2NW0A

Crystal structure of a lysin
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
GYIVDMSKWNGSPDWDTAKGQLDLVIARVQDGSNYVDPVYKDYVAAMKARNIPFGSYAFCRFVSVEDAKVEARDFWNRGDKDSLFWVADVEVTTMSDMRAGTQAFIDELYRLGAKKVGLYVGHHKYEEFGAAQIKCDFTWIPRYGAKPAYPCDLWQYDEYGQVPGIGKCDLNRLNGDKSLDWFTGKGEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The 1.6 A Crystal Structure of the Catalytic Domain of PlyB, a Bacteriophage Lysin Active Against Bacillus anthracis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PlyB
molecule tags Hydrolase
source organism Unidentified phage
total genus 71
structure length 189
sequence length 189
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-11-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2nw0A00
1SR0A 2Y8KA 1F4AA 2WSPA 4MJ4A 1HKMA 2GK1A 5JIPA 1WZLA 2WLZA 2XTKA 3BSGA 2JEPA 3CHEA 3SCOA 1E6NA 1FP8A 3VNZA 2WC7A 5EFFA 1KGWA 1OT2A 4EK7A 2Y24A 1V3IA 4MB3A 1QNSA 1VFUA 2V5DA 3BCFA 3RDKA 3MO4A 2BVTA 1EDGA 2XVNA 1M03A 2VX5A 2JF6A 4D6DA 4U33A 2VT0A 2D2OA 2G3JA 4QP0A 2GSJA 1WZMA 2OSYA 3TTSA 4JL2A 5CGTA 2CHOA 2WKGA 1CXFA 4JCMA 4UQDA 1QNOA 1V0KA 3ZJKA 1W3JA 3DYMA 3QHMA 4U2ZA 1JZ6A 3MV11 3SUTA 3WEOA 1EXPA 3A4AA 1B90A 3M7SA 2BFGA 2WHKA 1TR1A 1HL9A 1EO5A 4MDOA 2D0HA 1CENA 1KBKA 2VMFA 3MMWA 2DT1A 3T0BA 1US3A 3MSGA 4Q7NA 1BYCA 2W61A 1KCKA 3AMGA 3APGA 2XYLA 4H8VA 1E0VA 2A3HA 4D1JA 3FAXA 3ARVA 5I3DA 1FFRA 1PX8A 4MAVA 2WVSA 1M53A 4DWSC 3AYSA 5BCAA 1QI4A 1WPCA 1HNYA 2WZIA 2D24A 2ZX8A 5BXPA 5M03A 3W6MA 4URIA 3CZLA 3RJYA 1KXVA 1XD1A 1KXTA 4U5IA 2VVNA 4M24A 5LA0A 3WD3A 3AICA 1OM0A 3WD2A 5HOSA 1Q6GA 1JIBA 3SUSA 3AIWA 5I79A 5D4YA 2J7GA 3A4XA 5F7UA 1X6LA 2NT0A 1KXQA 3WH7A 5E09A 2BHYA 3EDFA 1GQJA 4LPCA 4MB4A 3WNNA 4PEEA 1V3KA 4AZHA 2JEQA 2FHCA 2YBUA 1BFNA 4DUWA 1FHLA 2ZICA 3CUGA 1NH6A 3NUKA 3PHAA 1MFUA 3SCVA 4QCEA 5BRPA 3MUIA 3THDA 