2J75A

Beta-glucosidase from thermotoga maritima in complex with noeuromycin
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
443
structure length
438
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEDIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDAPAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glycosidase Inhibition: An Assessment of the Binding of 18 Putative Transition-State Mimics.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 178
structure length 438
sequence length 443
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2j75A00
4OOUA 4FLOA 1HT6A 4AY1A 2FH6A 1CXLA 1DWIM 4ACZB 3CMGA 1GVIA 5A3HA 1KGXA 1CTNA 4L4PA 4QLKA 3CH9A 3L4UA 1KCKA 3WF2A 2IXVA 5I79A 5E9AA 1L8NA 5BXTA 4HA1A 1KFWA 1CDGA 3MUIA 3CUJA 3OZPA 4J3VA 2VRQA 1HVQA 1JDDA 5BRPA 3IJ8A 4OJYA 1V02E 4PMOA 2VC9A 1OT2A 3BAKA 4ZXLA 3J7HA 1ODUA 1KWGA 1UH4A 1W9DM 2HISA 2XFYA 3LPGA 2ZUMA 1V02A 1KXHA 9CGTA 1JFHA 5LYRA 4OKDA 1S46A 3BCDA 1R85A 4MB3A 1HIZA 1DWAM 2WVVB 1QBBA 1V3MA 2CIPA 4GXPA 3VTRA 1VEMA 3CZGA 1QI5A 5FL1A 1GOQA 3N12A 1PJ9A 4OIFA 2ZWZA 2D0FA 4V2XA 2MANA 2O9PA 2VRKA 2FHCA 4AWEA 1GVYA 4D1IA 2V3GA 3PZ9A 1WNOA 2V5DA 1D7FA 3UR8A 1PAMA 2WM0A 1E4IA 4HU0A 4MB1A 2PF0A 1PZ3A 1FFQA 2QMJA 4LPCA 2E3ZA 3RDKA 1ZL1A 3WFZA 1RD6A 2HVMA 1US3A 1RP9A 2E9BA 3AMLA 5HXMA 3K46A 2O92A 4ZE5A 1UKTA 2ZX7A 3RM4A 4Z2HA 2WVUA 1A3HA 2W66A 3AYRA 4UFLA 1CXFA 1NQ6A 1V6VA 1ZU8A 2XG9A 3CMJA 3DYPA 4A3HA 2A3AA 1J11A 1I75A 1JG9A 1PBGA 2VOTA 3TP4A 1V0MA 4B9YA 1CIUA 3OIHA 1UYQA 1OCQA 3VIJA 3AFBA 4JAWA 1E3ZA 1EHNA 4JFVA 3E1F1 4BQ5A 3POHA 2ZE0A 4M29A 2ZWYA 3F5JA 2V5CA 2XYLA 1SR0A 2PWFA 5DFAA 3ARPA 1UR1A 3GDBA 2OWXA 1VFUA 1XSKA 4YN5A 1QOXA 1HL9A 2OLHA 3WL0A 2CCRA 1G94A 1K9TA 3VDAA 1E6SM 1TCMA 4W8BA 2FGLA 3PBGA 1PX4A 3MMDA 3QOKA 3OGSA 2W61A 3BSGA 1FH8A 3S6TA 