2J9ZA

Tryptophan synthase t110 mutant complex
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
251
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Betaq114N and Betat110V Mutations Reveal a Critically Important Role of the Substrate Alpha-Carboxylate Site in the Reaction Specificity of Tryptophan Synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 95
structure length 251
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2j9zA00
3QPZA 1H7RA 4AH7A 3N2XA 3ZS4A 1OHLA 5G4EA 3UWVA 4FO4A 4LTSA 1EUAA 3G1YA 3NQEA 2YFOA 4LVGA 2IQTA 2B7OA 1BTMA 1YADA 3UY7A 1P5BA 1W54A 5LNSA 1LOLA 1FBAA 2FLIA 3GIYA 3DH7A 2CZFA 2BSLA 3TC6A 1G69A 3ABSA 2C14A 1XXXA 2JBMA 3QC3A 4QITA 4Z1CA 2RDWA 4C1KA 2RH9A 4HT3A 2X1TA 1SZEA 3HGRA 3UD6A 1TPC1 2P0OA 2CLLA 4AWUA 5BNKA 3STCA 3NQFA 4GWEA 2BTMA 3HBLA 3PC0A 4GNJA 2GPTA 4S2BA 2CWNA 3RNDA 1LRQA 4DO4A 2J9XA 3GDLA 2GQ8A 2BXVA 2WV8A 2Y89A 1JCYA 1SUXA 3CB8A 3EX3A 4EF8A 2J9YA 3LXCA 3WK0A 3G8EA 1R47A 1UJPA 4FX7A 2H3BA 2ZFAA 2QJIA 4Q33A 3SGUA 4LU0A 1XDMA 1SW0A 5HR6A 2QCMA 1H1ZA 1TQXA 5K9DA 3TH6A 3HO8A 3SY5A 5BOOA 1W1ZA 4IPIA 2J88A 3UWYA 1A53A 1T96A 3FLUA 2WSRA 2VEMA 3CIWA 3NQ2A 3CQ0A 1TRIA 2I1OA 1R46A 3NR0A 4ZQCA 1KW1A 4LVDA 2NV1A 4MLRA 2R91A 2Y6ZA 1Q3NA 4JEQA 3NEVA 5CZTA 3TAOA 3DKJA 1B3OA 4IUOA 1GVOA 4K8HA 4UIOA 2X1RA 3W1UA 1KFJA 4K7VA 5DLCA 4GFSA 5L6UA 3Q37A 4BF9A 3C2OA 3SW6A 4HIBA 4LUIA 3PB0A 4UTWC 1Q6QA 3B0PA 1SFJA 2EAWA 4ZQMA 5AHLA 3THQA 4O17A 5G5IA 3LBCA 1PCKA 3WJYA 4NNAA 2WNNA 3NPVA 5DELA 4FB7A 1SQ7A 3TUUA 2CLKA 1TMHA 4DBDA 3EX2A 1JRCA 1OJXA 4JGDA 2GQAA 5D09A 4RKAA 5LGZA 4IXHA 1IXPA 3QRHA 5CPOA 3P62A 2A0NA 3EXSA 4AWTA 2O7QA 2Y7EA 4IOTA 5F2IA 5LNWA 4MYAA 1U83A 5ABTA 3LI1A 3A9IA 1OG0A 2FB3A 3P81A 1TPWA 3LCIA 1EX5A 3O6CA 1SZFA 1QPQA 5HUOA 2WPBA 1ZNNA 1P4CA 3QZEA 