 4PL1A 1GVOA 5CZ0A 4BWLC 3P74A 3DI1A 3NQAA 1F73A 1PHQA 3H54A 1M7OA 5TIMA 3TK7A 3IVSA 1WX0A 1TPFA 1H7WA 5EPDA 2CZDA 4NJGA 5LHFA 1EP2A 3R8RA 2FPTA 3DI0A 4B5NA 4JTTA 1DBTA 4O1DA 2R91A 3W1TA 3EKLA 1YTDA 3LCHA 3VNDA 4AWSA 4O57A 4TMBA 1RPXA 3NQGA 3OA3A 5BMWA 3KVJA 3W85A 3BLIA 1LYXA 2DZVA 4UFIA 4O0ZA 1B4KA 1XDMA 1H7OA 1H1ZA 5HUOA 4JGDA 2QAPA 5U7SA 4DELA 3GKAA 4BI7A 1NVMA 1X1ZA 5K3VA 5HQEA 4NZJA 2CLFA 6ALDA 2Y62A 4QNWA 4JTIA 1XDLA 3A5FA 1S3HA 3VFLA 2NUYA 2DZSA 2XN2A 4LY8A 3IGUA 2E1DA 3M16A 5EKYA 1BTMA 1XUUA 1PS9A 2Y7GA 3CQ0A 4CQAA 4UCGA 3P7YA 1YLVA 5AYZA 1WA3A 3R5EA 1LBMA 4WQ6A 5BW6A 3C6CA 1PCKA 3N9RA 1PHWA 3P61A 1UUOA 3BVJA 4N9DA 3W1XA 3ZS4A 2CU0A 4Z1DA 1QCWA 2QEZA 3BW4A 2BLEA 4WXZA 4AXKA 1NF7A 1QFEA 6TIMA 4MJZA 3UWQA 4O1CA 4K38A 2QUUA 3JRKA 5L6UA 4WXYA 4PL2A 1OFEA 2VEMA 3P67A 4K7YA 3W74A 3ZWTA 3C52A 2ZFAA 2V5LA 3U6WA 5D02A 1QMLA 3STGA 2FPYA 2F7FA 3L2IA 5D38A 1PV8A 2A6LA 3NPVA 2YW3A 2ZTJA 3LI0A 2NWSA 3P5YA 5CPMA 3WK3A 1SZEA 3KX6A 3TQKA 1TYGA 1EIXA 4JR5A 3THAA 1FXPA 1P1XA 4Q33A 4MVAA 1DV7A 5AHFA 4LRTA 2DP3A 5CZJA 4DPQA 3QW4B 2QR6A 5DXXA 4O11A 4OQVA 3IIXA 5AHEA 1K8XA 2GQ9A 4O1BA 3NZ1A 4E38A 2TRSA 3TAKA 1LM1A 1B4EA 2A1YA 2A6NA 4WZHA 1XC4A 4P2VA 2GJNA 4ADUA 1HO1A 3W7RA 2NXIA 3GDKA 3EKZA 2WNQA 2B7PA 1D9EA 3S1UA 4Y6GA 1IXNA 1RQEA 4LT9A 1KFKA 3ABRA 5FF4A 5EA9A 5E93A 2VEPA 4O19A 3N14A 3HOJA 3NL5A 3SR7A 1YDOA 4GUJA 4Q32A 4ZZ9A 1OYCA 3S42A 1RD5A 5K7JA 3C0JA 5SWUA 4NNAA 1QR7A 1WOAA 3NGJA 1KM1A 1OYBA 2DJXA 3MUXA 4M5PA 4NJHA 2ABAA 2QJHA 3UZ5A 1TPVA 4JS3A 5DBUA 4FIRA 4LTSA 3QMRA 4AWTA 2A0NA 1SPQA 3LERA 3GDTA 3TC7A 1R2TA 3CIXA 1F7BA 3G1YA 4FO4A 4KWWA 3KVKA 1LROA 1H7PA 4IXHA 2Z2UA 2YFNA 2WOQA 1R2RA 4XTDA 3L67A 4Z0SA 4JIPA 1T0OA 2VFEA 2E5DA 1KBIA 5G1YA 1S5WA 4TO8A 1KTCA 3HJZA 1GQNA 3U8GA 2YXGA 2B7OA 1OK4A 1WBHA 3G0SA 4E2BA 4JX4A 5DCDA 3BLFA 4EOUA 3U2OA 