2HS6A

Crystal structure of the e291k mutant of 12-oxophytodienoate reductase 3 (opr3) from tomato
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
376
structure length
362
Chain Sequence
NPLFSPYKMGKFNLSHRVVLAPMTRCRALNNIPQAALGEYYEQRATAGGFLITEGTMISPTSAGFPHVPGIFTKEQVREWKKIVDVVHAKGAVIFCQLWHVGRASHEVYQPAGAAPISSTEKPISNRWRILMPDGTHGIYPKPRAIGTYEISQVVEDYRRSALNAIEAGFDGIEIHGAHGYLIDQFLKDGINDRTDEYGGSLANRCKFITQVVQAVVSAIGADRVGVRVSPAIDHLDAMDSNPLSLGLAVVERLNKIQLHSGSKLAYLHVTQPREEEEARLMRTLRNAYQGTFICSGGYTRELGIEAVAQGDADLVSYGRLFISNPDLVMRIKLNAPLNKYNRKTFYTQDPVVGYTDYPFLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of 12-oxophytodienoate reductase 3 from tomato: Self-inhibition by dimerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 12-oxophytodienoate reductase 3
molecule tags Oxidoreductase
source organism Solanum lycopersicum
total genus 137
structure length 362
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.42: 12-oxophytodienoate reductase.
pdb deposition date 2006-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2hs6A00
5D30A 1ICPA 1W1ZA 1F74A 4DPQA 4LV9A 2ABAA 2ZQ0A 1OYCA 5BMXA 3CC1A 4A29A 3NEVA 6ALDA 3PSWA 4IMEA 1H50A 2H3DA 3MMTA 2ZRVA 1TPDA 3M47A 1D9EA 5EY5A 1TPEA 1DQWA 1VHCA 2XFWA 4MZ8A 2J9XA 5KZEA 1X6UA 1FY6A 1XDMA 1ZY9A 1GOXA 2I9EA 3C2FA 2X16A 5K7JA 2V2HA 1VGAA 3VCRA 5LNWA 1OX4A 2HTMA 3O6YX 4ADSA 1Q6RA 3W7OA 3OVQA 3S5ZA 3SZ8A 2Y88A 4K7YA 4NJIA 4IJBA 4JX5A 1M6JA 3F1QA 1TMHA 1SZEA 3BLEA 1T99A 4DPPA 4TX9A 1GT8A 5D2TA 1WOBA 3MBDA 4JXCA 3PULA 1HTIA 5I3GA 4NJKA 4BF9A 3G1FA 3FKRA 4HHPA 3TC7A 1I2NA 4UFMA 4O17A 3TAOA 3W74A 4DXVA 3EEGA 3M5YA 1AMKA 2ISWA 5K4ZA 2Z1BA 3NQDA 4YMZA 3N14A 4PFMA 5AC6A 1LROA 3TJLA 3OEXA 5AOUA 4TMBA 3BW3A 3DENA 1TRDA 3ZWTA 1AW1A 2Y7DA 1BEUA 3SFKA 2BXVA 4EF9A 3D0CA 1X1ZA 1SZGA 3I65A 2BZNA 3PM6A 1RQHA 2JBMA 1OFEA 5K9DA 1N8FA 3O63A 4UTUA 2YR1A 3F4WA 1GJPA 2WNQA 3G18A 1PV8A 1SQ7A 3KXQA 1UJPA 3UQNA 3WFAA 3S5NA 1UASA 3KVMA 5KZDA 2NX1A 4MY9A 4QNWA 3QM3A 4BK9A 1DV7A 1KFCA 1Z44A 4JTHA 2QCMA 1YADA 5G1YA 5F1UA 3NG3A 3N34A 1W5NA 3W7PA 2OT0A 3LHUA 4XUGA 4DF2A 5D09A 3G0SA 3W2MA 