1OFOA 1OFDA 3WK1A 4UMAA 2Y85A 3W2KA 2A7NA 1TPH1 4H6KA 4OHQA 1LTDA 1YDVA 1D3HA 3NQDA 1HO1A 3CHVA 2ZZ7A 4E2DA 5AC6A 1H7WA 1L6YA 5DBTA 3OBKA 4JX6A 3PY2A 4JICA 2CLHA 1KM3A 4NXSA 2C16A 2EPHA 1QDSA 1LBMA 2CW6A 2ZQ0A 1ADOA 1TTQA 5CGQA 4FNPA 2DP3A 2VFHA 2WQPA 3UZJA 3QYQA 1O95A 1QOPA 3TV8A 3OA3A 5DXYA 4LVFA 4M7TA 5CZJA 5I3FA 2NUXA 5F2LA 2HMCA 1LORA 3MBFA 2FQIA 2GJLA 5EY5A 3EWZA 1TJRA 2H90A 2B7NA 4L4MA 3W7EA 2XN0A 2DJLA 1H5YA 4CQ9A 2V9DA 2Q3OA 2Y62A 1SSDA 3L9CA 3W84A 4ONVA 2V2CA 2QJHA 1OYCA 5BW6A 1SZNA 4QIUA 2J9ZA 3W7KA 3WK2A 3TE9A 2YYUA 4Y8FA 1I2OA 4A29A 5D2YA 3GDMA 3CEUA 3A22A 1VJIA 3ZFHA 4NUWA 5LHEA 2AQWA 3NO5A 2ZCGA 4JYFA 4ALDA 2NLIA 2G97A 4RK8A 3UY8A 1TJPA 2DZTA 2B7PA 5E93A 5I3JA 2QCGA 5EL1A 3W72A 1IXQA 2H3DA 1SSGA 4LV9A 3I68A 5D33A 1A5SA 3QM3A 2VKZG 1DBTA 1TPVA 4MPQA 1KV8A 3GK0A 4HNVA 1EPXA 1OX6A 1B9BA 1H62A 1RVGA 5EKYA 3NPUA 1KFEA 2QDHA 3QSRA 1TREA 3CC1A 3HGJA 5LZLA 3T44A 4HPXA 1TPFA 1VHNA 2G96A 4EVZA 1QFEA 8TIMA 1XBYA 5AC7A 3UPWA 3LHWA 4FXRA 3TR2A 3O05A 1TV7A 2WKJA 3YPIA 3MP3A 1QWGA 1LM1A 4OBTA 5G2IA 1HG3A 2YW3A 3RU6A 1GVRA 3V75A 2GVLA 3MJYA 5DY2A 1PE1A 1F2JA 4DEFA 1Q6RA 2YFNA 2YPIA 4MJZA 1H7NA 1IIGA 4AHOA 1C9DA 3KXQA 4WD0A 2VFIA 3TROA 4POCA 3UWQA 3C2RA 3IIOA 3LCGA 4WQ6A 4IGHA 1QO5A 3W75A 1PVNA 3G8RA 3NG3A 1VS1A 4YWIA 4CNOA 1ICPA 1ZAHA 2QUVA 3RK8A 1TPB1 1OF8A 4O1DA 5HWNA 3NA8A 3W23A 3R2GA 3DU0A 1OX4A 1Z44A 4XTIA 4IPJA 5T26A 4NX0A 2ZZ4A 2C15A 4UFHA 4H4IA 4DBEA 4JNMA 2CLEA 4HSNA 5HWJA 1KLZA 4CCDA 5CG7A 5AHEA 1FX6A 3M7WA 5AYXA 4N9CA 2E6YA 2A21A 3MYOA 2AAMA 2Y7DA 2HTMA 5U7SA 4Z0SA 1WXJA 1QAPA 3L0KA 1QR7A 2RHGA 2I14A 4A2SA 4MFEA 4O8RA 1K7XA 3N19B 1SO3A 4NVTA 1FDJA 1TRDA 4K7YA 4WY0F 3EWYA 4JX5A 4NT0A 1JRBA 3S9YA 1DJQA 3FJLA 4HKPA 2C6QA 4ZQPA 1TTJA 3GXPA 4WUIA 2WNQA 1ONRA 2VOMA 1KLYA 4NNCA 3G1FA 