2OX1A

Archaeal dehydroquinase
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
MKLVATLSSPEELELAEKADVVELRIDLFDFSGARVDKEKILTCRRVSDGGKFEGDERERIEKMKRAFDSLNPDYVDLESDLPDSAFDFNCRIIESYHNFIRTPDYSELKGIVEGRRGDLVKIATMGKSKRDVETIVRILTNYDDVVAFLMGERFSFTRVLAAYLGSPFIYCYVGSPKAPGQISLDDAREIISRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and lability of archaeal dehydroquinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
molecule tags Lyase
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 62
structure length 196
sequence length 196
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2007-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ox1A00
3EWUA 2Y7DA 1JCJA 4JNMA 4X3ZA 3W1QA 1GZGA 3IVSA 3TSDA 1OF8A 1RVGA 1LOLA 1TPH1 5AC8A 2DP3A 1CX9A 1ONRA 4O57A 4UC5A 2VENA 3FJ6A 2W0UA 1J2WA 4LT9A 3THQA 3M44A 3WJSA 1K7EA 4DPPA 1NVMA 1MO0A 3C52A 1UB3A 1LOQA 2CLEA 4MY1A 4RCXA 4GUJA 4LU0A 3FJLA 1VR6A 3NQFA 1G7UA 2JBMA 2VEKA 2DZWA 2NUWA 4YL2A 2QF7A 3IGSA 1VC4A 3TCEA 3RMJA 3OVQA 4MYAA 4LVFA 2G96A 3ELFA 1PS9A 1DJNA 1VCGA 3NL3A 1G7VA 2VFGA 4ZQCA 4IX0A 3EX4A 4M6VA 4WOZA 3QW3A 1YXCA 3GXTA 4K39A 4UTIA 5F2MA 2Y6ZA 1NFBA 1TPEA 3VCRA 1L2UA 1G4EA 3PC0A 1YLVA 4ORMA 3NQVA 3C56A 1I8JA 3DFNA 1EIXA 5D04C 1PE1A 1SSGA 2WSYA 2E5DA 2RFGA 1GOXA 3MHFA 3TNOA 3L2IA 2DJXA 1FWTA 2F84A 3NQ6A 3FYOA 5LZLA 4UR7A 4JTTA 3LCWA 3AO0A 5FEXA 2QUUA 4A2SA 3IGXA 1ZFJA 5K9CA 2E68A 3PWAA 5CZTA 3ATYA 3RFAA 2KZHA 2CZDA 3TQKA 5I3IA 2E6AA 2CLMA 2P0OA 4DO5A 1WX0A 5F4WA 4O1DA 1W5NA 3Q37A 1GG1A 2QDGA 4FNQA 4NZFA 4ZMGA 1W3IA 2ZBTA 1EWDA 5C54A 3UWQA 3O8AA 4K6AA 1LZOA 2CWNA 2OX1A 3IIVA 4I9AA 3JR2A 4GFSA 4XTDA 4DPQA 2D73A 4A2RA 3MP5A 1V5XA 1B3OA 4XKYB 2X30A 3P7YA 3TQVA 3BV4A 3CU2A 4U28A 3EB2A 1LTDA 5HMSA 2E5BA 2YYTA 2ZRXA 1ZAIA 4AF0B 1NAL1 3GB6A 1TB3A 4ZQNA 4DQWA 4AMAA 3GDMA 2JGYA 1G4PA 2GPTA 2ZA2A 3WK1A 4J9JA 1K8XA 4A29A 3MO7A 1SSDA 2CZEA 3FKKA 2YFOA 2V5BA 1FBAA 3I7RA 3G1VA 4IPJA 1ZENA 3IRDA 3F4NA 5D09A 3GR8A 3BARA 5AC7A 3W6YA 1OYCA 3LERA 1H1YA 1XDMA 4KKXA 4LS0A 