2NUWA

2-keto-3-deoxygluconate aldolase from sulfolobus acidocaldarius, native structure at 1.8 a resolution
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
MEIISPIITPFDKQGKVNVDALKTHAKNLLEKGIDAIFVNGTTGLGPALSKDEKRQNLNALYDVTHKLIFQVGSLNLNDVMELVKFSNEMDILGVSSHSPYYFPRLPEKFLAKYYEEIARISSHSLYIYNYPAATGYDIPPSILKSLPVKGIKDTNQDLAHSLEYKLNLPGVKVYNGSNTLIYYSLLSLDGVVASFTNFIPEVIVKQRDLIKQGKLDDALRLQELINRLADILRKYGSISAIYVLVNEFQGYDVGYPRPPIFPLTDEEALSLKREIEPLKRKIQELVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus acidocaldarius dsm 639
publication title Biochemical and structural exploration of the catalytic capacity of Sulfolobus KDG aldolases
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-keto-3-deoxygluconate/2-keto-3-deoxy-6-phospho gluconate a
total genus 118
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.55: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate/2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2nuwA00
1VHCA 2TYSA 3CQ0A 4LRTA 1ALDA 4MYAA 3TAOA 1XUUA 1F76A 4WQ6A 1I4NA 4AB4A 4H3DA 1FBAA 2C15A 3TW6A 3FEMA 3PB0A 1W5QA 3EXTA 5HJLA 3UZJA 1R2RA 3LHUA 3FS2A 4HSNA 3S6DA 4JX6A 3HMJG 2FPVA 4HT3A 1MZHA 1EUNA 5AHFA 1XXXA 2GQAA 3UPWA 1SO6A 1R2TA 4L4MA 3UY7A 4UFKA 1JCYA 3P5ZA 3DGRA 2BWGA 3NQGA 1XKYA 3NQAA 3L5LA 3LRMA 3PY2A 4UTTC 1T99A 4FX6M 5L6UA 3LHTA 4FO4A 1H7XA 1KV8A 1OF8A 1R30A 3W7NA 5J5RA 1ICSA 4EVZA 4ZQRA 2NV2A 1H7NA 4Y90A 4XTDA 4M19A 1QO2A 2QUUA 2ZA1A 5HUOA 2DJLA 4Z08A 4IOTA 4GUJA 3PSVA 4M6QA 4IX0A 3W1XA 5BOOA 3F1QA 1Z41A 4Y6GA 2VC6A 1TB3A 1YDOA 4O14A 4JTKA 4IXHA 1YYAA 3I6RA 4OBTA 1LLZA 3MMTA 4LV9A 1ADOA 4DO5A 1MXSA 4ORMA 2CLHA 1KM2A 1ZAHA 1P0KA 2CW6A 3E9AA 3QPZA 3T78A 5E1QA 3W22A 3STCA 1IXOA 2NWSA 2ZZ6A 4LC6A 2Z6JA 5EYWA 3U6WA 1KFKA 2AQWA 4MLRA 3NQ8A 2V82A 1UJPA 4Q33A 4DEFA 1VLWA 1KTNA 4FNQA 4RZ6A 1HFBA 1H7PA 1LM1A 5E0KA 4PTNA 3TC7A 2WNZA 2C16A 1EWDA 3HF3A 8TIMA 3YPIA 2NV1A 3M7WA 5FESA 3TNOA 1FCBA 3BG5A 4O13A 1X1ZA 2TSYA 1SO4A 1TSIA 4JTLA 3VE7A 4K39A 4AWUA 2YW4A 4O18A 4QM1A 1MO0A 1I2PA 3C2VA 4O4WA 1VC4A 3BLEA 1Q6LA 3HPZA 1P0NA 2AGKA 3P67A 3HBLA 3THAA 