2H3DA

Crystal structure of mouse nicotinamide phosphoribosyltransferase/visfatin/pre-b cell colony enhancing factor in complex with nicotinamide mononuleotide
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
476
structure length
465
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of Nampt/PBEF/visfatin, a mammalian NAD(+) biosynthetic enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 164
structure length 465
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2006-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2h3dA02
4KFOA 4JS3A 3G1SA 1R30A 3CU2A 5G2WA 4HIBA 1QOQA 1OX6A 4MVAA 1FCVA 2A85A 1PCKA 3PBYA 4A21A 1KLZA 4IMGA 4CQAA 1L9WA 1UB3A 3C52A 1LP6A 1H60A 2WJZA 1ZENA 4N9BA 3W70A 5E1QA 4Z0JA 5D32A 2ISWA 4GRSA 3DZ1A 3LHYA 3HQ1A 5D09A 3KVLA 1EB3A 5KINA 1ADOA 1TV5A 3S5ZA 3O8AA 2QJGA 3BLIA 1GEQA 2QCMA 2E6FA 2YXGA 1ZAHA 1OX4A 3BG9A 3P84A 3QH2A 4JTGA 4JD4A 5D03A 4A22A 1G7VA 2Y7FA 5K3VA 1ML1A 4B5NA 2GVGA 5D2VA 2QKFA 4WJEA 3NVTA 5D2XA 4BWLC 4UR8A 1XI3A 1GG0A 3ANYA 2B7QA 1ME8A 3R2GA 3KOFA 3LTSA 3PUEA 3NM3A 3LCIA 1LCOA 5EKYA 1I2OA 1U83A 1SO6A 1C29A 4YWIA 1QNVA 1KFKA 2DORA 2PURA 5HQEA 1R2RA 3STGA 3LCWA 2BX7A 3GDMA 5E0KA 3EX2A 3LOTA 3LV6A 3T44A 2AGKA 4L4MA 4MZ1A 4C1LA 3F4WA 3I65A 4OU1A 1NSJA 4HSOA 3BK0A 3W2JA 1B3OA 5J5RA 2VELA 2QR6A 2V81A 3MO7A 3GAKA 4IMCA 4TX9A 3QQ1A 2B7OA 3EWYA 1TB3A 3DAQA 1D9EA 3FOKA 3HG3A 3TQKA 4K8EA 4O18A 4LV4A 1F6KA 1GG1A 2YW4A 4JTJA 1OX5A 3KVKA 4HPXA 4FXSA 4RZ4A 1GWJA 3BPWA 1M6JA 3P67A 4RK8A 1F74A 3TW6A 1TSIA 3LRLA 3M5ZA 4JX4A 5G1TA 1F6PA 2X1UA 4O0ZA 3GK0A 1EWEA 2QCGA 3EX4A 1UJPA 3GIYA 2E68A 3KFTA 1T96A 1GTHA 3BARA 1T0OA 3VKJA 1YDOA 3TSBA 1SSDA 3N3MA 1VYSX 5I3HA 4NT0A 1VCVA 4NJHA 3MJYA 5A5WA 2JBMA 3NNTA 3M6YA 4A2RA 2BZNA 4PL1A 1LBLA 4OQVA 2ABAA 2J9XA 3LHVA 3A9IA 4DBEA 4UCGA 