2ISWA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with phosphoglycolohydroxamate
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
321
structure length
307
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARSVSVEAELGTLVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization, kinetics, and crystal structures of fructose-1,6-bisphosphate aldolase from the human parasite, Giardia lamblia.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Giardia intestinalis
total genus 114
structure length 307
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2iswA00
3GXTA 4N6FA 1GYNA 4YMZA 1YYAA 1PL9A 4LOCA 1KBIA 3LBCA 4ZQNA 3W76A 4HHPA 3MMTA 4MJMA 1KFJA 3QW4B 3TSBA 5G4WA 2BZNA 2ISVA 1I2QA 1XDLA 1TPC1 3C2VA 1DJQA 3O6CA 3W1PA 2ISWA 2ZZ6A 1FWWA 5IBXC 3ABOA 3S42A 4ONVA 3S8HA 3M47A 1KTNA 1WOBA 1TQJA 1O4UA 4UFLA 4BWLA 4WZHA 2PRLA 5FEPA 4UFJA 4GJ1A 4JXCA 4JYFA 4ALDA 1OFPA 1PCWA 2W6RA 4DXVA 5LGXA 3L66A 3F4NA 4TU1A 1J4EA 4FX7A 3TW7A 3NPWA 3G8EA 4N9DA 4UUIA 3O07A 3GLCA 5D03A 2A0NA 1X1OA 3G0SA 3T40A 1OHLA 3GDLA 5FESA 3T44A 3EWYA 2I9EA 5BMWA 5D30A 4QQ3A 1OYAA 5LNSA 2X1UA 1EPXA 3TKFA 3L21A 1VQTA 3PULA 2X30A 3TSDA 2YR1A 3UPBA 2DZTA 1G69A 1F05A 4Q33A 3M5VA 3WFAA 2C1HA 3CEUA 5KZMA 1AW5A 3CEPA 3NPXA 1LORA 3NQ8A 1TB3A 3KX6A 1TCDA 3HGOA 3LI0A 1GT8A 3S5OA 5FF4A 1X1ZA 4FX6M 3LDVA 5DCDA 2RKXA 4MUZA 4N2YA 2WJZA 3EXSA 5FEWA 3DFSA 3IGUA 1L9WA 2WSYA 1VHNA 1GQNA 1HG3A 5K2ZA 2Z2UA 3PUEA 2JBMA 4PODA 3S1UA 3FA5A 1MEIA 4JD4A 1VCVA 3QPYA 1AW1A 4ZVJA 4HIBA 3UWZA 3LHYA 2C16A 2FPVA 1DJNA 1CI1A 4QISA 3I7SA 4S2CA 4WY0A 3RU6A 5CKSA 3EX3A 1W37A 3PWAA 3HGJA 3QSRA 4WY0B 1B3OA 2CLLA 1SFJA 1TREA 3M16A 5CZ0A 4FXSA 2NWRA 3FJ6A 4CNOA 2V2DA 5J5DA 2V8ZA 4NJKA 5LNWA 2OT0A 4AAJA 4AHOA 5LNUA 2TSYA 3B06A 4K38A 3TAKA 1M7PA 1KM3A 4NZJA 2YFOA 2E09A 3L5AA 2Y7GA 