2HISA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase double mutant e127a/h205n with covalent cellobiose
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNAAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSNLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into transition state stabilization of the beta-1,4-glycosidase Cex by covalent intermediate accumulation in active site mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELLULOMONAS FIMI FAMILY 10 BETA-1,4-GLYCANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
total genus 118
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1998-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2hisA00
4PTVA 4P8UA 2D0HA 4URIA 3AIRA 5BRPA 3KE0A 4HA4A 3VIKA 2WMGA 3AMGA 3T09A 1CGVA 7TAAA 3AI0A 4D6IA 1W2PA 3W27A 1UH3A 2OYLA 3AHTA 3OZPA 3GYCA 1AMYA 8A3HA 3PTKA 4J7RA 4P7OA 2J25A 1TFVA 3CZJA 1QOXA 1OD0A 4MNMA 2QMJA 3AISA 2YA1A 3UR7A 4PMOA 1O7AA 4UFHA 1PJ9A 4HOZA 3KEHA 1NOWA 1BVZA 1KGWA 1WDRA 1FH7A 4W89A 4F9DA 2E9MA 1OIFA 4J3TA 3D5HA 1JI2A 1WZAA 1GW1A 2VVNA 1WB0A 2VZVA 2J8FA 4GIAA 3CUJA 2OSXA 1JAKA 3N11A 1EH9A 1I1XA 5ABFB 1OT1A 1U30A 3AS0A 4J3UA 5JBEA 3WF1A 1E71M 3PZOA 3MANA 4GQQA 2WSPA 2X2YA 4PMQA 3J7HA 3AYRA 2YLAA 4JL2A 1U33A 2XFYA 4RE3A 2E9BA 1K9EA 1V0MA 5I77A 2ZX6A 3CUFA 5CGMA 3LPFA 2CBIA 3UG4A 2ZUVA 2V3GA 1W3JA 2G4FA 4HU8A 1KB3A 1EGZA 1PBGA 1WDPA 3L4TA 3FN9A 3WL1A 1IZJA 3OA5A 2J75A 1WPCA 4CD8A 1V03A 2BNJA 3U57A 4QCEA 2FHBA 4E4PA 1W2VA 4UFJA 1MW2A 1JYVA 1EDTA 4W5ZA 1M03A 1Q6CA 2ZUSA 3UETA 3NIYA 5BXRA 1JGIA 3ARWA 4LQ1A 2DSWA 4P7QA 1ECEA 1W32A 2BVDA 1XCXA 1JZ3A 3N9KA 1W9PA 3L2MA 1GNXA 5LA2A 2D0FA 1SFSA 2WBKA 2WVVB 3UCQA 4HPHA 5CSUA 1C91A 4NZCA 1UKTA 4GI9A 5FOOA 1GZJA 4UCFA 1LLOA 2Z1SA 4UOZA 2V3EA 3RDKA 1UZ4A 3WNMA 2XIBA 3KL5A 1W9VA 2FGLA 2J74A 4TTGA 1VRXA 4IM4A 4J3VA 