2OX1 | Genus

Total Genus 62

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	62
sequence length	196
structure length	196
Chain Sequence	MKLVATLSSPEELELAEKADVVELRIDLFDFSGARVDKEKILTCRRVSDGGKFEGDERERIEKMKRAFDSLNPDYVDLESDLPDSAFDFNCRIIESYHNFIRTPDYSELKGIVEGRRGDLVKIATMGKSKRDVETIVRILTNYDDVVAFLMGERFSFTRVLAAYLGSPFIYCYVGSPKAPGQISLDDAREIISRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure and lability of archaeal dehydroquinase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	3-dehydroquinate dehydratase
molecule tags	Lyase
source organism	Archaeoglobus fulgidus
total genus	62
structure length	196
sequence length	196
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date	2007-02-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01487	DHquinase_I	Type I 3-dehydroquinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2ox1A00

3TH6A 4JTHA 3O16A 4K36A 5D37A 3ZS4A 4QNWA 1K8ZA 5HUPA 3E12A 3M5VA 3TW6A 4RLIA 1DJNA 3TQ0A 3PY2A 3VNDA 1AL8A 1AW2A 4MY8A 3EX2A 2NZLA 4CNOA 3O8AA 2NX9A 3QEZA 2ALDA 1LOSA 4O1CA 1VQTA 3LRLA 4N4QA 3O63A 3HG4A 1NF0A 3H55A 1ZJIA 2B7PA 2Q3RA 4UTLA 5FF0A 4LTSA 3L68A 5CZSA 4UTMA 1ZFJA 1JCLA 3DI0A 1O4UA 2V0TA 2OT0A 2XFWA 4N9EA 1LOQA 1EIXA 3CIXA 4O54A 1KBJA 3TMLA 4K7YA 4JY9A 1MZHA 2V5LA 4EF8A 1EB3A 5AHNA 1EUAA 1I2PA 1TRIA 1KBIA 1VC4A 3ZWTA 1JQXA 1JCJA 3RNDA 4HPXA 3IIPA 1KFKA 2A85A 5HR6A 2FIQA 3DI1A 3UPBA 3DBPA 4IX2A 4OV4A 4EF9A 3THQA 3O6YX 1TPEA 1H51A 1L6WA 1IF2A 1B4EA 4LVBA 1ADOA 4NJIA 4N9CA 5AC6A 3MP3A 2GUUA 3O6DA 3WK2A 3TAOA 5D30A 1XBVA 1J5TA 3W75A 4NNBA 3QW3A 4MYAA 4M19A 2E5BA 4IMGA 3C2VA 4M5PA 3W74A 4O14A 3P62A 2QDGA 3DFPA 5C5YA 3SR7A 1YPFA 2JKPA 2ZTJA 3PB0A 4UMAA 4I7UA 2Y88A 2CZEA 1UJPA 3LHTA 5AYYA 3HPSA 3BW4A 2WSRA 1LBFA 1KLZA 3KVJA 3C0JA 4RCXA 2NXGA 1VHNA 4GWEA 2YW3A 5DBUA 1PV8A 1LYXA 2HTMA 1Y0EA 5TBOA 4JEQA 4UTHA 4RR4A 4BI5A 1FCBA 2XN2A 1HTIA 1VRDA 3M9YA 2B7QA 1G4EA 3QMTA 3UWVA 2YGYA 3AJXA 2EAWA 3PM6A 3M1ZA 2TYSA 4QITA 2QJGA 4JTJA 1S5VA 4UMBA 3OVRA 1NSJA 4LUJA 4CNPA 3STEA 3I7SA 4PC8A 2WJZA 4N9BA 3IIVA 2UV8G 1W5PA 1GYLA 3UWQA 3TFXA 