2NUYA

2-keto-3-deoxygluconate aldolase from sulfolobus acidocaldarius in complex with pyruvate
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
MEIISPIITPFDKQGKVNVDALKTHAKNLLEKGIDAIFVNGTTGLGPALSKDEKRQNLNALYDVTHKLIFQVGSLNLNDVMELVKFSNEMDILGVSSHSPYYFPRLPEKFLAKYYEEIARISSHSLYIYNYPAATGYDIPPSILKSLPVKGIKDTNQDLAHSLEYKLNLPGVKVYNGSNTLIYYSLLSLDGVVASFTNFIPEVIVKQRDLIKQGKLDDALRLQELINRLADILRKYGSISAIYVLVNEFQGYDVGYPRPPIFPLTDEEALSLKREIEPLKRKIQELVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural exploration of the catalytic capacity of Sulfolobus KDG aldolases
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-keto-3-deoxygluconate/2-keto-3-deoxy-6-phospho gluconate a
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus acidocaldarius dsm 639
total genus 115
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.55: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate/2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2nuyA00
3TW6A 2Y88A 3TQKA 3VI2A 1SO3A 2E6FA 3M47A 3L5AA 2V5LA 3MBFA 3S5YA 5CPOA 1XKYA 4LV4A 2VFFA 3HB9A 2GQ8A 3NQVA 4IJBA 3BGGA 4IX2A 1RPXA 1QNVA 1K7EA 1R2TA 5D2XA 1H62A 1NAL1 4AVFA 5HMSA 5MHBA 3PUDA 3ATZA 1XBVA 4MIMA 5LNSA 4K38A 3W7MA 2KZHA 1DVJA 3S5ZA 2NV1A 5TQLA 2QAFA 1SZFA 1F2JA 3NQ7A 1I8JA 3HG3A 3GKAA 2GJNA 4GJ1A 1G69A 2OZ0A 3W2KA 1YDOA 5HR6A 4NJKA 5H2ZA 3HGJA 3R5EA 2E09A 1H7WA 4KWWA 1X8FA 1TPDA 2WNQA 3W2LA 3NQGA 3G1DA 2G95A 3NDOA 4MPQA 3G1VA 3UYCA 5AHLA 3KRUA 4GNJA 4OWGA 1FCQA 1H50A 1RR2A 3JS3A 5EPDA 2A6NA 1ZCOA 1LROA 1FWNA 4LUIA 5EY5A 3W87A 1PCKA 1R2SA 3FOKA 1AW2A 1G4EA 1ZENA 3O1NA 3GDMA 3NL2A 3ELFA 3INPA 3W7EA 1W3NA 1WOBA 2R8WA 1F6KA 1TREA 3TE9A 1OX4A 1KW1A 1KM2A 2B7NA 3P74A 2P1FA 3MW7A 4KWVA 1V7YA 2X1TA 2E1DA 1FWWA 5AOUA 3LOTA 2QUTA 3MI3A 4PFMA 2P0OA 4JTUA 2Y6ZA 3DXIA 4ZQPA 1X1OA 1FWRA 3B4UA 4RK8A 1ME7A 3NA8A 8TIMA 3FIGA 1W8SA 4Q32A 2DORA 1W5MA 2VEMA 3EXTA 3QMSA 3W1AA 2QKFA 2ZFAA 1W3IA 3QSRA 3DU0A 5E1QA 1YADA 1IXOA 4GXMA 1TTPA 3CLMA 3DBPA 4JTSA 1GVFA 1A5SA 3TR2A 3F1QA 1LM1A 4MLRA 3CU2A 3A9IA 2QCCA 5IM51 1SQ7A 3W75A 3LLFA 1QR7A 4UTTA 2ZRWA 1S5WA 