2HS6A

Crystal structure of the e291k mutant of 12-oxophytodienoate reductase 3 (opr3) from tomato
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
376
structure length
362
Chain Sequence
NPLFSPYKMGKFNLSHRVVLAPMTRCRALNNIPQAALGEYYEQRATAGGFLITEGTMISPTSAGFPHVPGIFTKEQVREWKKIVDVVHAKGAVIFCQLWHVGRASHEVYQPAGAAPISSTEKPISNRWRILMPDGTHGIYPKPRAIGTYEISQVVEDYRRSALNAIEAGFDGIEIHGAHGYLIDQFLKDGINDRTDEYGGSLANRCKFITQVVQAVVSAIGADRVGVRVSPAIDHLDAMDSNPLSLGLAVVERLNKIQLHSGSKLAYLHVTQPREEEEARLMRTLRNAYQGTFICSGGYTRELGIEAVAQGDADLVSYGRLFISNPDLVMRIKLNAPLNKYNRKTFYTQDPVVGYTDYPFLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of 12-oxophytodienoate reductase 3 from tomato: Self-inhibition by dimerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 12-oxophytodienoate reductase 3
molecule tags Oxidoreductase
source organism Solanum lycopersicum
total genus 137
structure length 362
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.42: 12-oxophytodienoate reductase.
pdb deposition date 2006-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2hs6A00
4XBKA 5HJLA 4RK8A 1OFOA 1VGAA 4R53A 4Y96A 3G8RA 3P8IA 1K8ZA 2X30A 3NR0A 1ME9A 2BX7A 2AAMA 1LLWA 1OG0A 3F03K 1QNVA 4HT3A 4MZ8A 3U6WA 3PY2A 1P4CA 2J9YA 3W7NA 1W1ZA 2CLHA 3GXTA 2VELA 4MVAA 3ABRA 2EF9A 4N9DA 4GXMA 3FEMA 4ONVA 3DKLA 4DO6A 1HO4A 3STCA 4JGDA 1W54A 4EF9A 2IQTA 4D2JA 5LSMA 3BG9A 4U4MA 3A9IA 3R8RA 4AHPA 1IXQA 1ML1A 3LXCA 4A29A 4CNPA 1RPXA 4H4IA 3UWYA 1TRDA 3HO8A 3U8GA 4JTUA 1F74A 1VQTA 1XBXA 3O06A 4X3ZA 1LOLA 2A7NA 4FNSA 1Q45A 2HSAA 2ZZ1A 2EKCA 3W7PA 4GWEA 2VFHA 4MKNA 3UZ5A 4NJGA 1EUAA 1TYGA 5BOOA 1WX0A 1S5TA 4UTIA 3L67A 3PR2A 3M41A 1FXQA 3PG8A 2BXVA 1W5MA 4LT9A 4DELA 4WY0A 3NDOA 2PRHA 3DBPA 3HPSA 3CHVA 1BWLA 3W75A 2ZRVA 2XFWA 5HWMA 2FPVA 4A3UA 3HGOA 3TXZA 1F76A 4XTDA 3G22A 2B7QA 1SZFA 5CG7A 4WX2A 3G1AA 2PCQA 1H50A 3D0CA 1NEYA 2ALDA 4ZMGA 1W8SA 1W31A 1HUVA 3W7LA 4NQ1A 5E93A 2VFFA 3JS3A 3W07A 3IIXA 3UWQA 2ZBTA 2ZYFA 5G4EA 3EXRA 3Q94A 1RZMA 1Z44A 2NXIA 3EX4A 4AWTA 1H63A 4AWSA 2A0NA 2B7OA 2X16A 3LHWA 2CLEA 5KMYA 3N2MA 3VKJA 2ISVA 3LERA 5I3JA 3W2NA 5CKSA 3E96A 3IGXA 