2MAN | Genus

Total Genus 130

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	130
sequence length	302
structure length	298
Chain Sequence	ATGLHVKNGRLYEANGQEFIIRGVSHPHNWYPQHTQAFADIKSHGANTVRVVLSNGVRWSKNGPSDVANVISLCKQNRLICMLEVHDTTGYGEQSGASTLDQAVDYWIELKSVLQGEEDYVLINIGNEPYGNDSATVAAWATDTSAAIQRLRAAGFEHTLVVDAPNWGQDWTNTMRNNADQVYASDPTGNTVFSIHMYGVYSQASTITSYLEHFVNAGLPLIIGEFGHDNPDEDTIMAEAERLKLGYIGWSWSGNGGGVEYLDMVYNFDGDNLSPWGERIFYGPNGIASTAKEAVIFG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
publication title	High-resolution native and complex structures of thermostable beta-mannanase from Thermomonospora fusca - substrate specificity in glycosyl hydrolase family 5. pubmed doi rcsb
molecule keywords	PROTEIN (BETA-MANNANASE)
total genus	130
structure length	298
sequence length	302
ec nomenclature	ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date	1998-08-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2manA00

3CUJA 1UKPA 4PSRA 2WSKA 2XGBA 4P8UA 4TUFA 2W5FA 3ARTA 3WQ4A 2WKLA 4H8VA 3VINA 5CG0A 4HZ7A 2XGIA 4OOUA 4GZJA 2XJ7A 2VX6A 3VGDA 4AIUA 5BYWA 3AMKA 4HZ6A 2WZEA 1D3CA 3M46A 3AHYA 4MDPA 4L4PA 3BSHA 5DT7A 1HJVA 3VNZA 1GOWA 1P6WA 4YHEA 1E72M 1OD8A 1UQZA 1H0IA 1NARA 1LG1A 3VOCA 4D6DA 2CBIA 3SCSA 3WD4A 2ESCA 3CO4A 3KL0A 3A4WA 2VZOA 3ZJ7A 3B9DA 1UZ4A 4DUVA 4AZCB 2EEXA 3K46A 1TUXA 3AMGA 4PCSA 1WCGA 2WLYA 3WELA 3F5LA 3CZGA 1NWRA 4W93A 1V3HA 1HJUA 2YA0A 4P7QA 3K4DA 1LQ0A 3UETA 3VILA 1J0IA 4V27A 2ZXAA 3WH5A 2J62A 2CBUA 3AHXA 5GNXA 1NOUA 5I23A 2DH2A 2Z1KA 4GINA 3L4YA 3WNKA 1VEPA 1X1NA 1KWKA 1KFWA 2WLZA 2WK2A 1W1VA 3M6DA 3AHZA 2YOCA 1UD8A 3FHAA 4JHZA 3T09A 2VX4A 4H04A 1CECA 1VIWA 4QLKA 3SUUA 3ZR5A 4IISA 4U2YA 5TD4A 1CGVA 4AW7A 1EDQA 1PZ3A 1XSIA 2AOSA 1UKSA 3AHVA 4GQRA 2HISA 3TTYA 1OIMA 4V2XA 3W25A 4UZSA 1QNOA 4JHOA 1UKQA 1V6VA 4XB3A 1E43A 1GORA 3TTQA 3PZ9A 1UG6A 1UWQA 2CERA 1UR9A 2XSAA 3KE0A 3WIJA 