2HS6A

Crystal structure of the e291k mutant of 12-oxophytodienoate reductase 3 (opr3) from tomato
Total Genus 137
50100150200250300350020406080100120140
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
376
structure length
362
Chain Sequence
NPLFSPYKMGKFNLSHRVVLAPMTRCRALNNIPQAALGEYYEQRATAGGFLITEGTMISPTSAGFPHVPGIFTKEQVREWKKIVDVVHAKGAVIFCQLWHVGRASHEVYQPAGAAPISSTEKPISNRWRILMPDGTHGIYPKPRAIGTYEISQVVEDYRRSALNAIEAGFDGIEIHGAHGYLIDQFLKDGINDRTDEYGGSLANRCKFITQVVQAVVSAIGADRVGVRVSPAIDHLDAMDSNPLSLGLAVVERLNKIQLHSGSKLAYLHVTQPREEEEARLMRTLRNAYQGTFICSGGYTRELGIEAVAQGDADLVSYGRLFISNPDLVMRIKLNAPLNKYNRKTFYTQDPVVGYTDYPFLQ
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (11-13)EMPTYAH5 (211-229)S1 (16-18)AH1 (44-53)O2 (312-314)S13 (316-319)S2 (21-23)TI7 (348-351)S3 (27-29)AH10 (351-357)3H2 (38-40)O1 (36-38)TIV9 (319-322)TII1 (55-58)S4 (59-65)S5 (102-107)AH3 (157-177)TI1 (68-71)TIV2 (74-77)3H4 (120-122)S10 (181-185)S11 (234-238)TII'2 (110-113)TIV3 (111-114)3H3 (116-118)S8 (146-148)TI3 (141-144)TI'1 (187-190)S6 (126-127)TIV4 (127-130)S7 (138-140)TI2 (134-137)AH4 (191-196)AH6 (252-270)TI5 (205-208)3H5 (231-233)TI4 (197-200)TIV5 (198-201)TI6 (239-242)TIV6 (243-246)TIV7 (244-247)TIV8 (249-252)S12 (276-280)AH7 (298-311)AH8 (324-333)S14 (338-341)AH9 (343-347)TIV1 (17-20)S9 (153-154)AH2 (83-99)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Solanum lycopersicum
publication title Crystal structure of 12-oxophytodienoate reductase 3 from tomato: Self-inhibition by dimerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 12-oxophytodienoate reductase 3
total genus 137
structure length 362
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.42: 12-oxophytodienoate reductase.
pdb deposition date 2006-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2hs6A00