1TPH1 1R46A 4O28A 5HUOA 4EF8A 5CGQA 3IVSA 3A21A 4XWUA 3MHFA 4JTJA 4AMAA 5AC8A 1DVJA 3OBKA 5F4XA 3SIZA 1H7OA 1TPUA 1OFRA 1F73A 4O12A 1FUYA 2P10A 3W1RA 3STGA 1M7OA 3ABSA 3L0KA 3L5LA 5F4WA 4WQ6A 3LGEA 5K3VA 1WXJA 4NUWA 4O1DA 7TIMA 5MHBA 4TX9A 5IBXA 3HG4A 3PUDA 1H7XA 3TMQA 3HBLA 1FCBA 2NX3A 3OVRA 2CWNA 2TRSA 4J9JA 4M19A 1SO6A 3F4NA 1DKWA 1W5QA 3LM7A 3QMTA 4WZHA 3WJWA 2YW3A 5KINA 5EY5A 1XUZA 4P2VA 5DBTA 4BF9A 1PL9A 4QAIA 4R34A 4WUIA 1SW7A 1YTEA 1VLIA 3RNDA 4BI6A 5TIMA 3MW7A 3GKAA 4Q4KA 3LBCA 3B04A 3ZS4A 1EB3A 3G3MA 2VEMA 3TW6A 2BTMA 4O50A 3UXAA 2JGQA 1PCWA 4ADSA 1GOXA 4Y8FA 4ZQPA 2Q8ZA 2YW4A 4XKYA 2V2DA 1QAPA 3STFA 4LUJA 4XTIA 4O1BA 4O1CA 1F6KA 1H62A 5AC6A 2CLMA 5I3HA 3W2KA 3FA5A 3MBFA 1P5BA 3DHFA 4IOTA 3QFEA 1O60A 2J6XA 2YCEA 3TX9A 3W2LA 1DHPA 3FJLA 4O10A 1EIXA 3GNNA 2DJLA 3R89A 1LROA 1LYXA 4LS0A 2C18A 3L5AA 1DOSA 3TSBA 1UJPA 3ZWTA 3W7HA 4JICA 3W88A 3NPVA 3QM3A 3TSMA 3UD6A 2WNNA 3CC1A 3LLFA 5CSSA 4O15A 4XUGA 1VYRA 3EWXA 3BV4A 1QPQA 4CQ8A 2V2CA 2FB2A 2JBMA 3AJXA 1K8YA 2R91A 4DQWA 1ZJIA 3NVTA 1JCJA 4HNVA 1QO2A 3A24A 5G1YA 1MEWA 1R30A 4UTWC 4OV4A 3KAOA 3M5YA 1DORA 3USBA 1SW0A 2Z0IA 5A8GA 4UR8A 1GVRA 3T44A 1JUEA 1ZENA 4L4MA 3PBYA 3PAJA 4IX2A 1P0NA 2VXNA 3MHGA 3V1PA 3UY7A 3MP5A 3S1UA 2H3BA 2ZTKA 4AH7A 1TO3A 4NT0A 1T99A 3W1PA 3W1NA 2VKZG 3GLCA 2QJGA 3L0NA 3DU0A 3H54A 1AMKA 1QMLA 1LBLA 3LXBA 2FQIA 1LBFA 3SZ8A 3LRLA 4CQAA 5G4WA 5LKYA 5HINA 1TV7A 2DZVA 2YSWA 4AF0B 2V9DA 4CQ9A 4NJJA 2X1UA 3TV8A 1JCNA 3BW2A 5G1TA 3Q58A 4LVBA 5D2YA 4AEOA 1QCWA 2J9ZA 4YXGA 2HTMA 4ZQOA 2YPIA 4WOQA 3RF9A 1QOQA 3NL2A 4N9EA 4YCPA 1TRIA 3RK8A 4ICNA 3MI2A 4YCOA 2ZTJA 1RQEA 3B0PA 5I3GA 2B7PA 4BWLC 3HQ1A 5D2TA 3PBWA 3NAVA 4OQVA 2GVGA 4QJ1A 2QDHA 3CM4A 4Z08A 2ZRYA 5D2VA 3MP3A 1YDNA 4JYEA 4E0CA 5G2WA 3LV6A 4FF7A 3UQNA 3BW3A 1PCKA 3W86A 2DJXA 3EWUA 1VH7A 3N2XA 2WJZA 3DZ1A 1TTJA 1Z48A 1RR2A 4PEKA 4FX7A 1J4EA 3UZJA 2A6LA 2A7PA 1JUBA 1OX4B 1W0MA 3PB0A 4JDBA 3NQDA 3HIJA 5C55A 4K7YA 2JK2A 5CPLA 3FIGA 3NPUA 4TO8A 1FWWA 4NJIA 5D33A 3BARA 4TMBA 3MUXA 3UNDA 2E6YA 1GVFA 5D37A 2ZZ4A 4UFLA 2WNQA 3LX9A 5F1UA 4FO4A 3DENA 5I3IA 3TJXA 1A5BA 4IQLA 2ABAA 1H7RA 