2NUYA

2-keto-3-deoxygluconate aldolase from sulfolobus acidocaldarius in complex with pyruvate
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
MEIISPIITPFDKQGKVNVDALKTHAKNLLEKGIDAIFVNGTTGLGPALSKDEKRQNLNALYDVTHKLIFQVGSLNLNDVMELVKFSNEMDILGVSSHSPYYFPRLPEKFLAKYYEEIARISSHSLYIYNYPAATGYDIPPSILKSLPVKGIKDTNQDLAHSLEYKLNLPGVKVYNGSNTLIYYSLLSLDGVVASFTNFIPEVIVKQRDLIKQGKLDDALRLQELINRLADILRKYGSISAIYVLVNEFQGYDVGYPRPPIFPLTDEEALSLKREIEPLKRKIQELVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus acidocaldarius dsm 639
publication title Biochemical and structural exploration of the catalytic capacity of Sulfolobus KDG aldolases
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-keto-3-deoxygluconate/2-keto-3-deoxy-6-phospho gluconate a
total genus 115
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.55: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate/2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2nuyA00
3HBLA 3W1PA 4CCDA 1V5XA 3NL6A 3L65A 4RV8A 1KBJA 2QAFA 2TYSA 1D3GA 3W2LA 3BG5A 3E49A 3QC3A 4XZ9A 4LC6A 2A7PA 4MYAA 2A1YA 4A21A 1U5JA 2QJHA 3STCA 2ZZ3A 4FO4A 2LLEA 5D04C 2Q3RA 5G4EA 4O18A 1H62A 3MBFA 1ICPA 1TPUA 5F2IA 3MI3A 1IXNA 3NEVA 1QNVA 4LT9A 3GK0A 4PODA 3TXVA 5K9CA 2NXIA 1A5CA 4GUJA 4FHAA 1SO3A 1QFEA 2TPSA 3W7JA 1Z48A 5KZEA 3L9CA 3M7WA 1NSJA 4JYFA 2NX1A 3LCLA 1H7WA 2DJLA 5AYYA 4E38A 2Q8LA 3HB9A 2J27A 3M44A 2A21A 2ISSA 4MZ8A 2NUYA 3G1DA 3HG4A 3KVKA 4Q4KA 6ALDA 4RK8A 3TFXA 5D2XA 3T55A 4NJGA 4DF2A 4UMBA 3VE7A 1E51A 2QAPA 2ZA3A 4QISA 1ME7A 1KM6A 2CU0A 1OYBA 1Q6LA 1TPFA 3PULA 1FWNA 2BX7A 3B0VC 4Z1CA 3HO8A 1DJNA 1IGSA 3SY5A 5DBUA 5FF3A 1M7PA 3TK7A 3KRZA 2NWSA 4AXKA 4L4MA 1VC4A 5AC7A 2ZZ7A 2ZRZA 2ZTJA 3GZ3A 3P62A 4JYDA 4FX6M 2V81A 4N6FA 2FIQA 5AFDA 2RHGA 1H50A 5KINA 4NJIA 3L0NA 5CG7A 3TKFA 4QJ1A 1B3OA 2ABBA 5IBXC 3TJLA 2YCEA 1L9WA 1EB3A 3LTYA 1W5NA 1OHLA 3OHIA 3FJ6A 1FCVA 4O16A 4JTJA 3G1VA 3W86A 1QAPA 3PG8A 1TREA 4YWIA 3B0PA 4LUIA 1FWWA 1TPWA 3M6YA 1QWGA 1IF2A 3MP4A 4MUZA 1IXQA 4Y9AA 2QCGA 3R2GA 1KBIA 2Y6ZA 3G1XA 3O15A 1FQ0A 1KFJA 1GTHA 1GOXA 3EWZA 4K8EA 