1R87A 2WB5A 4U3AA 1OWQA 4KRTA 2WMJA 4DUVA 4H8HA 3GXFA 1UD5A 3VMPA 1JNDA 3AISA 3SCWA 3VIFA 2WC7A 5C8BB 2XVNA 1DWJM 2VMFA 1Q6GA 1M04A 5A6LA 1Q6CA 5A8PA 2GK1A 3WNNA 2FGZA 2DSUA 3B9EA 4P7QA 4C7DA 4CD8A 1W9BM 1BGAA 3OZOA 4NI3A 4NRRA 5ABHA 1AQHA 2XIBA 1NP0A 2XIIA 2A3BA 1P6WA 3TTSA 3F5LA 1V3HA 4P7LA 5HDRA 3ZR6A 1JYWA 4W7VA 3THCA 2XVGA 2YDRA 3U57A 1VFFA 1H3GA 3O9NA 3U7BA 4BQ2A 1ISVA 3VMNA 5E6YA 4PUDA 2J7BA 4DWSB 3FHQA 2EPLX 1VEOA 3G6LA 4Z2JA 2EQDA 2VX5A 2DSVA 2X05A 4DWSC 2CBJA 1JL8A 4UQ9A 1E70M 1UKSA 3VX1A 3BMWA 5ABFA 1E15A 1XSIA 4PTXA 3L4ZA 3WSUA 4HZ8A 2EPKX 1W9UA 3PZQA 1W91A 4X0VA 1TA3A 1UWSA 3WQ6A 4KGJA 2VI0A 4XV0A 3RPMA 2EEXA 1VJSA 5A69A 4GQRA 4D6HA 2TAAA 4AD1A 2NW0A 1MQQA 3AIUA 2J77A 4S3JA 1J0JA 5I6SA 3I3BA 1LJYA 1CBGA 2CXGA 3FXYA 1MW0A 3ARYA 5LA0A 1GOIA 1LWJA 3AIEA 3WUGA 2DSKA 4AD2A 1YHTA 1XYZA 1FP8A 2WCAA 2WNWA 4F8XA 4AD0A 4CKQA 3VINA 2RGMA 3VOCA 2UY5A 8CGTA 1E71M 2Y5EA 1XSJA 1GZJA 4DM1A 2E4TA 1WDPA 2GDVA 3L4YA 2JF7A 2D2OA 7TAAA 4TVDA 3KL3A 1UKQA 5I2UA 4URIA 1TA3B 2VR4A 3WBEA 3CZKA 4E8DA 4ATDA 1US2A 4PEEA 1RP8A 1TZ7A 3VDBA 1ISXA 3AZRA 3AS0A 1NOFA 1UH2A 3MKKA 2W63A 2JIWA 3A3HA 3DHPA 3WDQA 3OA5A 4E8CA 2FHFA 3LPFA 1TUXA 3DYMA 5D9MA 1UOKA 1E6PA 2WPGA 1UD4A 5EFFA 1U30A 1ESWA 1BYCA 1NWUA 3BAWA 2EJ1A 1FH9A 3TTQA 5D8WA 4D6DA 4P8XA 2WANA 2J7DA 2BVTA 3ARTA 1H41A 1H09A 3RCNA 3WFLA 2G3JA 2YL6A 1UR9A 5F7UA 4MB4A 2VQUA 4TVCA 4AZHA 1E1EA 5LA1A 1RH9A 3AMDA 3WDPP 1Z32X 3FY1A 1R8LA 3EMZA 2VX4A 4TUFA 1H49A 4PMQA 1ZS2A 4UCFA 3W28A 2WBKA 3MU7A 3AHVA 3WMCA 1BYDA 5CGMA 5A8OA 4AZIA 1HKIA 1OIMA 2FHBA 5LA2A 4QLJA 1EO5A 1M01A 2VVSA 1NWSA 4Z2LA 1F4AA 4ATWA 1ISZA 2CKSA 2FH8A 3PTKA 1H4PA 2VR5A 3VD3A 1B3XA 2YA2A 4H8UA 2WCGA 2BV9A 5A2BA 1E4LA 5FKYA 1XRVA 4LYRA 2OYLA 3PZTA 3WNOA 5DEZA 4HMEA 1WKYA 4S3KA 3BAJA 5BROA 3VO0A 3AIQA 4J7RA 1OM0A 2DSZA 3RO8A 