2FJKA 5CPOA 3LCFA 1H7WA 4GUHA 3SECA 4XZ9A 1Q6LA 4RCXA 4Z0JA 4DBEA 2FTPA 3W23A 1KBJA 1YLVA 5G5IA 1MEHA 4FB7A 3VE9A 2X1SA 1JRCA 4LVFA 3GR8A 3BLIA 3I7SA 4ZZ9A 4QIUA 1G4SA 2A6NA 3N73A 4HKPA 3NXFA 2ZA3A 1G4TA 3JR2A 1QPNA 5L9FA 4JTIA 3IRDA 1TPDA 4FHAA 2V30A 3STEA 3C3NA 4FIRA 1G4EA 3IIPA 4N4QA 1PS9A 4JIPA 4WJEA 2CLFA 3NYZA 5C54A 3G0SA 3NNTA 5FEZA 1G6CA 1XM3A 3W85A 1WQ5A 1Y0EA 3O16A 2GQAA 3DFSA 1FY6A 3S1XA 3W1QA 2Z2UA 1TPWA 4LS2A 5FF4A 4AAJA 1I45A 1NF0A 3W7DA 1RD5A 3VCRA 3C2VA 1YTDA 5H91A 3W70A 4PL1A 1W3TA 1UUOA 3QPZA 3NQ7A 1P0KA 5DXYA 2VEKA 3G3DA 4JTLA 1KLYA 2QKFA 1KM1A 1ZNNA 5AN7A 4JDYA 2DZWA 4IMDA 3G1DA 5HULA 3TDFA 2DZPA 1TQJA 4UXDA 1T0OA 3NQ2A 4PCFA 4YMZA 3GK0A 4JX6A 5FF2A 1IXPA 2FDSA 3P60A 1CW2A 1ZALA 1F05A 4LVAA 3UWUA 1VPXA 4K7VA 5IM51 3GIYA 2CU0A 5KZMA 3C61A 3M9YA 5DELA 1QFEA 2ZFAA 4AWUA 1FXPA 1QR7A 3WFAA 1XFBA 4JTHA 4PL2A 2CLIA 3P61A 5LGXA 4HIBA 2GOUA 3M47A 5AHEA 3SFKA 3P7YA 4GC4A 3A5VA 3KX6A 3SR7A 3WJXA 3T78A 3NQEA 1IGSA 1Q6RA 4I7WA 2ZZ2A 3KVJA 1J2WA 4NNAA 1MXSA 4KFOA 3OHIA 3RMJA 3WJSA 3GX9A 5D03A 4QQ3A 5DY2A 4QITA 3PB2A 3PBVA 2JKPA 3EKZA 1CI1A 3HOJA 3HJZA 3M0ZA 3C2FA 4JTTA 4Z1DA 4UFKA 4GRSA 4UTKA 4MJMA 1C9DA 3NQVA 2NV1A 4Y90A 4UC5A 5KSWA 5AOUA 1R2TA 4K38A 3I65A 4FNUA 4UTWA 3S1VA 4LU0A 2A5HA 3C2OA 3QMRA 4UNLA 3EWZA 1SR9A 3IIZA 1JRBA 3Q37A 2QAFA 3DI0A 4WD0A 2Z6JA 3FOKA 3PULA 2JKEA 3T40A 4GUGA 3N3MA 3KFTA 4FIQA 3CLMA 1MEIA 3G18A 4MY8A 1I2PA 1Q6QA 1WDWA 1SO5A 1DL3A 4MLJA 3CT7A 5FF7A 3TROA 4UMBA 3IGSA 3P81A 1FWRA 4DF0A 2V0TA 1SZGA 1YYAA 2I14A 3WK0A 4JX4A 3M16A 4IXHA 3R13A 1FBAA 1ICPA 2RKXA 1RVGA 4BI5A 4M7TA 3MI6A 1I2OA 5HR7A 1OFPA 4MLRA 1M6JA 3EX3A 3LHZA 1HO1A 4PTNA 2ZZ7A 3NGJA 2GJLA 5AHNA 5A5WA 4HPXA 3M1ZA 1KTBA 1TTPA 4RZ6A 2V2HA 2OJPA 2E1DA 1O5XA 3MJYA 1KM6A 1QOPA 4MFEA 2NXHA 1AG1O 4MPQA 4DF2A 2GJNA 1K3UA 1GG1A 4R33A 1Q3NA 5KTLA 4E2BA 4IX0A 4IGHA 4DO4A 2DP3A 4Y9AA 3UWVA 2Q3RA 3THQA 2CZEA 3MYOA 2Z1BA 1JVNA 3GR7A 4G1KA 3QQ1A 4K8EA 1AL8A 1OFEA 1KBIA 2A2IA 1G7UA 1LCOA 1QPOA 1TPVA 5F2MA 5SWUA 1GVSA 1O95A 2R8WA 1R2SA 4NVTA 4MIMA 2VFDA 2V5LA 1OHLA 3LTPA 4NNBA 4O0KA 3W7KA 3ABOA 4JD4A 5HUPA 3LHYA 4MFDA 