2OX1A

Archaeal dehydroquinase
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
MKLVATLSSPEELELAEKADVVELRIDLFDFSGARVDKEKILTCRRVSDGGKFEGDERERIEKMKRAFDSLNPDYVDLESDLPDSAFDFNCRIIESYHNFIRTPDYSELKGIVEGRRGDLVKIATMGKSKRDVETIVRILTNYDDVVAFLMGERFSFTRVLAAYLGSPFIYCYVGSPKAPGQISLDDAREIISRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and lability of archaeal dehydroquinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
molecule tags Lyase
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 62
structure length 196
sequence length 196
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2007-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ox1A00
4CCDA 1MEHA 3DKJA 1BKSA 3BG9A 4ADSA 1QPNA 3QPYA 2E6FA 3H54A 4UTWA 3FJLA 3IEBA 3O16A 3C2RA 4ZL1A 1TMHA 3LM7A 1BWLA 1XDLA 5G2IA 3W1QA 1M7OA 8TIMA 1U5JA 2NV1A 2V0TA 1QOPA 2HS6A 1XBYA 1WDWA 4GJ1A 1AW2A 2NX9A 4H4IA 3NXFA 2GVLA 3NL6A 1SSDA 3OBKA 4IPIA 2JKEA 2FQIA 2J9YA 2G95A 1R30A 3P81A 5L6UA 4QNWA 4NQ1A 2NXIA 4PL2A 3O05A 1FWSA 2C16A 4AVFA 4UFIA 3BW2A 1WV2A 1YTEA 2JGYA 4AHPA 2XN1A 4NZFA 1OG0A 3PBWA 2CLHA 4O19A 2VFDA 2YFNA 4A2SA 3FA5A 4FX7A 4FNSA 1FUYA 5AHMA 1UUMA 1XXXA 3STFA 3W70A 2A6NA 1XBXA 5F4WA 4Y90A 3G0UA 4PCFA 1D9EA 5AHEA 1F74A 4JYFA 2QCHA 3MP5A 4D2JA 1X1OA 2YZRA 5LZLA 1GOXA 1SR9A 4WD0A 3TC6A 2V2DA 3VKJA 4AEOA 3W1MA 2CU0A 3VI2A 5I3HA 1OF8A 4UFMA 3NA8A 3W2UA 2TRSA 4UMCA 5U7SA 4OQVA 3N3MA 4GNJA 4Q4KA 3GDTA 2ZTJA 3LV6A 4N9DA 4Q32A 4MYXA 3FYPA 2C1HA 4WY0F 2XN0A 4MVAA 4JTJA 4O17A 4M19A 2ZCGA 5LNWA 2ZTKA 1TIMA 2JKAA 4N2YA 1Q45A 3CWOX 4DEFA 1W5PA 1FDZA 4Z1AA 4IMEA 4LVFA 2VFFA 1JQVA 2NX1A 2X1SA 3AJXA 3SIZA 4AHOA 2P1FA 2C18A 4LRSA 5CZTA 5CGQA 3Q58A 3S5NA 2DP3A 3W83A 1OFRA 3W22A 2QCFA 1MXSA 3TSBA 1XI3A 3W1LA 1SO3A 4CCCA 3LBCA 4LNYA 4WY0B 4LVBA 3PS7A 4TX9A 1E51A 1EUAA 4RXFA 1RZMA 1GVFA 5DBUA 3UWQA 6TIMA 4WOZA 3P8JA 3PUDA 1YXCA 3I68A 3W2KA 5D32A 3MBFA 1P0KA 1QOQA 2NZLA 3EKZA 4UTJA 4GUHA 2V2HA 4O1AA 4LV4A 3SGZA 5J5RA 4OBTA 2RDWA 3P8IA 4EWND 1G6CA 3P80A 2QCNA 3TNOA 3L9CA 