2I9EA

Structure of triosephosphate isomerase of tenebrio molitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
ARKFVVGGNWKMNGDKKQINEIIGFLKSGPLNQDTEVVVGVPAIYLELVRTCVPASIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDVGADWVILGHSERRQIFGESDELIAEKVCHALESGLKVIACIGETLEEREAGKTEEVVFRQTKAIAAKVNDWSNVVIAYEPVWAIGTGKTATPQQAQDVHKALRQWICENIDAKVGNSIRIQYGGSVTAANCKELASQPDIDGFLVGGASLKPEFVDIINARQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A coleopteran triosephosphate isomerase: X-ray structure and phylogenetic impact of insect sequences.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Tenebrio molitor
total genus 89
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2006-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2i9eA00
1KFEA 1A5AA 1K7XA 4XTDA 4CCDA 4OU1A 3LHYA 5D2TA 2Z6IA 3RFAA 2F84A 2VEPA 2QCDB 1EWEA 1SW3A 1PV8A 3KXQA 4WOZA 3W85A 1ONRA 1KFJA 3CU2A 4NNBA 3B05A 2XN0A 3LCLA 2YFNA 1GQNA 2ZFAA 3CHVA 3I7SA 3TC7A 1S3HA 3QF0A 3NZ1A 2ALDA 1L6YA 1ZAIA 3A9IA 4CCEA 3W07A 1W37A 1P1XA 3F03K 4EWND 2Z0IA 1YDOA 1TIMA 5F4XA 2DZXA 3HGOA 4FX8A 3P7YA 2VELA 3N2MA 4ZQRA 1GG0A 1R2SA 4MOZA 2QUTA 1XBYA 4HKPA 4UTUA 2QCHA 2WO5A 1F5ZA 1LOSA 2E5DA 3NQCA 5G1YA 3H55A 5SWUA 3QJAA 3NQ7A 2H8ZA 5HQEA 3C52A 2NV1A 2DZTA 2QAFA 2JBMA 4N9DA 1QDSA 3UWVA 1DL3A 4JX6A 4FIRA 5K7JA 4KFPA 3UNDA 3W7CA 4L4LA 3MW7A 2FJKA 5LHEA 5HJLA 2A1YA 1LCOA 1ML1A 5KSWA 5D2VA 3RK8A 3EX1A 5KZDA 5FI8A 5IM51 3BLIA 3HQ1A 3QRHA 4JYFA 1IIGA 5C2XA 2R14A 1H5YA 3PC0A 1QCWA 4MZ1A 2Y61A 3LHTA 4MVAA 3RNDA 2BWGA 1LROA 2YW3A 1I2QA 1Q6RA 1RD5A 3NO5A 1QO2A 2E6DA 4XTIA 2J6XA 1BKSA 4JTKA 4NNAA 3IIVA 4OT7A 1ICSA 2Y7EA 3I68A 3M9YA 4ZVJA 5DY3A 4HPXA 1W0MA 2ZRZA 2ZA2A 3LB0A 1ZHAA 4NZJA 2WSQA 4FXSA 5AC8A 1D9EA 2B7OA 4JYEA 4PH6A 4YCOA 4PL2A 4M5PA 4FNUA 3FKRA 4FXRA 4POCA 5DELA 3PUOA 4AWTA 5IBXA 2CWNA 4RK8A 1TPUA 