2GVJ | Genus

Total Genus 147

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	147
sequence length	477
structure length	465
Chain Sequence	FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Molecular basis for the inhibition of human NMPRTase, a novel target for anticancer agents. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
total genus	147
structure length	465
sequence length	477
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-05-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2gvjA02

1W56A 3W2NA 3TC6A 1GYNA 3MUXA 3OHIA 5K7JA 2C0AA 2ABAA 3SSJA 4ZMGA 4AH7A 3L0NA 2ISWA 3PBWA 4MJMA 3VI2A 1LOQA 1VC4A 4IMDA 5EKYA 3VE9A 3QM3A 4YCOA 4QIUA 2E6FA 1PVNA 2VKZG 2ISSA 1GQNA 3HPXA 2CZ5A 1MXSA 3LHZA 3FS2A 4MYAA 5K9XA 3EX2A 1TQJA 1QWGA 1X6UA 4XTIA 3DFOA 3OG3A 5G2WA 4FNPA 3C4UA 3RFAA 2ZA3A 4MYXA 4FNTA 1SW3A 4ZQCA 3BGGA 4OT7A 1VR6A 3ELFA 3UNDA 4OHQA 5C54A 4NT0A 1M7PA 4UFKA 3G24A 1TMHA 3LCWA 3TV8A 5AYXA 3P67A 5BNKA 1KM0A 4JS3A 4UMAA 2VENA 1RZMA 1XCFA 5AN7A 6TIMA 1KM2A 4UTUA 1TSIA 3N14A 1LBLA 4HSNA 1MEHA 4GUIA 2ZTKA 3BLIA 3MYPA 4JTEA 1OX5A 1JCMP 1GVQA 4Y96A 3CLMA 3S5ZA 1OF6A 2GJLA 4RK8A 3HMJG 1TB3A 2V9DA 4PEKA 3NVTA 3NQVA 4E2DA 4PH6A 4CLMA 4YLWA 1F73A 2GUUA 3LHVA 3DU0A 3G1DA 3VNDA 1FCBA 3M5ZA 3EB2A 5HWNA 1HG3A 2FDSA 4QISA 4ADSA 5LGXA 1EB3A 4KFNA 4AWTA 4R53A 6ALDA 5HUOA 4Q33A 3DHFA 3KVJA 4ORIA 1AMKA 2VFFA 1VPXA 2A7PA 3L2IA 4GFSA 4UFMA 1ME9A 2PCQA 2Q8LA 3QJAA 3GAYA 2QAFA 4FIRA 3E96A 4LT9A 3MWAA 3P61A 4IUOA 1FXQA 1HUVA 2VFHA 1H50A 5AC8A 2WSRA 3ATYA 3GDTA 4N2YA 1X8FA 2R94A 4ZQOA 4IMGA 3E9AA 3B06A 1O4UA 1DKWA 2ZZ5A 5EBUA 1FDJA 4FNSA 4QITA 1QPNA 3QZEA 1EA0A 1H61A 1LORA 4IXXA 3HB9A 1TJRA 1P5BA 1VCGA 5G1TA 3SGZA 4O54A 3G0SA 5D2TA 1TTPA 1RQHA 2UV8G 3PG9A 5G2IA 2H6RA 1D3GA 3IVSA 3PB0A 1XFBA 4HNNA 1TPB1 3W2LA 2CFFA 3HGSA 1Z42A 3GB6A 4MLJA 3GNNA 1G4SA 1VQTA 2NZLA 2GQAA 3OVRA 1F74A 2TPSA 2ZCGA 1KM5A 2EAWA 3RU6A 2B0MA 4BI5A 3M6YA 3NGJA 3T78A 1QNVA 3GR8A 1JQXA 2DJLA 3PY2A 2DZVA 3E12A 1TCDA 1OHLA 