2NZL | Genus

Total Genus 131

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	131
sequence length	358
structure length	339
Chain Sequence	RLICINDYEQHAKSVLPKSIYDYYRSGANDEETLADNIAAFSRWKLYPRMLRNVAETDLSTSVLGQRVSMPICVGATAMQRMAHVDGELATVRACQSLGTGMMLSSWATSSIEEVAEAGPEALRWLQLYIYKDREVTKKLVRQAEKMGYKAIFVTVDTPYLGNRLDDVRNRFKLPPQLRMKNFGLAAYVAKAIDPSISWEDIKWLRTSLPIVAKGILRGDDAREAVKHGLNGILVSNHGARQLDGVPATIDVLPEIVEAVEGKVEVFLDGGVRKGTDVLKALALGAKAVFVGRPIVWGLAFQGEKGVQDVLEILKEEFRLAMALSGCQNVKVIDKTLVR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of human hydroxyacid oxidase 1 rcsb
molecule keywords	Hydroxyacid oxidase 1
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Homo sapiens
total genus	131
structure length	339
sequence length	358
ec nomenclature	ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date	2006-11-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01070	FMN_dh	FMN-dependent dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2nzlA00

3CLMA 3PAJA 5DELA 3T7VA 1XCFA 4WXYA 4WJEA 1BWKA 4X3ZA 5EY5A 4AHOA 4JDBA 5LGXA 4N02A 4UTLA 1TPC1 2DZWA 5KZDA 3L66A 1PS9A 3UWZA 1KTBA 1A50A 2RH9A 1IXPA 3TR2A 3IGUA 1QFEA 1QR7A 1OABA 2B7OA 3R12A 1WXJA 5KINA 3QH2A 1LTDA 3P82A 4JIQA 3NG3A 2JKPA 1IGSA 3E02A 4XTIA 3ZWSA 5DY3A 2VFGA 3CEPA 4JTHA 4MKNA 3D0CA 5DCDA 1FXPA 4CNNA 3HGRA 4R33A 5F2IA 3P8IA 3PY2A 4JTLA 2EF9A 3HMJG 2ZCGA 4GXMA 2Z0IA 1BWLA 3HF3A 2V5LA 3TX9A 1TRIA 4WZHA 4HKPA 3EXRA 2TMDA 1EX5A 4GUJA 3FJLA 4IXXA 3W76A 2ZYFA 4CNPA 4C1KA 4HPJA 3WFAA 3NPWA 3UYCA 4UTHA 3PUDA 4TMBA 3P81A 3QMRA 5HJLA 1I4NA 1XL9A 3IVSA 4TMCA 5FF0A 3PBYA 2FQIA 3O6DA 3OG3A 3AO0A 1B3OA 2Z6IA 1KFEA 2Y61A 1WDWA 3EWYA 4LS2A 2A7RA 3G18A 1RV8A 2QCGA 2AQWA 1UCWA 1F74A 3TQKA 2QAFA 1SPQA 5AFDA 4DF2A 4L4MA 5D02A 3IVUA 3W70A 1JCLA 3TH6A 3KRSA 2I9EA 2YZRA 3DGRA 3TC7A 1KV8A 4DEFA 3NR0A 3FS2A 3WK1A 2OJPA 1TREA 3T55A 2X1TA 6ALDA 1EWDA 3NL2A 4KWVA 3L9CA 4LVAA 4UTUA 3S42A 3S1XA 1OYAA 1EIXA 3FEMA 2ISSA 3SI9A 3S1VA 4S2BA 2CLLA 3OHIA 1FXQA 4DBEA 4DXVA 2CFFA 1C29A 3KRUA 3SJ3A 1H62A 4UTWA 4N6EA 4HHPA 4HNUA 1HO1A 4NX0A 2E5DA 3IGXA 5CGQA 