2NUXA

2-keto-3-deoxygluconate aldolase from sulfolobus acidocaldarius, native structure in p6522 at 2.5 a resolution
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
MEIISPIITPFDKQGKVNVDALKTHAKNLLEKGIDAIFVNGTTGLGPALSKDEKRQNLNALYDVTHKLIFQVGSLNLNDVMELVKFSNEMDILGVSSHSPYYFPRLPEKFLAKYYEEIARISSHSLYIYNYPAATGYDIPPSILKSLPVKGIKDTNQDLAHSLEYKLNLPGVKVYNGSNTLIYYSLLSLDGVVASFTNFIPEVIVKQRDLIKQGKLDDALRLQELINRLADILRKYGSISAIYVLVNEFQGYDVGYPRPPIFPLTDEEALSLKREIEPLKRKIQELVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural exploration of the catalytic capacity of Sulfolobus KDG aldolases
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-keto-3-deoxygluconate/2-keto-3-deoxy-6-phospho gluconate a
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus acidocaldarius dsm 639
total genus 114
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.55: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate/2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2nuxA00
3DFSA 3M5XA 2IQTA 4YCOA 4NXKA 3RF9A 1ZJIA 1OFEA 5I3GA 3F4NA 3B04A 4YCPA 4R34A 1AL8A 2V2DA 3UNDA 1VYPX 1TB3A 4NX0A 1H61A 4UNKA 3NO5A 4Z0SA 1J4EA 2VFEA 5KZMA 1M7OA 2YGYA 3OBKA 1X1OA 2I14A 4M6VA 1JCJA 1XDMA 1SSDA 2A5HA 5LNVA 5LGZA 4C1KA 3QW3A 5DLCA 2BSLA 3HG3A 2VEIA 4GUGA 2ZTKA 1LROA 2ZZ7A 3EWYA 1GJPA 3HJZA 1XXXA 4FO4A 3QH2A 3MMTA 4H3DA 2H6RA 1XUZA 2FFCA 4JTFA 3W83A 3MI6A 3C4UA 3TX9A 2G95A 3NDOA 4AHQA 3P82A 2FJKA 3EXSA 1DQWA 3WK1A 2P0OA 3LI0A 4HKPA 2I9EA 1AMKA 2VEKA 1PS9A 2P1FA 3R2GA 2QR6A 4N9CA 4ADUA 3TK7A 3W7PA 1YPFA 4ALDA 1IF2A 2DZVA 3W7LA 4UTIA 1TTJA 5F2MA 4ZQCA 1SU5A 3G3MA 3G24A 2G97A 2CW6A 2DJXA 4LVDA 2JGQA 4IX2A 2Y7EA 3P62A 5EMUA 1VLWA 1GOXA 1YXCA 2E1DA 4GFSA 2V2HA 1KTCA 4W9TA 3DKLA 4PEKA 3GNDA 1PHWA 3TH6A 1TPB1 1GG1A 1KA9F 3TDFA 1OK4A 5DELA 2VFGA 2EKCA 1TV8A 5FI8A 1MXSA 1D9EA 1SQ7A 3GIYA 4IX0A 2ZA2A 3WJYA 1W1ZA 3W1XA 4A29A 2HTMA 4NVTA 5AFDA 1IXOA 3W72A 1SO6A 1SZEA 3EX6A 4UFIA 4JTLA 3W7JA 3TUUA 2YPIA 3GZ3A 1ME7A 1P0KA 2A6NA 1O60A 3OIXA 4HNNA 4N9BA 1W54A 4HIBA 3LERA 2FQIA 2C3ZA 5LNRA 4KKXA 1T99A 3GDKA 3G1YA 3QM3A 5CZ0A 1OHLA 