2NZL | Genus

Total Genus 131

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	131
sequence length	358
structure length	339
Chain Sequence	RLICINDYEQHAKSVLPKSIYDYYRSGANDEETLADNIAAFSRWKLYPRMLRNVAETDLSTSVLGQRVSMPICVGATAMQRMAHVDGELATVRACQSLGTGMMLSSWATSSIEEVAEAGPEALRWLQLYIYKDREVTKKLVRQAEKMGYKAIFVTVDTPYLGNRLDDVRNRFKLPPQLRMKNFGLAAYVAKAIDPSISWEDIKWLRTSLPIVAKGILRGDDAREAVKHGLNGILVSNHGARQLDGVPATIDVLPEIVEAVEGKVEVFLDGGVRKGTDVLKALALGAKAVFVGRPIVWGLAFQGEKGVQDVLEILKEEFRLAMALSGCQNVKVIDKTLVR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Homo sapiens
publication title	Crystal structure of human hydroxyacid oxidase 1 rcsb
molecule keywords	Hydroxyacid oxidase 1
total genus	131
structure length	339
sequence length	358
ec nomenclature	ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date	2006-11-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01070	FMN_dh	FMN-dependent dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2nzlA00

1R30A 4GNJA 3B05A 3C56A 2VFEA 3LCWA 5AOUA 1ZY9A 4A29A 3LCIA 1ZALA 3TW7A 1KV8A 3TQ0A 1RV8A 1IXQA 3QPYA 5KITA 4EF8A 4LY8A 5H2ZA 3TR2A 1QPNA 3W1PA 1KFBA 2H3DA 2QCLA 2JGYA 3EX2A 2B7PA 2DZPA 1JCNA 1TTQA 3PF3A 3S9YA 4Y9AA 3UPBA 4DEFA 3SFKA 1QAPA 3O8AA 3OVQA 4A2SA 3HMJG 3NGJA 4AVFA 3W7EA 2P10A 4ML9A 4JY8A 1JRCA 3N2MA 1RQEA 5A5WA 3BVJA 4LTSA 5CZJA 2QUTA 4Y90A 1OG0A 3SW6A 1TMHA 4O28A 5D37A 5IM51 1FWTA 3CU2A 4IWWA 2QJIA 3G1FA 4R53A 3TU9A 3QYQA 4PH6A 2QUVA 3GYEA 2FB2A 1A5CA 1VYSX 2ZZ7A 1TPVA 4IMDA 3QQ0A 6ALDA 3S1WA 3TJLA 4UIOA 5K2ZA 4PL2A 4ZQOA 3O15A 4CQ9A 2NUWA 5G4WA 1DQXA 5C5YA 2R94A 4R7JA 2P0OA 1HO4A 4NJGA 3KXQA 3NO5A 1VCVA 2A7PA 4GJ1A 4LNYA 2WQPA 1M7PA 4NX0A 2FIQA 3NPWA 1GT8A 2HTMA 4JYEA 4KWWA 1TPC1 2R8WA 3DKJA 3R12A 1QCWA 1XC4A 3MHGA 5HINA 1FWWA 4UMAA 3ATYA 1DJNA 3GNNA 1SZEA 1OFBA 3R89A 3QMTA 3DZ1A 3PY2A 2CLFA 2DZWA 3CT7A 1N55A 2ISSA 3KAOA 3T40A 3NPVA 4IXHA 2W6RA 5CSRA 3GXTA 3LCLA 3NL6A 3B4UA 5BNKA 1SZFA 3P8IA 3LTSA 1VH7A 4CLMA 2C3ZA 4RZ6A 5BOOA 5CSSA 3MI2A 3GXNA 4FB7A 1OYBA 1TV8A 4ADSA 1W5NA 1H7OA 1DKWA 5DCDA 4IX0A 2X1RA 1UJPA 4QQ3A 2DZVA 4OT7A 5DXXA 