3ELFA 2E6YA 3EXSA 1G7UA 2H3DA 5HULA 3NQFA 3CIWA 1W5OA 3B05A 2ZBTA 3DKJA 3P84A 4ZQRA 1RQHA 2GJNA 3M16A 4N2YA 4O50A 5I3HA 3LHYA 3CT7A 5LNSA 2PCQA 2E5BA 3OA3A 1OFEA 4X3ZA 3U2OA 4JYEA 1OVDA 2J9XA 1KM5A 3W88A 3ZS4A 3THQA 2DZUA 2Y63A 3ABOA 1EUAA 1QMLA 3ABQA 5MHBA 3BW3A 3ANYA 3TCEA 5CSRA 1O5KA 2O7SA 3QSTA 4LS2A 3TAKA 5CKSA 3LLDA 3AO0A 1W8SA 3CIXA 2DORA 1Z41A 2WSQA 3QYQA 1R2RA 4ADUA 1WDWA 4O14A 3IIOA 1XKYA 3RU6A 4QQ3A 3W87A 4FX7A 3CU2A 3M47A 1TTIA 3LX9A 2QCEA 3LV5A 5C6MA 2NUXA 4XKYB 2V0TA 3SSJA 1TPC1 1GT8A 2PC4A 2TRSA 1SW7A 5H2ZA 3F1QA 3NO5A 5HR6A 1TPVA 4DBDA 3VNDA 1SFJA 3GDKA 2Z0IA 1XFBA 1JRCA 3GNDA 3NQDA 4M6VA 1SPQA 2QUVA 1NFBA 3IRDA 2XN0A 1EUNA 3FLUA 3U8GA 3FKRA 3N73A 3LCXA 1GQNA 2D73A 3A5VA 3E12A 3VFLA 1JCYA 3TQ0A 3UWVA 1JUBA 4UTIA 3NYZA 2H6RA 5TQLA 1G67A 4OHQA 4UNKA 3UY8A 4K36A 3PVFA 4ORIA 1Q6RA 1MO0A 1QPNA 3W2MA 4K6AA 3IIPA 1YXDA 3E9AA 4HKPA 2FPYA 4HIBA 2QJIA 3MI2A 4S2BA 1GJPA 3NDOA 3T7VA 4U28A 3S42A 1KM2A 4FNPA 1FWTA 2DZXA 4QNEA 1GYNA 3QMRA 3DBPA 1W5QA 2C6QA 2R91A 3L5LA 3PR2A 3UD6A 4HNVA 1HTIA 3EWWA 5HNRA 1H7NA 5K3VA 1YTEA 3G18A 3G0SA 4MFDA 3GLCA 3NGJA 3M5XA 3W7OA 5L9FA 3GAKA 1AW2A 4JN6A 1WV2A 3M5VA 1KFCA 1W37A 1DORA 3F03K 3O06A 4RCXA 3E0IA 1TV7A 1OYCA 4RR4A 3TJXA 3W07A 2RH9A 1GG0A 4MVAA 5D33A 3C2OA 3PG9A 1K3UA 1KM0A 4MY1A 4E0CA 2I9EA 4UFJA 1FXPA 1TPB1 2BTMA 1SR9A 3EX3A 1S3HA 3INPA 1IIGA 1PS9A 3L21A 1W0MA 5HWNA 3TX9A 2VFFA 3Q37A 3MHFA 2JK2A 3LHVA 3W7DA 3LXCA 5FEWA 1W5MA 4NNBA 1I2QA 4LS0A 4XUGA 5I3JA 1P0KA 3PBWA 4JXCA 4E2BA 3BK0A 1EWEA 3W1LA 1H5YA 1KTNA 5FF4A 5HINA 4CQ9A 3QMTA 1ZALA 1F05A 4ZL1A 3C61A 2Y7GA 3PBYA 4JR5A 4GUIA 3HMJG 2XN2A 4QAIA 3O16A 3SJ3A 1KLZA 3I7QA 4LV4A 4KFPA 2C15A 1OX6A 4WY0F 3TA6A 3DGRA 2QUTA 3SFKA 4ORMA 1OF8A 3ZWSA 4CNPA 2YW3A 3NQ2A 3LCFA 1OX4B 4XKYA 3LDVA 1IXPA 3BG3A 2GQ8A 3LI0A 3BVJA 2KZHA 2NV2A 1OFAA 3LBMA 4CCEA 1ZAIA 3A21A 2ISWA 1TV5A 2CLKA 2NXGA 1IIHA 4FX8A 3PS7A 1TQJA 3IV3A 2V5BA 1WXJA 1OFOA 2E5DA 3LCIA 2CW6A 4JY9A 3NL5A 2QDGA 3IVUA 3W70A 1FWRA 1TPEA 2QCHA 4IPIA 5L6UA 1VRDA 4Z0SA 3MP5A 1OX5A 5DXYA 1JUEA 2V8ZA 4QIUA 1XCFA 1N7KA 3L67A 2FPVA 3BO9A 