2QJIA 4JIQA 1G69A 5KITA 1F2JA 3EWWA 2B7QA 1TTIA 1O5KA 3YPIA 2J9ZA 4IMFA 2G96A 2CLHA 2Y63A 4AF0A 5G2IA 2P0OA 3BG3A 2DZWA 2VEIA 1KM5A 1H7XA 3W76A 4QNEA 3LRMA 1XI3A 3JS3A 1CW2A 3NQ7A 1Q6QA 3GK0A 4GBUA 3L0GA 3S9YA 8TIMA 4ZQRA 3ZFHA 2J9YA 4UR7A 5DXYA 1DVJA 4LVAA 3NL2A 3N2MA 3O05A 1KM6A 1G4TA 2OMAA 3FJ6A 2FJKA 3O1NA 2VEKA 3T4CA 2FQIA 3HO8A 3L21A 1F5ZA 5C5YA 3W1LA 1G4PA 4H6KA 1F6PA 4BI6A 4E0CA 4M7SA 3W22A 1NSJA 2E6DA 1NFBA 2CLKA 4QSHA 1Q3NA 4MY9A 1UJPA 2FIQA 4HNUA 3EWUA 3S0CA 4AF0B 3HGSA 1EUAA 1W5PA 2CLIA 2WO5A 3JR2A 3TMLA 3W2NA 2C14A 4CNPA 1VGAA 3MHGA 1X7FA 4ADSA 2DZUA 3NQEA 3D0CA 2ZCGA 1YTEA 4AHQA 3BPWA 2YYTA 4BR1A 1IF2A 5T26A 4K37A 2ZZ7A 2HS6A 3THQA 2OZ0A 2PC4A 4MUZA 1X6UA 3TQVA 1SFLA 3KFTA 3LX9A 3TNOA 4Z08A 3QPZA 3MHFA 2Y6ZA 1YTKA 3CHVA 4AAJA 2BX7A 4JX6A 4NXSA 1GYLA 2EAWA 1IIGA 2WNZA 3I6RA 2V30A 4UFKA 5K9CA 4POCA 2ISWA 1O4UA 1LLZA 1DJQA 3SFKA 4ZQPA 5CG7A 3F4WA 3L9CA 1C8VA 3ABOA 3LCIA 1XBXA 1WAUA 2ZDRA 3I7SA 3NNTA 1JUKA 5E1QA 1GG1A 1YDNA 3A24A 4U4MA 3W2LA 1TPC1 4ICNA 4UTMA 4PODA 3GXNA 2OX1A 3LCFA 3QSTA 4IJBA 2Z6IA 4O15A 1SUXA 3GAYA 3EX6A 3I7RA 5D2XA 1VYRA 3ZWSA 2VENA 5DY2A 4UFJA 1JCNA 1W3NA 3P60A 2A21A 1H7RA 4RLIA 1KTNA 4CCDA 3DFOA 4RV8A 3HQ1A 1EPXA 3S1WA 2ZRUA 4J9JA 4FEZA 1ONRA 1VRDA 4AHPA 2VOMA 4JTUA 1OFOA 4I9AA 3A23A 3PC0A 1EP1A 4NJJA 4O14A 3W7OA 3C2VA 4MLJA 4O4WA 3O63A 3QF0A 4WD0A 1UUMA 1W3TA 4HHPA 1X8FA 4TX9A 4X3ZA 5FF7A 4QITA 3G1XA 1V5XA 5LGZA 5HWJA 2ZZ4A 4ZQNA 1WBJA 3P8JA 4PA8A 1MXSA 2Y61A 3DGRA 3W1UA 4DEFA 3C2RA 5HUPA 1TCDA 5FF0A 4ZQMA 3CB8A 5LNRA 5AC8A 3N9SA 1EB3A 1Z44A 2FPVA 2WSQA 4OWGA 3LLDA 1K8ZA 3RF9A 3TXVA 3NQDA 4DF1A 2PRMA 2Q8LA 2Y7DA 1MSSA 2C0AA 2PRHA 3T7VA 5FEPA 5LNUA 3UY7A 3FIGA 4LNYA 4PC8A 1QAPA 4XQ6A 4KKXA 3O8AA 3UWWA 1RVGA 5D2WA 1A5BA 2OT0A 5CZSA 1GZGA 1QOPA 2G95A 1JCYA 3HGOA 2OT1A 4K8EA 1SZGA 3TJLA 4RK8A 3G3DA 