4QJ1A 5DBUA 4IQLA 1XBXA 1LRTA 3Q2DA 1XFBA 3C0JA 3MHGA 1KTBA 3IEBA 3NQMA 3KVLA 4PTNA 3WJSA 2NX1A 4LUJA 3G24A 4HNTA 4UCGA 3QF0A 3ZWTA 2RDUA 2QAPA 3C2FA 2O7SA 1YDOA 1CX9A 4UTTC 4O11A 3LV6A 4JX4A 3WJXA 1FY6A 2YXGA 3ABOA 4N9DA 4UTLA 5I3HA 4K37A 1BWKA 1K02A 3DHFA 3QH2A 1R2TA 1EIXA 3MYPA 4XUGA 3W2NA 3W73A 1J5TA 3GKFA 1L6WA 3O6YX 1PL9A 3W1QA 4AF0B 3HG3A 4HHPA 2E5BA 2DZPA 4UTMA 3L0NA 3DFTA 4FX6M 4OE7A 3KOFA 2A2IA 1TTPA 3BW4A 2WO5A 3TQ0A 3EWBX 5KITA 2ZTJA 2E5DA 4KWWA 3P61A 1Z48A 3QMTA 4N2YA 7TIMA 3KHJA 2C19A 3STGA 1OFQA 1THFD 1LP6A 3N9SA 3NQ7A 5L9FA 3GLCA 5D05A 5AC8A 3P84A 5D2VA 2WSYA 4C1LA 2TRSA 5C5YA 4MZ8A 5CSRA 4LC8A 1VLIA 5E1QA 1N7KA 1UBSA 2ATMA 1H61A 3G1DA 4MY1A 3RMJA 4E38A 5DN1A 3TA6A 3IGXA 3GDKA 3MP5A 4IX0A 4LRSA 5I3IA 2Z1BA 2CU0A 3M43A 4HNUA 3MMTA 3ANYA 1W5MA 4HNNA 2KZHA 1YXDA 3H53A 4JYDA 1X6UA 1F6KA 1FWSA 4M19A 4XKYA 1A5AA 4O12A 4RJEA 1KV5A 5K9CA 1J2WA 4XZ9A 1IGSA 3BGGA 2Y7GA 5G1TA 5EYWA 2BZNA 3GR7A 3OHIA 3ABQA 3QPYA 4O57A 4ZQNA 4TMCA 3SIZA 4AWSA 3KRUA 4WXZA 2P10A 3T7VA 2Y7FA 1VC4A 1RQEA 2FFCA 4JTTA 3THAA 1K03A 4AXKA 4MZYA 1UCWA 3PAJA 4LNYA 3FKKA 4WXYA 3CIXA 2ZRVA 3M1ZA 2ZRYA 1OK6A 3A24A 4ZMGA 5FF3A 3CLMA 3B05A 2VFGA 3RLVA 1TQJA 1QO2A 3FOKA 1UASA 4EWND 3FEMA 2ZZ6A 3LHVA 1ME9A 3TSBA 4Z08A 1W0MA 4NJHA 1L2UA 3I6RA 1ZAJA 4X2RA 4O16A 2GUUA 1TV5A 3G3MA 3DGRA 1NVMA 4O10A 3LCXA 3B03A 1XM3A 1OFAA 3S5YA 3P60A 3LBMA 3DZ1A 3NQAA 1IXOA 1K7EA 3QW4B 1W5OA 4UR7A 5KMYA 3FA5A 1LRNA 4BI6A 1H7PA 2V5BA 4O15A 2E6AA 2QCLA 3W7JA 3N2MA 5CSSA 5G4WA 2DZSA 2F84A 3GZ3A 1X7FA 2A6NA 3F03K 1G4TA 3TSMA 2H8ZA 2JKEA 2E1DA 4RX0A 3MWAA 5D02A 1YXCA 3NM1A 4Y9AA 3MBDA 4OGZA 5DY3A 4WOZA 1VQTA 3KVMA 3CTLA 3UWZA 1MSSA 1YTDA 1UUMA 1GT8A 2ZRUA 1OFBA 2QCDB 3FS2A 2J27A 3G0UA 1A5CA 4WOQA 3LXBA 2A5HA 2CZEA 3PSWA 2VFEA 1H7XA 3RLUA 4R34A 