3LHYA 2YFOA 5J5RA 3A9IA 4XBSA 4FIQA 3NOEA 4XKYB 3G8RA 2QCHA 4IX0A 5HNRA 3NM1A 3Q37A 3LHZA 2PRMA 1MEIA 2G97A 1EIXA 2C14A 2VFIA 3L9CA 3NYZA 2Z2UA 4AEOA 1AW2A 4LNYA 4JDYA 1UB3A 3MYOA 4UMBA 1H51A 1KLZA 2VENA 2JGQA 4FX7A 1OFBA 1IGSA 1F7BA 4GC4A 1S5VA 2W0UA 1Y0EA 3NZ1A 4N9EA 1L6WA 5K4XA 2E68A 1H60A 3EXTA 3GDMA 3O8AA 1EEPA 1GTHA 3GYEA 3W2LA 1TPFA 1SUXA 3G22A 3FFSA 4TU1A 2WSYA 5DY3A 3IEBA 3KOFA 3QW4B 1W56A 4AB4A 2FJKA 1JCLA 2CFFA 3LB0A 1O4UA 4JTKA 3W7HA 1DVJA 2VFGA 4EWND 3DI1A 4Y9AA 2B7QA 5D2WA 1LOSA 4FNUA 2A1YA 3R5EA 1WOAA 3MI2A 3PBWA 5SWUA 5HWNA 1WDWA 3GXTA 4K6AA 4LC6A 4Z1CA 4UTHA 4NUWA 5HULA 1JULA 3TC6A 3QPYA 4XZ9A 3L68A 1TTJA 4OBTA 2FPVA 4XKYA 1PHQA 3W2JA 1OVDA 1P1XA 4OE7A 1XBYA 3V1PA 2V2CA 1YXDA 4IWWA 4A2RA 1EP2A 1G4SA 2Y7FA 4GUHA 3LGEA 3NL6A 4NZJA 4IOTA 1B3OA 1O5KA 3LERA 4FHAA 3MI6A 4JR5A 1Q45A 3UZ5A 3B8DA 4FF7A 5E93A 2G96A 4A2SA 1SR9A 3BVJA 5AHMA 2QCFA 3LM7A 1V5XA 1FUYA 1TTQA 2FFCA 2WO5A 4UTWC 3W85A 1DJNA 2TPSA 3C3NA 5FF3A 3FLUA 2PE4A 4DF0A 1W3TA 3TIMA 1OFOA 1ZENA 4H6KA 1DQXA 4EVZA 3HF3A 5F2IA 4S1FA 4JTUA 2G5WA 3G8EA 3DFNA 1ZAIA 3C61A 4HKPA 4W9TA 4ZQOA 3IV3A 4JEQA 3BG5A 2QJHA 3QJAA 5FEXA 4GBUA 1W3NA 3B04A 4JX6A 3W6YA 1QPOA 4YLWA 1I45A 2CLEA 1JCXA 2A0NA 2Y62A 3TQKA 4LVAA 5D37A 1QOQA 1MXSA 4IXHA 5DXYA 4R34A 3TSBA 5LHEA 5FEPA 2JKEA 3CPRA 3W70A 1XBVA 2DZTA 3IGXA 1FQ0A 2X1UA 3EX3A 3LBMA 4HNVA 4ONVA 4O0KA 1FWTA 4GNJA 2DZVA 3PS7A 4LS1A 5FF2A 3GDTA 2X1RA 2C16A 2QUVA 3P8IA 4R33A 3S9YA 5A8GA 3B4UA 5LNUA 5LSMA 4O11A 4Y8FA 3EX6A 1TTIA 3HG4A 1B4EA 3PUEA 1LORA 3M16A 4UTIA 1FCBA 1NF0A 4CCDA 4RXFA 2VOMA 4UXDA 4MFEA 1QO2A 2VKZG 3OA3A 4ZQCA 5D33A 2ZZ7A 1TJPA 1A5CA 1HUVA 3IVTA 3BGJA 4JTFA 4AHQA 3CT7A 4O0ZA 4ADUA 3STFA 2C3ZA 1LRNA 3TMLA 2ABBA 3UWQA 5BNKA 3TH6A 3NQ8A 4FX6M 3NNTA 5FESA 4O12A 1OYBA 1EWDA 1JUBA 3H55A 4EF8A 3JS3A 2RHGA 1TO3A 2YDAA 3L0KA 2NWRA 3E12A 3HPXA 1K3UA 1DORA 3NL5A 4FB7A 3GAKA 4WD0A 1QDSA 1MSSA 3ZS4A 4I7UA 1FWNA 5CPNA 1AL7A 3L0GA 3TE9A 2GPTA 2X30A 4UC5A 3DHFA 4OU1A 3S8HA 1PCKA 4UTMA 3GXPA 4GRSA 1A53A 1BWKA 3MHUA 3RU6A 1E51A 5HJLA 1KM4A 2FDSA 5E0KA 5C6MA 5DXXA 4NX0A 3IGUA 2HS6A 3Q58A 4E2BA 3F03K 3LHTA 