2H3BA

Crystal structure of mouse nicotinamide phosphoribosyltransferase/visfatin/pre-b cell colony enhancing factor 1
Total Genus 159
50100150200250300350400450020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
476
structure length
466
Chain Sequence
EFNILMATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLMETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPMDTVLKVLDILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSMHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
publication title Structure of Nampt/PBEF/visfatin, a mammalian NAD(+) biosynthetic enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 159
structure length 466
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2006-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2h3bA02
4IPJA 1L2UA 4N9CA 1RQHA 1JQXA 4JN6A 1UUMA 2C19A 1YTDA 3PG8A 5EA9A 4Y8FA 1ADOA 3ATZA 1JCJA 3UWWA 3W2LA 4EOUA 2W79A 4UTLA 4JTGA 1OF8A 1XUZA 3L68A 3L0KA 6ALDA 4Z1DA 1IIHA 1GTHA 3LHYA 3TQ0A 3U8GA 3IIOA 4RR4A 2YW3A 4H4IA 3M0ZA 3KRZA 4XUGA 3HPZA 2GOUA 4AWUA 1SSGA 2EGZA 2AGKA 3IV3A 4HNUA 3RLVA 4O28A 4FF7A 1RVGA 1Q3NA 4LVDA 7TIMA 1FCQA 1NSJA 1LLZA 1Y0EA 1F2JA 3B0VC 3HB9A 5LNRA 3KHJA 1TCDA 3W2UA 5AHLA 3L5LA 4O53A 3G1HA 3W7IA 1H7RA 1SUXA 3IVSA 3M5VA 3NZRA 4NJHA 4PFMA 4JTHA 1KBJA 1YADA 2ZZ2A 3O63A 1TIMA 3BVJA 1EEPA 5D2VA 4NVTA 2ZRYA 1AW2A 4RV8A 3SW6A 4LC6A 4DO4A 1KTBA 3QMRA 3W7RA 3ELFA 4A2SA 1K7XA 1LYXA 1DVJA 4O54A 3BG5A 1ZENA 1GTEA 1IXNA 4I7WA 6TIMA 1VCGA 3CPRA 4BWLC 1DKWA 5MHBA 2BSLA 1FBAA 1XBVA 5CG7A 3W84A 1XCFA 1OFPA 3N9RA 3HIJA 3NQDA 5H91A 3S1WA 2HTMA 1Z44A 3Q37A 3VI2A 3TV8A 3TH6A 1NFBA 1P0NA 3LXBA 3PBYA 4MUZA 2OX1A 5BMXA 1EA0A 5I3KA 3CB8A 3N73A 3LCHA 1G69A 3NDOA 4BI5A 4XBSA 3GX9A 1XBXA 4OV4A 1L6WA 5I3JA 3M7WA 1LZOA 4FNRA 1IIGA 1R46A 4LVGA 3WJXA 2FB3A 3C3NA 1NEYA 3MHFA 3T40A 1EPXA 3W7QA 3SR7A 2J24A 1TMHA 4NX5A 4MOZA 1GYLA 1SPQA 1I4NA 1ME9A 4QIUA 3MW7A 2WSRA 3MHGA 3UD6A 3G1FA 1X6UA 1GG0A 3MBDA 5D2YA 3EX6A 1LORA 3W6YA 2HSAA 1JUEA 5D2WA 3BW2A 4GFSA 3LLDA 3ABRA 4UFJA 1KM0A 