5A2CA 1CENA 3OB8A 1KBBA 4WKAA 3VIHA 1JI2A 3A6OA 3AROA 2ZX8A 4UOZA 2WKGA 4HMCA 2XVKA 4FK9A 5DT5A 1OGSA 2XGBA 1PPIA 4D72A 2W91A 2W5FA 3AICA 2VZOA 5A1AA 3WH8A 2WAGA 4AZBA 2J7HA 2YDQA 2VZSA 1QW9A 4W85A 1V6UA 3VDHA 2NT1A 4M8UA 5I24A 4RE3A 4AD5A 5KEZA 3VIOA 4Y7EA 5AYBA 5EBAA 4JHOA 1XD1A 3OBAA 1E5NA 2XM1A 4PMVA 3A4WA 3OG2A 1GJWA 1B2YA 4ZEPA 3SUVA 4CCCA 2Y4SA 3FNDA 3SCTA 1EGZA 5CJ5A 3W29A 2EBNA 4ZXOA 3WNLA 4NRSA 4OOZA 5CQ1A 2PC8A 1VBUA 4UFHA 4FF5A 2Y24A 1E3XA 3T08A 1SYTA 3CHCA 2F8QA 5CLTA 1JDCA 3KWXA 4UQAA 2Q8XA 3VVGA 2CKRA 2CETA 1H0GA 4JKKA 1B3WA 4HTYA 1XYFA 4XX6A 3ZMRA 3WEMA 4PMNA 1CZ1A 1C91A 3QOMA 4AEEA 1J0YA 1CEOA 1DP0A 1ZBVA 3BH4A 1C90A 1NM9A 1KBKA 1NOWA 2A3HA 5I23A 1JYXA 3WEOA 3WUBA 3PZVA 3A4XA 1UZ1A 4WF7A 6A3HA 1C3FA 1BSIA 1BLIA 4PTVA 2ZIDA 1HJUA 3T0DA 1AVAA 3VD4A 4TX8A 2PBGA 4DM2A 4H2CA 1JXJA 1VF8A 2J74A 1G0CA 5IDIA 2JE8A 4Q22A 1W3JA 5CSUA 2BHZA 1E43A 2Y8KA 4CCEA 2PWDA 2WVTA 3N15A 3T2PA 4WKFA 1KXTA 1JZ2A 3ZT5A 3BSHA 1QNSA 4XUYA 5GNYA 4Z2KA 1BQCA 1HKKA 2A3EA 3KE0A 5A8QA 4TTGA 1QNPA 3I3DA 5I5RA 1YQ2A 1GQLA 1HF6A 1J10A 4WK9A 3AOFA 2C7FA 2ESCA 3ARWA 2DDXA 3CBWA 3SCVA 4HA3A 3GTNA 2OSXA 1OGGA 4CU6A 3MO4A 1Q6FA 4CU8A 2VT0A 1EDQA 4HPGA 2DPEA 1TMQA 4WIWA 3NJ3A 5M03A 2WMIA 5C70A 1CECA 3SCQA 2XJ7A 3CO4A 4PMUA 4DUWA 5A6BD 1QW8A 1U2YA 4JFTA 4EANA 3G6MA 5CSYA 4HOZA 5A95A 3K8LA 4B3LA 3N9KA 2X8RA 3CUFA 1K6AA 3WL1A 3F5KA 2OYKA 1MFVA 1QNOA 3UG4A 4ZFMA 4BF7A 2A3CA 1CWYA 3N1AA 4EAMA 2W4XA 1W9XA 1UWQA 4PMDA 3AIWA 3VM7A 1W9PA 1JFXA 4PSRA 3RJYA 4J3WA 3D5HA 2WLZA 4M80A 4PMZA 1V0NA 2EO7A 1OD0A 4WJXA 1XD0A 1MXGA 3GH4A 1HJWA 1TVPA 4CCDA 2OSWA 2G3IA 3EDKA 2DT0A 3HU7A 1NWRA 1E6RA 1W32A 1GUVA 3L4WA 5AC4A 1JZ5A 2EPMX 1LG1A 4QAWA 1HKJA 3WMBA 2JEQA 3K8MA 1MVYA 2WMIB 1EHAA 5FL0A 1UWUA 3WY1A 4RL3A 2DH3A 3WQWA 4GQQA 1R86A 2XPKA 1JGIA 3ARVA 1Q4NX 