1TYGA 3WFAA 4DF1A 4UFMA 3EXRA 5BMWA 1LROA 4I7UA 1W3TA 3EKZA 1EP3A 3CPRA 3C52A 5D30A 3P7YA 4RCXA 5F4WA 1W5QA 3F4WA 3EX6A 1M5WA 3I7SA 2ZA1A 4I9AA 3UZ5A 1S3HA 3W22A 1QPNA 2ZDRA 3MHUA 2A6LA 3LERA 1AG1O 3QFEA 1DL3A 4MVAA 3I65A 1XUZA 4UTKA 3D0CA 2PC4A 4A22A 1OK4A 4G1KA 5SWUA 4JDBA 1G4SA 4W9TA 1FCUA 3W86A 4OV9A 2NX3A 3TJLA 1R2RA 1BWLA 2OX1A 1DQXA 2H6RA 4JTJA 4Z0JA 1A5BA 2FJKA 2PE4A 1T8XA 3DXIA 3A5VA 3BG5A 4S2CA 1PIIA 4UFIA 1WA3A 4GUIA 1YTKA 5LKYA 1EP1A 2ZA2A 2Y70A 4HPJA 5F2GA 1ML1A 1IF2A 3LCFA 4GUFA 1B4KA 4CLMA 1I4NA 1W8SA 3GYEA 5D37A 1TTIA 1GTEA 4LW7A 3TW7A 2YZRA 3VKJA 4B5NA 2QCEA 1F73A 2C1HA 1NFBA 1NAL1 4Q32A 4RR4A 4IX2A 1V5XA 4NJJA 4M7SA 3NL3A 3TW6A 3USBA 1BEUA 4FX8A 1DHPA 4CNNA 1F74A 1EA0A 3IVTA 4O18A 4X3ZA 1W37A 1NSJA 3OIXA 4NNBA 3FIGA 3DI0A 3PVFA 1N55A 3M16A 3FYOA 4PFMA 2UV8G 3Q58A 3WJZA 4CCCA 3S0CA 4NZJA 1VCVA 2JKAA 1RPXA 1OFPA 3W3OA 1ME8A 3NL2A 5AYZA 4ZQOA 4N4QA 1SW7A 1F6PA 3TFXA 4GJ1A 4GC4A 3TIMA 3PBUA 5AB3A 4J9JA 1FCQA 5EPDA 3H55A 2JKPA 2HS8A 4XWUA 4XBKA 1ZY9A 4JIQA 2DORA 4P2VA 3EWWA 3SR7A 1U5JA 4WJEA 3MUXA 5I3KA 2ABAA 4U4MA 5J5DA 1RR2A 1KTNA 5DCBA 1XUUA 1B4EA 2DU2A 4PEKA 4UR8A 5A8GA 2ATSA 4S1FA 1S5VA 3PF3A 3NM3A 3H54A 4TMBA 1DORA 3M41A 4TR9A 3LGEA 2ISWA 1T99A 4CCEA 1VH7A 3B8DA 3P8IA 1HTIA 3L67A 3LCWA 4MOZA 4N02A 3P5YA 4YMZA 5FEPA 5KSWA 4OQVA 3W7DA 3MW7A 3QQ0A 1EWDA 3G1VA 4JXCA 4O50A 1FDYA 2FPVA 4YCOA 2ZTKA 3L0GA 3FFSA 2ZA3A 3ZWSA 1EP2A 4ADTA 3HMJG 4JTSA 1SZGA 4FNRA 5K9XA 3FKRA 3VFLA 4UTTA 4LS2A 5TBOA 2VFFA 4ML9A 4BI7A 5FF2A 1DV7A 3SI9A 1AK5A 1LLZA 4K8EA 3ATZA 2NZLA 1PHQA 3S1UA 2QCNA 4IWWA 1TV8A 3W1RA 3NQ8A 4AHQA 4LVBA 3M5XA 3M47A 1RD5A 4PL1A 2TSYA 1TCDA 3PG8A 4UUIA 2OCZA 4QNEA 4NXKA 1M6JA 3S5OA 4A2RA 4P61A 1LCOA 1NF0A 2QF7A 2VXNA 1KM0A 4E2BA 1W3NA 2NWRA 5GVJA 3W74A 1LOSA 3RFAA 2QUUA 