1S5VA 1TPB1 3V1PA 1QPNA 1O5XA 3OA3A 4LS1A 1MXSA 3NQFA 2Y62A 1LRTA 2BSLA 4DEFA 1IXQA 2A6NA 4LC8A 3NQGA 1RQBA 2P10A 1H1YA 5CPOA 2J9XA 2C3ZA 4O1AA 2E1DA 3SZ8A 3ELFA 2QCGA 3LCIA 3KVLA 1IXOA 3QMTA 1SW0A 3NDOA 1H7PA 1AW5A 1YDVA 4AWUA 5D2WA 4UTTA 3TAOA 2Z1BA 3W76A 3FKKA 1WBJA 3S1XA 2C16A 1LORA 1KTBA 4X9SA 3O15A 1QO5A 4JIPA 4IMCA 3LHWA 4I7UA 4BFAA 4ICNA 4GUFA 3G0UA 4O52A 3M0ZA 2ZTKA 5K9CA 2FB2A 5AN7A 2YXGA 4BF9A 3PY2A 3NQ8A 4RV8A 3EXSA 3KVJA 4KWVA 2ZQ0A 2QCNA 2ZRWA 4JDYA 4N6FA 5AC7A 1LBLA 1Q6QA 4QAIA 3TDFA 5BMXA 4JNMA 1K8ZA 2W79A 2A85A 4Z08A 3WJXA 4HPJA 3S1WA 1BWKA 3LI1A 3NR0A 3SFKA 4NXKA 2V8ZA 1I2OA 4UTLA 1OX4A 3DU0A 1GVQA 3SSJA 2GPTA 3DXIA 3NM1A 5D2XA 2RHGA 3VNDA 5AYXA 4WUIA 3P74A 3RF9A 1QWGA 4AHOA 4PEKA 4FNPA 3LCWA 1DV7A 3GDRA 1OF8A 2C0AA 1P5BA 1SO4A 2HTMA 2LLEA 3MI2A 1IXNA 4FF7A 1D3GA 3TSMA 3TFCA 2WV8A 2J9ZA 2Y7DA 1B9BA 1XBZA 3W86A 1PL9A 3DKLA 1QFEA 2GQ9A 2F7FA 2TYSA 4I7WA 4M6PA 3W70A 2XN2A 1I2NA 3PBWA 3DHDA 1H60A 2FDSA 4EF9A 4NX5A 4K37A 3C2OA 4E38A 3LRMA 3HG2A 3DBPA 1XBVA 2DZSA 2WNZA 3BG3A 5KINA 2ZRVA 3NQEA 3NL3A 1OFEA 3S42A 2YFOA 2E09A 4Z0JA 2CU0A 3STGA 4HNTA 3M41A 4A21A 3B4UA 3SECA 4HNUA 1K3UA 3GNDA 4O11A 4IJBA 1P0NA 5J5RA 4XZ9A 2GJNA 2AAMA 2GVLA 4GRSA 4TX9A 3W7PA 2NWRA 3MP3A 5FESA 3SR7A 2DZVA 3NA8A 1OFQA 1IIHA 1KBIA 5EA9A 3ZWTA 2ZZ6A 3HG5A 3O06A 5BNKA 4LUJA 1D3HA 1TPC1 2YZRA 4ADSA 3PAJA 4FO4A 3CQ0A 4YCPA 3QMRA 3MMTA 1J5TA 1UUMA 4JYDA 1HG3A 1WBHA 3PBVA 4ADUA 1F74A 1OX5A 3QQ1A 3TW7A 2AQWA 3M44A 3AO0A 3Q58A 2QKFA 5AYYA 3THAA 1QPQA 4K36A 3PSVA 1WV2A 5E0KA 3LTSA 3TNOA 1DJNA 5BRBA 4JX4A 1TTIA 1GVFA 4OV4A 4MKNA 2QCDA 1GVRA 1TPWA 2RDWA 1VJIA 3HGSA 3E02A 4MY1A 4QSHA 3KRSA 1EX5A 2Y63A 1JCJA 4PA8A 1OABA 4CNPA 3OVQA 3LXCA 2WNQA 5DBUA 3PULA 2B0MA 4WY0F 2TSYA 2YSWA 5H91A 2Y89A 1AW2A 3DAQA 3TC6A 1EP3A 3HGJA 4N9CA 4PODA 1KTCA 4OBTA 4NJHA 2C1HA 2WQPA 2QAPA 4DBDA 