2NUWA

2-keto-3-deoxygluconate aldolase from sulfolobus acidocaldarius, native structure at 1.8 a resolution
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
MEIISPIITPFDKQGKVNVDALKTHAKNLLEKGIDAIFVNGTTGLGPALSKDEKRQNLNALYDVTHKLIFQVGSLNLNDVMELVKFSNEMDILGVSSHSPYYFPRLPEKFLAKYYEEIARISSHSLYIYNYPAATGYDIPPSILKSLPVKGIKDTNQDLAHSLEYKLNLPGVKVYNGSNTLIYYSLLSLDGVVASFTNFIPEVIVKQRDLIKQGKLDDALRLQELINRLADILRKYGSISAIYVLVNEFQGYDVGYPRPPIFPLTDEEALSLKREIEPLKRKIQELVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural exploration of the catalytic capacity of Sulfolobus KDG aldolases
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-keto-3-deoxygluconate/2-keto-3-deoxy-6-phospho gluconate a
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus acidocaldarius dsm 639
total genus 118
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.55: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate/2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2nuwA00
2X1RA 4FO4A 1VH7A 1Q6OA 4AF0B 4R7JA 4O18A 1J2WA 3P8JA 3LCWA 5AFDA 4FNTA 4LVGA 3DBPA 3L66A 4QM1A 3QEZA 3NA8A 4BK9A 4LS2A 4PTNA 2C15A 1T8XA 1P0NA 7TIMA 3ABSA 4ZVJA 4WOZA 1R2SA 3NM1A 3STCA 3QMTA 1H7NA 1HUVA 3W1TA 3MBFA 1C8VA 4LNYA 2I14A 1TTJA 1M7OA 5LNUA 4NJKA 1LOSA 1M5WA 4O4WA 3PG8A 2C16A 4ZQMA 4ZQRA 3NAVA 3SJ3A 3NEVA 1OYAA 3CLMA 4IQLA 5D02A 3NQCA 2DJXA 2FIQA 3R13A 2H6RA 4KWWA 1SW7A 2YW3A 4JDYA 1XI3A 2H90A 3NO5A 1RR2A 3C61A 1YDOA 2FPYA 1ICQA 3NYZA 1GVQA 2NXGA 2R14A 4CCEA 2ZCGA 1AW1A 2H8XA 3JRKA 4DF0A 5FEWA 2WSYA 1LBFA 4NJJA 3EKZA 3GXNA 1R46A 4LU0A 1ZJIA 3T4CA 1H7PA 1SUXA 2CLFA 2ZZ2A 4XKYA 4TU1A 3WK2A 4HPXA 1H7RA 1KTNA 1Y0EA 2VOMA 3ZWTA 1J5TA 3GDLA 4BI6A 1VCFA 5HQEA 3FJLA 5C54A 4GFSA 4O4VA 2QCNA 1TPB1 4JYDA 3LRLA 1LBLA 1TYGA 1ME7A 5LNSA 2NX1A 3GX9A 4NVTA 2E6FA 1OJXA 2Y7FA 4KFPA 4S2CA 1FWRA 2EPHA 3DGRA 2WNZA 4LV9A 6TIMA 5I3IA 1WA3A 3TFXA 3WK0A 2A0NA 5CSSA 3L0GA 1GVSA 4HKPA 1I8JA 3GDMA 1LZOA 1XKYA 1OX4A 3LV5A 3BW4A 2Y61A 1G4EA 3W7RA 3TQKA 2OX1A 3G1AA 4YMZA 2R8WA 3W1AA 4OBTA 3TH6A 3PBUA 5FEPA 2HS6A 1NEYA 1TCDA 5C5YA 5IM51 1H50A 1W5MA 3IIVA 