2HVMA

Hevamine a at 1.8 angstrom resolution
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
GGIAIYWGQNGNEGTLTQTCSTRKYSYVNIAFLNKFGNGQTPQINLAGHCNPAAGGCTIVSNGIRSCQIQGIKVMLSLGGGIGSYTLASQADAKNVADYLWNNFLGGKSSSRPLGDAVLDGIDFDIEHGSTLYWDDLARYLSAYSKQGKKVYLTAAPQCPFPDRYLGTALNTGLFDYVWVQFYNNPPCQYSSGNINNIINSWNRWTTSINAGKIFLGLPAAPEAAGSGYVPPDVLISRILPEIKKSPKYGGVMLWSKFYDDKNGYSSSILDSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 1.8 A resolution structure of hevamine, a plant chitinase/lysozyme, and analysis of the conserved sequence and structure motifs of glycosyl hydrolase family 18.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEVAMINE
molecule tags Hydrolase
total genus 96
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 1996-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2hvmA00
3S6TA 1V3KA 4HPHA 5FOOA 1W3HA 4WKAA 4PMYA 3LMYA 4XX6A 3CZLA 2PWHA 3FHQA 2J25A 3GH5A 3WF1A 1XHGA 3BMVA 5IHSA 1GPFA 3WQ6A 3W37A 4KH2A 2BNJA 2DIEA 1NH6A 3CUIA 3ZT7A 3CLWA 1E6PA 5JUVA 2EQDA 1UQZA 4H8VA 2V38A 1B90A 3AICA 3SURA 5LYRA 1C91A 4CU7A 4S3JA 4QDMA 1MFVA 4QFUA 5ECUA 1EIBA 2BY3A 2UY4A 2XGBA 2WHMA 3ARVA 1D2KA 1E6QM 4GPNA 1FFQA 2J4GA 3K46A 2CPUA 2YJQA 1K9FA 2YA1A 4AMCA 5A2CA 1CPUA 3GYCA 4NRSA 2YKKA 3VNYA 1IZJA 1CGYA 4JFTA 1J0IA 1E5NA 3L4XA 4MJ2A 1MFUA 3PZIA 2CESA 3WY1A 4LQ1A 2BXZA 4CD6A 3DC0A 2WCAA 4J3WA 4AEEA 5E09A 2XWEA 1E0VA 1GVYA 2X0HA 2A3HA 1GNXA 1BTCA 1WZKA 1VB9A 5CSUA 3AIQA 2NW0A 3CZ8A 3NCOA 3L2LA 5EBAA 4JKLA 1AQHA 2V3FA 1WE5A 3ARXA 5GNZA 4U33A 2BS9A 2XFFA 1V3JA 4DM2A 1E1FA 3UG4A 3VGEA 2O9OA 3BLKA 1HNYA 1IT0A 3BAYA 3OLDA 1QI3A 4LYQA 2D0HA 3W82A 2OSWA 1PIGA 4WKFA 2ZUVA 3IAPA 3VIMA 3ARYA 5A8NA 2OSXA 3B9AA 3T2OA 4AZHA 1FA2A 3FNDA 3GTNA 1H0IA 1GVIA 1CXHA 4UQCA 1K9EA 3WIJA 4UFMA 8CGTA 4B16A 4FLQA 3OLGA 4ATLA 3GBEA 3CMGA 2VX5A 3K8MA 1JZ2A 4JCMA 3SCUA 5A6BD 1OBAA 1V6XA 