1QBAA 5JIWA 1B3ZA 1UR2A 3WNKA 1UR8A 1C8XA 2Z1KA 3RILA 2JEPA 4PMXA 3OLEA 6TAAA 4U2ZA 4B16A 4D6EA 4ZENA 3GXDA 3PTMA 2D3LA 4GO8A 3POCA 5BWFA 3FHAA 4JFUA 1UWIA 3ALFA 4W87A 4P7NA 4ACYA 1E56A 1QHPA 5A6MA 1BPLB 4Z2GA 4E2OA 1E6QM 4JCMA 3IK2A 3SUTA 2F2HA 2CBVA 4UR9A 3O2LA 1DWGM 5C71A 3T09A 1GW1A 2UY3A 4LX4A 3W24A 4JIEA 3U5YA 3AS3A 3L2LA 3T2QA 1HJVA 2Y8VA 4M24A 1QI3A 4JFWA 4R27A 4AD3A 3SCNA 2O9TA 2X0YA 1HJQA 4NSBA 1HJSA 1AMYA 2G41A 3LMYA 2CITA 4FLRA 4U5IA 1CXIA 3B9DA 3U5UA 1LL7A 2WHJA 3U7VA 3VIPA 3A47A 4GPNA 5JBEA 2QPSA 3WQ4A 4QFUA 4AZ7A 1JZ8A 1V03A 3VNYA 2GVYA 4KH2A 1MFUA 1E5JA 1IV8A 3AJ7A 4P7OA 3VPLA 1HNYA 1VIWA 1BFNA 1W2PA 2WK2A 1FP9A 2WZHA 4P8VA 4K68A 3WH6A 2C8NA 3PHAA 1NWTA 1FHLA 1UZ4A 4JKMA 5EMYA 2J4GA 3N18A 1GOMA 2DT3A 4EE9A 3HJEA 1VRXA 4GI9A 3L4VA 4CD5A 4HMDA 4PUEA 4MAZA 1KWKA 1PEZA 3DHUA 1N82A 2G3NA 2CBIA 2IXUA 2YBUA 4PN2A 1HJXA 1WZAA 4W88A 3AYSA 5JBDA 2GK1B 5D9PA 2J78A 4LXFA 3II1A 4CU7A 3BGAA 4EK7A 3N11A 2ZX5A 3EDJA 1JZ7A 3CGTA 4JL1A 1ZJBA 1E6XM 4D6FA 3VGBA 2CHOA 3ZM8A 3VGFA 2V3FA 2BXYA 2JFEX 2XTKA 3NCOA 5BRQA 3W6MA 4W89A 2WC3A 4JHZA 1OB0A 1JAKA 1J12A 1E0WA 1V08A 1DTUA 4OUEA 5E6ZA 1CGYA 2WCSA 4GZIA 2OWWA 3SUWA 3VD9A 3WD4A 1UH3A 2D1ZA 3AXHA 4W5ZA 2EXOA 4HP5A 3VX0A 1DEDA 2ZUWA 5KZ6A 2ZX6A 3LPPA 1CGTA 1XCXA 5ABFB 3BLPX 4MNMA 5BYWA 3OGVA 3ZJKA 1E6ZA 1E72M 2WHMA 2X0HA 3IJ7A 3M07A 4CN1A 1KGUA 4GIAA 4KRUA 4AYSA 5FOOA 2VZVA 2VZTA 3BCFA 4M81A 1EDTA 2BFGA 2BS9A 5FCZA 3QHOA 1XH1A 1VFOA 1QI4A 1V3IA 2D23A 1DHKA 1ISWA 1GHRA 1SMDA 3WIJA 2D3NA 1EO7A 4IPNB 1W1TA 5CGTA 4P8UA 2XWEA 1B1YA 2ZUNA 2NT0A 1FA2A 2JIEA 3ZSSA 4AD4A 1WO2A 2EPNA 2GJRA 3UEQA 2EPOA 2OYMA 4F9JA 5I78A 2YLLA 5HPCA 1TE1A 3ZIZA 3M6DA 4L4OA 5D4YA 1M03A 1V0KA 1VEPA 4M56A 3ALGA 2YA1A 5A6KA 3W27A 2PWEA 2UY2A 1E9LA 3CUGA 1LL4A 4H8VA 3MUZ1 3ARXA 1MQRA 4YHEA 4W93A 2XFRA 