2G97A

Crystal structure of visfatin/pre-b cell colony enhancing factor 1/nicotinamide phosphoribosyltransferase in complex with the specific inhibitor fk-866
Total Genus 156
50100150200250300350400450020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
475
structure length
463
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVSENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGTFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN
50100150200250300350400450400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
publication title Crystal Structure of Visfatin/Pre-B Cell Colony-enhancing Factor 1/Nicotinamide Phosphoribosyltransferase, Free and in Complex with the Anti-cancer Agent FK-866
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 156
structure length 463
sequence length 475
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2006-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2g97A02
2CLOA 5HR7A 1FCVA 3T4CA 5A5WA 1FCQA 2AGKA 5J5DA 4NU7A 4UTMA 3C61A 4PCFA 3QC3A 2RDUA 4I7VA 4O11A 1R47A 2H8ZA 2XN2A 4LVBA 2TYSA 2TSYA 3GVGA 3TH6A 1L2UA 2VELA 3MBDA 3GDKA 3S6DA 4AXKA 5DBTA 3QPZA 1P1XA 2ISWA 5KITA 1IXQA 3NQFA 3W1NA 5AHNA 3HG4A 2CZEA 1OX5A 3QEZA 4XTIA 3BG3A 3TAOA 3W07A 3VCRA 2ZBTA 4A22A 3R8RA 1GTHA 1C29A 1UUOA 5TQLA 3G1VA 1R46A 5F2IA 1I2PA 4N9DA 4FB7A 3E02A 2VEIA 3B03A 3TROA 4M6QA 5C55A 3TW7A 2DZUA 2DZXA 3SR7A 1IXNA 4JR5A 1R30A 3GK0A 1W5OA 1KM2A 1WOAA 1NF7A 2B0MA 1X8FA 1VRDA 1W3NA 1H7WA 3N9SA 1QOQA 2Y62A 3P8JA 3PY2A 4O0ZA 2G96A 2H6RA 3L66A 3RLUA 1TJPA 1VGAA 3BLEA 1SW3A 3I6RA 1VLWA 3LCGA 4CQ8A 5I3GA 1JCJA 1VCVA 2XFWA 1TCDA 5CSSA 1H1ZA 2YYTA 3DHDA 3UWVA 3BLIA 1JCXA 4UTTA 4UTUA 3B04A 3NPWA 3I7SA 3G1HA 2CLMA 1W5QA 3W7GA 3R2GA 2QJIA 3C2OA 3HIJA 1LBFA 1BEUA 1DJNA 4N2YA 4DQWA 2QJHA 3BGGA 5EYWA 1H7NA 2HTMA 3BO9A 3CPRA 1QO2A 2P1FA 1JUKA 1DV7A 1ZJIA 5CKSA 3CIXA 1VJIA 