4L4LA 3TJXA 3W2UA 4UFKA 1TMHA 4HSNA 3UD6A 4Z0JA 5LNRA 1H7WA 1S5WA 4JYEA 5F2LA 5F4WA 2GVLA 1W3TA 2ZRWA 1YDNA 1THFD 3GLCA 1WX0A 3EXRA 4Z1DA 3HBLA 1ICSA 4O53A 1A5CA 3STFA 3DU0A 4HNVA 1JUKA 5KINA 3SGUA 3QM3A 5C54A 2ZZ1A 1C29A 3JR2A 3TW7A 3WFAA 4A29A 1ICQA 1TPH1 2YPIA 2X1UA 1WXJA 1TJRA 1QNVA 3NEVA 3V75A 1M7PA 3KRZA 3S1UA 3M0ZA 4K7VA 1L6SA 2PRMA 3BV4A 3DXIA 4N9DA 5I3GA 4Q4KA 4UR7A 2QJIA 3H54A 4HT3A 3OBKA 4IPIA 2Q8LA 2WPBA 3PWAA 2A0NA 3HG5A 1X6UA 1DVJA 3FKRA 3MYPA 4QQ3A 3TCEA 3NPVA 1K02A 4JTSA 2BWGA 2QCDA 5AHIA 1T96A 3ATZA 2NLIA 4JTTA 4RX0A 3C4UA 3CWOX 3L0GA 3W9ZA 1XM3A 4XBSA 4EVZA 1HG3A 3HJZA 4M6PA 2Y85A 2V82A 3BK0A 1GT8A 1W5NA 1ZENA 1V5XA 3SIZA 3S5OA 1E51A 4UIOA 5BMWA 5EBUA 1PS9A 2C14A 4M7SA 4MY1A 3QW4B 4JGDA 4WOQA 2ZCGA 3R12A 4MY9A 5FEZA 4CQ8A 3WK0A 4KWVA 4JTIA 1JR1A 1SPQA 2QCGA 1VCGA 3HGSA 2H6RA 1KFEA 3R2GA 5IBXC 3LERA 4HNNA 2V9DA 3CTLA 1MEWA 1GVQA 4JDYA 4Z1BA 3L2IA 4FF7A 3L5AA 1A5BA 5FEXA 3N73A 2VEPA 3IEBA 1KFJA 1JVNA 1WQ5A 1VYPX 4QAIA 2ZA2A 3LV6A 2A7PA 2QUVA 3QYQA 3NQAA 2DP3A 2ZZ6A 2CLLA 3GDTA 2QR6A 1Q6QA 4O0KA 2AAMA 1OVDA 1YPIA 3PG9A 4HNUA 5AHLA 2RH9A 3P67A 5HUOA 4D2JA 4GC4A 2WO5A 1SZFA 4UTJA 4DBEA 3W1XA 1L2UA 4FNRA 3S5ZA 4NXSA 3HQ1A 1A5SA 1VYRA 4FX8A 1FXPA 4JX5A 4ADTA 3UY7A 3NQEA 1SZEA 2ZA1A 5D38A 4PL2A 2VFFA 1M7OA 3GAYA 3IRDA 1AW1A 1WDWA 2Y62A 2WNQA 3E49A 1JCMP 4UNLA 4JNMA 2VFEA 1KFCA 3F03K 4O4WA 4DQWA 1OYAA 3Q94A 1Z42A 3D0CA 2H3DA 5FF3A 4HNTA 4UTUA 3ABQA 1AG1O 4O4VA 5AC8A 2QF7A 1O60A 5KMYA 3IIXA 5DLCA 3C2EA 4IXHA 1R30A 2ZTKA 2FPVA 1YDOA 2DORA 2CLKA 3C3NA 2I14A 4DPQA 1YLVA 3GDKA 4AWTA 3IVUA 3W7MA 2C6QA 2YX0A 2V81A 1IIGA 3HIJA 1OX6A 1GTEA 3F4NA 2JGYA 1QPRA 2HS8A 4NJJA 3IGSA 3W7IA 1PVNA 4W9TA 1SW0A 4LVFA 4LVAA 1W31A 1OFAA 4FEZA 4FNUA 5LSMA 2YXGA 3L0KA 5K4XA 2GOUA 1TV5A 3L21A 2CFFA 1UASA 1RQEA 3W7LA 3N9SA 1WA3A 5HWNA 4ORMA 2G5WA 1KM6A 1N7KA 1G69A 2J9YA 3W22A 1AL7A 1B4KA 3S8HA 3PVFA 2ZZ2A 4NJHA 4JYFA 2GVJA 1XI3A 4I7VA 1W1ZA 2ZDRA 3M47A 3ZWSA 1SO6A 3ABOA 4OT7A 3C6CA 2O7SA 4BI6A 1KFBA 2A21A 2ZBTA 3B0VC 5EPDA 1FXQA 3B0PA 4FNSA 3M7WA 3TMQA 1SO5A 2ABBA 5MHBA 4LRTA 1PHQA 