5DY3A 1ZAJA 3P61A 2PURA 3TNOA 3EXRA 1QAPA 3G1FA 3S5NA 1Z41A 4R34A 4CNNA 3KFTA 4QNEA 3CM4A 3MUXA 1SSDA 2E5DA 1QO5A 1KBJA 4Z1AA 2WNQA 2KZHA 3KXQA 1KFKA 1FXPA 2E6AA 3SI9A 5CSRA 4RZ4A 1H62A 3M16A 4K6AA 3ABQA 3R8RA 2WPBA 4BF9A 2ZRVA 4JTHA 3Q94A 5AHIA 1M7PA 1NSJA 5FI8A 3M0ZA 1AW5A 4MJMA 4MZ8A 4JYFA 2DZTA 1K8ZA 4TMCA 1A50A 1KLYA 4E0CA 3M5VA 3MW7A 3RLUA 2A6LA 2QUVA 3N2MA 1ICPA 3S5OA 4HN4A 1ICSA 2V5LA 3GNDA 4PFMA 4RZ6A 3W2KA 1YXCA 3TDFA 1GOXA 1B4EA 2B7QA 3CHVA 4A29A 2VELA 3GIYA 1XBXA 1OF6A 4OQVA 1UBSA 1YTDA 3USBA 3S1XA 3C56A 1I2NA 1W54A 2QKFA 2X1TA 4OHQA 3THAA 4PEKA 1NF0A 1KFJA 3L0KA 2PE4A 4I7UA 3O8AA 3MHGA 3HGRA 4J9JA 3P74A 1TV7A 4UTKA 3EKLA 3O63A 1GT8A 2ZRZA 1LRTA 1LRQA 5HR7A 3UZ5A 2RFGA 4JS3A 1ZALA 3STGA 1EPXA 3W85A 1GVFA 4N02A 3LCLA 3LOTA 4IPIA 5BMWA 1CW2A 2CLIA 5CPMA 2I9EA 5C55A 2H3DA 1B3OA 4WQ6A 3C0JA 4O8RA 4RCXA 4IUOA 4O19A 5DN1A 3SZ8A 4IMEA 1O4UA 4JR5A 2OMAA 1K3UA 2ZYFA 1TJPA 4M7SA 5ABTA 3MI2A 1R2TA 1TRDA 3IEBA 4MLRA 3BLIA 2NXIA 3NPWA 5DBUA 2A2IA 4CQ8A 1YXYA 5EY5A 4YWIA 3LGEA 3EEGA 1SZFA 5DBTA 2QUTA 2E09A 1OABA 2F84A 1IGSA 2ZZ6A 4NNCA 4JIPA 3AO0A 2DORA 5DXYA 3HB9A 3TQ0A 1F6PA 3E02A 4Z0SA 4Q33A 3N19B 1SO6A 1HFBA 1QFEA 2PRHA 4JICA 3DFOA 3UZJA 1TQJA 3LRMA 4G1KA 4QNWA 4MIMA 3QFEA 1MSSA 2FQIA 2CLHA 3LCFA 1I45A 1F74A 5AYYA 1KFCA 4IMFA 1UJPA 5A5WA 4RX0A 1KM1A 1IXNA 4BWLC 3PUOA 3GDKA 3W7JA 5CZSA 3QMRA 2CLEA 3WJYA 3H55A 1JR1A 1JQXA 1AK5A 3PUEA 4JTLA 4S1FA 2JKAA 3B04A 3W7LA 3G1SA 1Q6QA 4MLJA 4PA8A 3W7IA 4PODA 2PC4A 3CQ0A 3MI6A 2ZZ3A 3I68A 2VEIA 2XN1A 3VNDA 3DI0A 4LRSA 4DPPA 2ISSA 4NXKA 4HPJA 3M43A 4ZMGA 5L9FA 1W0MA 1PHQA 1F05A 1FWWA 1ME9A 3QYQA 4RXFA 3HMJG 3UY7A 1BWLA 4WX2A 3BG3A 1H7XA 1PS9A 1R30A 5LNVA 4MJZA 5G2WA 3GDTA 1HO4A 3L0NA 5A8GA 4FEZA 3LHWA 4OGZA 3CU2A 2J9YA 1N7KA 4POCA 4TX9A 4M7TA 4Y90A 2WSQA 1PV8A 1LBMA 4JX5A 1A5SA 3DENA 4O17A 2ZFAA 3G0XA 1VPXA 1ADOA 1R47A 3UWWA 3IV3A 4XQ6A 1IIGA 3L5AA 3M6YA 3OG3A 3BO9A 3QJAA 1IXOA 4Z1BA 3E12A 3G22A 4XBSA 1FDZA 1U83A 1H1ZA 1WOAA 2QF7A 3LTPA 1D3HA 1H61A 3EX6A 2WSRA 3W1RA 1VS1A 3PB0A 4ZL1A 5TBOA 3S42A 2JK2A 3D0CA 4AH7A 3W7KA 4UR7A 1H5YA 3W07A 