4NX5A 4JY9A 3SY5A 3W1NA 1VH7A 1W1ZA 3MI6A 2TPSA 1VLIA 5EY5A 2QCNA 1TPWA 3DU0A 3MW7A 1IXPA 2NZLA 4UTWA 3PBYA 3F4NA 1SW7A 4IMGA 1GT8A 1WYIA 2J88A 1OFRA 3EX2A 2VFDA 4GUIA 2YGYA 5DY3A 1TPB1 2F84A 3IIVA 4IQLA 3CT7A 4XZ9A 4HNNA 1F6KA 3ELFA 3USBA 4AVFA 1G4EA 4N6EA 3BW3A 5J5RA 3BV4A 1J5TA 4JD4A 1H1YA 3NM1A 3OVQA 3FS2A 2HSAA 2H90A 2WSRA 1JUBA 1QWGA 5FEWA 4LUJA 3M5XA 3RFAA 3O6CA 3PB0A 1YYAA 3BGGA 1PE1A 5BMXA 3B0PA 3QSRA 3QQ0A 1K7EA 1KM0A 3TE9A 1P4CA 3GNDA 4A2RA 1MEHA 5AN7A 2NUXA 3R12A 3LM7A 4CNNA 5BRBA 1XFBA 1HG3A 5AHNA 4AH7A 1FDZA 3HG3A 5I3JA 5F4XA 2RDTA 1TIMA 2C6QA 3BG9A 5CPOA 2HTMA 2QCEA 3QM3A 3NQMA 2Q3OA 3PUOA 1JJKA 4O1AA 2FLIA 1YXCA 1LRTA 2VC6A 4JTSA 1A53A 4O54A 3ABQA 3QZEA 1ME7A 3NPWA 3W70A 5KZMA 2ZRZA 1SZNA 2VKZG 5AYYA 3RLUA 3S5NA 4O50A 2RDUA 5H2ZA 3UPBA 4N02A 1HO4A 1FCVA 2C15A 5G4EA 1W5QA 5D2TA 4LV9A 3HPZA 1LBLA 4X2RA 4JXCA 3FYPA 3QFEA 3OIXA 3CEUA 1RQBA 1VZWA 3HG2A 4S2BA 3GDMA 4JX5A 3UWYA 3NPUA 4UMCA 1PCWA 4D2JA 2ZZ5A 4FF7A 4LVFA 3N34A 4OHQA 5G2HA 3RU6A 5HWNA 1AL8A 3WK0A 1GOXA 3R2GA 1LLWA 5TBOA 1KLYA 1G67A 1OVDA 3QQ1A 1KM4A 1RV8A 4DPPA 3W1PA 2C3ZA 2VELA 3G8RA 3STFA 1E51A 3W75A 4OT7A 1FXQA 3LGEA 1SZFA 4WOQA 3KRUA 4XTIA 1LRNA 1I4NA 3LCXA 1XCFA 2QUTA 1VR6A 4IPJA 1K8YA 3UWZA 3PY2A 5DCBA 2AGKA 4UTIA 3E49A 3QYQA 3CU2A 5I3FA 2ISVA 2YW4A 3SGUA 5J5DA 3W7MA 2Q8ZA 2B7NA 2DJLA 4U28A 3QJAA 3B8DA 1R47A 2CZEA 3FYOA 2GOUA 3KRZA 3TSDA 1ICSA 2JBMA 3CM4A 4RXGA 4WY0F 3FOKA 1TTPA 1KLZA 3GR7A 5HNRA 4NT0A 1PIIA 2GVGA 1JVNA 2GQAA 1ZNNA 2H3DA 2W6RA 5FF3A 5TQLA 3PVFA 3RMJA 1W3IA 1VCFA 4K8HA 5HULA 4MZ8A 4BWLA 1TPH1 3HPXA 2X2GA 4FNUA 2PURA 2R8WA 4H4IA 4JYEA 5A8GA 4PTNA 4RX0A 1I2RA 2A85A 5CKSA 4MY1A 2P10A 5D2YA 3W6YA 2HS8A 3LDVA 1XXXA 3DFQA 3S5YA 5AHMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2G96A

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