5KZMA 2JKAA 3TSBA 3W6YA 4HSNA 4K6AA 2TPSA 1ALDA 3S5YA 2JK2A 2V81A 5HNRA 3W88A 1J4EA 2G5WA 4NNCA 3I7RA 3LBCA 2X1SA 3HO8A 3W1QA 4NJJA 1A5BA 4LT9A 3QW3A 5I3JA 1RR2A 3NQ6A 4GJ1A 3TUUA 5FF2A 4CNOA 4XKYB 4CQ8A 4O50A 2RDUA 4NJIA 2OT1A 1W5NA 3F4WA 4JX5A 1I45A 1PIIA 1P0KA 1SFLA 3OIXA 5K3VA 3INPA 2PCQA 4DBEA 5CZ0A 4QNEA 4LVFA 4TMBA 1JUEA 3GX9A 3EX4A 4WD0A 3EX2A 3EWWA 3C2FA 1PVNA 2V9DA 3L21A 2YYUA 1OFBA 4LRSA 1F73A 5G5IA 1WYIA 3GLCA 3T7VA 4GUGA 1LOLA 3KRZA 4EF8A 3EWYA 1KV5A 1EP1A 1TRIA 4LC6A 3W2LA 4QM1A 3M1ZA 3TH6A 1LBMA 3TFXA 4FNRA 3O8AA 3UWZA 4LVGA 3HF3A 3PB2A 4LU0A 1H7WA 2WKJA 4ZQPA 2ATSA 4BI7A 2RKXA 2B7NA 1Z44A 3FA5A 3BK0A 4RLIA 5CPNA 3W1UA 2J88A 2NUXA 4S1FA 4XBSA 2ZZ5A 5FEWA 3B8DA 2NX3A 4JS3A 3IV3A 4HT3A 3EWXA 3LLFA 1OX4B 3L65A 1ICQA 1P4CA 3CEUA 2VEKA 2VC6A 3H53A 4FNTA 1JQVA 2GOUA 1OFPA 1KLZA 4O18A 1DVJA 4LS2A 2VFGA 3W2KA 3G1VA 1M7OA 5FF3A 5KTLA 3W7LA 1MO0A 3K30A 3Q37A 5EYWA 1WX0A 2X1RA 4AH7A 1L6WA 4UNLA 4O57A 1J2WA 1CW2A 1FCBA 1JCXA 2Y88A 3U2OA 4O0ZA 4FNQA 5CZTA 1JQXA 3BV4A 3L5LA 1YLVA 4JD4A 3STCA 1O60A 1G4TA 1ZENA 1TTJA 1Z42A 2YDAA 2NXIA 5AB3A 4IMFA 1FXPA 1X1OA 4RXGA 1SO3A 1XBXA 4HHPA 4K7YA 5C54A 4UFHA 4O12A 3WK3A 5D02A 5TQLA 4UMBA 4RCXA 2E77A 3ZFHA 1VLWA 1KV8A 1YPIA 3NL2A 2ABBA 2V2DA 4JTHA 1TB3A 4RXFA 1WDWA 1N7KA 3W72A 1LM1A 4UUIA 3S5NA 3FS2A 2Y70A 1IF2A 4MPQA 3UD6A 3L5AA 3NZRA 1TPFA 1IGSA 1TPDA 4TMCA 1U83A 1F76A 3B06A 3WK0A 3JR2A 4E2DA 1AG1O 5LZLA 5L6UA 1JCMP 5F2GA 1TQXA 3CWOX 4LRTA 4LVDA 3A23A 3CIWA 2JGQA 1LRQA 4GWEA 4GC4A 5F4WA 1HFBA 4MZYA 1TV8A 4K8HA 3QZEA 5FF4A 2A4AA 1MZHA 2X30A 5LNRA 5D2YA 4O8RA 3IVTA 3DGRA 1KLYA 3NEVA 4IUOA 1LRNA 1HL2A 3BLEA 2V5LA 4Q4KA 4UXDA 3BG9A 3M43A 4RZ6A 3BVJA 1U5JA 5D03A 1OYCA 1TV5A 1C29A 2G96A 2YGYA 2VXNA 2ZZ1A 4Y90A 5L9FA 1M5WA 3QSRA 1F6PA 3DZ1A 3LLDA 1JCNA 2A5HA 3A5FA 1NAL1 1TO3A 3LCFA 3FLUA 3L68A 3W1NA 2QEZA 3EWZA 