3EWXA 5DELA 4CCCA 3EX6A 2W0UA 2YXGA 1KM0A 1UCWA 2ZA3A 4GE8A 1H50A 3GZ3A 4MJZA 4NNCA 3W7JA 1ZALA 4FNSA 1W5MA 5U4NA 3THQA 3DFQA 3HG2A 3FYPA 5TBOA 3G22A 5F2MA 3IVUA 2H6RA 3NA8A 4CNNA 5D32A 2EAWA 5G5IA 3TQVA 3EX1A 4O15A 3HPSA 1I2OA 3AO0A 4YL2A 2E6AA 2YW4A 3EX4A 3LTSA 4O53A 4HNTA 2G96A 4C1KA 2F7FA 4N9BA 5D04C 3TMLA 2Y61A 1KFKA 4O18A 3EEGA 1S5TA 1LCOA 4O28A 2OJPA 4O17A 3B4UA 4PFMA 4GUGA 3UY7A 4BI6A 3E0IA 2QAFA 3NQMA 3NYZA 4GC4A 1VYPX 3PBYA 1SPQA 1VH7A 3L5MA 3O8AA 3EXRA 3OVRA 1OF8A 4NT0A 3G1AA 2VXNA 1K02A 3A23A 3N19B 4FO4A 4BR1A 1EWEA 3TH6A 3STFA 3U8GA 1B4KA 5MHBA 2ZA1A 4NUWA 1NSJA 1O94A 1TSIA 3TC6A 1OF6A 2NUYA 4AWUA 2A7NA 4ORMA 4IUOA 4TR9A 5KZDA 1IIHA 3GX9A 3O63A 1LRNA 3S5YA 1F6PA 1D9EA 3SI9A 3HGSA 3QPZA 2ZRUA 1KTBA 1JULA 4A3UA 1SZFA 5G2HA 3P67A 1KLYA 4AWTA 2ZYFA 1QNVA 2WQPA 1JCNA 2CLMA 4O8RA 1P0KA 2CZFA 2FFCA 3MO7A 2A7RA 5FEXA 1QO2A 4TMCA 1T99A 4KFOA 2E5CA 1S3HA 4O16A 4N9CA 3VNDA 3W75A 4R33A 3W2LA 2NX9A 1YDVA 1F73A 4FNTA 1QDSA 1Q6OA 3BLEA 2E6YA 2GJLA 4H4IA 2DZVA 2OT1A 2YYTA 1W5QA 2GUUA 4ZQOA 4MYAA 4O12A 3S1VA 4RCXA 4AHPA 4DELA 4LNYA 2J9YA 3TFCA 1RQBA 1VPXA 2VC6A 3GKAA 3UD6A 1GVQA 1KW1A 1WXJA 2QDGA 3LM7A 1ML1A 4K36A 4GNJA 1JCXA 1TPB1 3W23A 2J9ZA 4OBTA 2B7NA 2TYSA 1R46A 3FLUA 4NJGA 2H8XA 5FF2A 3UZ5A 5L9FA 1U5JA 4YCOA 1SQ7A 4LVFA 1H7PA 1F5ZA 4UTTA 2YX0A 5E0KA 1RR2A 4Z1CA 3B05A 4RLIA 2DJXA 2J27A 1W3NA 1W8SA 4XWUA 4IX2A 2OMAA 3UY8A 3NR0A 1KM4A 4BF9A 4IX0A 3STEA 3NO5A 3O6DA 3MHUA 1DVJA 3PM6A 4WY0F 4RX0A 4O54A 1H5YA 3THAA 2NX3A 1IXQA 1W31A 2BXVA 2A7PA 2CLEA 4LU0A 1LBMA 1VCGA 2Z0IA 4RKAA 5KINA 3F4WA 4HNUA 3MP5A 3HB9A 3ATZA 3C0JA 3C61A 3WK0A 5I3JA 4MFEA 5AFDA 3W7QA 3LRMA 3RLUA 4AMAA 1W56A 3MI2A 1QOQA 1PCKA 3LTPA 4LTSA 3KRZA 2CLHA 3KHJA 1A5AA 4POCA 2V81A 3BW2A 3ELFA 4JX5A 4MPQA 1K8ZA 4IWWA 3NZ1A 2J6XA 5CZJA 5AHFA 3W74A 4IMCA 