4RCXA 2EGZA 3L65A 4UMCA 4WUIA 3EX4A 1JRBA 3UWVA 2IQTA 1KTNA 3W1QA 1ZFJA 1I4NA 2NX9A 4NNCA 4UR7A 4CQ8A 1LLZA 4JNMA 1OHLA 1EUNA 2QUUA 5LNSA 1KV5A 1F2JA 3P61A 4XTDA 2VELA 3P5YA 5U7SA 1M5WA 3AJXA 3W7MA 5HQEA 1PS9A 3UXDA 4CCEA 3CU2A 4UNKA 3GNDA 1AK5A 4EOUA 2H90A 4PL1A 1FCVA 1A5SA 2YPIA 1QMLA 2VXNA 3CQ0A 3KVJA 2FQIA 2VFFA 5DCEA 3STEA 3BLFA 1P0KA 3GIYA 4HT3A 3NQAA 5TIMA 3MUXA 3LCXA 4GUIA 5F4XA 4O1DA 5D32A 4RKAA 1QO5A 1VRDA 2GQ9A 3THQA 5IBXC 1Q6LA 4OWGA 1DJQA 3M5VA 3NQGA 3WJYA 4M6QA 4UTKA 3TFXA 4DO6A 3LTYA 1XI3A 5F1VA 3N3MA 4IMFA 2C15A 1O95A 1J2WA 3JRKA 1DL3A 2CLOA 4AF0B 3IIXA 2A7NA 4XQ6A 4C1LA 4JTIA 1U83A 2E1DA 3IVSA 1SW3A 4JTLA 2ZA2A 3PG9A 4GFSA 5FI8A 3KVLA 2WOQA 1VCVA 3CEUA 3T7VA 3R8RA 1SO5A 1J4EA 3P62A 1Z41A 3HB9A 3NM3A 3HO8A 4U28A 4K8HA 3UZJA 5FEWA 1EPXA 4TO8A 2Y7EA 3NQFA 4D2JA 3LV6A 2BTMA 5ABTA 4RJEA 2ZRWA 5F2LA 2NUWA 2XN2A 4AHOA 5F2MA 4NNAA 1IXNA 5HINA 1Q6QA 4JX4A 3PY2A 1L9WA 3KRUA 1G7VA 3LDVA 4UTJA 1VYPX 3MP3A 3NL2A 1W37A 3PB2A 1S3HA 4O28A 2R14A 5HMSA 2YW3A 4MJZA 5AYXA 3SI9A 3E49A 3FJ6A 1EB3A 4P61A 5L6UA 2YYTA 3RLVA 1D3HA 4XTIA 1ZHAA 1JQXA 5I3FA 2RDWA 1GZGA 1GTEA 1M7PA 1C9DA 3CIWA 3O6DA 5CSRA 1P4CA 5HUOA 1R2SA 1XBXA 2GVLA 2NZLA 4NZFA 3MYPA 3QYQA 1VYRA 4FNQA 4O52A 4NNBA 1FXPA 4HSOA 5AHFA 3WK3A 1OF8A 1FCUA 3KHJA 4N2YA 2CLMA 3HGJA 4UTWA 1LBLA 5I3HA 2NX3A 4GE8A 2DORA 4QITA 4R7JA 3BO9A 4DF1A 3E02A 3ABRA 2ZRZA 3TR2A 1QNVA 3WJXA 4JY9A 4O57A 3R89A 2FTPA 3GKAA 3W1UA 3G3DA 1O94A 1GYLA 3G3MA 4PTNA 3O16A 3W83A 1YTDA 2NV2A 1R47A 1ZNNA 3PB0A 2J9ZA 5D02A 5G4EA 1W0MA 1ALDA 1VLIA 4CNNA 3QSRA 1KFLA 3LLDA 2E5DA 3LCFA 1KLYA 1SPQA 3R2GA 4ZL1A 2F7FA 1R30A 2WJZA 4UFKA 2ISSA 4B5NA 3LX9A 3OHIA 3LTPA 5BOOA 1KFJA 2FPYA 3N9SA 2O7QA 1JVNA 3PC0A 5IM51 1DKWA 4Q4KA 1TSIA 4UR8A 4FXSA 1QAPA 5DY2A 1X1OA 3A24A 1XUZA 4QAIA 4AHPA 2Y85A 2E5BA 3B0VC 3A5VA 4O19A 3NQ6A 4WX2A 1PE1A 4KWVA 2YCEA 3UXAA 1W54A 3W72A 4RXGA 3QH2A 3NGJA 3HG5A 4IMDA 3PF3A 4UTLA 3KFTA 3C2EA 3TNOA 2R8WA 3FOKA 4FNTA 3HGOA 3NPUA 3QC3A 3MI3A 4RV8A 3T40A 3VE9A 3W7EA 2I14A 3W73A 4FXRA 3W75A 2Z0IA 4GUJA 1WA3A 4DBDA 3DZ1A 5FF0A 3GXNA 3SGZA 1VH7A 1CW2A 1MZHA 5AYYA 5AHNA 