1LL7A 2VL4A 1E4IA 4UZUA 2YLLA 2V38A 2PBGA 1E6QM 1VFOA 3WH9A 5CJ5A 3FAWA 2BY2A 1UWIA 4GI8A 3SCWA 3WDHA 1D7FA 2OSYA 1BLIA 5HXMA 3M07A 3U5YA 1V3MA 1KQYA 2V3FA 3ARSA 5E09A 2A3BA 4WSKA 1JYNA 4D6EA 2DEPA 4JFWA 2CPUA 1JF5A 3VIOA 1HJQA 4DUWA 5E0FA 3ZSTA 1WZAA 1J0KA 2F2HA 1JF6A 1J11A 1H09A 2QPSA 3T0BA 5A8NA 2GK1A 2YDRA 5LYRA 3AIQA 3ZSSA 3OBAA 5A2AA 1ZU8A 4W5ZA 2J79A 3K1DA 3VDAA 2QF8A 2XFYA 3MO4A 1V3LA 5D9PA 1GQJA 2YBTA 1KCLA 4CCEA 2VC9A 4UR9A 3UERA 3CZJA 1M7XA 1JXKA 2DT0A 4UCFA 2GJXA 1CTNA 1W2VA 5IHRA 4F9JA 1EOMA 3AIEA 1UR0A 1NH6A 3SUTA 1G01A 1GJUA 3MUY1 1ODUA 2XPKA 4D6IA 1UD3A 1ZL1A 3DC0A 5EMYA 4PMRA 2D0HA 3MUAA 1ITXA 1H5VA 3WQVA 4QP0A 5I6SA 4AYSA 1V6WA 1C7SA 4PMNA 4L4OA 1HKIA 1W9DM 3U7BA 4ZE4A 5DMYA 3BMVA 2WMJA 3HMCA 4HMEA 1OSEA 1EGZA 4JKKA 3CTTA 2ZUMA 1TA3A 3ZJKA 1VJSA 4P7RA 4CD7A 4E2OA 4W87A 4MB5A 1WKYA 3AIVA 3ARPA 1B3XA 4RL3A 2CCRA 3BXWA 3N9KA 4LQ1A 3N1AA 1EQCA 2J75A 2YDQA 4WIWA 1ITCA 3GNRA 1US2A 5HNNA 2WWDA 1TVNA 4ATDA 4AD2A 3PZUA 2GFTA 2G3JA 5EFDA 1D2KA 1UWSA 4JFVA 2XVKA 1ISXA 5EBAA 4AZHA 3WEOA 1IZJA 1V02A 1C8YA 1E1FA 5D4YA 3IANA 2W63A 1TMQA 3AS3A 4PMVA 4UQEA 3FN9A 1GJWA 1H0GA 2WBKA 1QPKA 1L8NA 3LPGA 3SURA 1JNDA 2ZUUA 3OLDA 2GSJA 1V08A 2VCCA 2VOTA 1JDDA 3W37A 2GVYA 3G6LA 1KR1A 2W66A 1W9PA 4UQBA 1YHTA 2YA2A 4XZWA 2XIBA 2BVYA 3WH6A 1JXJA 4AZCA 2FHFA 5A6JA 3OZPA 2GUYA 1JG9A 2CITA 3T0AA 3IJ8A 2VJXA 4CD4A 1XCWA 2PWHA 2VO5A 3GXDA 1B2YA 2CYGA 1HP4A 3VIIA 3RDKA 2WM0A 3CZ8A 1NP2A 2D24A 2J74A 2YJQA 4CVWA 4AD0A 3PTQA 2PI6A 5IDIA 3DHUA 3D5HA 3E1F1 6CGTA 2G4FA 1E6PA 1QNSA 1U30A 1XCXA 2W62A 3TP4A 1RP9A 3VGEA 1M03A 3GTNA 4PBGA 3QOKA 1ZS2A 2XM1A 5EB8A 2ZOXA 2WHLA 3CBWA 3CZEA 2G3IA 3K8KA 1ZBCA 7CGTA 2VZUA 4HU8A 1JI1A 4TVDA 3CH9A 3WQ6A 3OLGA 3U5UA 2YA1A 3CMJA 4NF7A 4PTXA 3GM8A 3AS1A 1H4PA 1K9TA 2WMGA 2WB5A 1K9FA 1V3IA 3QHNA 1KXVA 5A95A 5F7UA 3TTSA 1CXLA 2EBNA 2FHCA 2ZUVA 3GXMA 3ZIZA 3S2CA 1TFVA 1BVNP 3SCPA 5AYBA 3U57A 