2A0NA 4EF9A 2V8ZA 2YXGA 3LV6A 1YTKA 3TU9A 4C1LA 2G96A 2DORA 4ADSA 4XBKA 1JRBA 3CEPA 4LC8A 1KM1A 1W3NA 4AVFA 4BFAA 5BOOA 1JCXA 4A21A 2RDWA 2JGYA 2PRMA 1PHQA 3EWBX 3DAQA 3L2IA 2ATSA 3N34A 1R47A 5A8GA 4I7UA 3FS2A 3GAYA 1WQ5A 4UMAA 3E12A 4LS1A 3M9YA 3S1VA 2WQPA 3B06A 2QCCA 3TMQA 3GR7A 4IMEA 5G2HA 3HGRA 1KFBA 5DBUA 3W71A 1G7UA 2NUYA 3JS3A 1FWNA 3NR0A 2J9YA 2CZFA 3FJLA 3IGUA 4O10A 1QDSA 5HNRA 1G6CA 1WYIA 1QPRA 4O1CA 5LNVA 4CLMA 4MFDA 4MIMA 2BXVA 1MEIA 1A5AA 1QO2A 3PB2A 1H51A 3CEUA 1EP3A 5AC7A 2DZTA 2WSQA 4MJZA 3L5AA 1VRDA 4AMAA 4CQAA 1SW0A 3NQMA 5EBUA 1N7KA 1QWGA 1ML1A 4Y90A 3LTYA 1DJQA 3IGXA 1F73A 2CLOA 1XKYA 3M47A 1KA9F 1ZNNA 2Y70A 5K7JA 2RKXA 4RJEA 4IPIA 1Q6RA 4JDYA 3SIZA 1I2PA 1RD5A 1O95A 3MO7A 4BI6A 3LBMA 5C6MA 3HG2A 4JNMA 2CW6A 1T0OA 1ZHAA 5I3GA 2ZZ7A 4AWSA 5F1VA 4HPXA 4AEOA 1L6SA 2V5LA 4YWIA 2IQTA 3G24A 3E0IA 1W5NA 4BWLA 3FA5A 1YXYA 1PVNA 3H55A 5CGQA 2CLFA 5EKYA 2E6YA 1OYAA 1TJRA 2WNQA 4S2CA 4XTIA 5F2LA 1GVQA 2NXIA 2CLIA 1RQBA 4OGZA 3HPSA 1OFAA 1FCUA 4UTMA 3WK0A 1VGAA 3NO5A 4DPQA 4DXVA 4JICA 2Z0IA 3G1SA 1ZCOA 1A5CA 1Q6LA 3W1QA 3EX3A 4M7SA 4U28A 3G1VA 4JR5A 1KFJA 4FX6M 5HUPA 3S6DA 4K8HA 1W5QA 5D30A 3UPBA 2JGQA 1OFBA 3KFTA 2RH9A 3LXAA 5F4SA 1XFBA 1J5TA 3STEA 3W70A 1K03A 3EKZA 1SSDA 2C1HA 1K8YA 5FEXA 5BMWA 1M7OA 3KXQA 3TSBA 3BO9A 1Q6OA 2ZZ1A 1DORA 1JRCA 1Z42A 1L9WA 4ALDA 4FO4A 3W1UA 4MY8A 3NL3A 1KTCA 4HT3A 8TIMA 3O8AA 4JTSA 5LSMA 2WPBA 3MYOA 4ZVJA 3UXAA 1H61A 3DKLA 2H3BA 1TREA 4O0KA 5BRBA 4TU1A 2B0MA 3VCRA 5TIMA 5C55A 1Z41A 2ZFAA 3TDFA 1XDMA 1TPDA 1JCMP 4WD0A 4AXKA 4GUHA 5AHMA 2OT1A 4C1KA 3P80A 5U7SA 4FXSA 2EHHA 1QFEA 3RLUA 1G4EA 3BGJA 1W8SA 1V5XA 2J9XA 2E77A 1TTPA 1B4EA 2D73A 4M5PA 3ABQA 1FWTA 2Y6ZA 3UZJA 3VKJA 3N2MA 1CW2A 2H90A 4UFLA 3W85A 2GUUA 1WV2A 5K2ZA 2NV1A 3BG9A 5G5IA 5HR6A 5CZJA 4YCPA 1SR9A 3ZWSA 3CC1A 3B04A 1EX5A 3TXVA 2QCGA 2BTMA 3MI2A 1I2QA 4JY9A 1PCKA 4IWWA 4JS3A 1PS9A 3TMLA 4NNBA 3VE9A 1IXOA 4UFKA 4LU0A 4WJEA 4ZQRA 3GYEA 2DZWA 5AB3A 1VJIA 1XBYA 3DHDA 3HG4A 3DFQA 3WK2A 4JYFA 4RXGA 1H7WA 2A2IA 2J9ZA 3UY7A 1O94A 1F7BA 5L6UA 