3GIYA 3KRSA 3GNDA 3M6YA 5AN7A 3HGSA 3G18A 3QSTA 4FXRA 4RXFA 5DLCA 5DCBA 2VEMA 3EXRA 3DAQA 3W83A 3W7OA 2VFEA 3GKAA 2EGZA 2QCFA 4Q32A 3RF9A 4K7YA 5D38A 4QSHA 3H53A 2E09A 1H1YA 2BZNA 4O15A 2VKZG 4XKYA 4CNNA 3STEA 3A5FA 4O13A 4XBKA 4LUIA 4O50A 3TCEA 3W1MA 4LVGA 1SZGA 4HNVA 1JULA 1FDZA 5AOUA 3MI2A 4XWUA 2QUTA 3B06A 4IPIA 3W1XA 2BWGA 2YPIA 5F2LA 3T44A 4IMEA 4LS1A 4FX6M 3TJXA 1H7XA 2NXHA 4O54A 4E2BA 2NWRA 2QAFA 2J88A 1ICQA 5K2ZA 2GJLA 1ICSA 2O7SA 3W84A 3MP4A 4WXZA 1F74A 2YYUA 5LNWA 4O1DA 4NNBA 4JDYA 2QCCA 5C6MA 3OG3A 4MPQA 2ZA2A 4KWWA 1I2OA 1RD5A 4A2RA 1HO4A 3FKRA 3H54A 2ZZ2A 3LB0A 4JDBA 4QISA 4ADUA 5FF4A 1XCFA 3QQ1A 2ZRXA 4FXSA 2C14A 2Z6IA 4Z1DA 4Y6GA 3A22A 4NT0A 4ML9A 5DXYA 5LNVA 3N9RA 4OU1A 3GAKA 3DH7A 3LI1A 1OF8A 2Y6ZA 1W54A 3W86A 3QZEA 4LNYA 4WY0A 1TPWA 4IQLA 3BK0A 1EA0A 3GAYA 2JGQA 2W0UA 3RLVA 3UWUA 5F2MA 1GYNA 3P61A 3N19B 5CZ0A 4NQ1A 3ABSA 3W1RA 4UTLA 3WJXA 3PUEA 5DCDA 1FWNA 3ZS4A 3I65A 4UFLA 3EWWA 5IM51 4NJGA 4X2RA 1FY6A 3CU2A 2G97A 2QR6A 4MVAA 2GQ9A 2ZZ5A 5K9CA 3BG9A 3DHFA 1OFRA 1KTCA 4JYEA 2F84A 2AAMA 2Y7EA 3GDLA 3UY7A 3ABQA 4MJZA 1TIMA 5IBXC 1ZAIA 1ZNNA 3STGA 4Z1CA 3HQ1A 4POCA 1QFEA 2DJXA 2ZCGA 3LHWA 1LBLA 1W1ZA 4AHPA 1BTMA 5AYYA 1AW5A 4CCCA 2Q8LA 1N55A 3OVPA 4YL2A 4Z0JA 3B0UX 1OJXA 3NQ6A 1TB3A 2Y7GA 5LKYA 1ZAJA 3NL6A 2RDTA 4JEQA 2P0OA 1G67A 2Q3RA 1JCYA 3QYQA 5TBOA 1OFQA 3M1ZA 3KAOA 3WJZA 4BWLC 4RZ6A 3FFSA 2ZZ1A 3L65A 1OX6A 3TR2A 3HOJA 1OK6A 3LRLA 1VR6A 2HS8A 3DFTA 4OHQA 4S1FA 4ADTA 1N8FA 3LCWA 1U5JA 5LHEA 5F2GA 1WV2A 3FYPA 3G1SA 8TIMA 4MFEA 2Y63A 5KINA 1TTIA 1SQ7A 3HG2A 4KKXA 1TO3A 5D33A 3LI0A 3GDTA 5LGZA 4MKNA 4U4MA 2ZZ7A 3SGUA 5AHEA 3MI6A 3M16A 1F6KA 1SZNA 3E96A 3W7IA 3M5ZA 3M7WA 2Y70A 1KTBA 1QO5A 3A9IA 3NQAA 1QR7A 2VFFA 2YW4A 3LHTA 4DF0A 1I45A 3V1PA 2CFFA 2NUXA 4JX5A 1LORA 2X1SA 5G2IA 1TJRA 4Y96A 1F05A 2UV8G 4PODA 3BGJA 4MZYA 2YXGA 1PL9A 3S8HA 3EX2A 4O4VA 2QCMA 3IVUA 1LBMA 