2H8X | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	ALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
publication title	Xenobiotic reductase A in the degradation of quinoline by Pseudomonas putida 86: physiological function, structure and mechanism of 8-hydroxycoumarin reduction. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Xenobiotic reductase A
total genus	129
structure length	358
sequence length	358
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-06-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2h8xA00

1GVFA 5CPOA 5AHEA 4MFDA 1VLIA 4UMAA 4JYEA 3C8FA 3DFNA 1N55A 1GYNA 1J2WA 3W1PA 6ALDA 5MHBA 1G69A 3QSTA 4Z1DA 3L5LA 2QCMA 4XTDA 4MZ1A 5FESA 1J5TA 5ABTA 2WSYA 1L6WA 2AQWA 1GZGA 5LKYA 1E51A 3A5FA 4A2SA 4QQ3A 1DOSA 2BTMA 1LYXA 4AEOA 1JRBA 1IIHA 1A5BA 2NX1A 1R2TA 1DJNA 4TO8A 2A2IA 1N8FA 1W3NA 3W7MA 3L0NA 3JS3A 4LVBA 3BW2A 3W72A 3NL2A 4I7UA 2Z2UA 4JYDA 2KZHA 1KM3A 3TU9A 4PL1A 1WX0A 3WJWA 1M5WA 3W70A 2RHGA 1L6SA 4NJGA 3S5ZA 1QPRA 2V9DA 3U8GA 2ABAA 3O6CA 1JUBA 3LB0A 1X6UA 1FDJA 4IX2A 5AFDA 2QCEA 2OT0A 2V82A 4O12A 4MZYA 4PTNA 4KFPA 5LGZA 2YSWA 3CEUA 1ZALA 1R46A 3GXTA 3TKFA 5TBOA 2NXIA 2CWNA 4X2RA 4RCXA 2A1YA 3OBKA 2C3ZA 1V7YA 2A7NA 2ATMA 4LOCA 3W2UA 1CI1A 3GR7A 5HWMA 1VH7A 1JCXA 1OF6A 4MLJA 4FNUA 3NZRA 2NX3A 5EA9A 1O94A 4A22A 3NQCA 4UFJA 4JX5A 4GFSA 5DY2A 2GQAA 3KVMA 3HB9A 4CCCA 2VOMA 3I6RA 4P61A 1K7XA 3UWZA 2Y85A 1LTDA 1THFD 4GUIA 2ZZ5A 3S5YA 3A9IA 3HPSA 1H50A 2NLIA 2J27A 4BR1A 3M43A 3W7PA 3LTPA 2Q8LA 4M7SA 3NQ7A 1R2RA 1JULA 3NXFA 3G1FA 4WY0F 5HMSA 4K36A 1UBSA 4H6KA 2QAPA 4OU1A 4AWSA 4I7WA 1YDVA 2J24A 4M5PA 1W1ZA 3UWWA 3CC1A 3S1VA 3G8RA 3UWQA 1FCVA 1OVDA 1Y0EA 2FB3A 2DZUA 3EX1A 3GXPA 2V2HA 1TYGA 1H1ZA 2JKPA 2E77A 1NVMA 3UY8A 3EWYA 2ZZ6A 4LV4A 2GOUA 3RNDA 4WZHA 3T7VA 5I3GA 3UXAA 1ZENA 1YXDA 1Q6OA 2J9XA 4FIQA 2ZRWA 1W3TA 1DV7A 3NNTA 4Q4KA 3V1PA 3N3MA 1TTJA 1NEYA 4UR7A 3T40A 5FF4A 1YYAA 2Q8ZA 3SJ3A 1ALDA 3TFCA 4RV8A 1MEIA 2OT1A 3E49A 2EHHA 2NXHA 4XQ6A 