1E4IA 1VFFA 2CKRA 2UY2A 4FLRA 1PX8A 3W6LA 3AOFA 1FHLA 2PC8A 3SCVA 4GXPA 2XYLA 1CEOA 3AMDA 4WKHA 3UERA 4P8UA 1E9LA 1BVZA 5KZ6A 3SUUA 3NDZA 1XH0A 4HOZA 1UA7A 4PSPA 1V0MA 2PWEA 1FH9A 1UD8A 1DWIM 4U3CA 2VT0A 3MS8A 5BXPA 4MAVA 5A95A 2ZX8A 1LG2A 3WELA 2CBJA 3NDYA 5A2BA 1E6XM 1G94A 1KFWA 3KE0A 3WNLA 1EDQA 2PI6A 2VRJA 4AZ5A 2XVNA 2F61A 4H04A 4D6EA 3UETA 5M5DA 5BRQA 1LWHA 3AHVA 1BGGA 1VAHA 1XRVA 1U30A 6TAAA 3RCNA 1UR9A 3OZPA 2D23A 4DUXA 3FAWA 3AHXA 1JFHA 4PMNA 1EGZA 4M1RA 3WH5A 4B3KA 1B9ZA 1UKQA 5A6SA 4P7QA 1LL4A 5BWFA 3WQ8A 2QHAA 2WHLA 4CN1A 2A3AA 5I5RA 2F2HA 1KXVA 3VMNA 3AS0A 1BG4A 1WCGA 4HU8A 4HZ6A 3BXWA 3OZOA 4W8LA 2BXYA 2J7CA 1CGVA 2GK1B 1JAKA 1LL6A 2ESCA 3WL0A 1HL8A 2IXVA 3CZJA 3ALFA 1G5AA 4EKJA 3VIHA 4WSKA 3VX0A 2FDMA 1W3JA 4AZ7A 3BAJA 2JEPA 4M81A 1LWJA 3T2QA 4BQ4A 1W1TA 2J79A 1CGWA 4H7VA 3VDCA 3VO0A 4TXEA 5HPCA 3O6AA 2BV9A 1JI1A 1AMYA 1I1XA 4W5ZA 1WKYA 2C7FA 4GO9A 3GXIA 1Q6GA 1OM0A 1CYGA 1NOFA 5JBDA 3QOMA 2FGZA 4OBSA 3L4ZA 1S46A 3ARRA 2XIBA 3RM9A 2VR5A 3AISA 1MW2A 2D24A 3WF2A 4CD4A 1W9XA 2YA2A 1BHGA 1JZ5A 3GZAA 4J28A 4IISA 1RPKA 3AZSA 3L4WA 2CIPA 4H8UA 3K8LA 1HJQA 1GJWA 2G41A 1JF6A 1QHOA 1C93A 1UQYA 5M03A 2XGIA 3WNKA 2JE8A 3UESA 1MWOA 2DT0A 1QHPA 1WNOA 2ZWZA 4MB4A 5E70A 3AXHA 1E3XA 4Y7EA 2PF0A 2A3BA 2QV4A 2CXGA 1E15A 2F8QA 1GOQA 2Y24A 3FHAA 1WB0A 2VURA 4BZYA 2DQXA 2BHUA 4W86A 1NWTA 4MNLA 1B3XA 4AD0A 4QCEA 2VRKA 2ZX6A 2VVNA 3CO4A 5DO8A 2WMKA 4BCEA 3PTQA 3MKKA 3WF0A 3ZQ9A 1JNEA 2JF6A 2YL6A 3BAXA 3KWXA 4BQ3A 3K4AA 4PCTA 1ZU8A 1E4MM 1JZ6A 3HMCA 1H2JA 4PSRA 2YBUA 4DWSC 1VBUA 3PHAA 9CGTA 3II1A 2O92A 5A2AA 2FHCA 2FHBA 4D6FA 4E4PA 2WVVB 3OLEA 2XPKA 3OLIA 5FD0A 2E40A 1JDDA 3EDKA 1ISVA 3OB8A 3AZTA 1WDQA 2XFRA 4N0RA 1MW0A 3PN8A 5LA1A 4BQ5A 1K9TA 2CHNA 2GJPA 2D2OA 1XSKA 1W9VA 5ABHA 2WVVA 3FY1A 4W5UA 1MQPA 2CITA 1NARA 4CUCA 4CCCA 3MV01 1PX3A 2EXOA 1UWUA 2AMGA 1TZ7A 1PX4A 