2TRSA 2J88A 5G2IA 3KX6A 4O50A 1H51A 3NXFA 2ATMA 3L2IA 3RLVA 5I3KA 1XDLA 2A7PA 4IMCA 5C6MA 2GQAA 2Y70A 2A4AA 4K39A 2V5BA 5FF7A 5IBXC 1JUKA 4Y6GA 4O1CA 3ELFA 1GWJA 1QNVA 3GKFA 4O1AA 4UR8A 3NQ7A 2FJKA 3UPWA 2ZDRA 4Q4KA 3W7PA 1YADA 2E6YA 3GYEA 3W1NA 3DHFA 2Y88A 2Z6IA 3LHZA 4MVAA 3C3NA 4IOTA 3PF3A 3T44A 5K7JA 3W1QA 4UFHA 1DQXA 3OIXA 1QMLA 1QO2A 4DELA 1RPXA 4AF0A 2C13A 4MUZA 3ZS4A 1B9BA 1K02A 3T55A 3M5ZA 2ZA1A 3TKFA 4OV9A 3LXBA 3R2GA 1EB3A 5EMUA 1SO3A 3L5LA 3HG2A 3UPBA 3NQGA 4JTSA 1VYSX 2H3BA 3WJXA 4O28A 4FNPA 3M47A 3R5EA 1S5WA 3UNDA 1TTIA 3RF9A 4ADSA 5EL1A 1UUOA 1DV7A 2JBMA 2A5HA 1DBTA 1KM5A 3EXSA 3N2XA 3C2EA 3LTSA 4GUIA 2J9ZA 1A53A 1SFJA 2QCMA 1EIXA 4DXVA 2DZPA 5HINA 3MP5A 3TSMA 3QSTA 5LKYA 2OT1A 5K9XA 3GAKA 4FIRA 2E5CA 4UNLA 1VQTA 2B0MA 1XUZA 1TRIA 1ZNNA 4N2YA 3W7EA 1VZWA 1VLWA 3SECA 2VFDA 5KZEA 2W79A 4ALDA 3MHUA 2J27A 5G4EA 3KOFA 5HWNA 5K2ZA 1C9DA 3W74A 2QJIA 1TPUA 3S9YA 3GAYA 4DO4A 3W7CA 4NXSA 5AYXA 3TROA 3G1DA 1ZY9A 2V2DA 3TCEA 1QOPA 3KVJA 4IGHA 5DCBA 3TAOA 4DO5A 4PCFA 1KM4A 2ZZ7A 4K38A 2GVGA 3W2UA 3GNNA 3SR7A 3HG5A 1K7EA 3DFQA 2QCCA 3PWAA 4WY0F 5F2LA 4TR9A 1LYXA 4LOCA 4L4MA 2BLEA 5AC7A 3PS7A 5DCDA 2UV8G 3C2RA 3A21A 3HQ1A 2GJLA 2WNNA 3L9CA 4BI5A 2C19A 3TXZA 3G0UA 3I7RA 3MMTA 3W1UA 3VFLA 1W1ZA 1TPVA 2NZLA 1YDVA 1DQWA 5TIMA 1SW0A 5K9DA 3W75A 1A5BA 3NL6A 3P82A 3K30A 4JD4A 3LCIA 3TSBA 3W1LA 1XXXA 3QF0A 1CI1A 3NL3A 1W37A 3NQVA 3NQ2A 1FBAA 3STEA 3NQEA 4Z1CA 5D2TA 2JKEA 5H91A 3MWAA 3G3MA 4HIBA 4WZHA 4LY8A 2X1UA 3OBKA 4Z08A 5E93A 3SY5A 5CZJA 4OE7A 5F1UA 4O1BA 3EWBX 5D04C 1KFLA 4WD0A 1XBYA 2YXGA 4YCPA 3IIXA 4JTEA 3KAOA 4JTFA 2VFGA 3TMLA 4E38A 1RVGA 1JCLA 4GUFA 1LOQA 3O6YX 3PC0A 4NX0A 1OK4A 1FY6A 2CLOA 3O06A 2YSWA 3PG9A 3OVRA 1Q45A 3N73A 3W76A 4ZQPA 3FKRA 3Q2DA 3TAKA 5BNKA 3A9IA 1IIHA 3FLUA 4GXMA 2ATSA 2YDAA 3O6DA 3LI0A 4A21A 4MZYA 3TFCA 2CLLA 5D38A 3RK8A 4FXSA 3QPZA 5D05A 5D2VA 3HF3A 4AMAA 4U28A 4AWTA 1F73A 3NM3A 3BGJA 1XUUA 4ORIA 4NQ1A 1FCQA 1H1YA 3LM7A 4O15A 2QDGA 5F2GA 1SU5A 2ZTKA 4MFDA 3CC1A 1D9EA 4ONVA 3S5ZA 3DKLA 3UWUA 3LCXA 3PR2A 5I3HA 2Q8LA 1GTHA 4FXRA 1VHNA 2QCDA 3G24A 3IVUA 