4IMFA 2OJPA 3IIXA 2WV8A 2B7PA 1W5QA 4DF0A 3L0GA 2FPTA 3M5ZA 1W5MA 4CQAA 4MJMA 5CPLA 5D2TA 2ZA1A 4FHAA 3W1XA 3TDFA 4K8EA 3T55A 3S0CA 4DEFA 3P7YA 1LOQA 5CPNA 1IXPA 1ZHAA 4XKYA 3S1UA 1KFJA 5LNVA 2RH9A 2VFEA 3AJXA 1QFEA 3M44A 4JTUA 3QPYA 1QPOA 3H53A 3MI3A 3O15A 3P62A 3R89A 3K30A 3BLFA 3GR8A 1A53A 3DFQA 4IX0A 3FYOA 2FPYA 3DENA 4WX2A 3NQ2A 4DPQA 5J5RA 2ZZ7A 1EP1A 1RZMA 1PCWA 4KWVA 4JX6A 5BNKA 5CSRA 3TFXA 2VKZG 3W1AA 4HT3A 3PY2A 5D2VA 3TIMA 4LC8A 1Q6QA 2H3DA 4ICNA 1R47A 3FKRA 3NPVA 3QC3A 4N4PA 5F4XA 3NPXA 2CZFA 4ADTA 2V2DA 2C18A 3QFEA 2E1DA 2ZYFA 4NXSA 1S5WA 5HULA 4MY8A 1D3GA 2NV2A 4R53A 4YWIA 2WPBA 4I9AA 1OFAA 4BF9A 3R8RA 3W7NA 4MOZA 4Z08A 3KXQA 3CT7A 4XWUA 3EXRA 2ZCGA 2WO5A 4Y8FA 3P81A 1PS9A 4N9BA 5EKYA 4IPIA 3QMRA 5FF0A 5F4SA 3LHZA 4PCFA 3UY7A 1GVQA 3PVFA 2ZFAA 4LVFA 1JCNA 2HSAA 2YX0A 1OG0A 2YFOA 4M6QA 1VJIA 4B5NA 1OFDA 3STEA 2DZXA 3T4CA 2CLEA 1QAPA 1QOQA 3P61A 4LVAA 4QSHA 3W1RA 3EEGA 2O7SA 3QEZA 3Q58A 3MP3A 1W56A 5D2YA 3C2EA 3C2RA 1KFEA 2E6DA 4GRSA 1HO4A 1O60A 2ZZ3A 5E1QA 2NZLA 2Y62A 4K6AA 4DO4A 3NQFA 2H90A 4TU1A 1LROA 5K9CA 2JGYA 4AHOA 4ALDA 4EF8A 4A21A 3KVLA 3UZ5A 3DI1A 4L4LA 1AW5A 1KTNA 1OK6A 3JR2A 5D05A 1K03A 1LLZA 3QQ0A 4JYFA 5D09A 2E6YA 2J9YA 1LBLA 1C9DA 4ML9A 4TIMA 1LCOA 4UTIA 1SR9A 3GDKA 1VR6A 4M19A 5EYWA 5KZMA 4JTFA 3IVTA 3EKLA 4FIRA 2GJLA 4CNOA 3O8AA 4YLWA 2NV1A 1KM6A 4IXHA 4I7VA 3WFAA 3I65A 1WOBA 4UFHA 4HIBA 3U2OA 4O16A 2R91A 5CZ0A 4YCOA 2Y88A 2ZZ2A 3SY5A 2QJHA 4CCEA 4O15A 1IIGA 5LHFA 1YPFA 3L5AA 2TSYA 2E09A 3VNDA 1C8VA 5KZEA 5CSSA 3EX4A 2ZTKA 1AMKA 3H55A 3MMTA 3A5VA 3HGOA 4TMCA 1A5AA 3PB0A 3E0IA 2QUTA 2P1FA 4JTSA 3YPIA 1I2QA 3EB2A 3HOJA 1DJQA 3UXDA 3ABSA 2Y7EA 5K4ZA 2ZTJA 1O5XA 4ZQCA 5K7JA 1SO5A 1TO3A 1CX9A 3KVJA 2TPSA 3B03A 1FX6A 5HUPA 1JCLA 1L2UA 3C0JA 5IM51 5LNRA 1ICSA 5G4EA 3Q37A 4MUZA 4ORIA 1F74A 4OE7A 5D30A 4ZMGA 5CGQA 2CU0A 2E5DA 2QCLA 3S1XA 3QJAA 5K3VA 4GUGA 5DELA 2NWSA 4IMCA 3BGJA 3HIJA 4JN6A 2Y6ZA 3B06A 3LHUA 1UB3A 3IVUA 1H63A 3NGJA 3UPWA 4UTWA 1H7XA 2QF7A 