3W29A 3LMYA 2VZSA 4ZENA 3AS2A 3W82A 3RILA 3WN6A 1VJSA 2YKKA 2CETA 1H1NA 4P8VA 4IPNB 1UD4A 4JKKA 1JFXA 3ARYA 3BXWA 1QNPA 4PMOA 3N1AA 1PX3A 3WUBA 3VX0A 2J77A 4XZWA 4HMEA 1CXIA 6CGTA 3ARTA 3TTYA 4AYSA 4GO8A 1EO7A 2A3EA 1VBUA 1HVXA 1QI3A 1FHDA 2BHUA 3WF4A 1E6XM 3PZIA 2Y2WA 1VFFA 3AROA 1VJZA 3RMEA 1QHPA 1VEPA 3VDBA 2VRJA 3OA5A 4ML4A 3VGDA 3CUIA 3WQ4A 3B8SA 4WLCA 3CZKA 2D3LA 3EMQA 5HPOA 1H4PA 3CUHA 4XV0A 3VX1A 4D6HA 4KRUA 2J4GA 2O9TA 3I3DA 1QVBA 4P7OA 2WHLA 1K9EA 3AHTA 3SCTA 3O2LA 1A47A 2DPEA 1HXJA 4HPHA 4DM2A 3VMPA 4JFWA 3WDRA 1W91A 1UG6A 5A6MA 1LLOA 3WKZA 1JNEA 1KB3A 4AXNA 1W9XA 1UA7A 5E0FA 3WSUA 1WCGA 1EHNA 2V3FA 2YL5A 3AHVA 1VB9A 4D72A 3ZSTA 1JG9A 3B9EA 4OOZA 1V3JA 1TVNA 5GNYA 2XFFA 2XGBA 1VRXA 4UOZA 2Y5EA 1G0CA 3DYPA 2JE8A 2VC9A 1JXJA 1J0HA 1NWTA 1R7OA 2AMGA 2E9MA 3VIHA 3AMCA 1CNVA 2VNCA 2XJ7A 1ZBWA 3BAJA 4PMVA 3ARZA 3OBAA 4PMNA 1EA9C 1E71M 3WDHA 1XH2A 3HU7A 3WF3A 5CQ1A 3QHNA 3WNPA 2YL9A 1V02E 1GHSA 1UKTA 4GI6A 3GYCA 2VVSA 1ISZA 2WMHA 3M07A 1OINA 2ZWZA 4MNJA 2F8QA 2W4XA 1TVPA 3CMGA 4M81A 1JYWA 1UD2A 1OCQA 1G01A 1U2YA 5AYIA 5IHRA 5C8BB 4JAWA 3VU2A 2YA0A 4JFTA 4CU7A 5FOOA 3FXYA 2WMFA 3W38A 3AIRA 3CIVA 1LL7A 2BY2A 1GQIA 2JIWA 3F5JA 3VDHA 4LYPA 3ZOAA 1JD7A 4U3CA 4FLQA 2VQUA 1B3WA 2GFTA 2VURA 5A2CA 5A69A 1H2JA 2W91A 1DWAM 1NP2A 1GQKA 1J0ZA 3AXIA 4AD0A 4WSKA 4N0RA 4HU8A 4OUEA 1KXHA 1HVQA 2EPKX 3GH7A 4M29A 3RO8A 4C7FA 4PMDA 4AD3A 5BYWA 1TUXA 1W2VA 1UWQA 1DWHM 3BAKA 1VF8A 3GXDA 2VX6A 2RGMA 3U7BA 2VCCA 1E6ZA 5A6KA 1SMDA 3SCWA 4S3KA 2BY3A 1CZ1A 1QNRA 3HN3A 1W1PA 1PJ9A 3NSXA 4UTFA 2YLAA 4B3LA 1D7FA 1JL8A 3AS3A 2OLHA 4Z2JA 5I5RA 1ESWA 2VTFA 3VIJA 3A47A 3ARWA 2XSBA 1MW0A 4S3JA 1VENA 1XD0A 2Q8XA 4E8CA 1BYDA 3VMOA 4HA3A 1KWKA 1TZ7A 2VCBA 1GCYA 3SCRA 1ZL1A 4U31A 3VDAA 3AS0A 5A6BA 1BG9A 3ARXA 1UKPA 3BLPX 2J7CA 3KZSA 1MFVA 2EBNA 5FCZA 2UY4A 4AISA 