3LPPA 1SFSA 2F8QA 1JZ4A 1C93A 1U33A 1W91A 3CHFA 1QVBA 1NQ6A 4BQ4A 5CLTA 4WLCA 3NCOA 2NW0A 4W7UA 4QAWA 3QGVA 2VX7A 1G1YA 1UUQA 1W9UA 1QI0A 1XGZA 4EKJA 1EOKA 2JFEX 1ZBVA 2WMHA 2J8GA 4BCEA 3PZOA 4AMCA 3PZMA 4AC1X 1KB3A 5FL1A 2JIEA 4NSBA 4X0VA 1UR1A 4ZE5A 1JYVA 5I77A 1AMYA 5M5DA 1E6NA 4AEFA 4KWUA 1M53A 2J77A 2W4XA 2JF6A 3EDKA 1B31A 3O9NA 1UWRA 5A94A 4MNLA 4ACZB 3WENA 3OZOA 2PC8A 3WDJA 4HMCA 4TX8A 4WK9A 5I79A 1CXEA 4W89A 1Q6EA 3AZRA 2A3EA 2WZIA 1V6UA 4WKHA 3WNOA 8CGTA 3BAYA 4W7VA 3BC9A 1C7TA 5CQ1A 1XSJA 2J78A 3SCRA 4Z2JA 1RD6A 4UFHA 4RE3A 1KXQA 3B9AA 3EMQA 4J3VA 1XH2A 4UFJA 4EE9A 4QCEA 2WMFA 4LXFA 3DYMA 2GDUA 2EPNA 2VCBA 4CCCA 4D6FA 3LPFA 1BVZA 4GO9A 2WXDM 1F4HA 1CDGA 4D71A 2FH6A 2GK1B 1XH0A 3IK2A 5I0DA 1JFHA 3WF3A 3PTKA 4D1JA 2PBOA 3PZGA 4Q22A 3WMBA 2VZTA 5E6ZA 4CKQA 3MS8A 2XFRA 1XHGA 5AY7A 4AXNA 5I78A 1QHZA 2YBUA 1HJSA 2J7BA 3ZQ9A 2DT3A 3GH5A 2J7DA 1W1TA 4KRTA 3SCQA 5I5RA 1LF1A 3AI0A 3PZIA 4CUCA 5IFTA 1QI5A 5LA0A 2X09A 4MNJA 5BRQA 1XRVA 4OOZA 1KGUA 3WKZA 3AMDA 1MXGA 2D0FA 1B3WA 4S3JA 2JE8A 3GYCA 4LYRA 3W0KA 3RJXA 3RO8A 1QNPA 3BMWA 3WL0A 4CU8A 2J7CA 1HJWA 5JBEA 4AWEA 4H8UA 1Q4NX 4JL1A 2Z1SA 2QHAA 4HA3A 2CNCA 5D9MA 4Z2IA 2VT0A 4A4AA 1PAMA 2ZUTA 2DT2A 3RM8A 3U7VA 2CKRA 5HDRA 1K9EA 1JZ2A 3CUFA 3IAPA 4D6HA 1SR0A 4CGTA 5DO8A 3FNDA 4PCTA 4F79A 4Z2GA 1JZ8A 3PZTA 3WNMA 1VRXA 3MSDA 3WDIA 5KEZA 4HMDA 3L4UA 4W7WA 1W3JA 1M01A 1R8LA 4UQDA 1TVPA 1R87A 4X0NA 1CYGA 1GHRA 2DSZA 1H3GA 3AYRA 1JZ5A 3WFZA 4XV0A 2OLHA 1RPKA 5FKYA 4NRRA 4PMDA 1W9XA 3VM5A 1JFXA 2J4GA 1UD6A 4TTGA 4P8WA 5JIPA 1E6XM 1H41A 3WMSA 2QMKA 2DPEA 3EDJA 3AYSA 3BAKA 4Q7NA 1OT2A 4BS0A 4XUYA 1CXFA 1ISYA 2VNCA 2FGZA 2PF0A 2VZVA 3ARZA 3UR8A 1WAWA 1SMAA 3BH4A 1EDGA 5FCZA 4Z2LA 1OB0A 2J7GA 1ESWA 2E8YA 3UESA 4GI9A 1IV8A 2V3EA 3AIRA 5KZ6A 1JD7A 4ZXLA 2GJRA 2ZX9A 2ZUWA 1V6YA 3EDFA 1MVYA 3AS2A 1V0NA 2UY3A 3DHPA 2WPGA 3ZR6A 3BAIA 3WF0A 1B3VA 4GI6A 2G8ZA 1UA7A 2EPKX 