4JD4A 1OFEA 4O14A 3LTSA 3C0JA 2QUUA 4LV4A 2GVLA 5CZJA 1UB3A 2B7NA 4L4MA 4JTJA 2DZTA 3NM1A 1GVFA 3FJLA 2QCEA 3MBFA 4K37A 5DBUA 3JRKA 2C19A 1XBXA 1E51A 1WBHA 4GC4A 2VFIA 3NNTA 1D3HA 3OBKA 3W73A 4OGZA 4WXYA 2WQPA 2GVJA 2PC4A 1GJPA 2EPHA 1JRBA 2DZPA 4JTGA 5D02A 3MI3A 4FNPA 4WD0A 1JCLA 6TIMA 1G4EA 1VZWA 1SW7A 4GUIA 4ZQRA 1XI3A 3G8EA 4HSOA 3M41A 1VLIA 1FXPA 4Y9AA 3GX9A 1R2RA 3W71A 1WDWA 3C6CA 3NA8A 1NVMA 3S42A 4RZ5A 1TV7A 1NFBA 2X2GA 3PBUA 1FWWA 1JJKA 2NZLA 1VPXA 3W72A 3W76A 4UFKA 4N4PA 1OHLA 1Q6QA 3RFAA 3UPBA 3LBCA 1A53A 2ZRZA 3NG3A 1XM3A 4JGDA 4E0CA 1X1OA 3HPZA 3DKJA 5I3IA 3L5AA 2D73A 1PIIA 4IMDA 4UXDA 3MHUA 1I2RA 3P80A 5AYXA 3NQ2A 2NXGA 5FF0A 2QCGA 3P84A 3HF3A 3HGJA 2ISVA 1SZFA 1F5ZA 3LHZA 3TE9A 3PWAA 2YGYA 3W2UA 3PBWA 2PE4A 1F6PA 4OWGA 4J9JA 3EX3A 5F1VA 3S5OA 1D9EA 1VHNA 2YZRA 4LRSA 3PG8A 3W7DA 3SECA 1ME7A 2ZTJA 4MY8A 4UTTC 5HWNA 4LS2A 1QDSA 2WNQA 2A0NA 3FA5A 1L9WA 4RK8A 5IBXA 5K4XA 1YXYA 4IOTA 2A85A 1YTDA 3ZWSA 3W9ZA 2ZDRA 4QNWA 3PBVA 4I9AA 3W7KA 3GKFA 2FFCA 5I3KA 2NX1A 3CWNA 1W56A 4H4IA 1K3UA 3DXIA 3G8RA 4LVFA 4Z1BA 1Z44A 4I7WA 2JK2A 3B0VC 3KVLA 2WSRA 3MP3A 3C56A 5SWUA 4NNCA 3QM3A 1GVSA 1WX0A 2PRLA 3HGOA 4TMCA 4FX8A 2RHGA 4H3DA 4EWND 5DN1A 3TJLA 4BWLA 2V0TA 2BTMA 3G1DA 1WOBA 3M47A 5FEPA 3ZR4A 1OFDA 2XN0A 2BX7A 1KM4A 4OBTA 3NZ1A 5C2XA 1K7XA 1QPNA 3DFOA 3BW2A 4N9BA 3NXFA 2W79A 3LERA 3O6DA 4JTEA 4AWSA 1KA9F 1V7YA 2B7OA 4EF8A 1DQXA 4HNNA 4NJKA 1YDVA 1Q6RA 1VYSX 3PB2A 2J9XA 2WV8A 2ALDA 1GZGA 1TPUA 1ZCOA 1EUNA 4FIQA 3K30A 3DFNA 2O7QA 1LTDA 3ATYA 4UUIA 1JVNA 2YW3A 4GUFA 1MEIA 1TQXA 3C2FA 1H51A 1VYRA 4Y90A 5FEXA 4GUGA 5T26A 3TX9A 3IVSA 1G4PA 1XL9A 1KLYA 2YDAA 3JS3A 3WK3A 2Q8ZA 3UZ5A 2JKAA 1KM5A 2VENA 1FUYA 1TMHA 4M6VA 2CLHA 4NX0A 5H2ZA 5AHFA 3DENA 3TC6A 1A5SA 1T8XA 3UXAA 1MEHA 3IIOA 3WK0A 3IEBA 2WSQA 1W5PA 2E6FA 5TIMA 3L2IA 2FQIA 3QW4B 2B7QA 2DU2A 3TXZA 1EEPA 3P81A 3N2XA 3L0KA 4IJBA 1OFPA 