2GVJA

Crystal structure of human nmprtase in complex with fk866
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
477
structure length
465
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular basis for the inhibition of human NMPRTase, a novel target for anticancer agents.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 147
structure length 465
sequence length 477
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2006-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2gvjA02
3W76A 4PL2A 1PHQA 2TMDA 3DZ1A 3MBDA 4W9TA 3C2VA 1TJRA 4BWLA 3QYQA 1ZAIA 4BI7A 2WKJA 5BRBA 3GXPA 5K4ZA 1GYNA 3KRUA 2J88A 5HWMA 1K7XA 4O18A 4MYAA 1H63A 2NXIA 5C6MA 2A6LA 3E12A 3MW7A 3N14A 2V82A 3EWXA 2ZTKA 4GUJA 3RLVA 3GNNA 1L6YA 2O7QA 3IGXA 2XFWA 4RX0A 2QCDB 3LM7A 3RK8A 3Q37A 3GX9A 1ZY9A 4OQVA 4NNBA 4O1AA 2H3BA 2QCCA 2YXGA 3CIXA 3G1SA 1B9BA 1HO1A 4DO5A 3S8HA 1D3GA 3DHFA 2BXVA 4O8RA 4O54A 1YXCA 4I7VA 4OHQA 4GJ1A 3B8DA 4M7TA 4LC8A 1LRQA 4N9DA 3HGRA 3P84A 3QSRA 5C5YA 3LXCA 2QAFA 4KWVA 1H61A 2CLHA 5E0KA 1I45A 4K38A 4E0CA 2RKXA 1QOPA 2I14A 2PRHA 3FIGA 1P5BA 3C8FA 3N73A 5A8GA 1EX5A 1RPXA 1KFLA 3GLCA 4IMGA 3VNDA 2QDGA 4LOCA 4UMAA 4PEKA 4UFJA 5FEWA 3KFTA 5K2ZA 4NNAA 4JEQA 2V2CA 2Y7GA 3OVRA 3AJXA 4QNEA 2CW6A 3LCGA 3G8RA 1I2NA 1THFD 1W5MA 5F1UA 1XFBA 3C52A 3R89A 3PBVA 3I65A 4CCEA 2VKZG 2QEZA 3NPWA 3W1TA 1UUOA 4UTMA 1TPWA 5DCEA 5G1TA 3HBLA 1OFEA 1DL3A 4O0ZA 4ZZ9A 3LCIA 4JD4A 1N55A 5LSMA 1A5AA 4FX8A 4A3UA 1D3HA 5CGQA 1KM0A 1XL9A 3NGJA 4AXKA 3P8JA 2A7PA 1H7NA 4IMFA 4FNSA 3B05A 3JR2A 3SSJA 3E96A 2ZCGA 5LNWA 3P60A 1LOSA 1W0MA 5I3KA 3UWUA 3O15A 2DZTA 3M44A 3G0UA 2GVGA 1OHLA 1B57A 1U83A 1IF2A 4IXXA 2QCNA 3QC3A 1W31A 4LTSA 1VH7A 4X3ZA 1TTPA 3PUOA 1K8ZA 3SJ3A 3MP5A 1GVOA 1OABA 2A4AA 1H7PA 4R53A 3HPXA 3W1RA 4AEOA 1DQWA 2P0OA 3NQGA 1D9EA 2OT0A 1EUNA 3QMTA 1L6SA 3TW6A 2NLIA 2C6QA 1JQXA 2Q8LA 1FXQA 4LC6A 1SU5A 5KZMA 3CTLA 5DY2A 1TV5A 4NT0A 1WXJA 1OG0A 4TIMA 4UFIA 2B7OA 3N2MA 4OBTA 3O6CA 1LLZA 