1RQHA 1ICSA 4ZVJA 3L21A 1WQ5A 1LBLA 3PBVA 1CI1A 4UTUA 3S1XA 4KFNA 3O15A 5EA9A 3W7PA 2YGYA 5CZ0A 2CLFA 3UXAA 3G0XA 1SFLA 3TKFA 2E6DA 5HR7A 2J6XA 4MY8A 5CKSA 2X16A 3B0UX 3P67A 3OG3A 2FIQA 5AOUA 3E96A 3UQNA 4MYXA 3W76A 4X9SA 2Z0IA 4ADSA 3S5NA 3BGJA 3M5ZA 4GUHA 3JS3A 1OYAA 3LLDA 3KAOA 2A85A 4N4PA 4JY8A 2VEIA 4RXFA 3LB0A 4FNTA 4WY0B 2YCEA 4JIPA 2QUTA 1EUNA 3CM4A 5D2TA 3TJXA 1IIHA 4H3DA 1H63A 1X1OA 1YPFA 2J24A 3C56A 2GOUA 4JTIA 2VC6A 2TYSA 3IGUA 1FWRA 4O1AA 5F1UA 5G2HA 1PV8A 4CNPA 3B4UA 2CLMA 5LNVA 1MEHA 1IXNA 4O0KA 2X2GA 3TMLA 3VE7A 1PCWA 5LHFA 2VEKA 5FEZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1V6T A;  3VYL A;  3FA4 A;  3G6M A;  4PB5 A;  3UWV A;  2YA2 A;  4M51 A;  2ZE3 A;  5E0C A;  3ARS A;  2BAS A;  4MM1 A;  2UY5 A;  4J35 A;  3VXG A;  4DNH A;  2XGB A;  1P5B A;  5LNS A;  1LOL A;  2YCI X;  4U31 A;  2D20 A;  1PKM A;  2FLI A;  2D2G A;  4C6J A;  4L1G A;  3GIY A;  2CZF A;  2AGT A;  2X0S A;  2JQX A;  4JKM A;  3FHQ A;  4NI8 A;  2RH9 A;  3ZST A;  4GXP A;  3UD6 A;  1TJ1 A;  2DZB A;  1WDR A;  2JFE X;  3HTW A;  4ZOB A;  5BNK A;  3CMJ A;  4GWE A;  3WO8 A;  4AY1 A;  1A5O C;  1UP2 A;  5EBA A;  3GNP A;  3HBL A;  2GPT A;  2CWN A;  4DO4 A;  6PTD A;  3AYR A;  4E8D A;  2CER A;  3ECQ A;  5BU9 A;  2BY3 A;  1SVD A;  1XLE A;  1NAR A;  3OP2 A;  3WK0 A;  1R47 A;  4DX3 A;  3FK4 A;  4M0X A;  4LU0 A;  1XIC A;  1XDM A;  3H2E A;  1E6X M;  1J8V A;  1HKW A;  1GQK A;  2Z1W A;  3TH6 A;  4IPI A;  3UWY A;  1A53 A;  1T96 A;  1W3L A;  1O66 A;  2W63 A;  1FH9 A;  3NQ2 A;  3DG7 A;  2FKP A;  1JPH A;  1TRI A;  3L7R A;  1R46 A;  4CN6 A;  3WLK X;  5JH2 A;  3W24 A;  4GX8 A;  5A6A A;  4GI9 A;  4GAB A;  4YU1 A;  2Y6Z A;  2GUB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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