4TR9A 1IIHA 3ZFHA 4ML9A 3LBCA 5AHEA 1KM4A 1T99A 3KXQA 1HL2A 4UTKA 1B4KA 3C2VA 3ZR4A 2IQTA 3LXBA 1M7OA 4Y9AA 1KV8A 3TW7A 4BR1A 1A53A 1EP1A 5U4NA 4LS1A 4AVFA 1QPQA 3JR2A 4UFLA 1QR7A 3CIXA 5AFDA 3W7JA 3TFXA 5KMYA 3NM1A 4Z1BA 3IEBA 1YPFA 2ALDA 2V2CA 3QF0A 4O17A 2X1UA 1DV7A 4KWVA 1Q6RA 3M44A 1EP2A 4JD4A 4O57A 3R5EA 1LLWA 3HOJA 3UWUA 2CU0A 4GC4A 3W7LA 3GKFA 2FB3A 4EIVA 1AW5A 3C2RA 1S5VA 2YR1A 3PF3A 1A50A 3H55A 3CTLA 2OT0A 1LDCA 3NPVA 3C61A 4NVTA 3UXAA 1I4NA 1TPH1 2NWSA 2A7NA 2Y7FA 5DLCA 4UUIA 3HQ1A 2B7QA 3LCIA 4L4LA 1IXQA 4TMBA 2D73A 3FYOA 4FEZA 2JKPA 1WYIA 1G7UA 2BZNA 5DCEA 1IIGA 4JY9A 2FIQA 4FX7A 1JVNA 1NVMA 2C16A 2TYSA 3S1VA 1WQ5A 3W1PA 3SZ8A 3MJYA 4HNVA 1A5BA 3IRDA 5DBTA 4E38A 4JTFA 3PVFA 4BWLA 1FX6A 1S5WA 3EX6A 3LCLA 3Q94A 4UMBA 5F2LA 3UXDA 3KVLA 2ZRXA 1OK6A 3IVUA 4NZJA 1A5SA 2DP3A 5I3JA 3CHVA 3HG3A 3UZJA 1J5TA 1MZHA 3HG5A 1UJPA 1N7KA 4NJIA 5G4EA 2NUXA 4RXFA 1PS9A 1ZHAA 1B4EA 3THQA 3B8DA 1KTBA 3QH2A 4DF2A 4MIMA 4O28A 4QM1A 2WNZA 5D33A 3GXTA 4ORMA 4JX4A 4NJGA 2VELA 1G6CA 3HF3A 3NAVA 1I2QA 3BO9A 5J5RA 2QJIA 3HG4A 3W7DA 4M5PA 4UNKA 3G8EA 3PUDA 4JTLA 1I2OA 2NX1A 3NQDA 3W70A 4YWIA 3QMSA 2QUVA 3OVQA 2B7OA 2KZHA 4YCPA 1OYAA 3H53A 4LU0A 4AXKA 2QUTA 3BGJA 3LRKA 3L5LA 4DPQA 3G3MA 4O1CA 3PR2A 1XBXA 3WK3A 2VEMA 3MBDA 3I68A 1SFLA 2J88A 7TIMA 4JYFA 3S9YA 2WNQA 1P0KA 5CZJA 3M43A 3MYOA 1PL9A 4DEFA 3M41A 1DHPA 3N9RA 4JTJA 3STFA 1G4TA 3DBPA 4Q32A 5G5IA 5E1QA 3P62A 1VYRA 1KFBA 1JQVA 5KZEA 3TXZA 1TRIA 3UPBA 4UTHA 3MI3A 3BW2A 2NXHA 4O16A 4ZQNA 4NNAA 4UC5A 3O8AA 5LHEA 3GAKA 1TQXA 2FQIA 3P5YA 2ZA1A 1YDVA 2F7FA 2WNNA 1K8XA 2RH9A 4N4PA 4WQ6A 3W7RA 4A22A 5HMSA 5K9CA 4K37A 3IIVA 1K02A 2EGZA 1K7XA 5K9DA 2EHHA 1HFBA 4K36A 1ALDA 4IPJA 4PC8A 5EYWA 3FLUA 3DENA 3LLDA 4AEOA 3W07A 3FOKA 3DZ1A 3TJLA 3M16A 4IX0A 5F2GA 1I2RA 5D09A 3W74A 4GUGA 4BF9A 4DO4A 4LV9A 5TIMA 2CZDA 2HSAA 3C2FA 4X9SA 3G1VA 4RKAA 4Z08A 3SIZA 1PHWA 5C2XA 3G18A 4HSOA 4S1FA 1W31A 3BARA 3FEMA 1VYPX 1RQEA 2ZTJA 3H54A 4O52A 2ZRVA 4E2BA 2QCGA 2Y63A 3DHDA 4ICNA 