3QZEA 2CZFA 3FLUA 4MKNA 3ZS4A 3GXTA 3OEXA 1HO1A 4HPXA 2ABAA 4WOQA 4JY9A 1EPXA 4WJEA 3KVJA 4TU1A 1C29A 1TPB1 4NX0A 5D30A 1HFBA 4Y8FA 3W3OA 1EEPA 5D09A 4XBSA 3B0PA 3G1FA 4WY0A 1ML1A 2V30A 3OIXA 2YXGA 4L4LA 1LLZA 2C19A 4OT7A 1GYNA 3GXNA 3CPRA 5G5IA 4IXHA 4MZ1A 3BV4A 2VEIA 2GJNA 4P61A 1Z44A 4UMAA 1PL9A 3G24A 3P5ZA 4XQ6A 2R14A 4JY8A 3RMJA 1XC4A 4FEZA 1LBMA 4KWWA 3TH6A 1R2SA 2CLKA 3P5YA 5LGZA 5C6MA 1OFOA 2BTMA 3DENA 1R46A 2QDGA 4FF7A 5I3GA 3B05A 2V8ZA 3SFKA 3NZ1A 3USBA 4JX5A 3PBYA 5G4EA 4UTLA 2B0MA 1AL7A 4OV4A 3THAA 3W6YA 5LHEA 4FNUA 3P84A 2VFGA 3W1PA 3LHVA 4K8HA 4MYAA 1SFJA 1MZHA 4MY8A 2Z1BA 3KRZA 4JTSA 5D04C 3TMQA 3DFTA 3C61A 3O63A 4NJKA 1TTQA 4O57A 3LCIA 2A1YA 1EIXA 3M1ZA 2VELA 3R12A 4N6EA 3W1AA 5F4SA 5HWNA 3SJ3A 1IXPA 1K7EA 5DBTA 3GKFA 4X22A 3H55A 2Q3OA 2C3ZA 1F05A 2JBMA 1T96A 5FF7A 1QNVA 1UASA 4OV9A 3QFEA 1VYSX 5BRBA 3W1RA 5C55A 3EX3A 5K3VA 4UTIA 2CZEA 3UZ5A 2A5HA 5CZ0A 3L0NA 3HG4A 2ZZ7A 2PRHA 1VGAA 3RK8A 3Q94A 1XBVA 1FCVA 3LI0A 1O4UA 4K7YA 2GQ8A 2X1UA 3O1NA 2ZRZA 4JTGA 1LM1A 4LRTA 1QDSA 3W7IA 2ZA3A 5ABTA 2CLOA 3ABRA 3NR0A 3WK3A 3G8EA 3ATZA 4ADTA 3TUUA 2ALDA 3W74A 1G69A 2QCCA 2CLMA 4DBDA 4W9TA 3BW3A 4MJZA 2VOMA 5IBXC 5KTLA 3W1TA 3P61A 4O50A 3G3DA 4GC4A 2RDUA 2J9XA 4RR4A 3WFAA 3FJ6A 3SY5A 1GTHA 3E9AA 3BLIA 4PA8A 2H3DA 4JEQA 5K9XA 1H7NA 2C14A 4AWTA 1SQ7A 3N2XA 4GUGA 2GOUA 4ORIA 3M16A 3TXZA 4BI6A 4O14A 1JJKA 3P82A 4JN6A 1ZAJA 3C52A 2H8ZA 1W5QA 3W7RA 5CG7A 3WK1A 2A6LA 4K38A 4MJMA 3UWYA 1JQXA 3PB2A 2QAFA 4UR7A 5A8GA 3WJWA 5AN7A 1L2UA 4FXRA 3THQA 3R13A 3UY8A 3HIJA 3MI3A 3LTYA 5AHFA 4GUJA 1H1YA 2E5BA 3LTPA 1RR2A 3EWXA 3G1DA 4YMZA 2X1RA 3VCRA 5HUPA 2XN2A 4NX5A 1PIIA 5E0KA 4UNLA 2FJKA 2QCMA 3QQ0A 1SZGA 2RKXA 2YYTA 1EP1A 1A50A 1IXNA 4DXVA 4KWVA 1QO2A 1H7PA 1SU5A 3VFLA 4QISA 3DZ1A 3A9IA 1TPDA 3TSDA 3HG5A 3M5ZA 2Y7DA 1XUUA 2RDTA 3OVQA 3IGUA 3CIXA 3BW4A 4CCEA 3L5LA 3W7HA 2A21A 3BVJA 1VLWA 4FXSA 3LRLA 2ISVA 5C54A 1KTCA 1I4NA 2O7QA 1GQNA 1OYAA 4DO6A 1O60A 4JX4A 1KFEA 5K9DA 1P0NA 1T99A 4XTDA 3G0SA 1M5WA 4AF0B 1VH7A 