2FLIA 1I4NA 3PVFA 3KVLA 4M7TA 1F5ZA 3UWUA 3V1PA 3MHFA 5TIMA 4FX7A 3B0PA 3G1DA 4JDYA 1EP2A 4LS1A 2C6QA 3LBMA 4HSOA 3W1QA 1EX5A 1LYXA 3PM6A 3QYQA 2GVLA 1VS1A 3DFOA 4MJZA 2CLHA 1OFQA 2ZZ4A 2BTMA 3NEVA 4Y6GA 5A8GA 1TJPA 3LDVA 4YMZA 2J9XA 3A24A 4RCXA 3P61A 3HGOA 3C3NA 5G1YA 2W0UA 3BW3A 3KVMA 4TO8A 3VI2A 1YADA 4NJIA 5J5DA 2Z2UA 5FEWA 2OT0A 4GUIA 5BOOA 3TAOA 3PS7A 1GPWA 1HTIA 1C9DA 1JCNA 1WYIA 4MYXA 5AOUA 1RQHA 2Y88A 3F03K 4OE7A 4FNQA 4OGZA 2ZYFA 3JS3A 4EWND 4LT9A 1W5PA 2DZWA 2Z6IA 2Y7FA 3L0NA 2RDTA 5CZJA 3UYCA 3SR7A 2RDUA 2EHHA 4UC5A 2JKAA 4I7VA 4DQWA 1DJQA 3S1WA 1B9BA 4UFHA 4ORIA 1GT8A 3NL6A 3W2LA 1DHPA 5FEPA 2A21A 1ALDA 3LCWA 3WK0A 4FB7A 3QEZA 3W88A 3G3DA 5F1VA 3W7OA 2QUTA 1IXQA 1LM1A 3W1RA 1CX9A 1N7KA 3HGSA 5HR7A 4E38A 1A50A 3LHYA 1WOAA 4RJEA 3TFCA 2ZFAA 3S1UA 4JS3A 4O54A 2QUUA 3RNDA 3P8JA 2E09A 3B0UX 1EUNA 3SY5A 2NZLA 3PG8A 1EWEA 1LP6A 2C13A 5F1UA 3P60A 1ZY9A 4JTUA 1ICQA 3O6CA 4DEFA 4NJJA 4OT7A 1JRCA 3UWZA 4JN6A 3TNOA 4OV4A 3F1QA 4IPIA 1IXNA 1K8YA 3MYPA 1M7PA 4QNWA 2VEPA 5D09A 3OVRA 1TQJA 1GYLA 5FESA 1ZNNA 4PL1A 1G4EA 3FA5A 3GDMA 3G1AA 4X2RA 3PR2A 3W7QA 4YWIA 1Z41A 2GUUA 4DO4A 3VNDA 2YW4A 1ZALA 1I45A 4JTKA 2D73A 3E02A 4LS0A 4FXSA 1B4KA 3A5VA 1I2OA 2E77A 4UR8A 2ZA3A 3RU6A 1QAPA 4PTNA 3NZ1A 1QFEA 3I6RA 5FF0A 5H2ZA 4XQ6A 1Z44A 1TPC1 1G7UA 1EUAA 3FKRA 2ATSA 4K8EA 5HR6A 1HO4A 5I3HA 3FKKA 4MYAA 3CPRA 2X1SA 1XC4A 3TW7A 3A21A 4QAIA 2V82A 1NFBA 2R8WA 1GYNA 3CT7A 1RVGA 4JX6A 1DORA 3A9IA 1OX5A 2ZRXA 2A0NA 3W2MA 3STGA 3F4WA 3FJLA 1MO0A 1Q3NA 3GK0A 2QDGA 2XN0A 3MP3A 4XTDA 4XUGA 5BRBA 3EB2A 1JRBA 4QJ1A 1ME8A 3PULA 1SZNA 3S8HA 4IMFA 4O1AA 4AWTA 1H51A 4LU0A 3HG4A 1OFOA 3P80A 1OF6A 4KWVA 2P10A 4O16A 4DELA 4HSNA 3ATZA 3UXDA 3OA3A 1TO3A 3RLUA 4JTEA 3BW2A 3TA6A 4DO5A 1IGSA 3QPZA 4ZMGA 1EB3A 5U4NA 5IBXA 2WO5A 4O57A 2CZEA 1VR6A 5AHIA 3B05A 2E6FA 3OVPA 4DF1A 3ZFHA 2CLOA 4IMCA 3I7QA 3G8EA 5CGQA 1R47A 4BWLC 3MHUA 3SGUA 3CIWA 1ZAJA 4MZ1A 5DXXA 4M7SA 3ABQA 3LGEA 3WJSA 1Y0EA 1M5WA 3DFTA 3TROA 3BVJA 1NEYA 4N9DA 1WDWA 2LLEA 1XL9A 1QPQA 3EX3A 3W6YA 4LVGA 4NZJA 4UMCA 5HULA 4EVZA 5C54A 5LZLA 3PAJA 4YL2A 4NNCA 