2W79A 2PURA 5LNWA 4LW7A 3ABRA 1YTEA 1OFEA 1U83A 1X6UA 2XN0A 2QDGA 4O52A 3W1LA 1FQ0A 4N6FA 1F6PA 3MBDA 4HNUA 3QF0A 4AHQA 2X2GA 3Q2DA 3F4WA 5AC7A 1W5NA 2HTMA 4A3UA 4PCFA 5KMYA 4AB4A 2VFDA 1RVGA 4HKPA 1GQNA 4JTJA 1KFEA 5K3VA 2QCHA 3A21A 1DJQA 1WYIA 4A2SA 4JYEA 1TV7A 4DBDA 1XUUA 2Z6IA 3W7PA 3W22A 5KZEA 4IXHA 5FF2A 1G4TA 1EB3A 3S42A 1P1XA 1OYCA 2RDUA 3P8JA 4JNMA 1HUVA 5HUOA 2GVGA 3E49A 1G4PA 3MMTA 3QW3A 4HN4A 3I65A 4ONVA 4R7JA 3NQMA 1EWDA 1EWEA 4MY1A 5K9XA 4QJ1A 5CSRA 4I7WA 4MZYA 3S8HA 3CB8A 1ZJIA 5L9FA 1QOPA 4JDBA 4CLMA 4AF0B 2DU2A 3L5LA 4JYDA 4DF0A 4EF8A 5TIMA 1JUEA 1A5CA 3N2MA 1QPOA 1UUOA 2DZWA 3KAOA 5D38A 1A53A 1TPB1 3HG2A 3ANYA 1AL8A 5DY3A 3IIXA 1QAPA 2NXIA 4Y96A 3TC7A 4ADTA 1V5XA 4OU1A 3NVTA 2X30A 4IMCA 4H3DA 3C2EA 1VGAA 3HMJG 3C2OA 4PA8A 1L6WA 2PRMA 3M7WA 1W31A 1JCLA 1GYLA 3TXVA 1TPH1 2BWGA 3KRSA 4QNEA 3AJXA 3TV8A 2EKCA 4BI5A 1NEYA 1G4SA 1A50A 3GLCA 3IIPA 5BMXA 4O28A 4ADUA 3NQFA 3UWZA 1A5BA 2C3ZA 2XN2A 3V1PA 2VOMA 4IWWA 1LOLA 3W7DA 3DFNA 1XUZA 4N9EA 5G1TA 4E38A 2X1RA 1QO2A 3MI2A 4FNRA 3GDRA 3NPUA 3IIVA 5G5IA 1KM0A 1HFBA 3FS2A 2EGZA 2D73A 1EPXA 1ZFJA 3QC3A 5CZSA 3W7KA 2FPVA 1PIIA 3GR8A 3L9CA 1HTIA 2WQPA 4O1BA 3DKJA 1TRDA 3FYOA 1LZOA 3N9SA 1PCWA 3I68A 3IV3A 4YL2A 4MFDA 3O8AA 1OFOA 5HNRA 3GZ3A 1W37A 2ZCGA 1T8XA 5DCEA 1EUNA 4TX9A 1KM6A 3A5FA 3WJSA 1YXCA 2I9EA 2RH9A 4NX5A 3FYPA 2GVLA 2G97A 5DXXA 2J24A 2NLIA 1JVNA 2FLIA 1QWGA 5I3FA 4L4MA 4O8RA 1EUAA 3R2GA 1S5VA 4I7UA 3W73A 4YLWA 3RLVA 4NNBA 3HO8A 1TV8A 3C61A 3G1SA 3GB6A 3S1UA 1T99A 4QITA 4RZ5A 3R12A 3N2XA 3O15A 1JJKA 1X7FA 3LERA 3UWQA 3CHVA 3WFAA 3PULA 1P0KA 3C56A 3G8RA 5KINA 4FX8A 4IUOA 3MI6A 4UUIA 3UY8A 1W3TA 3L0NA 3M9YA 2JBMA 4YWIA 2HS8A 3W1UA 2NZLA 4JX4A 4PEKA 3LGEA 2J88A 5CPMA 3E12A 1VCGA 3GXNA 1EA0A 2X16A 2NWRA 4UTWC 3DZ1A 1P5BA 3H53A 4K39A 2QCGA 3PR2A 2VC6A 5KSWA 5C2XA 4N6EA 1VRDA 2Z1BA 3W83A 3S1XA 1OX4B 3HPZA 3P82A 2C14A 2DJLA 3Q94A 1D9EA 2TYSA 3M43A 1H7OA 5LHEA 4XKYA 3WK2A 5DCDA 3DFQA 3MYPA 1XC4A 3ZR4A 2W6RA 1FY6A 4JX6A 3G0SA 2GUUA 4I7VA 1ICPA 5CG7A 5C6MA 4X3ZA 3DGRA 4DEFA 1Q6RA 5AFDA 4Z0SA 4FHAA 4UIOA 4JTEA 3CPRA 