4Z1DA 2FQIA 1NF0A 4H6KA 2E5CA 2X2GA 1JRCA 5AC6A 4GE8A 3IGSA 3GYEA 1X6UA 1QOPA 1W3TA 4ZQCA 2JKPA 1Y0EA 2R8WA 3WFAA 1G69A 4M19A 4MLRA 4IMDA 5D32A 3OVPA 2VFEA 3R12A 4MJMA 1W31A 4ZZ9A 2EHHA 3LI0A 5C6MA 3UWUA 4S2CA 1OK6A 1JR1A 1VQTA 3BW4A 2Z6JA 3G8RA 4M7TA 2CFFA 4R33A 2ZZ2A 4O0KA 4JDBA 5EPDA 1UBSA 4IPIA 3QFEA 4ORIA 1TPVA 2NX1A 3QW4B 3W23A 3C2VA 3LXBA 3MBFA 4N9BA 3N9RA 5DLCA 1UCWA 1KM2A 5LKYA 3TXZA 4DF1A 1T8XA 1A53A 4LVAA 5LGZA 3WJWA 4XKYA 2FB3A 3L9CA 3M5XA 4O10A 1ZJIA 3G1FA 1HUVA 4U28A 4JTSA 2NX9A 3FOKA 3UWQA 3C61A 1ME9A 3UXDA 5HWJA 1KM4A 3WJZA 2PRMA 4ONVA 1H7OA 1SZGA 3QPZA 5CZSA 4AWSA 4LTSA 3W7NA 3MHUA 3TE9A 1VLIA 3W1XA 4P61A 5A5WA 3TIMA 1V7YA 2JGYA 1SSDA 3G8EA 3SGUA 2ZA3A 4IMEA 4QISA 3PVFA 2W6RA 4LUIA 3GB6A 1EIXA 1X8FA 4KKXA 3HGRA 3ATZA 3KVKA 3TKFA 2QUVA 1M6JA 4UR7A 5F2IA 4MYXA 3EEGA 1YPFA 4YWIA 3F4NA 4BI5A 1EUAA 4DF2A 3HPZA 2NUWA 4S2BA 3MYOA 3L0KA 5G4EA 3PBYA 1FY6A 4NUWA 4UFLA 3UYCA 2ZZ4A 1PHQA 2CZDA 1S5TA 3L67A 3LDVA 4ZQOA 1JUBA 3C8FA 2OZ0A 1VS1A 3PS7A 2EPHA 4UTWA 1FX6A 3QYQA 1WQ5A 3S1UA 3LOTA 1QPOA 3RLUA 1GG1A 5E1QA 2G95A 3UWYA 5LNUA 1EUNA 4NT0A 3R5EA 5GVJA 1KM3A 5AHFA 5C55A 3MJYA 4Q33A 4KFOA 3N2XA 3QC3A 1GYLA 2CLHA 4FNSA 1YTDA 1W54A 1QNVA 4CCCA 3IVUA 4HSOA 2C14A 1Q45A 3P67A 5LNSA 2DORA 3W1MA 1ZAHA 4UTWC 5ABTA 1DHPA 1G7UA 1I2RA 3F1QA 4H4IA 3TQ0A 3W73A 3P8IA 3W2JA 2RDTA 2E5BA 4Y9AA 1KM1A 3NXFA 2ZYFA 4TO8A 1KBJA 1JCLA 3I6RA 3LM7A 3NQMA 4IXHA 1MEIA 5EMUA 1W5QA 2FPTA 4BK9A 4MLJA 3W71A 4LS0A 3NQDA 3G1DA 3MI3A 1PE1A 3JS3A 3N3MA 2TRSA 4JGDA 2DU2A 5G4WA 1B4KA 3FJ6A 3G0XA 4MUZA 3THQA 3W1RA 1KTNA 3STEA 3G24A 2QCEA 3S5OA 2V2HA 2Q3RA 4DF0A 1TQJA 4KWWA 3EB2A 3LXAA 3G1SA 4UTHA 2UV8G 3GZ3A 2OMAA 3LCXA 5D33A 4HN4A 1LYXA 3P62A 5EBUA 3DENA 4YMZA 2D73A 4M6QA 3SJ3A 5D09A 2A0NA 3GKAA 1RZMA 5TIMA 4RR4A 2NXHA 1FUYA 3CPRA 4NVTA 4O15A 1F6KA 3T78A 5DXXA 3FFSA 5AHMA 3GKFA 