3K8LA 4PMQA 2F61A 5A8NA 1H49A 4TTGA 3IK2A 3VGFA 5FL0A 1GHRA 1ITCA 1MVYA 1TFVA 2D20A 1JAKA 1B3XA 2V38A 3MMDA 2J7HA 1V0MA 4CVWA 1J12A 3LPGA 2WK2A 3WNMA 1B31A 3GDBA 4UNIA 1EH9A 1E73M 1PIGA 4U2YA 3OLGA 1EGZA 1GQLA 3DYOA 2OWCA 1C7TA 3WDIA 1UH2A 1QOXA 4AMCA 1V6VA 1WB0A 1JD9A 2ZXDA 2E4TA 3FNDA 2A3AA 2FGLA 1LWJA 5D9OA 2X1IA 1E43A 1OGGA 5I78A 2J25A 1TG7A 1HKKA 1OIFA 1CGWA 3VINA 3WFZA 3VUPA 1J0JA 1JF6A 1MXDA 2DSKA 1R86A 4UFLA 2VR5A 2DEPA 2E8YA 3WL1A 2V5CA 1H11A 3F5KA 2V3GA 3NYDA 5C70A 1KR0A 1V6WA 2QPUA 3EDJA 4W5ZA 4P8UA 1HKIA 4ATWA 2FDMA 3RM9A 2WVVA 4KGJA 2W63A 3L4UA 4D6EA 1OD0A 1W1VA 4Z2LA 1UKOA 2CNCA 2YDRA 2AOSA 4U3AA 3U7VA 4B16A 4IM4A 1HN1A 4GIAA 2WW5A 3SCNA 1WZAA 4QLKA 2XFRA 3GNRA 1GPFA 3ZJ7A 3M6DA 3K8MA 4V2XA 1XCWA 1WZKA 3AYRA 4UQEA 3SCUA 3EDEA 3U5UA 1C8QA 3SIMA 1ZBVA 1MWOA 3OLIA 4B3KA 4Z2IA 3K4AA 1UHVA 4JFVA 1I1WA 3L4XA 4AC1X 3OZPA 4AZBA 2J75A 2W67A 1ZJBA 2E40A 2VUYA 2Z1KA 4ACZB 3W53A 1W9PA 9CGTA 5JIWA 3AZSA 4PSPA 1OGSA 5A2BA 1BF2A 1JXKA 4J7RA 1HX0A 4NF7A 4AIOA 4AZ7A 1NP0A 2WXDM 4MADA 5M17A 1E9LA 2E3ZA 1NOWA 1V3HA 1OB0A 2YA1A 4A3HA 1PBGA 2CBUA 3N18A 3I3BA 2DT3A 3W24A 4AEFA 1HJWA 1OT1A 5LA2A 1Q6CA 3ZR6A 1BSIA 4CN4A 4GQQA 5CXPA 1JZ5A 2ZUUA 3B9AA 3WUFA 4NRSA 1C91A 4D6CA 1CGUA 4FLSA 3RCNA 4PUDA 3CUJA 1OIMA 3AOFA 8A3HA 1C3FA 3WY1A 4PMYA 1ISYA 3W25A 4CN1A 3KL5A 4PYSA 2ESCA 5A6SA 4AZCB 3IJ8A 4RE2A 1UH3A 2G4FA 1H0GA 2XWEA 2QHAA 2WAGA 1KCLA 3QHOA 4OBRA 1QHZA 2EQDA 2BXYA 3UCQA 1UWTA 4MNLA 2PI6A 4W88A 2ZUTA 4F79A 2VZOA 3W81A 1ZJAA 5IFPA 1ISXA 2X0YA 3L4VA 1DWFM 1UR4A 3GM8A 4UOJA 1JNDA 3UESA 3BGAA 3A6OA 5FL1A 3WNLA 4JHOA 1OGBA 5JUVA 5EMYA 3NSMA 4WF7A 2PC8A 5ABFA 4YPJA 2WCSA 4LQ1A 4XB3A 1C7SA 7CGTA 2ZUWA 4MDPA 1HJXA 2YDQA 1XRVA 1W3KA 1F4HA 2QMKA 2BS9A 4QCFA 1GORA 1UYQA 2Y8VA 1W9UA 3N9KA 4CU8A 4Z2HA 1NQ6A 3WBAA 1J0IA 3UEQA 1R8LA 3TTOA 1G5AA 4A3YA 3AI0A 