2DU2A 5K9XA 1G4TA 3N9SA 2E6DA 3BK0A 3W7QA 1SO3A 1KFCA 4CNPA 4O1CA 4H4IA 4RLIA 4JGDA 4MIMA 1OYAA 2E68A 3AO0A 1ZENA 4DF1A 3G1DA 1AL8A 1NEYA 3TSMA 1OFAA 3S5OA 1FDYA 3EWUA 1SZGA 4MY1A 1MXSA 2HSAA 4A29A 4LUJA 3FFSA 1KM0A 1D3HA 3ABQA 1IIGA 3UZ5A 4FNUA 2VKZG 1FDZA 2GVGA 3HGOA 3TW7A 3G1FA 3IGSA 4LC8A 1GVSA 1Y0EA 5KZDA 3W88A 4MVAA 2DZVA 3P67A 3CB8A 4OV9A 1LBLA 4DELA 2BLEA 3LB0A 1H61A 3A5VA 5DY3A 3P62A 2FLIA 3L0GA 3M1ZA 3NEVA 2GJNA 4OU1A 5EMUA 1OG0A 1K8ZA 2C16A 3BG5A 3E12A 3SECA 1EB3A 3OA3A 3PBWA 1JJKA 4Y8FA 2NZLA 1H7NA 2X1SA 4XKYB 2FIQA 3NQFA 4TX9A 2YSWA 3LCGA 4FB7A 4P2VA 1A5AA 2PE4A 2I1OA 2VEMA 3M5XA 4AHOA 3FJLA 1LRQA 1F6KA 3LOTA 1SO5A 4Q32A 4NX5A 2NUYA 2FB3A 3GX9A 1SFLA 3TSBA 1KM4A 4KFOA 1H1YA 2ZZ7A 3BLIA 1TTPA 1PV8A 1S5VA 4O4VA 1OFPA 2UV8G 3TFXA 4JD4A 4JTJA 2ZBTA 2ZTJA 4O1DA 3PBUA 2C14A 4LNYA 3G1VA 3R89A 1GVRA 2OJPA 3E0IA 2C19A 5E0KA 4O54A 1G7UA 2XN1A 1GWJA 5LGZA 3W83A 2Z2UA 3WJZA 4UTWC 2V30A 3SJ3A 2WNNA 3TQ0A 2C18A 3C0JA 3CQ0A 1O5XA 3W1RA 3ELFA 3G0SA 3UWQA 3P5ZA 2C3ZA 3I68A 1QDSA 3N2XA 1H7RA 1C29A 4KFNA 1ZALA 3W7NA 2O7SA 4R33A 3BG3A 3SR7A 3CHVA 4O13A 5DXXA 3S0CA 1HG3A 3SI9A 2DJXA 2DP3A 5FF2A 1W5OA 3WK2A 2R14A 3G0XA 4NXSA 3W75A 1XM3A 1KW1A 2OCZA 2EGZA 5D02A 1W3IA 3EXRA 1RZMA 5AHEA 3T44A 3W2UA 1QNVA 4YWIA 1XI3A 3GKFA 2NV2A 2YPIA 5D2WA 1SPQA 1QPNA 4O17A 4RZ6A 4O53A 3W73A 2C1HA 3G8EA 3W1XA 4UFKA 3T40A 1LTDA 1TPUA 3CWNA 1S5WA 1XBYA 3WK3A 4LT9A 2VXNA 3N2MA 3L67A 1JVNA 5D38A 4LVDA 5CGQA 1GG1A 3DHDA 3F1QA 5KZEA 5IM51 3C56A 1X1OA 2WSRA 1QO5A 1UB3A 4Z08A 3S9YA 1Z44A 4MOZA 5H2ZA 3W7DA 3SW6A 4C1KA 4JDBA 3L65A 3A9IA 4O15A 4DEFA 2OT0A 4E2BA 2ALDA 3Q58A 3W74A 3HO8A 2ZCGA 2NXIA 3W1AA 5HUOA 2VFHA 4EVZA 3W7JA 5LNUA 1R2SA 3W7LA 1K8YA 1KFLA 1AMKA 1I2NA 2V0TA 3FKRA 4QNEA 2YDAA 3HBLA 5K9DA 4WY0A 3W2KA 3TCEA 5LNSA 5FEZA 2Y7GA 4K8EA 4JX4A 4FO4A 4RJEA 5K2ZA 3WJYA 4AF0B 3CIWA 1MEWA 5G2WA 3BVJA 7TIMA 3S1VA 4UFHA 3GNNA 1OFBA 3PUOA 1LM1A 1SU5A 3I7RA 1VLWA 5AFDA 5AYZA 3NYZA 4O28A 3TAOA 2E5CA 2RDWA 2GQ8A 3MUXA 3R2GA 4LTSA 5C55A 1B4EA 1WV2A 1X6UA 3L0KA 1KTBA 3GLCA 2DJLA 3IV3A 1NSJA 1NFBA 3UYCA 4AWSA 5AHIA 5FI8A 3S5ZA 3W3OA 1LROA 1DHPA 2H3BA 5HR7A 5MHBA 1GQNA 5DLCA 2X16A 5HWNA 1WAUA 1EIXA 4DPQA 1OX6A 3A21A 2J88A 2Q3RA 1QPQA 4UR8A 2RHGA 4GWEA 4Q4KA 3UPWA 