3MW7A 1CX9A 2D73A 1RZMA 2NUYA 3BV4A 1H7NA 4ZQPA 5KTLA 4LRTA 4QJ1A 1GWJA 5D2XA 1OFQA 4Q33A 4RZ4A 2E6FA 1R2RA 4UFJA 4NJJA 4HNTA 1EP3A 4POCA 4M6PA 5CSSA 1NEYA 2A6NA 4UUIA 3C56A 1O60A 2B0MA 1H63A 2NXHA 3W84A 1YDVA 5KITA 3P82A 1DOSA 4O15A 3INPA 3UWYA 3W7JA 4JIPA 1T96A 3DBPA 4ALDA 3DHDA 3IIZA 2ZA3A 3EX2A 3Q94A 2WPBA 4UIOA 2DZXA 3M44A 4O16A 1GVQA 1XUUA 4MY1A 2FB2A 1WYIA 4LUIA 5EBUA 1GVOA 4YCOA 1QPRA 2ZZ2A 4MZ1A 2P1FA 3THAA 1OX6A 4MLJA 3HOJA 3LV5A 4LY8A 1LBMA 1YPFA 5K3VA 3TFCA 1PCWA 3W7NA 4JGDA 4CQAA 3W22A 4I7WA 4JIQA 3MP5A 4UTTC 1LP6A 1SO6A 2H8ZA 1HL2A 5LGZA 2EHHA 3TDFA 2DZWA 5DBTA 3PBVA 2EF9A 6TIMA 5AHLA 2VEIA 5TQLA 4TR9A 4Z1AA 3LXAA 3OBKA 1HFBA 5K2ZA 1B9BA 3ATZA 1N7KA 3MHFA 3MJYA 4L4LA 4LVDA 1OFDA 4UFIA 1KBJA 3M43A 4FO4A 1SW0A 1Z42A 3GK0A 3W1MA 3ABSA 3DFOA 1K02A 3A23A 3ABQA 3GAYA 2V81A 3BPWA 5BRBA 2GJLA 4H3DA 5HR7A 4IXXA 5IBXA 4WJEA 2W6RA 4WY0F 4M6VA 3H53A 4BI5A 1YPIA 5K9XA 2ZZ5A 1OFPA 4K37A 4N4PA 5F4SA 1J5TA 2CZEA 3DI0A 3BGGA 1TPB1 5G2WA 4AXKA 1TJRA 1ZAJA 4MIMA 2P0OA 4MVAA 2OT1A 1DHPA 3TK7A 4AWUA 3PWAA 1TB3A 1GVFA 3FS2A 3UY8A 2QEZA 1TCDA 2J9YA 1GVSA 3LLFA 3CHVA 5DELA 5BW6A 1EA0A 4O4VA 3DFTA 3CWNA 2E6YA 1OJXA 3VI2A 3FYPA 4N6FA 1VR6A 4A21A 4CLMA 4FIRA 2BLEA 3GX9A 2PRLA 4MUZA 4X9SA 4HPXA 4O14A 2CLLA 1TQJA 4MFDA 2ZA1A 3EWYA 3UY7A 3G1DA 4DELA 1SW7A 2ZZ4A 2VFEA 1GEQA 5DCDA 4GWEA 1YTEA 1CI1A 3S5OA 2YSWA 4PH6A 1KTBA 1VCFA 1NVMA 4MYXA 1EWEA 2A5HA 4NQ1A 4OV4A 1YLVA 1KBIA 2X2GA 3C0JA 3LOTA 1L6YA 4RLIA 3W7IA 3M5XA 2Y6ZA 3WK1A 3O06A 5AYZA 3KRZA 1LRTA 2RH9A 2KZHA 3BK0A 3H54A 1P0NA 2V5LA 3P74A 2QDGA 4JS3A 3P8JA 5F4WA 1NAL1 3LHWA 3VFLA 2QCNA 1JUEA 3N2MA 3W2UA 7TIMA 1W5MA 1K8ZA 1GPWA 3K30A 3TQ0A 1ICSA 4OHQA 3TSMA 4HIBA 3MBFA 1L2UA 4Z1BA 3LI1A 1MEWA 1G4PA 4LVBA 3DAQA 3PUOA 3UWZA 4BI6A 4K7VA 1WAUA 1QPNA 2E09A 1ZCOA 3L0NA 2AQWA 5AHEA 2RDTA 3NQEA 3W1LA 2OZ0A 1SFJA 1I2OA 3GR7A 1KM1A 3LXBA 2DJLA 3M7WA 3LCWA 5BMWA 3N2XA 3NVTA 3T78A 5C2XA 3PVFA 4LC8A 5I3KA 3BARA 4WY0B 1AG1O 1KTCA 4LT9A 2NXIA 2VFHA 4UCGA 3B06A 5L9FA 2LLEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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