5DCDA 3OVQA 4OE7A 1AMKA 4NZJA 1F73A 4QNEA 4R34A 2VFIA 4OGZA 1I2RA 3EX4A 2GPTA 1G7UA 3PULA 4O1DA 1ME7A 1HO1A 1XBZA 4H6KA 4KFPA 2CU0A 3MBFA 3P74A 3IGUA 3OG3A 2VXNA 5TIMA 3GB6A 1RV8A 3LHZA 1XC4A 3TR2A 5K2ZA 4OBTA 5D04C 1ZAJA 1XXXA 3P80A 3PSWA 5K9CA 1Q6LA 2P1FA 3UNDA 1W37A 1QPNA 3ZFHA 1SFLA 5HJLA 1KM3A 2A5HA 3C2RA 1QOQA 3B4UA 2C1HA 4NX5A 2C16A 4JIQA 3VCRA 3FFSA 1TPB1 1XBXA 3WJZA 3G8RA 3QC3A 4UFMA 2V30A 2DZSA 2VENA 4A3UA 2X2GA 5LNWA 2QKFA 2AQWA 5F4SA 1H61A 3OIXA 3G0UA 2NUWA 2A7RA 2GJLA 2NUXA 2J6XA 1WV2A 1SO3A 1MEHA 5CKSA 3FIGA 3GZ3A 5K7JA 2A6LA 4Y90A 1KTBA 1G7VA 1W5MA 4K39A 1O5KA 3E96A 1CW2A 4IMCA 3T44A 4UCGA 3PC0A 2ZYFA 2DZWA 1T99A 3FYPA 3NR0A 3LHUA 1W54A 4Q33A 1LOLA 1ZAIA 4O17A 2PRLA 1ZALA 2P0OA 1TV8A 3NQ6A 4S2CA 5LKYA 1XUZA 3T7VA 1H50A 2Q3OA 1H62A 2ISWA 2ZA3A 4QM1A 3W7NA 2E6AA 4O52A 2QJHA 4AWUA 4MKNA 1FX6A 4NZFA 1TPUA 1GEQA 3A23A 1LLZA 3UWZA 5DCBA 1IGSA 2X1TA 4TR9A 3CM4A 1H7NA 2Y61A 2CWNA 1EWEA 4FXRA 2OZ0A 3HGJA 3MHUA 4UTTA 3W1QA 3S0CA 1UBSA 3AO0A 5L6UA 1KW1A 3TK7A 5FEWA 3LBMA 1J4EA 2VC6A 3I68A 3TKFA 4WY0B 4PL1A 4RXGA 3T78A 1T0OA 3BPWA 1TPVA 4YWIA 4FXSA 2F7FA 4AWSA 4WQ6A 1W56A 2YFOA 3A24A 3W7EA 4KKXA 3GR7A 1OABA 1PCKA 3NQ7A 1Q45A 4WXZA 5CPLA 3C52A 3QMSA 4R53A 4CLMA 2I9EA 2EPHA 3PBUA 5F2IA 1IXPA 3DKJA 1WOBA 3VE7A 2HMCA 1I2OA 4QSHA 3PUEA 1FWSA 1LRQA 4WJEA 4HIBA 5KTLA 1IIHA 3GIYA 3MO7A 1GQNA 4UTTC 3W1PA 3M41A 3B0UX 3MP5A 4AAJA 5EKYA 4NX0A 4UXDA 2Q8ZA 5HQEA 4DPPA 3G1FA 1EX5A 4JTUA 3A5FA 1R47A 3R5EA 1OK6A 2ZFAA 4LS2A 5D2YA 1VGAA 2GJNA 1X1ZA 1KFLA 5AC7A 3VKJA 2BTMA 4GFSA 2DZTA 4MOZA 1KV8A 2RDTA 3IVTA 3P84A 3EX6A 4GJ1A 1RQBA 2Z6JA 2ZZ3A 4FNQA 2JGQA 1U83A 4JDBA 3E9AA 3LLFA 1TTPA 1SFJA 3CEUA 3INPA 3NQVA 3SY5A 4CQ9A 1X1OA 2FB3A 3MBDA 4WXYA 3F1QA 1LRTA 4GUIA 3CPRA 2ZZ4A 2IQTA 4G1KA 5AHEA 3R8RA 1TQXA 1FQ0A 3ZR4A 2NXHA 3G0SA 3W2JA 3G3MA 3SJ3A 5AYZA 4H3DA 1VH7A 3TNOA 1C8VA 3S1WA 5G4EA 1LDCA 5G2HA 3VFLA 3W1UA 2QCNA 4XKYB 3HB9A 3THAA 1GG0A 2C18A 2HSAA 2PE4A 3W7KA 2V2HA 3MP4A 4ZQOA 3QJAA 4UFHA 2VKZG 4HN4A 4P61A 5U4NA 5KSWA 1L6YA 1ICPA 2Z2UA 3PUOA 4KFOA 3EKZA 3N2XA 2GQ8A 1LRNA 