1NF7A 5CGQA 1F6KA 4UFHA 3IEBA 3MHFA 3UD6A 3TU9A 2NX1A 1KLYA 4JYEA 1ML1A 3O05A 1SZEA 3W86A 1DKWA 3S0CA 1OK6A 1RD5A 3EWUA 1TPWA 3C6CA 1WA3A 6TIMA 4UIOA 3GDRA 1DBTA 1TRDA 4JX4A 3W7KA 1NF0A 3GAYA 3HGRA 4IQLA 2NXIA 2FIQA 4JEQA 3MP5A 2J88A 1I8JA 3HGSA 4NJHA 5ABTA 3BW2A 2J9YA 3NQMA 4RV8A 3NVTA 3TFCA 3H55A 3TW7A 4N9EA 2DZVA 3HOJA 1GVSA 4CCDA 3L2IA 5H91A 3M5XA 5I3GA 4EIVA 3W7HA 1H1YA 3W70A 3R2GA 1VCFA 2ZRYA 3C2EA 1RZMA 4A2RA 1M6JA 2ATMA 1YDNA 3IIXA 5AHMA 3QMSA 3ELFA 1SZFA 5FF4A 3G24A 1UBSA 5F2IA 3EWBX 3DHDA 3USBA 2ZYFA 1TPVA 3TV8A 2A6LA 4AH7A 1K8XA 1W3NA 4R33A 4MIMA 4BWLC 2J9XA 4U4MA 4NZFA 5I3HA 3UXDA 3M5ZA 4ZZ9A 4IGHA 1JUEA 4DPPA 5LNUA 3CWNA 2G97A 1C9DA 2DZXA 1KTCA 2ZZ2A 4FIQA 3TCEA 3GXTA 4RZ5A 3QPYA 4CLMA 3VCRA 4AXKA 2GOUA 2RH9A 5H2ZA 1IXPA 3NNTA 1K8ZA 3LBMA 5K9DA 4LS0A 3P81A 4HSOA 2QAFA 1DJNA 2YDAA 4O10A 1LDCA 3B8DA 3FYOA 4O53A 4UCGA 4Y96A 2HSAA 1SR9A 3OEXA 4UXDA 2I14A 2BX7A 3UNDA 1TO3A 1C8VA 3GX9A 3BW3A 1KM4A 1O5KA 1EPXA 4K8HA 4QQ3A 4BK9A 3OVPA 3LGEA 2VEKA 1FWTA 1GZGA 1H5YA 5CPLA 4S1FA 1RR2A 4YWIA 3H53A 5DCDA 1XBZA 3GAKA 2X16A 3NQCA 3TH6A 2DZUA 1FDZA 1PVNA 1GYLA 2ISVA 4ALDA 3W7JA 5FF2A 3W1UA 3PSWA 1TMHA 2CLOA 1QCWA 1L6YA 1U83A 2E5DA 3QW4B 1OF6A 3N73A 2DZPA 1P4CA 2V30A 4GXMA 4GJ1A 1QOPA 3CPRA 3W2NA 1RQBA 1P5BA 3DFTA 4JTTA 2FFCA 4UR7A 3BPWA 5BNKA 3CEUA 3JR2A 3HPSA 4OE7A 1O94A 1XDMA 1OFAA 4UFMA 1SUXA 1TRIA 2JGYA 3TMLA 2FB3A 2V5LA 1DL3A 4WZHA 3T7VA 1OK4A 5MHBA 2AAMA 3NA8A 1QPOA 1OJXA 4ORIA 1RV8A 1DV7A 3B03A 1IXNA 1W31A 2ZA3A 3LERA 4I7VA 4LY8A 5CG7A 4L4LA 2H6RA 4K7YA 4BI5A 4E2DA 2G95A 3P74A 4AMAA 2QEZA 2E77A 3UWWA 4PCFA 3W1QA 4CQ9A 3GIYA 1ICQA 4WXZA 1W0MA 3PULA 4PC8A 3LOTA 4M7SA 2QF7A 2ZTKA 1ICPA 2C3ZA 1W1ZA 2BXVA 3BW4A 3TX9A 5L9FA 3KAOA 4MY1A 2O7QA 4LVDA 2E68A 2X1TA 1YPFA 2P0OA 3IGUA 3F03K 3G0SA 3NPUA 1S5WA 1KM3A 2GQ8A 3G1XA 4MJZA 2E5CA 2CWNA 4RLIA 1OX4A 3WJWA 3N3MA 2GPTA 5K3VA 1H61A 3L66A 3C4UA 3S5OA 4X9SA 3P7YA 3EX2A 1TV7A 3IGXA 1LP6A 2H8XA 3I65A 2QJHA 5EBUA 3M9YA 4NNAA 2OMAA 4IMDA 4HN4A 4JTJA 2PRHA 4S2BA 5LSMA 2E6DA 2C13A 2FB2A 2ATSA 3IIVA 3W87A 2VEIA 1EP1A 2Q3OA 3IVSA 1OYCA 