2IQTA

Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase, class i from porphyromonas gingivalis
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
NAMNKEQLQQMRQAPGFVGALDQSGGSTPKALKAYGIQPDAYQSEEEMFDLIHQMRTRMITSPAFATGKIIGVILFERTMRGKIEGMPTADFLWEKRHIVPFLKVDKGLQDEANGVQLMKPFPELGKLCEEAVGYHVFGTKMRSVIKQANEQGIRDIVEQQFQWGKEILSHGLVPILEPEVDIHCPEKAKAEEILKRELLAQLDKMTEPVMLKITIPTVDNFYKEIIEHPMMLRVVALSGGYSREQANELLSRNHGVIASFSRALVEGLSARQTDAEFNAMLEASIEDVYQASIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Fructose-Bisphosphate Aldolase, Class I from Porphyromonas gingivalis
rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase class 1
molecule tags Lyase
source organism Porphyromonas gingivalis
total genus 95
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2iqtA00
1DHPA 3L5MA 3C2FA 5AFDA 4H4IA 4MYXA 4ORIA 2W6RA 1LBMA 3UY7A 1DQXA 5F4XA 4UNLA 2I14A 3M16A 4I7VA 3W86A 5K2ZA 1HFBA 3GDKA 2WSQA 4IPIA 3STFA 1P1XA 4TR9A 1XCFA 2GQ8A 3NQVA 3KOFA 5CZ0A 3NXFA 3I7SA 2YZRA 3GR7A 2QUUA 3EB2A 1O95A 3HPXA 4BI7A 4IMFA 3C2OA 2WSYA 2ZDRA 5FF0A 2A0NA 2NWSA 3NPUA 3LTPA 3QSRA 1Q6LA 3DENA 4AAJA 1G69A 2FTPA 1VC4A 1VJIA 3TKFA 2X1TA 1S5WA 2OCZA 4O4VA 4N9BA 5BMWA 5G4WA 4IJBA 4WJEA 1KTNA 5CPOA 4A3UA 1HTIA 1TRIA 1K8ZA 1LCOA 3O15A 1H51A 3LCHA 3HO8A 4LY8A 2RDWA 2YYUA 3BARA 3EX6A 4FEZA 3NL2A 1OFEA 1KFKA 4WXZA 3ABSA 4E2DA 3KRUA 1XDMA 3Q94A 3SY5A 3M5VA 1ZHAA 3TIMA 4CNNA 3KVJA 1D3GA 4PFMA 3MI6A 3H53A 4RCXA 1WXJA 4WUIA 1N7KA 2PRLA 1I2PA 3FYOA 3M6YA 2DJXA 2FPYA 3TAKA 5J5RA 4O1BA 2CLEA 2YPIA 3H55A 1SQ7A 5DELA 1TQXA 4Z1DA 1LBLA 1Z41A 4XBSA 3L68A 5A8GA 4PODA 3R8RA 5DCDA 2QCDB 3BW4A 1IXOA 4NT0A 4HNVA 1TPEA 1FWNA 1VQTA 2P0OA 4K39A 1ALDA 4UTLA 3MI3A 1R2TA 1H7OA 3TW7A 4ADSA 1TO3A 2A6NA 4IX2A 4FX7A 3EX4A 5D2WA 3TROA 3GZ3A 3IIVA 3LRMA 3O6DA 1JUBA 1OFRA 3W7NA 2NX3A 4AVFA 3N9SA 4ZQOA 5HUOA 4LS0A 1DL3A 1FBAA 3L9CA 1TMHA 3S1WA 3A22A 2Z2UA 3WJSA 1F5ZA 5D2YA 2CFFA 4NNBA 1NEYA 3O07A 1GPWA 1ME7A 2RFGA 2V5BA 4LVDA 3W72A 4C1KA 3W73A 3NNTA 5G1TA 1FY6A 1PS9A 1TJRA 4MIMA 3USBA 2DZWA 4NJIA 