5D2WA 2YZRA 1FDYA 1S5WA 4HT3A 3EXTA 1WX0A 4NX5A 4RXGA 1OABA 5FF0A 2HSAA 1L6YA 2J24A 2EPHA 3NQDA 4UTIA 3S9YA 1GVSA 1DQXA 1FXQA 3P5ZA 1F2JA 1KM1A 3MWAA 4MZYA 3M7WA 4E38A 3NPWA 5DBUA 3Q94A 1DQWA 1XKYA 4I7VA 1VR6A 5HMSA 1I2RA 4PEKA 3TR2A 3HPXA 2FB2A 1EP3A 3TMLA 3UZJA 3BW2A 5TBOA 4TR9A 4QISA 1P5BA 1SO5A 1QO5A 3LHZA 4AXKA 4AWTA 3P8IA 2A7NA 1TMHA 4ADSA 5F4SA 3NOEA 3LM7A 1K8XA 1AW1A 3TQ0A 1JQVA 4LV9A 2NUWA 4JTEA 1GQNA 4MJMA 3CIWA 4KKXA 5AHMA 5F1VA 2C0AA 1RV8A 2NUXA 4N9EA 4A29A 1YTEA 1JUEA 3CIXA 1PIIA 3IEBA 3EX3A 2DP3A 2C14A 1KM0A 1IIHA 2E6AA 2ZA3A 1WOBA 3LX9A 2X2GA 5AN7A 2D73A 3W1TA 1O94A 1Y0EA 3BW4A 3GDKA 3MHGA 3OA3A 4NU7A 1PS9A 4NJIA 3TQVA 1PE1A 4O19A 1TV7A 3UWUA 1NVMA 1KM4A 3TXVA 3S8HA 1BKSA 2H8XA 3UWVA 2DZSA 3DXIA 3I7RA 4E0CA 1TPVA 1PL9A 5J5DA 4LUIA 1KBIA 4JICA 4O1AA 5AHFA 4QAIA 1GVRA 3UWYA 1GYLA 3VCRA 2J27A 2DZUA 2ABBA 3W3OA 5HUPA 2NLIA 3SW6A 1DKWA 4ORIA 3LLFA 3W7RA 1WOAA 2QCHA 4OHQA 1LOQA 1W5NA 3LI1A 3TJLA 2BWGA 1HFBA 2O7SA 4FEZA 1LBMA 1GTEA 3UY8A 2RHGA 1UASA 1VQTA 1W0MA 3I6RA 1R46A 4JN6A 4NXKA 2ZCGA 3SZ8A 4KWVA 4GFSA 4MZ8A 3LCFA 1DL3A 2QUVA 4GBUA 1SR9A 1UUMA 4O50A 1PHWA 1G6CA 3Q58A 2I14A 1Z41A 1WYIA 3W7PA 2ZRUA 1G4EA 1X7FA 1OVDA 1KLYA 5AC8A 2VC6A 3TJXA 4UTTC 2ZTKA 4UMCA 1KA9F 4K37A 1VHNA 4KWWA 3PBVA 1FDZA 3NQ2A 3W71A 5KSWA 3O16A 1ME7A 4FNSA 2XN1A 1JCYA 3B04A 1EA0A 5T26A 3GXTA 3LTPA 3M5YA 2ZZ6A 3O07A 4FNRA 1ZNNA 5AFDA 1N55A 2GQ8A 3O6YX 3PS7A 4G1KA 3W84A 2QAFA 4FB7A 2A6LA 2Y70A 2XN2A 1QPQA 5F2IA 2FQIA 1SZGA 2W6RA 4LTSA 5K2ZA 5CZ0A 3W7HA 1X8FA 4X9SA 5F4XA 4O13A 1K7EA 5KZEA 3NL5A 2VFFA 2E6YA 1FWWA 4WY0F 3HB9A 5G2HA 3P8JA 4WD0A 4FIQA 4BWLA 4JYFA 3NM1A 3FYPA 5EL1A 4POCA 5FEWA 5IBXC 1P0NA 4YLWA 2AQWA 1S5VA 3UQNA 4JXCA 4JNMA 2JKAA 3DFTA 4FX8A 4QNEA 3MHFA 3T78A 3THQA 3FS2A 1FWTA 4UTKA 1P0KA 4X22A 1B4KA 4GUHA 3GAYA 