4L4MA 2QCCA 1KLYA 1PL9A 3C52A 4BI5A 5LGXA 1W54A 3KAOA 1PV8A 3PF3A 5AHIA 4UTHA 3DH7A 1F76A 1KV5A 4GE8A 4DELA 2DZWA 1RV8A 3O6DA 2BLEA 4LUIA 4BI6A 4TMBA 4OQVA 1P0KA 1KFKA 3P80A 4XTIA 4AWTA 5D04C 2VEPA 1T8XA 5I3JA 2VELA 5FI8A 4JX4A 1OABA 3ELFA 1T99A 3W3OA 1LOLA 5EMUA 2VXNA 1Q6RA 4NX0A 3NQ6A 1XDLA 4AB4A 4CCDA 5DCBA 2FPVA 4MY9A 1QPQA 4AHQA 3DHFA 4UTTC 1H62A 1RQBA 2YXGA 4LU0A 1G4SA 3BVJA 1WAUA 5FEZA 3LHYA 2OMAA 4FNPA 2H6RA 3S5NA 4AF0A 5DY3A 1ZCOA 1ONRA 1TTQA 1G67A 4NXKA 4XBKA 4UCGA 4O0ZA 2NWRA 3HG2A 5G1TA 3S9YA 2DP3A 4FNRA 4ZL1A 3MI2A 2QEZA 3DXIA 1J4EA 1X7FA 5EBUA 1YDOA 1FDYA 4CQ9A 3HBLA 2CZDA 3G1AA 3RMJA 4OGZA 1XI3A 1ZAHA 3W71A 4JTIA 2X1SA 3G3MA 3DFTA 2VFGA 3MUXA 4XKYB 2JK2A 4LV9A 3GNDA 3HJZA 4JS3A 1TRDA 1TQJA 3NOEA 3USBA 4RZ6A 3A21A 2ZBTA 1SU5A 1IXQA 2YZRA 3IGUA 2X1RA 1Z48A 3NPWA 2Q3OA 4IPJA 1SZEA 3EWWA 1ZFJA 3NQAA 3TAOA 4CNNA 3MO7A 3HQ1A 1HO1A 5TQLA 1RVGA 4KFNA 4JR5A 3TSBA 4HPJA 1W3IA 4NUWA 3TH6A 4DO6A 2J88A 4GXMA 4AWUA 3W84A 1ML1A 1ZJIA 4AH7A 1SZNA 1N7KA 3O05A 3LX9A 1EUAA 1G4TA 3ATZA 3BG5A 3OVQA 3A24A 4UTWC 1SW0A 3SGZA 8TIMA 2DZPA 5HWJA 3TA6A 1QO5A 1K7FA 2XN0A 3LCGA 4K38A 2YYTA 3G0XA 2X16A 2C19A 2F7FA 4JDYA 1VZWA 3H54A 1OFEA 1OYAA 2GUUA 3EX6A 1LDCA 2HMCA 2RKXA 4NX5A 2V30A 1S5TA 4OHQA 3OA3A 2ISVA 1OJXA 3DKJA 3GKFA 1MSSA 3EWUA 4RZ4A 4N9DA 4FX8A 1FWWA 1SW3A 4O4WA 5D2XA 4O8RA 3GZ3A 1TV7A 3OHIA 4Q33A 3NVTA 3G24A 2YW4A 2QCHA 3OEXA 2ISWA 2VEKA 1JCJA 4NNCA 3GDTA 3W7OA 1A5CA 5IBXC 3FJLA 4NU7A 5E93A 3ATYA 3P8IA 3MW7A 4UIOA 1QNVA 4QNEA 3STGA 2XFWA 1YADA 3LTSA 1MO0A 4FX6M 2CW6A 1RQEA 2FFCA 3W1UA 4FB7A 2YPIA 1I2OA 1H51A 3TQVA 2CLKA 1GJPA 4GJ1A 4OWGA 4UFLA 3IVSA 1NF7A 5K9DA 3LCFA 3INPA 1EX5A 5C5YA 2AAMA 2DORA 1QMLA 2RDWA 1KTCA 2DJXA 3S1WA 1H61A 1VCFA 5K9XA 1I2RA 4O0KA 1WA3A 1JQVA 4BFAA 1GT8A 3FKKA 3BG9A 3MWAA 4FF7A 4P2VA 2C6QA 5LSMA 4R33A 1FWTA 3W2NA 2JKAA 2JKEA 4HSNA 2RDTA 2G95A 3PR2A 2YW3A 2GVLA 2A7RA 2C13A 4JIPA 1DVJA 4LW7A 5J5DA 1ZAIA 3M5YA 1KM5A 4O1DA 3QZEA 2E5CA 5A5WA 3MP4A 2JBMA 3HGJA 