3S5OA 3QJAA 4GUFA 1CI1A 2B4GA 3DFSA 2CFFA 1MEWA 3TNOA 4XWUA 3O6DA 1W5OA 1H7XA 1DQXA 4BWLA 3TAOA 2WNNA 1VCVA 2OX1A 1KFCA 3VFLA 1W56A 3NM3A 3NXFA 5DCBA 2V2HA 4CNPA 2EPHA 4JY9A 4M19A 1KA9F 5CKSA 1H7PA 3IVUA 3L21A 4MY8A 2CW6A 5KITA 1TMHA 4POCA 3BV4A 3T7VA 3TUUA 4NUWA 2ZZ2A 4NJGA 1UCWA 3C52A 4M7SA 3FA5A 4HNTA 3IEBA 4BF9A 1WBJA 5D2YA 3W7CA 4DPQA 1SZNA 1WXJA 2ISSA 3LTYA 1B3OA 4NZFA 4O53A 1ZY9A 4UMCA 3OG3A 2DZPA 3BPWA 3OVRA 4LVGA 1RQHA 2E5BA 3T40A 2CWNA 4LVBA 4LC6A 5FF4A 1L9WA 4TMCA 3MHFA 1W5QA 4QAIA 3B0UX 3QMRA 3W3OA 4MUZA 1KFLA 3SGZA 4ORMA 3KHJA 4QQ3A 3LBCA 3UXAA 2VKZG 2OJPA 3IVSA 5A8GA 3NOEA 5J5RA 3W07A 4LC8A 3EWZA 1PL9A 1XXXA 4O0ZA 2BLEA 1FWTA 3LTPA 2X1UA 5F4WA 4HSOA 4WY0B 4P2VA 4R34A 1WA3A 2XFWA 1LBMA 4PH6A 3YPIA 5K9DA 3EWYA 2JGYA 3NNTA 4JIPA 5CZ0A 3P8IA 1KM5A 5LNUA 3TA6A 5D2VA 3U6WA 3DHFA 4AF0A 2OCZA 4LS1A 1UUMA 3LCXA 1CX9A 2C19A 2QUUA 1QMLA 1GVRA 1NF0A 3GAYA 1W1ZA 1SSGA 2NV2A 3EWBX 3LLDA 2DZVA 2A6LA 2CZDA 4NXKA 2TRSA 5AHNA 2A5HA 2ZDRA 2X1SA 2A1YA 1F73A 3LXBA 1XDLA 1OX6A 1VJIA 1VS1A 1SW3A 1A5AA 1Q3NA 1HO1A 4FF7A 4U28A 4JTTA 4ICNA 3TU9A 4GWEA 1AW5A 3M5XA 4LOCA 5IBXC 2WO5A 2WSYA 4KKXA 1EIXA 3ATYA 2V2DA 3PSWA 3W76A 1Y0EA 4FNSA 5D04C 3SY5A 1GYNA 1SO6A 1NFBA 1QFEA 2Y63A 4ZQOA 5K4ZA 1XFBA 3QPYA 3VCRA 3PSVA 1L6YA 4DO4A 3L65A 4H6KA 4R53A 2GVJA 5CGQA 4JICA 3LXAA 3TXZA 4UTJA 2CLIA 2CZ5A 4Q4KA 2GJLA 2OMAA 1TPVA 4YCPA 2H3BA 3BG9A 5AYYA 4O19A 1VHNA 4O1CA 3STFA 4LUJA 4JDYA 3ZWTA 2CLOA 3LCLA 4FNUA 2VEKA 3THQA 4U4MA 5CZJA 5FI8A 1HL2A 4EVZA 1MEHA 2YDAA 2ZRXA 3GNDA 5FF3A 3NG3A 4UFKA 3HGOA 4OHQA 4Z1AA 2QCEA 3NL5A 1YDVA 3MHGA 4JXCA 4RZ6A 5EYWA 3QPZA 1Z41A 1MSSA 3W1RA 1Z48A 4WXZA 2ZRYA 4N2YA 3PM6A 3C6CA 3A23A 3MHUA 5DXYA 3W2NA 1SO4A 3NQAA 3Q37A 5I3JA 2F7FA 1ZAJA 4JX5A 3TCEA 5G4EA 3WK1A 2C6QA 4P61A 5U7SA 4LWWA 1R2RA 1XBYA 4WY0F 1NVMA 3S0CA 1H7NA 4BI7A 1T96A 3FKKA 4UMAA 2WPBA 1B4KA 1IGSA 4C1KA 2ABBA 2VELA 3GK0A 4XKYB 1H5YA 4HHPA 3G1HA 2JK2A 4O17A 3QQ1A 4QISA 1GG0A 3QFEA 5GVJA 3W84A 5AC6A 4IQLA 4I9AA 1UASA 2V5BA 5EA9A 4WQ6A 3C4UA 1L2UA 1AMKA 2FB2A 3VKJA 1IF2A 5D37A 4YMZA 4Z0JA 2VENA 5DBTA 4OT7A 