3TR2A 4AB4A 3LXCA 5FF3A 2QCDA 3UZ5A 1OFBA 1W37A 1MSSA 5D2VA 5G4WA 2NWSA 3AJXA 3IIVA 5I3FA 3L2IA 2V81A 2FB3A 1GEQA 4JTJA 3O8AA 4IXXA 1QDSA 3USBA 2QCFA 4AHOA 4FF7A 4N4PA 3H53A 3O16A 2HS6A 1G4PA 2O7QA 2DORA 4K7YA 4XBSA 3FFSA 1NF0A 5LSMA 4S1FA 3E49A 4HT3A 1TTQA 3E96A 4E2DA 4E2BA 3G1FA 4XWUA 4GE8A 3PWAA 3LRKA 4UUIA 3T44A 2QCNA 3TQ0A 3P7YA 3LCIA 2PC4A 3LXBA 4MLJA 3KX6A 1OFRA 1QPOA 1EA0A 1OFAA 2Y7DA 5KTLA 3HB9A 2C15A 4BK9A 4MY9A 2WSQA 2Q8LA 1YTDA 3NGJA 3KRSA 5F4WA 1I2NA 1FWRA 4NNBA 3PUDA 1L6YA 1I8JA 1J2WA 1TPUA 1D3GA 2RH9A 2VFDA 4RK8A 4UTJA 3TQVA 1TRDA 1T8XA 3FOKA 3SSJA 2DZSA 1NVMA 2OT1A 5J5RA 1W3NA 1F05A 1WXJA 3NNTA 4UTHA 1W0MA 4UFMA 2YFNA 3DU0A 6ALDA 4IUOA 2PRLA 3MJYA 3NL5A 1ICSA 3M5ZA 3EX2A 2HS8A 5EY5A 3DFPA 1UCWA 3IVUA 4QQ3A 2TMDA 5LNWA 1GG0A 1QPNA 2DU2A 2QCDB 1VH7A 4JTTA 3DBPA 4H4IA 1JQXA 3Q2DA 4LVAA 1THFD 4UTWA 3L0GA 3W7CA 4JYDA 3S1VA 4HPXA 1H62A 3LV5A 4MPQA 4JIQA 3KRUA 3T78A 1JCMP 5AN7A 2B7NA 3DXIA 1H63A 5KSWA 1DL3A 2Z1BA 3CQ0A 3W1UA 3WK3A 5AC8A 4M6PA 3SI9A 5HWMA 1O4UA 1TTIA 3BPWA 1WBJA 3L5AA 4P2VA 4M5PA 3W7EA 3QRHA 5D2YA 1R30A 4LC8A 3LHUA 4TMBA 1SZFA 3WFAA 1LORA 1TPEA 4LV4A 2VC6A 1JCLA 3IVSA 1TJRA 4N2YA 1GVSA 2RDWA 2YCEA 2JKEA 1KBIA 1PL9A 2NUXA 1GQNA 5D2WA 3FIGA 1GVQA 5CPNA 1OK6A 1G4TA 4Z1BA 3W87A 3LM7A 4A3UA 5DBUA 1C29A 5MHBA 1RQEA 1GVRA 4GWEA 3TIMA 1DJNA 1XKYA 5BMWA 3NQFA 2XN1A 4RZ5A 4AWUA 1HO1A 3NL3A 3QMTA 4RXFA 3B03A 2Y70A 3AO0A 4O28A 3FYPA 1Q6LA 3B8DA 3G1VA 3LV6A 4LW7A 1ZFJA 1MZHA 3TC6A 3HQ1A 5G5IA 1FCUA 3GDRA 1VYRA 1SPQA 1F74A 1KM3A 3LXAA 2YFOA 3Q58A 1P4CA 5D04C 4IQLA 4AVFA 4O14A 2WV8A 1WX0A 2CLEA 1FQ0A 3GKAA 5IBXC 2A85A 3V75A 2A4AA 3MW7A 2QAFA 4O8RA 2GJLA 3W85A 1YLVA 3TC7A 4JXCA 3G1XA 3BO9A 2GQ8A 4AH7A 1TIMA 1LCOA 3M41A 2X1UA 1KFCA 4OU1A 1V7YA 3U8GA 1WOBA 4MY1A 4CLMA 3BGGA 4UFLA 3C2EA 1KTBA 1X1ZA 3NG3A 5CZTA 3NYZA 3GNNA 4O11A 3W7NA 3FEMA 3MP5A 3W76A 3LTYA 4LRTA 4Y8FA 5C55A 1H7RA 1H50A 1K8ZA 2CWNA 4A2RA 3QMRA 5KITA 3PUEA 3UZJA 4JTHA 1HG3A 3SECA 1KTNA 2ISWA 2W6RA 3W74A 3NR0A 3NM1A 4UTTA 1C8VA 3DKJA 1T96A 1EP1A 3BG3A 2WKJA 3HG2A 2V0TA 1K7FA 2ZRYA 4L4MA 4UXDA 2JKPA 3T55A 