1XM3A 4PEKA 3LTPA 1RZMA 5FEWA 1I2PA 4PFMA 3PB2A 4LC6A 3QZEA 1W5NA 4ML9A 4JD4A 1D9EA 3S5NA 3ELFA 1DORA 4E2DA 3HOJA 3NQ8A 1OHLA 4UR7A 3SGZA 3DI1A 3I7RA 4HIBA 2G96A 3TQVA 5L6UA 2X1UA 1QNVA 4XKYA 1XBVA 3QMTA 1H61A 1S3HA 2GOUA 4ZVJA 3NM1A 2ATSA 2C19A 5D30A 2DZVA 1JRCA 3TE9A 2Y85A 2ZA2A 3SW6A 4GJ1A 1HTIA 2HTMA 2J27A 4LS0A 3QQ1A 4RK8A 4OHQA 3OEXA 5A8GA 3RU6A 3SSJA 2JKEA 3O05A 2P10A 2QF7A 3FKRA 3PWAA 3FYOA 1JCYA 3O07A 1VLIA 3E0IA 2Z6JA 1JQVA 1FCBA 2OCZA 3OVPA 4GUHA 4JDYA 1SR9A 3C56A 3BG5A 2HMCA 2Q3RA 3EXSA 4LC8A 1F73A 1H51A 4RZ5A 3PS7A 1W0MA 3M16A 5K9XA 5D04C 1NVMA 3O6CA 3VI2A 2GJNA 2RDWA 1G69A 3MHUA 1B4KA 1PL9A 4UFHA 1W37A 3C2VA 4QSHA 3KVJA 3W22A 4QNWA 1TPDA 3LCXA 1YXYA 1VZWA 3G1HA 3NAVA 2EKCA 3FIGA 2YPIA 3LM7A 4D2JA 4O19A 2W79A 5D2XA 3RNDA 4IMDA 3GKAA 1D3GA 1OG0A 3I7QA 3TFXA 1TQJA 1ZAHA 3L67A 4TU1A 3OBKA 3NQFA 1OX5A 3PSWA 1JCNA 3EEGA 2VFIA 3AJXA 3C52A 4AXKA 5DXYA 5GVJA 2ZRVA 4ORIA 1EEPA 1RQBA 3EX4A 1VCGA 2NLIA 4EF8A 1G4TA 1VR6A 5F2LA 3HGSA 3TJXA 1VJIA 3HG4A 4OV4A 1I45A 4TO8A 4JXCA 5CPLA 3LOTA 1ZCOA 3P62A 4MYAA 3BW3A 1YDVA 2F84A 3UZ5A 3C2OA 2B0MA 2NUXA 2ZZ4A 4YCPA 1JCMP 2WO5A 3BW2A 1K7FA 1LBLA 4MZYA 1OX4A 1SUXA 3S5OA 3FFSA 2LLEA 2OMAA 2CU0A 2VKZG 3N2XA 1I2NA 3R13A 1A5CA 3H54A 4GC4A 4JX5A 5D37A 5SWUA 1W8SA 4WOQA 1QOQA 3NDOA 4H6KA 3W1PA 2QR6A 3B4UA 4X2RA 1O94A 4Z1DA 2A4AA 2W6RA 5BMWA 4X9SA 4H4IA 4LS1A 4YMZA 4M7TA 3TXZA 2Y88A 1UB3A 3P5YA 3W7EA 1X6UA 5D2WA 2ZRWA 2YSWA 2CZEA 2JK2A 3HGJA 5FF7A 3NVTA 2PCQA 1BKSA 3DFOA 4OBTA 1KFCA 4LWWA 4AF0B 4WOZA 4FO4A 4S1FA 4BI6A 4UFMA 3DKLA 2QCFA 3PULA 4ONVA 4KFPA 4BFAA 1C9DA 5CKSA 3ABQA 4X22A 2VFFA 1YPFA 3NPUA 2IQTA 2VENA 3EWWA 3QM3A 4M7SA 1Z44A 5I3GA 3G1FA 2RHGA 2C3ZA 5LGZA 2D73A 1H50A 3EX3A 3FJ6A 3STGA 2WV8A 1HG3A 3TFCA 5K4XA 4I7UA 3G3DA 5K3VA 1GVRA 3B03A 3BLIA 1G4EA 4GUFA 2QUUA 5F2MA 3G1AA 5BNKA 4NZJA 4ICNA 4MVAA 3W1MA 4JNMA 1MSSA 5KZMA 1SQ7A 2CZDA 3QYQA 5LHEA 1DOSA 4Y96A 2ZZ5A 3CHVA 4JTJA 4GNJA 1W5MA 1VGAA 3KHJA 4N2YA 1FWSA 2VC6A 5FEZA 2Y7FA 3WJZA 1ICQA 1YTDA 1TPFA 1ZENA 1TSIA 3C2EA 3EWXA 1P0NA 1XDMA 3FA5A 1TV5A 5TQLA 2GPTA 5G1YA 5AHIA 2NX3A 2DJLA 