1M5WA 3N9SA 4N6EA 2Y63A 4TMBA 4JYDA 4JTLA 4ICNA 3NVTA 3LHVA 3I6RA 3USBA 3S42A 2ALDA 4NXKA 3HO8A 3L9CA 3TA6A 3LRMA 1O4UA 3A5VA 3OVPA 3ZR4A 3PC0A 1TPVA 4O17A 2V0TA 1OFDA 4LS2A 3TC6A 4HSOA 3HG3A 2HS6A 3LHWA 1FWWA 5HWNA 4JIPA 4S2BA 1UB3A 4KWWA 3THAA 2ZRZA 1YLVA 3GAKA 3NQ2A 4N9DA 5EY5A 5TQLA 4O15A 1A5BA 1YPIA 3W1RA 1LLWA 3FLUA 5DELA 3PG9A 1LROA 3TQKA 4K7VA 1ME8A 3ZS4A 4A3UA 3JRKA 4JX6A 1GQNA 3C61A 3TK7A 1TPWA 3NQAA 2FJKA 4L4MA 4KWVA 1F6PA 3A9IA 1JVNA 4CNPA 2Y61A 4N02A 4N9EA 3LOTA 4TIMA 2B4GA 1PIIA 4MFEA 1PE1A 4K36A 4UFIA 1WXJA 4ZQMA 5KTLA 4O18A 3C2FA 2YYUA 3GDKA 1GT8A 4UTIA 5K4XA 4CNOA 3QH2A 3QQ1A 3PULA 5HWJA 3DXIA 2PCQA 5BNKA 1VYPX 1KBIA 3EWUA 5GVJA 2X1UA 3UWVA 1W5MA 4IMFA 4BI7A 2CWNA 5J5RA 3FYPA 3SJ3A 1W1ZA 3G8RA 1SZNA 3LHUA 3LI1A 4UR8A 2OZ0A 4MJMA 1QO5A 2ZRWA 3KAOA 2Z1BA 4PEKA 2WNZA 3ABOA 2QCMA 5FF7A 1I2RA 4GUFA 3VE7A 5AC8A 3K30A 1SFJA 4K8EA 1R30A 4DF0A 3W23A 2YW4A 4R34A 3DBPA 1ZY9A 1MSSA 3W74A 3DFOA 2A5HA 1GVFA 1HO4A 1UJPA 2OT0A 1SFLA 1TV5A 3E96A 4IOTA 4WOZA 1LM1A 2Z2UA 1KM5A 2Y7DA 3GIYA 4MYXA 2PE4A 3CQ0A 4UUIA 2C16A 3HPXA 3O15A 1H63A 4GNJA 1DBTA 3SECA 3DFTA 1I2OA 4ONVA 4QNEA 5T26A 4DQWA 1W56A 4M7TA 3PUEA 1EB3A 2R8WA 1ALDA 3B8DA 3AJXA 3I7SA 2O7QA 3TFCA 2VEKA 2CLLA 1HFBA 3BLFA 2V9DA 5AC6A 3W07A 4H6KA 4DEFA 5D38A 1JCLA 4XKYA 2Y89A 2Z6JA 5D03A 1ZAJA 2C15A 1VLWA 1CI1A 1C9DA 2WSYA 4L4LA 4OV9A 5G2IA 2NUXA 4O1AA 3S1XA 5KZEA 1JULA 3QF0A 1N8FA 3TW6A 4GUIA 3NM3A 2Q3OA 3KVKA 2ZA2A 2KZHA 4N2YA 5EL1A 1GEQA 5C54A 1DQWA 3GK0A 1M7PA 4X2RA 4JTUA 3ABSA 4Y9AA 1YDVA 2A4AA 5IM51 2Q3RA 3VFLA 3EXTA 3NNTA 4HKPA 2ISVA 4JTFA 1JJKA 1LDCA 1SO6A 4LUJA 3TW7A 3L66A 1QOPA 1WOAA 3W7JA 2WV8A 1AL8A 1EUNA 3SSJA 5CSRA 3ZFHA 5FEWA 3OA3A 4K37A 2WKJA 1TTIA 1EP1A 3QZEA 4JIQA 4NXSA 2JK2A 4XKYB 1OK4A 3UWQA 3G1XA 5LNSA 4NT0A 1K02A 3U2OA 3LCXA 2DP3A 3EX4A 2Z6IA 3M5YA 4CCDA 1H7OA 3Q2DA 4ORIA 3W7LA 2QCNA 2VFIA 1QOQA 4IXHA 1SW3A 2A6NA 4FNPA 1FUYA 1RV8A 3Q94A 1B57A 1OX6A 5E93A 3QSTA 4E0CA 3MHUA 1VHCA 1OF6A 4LUIA 4Q33A 1AG1O 1OABA 2W6RA 4OWGA 3QC3A 3TR2A 3NAVA 3O07A 1O5KA 4JTJA 