1SFJA 2Z6JA 3W2JA 2R14A 4XQ6A 1DVJA 1B57A 3EX4A 4WUIA 3SY5A 1O5KA 2GQAA 3MWAA 1XBVA 3O6YX 3W85A 3BW3A 4X3ZA 3DU0A 1ZHAA 1G69A 2FB3A 2X30A 5KZDA 1K8XA 1SPQA 2LLEA 3LCLA 1LM1A 2YSWA 3W6YA 1PCKA 2VEKA 2A7RA 2Z2UA 1P0NA 4M5PA 4FHAA 1VS1A 3LXAA 5G2WA 1WXJA 2J24A 2WJZA 2I14A 3LV6A 4GUHA 3EKZA 3P5ZA 1IIGA 1PE1A 1S5WA 5LNRA 3IIXA 3L67A 1SSGA 3SZ8A 1GQNA 1FQ0A 1PHWA 1SO5A 1KV8A 3KHJA 2OT0A 1LCOA 3NQGA 1EP2A 3HPXA 3NPXA 3EXSA 2ZFAA 4OE7A 5KSWA 2ZRVA 3ANYA 4JY8A 2OZ0A 2YCEA 5EY5A 5CPLA 3C2EA 4BF9A 4DO6A 3VKJA 2A4AA 1R2TA 3EX6A 1L6WA 4ZQOA 2NXIA 2WO5A 4TX9A 1IXOA 4AB4A 4QAIA 1W5MA 3L5LA 3PVFA 1O60A 2H3DA 5GVJA 1I8JA 2QJGA 3HGRA 3W7MA 2QUVA 4JYFA 3PBYA 2QCDB 4RZ4A 1AL7A 2AQWA 3NL5A 1FCBA 4ADSA 4AWTA 4RX0A 5BNKA 2B4GA 2A21A 2NX3A 3L21A 3O1NA 4PFMA 1HUVA 4AHOA 2Y85A 2C0AA 5DXXA 4XBSA 4M7TA 2TRSA 2VFDA 3C4UA 1R2SA 1K8YA 1MXSA 3G22A 3QF0A 1TPC1 4DBEA 4JIPA 3R89A 4G1KA 4AAJA 4JXCA 5CZTA 4H6KA 3TQKA 1ML1A 2QF7A 3W87A 4JNMA 4M7SA 1K7FA 3W75A 1RV8A 4ZVJA 1AK5A 4UTHA 5EMUA 1H61A 3SSJA 5LHFA 2NV2A 3TMQA 1YDNA 2C3ZA 2DP3A 1Q6LA 4MUZA 3TIMA 4WY0F 1SZEA 2E6YA 3W1AA 7TIMA 1KM3A 3UYCA 1RQBA 3GDRA 3WJWA 2Y7DA 4KFPA 4WX2A 3LDVA 5F4XA 1NEYA 4MFDA 3YPIA 2J9ZA 5CPMA 5EA9A 3HG3A 3KOFA 3RMJA 2ATSA 1M7PA 4Z0SA 3RU6A 3N73A 1SFLA 1P0KA 1FWSA 2CWNA 5EPDA 2ZA1A 1K03A 1OF6A 5LZLA 4A29A 2G5WA 2DJLA 1YTKA 4BI5A 1QPQA 3UY8A 4O57A 1FWTA 1LOLA 3MHGA 4FNUA 5BMWA 5FI8A 3C8FA 5I3FA 1XDLA 1VHCA 4HPJA 1ALDA 3NL2A 4EF9A 1B4EA 2VC6A 1HFBA 3EWYA 5D2WA 3R12A 4N9CA 2H3BA 3DFSA 5LNSA 1TV5A 3IGUA 3NQVA 3MHFA 1O94A 3QMSA 2VXNA 2QCDA 5K9DA 1H5YA 3M0ZA 4LU0A 4TU1A 1WBJA 1RZMA 1VYPX 4LC6A 1YXDA 3NAVA 4KFNA 5D30A 3MJYA 1LRNA 5DELA 1HL2A 4NXKA 5HMSA 1W37A 3PAJA 4RLIA 4QM1A 2I9EA 1C8VA 1LP6A 3W7QA 2Y7FA 4UR8A 5FEWA 4K8HA 1O5XA 4MYAA 3W88A 5AC7A 4TMBA 3WK1A 5AC8A 1ZENA 3CLMA 4ZL1A 5BRBA 3TFCA 2YFOA 3B8DA 4NJHA 4ORMA 3QPYA 4KFOA 4WOQA 2FIQA 4Z1AA 