5TQLA 2G97A 3M6YA 3LRMA 4ALDA 2VELA 3QRHA 4MUZA 2QCHA 3EWUA 5A8GA 4AF0B 1YXYA 4E2DA 1DJQA 1JQVA 3PG8A 1FWTA 4O57A 4OWGA 3M5XA 4BK9A 3PF3A 1ZHAA 3GDRA 1OX4B 3HGOA 2YDAA 3F4WA 1O94A 3M5YA 3W71A 5AHFA 3LCIA 5DBTA 2PRHA 4ZQCA 3HO8A 1H7PA 1TRDA 3N2MA 3QFEA 4Z1CA 1RR2A 3LX9A 3N14A 1SU5A 3BARA 3DFOA 5CPMA 5G2IA 4O18A 3LHVA 1QMLA 2JKAA 2C3ZA 3ANYA 4UTWA 4PTNA 3LXAA 5AN7A 1KV5A 2BZNA 2WKJA 3NM3A 4YLWA 4JTKA 3KVKA 3G8EA 1W3IA 4JTFA 1KM5A 5A5WA 2E09A 1PHWA 2VEKA 4CQAA 3DAQA 1SR9A 3NPXA 3W84A 3IVSA 3LB0A 3TUUA 3RU6A 5F4XA 1R2RA 2NX1A 4O1AA 1KA9F 3LOTA 3W7GA 3LLDA 1LLWA 1PCWA 1YXCA 3LTSA 1DQXA 5D32A 1KM4A 1H60A 4BI7A 4AHOA 3LXCA 1QPOA 1GTHA 3PB2A 3T40A 2R94A 1JJKA 4U28A 5D2WA 1CX9A 4FNTA 3KAOA 1FWRA 1OHLA 3QZEA 2CW6A 2J9ZA 5E1QA 5D2TA 3W1TA 3GR8A 3TQKA 2C15A 2QAFA 3BO9A 3EKLA 1VLWA 3G24A 1TQJA 1TTJA 5FEPA 3LCGA 3L5MA 4NJKA 3DFSA 1EPXA 4LV9A 4QJ1A 1XBYA 3G1XA 3OVPA 4JX4A 4Y9AA 1JCYA 2EKCA 2QCFA 2V5BA 1SO4A 4UC5A 1TJPA 2CZ5A 1H1ZA 4OHQA 2TPSA 3KXQA 5GVJA 2E5CA 4JIPA 4K8EA 4E0CA 5D2VA 3NYZA 5G2WA 3UWWA 3CWNA 4Z1AA 1AK5A 1YTDA 3L66A 5K3VA 4KFNA 2FJKA 1KTNA 1Q6RA 4YCOA 1IXOA 2FLIA 4PFMA 3N34A 2A1YA 2ZRYA 3W86A 3CHVA 3WJYA 4UTKA 3QQ0A 2JK2A 3OEXA 4JS3A 2PCQA 3LDVA 4HSOA 5FF2A 3NXFA 4ORIA 1FCUA 3GXNA 3GK0A 3SSJA 4A22A 2P10A 2FFCA 3DFQA 4AXKA 2ISSA 4FNPA 4DBDA 3Q37A 4UFIA 3PR2A 2DJLA 4UFLA 3W1AA 5K9DA 3BVJA 3L67A 4UMCA 3M5ZA 3FOKA 3C2OA 2QUUA 5FI8A 3CEPA 2E77A 3MWAA 1XL9A 3C56A 4OQVA 2A4AA 4EIVA 2VOMA 3NQGA 1F05A 4ML9A 4DF2A 3TSDA 2QDHA 4UUIA 4YXGA 5BRBA 3KVMA 4RJEA 4X3ZA 2YYUA 3MJYA 4AHPA 4DF0A 1W5OA 1TO3A 4N6FA 4GXMA 1LM1A 3M16A 2OMAA 4IUOA 2ISVA 3LXBA 1HUVA 5G1YA 3S5NA 3TAKA 2NV1A 4BF9A 3KVLA 1BKSA 2DZVA 4LU0A 3ELFA 5EMUA 3TX9A 5BMXA 5E0KA 1VYSX 3LV5A 3NL2A 1XKYA 3RLVA 3STCA 4ZQRA 1FWWA 2ATSA 1DKWA 3I7QA 3EX1A 3LTPA 1OFOA 3UXDA 1VZWA 3M44A 3A22A 5EY5A 3O07A 3PSVA 4ADSA 1TPWA 1O95A 4X2RA 5CSRA 1XDLA 3EEGA 4EOUA 1B3OA 4O10A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2OX1A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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