3GR8A 3PG9A 1K8XA 1H7RA 3UNDA 3IVSA 1EUNA 4ZQPA 3GKFA 4Y6GA 5FF0A 3SW6A 1BKSA 5HWJA 1P1XA 4OHQA 2Y62A 2PE4A 1OFAA 4PA8A 1O60A 4EVZA 1FX6A 2QCFA 4NVTA 3CWNA 2R91A 3W7RA 1YPFA 2Q3OA 1DORA 5EY5A 3LHZA 3B0UX 2NUXA 5I3KA 1FY6A 1N7KA 3PS7A 1QO5A 4N4PA 1KFEA 1GJPA 1K03A 3NOEA 4OE7A 1JRCA 3W85A 1JVNA 1QCWA 2ZQ0A 5K4ZA 5G4EA 4BK9A 1IIGA 1K7XA 1WAUA 1F76A 2CZEA 1DHPA 3KAOA 1UUOA 1HO1A 2V30A 1ME9A 3NM3A 2GQAA 2DZXA 2PRHA 2QCGA 2V82A 1WQ5A 3P8JA 4WX2A 3P82A 4LW7A 2OX1A 1FWRA 1JCMP 4A21A 4Z08A 1EB3A 2PRMA 2YZRA 2NXGA 3FIGA 4ZQRA 5DCEA 1DKWA 2JGYA 3STGA 3LRLA 4UMBA 3MYPA 1I2PA 1WDWA 3VE7A 1YDOA 3G24A 1WBJA 4FNQA 3LV6A 3LHWA 3O1NA 5AHMA 3WJYA 1MXSA 4HSOA 2JKPA 1KTCA 3ATYA 1Y0EA 4BWLC 3NZRA 3M43A 2B7QA 2C0AA 1G7VA 2VEIA 3G1XA 2ZZ2A 2CLFA 3WJXA 3W2JA 1LLWA 3IEBA 5I3IA 4LV4A 4JICA 2R14A 1NEYA 1BTMA 2V2CA 4LUIA 5DY3A 1ZFJA 3E12A 1ADOA 2H3BA 4NJJA 4N6EA 4UC5A 4EF9A 2J88A 3R89A 3FYOA 4IXHA 3LGEA 5HWNA 3LCIA 1VYSX 3SGZA 1G4SA 4WOQA 2BX7A 3LXCA 1KM1A 4NXSA 3GAYA 1AW2A 4U4MA 1T96A 3H54A 1SU5A 1B57A 1GOXA 1MSSA 4LC6A 2C3ZA 2V5BA 4AWSA 2A1YA 3DI0A 4DF0A 5D05A 3NL2A 2ZZ4A 3W07A 1SUXA 3W1QA 4NJIA 2AAMA 2TRSA 2Z6IA 1H61A 4O0KA 3DKLA 3UWYA 4UFKA 1IXPA 3KVLA 2Y63A 4XQ6A 5F4SA 2NUWA 3BARA 3Q94A 1TPFA 1W5NA 3ZS4A 3QC3A 2VELA 3EWZA 2GVGA 1A5CA 2DZSA 1TYGA 3BV4A 4ICNA 5LKYA 3W84A 3A9IA 3LBMA 5TIMA 4UMAA 1ZENA 3TW6A 5D37A 3NNTA 1GVSA 4K6AA 2OCZA 3N34A 3G0UA 3P8IA 3W88A 4CNPA 2X1RA 4L4LA 5AN7A 5F4WA 4ADSA 3LCGA 3BLFA 4EOUA 4AEOA 2DZPA 2VENA 1HUVA 3L9CA 3MBDA 1H51A 3R8RA 3ZR4A 1OYBA 3TXVA 1XBXA 4IPJA 1H60A 3GDMA 4ZMGA 3IVTA 4MZ8A 4CLMA 3U6WA 3BO9A 2O7SA 1YDNA 3WJWA 3FKRA 3M7WA 1XBYA 4PTNA 1VHCA 3C2OA 3LHUA 5J5RA 1RD5A 2YPIA 4JEQA 3B8DA 3W2NA 2Y6ZA 6TIMA 4JTKA 4XBKA 2FPTA 1N8FA 3SSJA 3DBPA 4WJEA 3TFXA 4O52A 3UXDA 2A85A 1QR7A 3L2IA 4IMDA 3LCFA 5IM51 