4A22A 1C9DA 2NWSA 1L6WA 2BXVA 2Q3RA 3TSMA 3L68A 5CZSA 4R34A 1OFAA 2V81A 5CZJA 4HN4A 2F7FA 1QO2A 1HO1A 4A21A 1YYAA 1LBMA 1LYXA 3EX6A 3MJYA 3KRZA 1H1ZA 3CHVA 1OVDA 1VYRA 4LUIA 3O6YX 3EKZA 3LCXA 5G2IA 4BI6A 3LOTA 3TC7A 5C6MA 2TSYA 3I7QA 2VXNA 3MUXA 2YZRA 3TFXA 4GJ1A 1XBVA 3W2MA 2EHHA 3TC6A 1N7KA 3OVRA 2VFHA 4FNTA 1EP2A 2ZFAA 3MI2A 3TX9A 5G4EA 4N4PA 4MLRA 2FFCA 1BEUA 4MJZA 1ZALA 1GVOA 4ZQPA 1K02A 4ZQOA 1F2JA 3PBWA 4XUGA 1EA0A 4UFHA 2Y63A 4N9CA 5I3JA 1G69A 2J27A 3HG2A 3U8GA 2EGZA 1D3GA 4O8RA 3CT7A 1JCMP 2R14A 2NV1A 4CCDA 2ATMA 3HOJA 2I9EA 3HIJA 2RH9A 2E09A 3NVTA 1KV8A 4JICA 3QEZA 3P80A 4O13A 1H7XA 3GDLA 5AC6A 3BG9A 4JIQA 1AG1O 1ADOA 1NEYA 3BG3A 2NV2A 2VKZG 1UASA 2DZVA 5CSSA 3L0GA 5EMUA 3A24A 2QDHA 4EIVA 1JRCA 1FQ0A 3E49A 3FOKA 4MZYA 1YTEA 4O1AA 4EF8A 1A5BA 4Z0JA 1GYLA 4PC8A 5DLCA 3VKJA 1PVNA 5K3VA 4KWWA 1SO5A 1SPQA 3L67A 3T44A 5G5IA 2V0TA 3ABRA 3M1ZA 2DORA 4IXHA 4OGZA 1KFCA 3G1AA 3O07A 1AL7A 1H7OA 2PC4A 2V2DA 3M16A 4FNRA 1SW0A 4RZ6A 1JJKA 3TMQA 1J5TA 1ICSA 4IOTA 1O4UA 2WNQA 3NPVA 3M5ZA 2GJLA 1IXQA 3P8IA 5DBTA 4IMCA 1TPB1 3PBVA 2RDUA 3LTPA 1WA3A 4LRSA 1KLYA 3IGUA 1SZEA 1NF0A 1H61A 4O1CA 4Q4KA 3CTLA 1TCDA 2RDWA 4FF7A 3LHTA 2TRSA 3EXRA 2WJZA 4MPQA 4N6EA 4PL1A 2C13A 5U4NA 4AWUA 4IQLA 3O05A 1NF7A 2QCEA 5AHNA 3CM4A 2V30A 3IVUA 4ADSA 3R12A 4UUIA 2QCDA 3MP4A 3W72A 2ABAA 4RR4A 4ZVJA 1GVRA 3M41A 3JRKA 4IWWA 4UTKA 1KM3A 1DV7A 1TTPA 2A6NA 1F5ZA 1TSIA 3P67A 5G1TA 2BZNA 1W0MA 4CCCA 3OIXA 3R2GA 3QQ1A 4O19A 2E5CA 4FEZA 1LRTA 4UTTA 3P5YA 3NM3A 5G2WA 3ZS4A 4XZ9A 4GC4A 1AW1A 4MZ8A 1DBTA 5GVJA 4HNVA 2R91A 4WJEA 2OMAA 3M7WA 5TIMA 5K4ZA 3E02A 3L21A 2QCHA 3L0KA 3L0NA 2Y85A 3LX9A 2VFFA 4ZQRA 4QIUA 4IXXA 4WY0F 2OT1A 3HBLA 1U83A 4N6FA 2A7PA 3S6DA 2V9DA 3G1SA 3PB0A 4K7YA 4N9EA 3HB9A 4O4WA 3I68A 5DXXA 5HWJA 3A5FA 2IQTA 3P84A 4YCOA 1IGSA 5AYXA 2RDTA 2J9XA 3PUDA 3HPZA 1Q6RA 1TMHA 4MFDA 4FXRA 1TTIA 4JTGA 3SI9A 2B7PA 3R89A 1KTBA 1S5WA 4MZ1A 4DO6A 3W2LA 2QCDB 5SWUA 2Y88A 3W7RA 3GDTA 1XUUA 2FLIA 3R5EA 3EXTA 3GZ3A 3F1QA 1VYPX 2YXGA 4L4LA 