3SR7A 3WJSA 1OX5A 4TO8A 3LXBA 2TMDA 3M47A 3R8RA 4X9SA 3EXTA 3QYQA 4O1BA 3ZFHA 4QJ1A 5F2MA 4E38A 5CSRA 1L6SA 3A23A 3MO7A 3UYCA 2QCDA 5IBXA 1XL9A 2VFEA 3W7CA 4LTSA 5DY3A 1A5SA 2BZNA 1L6WA 3G22A 1G67A 1VCVA 5I3JA 3EXRA 1X1ZA 2VENA 1GPWA 1W3TA 2ZBTA 1RVGA 5D2WA 4JTLA 3JR2A 3EB2A 2OT1A 3B8DA 5TQLA 1RPXA 5DXXA 4UTWC 3C0JA 4BF9A 4BI7A 5F2GA 3R5EA 1JCXA 2ATMA 1KFCA 4RZ4A 1LRQA 3QPZA 4EOUA 4CNOA 4RLIA 2A7NA 3H53A 5DY2A 2VC6A 2DORA 1CI1A 3NQAA 5I3FA 2GVJA 2Y85A 1K7XA 2OT0A 3N9RA 2A7PA 3KRUA 4XTIA 3C2EA 2OMAA 4RZ5A 5AC8A 2TPSA 1D3GA 2ABBA 4K39A 5F2LA 5D2XA 1TCDA 2XFWA 1TTPA 4UTTA 3BLEA 1OX6A 3HPSA 2AGKA 4PODA 5D38A 4TIMA 3NGJA 1W3IA 4ZQOA 2P10A 1IIGA 3GX9A 2NUYA 4JIPA 3B0UX 1WBJA 3C2OA 4OGZA 3W86A 5BMWA 1QMLA 2CZ5A 5T26A 3BPWA 2NV2A 3LHZA 3IVUA 4XUGA 1WYIA 3I7RA 3NQ8A 3W84A 3B06A 1SFLA 1RQBA 1LYXA 3NVTA 3IV3A 4QM1A 4ONVA 4NXSA 5F2IA 4JYDA 4WQ6A 3LXCA 1LBLA 2D73A 2DZVA 3QC3A 2CFFA 3OVRA 4MZYA 2I1OA 3HPXA 1GVOA 2YDAA 3VNDA 1QWGA 3S1UA 1VYPX 3G1XA 3I6RA 1XUZA 4LW7A 3K30A 3UY7A 3A22A 2TSYA 1JRCA 3LCWA 1HL2A 1IIHA 4OU1A 3C8FA 3PSWA 1AL8A 4WXYA 3KAOA 5KITA 1M6JA 3S1XA 3DKLA 3W7NA 1RQHA 3S5OA 3P7YA 2OZ0A 1AG1O 4UFKA 2WKJA 3QW4B 4Y96A 3UD6A 4ICNA 3D0CA 1LP6A 1EWDA 4N9BA 5C2XA 2A7RA 4O0KA 2DU2A 3M43A 4NNAA 3W71A 2CLLA 3HGJA 1TRIA 4CNPA 5G1TA 1KLYA 3MUXA 3TV8A 5H2ZA 4L4MA 5EA9A 4B5NA 2Z6JA 4QQ3A 4NVTA 4JTKA 5D2VA 1YDOA 3DFQA 2VFHA 3HB9A 1TPUA 4M6PA 4RK8A 3U2OA 5FF3A 3ABOA 5HJLA 4NXKA 1ZHAA 1NEYA 3NQ2A 3NQFA 3LERA 3FS2A 2FFCA 2Y62A 1K03A 3LGEA 3W2JA 2DZXA 4PFMA 1F6KA 1KFKA 3FYOA 4MPQA 3B4UA 3NPVA 3ZWSA 3ATYA 2WSRA 3VE9A 3L2IA 2ZQ0A 2A4AA 3W7GA 2V9DA 4ZQPA 1NVMA 3QEZA 3MHUA 1SO4A 1YADA 1GJPA 3GR7A 4KFOA 1HO4A 1T0OA 4MZ8A 1WAUA 3DAQA 4MIMA 4JDYA 3GVGA 2WNZA 3I7SA 4I7VA 3LTSA 2PCQA 4JXCA 3MBDA 3W1XA 1BTMA 5G1YA 2HTMA 1AMKA 4FIRA 3CEUA 3TDFA 1ME8A 4IGHA 3NPUA 4BR1A 3KVMA 3LCXA 3NQCA 4XKYA 2FPVA 5SWUA 3WK2A 3FIGA 2PRLA 1H51A 3ELFA 3MI2A 4MUZA 3NAVA 3L65A 4BWLC 5HUOA 3UXDA 2QUVA 1RQEA 3TW7A 4O12A 4TR9A 4O0ZA 3S5ZA 3MYPA 1A5BA 