5T26A 3LCLA 3M1ZA 3PB0A 4FNUA 2ZBTA 2JK2A 4O4WA 2BSLA 3IGXA 2G5WA 3N73A 4NU7A 1OFRA 3UWUA 3GDTA 1BWLA 2V9DA 1SO5A 5L6UA 1VS1A 2VFEA 2ABBA 4KKXA 1IXNA 4FX8A 3LOTA 1K7EA 3P62A 5K3VA 1CW2A 3GR7A 3QH2A 1Q45A 1JUEA 4NNBA 5DN1A 3IV3A 1OJXA 2EKCA 4JTUA 4O0ZA 1AG1O 1KM5A 4MVAA 2GVJA 4OQVA 4DF1A 4JN6A 4J9JA 3G3DA 3DI1A 1DQXA 1FXQA 2ATMA 2FDSA 1PE1A 1WV2A 3OBKA 3WK3A 1LZOA 3DFOA 4DQWA 3P5ZA 3W7EA 1DL3A 4PL1A 2XN1A 3LERA 4E38A 4BI5A 3NQ2A 4JIQA 4Q4KA 5HUOA 3TX9A 1M5WA 4Z0JA 2ISSA 3TJXA 2VEPA 1O5XA 1NF7A 2JKAA 2XN0A 1LTDA 4WUIA 3P7YA 3IGSA 3ZWSA 4AHQA 1A53A 3GB6A 1B9BA 1VRDA 5LGZA 3O06A 2B0MA 2NV2A 3W72A 3EX2A 4M7SA 2B4GA 5AC7A 2ZZ1A 3R13A 3MWAA 2WO5A 3NQAA 1XKYA 5AC8A 1VZWA 4NNAA 2C6QA 4M6VA 1R47A 3MHGA 3M0ZA 4IJBA 3UPWA 4OT7A 2DP3A 3G1FA 4R53A 5CG7A 1XCFA 1WBHA 1DQWA 1TJRA 3F1QA 3W1XA 2X1TA 4O57A 2TMDA 2HTMA 3NEVA 1DOSA 5CPLA 4LVAA 4KFPA 4QM1A 3N2MA 3W7GA 5LSMA 5F2LA 1O95A 2BWGA 3TROA 1F6KA 1GTEA 1I2NA 1UB3A 3M41A 1ZNNA 3LXBA 5HINA 3DZ1A 4UTTC 3TIMA 2QCMA 4I7WA 2EF9A 4XKYA 2QCDA 3KRSA 3FJLA 4PL2A 4XKYB 2QCDB 3FKKA 3QQ1A 1ZY9A 4NJHA 5FF3A 2NWSA 5DCBA 4AB4A 3P81A 5AC6A 4DF2A 4MYXA 1F74A 5H2ZA 3U2OA 3W2KA 1R30A 1QAPA 5HUPA 4JTHA 3FOKA 3I65A 1XL9A 4UMCA 3GDRA 3LX9A 4UCGA 2CFFA 3CPRA 3LRKA 2I14A 3HO8A 1ZJIA 2QR6A 1XUUA 3TSMA 1KBJA 1W3TA 1OFEA 1PHWA 5HWMA 3V1PA 3AJXA 4OWGA 3B03A 2GVLA 1R2SA 4H3DA 1WYIA 3P84A 1SZEA 4DO6A 5CZTA 1OFDA 4JTLA 3E9AA 1GVOA 3P61A 1TPEA 3GXPA 5D2WA 4AXKA 2CLOA 3PUOA 1C29A 3VI2A 4HN4A 3ABQA 4A29A 3T78A 4ZL1A 1FUYA 4K8HA 3DGRA 1XDMA 1YTDA 4TX9A 2NX1A 2P0OA 1EEPA 2VFGA 2PCQA 2Z1BA 3PBVA 3EKZA 3EWUA 1PS9A 1JQXA 3M5YA 1FWSA 3DXIA 3OEXA 4JR5A 4Y9AA 3C52A 3S1XA 4WOZA 2VFIA 3P60A 3MJYA 1LOSA 1LLZA 4XTDA 3CC1A 4O1BA 4XUGA 4GUJA 1TPUA 1EP3A 1ME7A 5FF7A 1MZHA 4JIPA 5CPMA 3GNNA 1JCLA 1LYXA 5U7SA 3TCEA 3MUXA 2CLKA 3PUDA 