2PB1A

Exo-b-(1,3)-glucanase from candida albicans in complex with unhydrolysed and covalently linked 2,4-dinitrophenyl-2-deoxy-2-fluoro-b-d-glucopyranoside at 1.9 a
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Exo-B-(1,3)-Glucanase from Candida Albicans in complex with unhydrolysed and covalently linked 2,4-dinitrophenyl-2-deoxy-2-fluoro-B-D-glucopyranoside at 1.9 A
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein XOG1
molecule tags Hydrolase
source organism Candida albicans
total genus 154
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2pb1A00
3ARUA 3CMGA 4AD5A 2XGIA 2V3DA 3OIHA 3WMBA 2WVUA 4RE2A 1DHKA 4YPJA 1MWOA 3MKKA 5EBAA 2UY5A 3VU2A 4JFUA 2EJ1A 1CXFA 3VGGA 3A47A 5A8QA 4MNKA 6TAAA 1V0LA 2JIEA 1H1NA 2WKLA 3AS1A 1X1NA 1GJUA 4MAVA 5DFAA 5D8WA 5A6JA 4KMQA 2NT0A 4F79A 5C70A 4HMEA 4U33A 5CSYA 3BH4A 2FDMA 3OZOA 3NJ3A 4HMDA 4GO8A 3ZSTA 1WDSA 1S46A 2UY3A 2VOTA 1JZ3A 5I77A 3II1A 3SCOA 3WQWA 4LX4A 2E3ZA 4GI9A 2DIJA 3HN3A 2WC7A 3WF2A 2W92A 1B30A 2GDVA 2WSPA 3CUHA 4PMOA 1HJUA 2WHMA 1V3KA 1CLXA 2WMGA 1E3XA 4QDMA 1KXVA 1HJQA 2WLZA 4HPGA 2CBUA 3U57A 3IJ9A 4OOZA 2XHYA 1KBBA 2G41A 4M81A 1Z32X 2YOCA 3AI0A 4U31A 4JZ5A 3AZRA 2G4FA 4RE4A 2VR4A 4LYPA 1H09A 3ZQ9A 4AZCA 1TR1A 1B3VA 1UH2A 4LYQA 1QI4A 3KL5A 1MW0A 4P7QA 3WEMA 4XV0A 1J0JA 4TVUA 1KXTA 3CHFA 4A3HA 1C90A 4PTVA 3PZ9A 1JGIA 1F4AA 1CIUA 1V6VA 4FF5A 4ZE5A 2VJXA 1V6YA 1EXPA 2DSKA 3QOKA 1V0KA 3BCFA 4CD7A 2VO5A 4UTFA 4JKKA 2WVVA 2UWFA 1WZMA 2YIHA 2VZUA 2GK1B 1ISXA 1KFWA 3NSXA 5A6BD 2G3JA 5BRQA 2WMFA 2ZXQA 2OYLA 1HNYA 3ZOAA 2OSXA 3MUY1 1W9UA 2D3NA 4UFHA 4EAMA 1V3JA 2QF8A 2VZTA 3VMOA 3L4TA 4OJYA 3CHCA 3N9KA 4MB5A 1WO2A 1DEDA 1V3HA 3QHNA 5LA0A 1UHVA 4WLCA 2X8RA 3AHVA 5HNNA 1EDGA 3MMDA 1XYFA 4ZXOA 4W8LA 3EDEA 3AIEA 1TG7A 2ZUNA 5AC5A 3SCNA 3JUGA 3WQ5A 3ARXA 2PI6A 2ZX6A 3AYSA 4UZUA 4F9DA 4XX6A 1BYBA 1TA3B 3AQUA 3PN8A 4FLRA 1E6SM 2BXZA 5I3DA 1VJSA 2CXGA 1XRVA 3PTKA 3FNDA 3AMCA 3AMLA 5D9PA 4H8HA 1W1VA 5AYBA 1K9FA 1M53A 2VZOA 1MFVA 3B9AA 4UFLA 4B9YA 4WKFA 3L4VA 1FP9A 3ZT7A 2VRJA 3MUIA 3UG5A 4UNIA 3T2QA 4M1RA 1LF1A 1UWQA 3WIJA 3AJ7A 2YL5A 3ZR6A 1YQ2A 5I2UA 3ZO9A 4MNLA 3ZIZA 1MVYA 2VX7A 1SMDA 3AROA 4PSRA 3CLWA 4OUEA 1R7OA 3IANA 4AC1X 3WD4A 4AZ5A 4WKAA 3K4AA 5IDIA 1UQYA 1YHTA 5JIWA 2F61A 4C7DA 4Y7EA 2XVGA 3MO4A 2Y5EA 4P7LA 2YKKA 2VVSA 2XSAA 5D8ZA 1G94A 