2C16A 4OBTA 4OT7A 4IPIA 5LNWA 3OHIA 3IIZA 4TMBA 4Y6GA 1IXPA 2HS6A 1PHQA 3LBCA 4OHQA 2QCNA 4C1KA 2CW6A 3P61A 2WV8A 2PURA 3OEXA 4GNJA 3LCIA 2EAWA 3KFTA 5J5RA 2I14A 2V2CA 3QW4B 2GVLA 5CPLA 3CLMA 1H60A 2JKAA 1KFJA 4ONVA 4RZ5A 4LS2A 1TTJA 4WQ6A 4AB4A 2EPHA 2ATSA 1WBJA 3S0CA 2WSQA 2G97A 2J6XA 3DHDA 5K9DA 3NDOA 2Z0IA 3TAKA 2AQWA 2NXHA 4UTHA 2H8ZA 2VFIA 3UWWA 4BR1A 4O16A 2H6RA 5L6UA 4MLJA 4JTIA 2YW4A 2C1HA 3STGA 4RX0A 3NQDA 5C2XA 4ZL1A 3UYCA 1QFEA 4DEFA 3O15A 5D38A 4XTIA 1JVNA 1PCKA 3CEUA 3B4UA 3UZJA 1SW3A 2YCEA 4LC6A 2CZFA 5DCEA 1AL8A 3B0VC 2C3ZA 2X1UA 1FCUA 3EWBX 3NL5A 4QQ3A 1W54A 1F6KA 3TA6A 4LV9A 3GK0A 1W5PA 1KBJA 5HR6A 5CKSA 1LLWA 5CSRA 4LVAA 5HNRA 3WJZA 4PCFA 2B0MA 3DGRA 4HNTA 5G4WA 1T0OA 3DFPA 4JTHA 4LOCA 3W74A 2ZQ0A 3W7HA 2ZDRA 5E0KA 1OFOA 1QPNA 1W31A 1RQBA 1ML1A 3W1RA 3DU0A 5FEPA 4A3UA 4Z08A 3SGZA 1FCVA 3GXPA 3QMSA 1QDSA 3W2KA 4ZZ9A 4UIOA 1TYGA 1ZHAA 4N4QA 1ICQA 1P0KA 1MEHA 3PULA 1TRDA 3N73A 2XFWA 4XBKA 4JTJA 1C29A 1QMLA 1LBLA 1O60A 3DI1A 3L5AA 1K7FA 1Z41A 4RV8A 3A22A 3MBFA 3E12A 3THAA 3S5ZA 3USBA 4FO4A 4GUHA 1R2RA 5I3GA 3QSRA 3W7LA 2ABBA 2R8WA 2ZZ2A 3N2MA 3W70A 1WDWA 4KFNA 1TQJA 5LKYA 3PBUA 1QAPA 1MXSA 1OHLA 3NAVA 1GT8A 2ZZ6A 3QRHA 2FTPA 4JR5A 4HSOA 2FB2A 4NU7A 1DORA 3UZ5A 3W1AA 2BSLA 4K8EA 2E6FA 4JD4A 5A8GA 3LCHA 2E6DA 3NQ7A 4NNBA 1TPUA 2VEIA 3NQ2A 3O6DA 3KXQA 4NXSA 4EOUA 4JYEA 4OU1A 1XXXA 1KFLA 3VE9A 5I3FA 5J5DA 4WOQA 1TIMA 1PV8A 3HG4A 1EB3A 1OABA 1OX4A 3G3MA 3G8EA 3RLVA 3TQ0A 3AJXA 2HTMA 4BFAA 4UCGA 2YFNA 3MHGA 2QR6A 4CNPA 5C55A 1GG0A 1I2OA 4O54A 4Z1CA 1SO6A 1KM2A 4QISA 3DI0A 3NOEA 1JCLA 3NO5A 3MI3A 4O17A 3L9CA 2PCQA 4DXVA 2ZZ1A 2FDSA 3S5YA 3E0IA 4JS3A 5FI8A 3M47A 1R2TA 4C1LA 2A4AA 1FX6A 3MYOA 3CPRA 1SFLA 3HJZA 4L4MA 1LLZA 2HMCA 1DHPA 1G4SA 2C15A 1GVQA 5CG7A 1OF6A 1GVSA 4MY9A 5G2HA 5D32A 4ML9A 3IVTA 4QAIA 3Q94A 4FNPA 1IXOA 2C19A 3HMJG 3P8JA 2ZRZA 4LW7A 1A5CA 5FESA 5G1YA 1QOQA 2DZSA 5LHEA 1TJRA 3KRUA 4HHPA 4NQ1A 2ZZ3A 4AHOA 1VLWA 2GJNA 3QMTA 3TROA 3KHJA 3PAJA 3PG8A 1OFDA 1KM6A 4UXDA 3S42A 3GX9A 