1W3TA 4LVBA 5CSRA 5ABTA 5L6UA 3N3MA 1EP3A 3UWVA 1X8FA 1NF7A 3B0VC 1O5KA 1W0MA 3ANYA 3PG8A 2YFNA 2TMDA 4JTLA 4OGZA 3NQGA 1PHQA 3FOKA 4Y90A 2VOMA 4LY8A 1J5TA 3LBCA 4HIBA 3FJ6A 1WYIA 1XUUA 1I2RA 5HMSA 4I7VA 2X1RA 1E51A 1ML1A 4FNRA 2FFCA 4K6AA 1PE1A 2WQPA 1XBVA 3LCXA 5DN1A 4G1KA 4UTHA 3M44A 3GDTA 1TSIA 3M43A 4LVGA 4O0KA 3TUUA 4X22A 4AAJA 2BSLA 2YZRA 3V75A 4ALDA 4N9DA 3G18A 1F2JA 3G1HA 3HG2A 1XDLA 3NZ1A 4N4QA 4JNMA 1SZFA 4CCDA 2B0MA 3NG3A 3IVUA 1VYRA 2A5HA 2JK2A 5EA9A 1YPFA 5G5IA 4OQVA 3TA6A 5IBXC 4O0ZA 5G4EA 3YPIA 4XZ9A 4MYAA 1J4EA 3ZFHA 4R34A 1K3UA 3HQ1A 4JIPA 1TYGA 1LYXA 2A7RA 2H3DA 3W2NA 1FWRA 3E02A 4KWVA 1IXNA 2XN0A 2VFDA 1GZGA 3S42A 5DCDA 3TR2A 2WPBA 1VLIA 2ZTKA 3CEPA 3M6YA 3CEUA 3QQ1A 5D33A 4P61A 2J24A 2VEKA 1EUAA 2IQTA 3P84A 4LU0A 4UFMA 1PCWA 3DU0A 1LOQA 2ZRYA 4JX6A 4NJJA 2PC4A 4JN6A 4XBSA 4BI5A 3O1NA 4EWND 4HNNA 1TJRA 4LWWA 4LVFA 5AB3A 2DZWA 2X30A 4NJHA 1XFBA 4RZ5A 3LM7A 1QWGA 1H5YA 2TRSA 3LHWA 3DXIA 3PWAA 1O94A 3NR0A 1ZNNA 1PHWA 1VZWA 1F7BA 1W1ZA 1WOBA 4IPJA 3Q37A 2B7OA 1R2RA 3RMJA 3EB2A 1F5ZA 1JUBA 3R13A 1T99A 2Y7EA 4O4WA 2Z1BA 5HNRA 4UIOA 5DBUA 5F4XA 4LC6A 3O15A 1D3GA 3NGJA 3W23A 3N14A 4A3UA 4KFPA 3SGZA 1M7PA 1RQHA 1Q6QA 1Q6OA 4FIQA 3NQVA 4UR7A 4UUIA 1ZY9A 3CWOX 1YTDA 4IGHA 3SY5A 3C2OA 5F4WA 2OMAA 5F4SA 5KZMA 4UFLA 3QPYA 1OF8A 1SO6A 3P8IA 4M19A 1QOQA 4FNQA 3CC1A 2DZSA 3M47A 1VR6A 4UTJA 3KRSA 4AWUA 3VFLA 5LHEA 5C54A 5FF4A 2CWNA 3WK1A 4O11A 3GZ3A 4GUIA 4PFMA 3DFSA 1I8JA 2Y61A 1FX6A 5CPLA 4UTUA 1TPVA 4JTEA 4M6PA 2PCQA 3LI1A 2V2DA 4WX2A 4UMAA 2CLKA 4GNJA 3CIXA 3THAA 1QMLA 3QRHA 4ORIA 5G1TA 4D2JA 3EX3A 4JYFA 2GQAA 4ZQOA 4GBUA 4PL1A 3LLDA 1TJPA 4L4LA 4FNTA 2PRLA 4RKAA 3NL5A 1BWLA 3DGRA 4LS1A 1FWTA 3G3MA 5D05A 1JCLA 4AEOA 2VENA 3OHIA 1JUEA 1VGAA 2Y62A 4MZYA 4OT7A 1R47A 3O06A 1H51A 3TC6A 4B5NA 3CTLA 5G2IA 2RFGA 1YTKA 3B0UX 1W5MA 2XN2A 1YDNA 4N9BA 1OX4A 1YDOA 2V5LA 1EWDA 4O12A 3O63A 1XBXA 4AB4A 2R8WA 5AHFA 3T78A 1W5PA 1OVDA 1IF2A 1K7EA 4AVFA 2Y85A 4PC8A 2CLLA 5U4NA 1X7FA 1L6YA 1TPC1 4IUOA 1FWNA 1ONRA 2WNQA 2XFWA 4WD0A 4XWUA 1VHNA 