2I7GA

Crystal structure of monooxygenase from agrobacterium tumefaciens
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
GMELGLYTFADVNPNPADGRGPEGARRLRELLEEIELADQVGLDVFGLGEHHRPDYVVSSPSTVLAAAAVKTKNIRLTSAVSVLSSDDPVRVFQQFSTVDLLSNGRAEIMAGRGSFIESYPLFGYDLEDYDVLFAEKLDLLLALREQEVVTWSGTKHPAINGRGVYPRPLQERLPVWIAVGGTPQSVARAGAMGLPVALAIIGGEYRRFAPLFDLYHEAARRAGQEKTKLRTSINVHGFIADTTDKAADQFYGPQAEVMNRIGRERGWGPTNRAHFDAARGPEGNLFLGEPELVAEKIIKAHGVFKNDRFLLQMAIGLMPHDQIMRGIELYGTKVAPLVRKELT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of Monooxygenase from Agrobacterium tumefaciens
rcsb
molecule keywords Monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Agrobacterium tumefaciens str.
total genus 123
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 2i7gA00
1LUCA 1LUCB 1BSLA 3RAOA 1Z69A 3B4YA 3B9NA 1YW1A 3B9OA 1M41A 2I7GA 3C8NA 3SDOA 5AECA 1F07A 1RHCA 1FVPA 3FGCA 4J2PA 5DQPA 1EZWA 1BRLA 3FGCB 1TVLA 1BRLB 1NFPA 2B81A 4UWMA 5LXEA 1NQKA 4US5A 4US5D 1XKJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IJ7A 3M1ZA 1JEZA 3GFXA 1R2SA 2EPHA 2WV8A 1EJ7L 1W9XA 5AB3A 1H7WA 3LMYA 5G4WA 1V3JA 2NV2A 4ADUA 4NRRA 4GI8A 1YE6A 3KW3A 3N3MA 1FP9A 1ME7A 3CNYA 1UZDA 3VZZA 5LNRA 3BCDA 5KSWA 3VABA 3ZLHA 2R8WA 5ECVA 4UFIA 1YTKA 3UFYA 2PDNA 2DUAA 4Q4KA 3W87A 4HHHA 3TKFA 3P7YA 4H8UA 3W53A 2DU2A 4N2YA 2ABBA 4F2TA 1LWHA 1BVWA 5D2YA 3M0VA 5JUVA 6PTDA 3WLQA 1US2A 4E5TA 4DUVA 3WQ8A 3CV2A 3IVUA 4QSHA 1VEMA 3G1VA 1MFUA 4NAFA 1L6YA 3HN3A 3UZYA 3LERA 3WYZA 3LOTA 1J0ZA 3FVDA 3VDCA 1W8SA 3NJ3A 2OU4A 4DZ5A 3W81A 2D20A 4EF8A 2QR6A 2V68A 1XYZA 3STFA 2FYMA 1KBIA 1CIUA 3MJYA 5D33A 2I9EA 2ZZ2A 1KBJA 1R3SA 1M7XA 4GGBA 3I6RA 3VKKA 1GVIA 4MMWA 2YBVA 1GW1A 1O12A 4L5ZA 1WQ5A 1RQHA 4MWAE 3V75A 3L66A 3UNTA 1DWJM 3KUMA 1OX5A 1TREA 1P6BA 1V6UA 5I24A 4RW5A 4JS3A 3QV6A 2QF7A 5HULA 3TONA 2XFRA 1V6TA 1E4LA 3KZSA 3D46A 1HKMA 2FJUB 1A5LC 4YCPA 1WKFA 5BCAA 3M5ZA 3KBMA 4OBRA 3W88A 4LV4A 4LC8A 3CAKA 4K3ZA 4HNCA 3ARVA 2JK2A 5I77A 4G2DA 4J3ZA 1KM5A 4S38A 2BFGA 1Y5XA 4I90A 4GABA 4UFLA 3EZ4A 3WQ4A 1WO2A 5BXTA 3L67A 3LV5A 3EWXA 4HN4A 3NL2A 3G6MA 