3A21A 1SW3A 3RF9A 1HO4A 5HR6A 3ABRA 3TAOA 4FNRA 1TV8A 3SY5A 3QM3A 3EXTA 3OIXA 5G1YA 3LI1A 2P1FA 3BVJA 5CGQA 3PVFA 1RZMA 3MBFA 2DORA 4JX4A 5D2XA 4PC8A 3TQ0A 5D09A 2Q8ZA 1JUKA 4M7TA 4IMGA 1OK4A 3TDFA 2D73A 2NXIA 3TK7A 2GJNA 5A5WA 1GG1A 3HG3A 3PF3A 2FIQA 3VE9A 2XN2A 3CWOX 2VFDA 2WSQA 3BLIA 3C2RA 1LROA 3DH7A 1P5BA 3P74A 3PSVA 2ZRZA 4Z1AA 2WOQA 3QEZA 1FBAA 2J24A 1LRQA 4NXKA 4DPPA 4JDBA 3SGUA 1LM1A 1KFBA 5F1VA 4R7JA 5G2IA 1A5BA 1BWKA 1H7WA 3OVPA 1H62A 3NQ6A 2V5LA 3W22A 2C15A 2C18A 4UTIA 4O1CA 2ZDRA 4XBSA 3TE9A 3TMQA 1W54A 1VYRA 3L0NA 2QCNA 5K4XA 3HG5A 5FEZA 2WV8A 3PC0A 3KXQA 3LLFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2EQD A;  3GTH A;  1LL4 A;  1Q6E A;  2Z2B A;  3ARW A;  2W66 A;  4ZQN A;  3W76 A;  4JTQ A;  4NYY A;  5G4W A;  4V27 A;  3BQ5 A;  3ZQ9 A;  1TUF A;  4I90 A;  5E0C A;  3N17 A;  2ISW A;  3S42 A;  2O4Q A;  4ONV A;  3ARZ A;  3ZR5 A;  5C9U A;  3S8H A;  1ZBC A;  3M47 A;  3PNU A;  2R9R A;  3TTY A;  4WZH A;  2PRL A;  3MSD A;  3TN6 A;  4GKL A;  3ZMR A;  4GA8 A;  5ECU A;  4ALD A;  2DZB A;  2Q09 A;  4DXV A;  3MQT A;  2NT1 A;  2BOD X;  3POH A;  3WUG A;  4PUM A;  4UUI A;  2IPJ A;  3AIC A;  3QKE A;  3ANU A;  5FES A;  1KKR A;  3T44 A;  3EWY A;  4CNS A;  5C7H A;  3H4W A;  1S1R A;  1XLG A;  3ZJ6 A;  1OYA A;  5LNS A;  3GVV A;  4F48 A;  5C8B B;  3WDI A;  3PUL A;  2X30 A;  4O1E A;  1KR0 A;  2YR1 A;  2DZT A;  3VIL A;  1JPI A;  1G69 A;  1GQL A;  3CZG A;  4Q33 A;  3UFY A;  3WFA A;  1XP3 A;  3CEU A;  5KZM A;  1SFS A;  3NPX A;  4QJ5 B;  1XIB A;  4UOZ A;  4CD4 A;  1XLM A;  1TCD A;  4Q8P A;  1GT8 A;  2WB5 A;  1X1Z A;  3LDV A;  4N2Y A;  4DJE A;  5FEW A;  2JF7 A;  1L9W A;  3UZX A;  1HG3 A;  3EDD A;  3UBP C;  1QU4 A;  2JBM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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