3I7QA 5FEZA 1VJIA 3NQGA 2WPBA 3PUDA 4NZFA 3CEUA 3W22A 5AOUA 5HR7A 4ZQPA 1ZHAA 5LGZA 4JIQA 3DENA 5EA9A 3EKZA 2W79A 2Y6ZA 2Z0IA 2A1YA 2NXIA 4O57A 3TAKA 5AHEA 1IXPA 2WKJA 3N9SA 4MY1A 2CU0A 3LLDA 4X2RA 1H7PA 1W1ZA 2YYTA 2ZDRA 2YFNA 3P82A 4LY8A 3W7CA 2E5CA 1KFEA 2QUUA 1TREA 2Y61A 2H8ZA 3CWOX 1W5OA 2ZZ1A 3G18A 3L5AA 1EP1A 3C2FA 3C6CA 7TIMA 1LOSA 2NWSA 1H7OA 2CW6A 3LCGA 3BV4A 2I9EA 1WXJA 3MP4A 2NX1A 1MEIA 5CKSA 1JCXA 1SQ7A 3O6CA 3W74A 4FX7A 1ICQA 2C6QA 4IX2A 1TIMA 4UR7A 1I4NA 3SR7A 3L65A 3LI0A 3G1DA 1FBAA 1NF7A 3BVJA 4JDYA 3TK7A 1NAL1 3TMQA 3UYCA 4QJ1A 3GVGA 4JTTA 4Z0SA 3TSMA 2BXVA 3AO0A 4HNUA 1W5MA 5EBUA 2GJNA 4EIVA 3RK8A 5LNVA 1SW3A 2TYSA 3UWQA 4LS0A 1XCFA 1G67A 4FNTA 4WX2A 1LROA 3G0UA 3G3MA 4DF0A 1XM3A 2Y88A 3PR2A 2XFWA 4JTLA 3TSDA 5EPDA 4O52A 2YGYA 4K7VA 4FX6M 1JRBA 4XTDA 4I7UA 2X1RA 3QSRA 1BWLA 1L2UA 1JCNA 1XBZA 3RF9A 1AK5A 4UFIA 2Q3OA 3LCXA 1AL7A 1PVNA 2ZYFA 3IVSA 2P1FA 1GYNA 1V5XA 1XXXA 3RMJA 3E96A 3W1AA 3O15A 2J88A 3GLCA 4EVZA 1RR2A 1LDCA 1Z48A 3ZS4A 4CCEA 1KV5A 3MP3A 1OFRA 1YPFA 5F2LA 2QCNA 3N9RA 1N7KA 3LXBA 4ML9A 2Y62A 5HULA 1OFOA 1KFLA 2QCLA 3PBUA 3IGSA 3BG5A 3O63A 4PTNA 5AC7A 1VRDA 3KVJA 1TJPA 4N02A 3NL2A 3ZFHA 5AB3A 3OBKA 4LRTA 3SJ3A 1R2TA 2DU2A 5K9CA 4Z1DA 1SPQA 1ZALA 4HKPA 2ZZ5A 4UFJA 4JTHA 3W1NA 4GUIA 4ALDA 3YPIA 3W2UA 4BR1A 4LT9A 2VXNA 1VS1A 3EEGA 1HUVA 5KZMA 5ABTA 3M0ZA 3WK1A 3LERA 3QW4B 2JGQA 1Q45A 4IPIA 2DJLA 1H1ZA 3F1QA 3NQAA 1TPFA 4YXGA 4HSNA 2WNNA 1XBYA 5FF2A 3UD6A 3FA5A 5CG7A 2WNQA 2WSQA 2G96A 4RZ6A 1JVNA 3VFLA 2VEKA 1J4EA 2CWNA 2BSLA 2H3DA 3TUUA 3NL6A 3QW3A 3W2NA 1OFQA 1DV7A 2JKEA 1XFBA 4AHOA 3DFQA 2E09A 3STEA 4Z1AA 4GJ1A 4IGHA 3G0SA 1K8YA 2VFHA 5AHLA 5FEPA 4GUGA 1TRIA 1H50A 4BI5A 3G8RA 3KHJA 4DELA 1TCDA 3WJWA 4PC8A 1KM5A 4P2VA 3ABOA 2TPSA 1K7XA 3GXNA 3KVMA 3SECA 3MHUA 5FF7A 5LSMA 3CT7A 4DO6A 