2C14A 3CPRA 3TR2A 4RX0A 2QUVA 3C52A 3O6YX 4M6QA 2E09A 2R14A 4N2YA 4QM1A 3DFNA 3FLUA 2P0OA 3BGJA 1KW1A 4TMCA 4HPJA 2HS8A 4N6FA 2XN2A 1JQXA 1SFLA 1K02A 4A2SA 1F2JA 1TCDA 5C5YA 3NZRA 1AW5A 5D30A 3C2EA 1VC4A 2X1TA 3LBMA 3GXNA 1I4NA 4NX0A 1W56A 2EAWA 4S1FA 3W7EA 3LTSA 1TPC1 1LDCA 1E51A 2DZUA 4UTTC 1B4KA 1EUNA 3UYCA 1RV8A 3ZWSA 1WYIA 3GVGA 4LRTA 4AF0A 1FX6A 5AFDA 2H6RA 3Q2DA 4JR5A 3SW6A 1SSDA 4NXKA 4PC8A 3A22A 4RXGA 3MO7A 4CCCA 1LRTA 3TE9A 3I6RA 1JCMP 3GDMA 3KRUA 3QPYA 4NU7A 1JCXA 3B4UA 3TJLA 2NX1A 1Q6OA 3N14A 3NPXA 3PM6A 1LOSA 5AHLA 1GYLA 1OFDA 2ISSA 4GE8A 2HS6A 2Z6IA 2YR1A 3E0IA 1N7KA 3TSDA 3P84A 2TSYA 5EBUA 3E02A 1HTIA 4ZQMA 3DAQA 4P61A 3W22A 1ADOA 3ATYA 3GDKA 3IIOA 4KWWA 3CQ0A 1MSSA 4QNEA 2CW6A 1LTDA 2C6QA 3DH7A 1FWTA 1WAUA 3B06A 1G7VA 1TV5A 2DU2A 2QCFA 2PC4A 1VJIA 2QCEA 3O8AA 1DV7A 3CIXA 3PVFA 3V75A 4N6EA 4HSNA 3NQCA 2GPTA 2YFOA 4NJKA 1OX4A 3FKKA 1V7YA 3GNDA 5K9DA 5HWNA 2I9EA 2Y7EA 3GZ3A 3TQKA 1G67A 1SU5A 1D9EA 3W1AA 1SW3A 3F1QA 3M5VA 1XL9A 1WOBA 4NXSA 4WOZA 2ZZ3A 3G1FA 3C2RA 4I7VA 4JTEA 4UFMA 3IIVA 1YXCA 1H7NA 3QW3A 5BMWA 3WK1A 1YDVA 3A23A 2YYUA 4WXYA 1OYBA 2QDGA 3NQ8A 1LP6A 3T55A 1LRQA 3HGJA 2DZTA 1S3HA 2Y89A 2A85A 3P5YA 4DEFA 2Y61A 1B57A 2ATSA 3H53A 3BO9A 2Y70A 3TFCA 2AQWA 2WPBA 3FJ6A 4ALDA 3INPA 1UBSA 4M5PA 4LTSA 4JTFA 1RQHA 3UWWA 4UUIA 2EGZA 3QJAA 1VLWA 3NL6A 8TIMA 2A21A 3OVPA 2ZZ5A 4FNRA 3W87A 3OIXA 3W7MA 3M6YA 5EA9A 4JYDA 4OBTA 2E5DA 2CFFA 4O53A 5LZLA 3WJZA 1F6PA 4UTMA 3BVJA 5KITA 3QC3A 1LBMA 2R94A 1MO0A 4N9BA 2BLEA 1GEQA 1VYSX 1GG0A 2TYSA 5LNRA 4RJEA 2RFGA 2F7FA 1R47A 1L6YA 1TQXA 3TC7A 3TK7A 3TMLA 3IEBA 3LOTA 5DCBA 3S42A 3TQVA 1JULA 4ZL1A 3ZFHA 2F84A 2QEZA 4Z1BA 2YYTA 2PRMA 4O57A 3MWAA 4RV8A 5HMSA 4GFSA 2NLIA 1H61A 1TIMA 3SSJA 5FEPA 5HWJA 1J5TA 4LW7A 3E9AA 5AYXA 1XBZA 2PRLA 4DPPA 3N9SA 3W2JA 5EYWA 1HG3A 1LRNA 4RKAA 1Z41A 5K4ZA 1OVDA 3M5ZA 3QMSA 1FCVA 1JJKA 4UTUA 1IXNA 4UTHA 1ICQA 3LLDA 5H2ZA 3QZEA 5FI8A 2NUXA 5DCEA 2NX9A 1OK6A 4YLWA 1B9BA 2LLEA 4ADUA 3FYPA 1OJXA 2DZSA 3VE7A 4UCGA 4AHOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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