1F74A 2ISSA 2XN2A 7TIMA 3KOFA 1CW2A 3QFEA 3G0UA 4K8HA 1OX4B 3NQMA 1I45A 2ZA3A 5D2YA 3S1UA 1OFBA 3NXFA 1VRDA 1VZWA 3W1NA 2NX9A 3VI2A 1I2RA 3GKFA 2QEZA 4O4VA 3HO8A 1UUMA 3IIXA 2PE4A 5AN7A 3RLUA 2DJLA 4FIQA 3C8FA 3DKJA 4NVTA 1N55A 2YGYA 3W1XA 4BK9A 1XM3A 3VFLA 5E1QA 3TDFA 4HKPA 2VFEA 4IMFA 3S5OA 2Z2UA 4JXCA 2P10A 4ADTA 3PBYA 5LNUA 4X22A 1SU5A 3QM3A 3G18A 5EL1A 1PL9A 1EWEA 4U4MA 4K38A 1J4EA 4M7SA 1OFEA 1GJPA 5D33A 1W5MA 3LDVA 4GWEA 3UWYA 2YDAA 1QCWA 4GUFA 5CGQA 1TPFA 4P61A 2ZTKA 3W7NA 1ME8A 3W1LA 3NPWA 3PY2A 2FPVA 3W7JA 1LM1A 1MZHA 3C0JA 4AHQA 4OQVA 1OFRA 5BW6A 3BW3A 1HL2A 4OWGA 1FUYA 3OA3A 4OV4A 1F73A 4R7JA 4FHAA 3H54A 4ADUA 2A21A 2CLHA 4AH7A 2WSRA 3H55A 5AHMA 2ZZ7A 3EWWA 1X1ZA 3CWOX 4YMZA 1XC4A 4Z0SA 3STFA 4JDBA 1AMKA 2PRMA 2Z6IA 1W56A 4R53A 2GVJA 5KITA 4DF0A 5KSWA 3K30A 2Y70A 1WQ5A 3HGOA 5D37A 4UMCA 4WZHA 1FDJA 1HO4A 3V75A 2CFFA 2I1OA 1FWWA 3GR7A 4WXYA 5I3HA 4ALDA 4MVAA 1ZAHA 3OBKA 1W1ZA 1LCOA 1HUVA 3RU6A 3R13A 3NQAA 5HWNA 3SGUA 2HS8A 5F2IA 2QJGA 3GLCA 5LNSA 2A2IA 1KBIA 1B57A 1H7RA 1Q45A 2Y89A 5IBXA 3EEGA 3B0UX 3B04A 3T4CA 1YDVA 1T96A 2QKFA 1VJIA 5AHLA 2NUYA 5D05A 1OJXA 1TPC1 1YXYA 1TV8A 3GDRA 2CLLA 2V82A 1IXNA 2UV8G 4GBUA 3DFQA 1L9WA 4BI7A 3NR0A 4FX8A 5FF2A 2QAFA 3NA8A 1R47A 4UFIA 3DKLA 4O12A 3B8DA 5KMYA 1TREA 3C2VA 1Z42A 1UBSA 5C5YA 5AFDA 3UD6A 2V2HA 2V5LA 1WXJA 3LHYA 1M6JA 5LGXA 1I4NA 2GQ8A 2X1TA 3DZ1A 3U2OA 4BF9A 1RPXA 4IJBA 3CIWA 3SJ3A 3TW7A 1RV8A 4I7UA 2Y61A 2NX1A 2B7QA 2FJKA 1HTIA 1KM4A 4LRTA 4NJHA 4H3DA 1OYAA 5D2WA 8TIMA 1DOSA 3TFCA 2ALDA 2DZPA 3W71A 4QNEA 5DY3A 4H4IA 1A5SA 3BPWA 1ZJIA 1H50A 3LCLA 3PS7A 4S2BA 4BWLC 2B7NA 4JGDA 5BRBA 1UUOA 2YSWA 4POCA 5IBXC 2E77A 2CLIA 3EXSA 3M9YA 1W5OA 3LHUA 4WX2A 5AHIA 4M6QA 1SUXA 4IX2A 4JTKA 4YXGA 1FCBA 4JX6A 5FF4A 3SIZA 2NXIA 2G5WA 3QC3A 4R33A 4NJJA 1S5VA 4CQAA 1QO5A 3NPXA 5CPOA 3S5NA 3W7DA 4JYFA 1JQVA 3N2XA 4UTJA 2QAPA 2H8XA 2YW3A 2X1SA 2FQIA 1MEWA 3QPZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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