4UTWC 5LNUA 1YXDA 1K03A 3NQ6A 4YCOA 3W2JA 1XDMA 2GOUA 1C8VA 3VKJA 2Z1BA 3NAVA 3V75A 1VGAA 4XKYA 3O05A 4JY8A 4WXYA 3HQ1A 2RDTA 1I4NA 4O10A 5F4XA 1TPEA 1XUZA 1FBAA 5AYXA 4AB4A 5LZLA 3TCEA 3BV4A 2QCHA 3A21A 2YYTA 3GKAA 3SGUA 3M16A 3P67A 1UASA 5L6UA 1QWGA 2QUVA 5U7SA 2I9EA 1FWTA 4O52A 4M7SA 1AK5A 4UR8A 3HPZA 4R34A 3A5FA 3NDOA 3QRHA 2C19A 3LXAA 3C0JA 5DXYA 3ATYA 4MVAA 1CW2A 4O57A 5KMYA 1KFEA 3M5XA 4MFDA 3W7MA 3IIVA 1B3OA 5G2HA 4MKNA 2NV1A 1WV2A 3PG9A 5HR6A 1YTDA 1R46A 3P8IA 5FF2A 1EB3A 2NV2A 1NAL1 1MZHA 5KZDA 3W71A 5TBOA 5CG7A 4N2YA 2JKEA 1OX4B 3LV5A 4TR9A 2J24A 2BLEA 2NX1A 3L68A 3W2NA 2KZHA 4MZYA 3QJAA 5KTLA 2VEKA 3M6YA 1OF8A 4RZ6A 3C4UA 3LLDA 4Y96A 1I2PA 3M1ZA 2PC4A 4R7JA 1G6CA 4NJGA 1BWLA 3UY8A 2OZ0A 4UXDA 1ML1A 1O60A 3W7JA 2YR1A 3FFSA 4RKAA 1MEWA 3RNDA 2I1OA 4EVZA 4LRTA 1G4SA 1QNVA 2ZRYA 3NG3A 4JDBA 2JGQA 2YW4A 4LVFA 4YL2A 2Y85A 3FKRA 4B5NA 3IVSA 3YPIA 1SPQA 4UMCA 5K9DA 3QW3A 3BK0A 2HTMA 4YCPA 1IXPA 2FB2A 1EP1A 4NX5A 3C61A 2FDSA 5D2XA 3KX6A 1RVGA 3W7IA 2O7SA 2QCGA 2GJNA 4LW7A 3INPA 3TK7A 3TQ0A 2DJLA 1QR7A 2F84A 3GZ3A 3ABOA 1OF6A 3HG4A 5LNSA 4JTJA 3GNDA 3TFXA 4N02A 2R94A 5CPMA 4BWLC 1ICSA 4UTJA 3QF0A 5BNKA 4Q33A 3DKJA 4MJZA 4L4MA 2RDWA 2VEMA 2NUYA 4M6PA 3TX9A 1OX5A 3NM1A 2P10A 3NO5A 5DBTA 3OBKA 1WBJA 1Z42A 1YXYA 1G4EA 2NWRA 1IXNA 4AVFA 3T7VA 2FJKA 3M0ZA 4KFPA 3OA3A 3E0IA 3OEXA 4UIOA 2YYUA 5E1QA 3F4NA 3R2GA 3DAQA 3RFAA 4CLMA 5DCBA 4MPQA 1HUVA 4FNRA 2RFGA 3UPWA 4DF0A 1WOBA 1NFBA 1EP2A 2Y89A 3W6YA 3R8RA 4HT3A 4H4IA 3G1FA 4O0KA 2Q8ZA 3HPSA 1QOQA 1SSDA 2QF7A 4NZJA 3C2RA 5IM51 3UWQA 3LOTA 3TUUA 1VHNA 1YADA 4XKYB 2XN0A 3T55A 3NVTA 3R13A 1K8YA 5D05A 4IPJA 5EPDA 3MBFA 4O4VA 4O4WA 4AHQA 3ZWSA 5KZEA 3M5YA 1EIXA 1XM3A 3HB9A 2NX9A 3LX9A 3FLUA 3TJLA 4K7VA 5AHFA 1RQEA 3SECA 3TAOA 1OK4A 5DBUA 3BG5A 4JTUA 1EA0A 1OFPA 4HNTA 3IGUA 5KSWA 3IGSA 1GZGA 4GUFA 4JTIA 1YPIA 1G67A 4GXMA 1JR1A 1HG3A 4EF8A 3MYOA 4MZ8A 1KM4A 1SO4A 2ZBTA 1OJXA 3EX4A 3UZ5A 3G18A 3B03A 3NOEA 1XI3A 1PIIA 1KM1A 6ALDA 