2XN0A 1TPB1 3CIXA 3IVSA 1G6CA 1XC4A 5FI8A 2RH9A 2H8ZA 1QPQA 2WO5A 2VFGA 3S5ZA 3TU9A 4ZQMA 2J88A 4N02A 3RNDA 4ZQNA 2GJNA 3LHTA 1EIXA 2C14A 5AHLA 1D9EA 3LHWA 4M6PA 3UNDA 1IIHA 2CW6A 4BI5A 3EXSA 3KVMA 3NL5A 1TPC1 3W87A 3G1FA 4JICA 3W2UA 4LRSA 2ZRVA 5I3IA 3BLEA 3KX6A 4JDBA 4KFOA 3P61A 2FDSA 4LNYA 1KM0A 3M44A 4RV8A 3BG5A 1AMKA 4FNQA 3UXAA 3S0CA 4U28A 4GNJA 2E09A 2GPTA 1Y0EA 3FKKA 1YXCA 1EP1A 5K4XA 2WNQA 3NZRA 4MOZA 5A5WA 3NAVA 3L65A 3IRDA 3W83A 2GJLA 4O53A 2A4AA 4LUJA 5HWNA 3TQKA 4AWTA 2XN1A 3CTLA 3P62A 3UZ5A 3NQ6A 1YPFA 4QM1A 2E6DA 2QJHA 5DN1A 5KTLA 7TIMA 1XBXA 3ABRA 3CEPA 1ZENA 4UTMA 4YXGA 1UJPA 2NXHA 1HUVA 1LRNA 2R91A 3HG2A 4GE8A 5AC7A 3NQFA 3GR8A 1GVSA 2VEPA 1O4UA 1RVGA 5K7JA 1KFBA 1V5XA 3F4WA 2XN2A 2X2GA 4M6QA 1WBJA 1ZALA 1H60A 4K36A 1NF0A 4MJZA 1S5TA 3TSBA 3I68A 2AQWA 4U4MA 1FWRA 3B0UX 4S2CA 3LXBA 3PS7A 5F2LA 3SGUA 3NQEA 2QCHA 4WY0F 1OFOA 4S2BA 1ZAJA 4OHQA 1H7WA 4FF7A 2PE4A 5LNVA 3QW3A 1KFLA 3AJXA 2ZZ2A 1W56A 3PM6A 3NM1A 3OVPA 1IXPA 3THQA 4UMBA 3W7MA 1JRCA 2P10A 2YR1A 5FF2A 1AG1O 3IVTA 4IUOA 4Z1CA 4BR1A 4IOTA 1X1ZA 1GTEA 4N6FA 1LRQA 3SGZA 2GQAA 1JRBA 2B7OA 4KKXA 1G4EA 3TX9A 3TQVA 1SO6A 3KAOA 3S5OA 3CQ0A 1NF7A 2E1DA 4UTTC 1QAPA 3NGJA 4MZ1A 4OWGA 4XBKA 3BGJA 3TFCA 4HNNA 2QR6A 3T44A 3U8GA 4GJ1A 4O1AA 3W7KA 2CU0A 1JCXA 4Q33A 3IIZA 4E38A 1GWJA 1H7PA 2X1RA 1U83A 4GFSA 2Y7FA 4CCEA 5AC8A 1IF2A 3EKZA 6ALDA 1SSDA 3LI1A 3W2MA 3GB6A 2ZRXA 4RR4A 3TR2A 3GDTA 2OX1A 4NZJA 1FDJA 4MY9A 4WZHA 1QO2A 3E96A 4UR8A 3W1MA 1IXNA 3UD6A 4RK8A 1YXDA 3SJ3A 1KM6A 1U5JA 3DBPA 3LDVA 4W9TA 3QJAA 1GT8A 2ZRWA 5D03A 3B04A 4QJ1A 1K03A 1LOLA 3C2RA 4YCOA 4IXXA 3PWAA 3LLDA 2ZRZA 4IX0A 2CWNA 3MYOA 4MZYA 1G4TA 1GJPA 3BVJA 4WQ6A 5CZTA 1WA3A 1QOQA 4AHQA 4IMDA 1TREA 1KW1A 2C0AA 3O05A 3PY2A 2QAPA 4UTTA 2G95A 3G22A 4WOZA 4AXKA 4MKNA 3WJYA 1TV5A 4XWUA 3OBKA 3IEBA 3VI2A 4Y90A 1GZGA 2ZA3A 4OQVA 1VYSX 4UTIA 4RKAA 1WAUA 4ZL1A 1FXQA 2CZEA 1KV5A 4JX6A 3W7IA 2RHGA 2WJZA 2ZYFA 1T99A 3MBDA 4O0KA 3QSTA 2YGYA 4PA8A 4PTNA 4R7JA 1O60A 4LRTA 4KWWA 2B7PA 2VFIA 3E49A 4JS3A 4Q32A 3U6WA 3A24A 