2D22A 4H41A 1QBBA 4W85A 1JDDA 3MMWA 2E8YA 3BAJA 2FH8A 3AIQA 3WUFA 3AHZA 3MSGA 1AQMA 1K9EA 2G3MA 3BLKA 3IAQA 2E9LA 1DWAM 1EQPA 3ARYA 1E6XM 3CZJA 4E8DA 1MYRA 1VBRA 4F8XA 3VIHA 1PAMA 4HA1A 1UWTA 1QW8A 2CCRA 3WNLA 4P8XA 2J7CA 1VRXA 1WAWA 2W91A 4WK9A 3MUZ1 1OWQA 2G8ZA 2WPGA 3SUVA 2CBVA 3GM8A 1UR0A 1XSKA 4AIEA 2FGLA 7CGTA 3UR8A 4H04A 2E40A 1V0NA 2OLHA 1W32A 3A4WA 2W62A 3SCWA 5BYWA 1HKJA 3AS3A 1BFNA 5HPCA 3WEZA 2YLAA 2PBOA 2VRKA 4AISA 2JEQA 3QGVA 3AXXA 4HZ8A 5A6LA 2NSXA 2VVNA 3IAPA 2HISA 4R5EA 4AD0A 1XCWA 4ATWA 3O6AA 5I24A 4D6FA 3ZM8A 4GI8A 5D9MA 4UQBA 1IV8A 1QHOA 5FOOA 3SCTA 3AZSA 3GXDA 2B31A 4JFWA 2ZWYA 4PMUA 1UD6A 4J28A 1UWUA 3A3HA 3U5YA 1W1YA 5EFDA 2GFTA 4NSBA 5CQ1A 4IM4A 4J3SA 1BPLB 1B31A 1PEZA 2J75A 4BCEA 1QPKA 4OOUA 5DO8A 3PTQA 1WCGA 5HBFA 1ZB5A 1ZBVA 1LQ0A 2ZE0A 1PZ3A 2WVSA 3DYMA 5CLTA 4ACZB 2WANA 4B3LA 1LJYA 4CKQA 3NSMA 4FLOA 1EQCA 2V5CA 3VDBA 1D2KA 4AEFA 8A3HA 1BQCA 2WLYA 1IZJA 2J62A 2D3LA 1BF2A 4P7OA 3HU7A 3WH6A 2WW5A 1GHRA 4MDPA 3WNKA 1UD5A 2ZUVA 3HJEA 4GZEA 3WF4A 4CVUA 2WZHA 3M07A 4RL3A 1MW1A 3BAKA 2E4TA 2ZXBA 3VIJA 3DECA 4RE3A 3SIMA 5DEZA 4UOJA 4W93A 2ZIDA 3LPPA 1ZU8A 3VD9A 1UKSA 4PCSA 4XUYA 3WD3A 3NSNA 1ESWA 3M7SA 2GJPA 3AXIA 1B9ZA 4W89A 3PZQA 1FFRA 1V6XA 5FKYA 1WP6A 1KR0A 4AY1A 1QHPA 2OYMA 1E4NA 2WMHA 3GBEA 1LG2A 2WM0A 2DGAA 4FK9A 4GQRA 1C8YA 4PMRA 3VGEA 3AIWA 1WZAA 4PMDA 3B8SA 1OT2A 1EO5A 2J7GA 1MQQA 5CZKA 5GNXA 3UR7A 4N42A 3MV11 3ARPA 1XH2A 1HP5A 2Y8VA 5DT5A 4OBRA 1QNSA 2Q8XA 3AOFA 1C3FA 1U30A 4EE9A 4Z2JA 4KWUA 2XTKA 2XYLA 3OLEA 3ZMRA 4DM2A 3VUPA 4V28A 4BQ2A 1CGVA 3N12A 3WFZA 2XVKA 2FHBA 4D1IA 1GQLA 5CJ5A 4MJ4A 4AZGA 3T0AA 3ALFA 1J12A 5IHSA 5E6YA 4H8VA 3BMVA 1V08A 1XCXA 3WL1A 2BHYA 3RO8A 2CKSA 4W5ZA 2NT1A 1HN1A 3WNPA 4TVCA 4D1JA 4K68A 2PWHA 3AFBA 5A6BA 5GPRA 1UR1A 7TAAA 2Y2WA 6CGTA 3WKZA 4FMVA 2VRQA 1FH9A 5EMYA 4P7RA 1KCLA 1JD9A 1JFXA 1HJVA 3POCA 3L4UA 5AC4A 2XGBA 1QNOA 1JXJA 1VF8A 3OGSA 1W3KA 2WMIA 1MW2A 1H49A 4CN4A 1E0VA 4LPCA 2VL4A 1EHAA 1XYZA 1HJWA 1E15A 3I3EA 1H0IA 2GUYA 3OGVA 3PBGA 4DUWA 3APGA 3TOPA 4Z2LA 2J7BA 2JE8A 2OSWA 8CGTA 3UESA 2GK1A 5CLWA 1QI0A 3OGRA 2YL9A 3CGTA 2WB5A 3W29A 3POHA 2QHAA 1DWIM 1UA3A 1SYTA 3MSDA 2FHCA 4UQDA 4MB4A 1J11A 5KZ6A 3SCQA 3RIKA 1H2JA 5IFPA 5BWFA 1GQKA 2XUCA 1I1WA 4AD1A 1K6AA 1UR8A 2DH3A 4J27A 3AXHA 1UUQA 1XSJA 4W7VA 2ZXAA 1HKMA 1R86A 1QI3A 1OCQA 2CESA 