4EP8C 3GAYA 3E2SA 4CQDA 3TC6A 3TYZA 4D6CA 3B9DA 4HU0A 3S1WA 1PIIA 4RV8A 2QUTA 2WQDA 1FHLA 3LCWA 2ZWYA 2Z7KA 3ATYA 5FESA 3BMVA 4MG4A 2YIHA 2YDQA 1XYBA 2QDEA 2OPJA 5A5WA 2KZHA 4UNIA 2WHJA 4E2BA 3PZVA 1IIGA 3ZWSA 1AL7A 4GY7A 2OWWA 1YTDA 4JTJA 4TMCA 4YPJA 3TVAA 1TELA 1YPIA 2GUYA 4AXKA 2CLKA 4RZ4A 2PP0A 4WGXA 2J7HA 1UD3A 2X09A 4XK2A 5A8PA 1BGAA 4OJYA 3RIKA 4C7DA 3AROA 3W37A 3TQVA 1QOPA 1SFTA 1KCKA 1EWEA 1OM0A 1JNDA 3UT0A 3RX2A 1VIZA 2ISSA 3NVDA 2PDGA 1GZJA 3B0PA 4DO6A 2DVUA 4Z0JA 4CCCA 3PR2A 4MJ2A 3GC4A 3BSGA 4AEFA 4HJFA 2J7FA 4QR6A 1M65A 1IF2A 6REQA 2V30A 2GVLA 2E67A 1S2CA 4LNYA 2JEPA 2BOEX 3GC2A 3T55A 2V5BA 1YDYA 3N2TA 3G6LA 1LOQA 1QPNA 1SO6A 2ATMA 2HS8A 3DU0A 4IH3A 3C0LA 2OX4A 3GTHA 4F0LA 4FSAA 3KS6A 1QT1A 4Q7NA 1EYWA 2EBNA 1HJXA 2PTWA 3OQ8A 1XKYA 3A24A 5E1QA 1FWIC 1I9CB 1QOQA 2E9LA 3NURA 3K2GA 2AQOA 3V18A 5DCDA 3I4KA 3L5AA 4FLSA 4OKDA 4QAIA 1Z44A 2A6LA 4KMQA 4Z2LA 5DO8A 1XGDA 2W3ZA 4K8GA 1BD0A 2EAWA 3DI1A 1UPMB 3A13A 4LVBA 7REQB 2YL6A 1HKJA 2VRJA 3SCPA 3WK2A 3MCNA 5DT5A 3LSBA 1JI2A 1D7KA 1JNEA 4I6KA 1HX0A 3HMCA 2P0IA 5HINA 3NL3A 1XDLA 3N9KA 1XDMA 2ZRUA 1W32A 5AVHA 3SUSA 5DN1A 4KEMA 1F4HA 3F2CA 1E0VA 8XIAA 4EPEC 1WZLA 1LF1A 2HTMA 3OB8A 4RUBA 3BG3A 3RNDA 4ADTA 2ZRYA 1PXGA 4IMFA 1TVLA 4FNRA 3USZA 1R3RA 1ZPTA 1ONXA 1K03A 4XAFA 3W1UA 3TEVA 3VE7A 5AZ0A 1L2UA 2CNCA 3NO3A 3BVJA 2CU0A 1ODUA 1I45A 1EOKA 5C54A 3ONBA 3EDDA 5MKGA 2ZA3A 1ZCOA 3DAQA 1MFVA 4LOCA 5E09A 3P2VA 4AZIA 4PRTA 5G2WA 3SRKA 3S9ZA 1VZWA 4JIQA 5LNVA 4AISA 2FJKA 1SFLA 3STEA 2PU0A 3GXTA 4XVDA 2G4JA 1W5NA 2DH2A 1UJQA 3WLMA 3GK0A 4AX6A 1T8QA 2C15A 1OX6A 2H3BA 4QLJA 3OOQA 1ICSA 1X6LA 3KCJA 4JIRA 4JL2A 4AD3A 2QUVA 5D09A 2GK1B 4TX6A 2J7EA 1BF2A 4AD0A 1IR1A 1VYSX 4QXIA 4HNVA 3W7EA 4YVVA 1R3TA 3JW7A 3K30A 3QHMA 4H1ZA 4XAPA 2NUXA 3OU8A 4AVFA 4UTLA 1JVNA 1UH4A 1A0EA 2HSAA 2IMRA 3BAIA 1B2YA 1GJUA 1NWSA 4XSMA 4DBDA 1KBLA 1J2WA 3TAOA 1S38A 1R87A 4WX2A 3MJMA 5CBIA 4U2YA 1PZ3A 1XFCA 3L0GA 2FIQA 4NJJA 3QV8A 2JGYA 1GPFA 1NH6A 1VJZA 4GBDA 3N18A 2D2HA 3UY8A 4Z1AA 2J6VA 1OY0A 4HPNA 4C7GA 2V82A 3THQA 4IPIA 3U48A 3B05A 2Y61A 4IOTA 3ZMRA 