1OFAA 3QPYA 1OHLA 4N9EA 3MBFA 1LROA 3W2LA 3MHFA 3IV3A 3P8JA 2H3BA 2QCLA 1M7OA 5TIMA 3MHGA 4NX5A 2EAWA 1YPIA 1ICPA 1XUUA 5HUPA 1LBFA 3VE9A 4Y8FA 3ELFA 3LX9A 1OX4A 4Q4KA 5CKSA 2RDUA 3W2JA 3FFSA 2QUVA 1TJPA 2Z1BA 3M5ZA 3BV4A 3QRHA 1FUYA 1EWEA 2ZZ3A 4FNUA 2V8ZA 5DCEA 2BWGA 3I65A 3G3MA 1VH7A 2QJGA 3FS2A 3LBMA 4HSOA 4X9SA 2JKPA 2ZZ7A 3L67A 4ZQPA 3UQNA 3ATYA 1W3NA 3DH7A 4I7WA 5CZJA 4NU7A 4Y9AA 2QF7A 3UY8A 1HO4A 3U2OA 2C13A 3QMSA 1C29A 1DV7A 1VYPX 1WBHA 3W1TA 2V2HA 3PR2A 1K3UA 2G96A 5AYYA 2QDGA 4UFKA 3NQDA 2ZCGA 1KTBA 3W7HA 4S1FA 1SW7A 4LTSA 2OMAA 2EKCA 3TMQA 4JYEA 1IGSA 1GVQA 1YYAA 2H3DA 3G1VA 2QCDA 5H91A 2V9DA 5U4NA 3NQCA 3TV8A 4O1CA 2C3ZA 1SO4A 1LZOA 4QITA 1ONRA 2R8WA 1KA9F 2ISWA 4M5PA 1XI3A 5L6UA 4G1KA 2YDAA 4ZQRA 4ML9A 3S9YA 4M6VA 2J9YA 1GVFA 1TRDA 2O7SA 4A29A 4C1LA 3O63A 4FNPA 2JKAA 4GUGA 4LU0A 2DZXA 1TTQA 3S42A 3GIYA 1ME8A 3W85A 2VC6A 2FPVA 3GKAA 3G18A 5T26A 5MHBA 1SFJA 4IMCA 1OFBA 2V0TA 3Q58A 3I7RA 4K38A 3STEA 1TPUA 3C56A 1Q6OA 2Y88A 4AF0A 2FB2A 3LCWA 3W7JA 4PL2A 1MSSA 5CSRA 5F4WA 1HL2A 3W74A 4LW7A 3G1AA 4B5NA 3NPVA 2CZDA 1O5XA 3GLCA 4QISA 3UWUA 1FXPA 3FOKA 5D02A 2AAMA 3QMTA 1XBYA 4Z1BA 3EWZA 2ALDA 1BWLA 3A5FA 1UASA 4IMEA 1X6UA 1GG1A 2DP3A 1YLVA 3P74A 4H6KA 3G0XA 1FX6A 2V30A 4O11A 2JGYA 2R94A 4AH7A 3L5AA 4MUZA 4QNWA 2VENA 3QQ1A 4I7UA 2BXVA 3NQAA 3GXPA 1SPQA 4O54A 3W1QA 5G2IA 4FB7A 5EYWA 4Z1AA 3HPSA 1F05A 1SO3A 4WOQA 1I8JA 3MI2A 2Q3OA 4FXSA 4LVBA 4UNKA 1LLZA 5FF4A 2O7QA 4JTFA 4YWIA 1PL9A 3H54A 2ABAA 1QCWA 4OBTA 3TAOA 3BW3A 4FIQA 3P67A 1SO5A 3LV5A 5HWMA 2QJIA 5F2IA 4X3ZA 2E5BA 5AYZA 3UPBA 3T78A 4FNSA 3NDOA 3SZ8A 3O06A 5EBUA 1JQXA 3TJLA 4WY0A 1OF6A 4OV4A 1R30A 2WPBA 2H90A 3BK0A 1AW1A 1WX0A 4NNCA 3STCA 4TMBA 5BOOA 4BI6A 5FF3A 2C15A 3N9RA 3C2VA 3GNDA 3LCLA 3R89A 2ZRUA 1LM1A 3GYEA 2HMCA 1H7RA 3LTSA 5DLCA 4HPXA 1F6PA 3LOTA 4N4QA 1W1ZA 1VHNA 2X1UA 1W31A 3R5EA 4JX5A 3B03A 3NO5A 5KITA 1RR2A 4AWUA 2VFHA 3M7WA 1KFCA 1X7FA 4CNPA 2VEMA 3T4CA 3LRLA 1TSIA 4UFJA 4R53A 1RPXA 1A50A 3WK1A 5I3GA 2YYTA 1MO0A 1KBJA 1YTKA 5D32A 3PSVA 1KM3A 2Y6ZA 4KWVA 