4MYXA 4NJHA 3TJXA 2ZRXA 4OWGA 2X1SA 3B0VC 4BWLA 1FUYA 4PL1A 2A85A 4CCDA 3B0UX 4GUGA 1B57A 3MP3A 4O12A 3VE7A 3IGXA 3HBLA 2C1HA 1WOBA 3W86A 1SZNA 2QAFA 4HHPA 1GQNA 1F7BA 1OFEA 3HOJA 4Q32A 3CEPA 3MBDA 4IPJA 2R94A 3P80A 5KSWA 3H53A 3FYPA 4JY9A 3RNDA 2QCGA 4JNMA 3R12A 5CPNA 3W88A 1K8XA 2O7SA 4O54A 4FX6M 1E51A 3HJZA 4JXCA 2FPVA 4ZQOA 2QJGA 3W2JA 5LSMA 3PUDA 1GEQA 3ZFHA 1U5JA 3EWXA 3A22A 3S1WA 4EWND 3DXIA 2C6QA 2V2CA 1O60A 1YYAA 2V9DA 1XC4A 3P5ZA 3JS3A 3Q37A 4P61A 1QCWA 2JGYA 2PCQA 4N6FA 4DBEA 3VE9A 3DU0A 4LC6A 4MPQA 1TMHA 4UMAA 3B8DA 3UWVA 4NNBA 1AW2A 1BWKA 3SSJA 5DXXA 4HSOA 4Z1DA 3QW3A 3P8IA 1A5AA 3FYOA 3LRKA 4MOZA 2FLIA 3FEMA 5HJLA 5FF0A 3BG5A 3LLDA 4YCOA 1LLWA 2GQ9A 5C2XA 5K4XA 3LXAA 2OZ0A 4QAIA 1OX6A 5D03A 2C0AA 1SO5A 1IXQA 1D3GA 4JDBA 2DJLA 1GTEA 3EX1A 4NZFA 3CWNA 1HTIA 3HG3A 1QPQA 4UXDA 5IBXA 3LDVA 3T40A 2FDSA 2Y62A 2CZFA 3NL2A 3O05A 3SIZA 3I6RA 2QDHA 2JKPA 4AB4A 3NNTA 5U7SA 5I3GA 2RH9A 1X8FA 3NPVA 2E6DA 2J24A 2GOUA 4PC8A 1OVDA 5HWJA 4LUJA 3W1PA 1M6JA 3QRHA 3BGGA 5G1TA 1YPFA 5D32A 1MXSA 3L65A 1I2QA 3DZ1A 3RMJA 2YFOA 1G7VA 1W8SA 1EUAA 2QCDB 3CB8A 3OA3A 4LS1A 1G4PA 1RQBA 1MZHA 4QQ3A 2CLMA 3W7GA 4HSNA 4NZJA 4ZQNA 1OK6A 1R2RA 3PM6A 1OX5A 5LHFA 1JUBA 5EPDA 1W5QA 1QPNA 3KRZA 2Z1BA 2A6NA 3FA5A 2GQ8A 3HIJA 1V5XA 3I7QA 3UYCA 4N9CA 1I4NA 4LRTA 4AVFA 4K7YA 1ZFJA 1G67A 3G1HA 3GDRA 2G96A 3BLFA 4MY8A 3P67A 1WAUA 2VFEA 2NV1A 2NUYA 4KFNA 4EIVA 2ZZ1A 1SZEA 4FHAA 4IMGA 3Q58A 5D30A 1WQ5A 2Y63A 4K37A 4L4LA 4JTTA 3VI2A 1LCOA 1YLVA 3RU6A 5D09A 2YFNA 4JYEA 4LV4A 3KRSA 3EX2A 1FXQA 3IGUA 1SO4A 1KLZA 4AHPA 1VGAA 3LHTA 3UWYA 1ZHAA 1N55A 1AMKA 4ZZ9A 5D2WA 4YXGA 3V1PA 3CEUA 1W5OA 2DZWA 3F03K 3N9RA 4UFIA 3G8RA 4JIQA 2TPSA 4Z0JA 2WJZA 3N3MA 1KM6A 1I2RA 3W1XA 1FQ0A 4FNSA 1SPQA 1OFPA 2YPIA 6ALDA 3GXPA 3EWUA 4MZ1A 3UWZA 5AHNA 5I3JA 8TIMA 1PL9A 3G1VA 1KV8A 1VHCA 4A22A 1EWEA 3GR8A 4GBUA 3TE9A 4AEOA 3G18A 1DHPA 4O53A 2Z0IA 1Z44A 3B4UA 1EEPA 4UC5A 1WX0A 3P62A 3W7OA 2QCLA 2YZRA 1F76A 1JRBA 1EUNA 2DU2A 3PY2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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