1S5TA 1W3NA 4AHPA 3VFLA 4UTKA 3A5VA 3W87A 1WX0A 4LVGA 2DZXA 3KHJA 3MO7A 2NUXA 1R2RA 3LCXA 3EWZA 2E6DA 1W56A 3FS2A 3W7PA 3G24A 5IBXA 4NJIA 4M5PA 4ORMA 1SW0A 3BG9A 5HMSA 3ANYA 4JY9A 3STFA 2V0TA 3PAJA 1MSSA 3WK1A 2B7PA 1F7BA 3C56A 3PS7A 1HL2A 5D2YA 3LCLA 3HOJA 5MHBA 3SR7A 4UTLA 3W7KA 4ZQOA 4H3DA 4MYXA 2VFDA 4AWTA 1KM3A 3N9SA 2QKFA 3W7GA 1Y0EA 2CLLA 3NZ1A 1LOLA 1NF7A 1P4CA 3L0KA 3CWOX 2EKCA 4GNJA 1GQNA 2VXNA 2YZRA 4Y9AA 1WQ5A 1H62A 3TC7A 1VPXA 1A5CA 1VC4A 3F1QA 4DELA 3SW6A 3PY2A 3UY7A 4EWND 1XBXA 1O95A 3O6DA 5U4NA 5EKYA 2LLEA 3P74A 1W5NA 3GK0A 2PCQA 3STCA 1TMHA 3Q94A 2HMCA 2DZUA 3T4CA 3MP4A 4WY0A 4WJEA 1AL7A 1I2OA 4U4MA 2Q3RA 4A2RA 2Y7FA 3UWWA 1W54A 4LY8A 5I3IA 1YTEA 1G4TA 4FX6M 3QQ1A 3U2OA 1TPVA 3E9AA 5K9CA 1M6JA 1SZEA 4MOZA 1MEHA 3W1QA 3S9YA 4KKXA 3O16A 2ZRZA 3SZ8A 2HS8A 2PURA 1L6WA 1UBSA 4YLWA 3M9YA 3W7EA 3NA8A 3S1VA 3PSVA 1AW5A 3U8GA 4LUIA 4PFMA 3GAYA 3KVJA 3M5VA 4N4QA 4MY9A 1GTEA 2Y6ZA 2ZZ2A 1JQVA 2WSQA 2C18A 3IIPA 1SFLA 3NEVA 5CSSA 2QUTA 3Q2DA 4HSOA 2B7QA 3SGZA 1SO6A 3EWBX 4WOQA 1QPOA 3EWYA 3LDVA 4TX9A 1OFRA 1SO5A 3BGJA 4JN6A 3OVQA 1FWNA 3LHVA 1R30A 3RF9A 4MZ1A 5AFDA 4NJHA 1M7PA 3ZWTA 3QH2A 2OCZA 1F74A 2ZA1A 3LGEA 3EX3A 3N19B 4I7WA 1DHPA 5G2IA 4AF0B 3L66A 5FEPA 3DH7A 2BZNA 3M43A 1QDSA 2ZA3A 4JTLA 4LNYA 4RZ5A 3G0SA 2R91A 4LVBA 3PM6A 1F6KA 4WY0F 5E93A 4DXVA 4HIBA 3G22A 4IMCA 1TQJA 3DFSA 4XTDA 4UR7A 2G97A 3NL6A 4WZHA 5LHEA 3UNDA 3EKZA 1QPNA 3HG5A 5F1VA 4AAJA 4FXSA 5LGZA 2W79A 3GR8A 3BPWA 1PHWA 4R33A 3B06A 3NQ2A 1Z48A 1FCQA 3LTYA 5AC6A 1TTJA 2VFFA 5F2GA 1F76A 4OGZA 1H1YA 1ZFJA 3LLFA 1ADOA 3OVPA 2FQIA 4JGDA 4QM1A 3OG3A 1PE1A 4XQ6A 3QFEA 2VENA 4ZQNA 3W7CA 1Q3NA 3A9IA 5AHNA 3BLIA 2V2HA 5DY3A 2H6RA 4BFAA 2V2DA 4LUJA 2FLIA 1VCFA 1JCYA 4NZFA 5AYZA 1UUMA 2JKAA 3W7HA 4HNNA 4JTEA 3DFQA 4GC4A 4IXHA 4XUGA 4KFNA 3QW4B 4JR5A 1GEQA 1U5JA 1E51A 4NVTA 5AB3A 5D32A 1VCVA 4N4PA 4O11A 3W1UA 3LTSA 1MEIA 4Z0SA 4FB7A 4Z0JA 2G5WA 5FEXA 1LOQA 1W3TA 3W2UA 2NXHA 1NVMA 1O94A 3IV3A 3TSBA 1S3HA 