5D37A 3V75A 4GC4A 3WJXA 4LW7A 4WUIA 4EF9A 1KW1A 4HNVA 4O1CA 4UTTA 1DBTA 3C3NA 3EXRA 3W75A 2ISSA 1VGAA 2Z6JA 4UMBA 1OF6A 1XUZA 4YMZA 5KTLA 1S3HA 3TIMA 1B9BA 1GZGA 4LVBA 2E1DA 4QSHA 4XUGA 1F7BA 4AF0B 1OJXA 3L5MA 5HJLA 3QM3A 1A50A 2CLFA 3CLMA 4PA8A 1LM1A 1OG0A 2FPVA 5LKYA 4U4MA 1K02A 5CSSA 3P80A 1EX5A 4MYAA 2A7RA 3EWBX 2J9ZA 3T40A 5G4EA 5F1UA 1RPXA 3WJYA 2CFFA 1LYXA 1SU5A 4N6EA 2PC4A 2CZDA 3LHWA 1Q3NA 4NNAA 5D04C 5HUOA 3UPWA 1AL8A 1XBXA 1KFBA 2Z2UA 3LXCA 2ZRYA 3RLUA 1VLIA 3V1PA 4I7WA 2CZEA 3IGUA 5AHIA 4R53A 1DVJA 4DEFA 2CLIA 1VHCA 2X30A 3UZ5A 1AW2A 3I7SA 5IBXA 3IVUA 5AYYA 2QCCA 2VEPA 1P1XA 3PB2A 5FI8A 1JR1A 4K6AA 5C5YA 4CCDA 3R89A 3NPXA 3MBFA 2VOMA 4JR5A 1YTKA 1RQBA 1X6UA 1VH7A 1L6SA 5U7SA 5SWUA 1HG3A 3NZ1A 2JKPA 4M19A 2RDUA 3R5EA 4QITA 3GKAA 3ZWSA 3TC6A 3NZRA 2ZZ4A 3IIVA 1Q6LA 3O06A 2C16A 4N4QA 4UFKA 4N9CA 3BO9A 1YXYA 4FNUA 5I3FA 2WQPA 2HS8A 2ZRVA 1GPWA 2NWRA 3TAOA 2A0NA 3C2VA 1RD5A 2YDAA 2A7PA 4NJJA 1Q6RA 2FPYA 1VZWA 3AJXA 4XZ9A 4ZQNA 4O54A 4FHAA 4PL2A 3FKRA 4Q33A 3G1HA 2ZZ7A 3L0KA 1LRQA 3O6DA 3C56A 5EMUA 4IWWA 1WBHA 1MXSA 3C4UA 3CTLA 4AWUA 3MBDA 1XDLA 2RDWA 2HMCA 4S2BA 4LC8A 4GUJA 1H7XA 3NEVA 4GNJA 3DBPA 1Z42A 3PAJA 1QDSA 5DBTA 2A6NA 3DKJA 3OHIA 4LS2A 5D33A 1EWDA 1GOXA 2A4AA 3DHFA 3DFSA 1BEUA 1FWNA 1TO3A 3GDLA 4MOZA 3A5VA 3W7QA 3QMRA 3C2OA 2GVLA 1SW0A 5TIMA 2DZWA 3OVQA 1G4TA 1OFBA 5KZDA 2Z1BA 4GUFA 2VFIA 3FYOA 4NXSA 1W3NA 2VFGA 1RVGA 1K03A 3HBLA 3HJZA 1DHPA 4WQ6A 5C54A 3KXQA 3H55A 4OE7A 1Q6OA 4O1DA 1ICPA 4R34A 4UUIA 3HG2A 2FFCA 1GJPA 2IQTA 1H1YA 3W1XA 4IMFA 3NQVA 1U5JA 2YCEA 4UFLA 3G24A 2QJIA 1VYRA 4Q32A 2YSWA 1E51A 3UWWA 1A5BA 3NDOA 4FF7A 1SFJA 1TPB1 4KFPA 1H7WA 3N73A 3IIPA 1I8JA 3DI0A 2EGZA 2TSYA 1FY6A 3NA8A 3PF3A 5MHBA 1VC4A 4P61A 3F4NA 1H62A 2EHHA 1MO0A 1TV8A 2NUYA 4X3ZA 2Q3RA 1MEHA 5FESA 1WAUA 1VYPX 