3J7HA 2J47A 1ISWA 3CHFA 2CETA 4ZE5A 4AZGA 4CN6A 4D6DA 1NWUA 2WAGA 3CZGA 1C90A 4LXFA 3CHCA 2V3DA 1UWQA 3GDBA 3VIJA 1BYCA 1H4PA 1GQLA 3UG3A 5D8ZA 3WSUA 5CLWA 1BF2A 3B8SA 2BY0A 1V08A 1QI0A 4HU0A 4PTVA 2EPLX 2DGAA 5E9AA 1ISYA 3N12A 1QI4A 3AHZA 3AXXA 4KGLA 4E8CA 1TA3B 1PZ2A 3VINA 2XVPA 1J0KA 1J0HA 4JIEA 4NSBA 2G8ZA 1XV8A 3G6LA 1HL9A 4X0VA 5GNYA 2WBKA 3WEZA 2DH3A 2YDSA 5I6SA 1W91A 2WLZA 3RIKA 3ZIZA 1ZB5A 4C7FA 5D9MA 4UQAA 1XD0A 3WNPA 2EPMX 4LX4A 2OYKA 3VTRA 4ZXOA 3GNPA 3VIGA 4U31A 1V0NA 3GXFA 3WF4A 3MU7A 1CTNA 4PMUA 3F5LA 5A69A 1R87A 3W38A 2WMFA 5A6JA 5BROA 5LA2A 1B3YA 3WEMA 1QNQA 1LLOA 4PEEA 1O7AA 3DYMA 3A4XA 3WDJA 3SIMA 2PB1A 3MUY1 4MB1A 3WUFA 5M17A 3FW6A 1V02A 3GH4A 4CD5A 3TTQA 5CPSA 1JI2A 4AIUA 2EEXA 4CGTA 3AS3A 2V3EA 3L4UA 5IFPA 1US3A 4W93A 1E72M 3CGTA 1VBRA 1PBGA 1V6WA 2XTKA 3QOKA 1CWYA 2D3LA 4RE3A 2A3EA 1W1PA 2VZUA 3IJ8A 2VZSA 3SCRA 3CUJA 1LF1A 3OBAA 1CXFA 1GCYA 4ACYA 1E3ZA 3CZKA 1OT2A 3SCWA 2WZHA 2V5DA 4D6CA 4BQ2A 2ZUSA 1UH4A 3EBVA 3TTYA 1KXQA 4HTYA 4LGXA 4EK7A 4W7WA 4Q7NA 3SCQA 3FAXA 1C8QA 5EFDA 3N11A 1DWFM 4GI6A 4IPLA 1JXKA 1RH9A 4E2OA 1EQCA 2BY2A 2W66A 3GXDA 1IV8A 4WF7A 5C71A 3WDHA 3QHMA 1NWRA 1HJSA 3WH7A 5A8OA 1BAGA 3U7BA 1UD5A 3NSNA 2OSYA 2XVLA 1MQRA 1UH2A 3W53A 2EPKX 3AMCA 4JFSA 2E9LA 3VDBA 1Q6FA 1WO2A 4R27A 1K6AA 1B1YA 3THCA 5M3WA 5DT5A 3POHA 1GHRA 5E0FA 4OIFA 4RE4A 1D7FA 1QPKA 3MSGA 1EO5A 2OWWA 4PYSA 1UKPA 4PUDA 4PUEA 1E55A 4GQRA 4J3SA 4KMQA 1W3LA 2WMHA 1OIMA 1EHAA 1ZBKA 1J12A 2E4TA 3PZOA 2GJXA 3AYSA 1HIZA 4F8XA 5IXEA 1QBBA 2EJ1A 2E8ZA 2J62A 5I0DA 1HP5A 1W9BM 5DT7A 4NF7A 2GSJA 1R85A 2W91A 2EPOA 1Y7VA 3T09A 5CPTA 1DWJM 1JYWA 3OG2A 3MMUA 4MTVA 4AIOA 2VRQA 3BLPX 4AW7A 1HVXA 5EFFA 2WWCA 4P8WA 1H49A 1E56A 1FH7A 1E70M 2NT1A 3BCDA 2CBIA 4UFLA 1B31A 1EQPA 1A47A 3HN3A 4UZSA 3AMKA 3ZM8A 1WDRA 3G6MA 3NIYA 4YN5A 3CUGA 3AHYA 3VGDA 5GNXA 3VD5A 2WKLA 2D0GA 5ABFA 