3DENA 1G7VA 2A2IA 5HUOA 3BARA 4IUOA 3HMJG 3UZJA 1IXOA 1XBZA 3TKFA 1OFDA 3NPVA 4NNCA 4BF9A 1SW7A 1VLWA 2E5CA 1KBIA 2YCEA 2F7FA 1RQHA 1KM5A 3KAOA 1ONRA 4O12A 3KVLA 5CZJA 3P5YA 1IIGA 1IIHA 3CC1A 4RLIA 1BWKA 1FXPA 2E6AA 2GJLA 5EYWA 4BR1A 2QR6A 5T26A 1PV8A 1WBHA 2RH9A 3EX2A 4ADUA 2QJIA 2YPIA 1MXSA 3EWWA 3NZRA 3MUXA 3MI6A 3IVTA 4G1KA 4RJEA 2YFNA 1FCUA 2Y62A 5CSRA 4GBUA 3GDKA 4BI5A 1VQTA 4E2DA 2ATMA 4K37A 2ZYFA 2TRSA 3W07A 4IMDA 4IJBA 1R2SA 1WDWA 4Q4KA 1V5XA 4EOUA 4JIQA 3FEMA 2HS6A 4HNVA 1RQBA 5CPOA 3HGSA 1AL8A 3TV8A 2WV8A 2CU0A 3S5YA 3A23A 5LNRA 3CM4A 5AHMA 3E49A 4O14A 3TH6A 1KFCA 3MMTA 3FYPA 1VYPX 1TV8A 3SI9A 3BW2A 2VEPA 2ZZ4A 4JTHA 1M5WA 1SZFA 2A7NA 2ZA2A 5HQEA 2Z0IA 3MHGA 1TREA 3E02A 2Y7EA 1AW1A 4WUIA 4UTTC 3GXTA 3SFKA 3TW7A 6TIMA 1YDOA 1GVFA 4LVDA 4OU1A 3R5EA 3RMJA 1I2RA 3GB6A 1CX9A 5C55A 5D30A 1KTCA 2EPHA 3LERA 1VYSX 4FNUA 1MO0A 3N9RA 1OYCA 1XBYA 3W88A 4AWSA 2E09A 4LWWA 3G3DA 3IEBA 3GDRA 1OFBA 4UFMA 4EF9A 1JCNA 4CCDA 2X16A 3PC0A 4XWUA 4Z1CA 3QMSA 4Z1AA 3NQVA 1VYRA 1TB3A 1LTDA 3G1XA 5FI8A 4P2VA 1YTKA 5K3VA 3TU9A 4KWWA 4LS0A 4RZ4A 4D2JA 3LHWA 4JTTA 4EIVA 3I7SA 3CIWA 2VOMA 3BLFA 5EBUA 3TC6A 3I7RA 4GWEA 1TSIA 3P81A 3NM3A 4ADTA 3CLMA 3B0PA 4DO6A 5HULA 1TPB1 1OFAA 5D38A 4A2SA 5J5DA 1EWDA 5A5WA 2RHGA 3MHUA 4GUGA 5EMUA 3PR2A 1ZHAA 1T8XA 1FDYA 1W37A 3TXZA 4RK8A 3LHZA 3ZFHA 2NXGA 3JS3A 3EXRA 4YMZA 1JUBA 4MFEA 4CNNA 3M5ZA 1VZWA 3TQKA 1TJPA 3UYCA 3QEZA 3PUDA 1OK6A 1YYAA 3LCHA 2OJPA 2V8ZA 3O1NA 3TROA 2PE4A 1ZENA 3L0NA 3LRMA 3TR2A 2NWSA 1ALDA 3G1VA 4ONVA 3W75A 4ZL1A 3TMLA 3LHYA 3PB2A 3A24A 1SZGA 3WJZA 2Z2UA 3PF3A 4RV8A 2JBMA 2V30A 1TO3A 2RDUA 1EWEA 5F4WA 4M6QA 2WNQA 3MI2A 3QM3A 1G7UA 5G1YA 2E5DA 4S2BA 3W72A 2XN2A 1KTBA 3W2LA 1TPUA 2AAMA 2Y70A 3UPBA 1QO5A 4DF1A 3W73A 1ICPA 3QSTA 3B4UA 3ABRA 4E2BA 3Q58A 3LBCA 5C2XA 4S1FA 3TE9A 4K36A 2AQWA 3WK3A 4BK9A 1SR9A 1NF0A 3HF3A 2VFEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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