1SZNA 2V9DA 4MJMA 2WPBA 4O16A 3W7LA 3W88A 3W7EA 3CWOX 4ZQNA 4JTGA 4UTMA 1L6SA 5D2XA 1A5AA 2EKCA 4JS3A 2DZWA 2CZ5A 4PL1A 1VLIA 2H90A 4X2RA 3W1LA 2YZRA 4LRSA 4UNKA 1GVQA 1A50A 1WAUA 4I7UA 1W37A 3W1RA 4NVTA 1ZCOA 4NNCA 1XBVA 5AYYA 2X1SA 3TIMA 1OX5A 1KBIA 4YMZA 3UWVA 3E0IA 1LRNA 1TJRA 3GB6A 2CLEA 2X2GA 3O07A 5HWNA 1JQXA 3MHGA 3SGZA 1WOAA 1I2NA 1T0OA 1G6CA 1XI3A 3G1SA 3S5YA 2F84A 4UUIA 4CNPA 1OFRA 3G1VA 4ZQPA 1YTEA 1H60A 3KX6A 4MZYA 3UWYA 2NUWA 1P1XA 1GEQA 2ALDA 1EP2A 2WV8A 1EP3A 4UTWC 4KFOA 3UWZA 1OFQA 3FIGA 1JULA 3QYQA 5DBTA 1CI1A 5KZEA 2OT0A 3DKJA 3CLMA 3O8AA 3IRDA 3DXIA 2B7NA 3L5MA 4EF9A 5F2MA 4JR5A 3LCXA 4FXRA 3P8IA 3RF9A 4O4VA 1A5BA 4EWND 2NXGA 3L0NA 3A24A 1LROA 3CEPA 2J27A 3L5AA 1YXCA 4QIUA 5LNSA 2JKEA 3M43A 1F74A 2HTMA 5LGZA 2TPSA 2V0TA 3NL2A 1FY6A 3U8GA 2YCEA 1XC4A 3BV4A 2RFGA 2PRMA 3IVUA 2NUXA 3MWAA 4GUGA 4KKXA 1YXYA 1KM1A 3LCHA 4GBUA 1E51A 3I7RA 4MVAA 1OFOA 1TREA 1VCVA 1WXJA 1GTEA 2JK2A 2PCQA 3GXPA 2QJGA 3S8HA 3EWXA 3PF3A 4LC8A 4N9DA 4K38A 2Y88A 5LKYA 1FCUA 3G8RA 2EGZA 1Q45A 2QDHA 3E96A 5KZDA 1IIGA 1G7UA 1JVNA 3PR2A 3MW7A 3NL5A 3VFLA 3DZ1A 1FXPA 4YLWA 3EEGA 5G5IA 2I9EA 2Y63A 2YX0A 3RMJA 1RPXA 1UCWA 6ALDA 3BLFA 3L65A 1GJPA 4AVFA 3PB2A 4XKYB 2Y89A 4I9AA 2WNNA 1KFJA 5AN7A 4PFMA 3UWQA 5CPOA 1Q3NA 3MO7A 1OX6A 1TV8A 1MEHA 1TYGA 2QCNA 2WSYA 1I2RA 4RKAA 1FDYA 1ZJIA 2RDTA 3F4NA 5EKYA 1A5CA 1JRBA 2YYTA 5AFDA 5D32A 4CNOA 3C8FA 5EY5A 3WJSA 1FX6A 3S5NA 4JD4A 4WX2A 5C55A 4UFJA 3F4WA 3W84A 3G3MA 4GFSA 3T4CA 3BK0A 3GKFA 5K7JA 3W76A 1ZFJA 1I2QA 5F4WA 2VELA 4WXYA 4E0CA 3EKZA 1UB3A 1VPXA 5D09A 1W56A 1DHPA 4P2VA 5AB3A 5G2IA 3NAVA 2R14A 4O17A 2NUYA 2XN2A 3TAKA 3FLUA 4LVAA 4POCA 4BF9A 4O50A 2VFGA 3QRHA 2E5BA 4IMFA 3RNDA 1S5TA 3CT7A 3D0CA 1EWEA 1AW1A 3C2FA 3PUOA 3A23A 3TFXA 1LOSA 4AHQA 4HNNA 4YL2A 1NFBA 1PV8A 4OGZA 1HO1A 3LRLA 4O8RA 2BTMA 5FI8A 3OBKA 3PUEA 2YFNA 3ZFHA 2CLKA 3SZ8A 4FX7A 1YPIA 4IUOA 3PWAA 1XL9A 1TPC1 4QAIA 3QSRA 5C2XA 4JTHA 5CZTA 3U2OA 4A21A 2H3DA 4AF0B 3NQVA 3KRSA 4N6FA 4DPQA 3SECA 5EMUA 4N6EA 2BZNA 5I3JA 3LI1A 3P5YA 3PAJA 4XQ6A 4LVGA 4MKNA 2CLMA 2X1UA 1FWRA 3BGGA 3W1AA 