1DQWA 3GB6A 4QSHA 3PBWA 5DCBA 1XXXA 3UWVA 4LUIA 4JTUA 4O4VA 3C8FA 1I8JA 3BW2A 3G3DA 5DBUA 1HO1A 1WYIA 3GR8A 4FNTA 2V5LA 2NX9A 3L67A 4PFMA 3QMRA 1LBFA 1D9EA 5K7JA 3NQEA 4D2JA 1YTKA 2YX0A 3R8RA 3L5AA 4GUHA 1OF8A 1JUKA 4JYDA 1I4NA 5E0KA 2TSYA 4JR5A 4XBSA 4RKAA 1U5JA 1UCWA 4DO4A 3LGEA 1OJXA 1ONRA 4EOUA 1FCVA 2O7SA 1SSDA 4BI5A 1SO5A 4O1CA 2A7NA 3W71A 3LTPA 1BWLA 3W1AA 4O12A 3M47A 3W7IA 1TJRA 1AG1O 2Y7EA 5DELA 2Y6ZA 4KFOA 1Q45A 5DN1A 1OX6A 2E77A 3KOFA 1EWDA 1BKSA 1LRTA 4QJ1A 4JXCA 5AC6A 4JTFA 3GDKA 1WQ5A 3M9YA 4L4LA 2ZRYA 4ADTA 1EP3A 3FYOA 1KFEA 3I7RA 3LCHA 1OK4A 1SW7A 4S2BA 5KMYA 2VEMA 3FLUA 2W79A 3N73A 2C6QA 2FPTA 1SZNA 1M5WA 2Y7DA 3LHWA 4AF0A 3NEVA 3M1ZA 3W76A 4AWTA 5CGQA 1WBHA 1GWJA 3DXIA 5FEPA 4LVAA 2OT1A 2PRLA 2RDWA 1SFLA 2WKJA 3CTLA 5LGZA 3GNDA 2B4GA 5EMUA 3C61A 3STFA 3E02A 4M6PA 1LOSA 4XTDA 4Z1AA 2Y85A 1KM0A 4H6KA 1LOLA 3QSRA 1H60A 5CKSA 1JCMP 3E96A 2ZA2A 2Y88A 2CFFA 5FEXA 2NX1A 3UYCA 4N9BA 3NXFA 4X2RA 4LVBA 3F03K 4JTEA 3W84A 4ORIA 2C19A 1VCFA 3Q58A 4E2DA 4MFEA 4BF9A 3QC3A 1WA3A 4HHPA 4JY9A 3GVGA 3TXVA 2Y62A 3PR2A 5KSWA 1XBZA 2QDGA 2GPTA 8TIMA 2R91A 5K4XA 3L0GA 4ZMGA 2DZSA 4H4IA 1ZJIA 2CZFA 5D32A 1R2RA 1ME7A 4BWLA 3IV3A 5D02A 3FKKA 3W1LA 1S5VA 3W86A 4E0CA 1L2UA 5HWMA 1F74A 3W73A 4YLWA 4N6EA 3KVJA 2C15A 1P5BA 2V0TA 4OE7A 1TO3A 3W2LA 2V2CA 1UB3A 3DGRA 4TIMA 1W5PA 1Z42A 1W31A 4AB4A 2D73A 1H7NA 5L9FA 2KZHA 4JIPA 1SR9A 2ATMA 2E5CA 4YMZA 3TH6A 4FNSA 1GG0A 3R2GA 3SY5A 2ZQ0A 4R33A 3H53A 3NQDA 2NV2A 3M5ZA 2DZUA 4MPQA 1IXNA 3ABSA 3A5VA 1G4EA 5KINA 2Z0IA 1GOXA 3C6CA 4BI7A 4AH7A 4GRSA 5LHFA 1H1YA 3IGUA 1HG3A 2ZTKA 3QFEA 1W0MA 3NR0A 1H61A 1K7FA 3GX9A 4DBEA 3CQ0A 4TMCA 5E93A 2JKEA 3UWUA 3RNDA 2WNNA 1J5TA 3BGJA 4NJHA 2QUUA 1EEPA 3BK0A 4LS2A 4DBDA 1TCDA 1DORA 1EUNA 2H8ZA 4FNPA 4OGZA 1GTEA 4UFLA 1Q6LA 5ABTA 5D2WA 3PG8A 1CI1A 1EIXA 4LVGA 2FJKA 2CZEA 3TAOA 1TREA 2YXGA 4FO4A 5CG7A 5I3HA 3RMJA 3ABRA 3M5XA 4OBTA 3W2NA 1W8SA 1DVJA 1TTIA 5IBXA 2FFCA 4K8EA 1GTHA 1KFLA 3FS2A 4NJJA 1FX6A 2QCDA 1B4KA 2Y61A 1WDWA 3G1VA 3CB8A 2Y7GA 1HL2A 1MEWA 1DHPA 3LI1A 4O19A 2YYUA 1B4EA 4M7SA 4O18A 2Y89A 1OK6A 3MO7A 