1DJQA 4I7WA 3DH7A 5AHMA 5CZ0A 4BWLA 3NM3A 2YYUA 3FOKA 3WK2A 3P80A 1YDNA 1MEIA 3GVGA 4N9EA 3UWYA 4Y8FA 4AAJA 4IUOA 1X8FA 4N6FA 4Z08A 4FNPA 2Y63A 4WQ6A 1BTMA 2WNQA 3TKFA 1E51A 2A6NA 5LKYA 1K7EA 1R2TA 3DAQA 4GFSA 4TX9A 3M44A 5TBOA 3YPIA 2E6DA 3G1VA 2A5HA 5HINA 1H7WA 1SFLA 1AL7A 5KZEA 1GYNA 1F5ZA 5BW6A 2YFOA 4UTJA 3BLEA 2QKFA 3LCLA 4Y90A 7TIMA 2H8XA 2Y7EA 3O1NA 1LYXA 3T78A 3S9YA 1SZEA 3TU9A 1J4EA 4UTTA 4MIMA 4NJHA 3I68A 1XI3A 3E49A 4LY8A 1VPXA 3DFPA 3O06A 3CQ0A 4AWTA 1LM1A 2ABBA 4HPXA 1GVOA 3GZ3A 1WAUA 4LVFA 4UUIA 1FWTA 4O54A 1OFBA 1GYLA 4QISA 2FLIA 1W3TA 2FFCA 4O28A 4KKXA 3M41A 1OFEA 4ZQPA 3L5AA 1ZALA 1A5AA 1AK5A 3MI3A 3MO7A 4CCCA 2CLEA 4NXSA 4Q33A 3MJYA 1Y0EA 5HR6A 4UMCA 2DZXA 3W7GA 1N55A 3MYPA 4O4WA 3C2RA 1GVSA 4RX0A 2AGKA 5C5YA 3LCIA 3VKJA 1K3UA 4JYEA 1DKWA 2GQ8A 3ANYA 1O5XA 4O15A 5F4XA 4EF9A 2B7NA 4XKYB 1WOBA 2V82A 3NEVA 1LLZA 4IPJA 3FKKA 3UY8A 4EOUA 1W56A 3CM4A 1Q45A 4NNBA 1WV2A 2NXIA 3KVKA 3LBCA 2J88A 4DPQA 5FF4A 2AAMA 4LRSA 4O16A 5FESA 1T0OA 1X1ZA 4BWLC 2I14A 3PG8A 1QDSA 4ALDA 4UTKA 3MHGA 1P1XA 3IV3A 4Z0SA 1CX9A 3DI0A 4M6VA 4DBDA 3GXTA 4FX7A 3G0XA 2A6LA 3KXQA 2VELA 5HWNA 3STEA 2GQ9A 4K39A 2V5BA 2YGYA 3A5FA 5G2WA 3LRLA 3N34A 3UWVA 2FPTA 1LOSA 4TR9A 3V75A 3QC3A 3TAOA 3B8DA 2VFDA 3TW6A 1WX0A 3UD6A 1EUNA 1KM1A 3ZWTA 1K02A 1QO2A 3L21A 1OVDA 4CNOA 3W7MA 1K03A 4N9DA 3GDKA 1ICSA 3B06A 3M5YA 3NOEA 4RLIA 3LCHA 5CZSA 1W5QA 2BWGA 1LROA 1LOQA 3SR7A 2GJLA 4CQAA 1W5OA 5AHFA 3P61A 3GDMA 2B7QA 2TRSA 6TIMA 1OF8A 1LP6A 4JTIA 1YTEA 3W85A 1U83A 4JTTA 3TNOA 4ZL1A 1L6WA 1JUKA 1MO0A 2HS6A 1FDJA 2NV2A 4JTFA 3NXFA 2VOMA 1O5KA 3W1LA 2QJIA 3QFEA 4UTMA 2NWSA 3TQ0A 1DHPA 1TTQA 1W54A 3ABOA 3LHWA 1TPWA 5C6MA 4S2CA 3GXNA 5E93A 1XBXA 1DBTA 2HSAA 1VHCA 3DBPA 5E0KA 2J9ZA 4P2VA 1GTHA 1NAL1 2YYTA 4UXDA 1DVJA 2EPHA 3MWAA 4U28A 5FEXA 1R2SA 3V1PA 2ATMA 2VEIA 1SSDA 2Q8LA 1KM4A 5F4SA 1JUEA 4RR4A 1CW2A 3GR7A 4GUGA 2XFWA 3P67A 4OT7A 2BLEA 3W1XA 3CU2A 3HQ1A 5K4ZA 1PE1A 5KMYA 2QAPA 2Q3OA 1NEYA 1OX4B 1TRDA 1L2UA 2I1OA 2YXGA 4FXSA 1UUOA 1GVFA 3GYEA 3B0VC 4NJGA 2V2DA 4MYXA 3W1RA 1ZY9A 1GT8A 2A7NA 5HULA 4FNTA 3O8AA 