3L0GA 3S5ZA 3CIWA 3P84A 3ZWSA 3W1PA 2A7RA 1IXQA 4Z0JA 3LCGA 2ISSA 5LHFA 1AW2A 1SFJA 2NWRA 2E6AA 3O1NA 3FKRA 1UASA 2A7PA 3DENA 2E6YA 3O16A 4NQ1A 3R89A 3NYZA 3NPXA 1Y0EA 2ZQ0A 2FLIA 1K3UA 2V81A 4TR9A 5LNVA 3QH2A 4JXCA 2C14A 4DXVA 1VH7A 1F05A 1L6WA 1JR1A 4AEOA 2B0MA 2D73A 1S5VA 2QR6A 4GC4A 2B7OA 4WY0B 1ONRA 4H6KA 1R46A 2RKXA 4CQAA 3VKJA 4O11A 1KLZA 2OJPA 3GXNA 5CKSA 3WK1A 4M6PA 4OQVA 4UNLA 1KBJA 5SWUA 3MBFA 3W7DA 1YADA 3B0PA 1T8XA 4LW7A 3STEA 5FF0A 1WBJA 2A85A 3R12A 4IX2A 4BR1A 2CZDA 3MBDA 2OZ0A 5K4ZA 3ATZA 4ML9A 2HS8A 3B4UA 4UTKA 3PBVA 3S9YA 3PVFA 3NQEA 1F7BA 4UTLA 3W3OA 1G4PA 2VEPA 5FF3A 1F2JA 4LVBA 3HJZA 1BEUA 2B7QA 2CLFA 3W7RA 4O1CA 3O6YX 5DLCA 1DOSA 3TQVA 3LRKA 1KM5A 4TMBA 3G1FA 1ZHAA 4Z0SA 1J5TA 2OCZA 3EXRA 5K9CA 4WJEA 2WKJA 3DU0A 2ISWA 2QUVA 2R94A 5K9XA 3W2JA 4MLJA 1JJKA 4C1KA 5KINA 3NG3A 3W07A 4MZ8A 3W6YA 3HGOA 2QCDB 2VFHA 3PBUA 1GVFA 3B06A 5AHNA 4WOQA 1VQTA 3MI2A 3EKLA 5G4EA 2NX9A 4FB7A 1BWLA 2Y7EA 1LLWA 4NX5A 3LDVA 4PA8A 3W7IA 1MEWA 2Y6ZA 1EIXA 3A9IA 3LTPA 2CZEA 4W9TA 5IBXA 3MP4A 3IV3A 1TCDA 4PODA 3MUXA 2FTPA 4RXFA 2A2IA 2ZZ5A 2X30A 4AHOA 3GDLA 1UUOA 2FDSA 1DVJA 5F1UA 1LRTA 3C2OA 1YLVA 5F4XA 2V2CA 3GK0A 2WNQA 2QCGA 4MFDA 1KFCA 1TPUA 3A21A 5DN1A 3MYPA 3M16A 3TJLA 1GYNA 3WJYA 4OV9A 2R91A 4E2BA 3M5VA 1EUAA 4LOCA 2G96A 4ADUA 2A4AA 1LRQA 4UTIA 3SIZA 3VE9A 4CNNA 4XKYA 2ZRZA 3TDFA 1GG0A 4DQWA 1LOQA 2FPYA 3M47A 3LI0A 4P61A 4TU1A 5D04C 1W5OA 3KOFA 3UZ5A 4OHQA 4H4IA 3HPXA 1XDLA 1N55A 1SU5A 2WQPA 4OWGA 3TE9A 2VENA 5C5YA 5HULA 2EHHA 2VXNA 3R5EA 2Q8LA 3ABSA 3W85A 2TMDA 1R2SA 2W0UA 2ZZ4A 4O0KA 1VGAA 5BMXA 2YYUA 1Q6OA 4XBKA 1B9BA 3L0KA 3GVGA 4O19A 4NJIA 2JGQA 4D2JA 2ZCGA 4UFIA 5I3KA 4CCEA 5A8GA 1KFLA 3MHUA 3EB2A 3NO5A 2Y70A 1MSSA 5TQLA 3IGSA 4Q32A 1OFEA 1QWGA 3SR7A 4NU7A 3S42A 1O95A 1W3IA 1DJQA 2A21A 1LZOA 4Y8FA 3ZR4A 3OIXA 3GNDA 4O1DA 1SO5A 4O57A 4NJJA 2C6QA 3L67A 3W7QA 4A2SA 4TMCA 3QC3A 3Q37A 5DCEA 3L9CA 4EF8A 1BKSA 2Z2UA 3N34A 4ZMGA 2WO5A 2JKPA 4JY9A 3BGJA 5AYZA 5D2VA 3I7QA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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