4JTGA 1GEQA 2E6AA 2XFWA 1VPXA 1SSGA 3HIJA 3UZJA 1EEPA 2QUUA 3G1AA 3M7WA 5LNVA 1GT8A 2CLEA 1G4SA 1L9WA 3W9ZA 1H63A 4N4QA 1AK5A 1AL7A 5HR7A 3QMSA 1VC4A 1R46A 2VOMA 3CEPA 2QJGA 5AHIA 2EGZA 3DFPA 4GXMA 1GPWA 4C1KA 5K4XA 4TIMA 3LV5A 2Q3OA 7TIMA 3UPWA 4AHPA 4JTJA 5KZEA 1NF7A 3DH7A 4WX2A 3GXPA 2E6FA 5F1VA 4IPJA 1FDZA 3M5VA 3PR2A 2CLIA 3SI9A 4X2RA 4DPQA 1NFBA 3N73A 3M47A 2Q8ZA 2YW4A 4DQWA 3NOEA 2Y85A 1QR7A 4PL1A 3C0JA 3CWNA 3P8JA 3UXAA 4IOTA 2BX7A 3PB0A 3PG8A 3W3OA 3WK2A 3MO7A 4G1KA 3CB8A 3GVGA 1ME7A 2WPBA 1V5XA 3KVMA 4YL2A 3G0SA 1E51A 5D38A 3S6DA 1SQ7A 4QQ3A 2A2IA 1KM0A 5G2WA 3W7HA 3BW2A 3HB9A 4O16A 5K9XA 4O4WA 4O17A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DFH A;  4MB4 A;  2WAG A;  2XHY A;  4OU1 A;  5D2T A;  3RFA A;  4JBR A;  1PV8 A;  1ZGD A;  3EYP A;  1ONR A;  1KFJ A;  5GJP A;  2CBV A;  4ROP A;  3LCL A;  1JIB A;  1UH4 A;  2YFN A;  4FOJ A;  4L1W A;  1GQN A;  1E56 A;  3CHV A;  3TC7 A;  1VPQ A;  1S3H A;  2NVD A;  3QF0 A;  1XLC A;  4BKN A;  2XU2 A;  1QWK A;  1ZAI A;  3A9I A;  1WCG A;  3T0A A;  4DJF A;  1C9W A;  2DZX A;  3U48 A;  4Q8N A;  3R58 A;  3QY7 A;  2VEL A;  3VIG A;  4QHR A;  2EQD A;  2XVG A;  1GG0 A;  4YHG A;  1XBY A;  4HKP A;  1IWB A;  3ARS A;  4UTU A;  1C91 A;  5A8M A;  1F5Z A;  2RJG A;  2ZDS A;  5SWU A;  4X9Y A;  5XIM A;  2V3E A;  3MSG A;  1B54 A;  4S3F A;  1W1B 1;  1IQ8 A;  4NZ5 A;  3BSM A;  3NUK A;  3SRH A;  4FIR A;  5H1W A;  3W7C A;  1BPL B;  5HJL A;  2D0F A;  2R9R A;  1ML1 A;  5KSW A;  5D2V A;  3RK8 A;  3EX1 A;  3QRH A;  2VX7 A;  1IIG A;  2VR2 A;  4JYF A;  2R14 A;  4DZH A;  2ISD A;  5I0D A;  1ZL1 A;  1DXE A;  3VIK A;  4IIE A;  1QCW A;  2Y61 A;  3E38 A;  1XD0 A;  3RND A;  3TOY A;  4M80 A;  3LU2 A;  2WM0 A;  3STP A;  2BVW A;  5JIW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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