1JCYA 1Q45A 1TTIA 2R94A 5DBUA 3C4UA 5I3KA 2PRHA 1Q3NA 4RR4A 3MBDA 1BKSA 3W85A 5FEPA 2WNNA 2HTMA 2B0MA 5DCDA 3NYZA 4FXSA 3QSRA 5LNUA 4HKPA 1L6YA 5AHLA 1ME8A 2OCZA 3SFKA 3PBVA 3ZWSA 3LCIA 5DXYA 3P67A 1XBYA 1TPC1 3O07A 1VHCA 3QPZA 3SGUA 5AYZA 4ONVA 4O10A 4WOQA 1JUEA 2H8XA 1KTBA 4NZJA 1FBAA 1TPB1 1EP2A 1XUUA 3N9RA 1K8XA 1HG3A 1TPDA 1F5ZA 2ZDRA 2CZ5A 1G6CA 1LP6A 2ABBA 3LI1A 5KMYA 1GVRA 2VFDA 1TRIA 3HO8A 5CZSA 1SFLA 5KZDA 3W88A 2PCQA 3P5ZA 4TX9A 3UYCA 1B4EA 3M0ZA 2R14A 5G4WA 4QITA 1VLWA 1OFBA 1LLWA 4LUJA 2F84A 1X1ZA 3MP5A 3RFAA 3G1YA 4JGDA 1P4CA 3GYEA 5HINA 5G1YA 3B4UA 3WJSA 4BWLA 4W9TA 5G2IA 3QW3A 1OFOA 3M6YA 3S8HA 3M47A 4N2YA 3S6DA 4UMBA 4O1AA 4UXDA 4RKAA 2H3BA 2X2GA 1X8FA 2Z1BA 4JICA 1TPVA 3NAVA 5DLCA 2QUUA 1BWKA 4WJEA 4GBUA 3SZ8A 1OX5A 1W8SA 1WXJA 3GNNA 4PEKA 1O95A 3P5YA 3PG8A 4EVZA 3CEPA 5F1UA 2OZ0A 3TJLA 2EAWA 3BLEA 4AF0B 3EX3A 3C2VA 1WYIA 4MPQA 5TIMA 4QNWA 3PSVA 3HPXA 1W5NA 1F2JA 4POCA 1KFLA 1PIIA 1R2SA 4O1CA 5D33A 1SW7A 1O4UA 3N34A 4AVFA 1Z44A 3CWOX 4AAJA 3M1ZA 3G22A 2A21A 4IGHA 1DORA 4O19A 3PBYA 5DXXA 1GVOA 4TR9A 3D0CA 1R30A 2PRMA 5I3IA 4MFEA 5A8GA 4Z1CA 5C2XA 2GQ9A 3PUOA 3GB6A 4UFIA 4S1FA 3TQ0A 1I45A 2ZQ0A 5D38A 1DBTA 3C61A 3LHTA 3FFSA 3N73A 3NM1A 1ME7A 3NL5A 4FX7A 4GC4A 3MHUA 1SUXA 3OG3A 3UNDA 4DBDA 3W76A 2A6LA 5E0KA 3HPZA 1FXPA 3VFLA 1H7PA 3WJZA 4MLRA 1AL7A 2DZSA 1FQ0A 2PURA 4ZQOA 2G5WA 1LBFA 1W5OA 3L68A 5CG7A 3PB2A 4UFKA 4LY8A 2NX9A 4DXVA 3O1NA 3WJXA 2YGYA 3BO9A 3R12A 3W7CA 2CLMA 4FNTA 5H2ZA 4E2BA 3HF3A 1GOXA 1EWDA 3LERA 5HQEA 3P60A 3TR2A 4YL2A 5LHEA 4IMEA 3DAQA 3FJ6A 3W7JA 1F6KA 3W2LA 1VHNA 3NEVA 1TV5A 1BEUA 1RQHA 2VFFA 5FEXA 1TV8A 3S5OA 1BWLA 3B0UX 3MI6A 4IWWA 4PL2A 5AHFA 5F2IA 2ZRUA 3A22A 1IF2A 4M7TA 3TUUA 3G1VA 3LRKA 3PULA 4HSOA 2CLFA 1AW1A 1P1XA 2ALDA 4A3UA 5G2HA 4S2CA 4UTKA 3NQMA 1DQWA 5D02A 1SZGA 4UR8A 4LT9A 1PHQA 3G0UA 4BWLC 3ZWTA 1OYBA 3L2IA 3IIZA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2H8XA

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