1Y0EA 4JY9A 4EIVA 1O95A 1TYGA 1KFJA 3T78A 1S5VA 2BSLA 3LX9A 5HWMA 4RJEA 2VFHA 1KFLA 1Q6OA 3HMJG 4CLMA 4NZFA 3BW4A 1GYLA 2H8XA 1GT8A 5D03A 1MO0A 2ZZ6A 4Q4KA 1DL3A 4E2DA 4OV4A 1DKWA 4E38A 3M5XA 3QFEA 1YLVA 1ZFJA 5D2VA 2GJNA 2ABAA 5L6UA 3BVJA 3DFQA 4JTIA 3CTLA 3S9YA 2NWSA 3SW6A 3A23A 1D3GA 3IIPA 3P8IA 1JCMP 3MO7A 4JTFA 3W74A 4LV9A 2QKFA 2Z0IA 4UNKA 3MYOA 3ABOA 1X6UA 4QNEA 1J2WA 3HG5A 1PVNA 4DO4A 2Q3OA 4HNUA 2A2IA 2OMAA 4IMFA 1QPRA 4RKAA 5I3JA 4HPXA 3UWQA 1OK4A 2V81A 5HINA 4LVDA 1XBYA 3M9YA 3WFAA 4QIUA 2FLIA 3P74A 1EIXA 3TA6A 3F4WA 1SO6A 1G7VA 1I4NA 3LHVA 4FIRA 3NL3A 4IUOA 1EWDA 5AYZA 4IPJA 2JGYA 3S1VA 3E9AA 3DBPA 1XXXA 3TK7A 4CCDA 3CIWA 3G3MA 1KV5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1KCX A;  4RL3 A;  2XVG A;  3C61 A;  3CJP A;  4PCF A;  4GIS A;  4PCT A;  3CK5 A;  1ESW A;  4LVB A;  4FS9 A;  1JZ5 A;  4J28 A;  1UOK A;  3TH6 A;  1L2U A;  3MBD A;  3S3G A;  2GDV A;  3S6D A;  1J0I A;  3GVW A;  3QPZ A;  5AHN A;  4XKM A;  1KBL A;  1QOX A;  1M01 A;  3VK5 A;  4J2P A;  2CZE A;  1EDQ A;  3U4A A;  3QEZ A;  2J47 A;  1GHS A;  1KB3 A;  3TOP A;  3R8R A;  1C29 A;  1UOZ A;  3MB9 A;  3GIP A;  3G1V A;  5ABF A;  3A64 A;  3S83 A;  1R46 A;  3WCZ A;  1ITQ A;  3VIH A;  3E02 A;  2VEI A;  1ODZ A;  2V5K A;  4QTG A;  3CMF A;  4A3H A;  1JDA A;  2G0W A;  2V3G A;  4M6Q A;  5C55 A;  2DZX A;  3SR7 A;  3V1H A;  1CGU A;  4JR5 A;  3P0W A;  2I16 A;  4KWU A;  2OOF A;  3VU2 A;  4KIE A;  2EEX A;  1H7W A;  1UKS A;  2VM8 A;  2Y62 A;  3PY2 A;  2DW6 A;  3WQC A;  3RLU A;  4RNJ A;  3WF4 A;  3AYV A;  5C7H A;  3BLE A;  5A8O A;  1O5R A;  1B9Z A;  4D8A A;  1VLW A;  5MKG B;  1VCV A;  3FAW A;  1HKJ A;  1IR2 A;  3W6L A;  5CSS A;  1H1Z A;  2P5N A;  3QV8 A;  1QNS A;  2YYT A;  3LPO A;  1JCX A;  3ITC A;  4AX7 A;  1XS2 A;  4D8Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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