3PB0A 3IIOA 3CWOX 4LV4A 4GBUA 1ZAIA 1ZAHA 4CCDA 1Q6RA 4O14A 4K8HA 5LHEA 3N3MA 1B4KA 3MJYA 5L9FA 3EX1A 1XM3A 3MWAA 4NNAA 1OFQA 4N9CA 3TDFA 2YFNA 3WFAA 1B3OA 1YTEA 3TSMA 3O6YX 3EWYA 3LERA 4GC4A 5F2GA 3A5VA 3BG9A 4WD0A 3N73A 1D3HA 3HJZA 1LOQA 3C3NA 4JTUA 4K7YA 4RZ4A 2V2DA 3NL6A 3M41A 4RX0A 2CLHA 4JTJA 2VFEA 4HN4A 4YL2A 3LGEA 3RK8A 1AK5A 4TX9A 2QAFA 5K9XA 4UFIA 1A5BA 1XFBA 1KFEA 2GVJA 5FEXA 4JIQA 4I9AA 3LB0A 4HNUA 1SU5A 5I3HA 2I9EA 2ZA1A 1KM1A 1ML1A 2PRMA 4OV9A 3W7RA 4RXGA 3BGGA 2GVGA 2VOMA 3C61A 2FPTA 2VFFA 3INPA 5I3KA 1KFJA 4NZFA 1T8XA 4NUWA 2Y7GA 2OT1A 4K37A 3JS3A 2FFCA 3VFLA 3SI9A 3N14A 1QPOA 3HGJA 4LS1A 5D2TA 3EEGA 3ZWSA 5HNRA 2QCCA 1UUMA 3R13A 1LORA 4CNOA 1C8VA 3QF0A 3M0ZA 4O10A 5CPNA 3G1DA 3HGOA 1JUKA 1Q45A 4GWEA 4JY8A 4EOUA 3FA5A 2A6LA 3FIGA 3HG4A 3MMTA 3NEVA 4LOCA 2TPSA 1RV8A 3TK7A 1K7EA 1TQJA 1RZMA 2C18A 1KM5A 4BWLC 4Z08A 2Y85A 3PUDA 3KRSA 1LRTA 3S5YA 4M7TA 2CZ5A 4LVAA 2CLFA 4ZQCA 3NG3A 1O94A 3OVRA 2YW4A 3CEUA 3I7QA 1W5PA 3B4UA 4JXCA 3JR2A 4POCA 4K8EA 1TV7A 4PEKA 3V75A 4RXFA 3VNDA 1I2OA 1OG0A 3DFQA 3L0NA 1JULA 1BEUA 3B0VC 4DXVA 1NAL1 3GXTA 4IPJA 5AB3A 5DY3A 3S1VA 1K8YA 5F2MA 3LV6A 3HF3A 3NVTA 1TYGA 4JYDA 1M7PA 4A21A 4JEQA 3VKJA 3W1LA 4IQLA 3W7DA 1F74A 4N9DA 2QCNA 3S8HA 3NA8A 2E77A 2J27A 2P1FA 2C1HA 3M9YA 4UTJA 4HSNA 4PCFA 5EY5A 2V5LA 3P80A 3M5XA 4RZ6A 5E1QA 3IGXA 4TO8A 3TC7A 1SZFA 5CGQA 2V2CA 2C16A 1W37A 1BKSA 1QDSA 3TH6A 1OYCA 1TPH1 3FYPA 5FEWA 2ATMA 3HG5A 5LKYA 4BF9A 4JGDA 3NQ8A 1A5SA 2RKXA 2VXNA 3WJWA 3M47A 3UWQA 5I3JA 4QQ3A 4GUHA 4NXKA 3GNNA 4JY9A 2HS8A 1VPXA 1TV8A 3CU2A 3C52A 1H5YA 1VRDA 1W5OA 1GVOA 4O52A 1RQHA 1WOBA 4LC8A 1CW2A 1IIGA 2E5CA 5K3VA 4JDYA 1PHWA 2A7PA 2Y7DA 2FIQA 1THFD 1PV8A 1R47A 1P0KA 3GDRA 2PURA 4JTHA 4NX0A 3GDMA 1JCMP 3BO9A 2E68A 3BLIA 2YW3A 3DI1A 5K9CA 1RD5A 1ZFJA 2PRHA 2EGZA 3HGRA 2R14A 3OG3A 3QPZA 1YTDA 2WV8A 1M5WA 3BLFA 3EX2A 3S5NA 3OA3A 2DU2A 1BTMA 3L5LA 3W6YA 2V81A 5LNWA 4E2BA 1FDZA 3QM3A 4HT3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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