2J7HA 4H2CA 2DT3A 3WDJA 1KWKA 4J7RA 4BQ3A 4Z2KA 1XSIA 3W25A 5JBFA 3S6TA 4ATDA 4U2YA 1Q4NX 4QLLA 5BXTA 2NW0A 1BLIA 3WQ6A 2EPLX 1OD0A 1E71M 3BAIA 4HU0A 1NH6A 2V3GA 2VZSA 1TVNA 1GOQA 2XPKA 3GNRA 4GPNA 2E0PA 1E1EA 2XM1A 1E56A 5KEZA 4YHEA 2BVTA 3F4VA 2J74A 1NWSA 4UCFA 1BTCA 1M03A 3K4DA 1Q6EA 1JYXA 4CD6A 4UQ9A 5IXEA 2BY0A 1E73M 4X0VA 4HOWA 1E5NA 1UKTA 1E4LA 1E72M 1CGXA 4UFMA 2XFYA 2DH2A 3TA9A 4GZJA 1JNDA 4NRSA 1UYQA 3TTQA 1ZBWA 5A2BA 1V3LA 1E5JA 1NARA 3NYDA 3VIKA 3WSUA 1C8XA 2XVNA 1DP0A 1UZ4A 4Z2HA 2WKGA 4AD3A 2J8FA 1WZKA 1OGGA 3B9EA 1NWTA 2AAAA 2YBTA 3PZVA 1QI2A 2IXUA 1G1YA 6A3HA 3RILA 2JALA 3AMGA 2VCAA 3AZTA 4X9YA 2VR5A 4MDOA 2OYKA 3VGHA 4AEEA 3G6MA 3F5KA 3WN6A 3KL3A 3VIOA 1TVPA 1U33A 2CERA 3LPFA 2A3BA 4LQ1A 4QFUA 2O9TA 2DT2A 5E9AA 3MU7A 5A8NA 3VGDA 4E2OA 2CBJA 2TAAA 2MANA 3FHQA 1JZ5A 3ZJ7A 2WXDM 4W8AA 3N11A 1W3JA 4MADA 5I0DA 5A69A 3WH5A 3CZLA 1H41A 1E6PA 4BQ5A 1ISVA 2WCSA 1E6NA 2JFEX 2BHZA 5F7UA 1ODUA 1E3ZA 4B9ZA 3GNOA 1GVYA 2X09A 1BVZA 1V02E 4UR9A 4LYRA 3U5UA 1J18A 1DWHM 3KZSA 4TX6A 1RP8A 1KXHA 2UY2A 4PTMA 1EH9A 3THDA 4Z2IA 5FCZA 3I3BA 4WSKA 5CG0A 4TTGA 1GORA 5LA1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ARU A;  3CMG A;  4AD5 A;  2XGI A;  2V3D A;  3OIH A;  3WMB A;  2WVU A;  4RE2 A;  1DHK A;  4YPJ A;  1MWO A;  3MKK A;  5EBA A;  2UY5 A;  3VU2 A;  4JFU A;  2EJ1 A;  1CXF A;  3VGG A;  3A47 A;  5A8Q A;  4MNK A;  6TAA A;  1V0L A;  2JIE A;  1H1N A;  2WKL A;  3AS1 A;  1X1N A;  1GJU A;  4MAV A;  5DFA A;  5D8W A;  5A6J A;  4KMQ A;  2NT0 A;  4F79 A;  5C70 A;  4HME A;  4U33 A;  5CSY A;  3BH4 A;  2FDM A;  3OZO A;  3NJ3 A;  4HMD A;  4GO8 A;  3ZST A;  1WDS A;  1S46 A;  2UY3 A;  2VOT A;  1JZ3 A;  5I77 A;  3II1 A;  3SCO A;  3WQW A;  4LX4 A;  2E3Z A;  4GI9 A;  2DIJ A;  3HN3 A;  2WC7 A;  3WF2 A;  2W92 A;  1B30 A;  2GDV A;  2WSP A;  3CUH A;  4PMO A;  1HJU A;  2WHM A;  1V3K A;  1CLX A;  2WMG A;  1E3X A;  4QDM A;  1KXV A;  1HJQ A;  2WLZ A;  4HPG A;  2CBU A;  3U57 A;  3IJ9 A;  4OOZ A;  2XHY A;  1KBB A;  2G41 A;  4M81 A;  1Z32 X;  2YOC A;  3AI0 A;  4U31 A;  4JZ5 A;  3AZR A;  2G4F A;  4RE4 A;  2VR4 A;  4LYP A;  1H09 A;  3ZQ9 A;  4AZC A;  1TR1 A;  1B3V A;  1UH2 A;  4LYQ A;  1QI4 A;  3KL5 A;  1MW0 A;  4P7Q A;  3WEM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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