1H60A 3HGJA 1F5ZA 3NOEA 2CZDA 4FXRA 1YPIA 5A8GA 4GUHA 3NVTA 3FS2A 4AB4A 3KX6A 2P0OA 1YTKA 4ZQMA 1FWSA 4MJMA 3B06A 3H55A 5D03A 3EX1A 4LVGA 4PL2A 2RDTA 1G4PA 3GDLA 3T4CA 2PE4A 1LORA 3BLEA 4UR7A 8TIMA 3W85A 2VOMA 5G4WA 1X1ZA 3GR8A 4EWND 3QQ0A 5BRBA 1VCFA 3CM4A 1Z42A 1H7OA 3IIXA 3OVRA 3C2EA 5DCDA 3N34A 1LM1A 3W7RA 1EA0A 1SSDA 3NQVA 1AL7A 3C6CA 3QW4B 4A2SA 2YX0A 3LERA 1F6KA 1HFBA 1KM3A 5F2MA 5IBXA 1KLYA 4RZ5A 3SGZA 4DBEA 5KITA 2FJKA 1H7RA 1F6PA 3R12A 4NVTA 4MY8A 3C4UA 4FIQA 4BR1A 1Z44A 4ADSA 1TTJA 1BWKA 3DFNA 1UBSA 1KTBA 3W7PA 1OYAA 3RLUA 3HGSA 1TRIA 3BARA 4O0ZA 4UFIA 1FCQA 2B7NA 1LYXA 4ML9A 3N9SA 5HUPA 5C55A 3KRSA 3QJAA 3DFOA 3GIYA 2OZ0A 1FCBA 3RFAA 1SZNA 4IMGA 4TO8A 3W7CA 2ZA1A 1O5XA 1K8ZA 4UTLA 1YTDA 3IVTA 3UWQA 3QW3A 1X6UA 2G97A 4QSHA 5G2WA 2DZSA 3NPWA 4LNYA 1J2WA 1W3NA 4N9BA 5TIMA 1TPH1 5D2VA 1MEHA 4O52A 3QEZA 3S5OA 1KTCA 3A23A 3C56A 5AC6A 3FYOA 2HS8A 4NJJA 1WQ5A 3VI2A 1NVMA 3MBDA 4UFKA 3HF3A 1YYAA 5LNUA 4MPQA 4IUOA 3NQ6A 3PB2A 2V5LA 1FUYA 4S1FA 5J5RA 3UNDA 3GKFA 1SO5A 1I2NA 4O4WA 2DP3A 1JCNA 1W1ZA 2Y70A 4IMFA 5EA9A 3M5YA 4WZHA 4UTTA 1B9BA 3T40A 4UCGA 4JNMA 4ZVJA 1GVSA 3TMQA 1ML1A 3FA5A 3UZ5A 5I3KA 1Q45A 5TBOA 1EP1A 1OX4A 3P74A 5K9XA 1LCOA 4BK9A 3QM3A 3MJYA 1KM1A 1R2TA 4CNOA 3A22A 1PCWA 3W6YA 1EPXA 1M6JA 2ZCGA 2HSAA 4OBTA 4O12A 4FB7A 4H4IA 4KFNA 4PC8A 3SZ8A 2QEZA 3L68A 5FEPA 1BEUA 4R34A 2Y61A 1A53A 4YLWA 3W7HA 1JCLA 2VEKA 3P82A 5LGZA 1LDCA 1VYPX 4GC4A 1TV8A 5LKYA 5K4XA 1F73A 3QZEA 4JDYA 4O8RA 4UNLA 4GWEA 4Y8FA 2ALDA 2GJLA 5FEZA 2CWNA 4NZFA 2EPHA 3TC6A 1SUXA 1DHPA 3F4NA 3W7IA 5DELA 3CQ0A 3G1HA 2AAMA 4JTSA 3TAOA 1NEYA 3LRLA 4YMZA 1P1XA 4JEQA 3ABRA 4POCA 2QF7A 1OF6A 3W7GA 2FB2A 3LGEA 3SR7A 1XBVA 3DAQA 1HG3A 3NM1A 1OABA 3O07A 3YPIA 4EF9A 1B4EA 1OFDA 4RJEA 1T8XA 4EVZA 3QRHA 3NQ7A 3HG2A 3DFTA 3GXNA 3HJZA 3KHJA 4GUGA 1DQXA 2VELA 2X1RA 3HG3A 2ZRYA 1TJPA 1TQXA 5BOOA 1AK5A 3K30A 1D3HA 4TX9A 3G1SA 3TR2A 5F2GA 4MJZA 3C0JA 3NZ1A 4ZQOA 3HPZA 2A85A 1H1ZA 3GVGA 1XC4A 5AC8A 1GVRA 2E5CA 3S9YA 3BV4A 3TSMA 1GEQA 2RDWA 1RQBA 3LXAA 3NQEA 1GG1A 5HWMA 1QCWA 4LW7A 2E6AA 3DU0A 3S8HA 3N14A 4I7VA 