3N19B 3SFKA 2WNNA 1T8XA 3GB6A 4RCXA 5A5WA 4DF0A 2ZFAA 3CTLA 3W75A 1WYIA 3F1QA 1LDCA 2X30A 5EYWA 1G4SA 3L5LA 3LX9A 2QCDB 1DQWA 3IIXA 3W86A 4CCEA 1W1ZA 4UIOA 4G1KA 1KBJA 3BVJA 1D3HA 1LBFA 5LNVA 2G5WA 1FUYA 3QEZA 1M6JA 3L0KA 1JR1A 3E9AA 1YYAA 3LLDA 4NZFA 1TTIA 2ZZ6A 3QJAA 3BLFA 4K8EA 3F4WA 5K7JA 4POCA 4R34A 3G24A 3P60A 1KW1A 1LRQA 2W0UA 1FBAA 2YDAA 3LV6A 4H3DA 3A5VA 4R53A 3LTSA 3W1UA 4O10A 1OK4A 1PHQA 4A2SA 1GEQA 1TCDA 3LCGA 2BX7A 3R5EA 4PH6A 2QCNA 2RFGA 1M7PA 3GXPA 4M19A 3EX6A 3G22A 3CEUA 1ZNNA 2ISWA 4FB7A 3HB9A 1HO4A 1TTPA 1R47A 1P4CA 4AEOA 1ZAJA 5C55A 4EVZA 3C61A 3W07A 5C54A 1ZJIA 1IXNA 1TPEA 3M1ZA 3GK0A 4Z0JA 2DJXA 3EXTA 1SZGA 1TJPA 3A21A 3VE7A 5HMSA 2Z2UA 3G1YA 2UV8G 4FIRA 4Y9AA 4UTWC 1O95A 3W7LA 3GIYA 1LORA 3LV5A 4GBUA 1UUMA 4A3UA 2VFHA 3QRHA 4ADSA 3KRZA 3BW4A 3QQ0A 3WK3A 4K7VA 3STFA 4MLJA 1QPRA 3UWQA 3W1AA 2E68A 4Q4KA 1ALDA 3ZS4A 1B9BA 1H7RA 2P0OA 3DFTA 1YXDA 5IM51 1DL3A 1KBIA 5FF3A 3CIXA 3I65A 4JYDA 5EKYA 1AL8A 1EP1A 3BO9A 1SSGA 5TIMA 4JS3A 4N9BA 3A9IA 3L0NA 3PBVA 5EMUA 5F4WA 3PG9A 5F1UA 5BOOA 2VEMA 1L9WA 4OQVA 3EB2A 1TPB1 4OU1A 3N3MA 4IX2A 5AYYA 5C2XA 1PIIA 3LHTA 5CPMA 2FDSA 3W7KA 1DV7A 4IQLA 3W3OA 5J5RA 4Z1BA 2DZSA 1T96A 5CG7A 1K8ZA 1WA3A 2EAWA 1EB3A 1RQHA 3W83A 5DCBA 2X1RA 4DO4A 5U4NA 2QUVA 1FX6A 2E09A 4MY8A 3MI2A 4HSNA 5U7SA 2NX1A 1AW1A 1GG1A 5AN7A 3ATZA 4ADUA 4OE7A 3QSTA 2CLKA 3NL6A 3CIWA 3TXVA 2ALDA 5HR7A 4JTSA 2PRMA 1FWRA 5IBXA 4U4MA 4YWIA 2Y89A 4FNSA 2Y62A 3ABSA 3O15A 2CLOA 4K38A 1RQEA 1N7KA 3OA3A 2FB2A 4I9AA 5LNSA 4JN6A 3UY7A 3QMSA 1H1ZA 2A1YA 2ABAA 1FQ0A 2QCDA 5F2GA 5FF2A 4PL2A 4Y6GA 4J9JA 3N2MA 1VYRA 1I2RA 5L9FA 3PC0A 1RVGA 1AW2A 4QAIA 1QPQA 3EKZA 1OJXA 1XKYA 3S6DA 1K8YA 1WBJA 3M5ZA 1GPWA 1SZFA 3BPWA 3S1WA 1WBHA 3CB8A 5DBTA 5FEPA 4WY0B 2ZZ7A 3GNDA 2A21A 5DCEA 8TIMA 1ADOA 4LUIA 2J9XA 1ME7A 3UXAA 2CWNA 3W23A 3TCEA 5AHNA 2PURA 1IF2A 1WOAA 1PCWA 2V2CA 1R2RA 3PUOA 2H90A 3MP4A 5D03A 3EWZA 3GKFA 4MFDA 1TPUA 3P74A 3S8HA 2WSQA 3EWBX 2BZNA 1TPH1 2ZRXA 1ME8A 3IEBA 1W5PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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