3MANA 4J3TA 1CGUA 1HX0A 4NZCA 4W88A 2D22A 1UHVA 4DM1A 1JZ8A 3WQVA 3VD7A 3AMGA 3B9DA 3MMWA 2RGLA 2JIEA 1V6UA 2PBOA 5AYIA 1E71M 1U2YA 2WSPA 1E4NA 1TVPA 2E3ZA 1ESWA 1L8NA 2ZIDA 3BSGA 3CUFA 1MVYA 4C7GA 1UKTA 4KGJA 4GQQA 3RM4A 5BRPA 1CDGA 1GOMA 3ECQA 1JYNA 1XYZA 1JD7A 1JZ7A 1GQJA 2CCRA 1BPLB 2WBGA 1M53A 1C7TA 3T0AA 3W25A 4D71A 1V03A 4PTMA 4LYRA 1UA3A 1PZ3A 1HT6A 2G3MA 4JHZA 1VJZA 1WP6A 4XZBA 2ZXAA 3VPLA 4OOZA 4CU8A 1CXKA 4DWSA 1BYDA 1DWAM 2W61A 3APGA 3HU7A 3JUGA 5I24A 1N82A 3D5HA 1ZS2A 4D72A 2XWDA 1EXPA 1H41A 3GM8A 4TVUA 4AYSA 1ZJAA 3ZOAA 2J7FA 3K8KA 5BXSA 4JFVA 4HZ8A 1J11A 2GUYA 3ARUA 4JKKA 5HNNA 4IUGA 4EE9A 1UH3A 5JBEA 3ZJ7A 5D8WA 3VDHA 1OGGA 2Z1SA 3T0BA 1FOBA 1UKOA 2X05A 1UWRA 4GZIA 3VUPA 4NI3A 1UWSA 2FH6A 5A94A 1DEDA 4TUFA 2XVGA 4M82A 5FIPA 4UQ9A 3M46A 4BF7A 4UOZA 1OT1A 1XSJA 3W29A 4M29A 3VILA 2VX7A 2DSUA 4M24A 1US2A 1JYVA 2WMJA 4MDOA 3WDIA 3WMBA 2OYLA 4D6IA 1GOKA 3W4RA 3T0DA 1B3ZA 2X2YA 2WVUA 1V3HA 1BGAA 3VNZA 1H1NA 4AZCB 1A3HA 2DSKA 2VMFA 4LPCA 1ZBVA 3NYDA 5HDRA 1P6WA 4U2ZA 1YQ2A 1NP2A 2CKSA 4A3YA 7A3HA 4F66A 1VFMA 1J9YA 1VFUA 3T08A 3BSHA 1LQ0A 2VZOA 4AZCA 4UFKA 1CLVA 1OD0A 1WDSA 4KRUA 3AIWA 4HA1A 4C7DA 4PTXA 2AAAA 4ACZB 1E5JA 5A8MA 3UR7A 1E6RA 2E8YA 5IFTA 3KL3A 1SR0A 2XVKA 2GJRA 3NUKA 4OOUA 4P8XA 4YHGA 1X1NA 1QNOA 1R7OA 1TCMA 3AIEA 5A6MA 2J7EA 3BC9A 1KXTA 1JIBA 4ACZA 4CVWA 1M7XA 4EAMA 4HMCA 3IJ9A 2BVTA 1B30A 2XSBA 2DH2A 2X0YA 4LYPA 3WNMA 1EDTA 1F4AA 2G3NA 3PZUA 1KR1A 3BMWA 2G3IA 7CGTA 2VX4A 4W8BA 4W84A 1CXLA 5TD4A 2G3JA 3WH6A 1TR1A 3K4DA 1E0WA 4GZEA 3ALGA 3VIPA 4Z2GA 4D1JA 2XM2A 5C8BB 5I77A 4YHEA 2WYSA 2DSVA 4FF5A 3GH7A 2VZTA 5HPOA 5JBFA 1KR0A 4PN2A 1JZ4A 1W1YA 2J75A 3WUGA 4AD4A 1KXHA 4J3VA 2WNWA 3W28A 2ZICA 1CXEA 4M8UA 4P7NA 1CIUA 1VRXA 2VZVA 3A6OA 3CMJA 2CBUA 4D6HA 1JXJA 4U5KA 3W24A 1G1YA 3GNRA 1KGXA 1JZ3A 3ARZA 2YA0A 3DECA 5CZKA 1VIWA 2ZX9A 1QBAA 