1F5ZA 2CLMA 4TX9A 3OA3A 3B0VC 2Z6JA 4N9CA 3W7OA 1NAL1 3NQ7A 4MJMA 4Z08A 3TJXA 1TIMA 1I45A 5GVJA 3W1NA 3G8RA 4ORMA 3W85A 1AL8A 1AW1A 2V2DA 1JULA 3UXDA 1FXPA 3GDTA 4ZQCA 5FF4A 1TPB1 1VRDA 3NVTA 3NQ6A 3OBKA 1JCYA 4ZL1A 1TB3A 2PRMA 1Y0EA 4BI6A 1OYAA 3BG9A 3IGXA 2GJNA 3TIMA 4UFJA 1PIIA 3HGRA 1H51A 1G4SA 4O17A 3W7NA 1ZCOA 1N7KA 3KRSA 4H3DA 3SIZA 1QOPA 1OX4A 1I2OA 3L5MA 3PB0A 4JGDA 4BR1A 4IUOA 4XKYA 1FDYA 2A2IA 2ZA3A 4N02A 3QF0A 3MHFA 4WD0A 4JTJA 4HPXA 5I3GA 2DJLA 2QCDB 1FXQA 1XKYA 1S3HA 5FF2A 2EPHA 3LHUA 1OVDA 3NDOA 1FDJA 2ZZ2A 3IVTA 3G1HA 1SO6A 2GQ9A 2FDSA 1IXOA 5DBTA 1E51A 1FCQA 3BW3A 1XUZA 4A2RA 2QCFA 5AHLA 4UFMA 1FQ0A 5LGXA 3P7YA 3SGZA 4TU1A 2H8XA 1GPWA 4NJIA 1QR7A 1PCWA 3DENA 5EPDA 1I2QA 3O6YX 3W7PA 2DORA 3HJZA 3NQ2A 3U6WA 3W1MA 4JS3A 4Y6GA 2YW3A 3QJAA 2QCMA 2VXNA 3HF3A 3GZ3A 2ZZ6A 4HT3A 3HPXA 3ATZA 3I7QA 3TW6A 4BWLC 3A24A 3CLMA 3DBPA 3Q94A 1JCJA 4ZVJA 1SSGA 2EAWA 4PODA 4WQ6A 1GZGA 3M43A 3SGUA 2BZNA 1LROA 1R2TA 2DU2A 3LCFA 5J5RA 3E0IA 1AK5A 4PC8A 2AAMA 2Z6IA 3UWZA 2OX1A 1OX4B 4NX5A 3NM3A 4XKYB 4MIMA 3LCGA 3MI3A 1ZFJA 2RHGA 3P67A 5AYXA 1RVGA 2DZXA 1OF6A 3FJ6A 4UFKA 3FIGA 4O0ZA 5AHMA 1O60A 3KRZA 1TPUA 4O16A 1KBIA 2CU0A 1TRDA 1M6JA 2Y63A 1L9WA 3STEA 3G0XA 1VS1A 4EWND 3VE9A 3G8EA 4KKXA 2CW6A 3KVKA 5AHNA 4UFHA 1O94A 1YADA 1EWEA 4Q32A 5T26A 5BRBA 3TC6A 1HFBA 4UNKA 3QW4B 1OFPA 1ZHAA 1QO5A 1KTNA 2C13A 4N4QA 2TMDA 4GFSA 3LV6A 5CZSA 3C2RA 1TTPA 2CLEA 5D09A 1VYPX 1QFEA 3HG2A 4O13A 2YCEA 3TX9A 4UR7A 4CNNA 2Q3RA 4N9DA 5FF0A 1W37A 3LB0A 4O1BA 3EKZA 2YPIA 4TMBA 5I3FA 1K03A 1OFOA 3W9ZA 3RLUA 4GUJA 1MXSA 2CZ5A 3CIWA 4N9EA 3PG9A 1LZOA 3TA6A 4QM1A 3EXTA 1VGAA 5AHIA 2W0UA 3PM6A 3P5ZA 3BO9A 1C9DA 5LHEA 4NUWA 4XQ6A 4NNBA 3K30A 4N4PA 1IIGA 3EWUA 1XL9A 1L6YA 1F6PA 3M0ZA 5AN7A 5IBXC 2AQWA 2OJPA 2RDTA 3W2UA 4UTIA 4MLJA 5G2WA 2V2HA 4MYAA 4Q4KA 1ML1A 1X6UA 3RF9A 5FF3A 5TIMA 1UASA 4I7VA 4ZZ9A 4UTUA 1W3TA 4NXKA 1Z44A 1XBYA 4MJZA 5DY3A 2X16A 2GQAA 5K9DA 3IEBA 1LM1A 4POCA 3V75A 1G7VA 4JX6A 4GXMA 2JGQA 1JVNA 3PVFA 4LC8A 1T0OA 3W1UA 3S1XA 2HS8A 2ZTJA 1I2RA 1BEUA 1GQNA 1C8VA 5DXYA 4S1FA 4CCEA 1OYCA 4Z1BA 