1N82A 4D1IA 2OYLA 1B2YA 2EPLX 2G41A 2V3DA 1CEOA 1RH9A 4KWUA 1JYVA 2YL8A 1MQPA 3WENA 3PZOA 1KQZA 4QDMA 1E3XA 4GQRA 4PTMA 1Q6EA 2ZUMA 2DIEA 3AQUA 1R7AA 2NW0A 3BAWA 1PIFA 4DUVA 3SUVA 5IDIA 3U5YA 1XH0A 7TAAA 3DHUA 4ZXOA 2E0PA 5CPQA 5HDRA 2CBJA 2PWGA 1JF5A 5I24A 5CLTA 4J28A 2YOCA 1M7XA 4BQ3A 4P7QA 2WB5A 3WBEA 5ECUA 3OZOA 3O9NA 3VMNA 4TUFA 3BAYA 3PZNA 3GH5A 3OB8A 2ZX9A 1E15A 3T0DA 3NJ3A 5FD0A 1BYBA 3MUAA 4PMRA 3GNPA 2X0HA 4TXEA 3RIKA 2YA2A 4MNKA 1J9YA 2WKLA 4X9YA 3SCQA 1UQZA 4JIEA 1D3CA 2PB1A 5EBAA 2E9LA 2XG9A 1BYAA 2EO7A 2EPNA 2VOTA 3ARQA 3RM4A 3IAQA 1J0KA 3VGHA 1UUQA 1XYFA 2GJPA 2QLYA 3BMWA 1UR0A 1EOMA 5I2UA 4BZYA 1XSKA 3AZRA 1O7AA 4ACZA 4MB1A 4IPLA 7A3HA 1E0XA 1PAMA 4J3SA 4UQ9A 1EOKA 3PZTA 1RP8A 3K1DA 4OIFA 1G94A 1RD6A 4UFIA 1J11A 2WVTA 2MANA 3GZAA 1V6YA 3VDCA 1KWGA 5CSUA 1FOBA 4HZ6A 3PZMA 4QAWA 3PZGA 3MMUA 2J79A 1HJQA 2UWFA 3RJXA 2J7FA 1WDSA 4XX6A 4CD6A 2JIEA 2CITA 6TAAA 3T0AA 5D9NA 3AHZA 4MTVA 3OG2A 3CGTA 4GI9A 5BRQA 2QMJA 1E6QM 1C8XA 4DWSA 2C8NA 5E0CA 5LA1A 1IZJA 4M80A 4DUXA 2DQXA 1BVZA 3TA9A 3WUEA 4B9ZA 3NDZA 2G3MA 2XVPA 3PTKA 4CKQA 4GZEA 1OD8A 4K68A 3FW6A 1VEMA 4JL1A 2WVVB 4AZCA 1KGUA 4KMQA 4W85A 2VCAA 1DWJM 2XGIA 4GKLA 3UG5A 3WNKA 1IZKA 4W89A 4AZ5A 2J78A 3W6LA 2WZEA 3MU7A 4PMZA 1I1XA 2ZX5A 2FH8A 4BCEA 2JF7A 2RGLA 5EB8A 5CLWA 1YQ2A 2YJQA 4PCSA 4UFJA 4L4OA 1UR1A 4MAZA 3L4YA 4M56A 3AZTA 3MS8A 3PZVA 5IXEA 1QBBA 3HJEA 3WD4A 2D0FA 2EPOA 3PN8A 3QGVA 2WSKA 4ZXLA 4X0NA 1ITXA 3BSHA 3ZMRA 2BVDA 2WCGA 1TA3B 2YL6A 4GXPA 1Z32X 5A8PA 1CGXA 4UQAA 4HTYA 1Y7VA 4QFUA 1O6IA 2XVLA 3AMDA 4M1RA 4TOQA 3UG3A 1LJYA 1HP5A 1JYXA 1GZJA 1LF1A 4KRTA 4NZCA 1E6RA 4W7UA 3WDPP 2CHNA 4EAMA 1W9BM 3AXXA 1W2PA 2OYKA 4E2OA 4UCFA 3W4RA 1LG1A 5A95A 4J3VA 4AW7A 1ODUA 2PWEA 3B9DA 1JAEA 5E6ZA 3WH8A 3FY1A 4J3XA 3CO4A 1GW1A 2W62A 5D8WA 1B1YA 2XM1A 4ZE4A 3DECA 3VTRA 1E3ZA 4W87A 