2YDQA 2YL5A 3QR3A 1ODUA 2PWFA 3GNOA 1OD8A 2WK2A 3AZRA 1BYBA 2J74A 3SCNA 2VVSA 3WL1A 4OUEA 2Y8KA 3WENA 4DWSD 1EH9A 3IJ7A 1EDGA 1BSIA 4JFUA 1QHZA 4WSJA 5EMYA 2VCBA 1C7SA 3SCPA 2W62A 2UWFA 1ISXA 3WQ5A 1RD6A 2W63A 1I75A 2PBGA 2QMJA 4ML4A 3OGSA 3AQUA 3VU2A 2GDUA 1KBBA 2VNCA 1HF6A 1V6VA 2OWXA 5HBFA 1JD9A 1SYTA 2IXUA 3GXMA 3BGAA 4P7OA 2QLYA 7TAAA 5I23A 2DEPA 2J8GA 8A3HA 3BAKA 1E40A 2W67A 2JF7A 3AJ7A 1LJYA 4P7RA 4Q22A 1OGSA 1XCWA 4UFIA 4XV0A 3RDKA 3RJYA 4W87A 1YHTA 1XH2A 4UOJA 4CVUA 2WVSA 3VGBA 3MV11 2WLYA 4QCFA 4U5IA 3WN6A 2D3NA 5IDIA 1V02E 3UR8A 4AWEA 4GINA 3M7SA 2RGMA 2WMGA 2DT3A 4UQDA 1UZ4A 4UFHA 3MMDA 4GI8A 4JL2A 4PMXA 1HKMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3S6T A;  1V3K A;  4HPH A;  5FOO A;  1W3H A;  4WKA A;  4PMY A;  3LMY A;  4XX6 A;  3CZL A;  2PWH A;  3FHQ A;  2J25 A;  3GH5 A;  3WF1 A;  1XHG A;  3BMV A;  5IHS A;  1GPF A;  3WQ6 A;  3W37 A;  4KH2 A;  2BNJ A;  2DIE A;  1NH6 A;  3CUI A;  3ZT7 A;  3CLW A;  1E6P A;  5JUV A;  2EQD A;  1UQZ A;  4H8V A;  2V38 A;  1B90 A;  3AIC A;  3SUR A;  5LYR A;  1C91 A;  4CU7 A;  4S3J A;  4QDM A;  1MFV A;  4QFU A;  5ECU A;  1EIB A;  2BY3 A;  2UY4 A;  2XGB A;  2WHM A;  3ARV A;  1D2K A;  1E6Q M;  4GPN A;  1FFQ A;  2J4G A;  3K46 A;  2CPU A;  2YJQ A;  1K9F A;  2YA1 A;  4AMC A;  5A2C A;  1CPU A;  3GYC A;  4NRS A;  2YKK A;  3VNY A;  1IZJ A;  1CGY A;  4JFT A;  1J0I A;  1E5N A;  3L4X A;  4MJ2 A;  1MFU A;  3PZI A;  2CES A;  3WY1 A;  4LQ1 A;  2BXZ A;  4CD6 A;  3DC0 A;  2WCA A;  4J3W A;  4AEE A;  5E09 A;  2XWE A;  1E0V A;  1GVY A;  2X0H A;  2A3H A;  1GNX A;  1BTC A;  1WZK A;  1VB9 A;  5CSU A;  3AIQ A;  2NW0 A;  3CZ8 A;  3NCO A;  3L2L A;  5EBA A;  4JKL A;  1AQH A;  2V3F A;  1WE5 A;  3ARX A;  5GNZ A;  4U33 A;  2BS9 A;  2XFF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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