1OQFA 2PZ0A 4PA8A 1LL7A 4MJZA 4PBFA 1NFPA 5D8ZA 4WD0A 1B5TA 4YHGA 3B8SA 2QZRA 4DWDA 2J13A 5EB8A 3QYSA 3NG3A 3NQDA 1N8FA 1ZNNA 3NL5A 5HNRA 3HGRA 1V51A 4ZMGA 4PMNA 2FLIA 5BRQA 1UR3M 1X1OA 2E77A 2QCGA 1E15A 4OECA 3GTNA 4OU1A 2A3EA 3FKKA 3GNXA 1F8MA 1R7OA 4GISA 4NL1A 1NF7A 1V03A 2CHNA 1OC6A 2WNWA 4GX9A 2ACRA 3T9PA 4ILSA 1B0IA 2V0TA 1H62A 3IJ6A 2HXUA 4B90A 3OEXA 2YPIA 5CAHA 3GG7A 3VD3A 3E1F1 3RLHA 3G1XA 5A69A 3HU7A 1D8WA 1QW8A 3GIPA 4WSJA 1LBFA 3TJXA 3L4ZA 2NX3A 2YB4A 1QOXA 3GDMA 5AYYA 2MUCA 4IMCA 1ODZA 5AC6A 1CGYA 2A3LA 2OO6A 3WQPA 3V5OA 2WCGA 3FXYA 1LRQA 2E0PA 4A8IA 2C71A 3F7JA 1MXDA 4NAEA 3KP0A 2C6QA 1JYNA 3MU7A 3SEPA 1FWCC 1VFFA 3RR1A 1Q63A 4QDMA 4IL2A 2QCCA 1RJRA 2ZTJA 1XSJA 1O5QA 3APYA 2PSNA 3MZ2A 5F2IA 5I03A 4MKVA 3VVGA 3EMCA 4ZXLA 4AY7A 1P6WA 2YYUA 1SFSA 1FUYA 2X05A 1LBLA 3UR8A 3SO7A 4QG9A 3CAQA 3M5VA 2NSOA 2W6RA 1BRLA 2WBKA 1TVNA 2G0WA 2PBGA 2WC7A 3CH0A 2GVGA 3LNMA 3ABQA 4LS0A 1S1RA 1L8PA 5EBUA 3RN6A 4I7VA 4MKNA 1H5YA 2J78A 2IUZA 4IQJA 2NQ5A 4AY1A 4NSBA 5KMYA 4N4QA 3W26A 1TTIA 4C5YA 4ZENA 1IEXA 3RJXA 1LJYA 4QROA 3QSRA 3THCA 5EMJA 4A2RA 1LQ2A 3ALFA 4HSOA 4TVDA 3TYDA 3WG6A 5I0DA 4FNUA 2QDGA 4JDYA 1A5OC 3G0SA 4GNVA 2ZADA 2CC0A 2PWUA 1RLDA 1KFEA 4ECLA 1U83A 5MF5A 4HMNA 1BYAA 1QU4A 1CB2A 1UD8A 3J7HA 3PTKA 3R8HA 1V02E 3LG3A 4IUOA 2UY3A 3IPWA 1B4KA 4FOJA 4LAOA 3GYCA 4FS9A 4HCHA 4KWWA 3GXIA 1DTUA 1XLCA 3CUFA 3IUDA 4PFHA 3LENA 1Y8BA 4XX6A 2CXEA 1LYXA 1ZENA 3N34A 4HGXA 4RXFA 4N9CA 2GQAA 1NELA 4J27A 2JIWA 2Z1SA 3LD5A 5EA9A 4GINA 1MDRA 3TW7A 3AALA 2Y70A 3TK7A 4G7FA 3I6TA 3LS9A 1ISXA 4C6NA 4O10A 3ARQA 5REQB 1JCTA 1SO3A 1J2BA 4HCDA 1ITQA 4JIIX 2FHBA 2PPGA 2QPXA 4J28A 2VHLA 1ITUA 4H9VA 5HNTA 1WNOA 3A3XA 1JDEA 1Q7MA 3HA1A 4C1NB 3H2OA 1R86A 2ALRA 1XLAA 3BG5A 2JE8A 1SZGA 5DF0A 4IIGA 4FPSA 3H22A 3MP4A 2NX1A 3MUAA 1E4NA 1UCWA 2I56A 4L4OA 3TMQA 3UZJA 3QKEA 2HE5A 1UKPA 2CLEA 2V38A 2XIOA 4E0CA 4LJ3A 4PSRA 4GZEA 2VYOA 4AWTA 3AS1A 1DYSA 4D6EA 2VEMA 3POCA 4W86A 3NM1A 4I9AA 5E70A 2BV9A 2DEPA 1FKWA 2VZVA 5CC7A 1J11A 3NM3A 1Q2SA 4XZNX 3O8AA 1V3LA 2ABAA 4KWOA 1PKYA 2F6XA 3MMDA 3W24A 3W7PA 1SZRA 1ZCCA 