1NSJA 1GJPA 1TIMA 3GX9A 4YXGA 2GVGA 2JBMA 3R13A 5H91A 3O1NA 3CT7A 4MY1A 1NF0A 1KLZA 3E49A 2JGQA 1QOQA 2DZWA 1ZJIA 4WY0A 1KM3A 1FQ0A 1TV5A 3FYPA 4IX2A 4ZQMA 2C18A 3A9IA 3DFNA 2DZSA 4MVAA 4PTNA 4UXDA 1L6SA 4LUIA 4O12A 2Q8ZA 4K8EA 1RVGA 3UWZA 5DN1A 1UUMA 1W54A 5TBOA 1N8FA 1OABA 1L2UA 2G5WA 3SJ3A 3W1AA 1AW2A 4R34A 3U8GA 4D2JA 4O53A 1JCNA 3LTYA 1XDLA 4GWEA 4C1LA 1TV8A 3NPXA 3W7OA 1F2JA 3RLUA 5DELA 4O4VA 4XUGA 4OBTA 4WJEA 2FPTA 4WXYA 3A21A 1NEYA 1S3HA 2OX1A 3BW3A 2TSYA 4JYEA 2OCZA 4ZZ9A 1FDZA 3EWUA 1QPRA 1NF7A 1GEQA 1R2SA 2H90A 4QNEA 2YYTA 3W1NA 4WZHA 1Y0EA 1IXOA 1UB3A 1SW0A 1ZFJA 3STEA 4GUHA 3HPZA 3NZ1A 3S42A 4OV9A 1L6WA 4L4MA 2YCEA 1PV8A 1NFBA 5HWJA 4MZYA 3C52A 2VEKA 3KFTA 1OX4A 3OA3A 4JTSA 3GLCA 1WA3A 2DORA 1G4PA 1QFEA 1W1ZA 4K7VA 3A22A 5AYYA 1O60A 4AMAA 4NZFA 2ZZ4A 1FWRA 4POCA 3EX4A 5A5WA 4MOZA 1L9WA 4XBSA 3G0XA 4DXVA 2DZTA 1R30A 1KTNA 1MO0A 4KKXA 4UCGA 1D9EA 4LVAA 2Z2UA 1EUAA 4UTLA 4UIOA 1B9BA 1EP3A 2V5BA 4GRSA 3QMTA 1W3IA 3IIOA 4JDYA 3EXTA 4K7YA 4Z1DA 2E09A 3U2OA 3C56A 3LHYA 3QW4B 4M6QA 2B4GA 1P0NA 4LVFA 5K4ZA 2QCDB 1PHQA 1HTIA 3W7MA 2CWNA 4K38A 2Z6IA 4RXGA 2FFCA 4A29A 3QRHA 3IIXA 4TMCA 3PB2A 2CLOA 3HGOA 1SU5A 1XBVA 5BMXA 2Q3OA 3LOTA 3GZ3A 1UCWA 1GWJA 1UBSA 4ALDA 3CIWA 1KW1A 4ADUA 2NWRA 4Z1AA 2VEPA 1DJNA 3LTPA 2WJZA 5F1UA 3P84A 4X3ZA 3AJXA 1GTHA 2QCMA 1DVJA 1H7XA 3LGEA 3QSTA 4NQ1A 2BXVA 3IGUA 2DZXA 3LV5A 2H8ZA 1G7VA 3A23A 2BSLA 4O15A 3W84A 5AB3A 1SO3A 1KFEA 3TFCA 5HWMA 2FPVA 1TPFA 2QF7A 3N34A 2A21A 3HJZA 4ADTA 2ZA2A 4DO6A 1FWTA 1FBAA 1KFJA 1YTKA 4RX0A 4NX0A 3LM7A 4AHQA 4CCCA 3R8RA 1ZAJA 4EF8A 4O1DA 1HO4A 2P0OA 3R2GA 2RKXA 4G1KA 3LI0A 2A2IA 3LCGA 2O7SA 2E6YA 3TIMA 1FY6A 3LLFA 5D2YA 4CNNA 3NQ2A 1LLZA 1CW2A 1WDWA 1N55A 1XKYA 4WUIA 1XBYA 3DI1A 2PRHA 3S5OA 3GVGA 1TRDA 2TRSA 3EEGA 1W37A 1A5CA 1WBJA 4UFHA 4FXRA 4JICA 3STCA 3TKFA 3O06A 2QEZA 5AOUA 3S1UA 3I7RA 5AHIA 1SZGA 5L6UA 1O5KA 3W7KA 4LV4A 3NDOA 2YFNA 2BLEA 5KSWA 2C13A 3BLEA 3FA5A 4Y8FA 1YXYA 5U7SA 4M7SA 3TQVA 2CLMA 3N73A 1KV5A 1YADA 2PRLA 