1SZNA 3W7KA 5CPMA 5BOOA 4LS1A 2B4GA 3BARA 1BEUA 5CZSA 2B7QA 3ABQA 3DU0A 3IGXA 1OF6A 1VR6A 2EPHA 5BNKA 1ICQA 1WX0A 5DLCA 2GUUA 4LVGA 2VEPA 3WJXA 2BWGA 3GLCA 2QAPA 2A85A 4A2RA 4N9EA 1YDVA 3NQDA 3L68A 1O95A 3LOTA 4DF2A 2VFIA 3HG2A 3GNDA 3ZWTA 2QCEA 3TE9A 3IIOA 2QKFA 3BGJA 4JTIA 1KBJA 3E12A 3GR8A 4POCA 1TQXA 3PG9A 2YSWA 3T55A 3PWAA 1VQTA 3GAKA 1K02A 5K9CA 2JKPA 4MLRA 2H3BA 4CLMA 2YPIA 1TJPA 1B57A 1GVQA 1VC4A 3LV5A 3P74A 3KRSA 3ABSA 1KTNA 3NQ7A 2NUWA 3N19B 4DO5A 1FWRA 5K4ZA 3PAJA 4HNTA 1S3HA 4ML9A 1LLWA 2Y70A 3UWVA 4CQ9A 1FCBA 4NZJA 1I2OA 2A2IA 4JTEA 2OJPA 2Y63A 3KX6A 3LX9A 1FDJA 3P60A 3LRKA 5EMUA 4FHAA 2V5LA 1W8SA 1WXJA 5CPNA 5HWMA 5I3IA 4UTHA 2J6XA 4X3ZA 3E02A 1QAPA 1M7PA 1YLVA 5TIMA 4Y9AA 5AYZA 1ZNNA 5AC6A 1H62A 5KSWA 3S1VA 1TQJA 2X30A 3A24A 3NM3A 3O6YX 4LT9A 3EX6A 4IWWA 2NWRA 1KM1A 3M9YA 5L9FA 1VRDA 3QRHA 4OWGA 1FCQA 3EXSA 4O52A 3NL2A 5AHIA 3PM6A 3FKKA 4Z1DA 4M7SA 1Q6QA 4DPPA 1MO0A 3STGA 4BK9A 4LC6A 4BWLA 4DPQA 5LNUA 3QM3A 1LROA 4ZVJA 1KA9F 2WJZA 3BK0A 4HNUA 2NXGA 2GJLA 3M44A 4KKXA 3UXAA 4O11A 4PEKA 3S8HA 4K37A 3V1PA 2NLIA 1OFDA 4Z1CA 4MY1A 3M0ZA 1K3UA 1Q6OA 1F5ZA 5AHLA 2YFOA 2Q8LA 3S9YA 4AHQA 2J9ZA 1W0MA 5BW6A 4KFNA 1YYAA 5K2ZA 4O53A 1XFBA 3G8RA 2FDSA 2YGYA 4HPJA 3QSRA 1SW0A 3B0VC 1A53A 1JCMP 1H7RA 1Z41A 5FEXA 2ZZ3A 3PUOA 1MEIA 3GDRA 3GXPA 4JX6A 4QSHA 4HSOA 2Y7FA 3LB0A 1Z42A 1JCNA 4DELA 3CB8A 4O8RA 2ZZ4A 2W6RA 3W88A 1G4SA 1DQWA 3DGRA 2QF7A 4X2RA 4N9CA 1K8XA 3TFXA 3WK0A 1ZAHA 5FF2A 4FX6M 1TB3A 2I9EA 4O28A 3NQMA 3EX4A 4R33A 2UV8G 3N9SA 1X6UA 3RF9A 4HNVA 1DOSA 1NF0A 3GAYA 4LS0A 2WPBA 4YLWA 4LWWA 2C0AA 3QMSA 2ZZ5A 4CQ8A 2P0OA 2QUTA 3YPIA 1G4EA 2E6AA 1GVSA 1H61A 4A3UA 4OE7A 5D37A 3ANYA 2EF9A 3W2NA 3N34A 4UC5A 2CLEA 3LLDA 1I45A 3S6DA 4WUIA 4WX2A 3CU2A 4N6FA 2CLIA 1SO5A 5BMXA 1NSJA 3NPXA 1UJPA 1SW7A 3HF3A 4NU7A 3L67A 3BGGA 5EYWA 1KV5A 1U83A 3EX1A 4LVAA 1XBZA 5CZJA 4BFAA 3HQ1A 1C8VA 3G1HA 2G97A 1LRTA 1W5OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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