1H63A 3G1FA 3LRMA 2GJLA 1I2QA 3M47A 4NJKA 4MPQA 4UTUA 4PCFA 4IX0A 3HGOA 1B4EA 4O12A 3W83A 2QUTA 1YLVA 2ISVA 4WXZA 1OFPA 1A53A 5A8GA 1LZOA 1W54A 2ALDA 1TRDA 4MY9A 1HL2A 1UCWA 1G4SA 3U8GA 1TJRA 3GB6A 3E12A 1SO4A 4TIMA 5LHEA 3DH7A 3M5VA 4PFMA 1ZJIA 2CLOA 4JTSA 2CZFA 4ZVJA 3FJLA 4UTWC 3N2MA 1LOLA 1TPUA 2E5DA 2ZA2A 4RZ5A 3DFPA 5U4NA 3LXAA 3UNDA 3PWAA 1RQHA 5BNKA 4IQLA 3N19B 1W37A 4JY8A 4YCOA 3DGRA 2GQAA 4LC6A 3STFA 4PH6A 3ZR4A 4N2YA 4H3DA 4RR4A 5K7JA 1KFJA 3EXSA 4DO5A 2ZZ2A 2PCQA 1OYBA 3HGSA 3B8DA 3PSVA 4TMBA 3LB0A 2YW3A 4TMCA 5AYXA 3VE7A 3W7IA 1H7NA 2FLIA 2Q8LA 1O60A 2QF7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4FNU A;  3TTS A;  5I3F A;  3CGT A;  1JZ3 A;  2A0N A;  2YDA A;  4NJJ A;  2R1M A;  2FPY A;  2WQD A;  1XYL A;  2ASH A;  4PL2 A;  2ZZ7 A;  3DN5 A;  3L0K A;  1KBL A;  3AMC A;  3C56 A;  1MDL A;  5EMU A;  4IWW A;  3E1F 1;  3CTL A;  2HE8 A;  2CHO A;  2DVU A;  3VII A;  3MBD A;  3EB4 A;  2HMC A;  4Y2W A;  2OEJ A;  1O68 A;  1H7X A;  4GNJ A;  4JCM A;  3NVD A;  4UQD A;  1Z42 A;  2FFI A;  3T9P A;  4EXQ A;  2BB0 A;  1JND A;  1GOX A;  2A4A A;  4PTW A;  3DHF A;  3UZZ A;  5A2A A;  2O0T A;  5HAO A;  2WCS A;  3VKB A;  3C2O A;  4L1W A;  3T1G A;  4C6D A;  1LUC B;  5KZD A;  2Z1B A;  2VFI A;  3FYO A;  1W3N A;  4GY7 A;  2A3L A;  1MQP A;  3HJZ A;  1U30 A;  1GQK A;  4V28 A;  3BJS A;  2C91 A;  1QK0 A;  2Z27 A;  3HG2 A;  5HMD A;  4NIR A;  4D6J A;  2VDI A;  1Q8J A;  4IMF A;  4ZBC A;  1KR0 A;  3WD3 A;  4Q32 A;  3RM9 A;  4B2D D;  4GKT A;  1SFJ A;  1ISW A;  3M0X A;  1E3X A;  4KFP A;  1H7W A;  3IIP A;  4DO7 A;  4IF2 A;  1FY6 A;  2ODO A;  5AC4 A;  3NA8 A;  5MHB A;  1XG4 A;  1VC4 A;  4MWA B;  4P61 A;  1Z32 X;  4X3Z A;  2Q3R A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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