2VO5A 2D3LA 2W92A 5ABEA 1V0NA 3PZ9A 4D6HA 5A1AA 1NWTA 3ZIZA 4BQ4A 5BCAA 1CXHA 3VD7A 1WCGA 4UFLA 3NUKA 1KCKA 1ZB5A 2JEPA 1GORA 2VZTA 3ZM8A 5IFPA 1AQHA 1B31A 4MB1A 5DEZA 3SURA 1XC6A 3IJ9A 2VI0A 4A3YA 4CKQA 4BF7A 1V6YA 4IPLA 3AZTA 4DWSA 1HNYA 1B2YA 3RM8A 5M17A 3RCNA 3GBEA 2BXZA 3II1A 3WD0A 1C7SA 1H0GA 3SCRA 3L4UA 2G3JA 4PYSA 1FHLA 1QI2A 2XM1A 2JEQA 5A6AA 3CZEA 2JIEA 1J01A 3GM8A 1K9FA 5E09A 2EPMX 1JZ8A 1B3YA 3WDPP 2J7GA 3ZMRA 3AS3A 1R87A 1B3XA 1R86A 3B9EA 4DM1A 3A4XA 3SUWA 3EDKA 1KXTA 2DT1A 4GO9A 1UR0A 1V6VA 5CLWA 3WQ5A 2XIIA 1P6WA 3VU2A 2AMGA 3AIUA 3WF3A 1G94A 4WSKA 4HP5A 5A69A 2BV9A 1DP0A 1LF1A 4GZEA 3NJ3A 3FY1A 1WE5A 2FGZA 2PWHA 1UKOA 1CYGA 2V5DA 1L0PA 1C93A 3EMCA 1TR1A 2XJ7A 2QMKA 3VTRA 1W1TA 4HZ7A 1KCLA 7A3HA 3BXWA 3MKKA 2XYLA 5D8ZA 4CD6A 4W8BA 1FOBA 1XD0A 1FHDA 2WVSA 3WH6A 1MQPA 4XV0A 3AROA 3KZSA 1XSKA 4Q7NA 1XH2A 4AWEA 3BLKA 1V3LA 3VGHA 3A3HA 1EO5A 4WIWA 2NW0A 2VZUA 3IK2A 4UQ9A 4E8CA 2C7FA 3KWXA 4BQ5A 1R8LA 2E4TA 3BAKA 3OLIA 4WKAA 7CGTA 4JCLA 3DHUA 3EDJA 5A6JA 4TVCA 1V3HA 3ZOAA 1UR1A 6CGTA 1VAHA 3VMNA 1E5JA 2VJXA 1XSIA 3ZJKA 4D1IA 4LGXA 4FMVA 3CO4A 1QBBA 1V0KA 5A2CA 2PWFA 1JIBA 3UEQA 4PMRA 4ZE5A 1VFMA 4M29A 1HVQA 3CUGA 1HF6A 2A3CA 1UQYA 2PC8A 4PMXA 1JZ7A 1H0IA 4CUCA 4XUYA 1GOQA 1GVIA 2J7HA 3EDDA 4LPCA 4DM2A 3A6OA 3OZOA 2XPKA 2WHMA 5ABFA 4D6EA 2QPUA 4PMNA 5DF0A 4ACZB 3SCVA 4B16A 4JFTA 1C92A 1NWSA 2YDQA 3U5YA 3WEOA 1VBUA 3AYSA 4M24A 3ZQ9A 3FHAA 1PX4A 1QPKA 2WAGA 3N1AA 3WQWA 3MV11 1KBBA 3K8KA 2BXYA 4UFMA 2WK2A 4BCEA 4M82A 1LL4A 1HKIA 1HXJA 4GO8A 3W28A 5HDRA 1OD8A 4MAZA 1PPIA 1E4MM 2WCSA 1WZMA 3VIJA 2XSAA 2EPOA 3ARUA 4CD7A 2E40A 2HVMA 3RJXA 2XGIA 3RIKA 1TVPA 3ARZA 4NI3A 5A8NA 3PZGA 2XFFA 4E8DA 1VENA 4R27A 1E4LA 3FAXA 3UERA 1UWQA 1HVXA 2G3IA 1Q6DA 2CKRA 3T2PA 4F8XA 4LX4A 2ZX5A 3AXHA 3ZSTA 3N13A 2EBNA 1GHRA 1Q6FA 4MNKA 5DFAA 1H5VA 4HMDA 