1DBTA 2WQPA 4AHPA 3O07A 3C2VA 1BTMA 1KFJA 2GQ9A 4N4QA 4NJKA 4RX0A 1YXYA 3IGXA 1F2JA 2PRHA 5DXYA 3PY2A 5G2WA 2OX1A 1OG0A 1NAL1 5CG7A 2BWGA 4O15A 1I2PA 3R8RA 3LBCA 4I7UA 3W1NA 1A5CA 2OJPA 3QMSA 4S2BA 3P5ZA 2CZDA 1ZHAA 4NX5A 3FS2A 2QCEA 2C19A 1HFBA 1ONRA 4BI6A 3KOFA 3MP4A 3CIXA 4NZFA 3UWYA 3W7IA 1OX4A 1S5WA 4LRSA 3CC1A 2ZZ2A 3TKFA 4RZ6A 3DI1A 2G5WA 2AAMA 5DCDA 4JTIA 2BZNA 1SW0A 5HQEA 4DBEA 5K3VA 4CQ8A 3LLFA 5KZDA 1F76A 4ADSA 1LOSA 3NQ6A 2WOQA 1LRTA 4WQ6A 4PA8A 5DCEA 3O05A 4NXSA 1JQVA 1KM0A 4MZ8A 1VLIA 3PBVA 4O1BA 3VFLA 3S9YA 4A22A 3TXVA 1VQTA 1XBYA 2A6LA 3LRLA 4TMCA 3HF3A 1SW7A 4IWWA 1QOQA 4EF9A 5IM51 3N14A 2TRSA 1OFPA 4WD0A 3C52A 3N3MA 3UY7A 4EOUA 1QWGA 2ZRZA 2QCGA 2ZZ6A 1KM4A 1CW2A 3L5MA 4JTGA 4UTWC 1TQXA 1W3TA 1KM2A 3W2NA 1W56A 3R12A 1L9WA 1KLZA 1OVDA 3L9CA 2WNNA 2R14A 1KFEA 2QJIA 3SZ8A 2DZPA 4IMEA 2CU0A 5D2TA 1Q45A 3LTPA 4JIPA 3P67A 1RZMA 4Q4KA 1KFKA 2Z6JA 3G8RA 4Y96A 3SIZA 3EX1A 3GDLA 1OFDA 3OVQA 4UCGA 1KM5A 4Z1AA 1W5NA 4MLRA 1SUXA 3QFEA 1PE1A 1U5JA 4FX8A 2GVGA 1A5BA 4UIOA 1LOQA 3TV8A 2A2IA 2DP3A 2KZHA 3E12A 2EF9A 4MZYA 3NPWA 2Y63A 1FY6A 1EEPA 1JCXA 1TV7A 4PCFA 2NLIA 1FWSA 1I2QA 1OX4B 1JVNA 4WOZA 5FF4A 3WK2A 4JGDA 3CU2A 4B5NA 1TTPA 5A5WA 3M43A 3QPYA 1G7VA 4AEOA 1LDCA 3TCEA 1LBLA 1QMLA 2PURA 2A1YA 1PHQA 3QQ0A 1TMHA 3WJZA 1EWDA 1PCWA 4L4LA 2QUVA 3THAA 5LNUA 2X1TA 3M5YA 2J27A 1H7XA 1S5TA 1FWWA 2FIQA 1YXDA 1ADOA 4WX2A 2ISSA 4A21A 3QQ1A 2Y61A 4ZVJA 3EKLA 3RFAA 4CCCA 3L68A 3UXAA 1O95A 4S2CA 1B3OA 1JUBA 3HMJG 5TBOA 4ADTA 3C0JA 3IIPA 2V5BA 3UY8A 1TPDA 1FXQA 2V30A 4K8HA 2VKZG 4LWWA 2NXHA 1VHCA 4UTUA 1LRQA 4K36A 4JICA 2QJGA 4XTIA 5D33A 1FBAA 3JR2A 4NNAA 5EPDA 4TX9A 1UB3A 2VEMA 1H5YA 3W1AA 1TPVA 2DZTA 1TV5A 3M7WA 4Y9AA 1QCWA 1F7BA 3T40A 3LCGA 3NQMA 5F4XA 2Q8ZA 1XM3A 4O18A 2E5BA 2VENA 3HPXA 5L9FA 1QR7A 4OHQA 8TIMA 3PBUA 4UFKA 1Q6RA 2B7OA 2YR1A 5L6UA 4O12A 1KV5A 1L6WA 3G0XA 3LTSA 3W71A 4M6QA 2H8ZA 4WUIA 5K9DA 5HINA 4ICNA 2CZ5A 4KFNA 1LZOA 2A7PA 4UR7A 5C5YA 4LC6A 4KFPA 4JNMA 3CEUA 4X22A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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