3HG4A 3DFQA 3KFTA 3EX1A 4LV9A 2G95A 3LLDA 3TQVA 4RR4A 5AHFA 1BWKA 1Q3NA 2R14A 3L5LA 3KRUA 1H7XA 3W70A 3RLVA 4Z1CA 3QM3A 1JUBA 1TPH1 3SZ8A 5K3VA 3N14A 5U7SA 3N2XA 3FJLA 1W5OA 5KTLA 2ZRVA 1KFJA 4FXRA 4GUGA 1TPDA 1XCFA 3FEMA 4OQVA 1ZAJA 3UY8A 2H3BA 3OVRA 5H91A 1F2JA 3M5VA 1NFBA 2V9DA 4RCXA 1GVRA 2E6DA 2QCHA 1JCXA 3G0UA 3QEZA 2VFIA 4L4MA 1VLIA 3GDLA 6TIMA 4HSNA 4K8HA 2Y7FA 3MBDA 1QO2A 3B03A 3LXCA 3TSDA 5LNWA 1OHLA 3MMTA 4JYFA 3EX3A 1KW1A 1RQHA 1XBXA 2A5HA 1DV7A 3IVUA 2X1SA 2YDAA 2J6XA 4NT0A 3W2MA 1XI3A 3W7JA 4NXSA 4OV9A 5C6MA 3PWAA 3ZR4A 4O0KA 4LWWA 3I68A 2CLHA 2OMAA 3EWZA 3W7MA 4UTHA 1DOSA 1KM3A 1RQBA 1S5WA 4LVFA 1KM6A 3G22A 2B7OA 4AHQA 4BK9A 3BLEA 1IIHA 1YDNA 2ABAA 4O14A 1L6WA 2A85A 4CNOA 3SSJA 3HGJA 5F2LA 3CPRA 1JJKA 3A21A 2BSLA 1SFJA 5E1QA 4IPJA 1Q6RA 3PAJA 1LBLA 4WY0A 1QNVA 5DY2A 3THQA 4K37A 2ISVA 5BW6A 2J9YA 1AW5A 4U4MA 2NV1A 3W3OA 3BARA 1EX5A 1WOBA 4DXVA 5AB3A 3RU6A 2JK2A 4FXSA 4NJKA 4NU7A 2FPVA 4WXZA 3LRKA 1H1ZA 4RLIA 4NQ1A 4O4WA 5D2YA 2E1DA 3LTYA 4EIVA 2ZFAA 1UUOA 1B57A 2BWGA 3W1TA 3W88A 3QRHA 2GQ8A 4CCDA 4MVAA 2YYTA 2E09A 3MW7A 3ABOA 4Q33A 1KTBA 3HO8A 3ZS4A 2QCEA 4J9JA 2WNZA 4CNPA 5L6UA 5AHEA 1DJQA 3A22A 4G1KA 3FA5A 4O8RA 3NQMA 3B0UX 3VI2A 3A5FA 3G1XA 3ZWTA 4UTJA 1KFKA 1H50A 3HG3A 4IMCA 1I2PA 1KA9F 1VQTA 4K36A 1SUXA 5U4NA 1S5TA 2LLEA 3VFLA 1GVFA 4LRSA 2A7RA 1A5BA 3CEPA 4K6AA 4NVTA 1LRQA 1G7UA 4AF0B 2DP3A 3NAVA 3M7WA 2WSYA 4WY0B 1A5SA 3O6CA 4BFAA 3B8DA 2JKPA 5FEWA 3CM4A 1KTCA 3RK8A 2X2GA 2ZRXA 3DHDA 3VE7A 2NWSA 2CWNA 4MY1A 3OEXA 4O15A 5FI8A 3O63A 2DJXA 2ZZ5A 2WOQA 4DF2A 3LM7A 3W07A 3W7QA 3W2JA 2A1YA 4HNNA 3AO0A 5F1UA 3MHUA 2Z1BA 3G1AA 5CPOA 3TMLA 2RKXA 1H63A 3NQFA 3DHFA 4RV8A 3LV5A 3TUUA 3MP3A 3G0SA 3HG5A 4KFPA 2WJZA 3HIJA 3LI0A 3S6DA 3EWXA 3PSVA 3R13A 1IF2A 3B06A 3N3MA 4AMAA 4YXGA 3PBYA 2B7QA 2VOMA 1FBAA 2QR6A 3LLFA 3DFPA 3HBLA 1OFRA 4UTKA 3IGSA 4JIQA 5D30A 5G5IA 5CPMA 2YFNA 1ZAIA 4JTTA 3GAKA 3QQ1A 5BMWA 1LYXA 4HIBA 1KM4A 2HSAA 3QMSA 1W3IA 3W1RA 4O50A 3MYOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2NZLA

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