3OLIA 1E3ZA 2NT0A 4W8LA 4C7GA 1CPUA 1X6LA 1LG2A 4KGLA 4UOJA 1ECEA 3WD1A 1EIBA 1JI2A 1LL6A 3OG2A 2BXZA 4ML4A 4H2CA 2WMIA 3TA9A 1QBBA 3VVGA 4U5IA 3PZQA 1B3YA 1BPLB 1WP6A 1RH9A 1XYZA 3WH8A 1VBRA 3WNPA 1KCKA 3AXIA 5JBDA 4ACYA 4D6CA 3FAXA 3GH4A 4HOWA 4P8VA 2VURA 2O9OA 1R85A 4AISA 3F4VA 1C8XA 4CU6A 5JUVA 1QI2A 1G94A 4MADA 4JKLA 4RE2A 4GZEA 2VVSA 1QI3A 3KWXA 4B9ZA 5BWFA 3CHEA 4ACZA 1GZJA 1Q6FA 3AOFA 3PZNA 5HOSA 4C7DA 4TVCA 5E0CA 1QW8A 3FHQA 3AIWA 4WF7A 3ECQA 1H2JA 4R5EA 1HL9A 2NT1A 3F5KA 2DSWA 3RPMA 3T2OA 2D23A 2VX5A 3TOPA 1E6ZA 2FHBA 2UWFA 2Y5EA 3L4ZA 3MV11 3OGVA 3WNLA 3ZT7A 2V3GA 1I75A 3N18A 2D1ZA 2WCSA 2X2YA 2VR4A 3MMDA 3N15A 5E6YA 2DT1A 4JKMA 3AIBA 3ZT5A 2D3NA 1HJXA 4PUDA 3OIHA 2CETA 1ISZA 1BYCA 2JEQA 2CEQA 2V5DA 4W85A 2CESA 4AZ5A 2DDXA 5FD0A 2RGMA 3A3HA 5DFAA 1B3ZA 1J0HA 3QR3A 2WSPA 2E0PA 2X1IA 1HF6A 2E9MA 1HIZA 4WJXA 2DQXA 3WY1A 2C8NA 1J18A 1DHKA 3ALFA 2W91A 4YHGA 2V5CA 3VD5A 2VRJA 4KH2A 5CPSA 5A8OA 5DF0A 2XWDA 1VAHA 4F9DA 3SCUA 1QNRA 3GXFA 1WE5A 2HVMA 1H11A 1EA9C 1JL8A 2WHJA 3VPLA 2WWCA 3EMZA 3WBAA 1E5JA 4GXPA 1SYTA 2WVTA 1GONA 4N0RA 5CGTA 2CHNA 1GPFA 1B30A 4PN2A 4TXEA 1NM9A 2PWGA 1DWIM 3PTMA 1WZLA 4KRUA 2JF7A 1GHSA 2YL6A 5C70A 3ALGA 5CPQA 2ZXDA 3IJ9A 4DM1A 5D9NA 2ZUNA 3WMCA 4CVUA 3AS0A 3WUFA 2XYLA 2BXYA 3OB8A 2X0HA 2VQTA 3ARUA 4V28A 1BQCA 2UY4A 3HJEA 3APGA 4CN1A 4LYQA 2WVUA 2PWEA 1BYDA 3J7HA 1CNVA 1VJZA 2QPUA 4WKAA 2E8ZA 1B9ZA 1GQIA 2XHYA 4RE4A 1UHVA 5A8PA 5A6SA 1EH9A 5HPCA 4D1IA 4MAZA 4BZYA 2D2OA 4F8XA 3CUHA 3RJYA 1CEOA 4JL2A 4B3LA 1CGXA 3VGHA 2ZX8A 1BG4A 3M7SA 3SCTA 1JYWA 1R86A 2IXVA 4KGJA 1PBGA 5FL0A 3OLEA 3WN6A 3FXYA 3CMGA 1OBAA 5A6BD 5GPRA 1NOWA 2WVVB 2B31A 1OIFA 4ZEPA 3NJ3A 1MQRA 1J10A 1US3A 4FLRA 3FY1A 3IAQA 4GZIA 1E6SM 1U2YA 3LPOA 1XSKA 3ZJ6A 4QCFA 1PJ9A 5M17A 5GQBA 4AEEA 1HKKA 3GZAA 5C71A 3DECA 4J3UA 5ABEA 2BHZA 2WC3A 3K4AA 1GOOA 3VIKA 2VR5A 3AICA 3BAXA 1WPCA 4AY1A 1PX8A 6TAAA 2O9RA 3ARYA 