2OWWA 3M6DA 4MB3A 1CGWA 2D23A 3QOKA 1QW8A 2NSXA 3VGBA 4U33A 1FFRA 5JIWA 2V5CA 1NWRA 5JBDA 4WSJA 1W9DM 3W26A 2WYSA 1H09A 3KL3A 3DECA 2WHJA 5F7UA 2J7FA 3T0BA 5KEZA 1UWRA 5EBAA 4BQ2A 4YN5A 1BPLB 3EDFA 1NM9A 2OYKA 3TOPA 3W81A 1E43A 3GNRA 3BC9A 2PWGA 1WNOA 2CITA 3TA9A 4PMVA 2AOSA 2QPSA 1JFHA 1JYWA 4BQ3A 2YJQA 2F61A 4QLLA 1G5AA 3RO8A 2WSKA 3MSDA 1EHNA 1LG1A 3I3BA 2GFTA 4Z2LA 3U5UA 1CXFA 1CXKA 1V0LA 3UR8A 3MMUA 1BAGA 5CQ1A 2D0GA 1CGXA 1JZ4A 3BAJA 1MQRA 2D2OA 3LPGA 1HN1A 3G6MA 2VCBA 3QGVA 3WNOA 4J3SA 3OGRA 3ZJ7A 1JYNA 2WMFA 4ZFMA 3THCA 1D2KA 3VMPA 1LWHA 1H1NA 3CPUA 2ZX9A 2WZHA 5GNZA 4Z2IA 3BMWA 3M07A 3ARQA 2OSWA 2WCGA 1H2JA 1E6SM 2V38A 2CHNA 1C7TA 1HIZA 2WPGA 1JNDA 1KXVA 3I3EA 4M81A 3WIJA 2XGBA 4N0RA 4CCEA 1ISYA 2HISA 4CU7A 3RMEA 1ISZA 4P8VA 1LG2A 3EMZA 1X6NA 1AQMA 1GVYA 1A47A 5AYBA 3VIGA 1ITCA 2WVTA 1TE1A 1BQCA 1E0WA 3AXXA 3AHVA 3WBEA 2X1IA 2WBGA 1QHPA 3OGSA 3W37A 4HA1A 2QV4A 3WFZA 4W7WA 3TTQA 3L4YA 5A8PA 5CPSA 3WD2A 3L2LA 4HTYA 1E0VA 4M8UA 1JI1A 2ZWYA 1TMQA 3O2LA 1XYFA 3MMWA 4P7NA 3VPLA 3UG5A 3RJYA 3CHFA 1EDQA 3GNPA 1IZKA 1NARA 2C0HA 4MDPA 1GQKA 1LJYA 2X09A 4J3XA 1E6RA 3MUY1 4EKJA 4EE9A 3SEPA 3PZMA 2E9LA 1CNVA 3WF4A 3ZR5A 3BSHA 3VIHA 3D3AA 3WELA 3MS8A 2D24A 1C8XA 1E1EA 3AIVA 4AZ5A 5DMYA 3VNYA 3SCTA 1NP0A 4ACYA 4B15A 1PX3A 3WMSA 3PTQA 1V6WA 2WZIA 3BAXA 1JNEA 1G1YA 3A47A 1OWQA 3U7BA 2WMIB 4KWUA 5A6LA 4TOQA 2W66A 1G01A 1GONA 2W67A 2EPKX 1XH1A 5D8WA 3TTYA 1GOWA 1E6PA 5DT7A 3WKZA 4D6JA 1DTUA 1PZ2A 4AY1A 3POHA 2JIWA 2XUCA 2YBUA 3ECQA 4AD3A 2ZIDA 1KR0A 4A4AA 5GPRA 3F5JA 1SMAA 3CTTA 4KH2A 2QHAA 4JKKA 2ZICA 3BAWA 4Z2KA 5I2UA 1AVAA 4B9ZA 4JFVA 2E0PA 1JDCA 5DO8A 2CYGA 5GQBA 1WZKA 4ACZA 1JF5A 2Y8VA 1PIFA 2D3NA 1OBAA 1E40A 4A3HA 4W8LA 3PZVA 1GQLA 1XYZA 2GJXB 5M03A 1H3GA 5AC4A 4FLRA 3SIMA 4AEEA 3T0DA 5LYRA 3PTMA 4D1JA 1RH9A 4JKMA 4M80A 1B90A 2O92A 