2E77A 3W2MA 1PL9A 2ATSA 2V9DA 4GJ1A 1IXOA 1J2WA 2H8ZA 4NZFA 4UTLA 4BR1A 3UNDA 4UTWA 1I2PA 1F05A 4O1BA 3W1PA 1ZHAA 4PL2A 1Q3NA 1EEPA 4UMCA 3NQAA 3RU6A 1QCWA 1GTEA 4MJZA 4R7JA 1G69A 1HTIA 5TIMA 1SFJA 4PODA 4IJBA 3PC0A 5D09A 4H3DA 1SZEA 4IOTA 4ORMA 3NDOA 4Y96A 4XTIA 3F03K 1PIIA 5BRBA 4K7VA 4WQ6A 4Y6GA 5EPDA 4OHQA 4QIUA 4IMGA 4DF0A 2A21A 3PUEA 5FESA 3GDMA 5LHFA 1VRDA 1OK6A 3O6DA 2NXHA 1WDWA 3QC3A 3TQVA 3GAYA 1YYAA 2ATMA 4YMZA 3LX9A 2NWSA 5I3HA 1K7FA 3QQ0A 4EF9A 4CLMA 2Y6ZA 3HF3A 5HWMA 2H6RA 5LSMA 1YADA 1OFOA 4A2SA 5HULA 3NQMA 4I9AA 1TQXA 2ZQ0A 4WOZA 2AGKA 3QH2A 1GPWA 1PVNA 4IMDA 1RPXA 1FCVA 4IXXA 1RV8A 4GC4A 5FF3A 4HSNA 1RVGA 3W86A 2YXGA 3ZWSA 3OG3A 3HPSA 1HO1A 2X1UA 3TIMA 4NX0A 2ZA2A 1O95A 4NQ1A 1EP1A 3DFQA 3M16A 4JEQA 1KA9F 4AMAA 3UWZA 5LNWA 2QCNA 1H62A 1KTNA 8TIMA 3BLFA 1Q6RA 5F2MA 3O6YX 1TREA 1ZAJA 3PSWA 4NUWA 1T96A 4GXMA 2FB2A 3IIPA 1B9BA 3C2VA 2I9EA 2NX3A 3KVLA 1TMHA 1GVOA 4X9SA 3LXBA 2Z0IA 2GVJA 1TB3A 3FA5A 1FCQA 2QCCA 2FJKA 1FUYA 4S2CA 1GYNA 1TPFA 1ME9A 3P74A 1TPH1 3W7GA 3I7SA 3LLFA 1SSGA 2WNZA 3A22A 2C6QA 5K4ZA 1PCKA 2TSYA 1XKYA 5CZTA 4UCGA 5HR6A 2P10A 2CZEA 4XTDA 3BGJA 4O18A 2Y89A 3BGGA 1KBJA 3TE9A 5DXYA 2B7PA 1G4EA 4OV4A 2P0OA 5C5YA 1A5CA 5CG7A 5AC7A 3HMJG 4A2RA 4NXKA 4CNNA 3L5AA 1KM3A 4FX8A 3C3NA 3F4NA 1ALDA 2J9XA 3EEGA 4JY9A 4LS0A 3DFTA 5D30A 2DZUA 3MI3A 3TJXA 4JS3A 2OZ0A 2QR6A 2QEZA 4TMBA 5AYYA 5LKYA 1GG0A 3HGJA 1G67A 3CT7A 4QAIA 2G96A 6ALDA 1TRDA 1FCUA 3KFTA 3NXFA 4LV4A 3UZJA 3W07A 2F84A 3CLMA 2ZYFA 1QOPA 2ZZ6A 4GUJA 3P82A 4ZQPA 4JTFA 3NL6A 5D04C 3TW6A 3LGEA 4DBEA 1NAL1 3JRKA 1YPIA 3WFAA 1QR7A 4ZZ9A 1KV5A 1A53A 1FDJA 4NJKA 2V81A 3OVQA 2A1YA 4HPXA 4HSOA 3P80A 4JTUA 3PVFA 4MY9A 4RK8A 3EKZA 1F76A 2ABBA 3ABOA 3LI0A 4FNSA 3NOEA 3W7MA 2Y63A 5BMWA 1M5WA 3C2EA 3TDFA 1TTJA 4O1AA 4MPQA 2B7QA 5E1QA 2ZZ1A 3MI2A 4Z1DA 4Z0JA 2QCLA 1SW3A 1ICSA 4LUIA 3INPA 2Y7DA 5K9CA 3W22A 2FPYA 4K38A 5J5DA 3ZS4A 2ZRVA 4PEKA 2E6FA 3EWBX 5HQEA 1OF6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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