1QO5A 3PC0A 3WJXA 3W1NA 1VLWA 4K6AA 3M5ZA 3W7GA 5K7JA 1ZAIA 7TIMA 1XI3A 3NQDA 1IIHA 2H8XA 3UWWA 2Q8LA 3ZWSA 4RCXA 1DV7A 1OF8A 1K8ZA 2B7QA 3WJYA 3M5YA 3F4NA 1PVNA 4ZL1A 4O12A 2VFGA 2Q3OA 5F2MA 1ONRA 3W1PA 4IOTA 2YYTA 3IRDA 4WD0A 3EX2A 1TPWA 5K9CA 3UXDA 4JIQA 3GXPA 3P60A 3LI0A 3UY7A 3DKLA 1M5WA 1H7RA 2Y89A 4UXDA 1Q6QA 2WV8A 4FNTA 3BG3A 3NEVA 1FWSA 3KVMA 3L67A 3HGSA 1SW7A 1J5TA 4XZ9A 2AAMA 3LXCA 3EX3A 3GDKA 3W7OA 2OT1A 1CW2A 4IMEA 2YW3A 1OX5A 3AO0A 1K03A 1TPFA 3G3MA 3OVQA 4WOZA 4DELA 1R30A 5U4NA 1LDCA 4K37A 2R14A 2J9YA 1FDJA 4Y9AA 3LHTA 3WJZA 4MY9A 4UTTC 2Q3RA 1GVQA 5F2IA 3VE9A 2A2IA 2BSLA 1KBIA 3MP4A 1OYAA 4J9JA 2YX0A 1WX0A 4HIBA 3PBYA 4AWUA 4O18A 5F1VA 3B0PA 1O95A 3THAA 4JTLA 4O15A 1JRBA 1NF7A 3STCA 2FFCA 3CT7A 4AH7A 1DHPA 1DORA 4UFIA 5D05A 1KTNA 4JN6A 4K7YA 3M5VA 4DQWA 1QPNA 4GUJA 4LS2A 2DZTA 3UWYA 4UTHA 3TJLA 4S2BA 5C54A 3HOJA 3TQVA 3LM7A 1KFKA 3HQ1A 3MYOA 1GTHA 4AMAA 1KM1A 3DI0A 4WY0A 2A7RA 3V75A 1ICSA 3W72A 1S3HA 1LOSA 2IQTA 4GE8A 4IGHA 4M6VA 1EX5A 1MZHA 5I3IA 2RDWA 4NJIA 1LYXA 4FNPA 5BMWA 1F74A 1BTMA 3UZJA 3W1XA 1JQVA 2QEZA 3QMTA 2H90A 2QCFA 3LCIA 5FEWA 2ZRZA 1TTQA 2QR6A 3A5VA 2YFOA 4QSHA 2WJZA 1S5TA 2ZZ1A 4UNKA 4RR4A 4FEZA 2VXNA 1UB3A 4O57A 1LORA 3KVJA 3DFPA 3W71A 3HGRA 2TMDA 4EIVA 2YXGA 1DJNA 3MO7A 4ZZ9A 2WKJA 2C18A 3BLEA 3KVKA 2G96A 2ZZ7A 4UTUA 1P4CA 4MFEA 4AEOA 4JTGA 4O10A 3LB0A 4O54A 1I45A 3OA3A 4NXSA 1JQXA 3SZ8A 3HIJA 3PUEA 3DFTA 3TDFA 4CQAA 3KXQA 3KRZA 4UC5A 1KTBA 1FCVA 2ZA3A 3G0UA 2V8ZA 3N73A 1SZGA 2ZZ6A 3W1MA 3W6YA 4NNCA 1TJRA 2V9DA 3RFAA 1H51A 1TPC1 5D02A 1R46A 1C8VA 2QF7A 2B7PA 1JCXA 1FXPA 4HNVA 3EEGA 4UNLA 3UWUA 1B4EA 2YZRA 3LHZA 2RKXA 2Y7FA 4A29A 2C15A 1LP6A 3NAVA 3U8GA 1KM3A 3S9YA 3TW7A 2R91A 3RU6A 5T26A 2NUXA 4PTNA 3P62A 1SUXA 1I2NA 2RFGA 4RX0A 2FIQA 1HO4A 1M6JA 1J2WA 3BO9A 1KV5A 3PUOA 3LV5A 5HQEA 3GXTA 1UBSA 1EP1A 1VQTA 1I2OA 2JKEA 5D33A 5BW6A 1VR6A 4N4PA 2ISVA 4O50A 3PG9A 1OABA 1KLYA 3MWAA 3RF9A 1TYGA 4LRTA 3CWOX 1IIGA 3GIYA 4AXKA 4CNNA 5J5DA 1OFDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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