1G0CA 3CUGA 3VMNA 2OWXA 1CLXA 4NI3A 4U33A 5AYIA 3KEHA 3OGSA 1JIBA 4AZIA 2DSKA 1CENA 1X6NA 3MUIA 4NRSA 4W86A 1UH2A 4XZBA 4ATLA 3KZSA 1EO7A 1KXHA 3WH7A 1CXIA 5CXPA 5HPOA 1OGSA 1C8QA 1J01A 5I3DA 1VFFA 4FMVA 2DSUA 4UFIA 2JIWA 3SUWA 4CD6A 4UTFA 3W27A 4AD3A 3B9EA 5JBFA 4W8AA 1AQHA 2BS9A 4J7RA 3UR7A 4WKFA 1TCMA 2XUCA 3WD2A 1E4NA 5FOOA 2WMIB 4QLLA 3VD3A 4TTUA 1UKOA 3VIGA 2WCAA 2PWDA 4CN4A 2WW5A 2ZXBA 4AZ6A 4Z2KA 1JD9A 1V3JA 5HBFA 5DT5A 1HKJA 1OGBA 2JEPA 4CU7A 1VBUA 2DH3A 4HPGA 1FP9A 3WBEA 1I1XA 1C90A 3CHDA 4N42A 1BGAA 1E55A 3EYPA 2EO7A 2UY5A 3I3EA 4PEEA 2CBJA 1NWUA 2PB1A 1B90A 1JZ7A 2VMFA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3CUJ A;  1UKP A;  4PSR A;  2WSK A;  2XGB A;  4P8U A;  4TUF A;  2W5F A;  3ART A;  3WQ4 A;  2WKL A;  4H8V A;  3VIN A;  5CG0 A;  4HZ7 A;  2XGI A;  4OOU A;  4GZJ A;  2XJ7 A;  2VX6 A;  3VGD A;  4AIU A;  5BYW A;  3AMK A;  4HZ6 A;  2WZE A;  1D3C A;  3M46 A;  3AHY A;  4MDP A;  4L4P A;  3BSH A;  5DT7 A;  1HJV A;  3VNZ A;  1GOW A;  1P6W A;  4YHE A;  1E72 M;  1OD8 A;  1UQZ A;  1H0I A;  1NAR A;  1LG1 A;  3VOC A;  4D6D A;  2CBI A;  3SCS A;  3WD4 A;  2ESC A;  3CO4 A;  3KL0 A;  3A4W A;  2VZO A;  3ZJ7 A;  3B9D A;  1UZ4 A;  4DUV A;  4AZC B;  2EEX A;  3K46 A;  1TUX A;  3AMG A;  4PCS A;  1WCG A;  2WLY A;  3WEL A;  3F5L A;  3CZG A;  1NWR A;  4W93 A;  1V3H A;  1HJU A;  2YA0 A;  4P7Q A;  3K4D A;  1LQ0 A;  3UET A;  3VIL A;  1J0I A;  4V27 A;  2ZXA A;  3WH5 A;  2J62 A;  2CBU A;  3AHX A;  5GNX A;  1NOU A;  5I23 A;  2DH2 A;  2Z1K A;  4GIN A;  3L4Y A;  3WNK A;  1VEP A;  1X1N A;  1KWK A;  1KFW A;  2WLZ A;  2WK2 A;  1W1V A;  3M6D A;  3AHZ A;  2YOC A;  1UD8 A;  3FHA A;  4JHZ A;  3T09 A;  2VX4 A;  4H04 A;  1CEC A;  1VIW A; 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2MANA

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Chord Diagram

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