4AD4A 1H3GA 3G6LA 2GUYA 2DH3A 3N17A 1CLVA 1B3ZA 3UERA 3FHQA 4AD1A 3GTNA 5A1AA 5GNXA 3WELA 4BS0A 2PBGA 1VFMA 1V6UA 3WUGA 2HVMA 3WDJA 1HF6A 2ZXBA 1FH9A 1QHOA 1R87A 1CECA 4H8UA 2DT0A 4D6IA 3AJ7A 2VX7A 2DDXA 2PWFA 3N04A 3AIUA 5A6AA 5GPRA 4D6JA 5TD4A 5DO8A 3WMSA 3N12A 1S46A 4TX8A 4OZOA 2BVYA 1E4NA 4YHGA 4AIUA 5I0DA 1E56A 2WVUA 2VRKA 4GPNA 1E6SM 4W8LA 1E70M 5CZKA 3D3AA 5ABFB 4H2CA 1JDAA 2C7FA 3GXIA 3ARRA 4X0VA 4RE3A 1BAGA 1JZ3A 2J7DA 5BXSA 1US2A 3VD7A 1JYNA 5C71A 5A2AA 1ISVA 4L4PA 3MUZ1 5A6BD 1QW8A 2VI0A 1ECEA 3UG4A 3SCSA 1AQMA 5DEZA 2PBOA 3J7HA 2BY0A 3VIIA 2EPMX 4F8XA 5ABHA 1VFOA 2DSUA 2WMJA 4FLOA 1JZ7A 5DFAA 4AEEA 1NM9A 3EYPA 4JFSA 3MUY1 1R85A 4WKAA 3VM7A 4MJ2A 2XM2A 3W0KA 1K6AA 1OWQA 1CGYA 2CKRA 1GOWA 1P6WA 3OGSA 1DWGM 1RP9A 4V28A 2XPKA 2GDUA 4V27A 3WD0A 1GOMA 4PCTA 2E9BA 2CKSA 1UD5A 2WANA 4CCCA 3AS1A 3NDYA 2XVKA 4F66A 1NWRA 1MW1A 1QI0A 1W3LA 4HZ7A 1G9HA 3VNYA 3VIGA 3VGEA 3VO0A 4AIEA 2CXGA 1ISWA 3KL3A 3CMJA 1X1NA 3ALGA 3ARSA 4F9DA 4BA0A 1WDQA 4HOXA 3DC0A 5DF0A 1GOOA 3WH6A 5A3HA 3EDDA 3S6TA 1JZ2A 1DHKA 1C8YA 5A94A 2D22A 1DTUA 4P7LA 1UWUA 1HL8A 1C92A 4CD4A 2A3CA 4UQBA 1B3YA 2D23A 3CH9A 3TP4A 5E70A 1L0PA 4LGXA 4PRWA 2YDSA 2ZUNA 3GBDA 1QI5A 3WMCA 3AHYA 4M82A 1GNXA 1LWHA 5DMYA 3VM5A 2J8GA 2A3BA 3JUGA 1U33A 4W8BA 4R27A 5LYRA 3UETA 4PTXA 2WBGA 3WF0A 2C0HA 1J0YA 3GXMA 3SURA 3WD1A 3L2MA 1TA3A 4QLJA 2BY1A 3BH4A 1E4MM 1CDGA 3PTMA 1QNQA 3AXHA 1ODZA 4MB5A 4UR9A 1QPKA 4W93A 2UY5A 1CXHA 1CXLA 1GOKA 4CU6A 2VX4A 1E72M 4TTUA 4CD7A 1VAHA 5JBDA 3F4VA 4J3WA 1XSIA 1UOKA 1Q6FA 1GOIA 1GJUA 1W32A 2QPSA 2ZE0A 3AIBA 3PTQA 3AMKA 3PZQA 1B0IA 1TCMA 2WMGA 5E9AA 1NWSA 5M3WA 3W28A 1E40A 5GQBA 4UFMA 2WPGA 1Q6DA 2CCRA 4HA4A 1PZ2A 1V03A 4CVUA 3ECQA 4DWSB 2WMKA 2QV4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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