4JL1A 1R7OA 1GHSA 5FL0A 2XHYA 5FCZA 2VX6A 1EOKA 1HJUA 3WD3A 3AZSA 4JFUA 3T08A 1C8QA 5A3HA 1KQYA 4RE2A 4AW7A 1DWGM 1TZ7A 1B9ZA 1MXDA 1NQ6A 4W7VA 1GPFA 3GDBA 3ZO9A 3W4RA 1BFNA 2G3NA 3LPOA 3K4DA 4YPJA 4MJ4A 2CBVA 1J0HA 2ZUMA 4L4PA 3QHMA 4Y7EA 3W6LA 4DUVA 2DIEA 1VB9A 3AMLA 1E4NA 3GTNA 3VX0A 2X0YA 1QNRA 1ZJAA 5CPQA 2VURA 1JD7A 4M1RA 1QHOA 2Q8XA 3CHEA 2WC4A 1OGBA 5D9PA 2J47A 2ZE0A 3K46A 1UWUA 1UD2A 3WMCA 5CZKA 2DT2A 3AMCA 3CZGA 3AHZA 4JIEA 4P7RA 4ATLA 4HMCA 4OUEA 2GVYA 3T2OA 3UG3A 3WNLA 2WM0A 1UG6A 3WH5A 2ZUUA 4W84A 1UD8A 3ALGA 4AXNA 2OLHA 4ML4A 4AD0A 1L8NA 2JALA 2O9RA 3POCA 3GH7A 2BY2A 4B9YA 1V6UA 3QOMA 1UR4A 4GQRA 4U2YA 3WH8A 4DUXA 1E0XA 2X05A 4OKDA 1FA2A 4AZBA 1OINA 1VBRA 3WUEA 2W5FA 4HPGA 4H04A 5JIPA 3CIVA 1UZ1A 3VOCA 3FW6A 4AIOA 4TX8A 5A8QA 4WJXA 1UKSA 2WVUA 4IISA 1J0ZA 3UESA 3WN6A 1Z32X 1K9TA 3BMVA 3ZJ8A 3AIBA 2XSBA 1C90A 1HX0A 2Y8KA 2EJ1A 3BAIA 5A6SA 4OOUA 2J62A 4PEEA 3M7SA 4LYPA 1ZBCA 3HU7A 1ITXA 4H7VA 2ZXBA 4W88A 1W1YA 4W86A 1QI0A 2FDMA 2OYMA 1EXPA 3W82A 1ZBWA 3AXIA 5A6BA 2ZXAA 1CWYA 1J12A 3B9DA 5JBFA 1GOMA 2VOTA 4U31A 1BYDA 3IJ8A 1UUQA 5A8MA 1TUXA 2OWXA 4ZE4A 5C70A 4F79A 4WK9A 1QVBA 1XD1A 4UZSA 1CLVA 1A3HA 1W3KA 1V3IA 3WD1A 4ZXOA 4GINA 3VDAA 3ALFA 1QBAA 3MO4A 2WC7A 3FNDA 1CXIA 1GOOA 3SCOA 2DT0A 4IUGA 2VVSA 3AS1A 3W53A 4V28A 1DWFM 3SCSA 4HZ8A 3NYDA 4FLOA 2DH3A 2CETA 1DWIM 1CXLA 2IXUA 3DHPA 5E6YA 1HJWA 3VKKA 1F4AA 3CGTA 4YHEA 3AMKA 4IPNB 5IDIA 2UY3A 1CLXA 3GXIA 4H8HA 1EA9C 2DSUA 1KWKA 1W9BM 2VQUA 3PBGA 1WP6A 3WSUA 4C7DA 5EB8A 2ZOXA 3GBDA 1ZJBA 3HJEA 5GNYA 2G3MA 1J11A 3OLEA 3ARVA 3CZLA 2ZX7A 5ABHA 1ZL1A 4PMUA 5AY7A 1B0IA 4JAWA 3MSGA 1J0IA 2WMIA 1ZU8A 3F5KA 2W91A 2WMHA 3VD3A 5A8OA 3WDRA 4PN2A 4QP0A 3DYOA 2VTFA 4UZUA 4D6FA 4PRWA 2E8YA 2D20A 4BZYA 2VX7A 3G6LA 3VD5A 4TTUA 3WEMA 4J3WA 3ARPA 2MANA 2XVNA 2CKSA 1W9UA 2YKKA 2J77A 4U5KA 2WXDM 