3NDZA 3WDIA 1WCGA 3NSNA 2QMKA 1W3LA 2DH2A 1C93A 3FW6A 3AXXA 4MB5A 3IJ9A 5CZKA 3CZ8A 2YKKA 3MMWA 4D6GA 2RGLA 4QLLA 2PWHA 4FMVA 3UETA 1UUQA 5A6SA 4E4PA 1WDQA 1ECEA 4Q7NA 4OBSA 1ZJAA 2E8YA 4HU8A 3ARZA 1CLVA 4DWSD 3VILA 5ECUA 1JXKA 1WZLA 1GORA 2WZIA 1V3LA 4D6IA 3GZAA 3AS1A 1UA7A 3QR3A 4TVUA 2DEPA 3CUIA 3W82A 1B90A 4J27A 1MW3A 1JI1A 1SFSA 3MSDA 1I1XA 2O9OA 2J8GA 2VX7A 3CHFA 1B3YA 1NP2A 1B9ZA 4PCTA 1FHDA 1GQKA 1XH2A 4TOQA 3ZSTA 2GFTA 2G8ZA 3EMQA 4IUGA 3W38A 2F61A 2ZUUA 5EFDA 1FH7A 3SCSA 3OLDA 3S2CA 1HVXA 1W2VA 1X1NA 4W8AA 7A3HA 2BVYA 1CXEA 1JZ3A 2AMGA 2DGAA 3CUHA 4GO9A 3W25A 2YLAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OOU A;  4FLO A;  1HT6 A;  4AY1 A;  2FH6 A;  1CXL A;  1DWI M;  4ACZ B;  3CMG A;  1GVI A;  5A3H A;  1KGX A;  1CTN A;  4L4P A;  4QLK A;  3CH9 A;  3L4U A;  1KCK A;  3WF2 A;  2IXV A;  5I79 A;  5E9A A;  1L8N A;  5BXT A;  4HA1 A;  1KFW A;  1CDG A;  3MUI A;  3CUJ A;  3OZP A;  4J3V A;  2VRQ A;  1HVQ A;  1JDD A;  5BRP A;  3IJ8 A;  4OJY A;  1V02 E;  4PMO A;  2VC9 A;  1OT2 A;  3BAK A;  4ZXL A;  3J7H A;  1ODU A;  1KWG A;  1UH4 A;  1W9D M;  2HIS A;  2XFY A;  3LPG A;  2ZUM A;  1V02 A;  1KXH A;  9CGT A;  1JFH A;  5LYR A;  4OKD A;  1S46 A;  3BCD A;  1R85 A;  4MB3 A;  1HIZ A;  1DWA M;  2WVV B;  1QBB A;  1V3M A;  2CIP A;  4GXP A;  3VTR A;  1VEM A;  3CZG A;  1QI5 A;  5FL1 A;  1GOQ A;  3N12 A;  1PJ9 A;  4OIF A;  2ZWZ A;  2D0F A;  4V2X A;  2MAN A;  2O9P A;  2VRK A;  2FHC A;  4AWE A;  1GVY A;  4D1I A;  2V3G A;  3PZ9 A;  1WNO A;  2V5D A;  1D7F A;  3UR8 A;  1PAM A;  2WM0 A;  1E4I A;  4HU0 A;  4MB1 A;  2PF0 A;  1PZ3 A;  1FFQ A;  2QMJ A;  4LPC A;  2E3Z A;  3RDK A;  1ZL1 A;  3WFZ A;  1RD6 A;  2HVM A;  1US3 A;  1RP9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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