5F2LA 3W72A 1D9EA 1TPDA 3LOTA 5FI8A 1PV8A 1VHNA 3EXRA 3S1UA 4JIPA 3NL3A 3A9IA 1OK4A 4OU1A 1BKSA 4O19A 4MZYA 2Z6JA 1PVNA 5DY3A 4JTHA 5G5IA 4MYXA 3M0ZA 1B57A 4HPJA 3C52A 1A50A 3A5FA 3NPXA 4YL2A 3LHUA 4OE7A 3HGOA 4RXGA 3Q2DA 3JR2A 3EWUA 2JKAA 3DXIA 2C3ZA 2ZRUA 4O53A 4HNUA 1X8FA 3NNTA 3FKKA 4RZ6A 1LRTA 3TE9A 3E96A 4O1AA 4N02A 1OFQA 1ZENA 2V2DA 2PURA 4WJEA 4U4MA 1H63A 5C2XA 4NJKA 5AHLA 5CZTA 3TC7A 1XBYA 3PBVA 1YLVA 2WOQA 3TU9A 5C54A 4DEFA 4FNSA 4ONVA 2YYTA 3W2JA 5LZLA 4TR9A 5LGXA 3PC0A 4Y90A 2VEPA 1QOQA 5BW6A 3GDRA 2J9YA 1O94A 2BSLA 5DXXA 1ME8A 1LLZA 4CQ8A 4IQLA 4UTTC 3B8DA 1JVNA 3L5AA 4NNCA 4HNTA 1JRBA 2FTPA 2CLFA 4WOZA 1KFLA 4AWUA 5E1QA 3RK8A 4J9JA 3SECA 4BI5A 3P8JA 2C18A 1VGAA 3IVSA 4X9SA 1B4KA 5A5WA 1I2RA 3W1UA 1THFD 4TIMA 3NM3A 3IIZA 4K7YA 4WXZA 1BTMA 2I14A 5CPMA 3U6WA 5LNWA 5I3GA 1LOQA 5G1TA 5CPLA 3B4UA 1WOBA 3GB6A 2VFEA 2ZZ4A 1JQXA 3CPRA 3L66A 3PBUA 3UWUA 4NX0A 1TTPA 3TQVA 3DZ1A 1G4EA 3IGXA 3VKJA 3O6DA 2ZTKA 1PCKA 3B0UX 1H1YA 1JQVA 4FNRA 2A6NA 3B03A 2VKZG 5CGQA 2V2CA 3UQNA 2X16A 4WD0A 3S5YA 2ISVA 3C2VA 3NQCA 5G1YA 1ADOA 5HMSA 4Q33A 1WYIA 3USBA 4NJHA 4M19A 3STEA 3MMTA 3I65A 4N4PA 3MHUA 3TNOA 3DH7A 2C13A 4AWSA 1TMHA 2P10A 2NZLA 3GAYA 1F76A 4N9DA 1J4EA 3KRUA 2W6RA 5LSMA 4UFLA 4DF1A 4LV9A 5C5YA 1O60A 3UWZA 3KOFA 1LP6A 3LM7A 2ZDRA 2B4GA 2A0NA 2CLIA 3P7YA 4Y6GA 1CW2A 3M41A 3NQ8A 1KM4A 4W9TA 2CLMA 3CEPA 2A5HA 3LI1A 1SW3A 2X1TA 5AB3A 4LU0A 3I7RA 2C1HA 2B7OA 1X7FA 2RDUA 4R33A 5F1UA 1AW5A 1ZJIA 1YXYA 4DQWA 2GQ9A 1FBAA 2C14A 4NX5A 4JX5A 1GVOA 1YADA 3W75A 1QDSA 1F74A 5HWJA 1K02A 3S1XA 3RMJA 1VLWA 1NF0A 3LHWA 1PHQA 5KZDA 3S6DA 1P0NA 1EEPA 3RNDA 3OG3A 3T78A 4UTHA 5T26A 4O28A 3P5YA 2TSYA 3IEBA 4L4LA 2Q8ZA 1UCWA 1SFLA 2QKFA 2EGZA 1HL2A 5CZJA 2A2IA 3T44A 3TFCA 1JCJA 1DV7A 3N19B 2VC6A 5AHFA 3M5ZA 3HGRA 1FXQA 3N9RA 3UWWA 5CZSA 1UJPA 3ZR4A 3QPYA 1LROA 3B04A 3G24A 4JTEA 3TQKA 4AHOA 2EHHA 2CZEA 2A7RA 1XBZA 3HPXA 2XFWA 3NXFA 4EIVA 2VFDA 4AF0B 5I3IA 4IJBA 3IIVA 3PUOA 4IMCA 2P1FA 1T96A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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