4CU8A 4AZCB 1E6QM 4NRSA 2WANA 3AHYA 3TONA 5HXMA 4JZ5A 2GJXA 2OSYA 3EYPA 5I5RA 1HP4A 4PMYA 2J4GA 1DWJM 5JUVA 1YQ2A 1EQCA 3QR3A 1K9DA 2DDXA 4AD5A 3IAPA 4NSBA 3BAYA 4HMEA 1GJWA 3SCQA 2CNCA 4X0NA 1NWUA 2F2HA 3PZIA 5HPCA 1RP8A 1M01A 1OGGA 2C8NA 2CPUA 4N42A 2JFEX 5E0FA 4AIUA 5I3DA 2Y24A 1VFUA 3AOFA 2B31A 4NF7A 1MVYA 4CVUA 3VNZA 3MUAA 4L4OA 3FXYA 1V3JA 1SMDA 2WVVA 1HKKA 3WQ8A 1VJZA 1VFFA 2PB1A 5A2BA 1CTNA 1JD9A 3SCPA 3APGA 1B3WA 2A3BA 2ZUNA 3PZUA 5BXTA 3K1DA 1US2A 4PUEA 3IANA 3B9AA 4V2XA 1BLIA 2PI6A 4GXPA 1FFQA 5GNXA 1UWTA 4QAWA 1ESWA 3PN8A 1W1PA 1TA3B 1JG9A 2VX4A 1V02A 3VD4A 4J27A 3RM4A 2CCRA 4XX6A 5FL1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PTV A;  4P8U A;  2D0H A;  4URI A;  3AIR A;  5BRP A;  3KE0 A;  4HA4 A;  3VIK A;  2WMG A;  3AMG A;  3T09 A;  1CGV A;  7TAA A;  3AI0 A;  4D6I A;  1W2P A;  3W27 A;  1UH3 A;  2OYL A;  3AHT A;  3OZP A;  3GYC A;  1AMY A;  8A3H A;  3PTK A;  4J7R A;  4P7O A;  2J25 A;  1TFV A;  3CZJ A;  1QOX A;  1OD0 A;  4MNM A;  2QMJ A;  3AIS A;  2YA1 A;  3UR7 A;  4PMO A;  1O7A A;  4UFH A;  1PJ9 A;  4HOZ A;  3KEH A;  1NOW A;  1BVZ A;  1KGW A;  1WDR A;  1FH7 A;  4W89 A;  4F9D A;  2E9M A;  1OIF A;  4J3T A;  3D5H A;  1JI2 A;  1WZA A;  1GW1 A;  2VVN A;  1WB0 A;  2VZV A;  2J8F A;  4GIA A;  3CUJ A;  2OSX A;  1JAK A;  3N11 A;  1EH9 A;  1I1X A;  5ABF B;  1OT1 A;  1U30 A;  3AS0 A;  4J3U A;  5JBE A;  3WF1 A;  1E71 M;  3PZO A;  3MAN A;  4GQQ A;  2WSP A;  2X2Y A;  4PMQ A;  3J7H A;  3AYR A;  2YLA A;  4JL2 A;  1U33 A;  2XFY A;  4RE3 A;  2E9B A;  1K9E A;  1V0M A;  5I77 A;  2ZX6 A;  3CUF A;  5CGM A;  3LPF A;  2CBI A;  3UG4 A;  2ZUV A;  2V3G A;  1W3J A;  2G4F A;  4HU8 A;  1KB3 A;  1EGZ A;  1PBG A;  1WDP A;  3L4T A;  3FN9 A;  3WL1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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