1UH2A 3QV9A 5FJUA 3NSNA 2JIEA 4E3TA 2V8ZA 2PD5A 4BA0A 1Z41A 3EDFA 4CUCA 3PWAA 4FP1A 4LWWA 2QV4A 1TZZA 4OZOA 2VWSA 3FN9A 3TC7A 3KVJA 1GHRA 1XIFA 1BWKA 1FH8A 1GQKA 1EJVC 1V8EA 4GLEA 3T09A 3AXMA 2E25A 1PZ0A 1V4YA 4YYFA 2DW6A 3E74A 1WP6A 4IXXA 3HQ1A 3U6WA 3UJFA 4P7RA 5DCEA 1K7FA 3TZNA 2Z28A 2VNCA 4PMDA 5AZ1A 4DI9A 1KFBA 1MSSA 2EG8A 3WLNA 3HFYA 3GG1A 4GJ1A 1EO7A 4AXNA 3DKLA 3F2DA 4FAMA 3CWOX 4GVFA 3HFTA 1VFUA 3F4WA 5G1YA 4K8HA 1TYGA 4JYDA 2WMGA 5D9NA 4Q4MA 1ZY9A 3WH5A 1F3TA 3AHVA 2PTXA 1MEIA 2DZVA 3O3RA 4JEJA 4S1FA 1CCWB 4FX8A 2FZMA 4Z1BA 3CTLA 2OSWA 1TJ0A 2FPTA 3BANA 2QQ6A 1VQTA 3MWAA 4X63A 5BMWA 4CKQA 3G77A 3W7KA 4NZ1A 3MB9A 5E9AA 3QBUA 4MAVA 3CIVA 2DZBA 1ZAJA 2BNJA 3U0HA 5TIMA 3PFMA 1C8QA 2PDXA 5HQMA 1FKXA 1F7BA 3MI6A 1ESWA 2VTFA 3ZOAA 3WH9A 3FAXA 2PMQA 3R12A 3UCCA 4EK7A 3ONCA 3FYPA 3DHPA 3IV8A 2ZWZA 4I5RA 3H4XA 3TJLA 2FMOA 4F2BA 2B4GA 2VR5A 3G1AA 1V3HA 1YMYA 1V3MA 3TOYA 4GGHA 3MKCA 4P8VA 3R0KA 4DNHA 2YDSA 1UOKA 3P93A 2E9BA 2GPTA 1B54A 4LV9A 3NNTA 5D37A 4LB3A 3NA8A 3GE7A 1YKWA 1UIOA 4KKXA 1PWLA 1A49A 3N1AA 2XVPA 4JQ2A 1XLLA 3CZ8A 5TNVA 2XINA 4DF2A 3P0XA 3MC5A 4B9YA 1L6FA 1VLIA 1MMFA 3O05A 4AWUA 4CNNA 3UWWA 3AS2A 4ZTXA 1EGZA 2BMBA 4DWSD 4DB7A 3QM3A 2YZ5A 5A94A 1UUMA 3QPZA 1X1NA 3KVKA 2XH2A 2YFOA 2ZUNA 4DBUA 3P8IA 2QDHA 1QCWA 2A79A 1IIHA 1QHZA 3LPPA 3S1XA 3GDLA 3W74A 4U5KA 1JF6A 4GKLA 4RJEA 3AYVA 1XGEA 4LC6A 4GO8A 4W8BA 2AL2B 5H8UA 3FNDA 3ZWTA 2HBVA 3L0KA 3NXLA 1K6AA 2D0HA 4W88A 1XKJA 4XAYA 3HPAA 2VX7A 4M0XA 4PN2A 1POKA 2QCLA 1W5MA 2VEIA 3R1ZA 2PDPA 3L5MA 3GUWA 4XUGA 5FI8A 6ALDA 2ZDRA 9XIMA 4LAKA 4LUIA 1OABA 1M03A 3E2QA 3IEBA 4PTWA 3KBVA 3KL5A 3MCMA 4NASA 5EFDA 2FDMA 1A5NC 3UVIA 4I9MA 3KTSA 4ZB2A 3P14A 3QSTA 4BR1A 3MUY1 4LANA 1ZBKA 3C56A 4J7RA 7PTDA 1H61A 2V2HA 4W5ZA 3W2NA 1LQ0A 3S5YA 4H4IA 5IXEA 1WDWA 2A1YA 3NPWA 1OGSA 2PF8A 3V5FA 1WAWA 3WH8A 2ZVIA 3PJWA 4HZ8A 1Z7AA 4FIRA 3L65A 3EWZA 9CGTA 3S5ZA 3N6QA 4NXKA 1KFCA 3MSRA 2ZE0A 2BY0A 2PGWA 4L1WA 4JGDA 1S2TA 1DHPA 3FGCA 2QIWA 5FSDC 2AQVA 3OIHA 1D9EA 3BAJA 1V77A 3A4AA 3LEPA 1TV2A 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