1ZAHA 1F05A 1LRQA 1I2NA 5EYWA 2CZ5A 4ORMA 1FQ0A 2YPIA 2NX3A 4JDBA 1FDYA 4ML9A 4XWUA 3NPXA 1OFOA 4UTJA 3CWNA 3N2XA 4P2VA 4Y96A 4LRTA 1S5VA 2I14A 3P62A 4O14A 1ZAIA 2B7OA 2Y7EA 2ZQ0A 4WXZA 2P1FA 3INPA 4O1BA 1HTIA 2VELA 2X1RA 5CSSA 2ZBTA 2GVGA 3C52A 3WJWA 3LM7A 3GB6A 3T78A 1GVRA 3NL6A 1YPFA 4WXYA 2E6DA 4UTTC 2Q8LA 3C2EA 3C2OA 4NNCA 5D32A 1FDJA 3NPVA 3RMJA 3V1PA 1FCBA 5AOUA 4K38A 4FNUA 1KW1A 1P1XA 2GVLA 1H1YA 3OBKA 4LVBA 3TSMA 3UNDA 2VOMA 1DV7A 2V2HA 3AO0A 1AMKA 4QNWA 4UTHA 1TPEA 3M5XA 3GDMA 2BLEA 2LLEA 3NQVA 3W1XA 3FIGA 1WBJA 4MLJA 2NX1A 3PR2A 1LBFA 3O1NA 2GQAA 3GNNA 2A6LA 1RPXA 3QPYA 1OFEA 4NUWA 3G3MA 3S9YA 3IEBA 3TQVA 2JKEA 1ICPA 2O7SA 4OQVA 3IVUA 3W2KA 3S0CA 4I7VA 5DY3A 3MBFA 5D2XA 1I8JA 1D9EA 3G0UA 2GJNA 1TTQA 5DXXA 3KVJA 3NPWA 2BX7A 3NQ6A 4GUJA 4QQ3A 5EMUA 3ATYA 5LGXA 3MI3A 2Y85A 4EF8A 4NNAA 3CT7A 3KRUA 3W1MA 2AAMA 2CZEA 3TXZA 4IQLA 3UWUA 3CIXA 3O6YX 4HNTA 3KX6A 3P61A 4QJ1A 1NVMA 1ICQA 4DO6A 1Q45A 3W7OA 5AYYA 3LTPA 1OK6A 4NJIA 4YCOA 2FPYA 1TPB1 4FB7A 1SW7A 1JCYA 3KVLA 4MKNA 4LW7A 2ZZ4A 2ZA1A 4FX8A 3R8RA 3PB0A 1P5BA 1AW1A 1YYAA 2VFGA 2QUVA 5CPMA 3I65A 4YL2A 4JX5A 2FQIA 1MXSA 4IMDA 1N55A 1TSIA 3LI0A 1KM2A 3LGEA 3W1NA 4G1KA 4IGHA 1EIXA 3YPIA 1VH7A 1E51A 2ATMA 4EWND 3FKRA 3UY8A 4E2DA 4CCEA 2A7PA 3C0JA 4RZ5A 3G22A 2RHGA 5D09A 3EX1A 5KMYA 1HO1A 4K39A 4KFPA 1IXPA 3TCEA 1OHLA 3MP3A 4UXDA 1VR6A 1OX4A 5DBTA 3EB2A 1TB3A 4AB4A 3GXTA 3OIXA 1FXQA 1TPC1 3C8FA 3DHFA 4DF2A 1FX6A 3BGGA 3I7RA 3BLIA 4NZFA 3GKAA 4PL2A 3NL2A 5HJLA 4LVFA 3OG3A 5LNWA 4NZJA 2E09A 3Q58A 1BKSA 4DELA 2C13A 5CZSA 1YDOA 4UTTA 1KM3A 1LOLA 1W54A 4XQ6A 3IIPA 2NWRA 5ABTA 1VC4A 3P82A 2VFDA 5KSWA 2DJXA 4O13A 3GVGA 4HNVA 5I3IA 2QCHA 5LZLA 5IBXC 2Y7GA 4JX4A 2X16A 4CQ8A 1HUVA 4GBUA 1ZALA 4Z1BA 1KM4A 5HULA 5AN7A 2R14A 1OX4B 4NJKA 1TRIA 1GWJA 5DLCA 4AWTA 3M43A 5DCEA 2TYSA 5G2WA 5DCDA 3PY2A 1JCNA 2V2CA 4LOCA 3G1AA 3IRDA 1KFLA 3W7DA 2X2GA 3W72A 4AHOA 3BG3A 2XN1A 3A22A 3P5ZA 2RDUA 4O19A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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