1C9DA 2NX9A 1K7EA 4IQLA 5EA9A 4DF0A 3P82A 1H1YA 3KRSA 1OX6A 3NL2A 1IXPA 2DJXA 3W1UA 5IBXC 4UFIA 4IXHA 4A2SA 1I8JA 3TNOA 1KM6A 2QCLA 5DCBA 3CEPA 4DQWA 3CWNA 4M6VA 5LNVA 3G1SA 4O4WA 4ZQRA 2E5CA 4UTTC 1BEUA 1RR2A 3P74A 1R2TA 3ZWSA 3DFSA 3OVPA 4O18A 4KFOA 4A3UA 3W3OA 3Q58A 1E51A 2ABBA 4N9BA 2NX3A 5D05A 3ABQA 4H4IA 3W7NA 4O14A 5F1VA 2QCFA 4O13A 2QCDA 5D2WA 1TTIA 1DBTA 2OT1A 2XN0A 5AYZA 3R89A 1H7OA 3A24A 1JRBA 1TPEA 3NQ6A 2JGYA 1VJIA 3KRZA 4LC6A 4Z0JA 3W87A 4I7UA 1XM3A 3PBVA 4GUJA 4Y6GA 2CLLA 1D3HA 2FPYA 3BLFA 5F4XA 5EMUA 1VS1A 3WJZA 2E6AA 1W3NA 4FNRA 3ABOA 3KAOA 4O0KA 2A1YA 2NUYA 5CG7A 1O95A 4O10A 4JTGA 3TE9A 1EPXA 1SO5A 3RF9A 5I3GA 4R7JA 3NYZA 2J9YA 5CPNA 1FDYA 2R8WA 2TMDA 2YFOA 3W2UA 1BWKA 2O7QA 5HINA 3ZS4A 3KHJA 1ONRA 3SR7A 4EWND 3QC3A 2HMCA 5FF4A 1XC4A 1H1ZA 3C6CA 1OFBA 4E0CA 3GXNA 3TQKA 2LLEA 1B3OA 2VXNA 5FEPA 2Y7GA 1KA9F 2WQPA 4IOTA 4FB7A 4O11A 1OFRA 3RLVA 5C5YA 3RNDA 1M5WA 5DXYA 3LERA 2PURA 3W6YA 3C2EA 4X22A 3SI9A 3TUUA 3CU2A 3TA6A 3MO7A 1OYBA 3HGRA 5BMWA 4BI7A 1LM1A 2Y85A 2A85A 4LS2A 1W5PA 2Z6JA 4XQ6A 4Y90A 3DFTA 5I3FA 1QDSA 4AWUA 1XXXA 3EWXA 2V2HA 4JN6A 5KZDA 4R33A 5LHFA 2R91A 5I3HA 5CKSA 4DPPA 3TSMA 2GVLA 2WV8A 4N9CA 3AO0A 5CGQA 4RZ6A 4ZL1A 5FESA 2Q3RA 5AC6A 2ZBTA 2Y61A 1VCFA 1ADOA 4NU7A 4U4MA 2FLIA 1JCXA 4ONVA 5FEZA 3W72A 4DBEA 5CSRA 1IF2A 4QJ1A 4YMZA 4XTDA 3W2KA 1RQBA 5LNUA 5DCDA 1AL7A 5G1YA 4MY8A 1JR1A 2QAPA 1XDMA 1FUYA 4OV4A 2CW6A 4JX6A 3C3NA 5BOOA 3S8HA 1GZGA 1JCJA 1Z41A 5D37A 4TIMA 1GT8A 3W7QA 3HPSA 3W7PA 5I3KA 1FCVA 4M6PA 3WK1A 3LXAA 3QEZA 2Y6ZA 3M7WA 3P60A 3W76A 3M5YA 1S5TA 3U6WA 1H7PA 3TROA 1C8VA 1SO6A 5IM51 3PAJA 3N3MA 3QPYA 4LC8A 4LVGA 3MP5A 1K3UA 1X7FA 4N6FA 3T40A 3O05A 1H62A 3LHWA 1KTCA 4N9EA 2ISVA 4PA8A 4MY9A 2QJHA 1LBMA 5LSMA 1IGSA 5CPOA 3VE7A 3W83A 1GVSA 3W2JA 3F4NA 2Z1BA 1YTEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2GVJA

Total Genus

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Chain Sequence

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