2PBOA

E27q mutant of exo-b-(1,3)-glucanase from candida albicans at 1.85 a
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLQPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Analysis of Protein:Carbohydrate Interactions at Three Distinct Sites in Candida albicans Exo-beta-1,3-glucanase
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein XOG1
molecule tags Hydrolase
source organism Candida albicans
total genus 151
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2pboA00
2VVSA 3CHDA 3F5JA 3IAQA 2CXGA 3L4VA 4U3AA 1DWAM 4CD6A 1G5AA 4MNJA 4AEFA 1PX3A 3VM7A 2WMHA 1W1PA 4W8AA 3PZGA 4UQBA 1G1YA 4V28A 1KWKA 3AS2A 3GNOA 2B31A 1U30A 2XPKA 1HKJA 1NP0A 4KRTA 1GJWA 3W24A 1EQPA 5D9PA 3VD3A 5GNYA 1AQ0A 3RJXA 3SCWA 1V3LA 1D3CA 3AMCA 2ZXQA 5JBEA 2E8ZA 2DSKA 4AIUA 3AMGA 3OGRA 2DT0A 2D0FA 1JGIA 1UA3A 3N1AA 2DSUA 4DWSA 3VX1A 1CWYA 3VD7A 4TUFA 2J7GA 1OINA 3VO0A 2VZUA 2WHKA 1UD6A 3N11A 3FAXA 1HP5A 5A6LA 4CKQA 3AIBA 3MUY1 4JFUA 4PTVA 1JD7A 4PMRA 2OWCA 1W9VA 1H0IA 1UQZA 2XM1A 4E8CA 4YPJA 1HN1A 2BVTA 1BHGA 1K9EA 1H0GA 3IK2A 3RPMA 3GDBA 3NSXA 1LL4A 3AIUA 3WUBA 4WLCA 5DMYA 3KL0A 1W9PA 2CNCA 3HJEA 4WK9A 2ZWYA 3VD5A 3IJ8A 3ZJ7A 4E8DA 2DDXA 1MQQA 3WD3A 1B3VA 3BMVA 1E43A 2YBUA 5F7UA 3KEHA 4B15A 2AOSA 5BROA 4WSJA 3L4YA 4HOXA 4ZENA 4Q7NA 1KCKA 3ZT7A 1YHTA 3TTSA 2WSPA 4CU8A 2D3LA 4UTFA 2V3DA 4UQEA 2UY4A 2IUZA 4B16A 2XWEA 2WVUA 2JF7A 4GO8A 5AY7A 2BNJA 5FOOA 3UETA 1JAEA 2CITA 3BXWA 4GPNA 2EPNA 3S2CA 3EBVA 3VDCA 3N15A 5FIPA 5EFDA 3KZSA 4E2OA 3AZSA 2D22A 2XUCA 1CLVA 8CGTA 4XB3A 1ZBCA 4PTWA 4HMEA 4H41A 5I5RA 5IDIA 3AI0A 1XH1A 2WBGA 2XJ7A 2PI6A 4OKDA 2ZUUA 3VIJA 4PBGA 2ZUNA 1NWSA 3BAYA 2DQXA 1M7XA 3K8LA 5I78A 4ZXOA 1MXGA 4CCEA 5LA2A 2V3GA 2G41A 4W8BA 4P7QA 3UEQA 3I3DA 2GJXA 4P8XA 5IFTA 3SCTA 1UQYA 3MU7A 2W63A 3VMOA 4QLKA 1FFRA 2J47A 1BFNA 1QPKA 5BRQA 1UG6A 1JI1A 1N82A 5DT5A 1L8NA 2VX5A 1I75A 3VGBA 2UY2A 3NCOA 3GM8A 2YDQA 1W2PA 5BXTA 4M24A 1JIBA 3I3EA 4W7WA 3CUJA 2C8NA 4NF7A 2XGIA 2PBGA 3RMEA 3VOCA 4JCMA 3GNRA 4PRWA 2G3JA 4NZCA 5E09A 4W93A 1KCLA 1GPFA 2FHCA 2Y8VA 4M80A 1JNEA 1WZLA 5CG0A 3TOPA 3BCDA 3G6MA 3AMLA 4OJYA 3VVGA 2RGMA 5ABEA 3BLKA 2CIPA 2W5FA 4AW7A 1AVAA 4LPCA 1MFVA 2DSWA 3OGSA 1HXJA 3WQWA 5CQ1A 1OT2A 1XSJA 1UWUA 2CCRA 2HISA 3HU7A 1QHZA 1E56A 4J7RA 1C90A 1W1YA 4TX8A 3DYPA 1OGBA 1Q6CA 4P7NA 3EMQA 4F9JA 1JAKA 2VR4A 5CPQA 5JUVA 3WF2A 5D9MA 4AZBA 3UR8A 2G4FA 2J62A 3CZ8A 1VJSA 2EEXA 3CO4A 4BS0A 3VIGA 4PCTA 2E9MA 1ISVA 3VPLA 4HMDA 1GONA 4JFSA 1J12A 1VJZA 2WLZA 4TOQA 3AFBA 1LG1A 1QBBA 1RD6A 3AYRA 3VIMA 1QNPA 1UD3A 4HP5A 3UG4A 5A6SA 1V6WA 2WC4A 1MVYA 5CXPA 2XYLA 3RM8A 4PTMA 3K1DA 1UKTA 2DIEA 2ZX7A 3EMCA 3K8MA 4FLRA 3T0DA 3JUGA 1QNOA 5D8WA 4CD7A 2WANA 2BHZA 2ZUMA 1VB9A 5FL0A 5GPRA 4CU6A 2X2YA 3QGVA 2J7CA 4J3XA 4MB5A 1HJQA 7CGTA 1WP6A 3NSNA 1OD0A 3SCVA 4CVWA 3SUWA 3WUFA 2PC8A 1SFSA 5JBFA 1UZ4A 2O9TA 2X05A 2DH3A 4U2YA 1KGUA 3W6LA 1CXKA 1V0KA 1PBGA 2VI0A 1V02A 3A4WA 4D6JA 4TTUA 1GOQA 2YL8A 2EO7A 3WQ4A 1QI2A 4YN5A 4JAWA 1WAWA 2G3NA 4ZXLA 3WMBA 5JBDA 2GVYA 2ZXBA 1V3MA 5A94A 2ZUSA 3CBWA 2CKSA 2A3BA 2WSKA 4GINA 4JKLA 4TVUA 4URIA 4W7UA 4W87A 2J4GA 2YLLA 1CXLA 1BG9A 4GZIA 1WDSA 1WZKA 2WXDM 3OBAA 2ZX9A 3ALGA 4HZ8A 2BHUA 2ZX6A 5E70A 1UKPA 1LWJA 4CD5A 1W9UA 2W66A 5DT7A 3QHMA 3GZAA 3THCA 2CBIA 4A3YA 4MAZA 1DWFM 4A3HA 5IXEA 1UR1A 4Z2HA 3T09A 1ESWA 1NOWA 5E6YA 4D6DA 2WVTA 5A6MA 4M82A 3WELA 4S3JA 3WD2A 1UD4A 1CLXA 3GXFA 5D4YA 3WH6A 1KBBA 1NOFA 1WKYA 3SCSA 2ZXDA 3L2MA 2VUYA 2ZICA 3N12A 5LA0A 2WHLA 2CBUA 3WNOA 3W81A 4LXFA 1W9DM 4LYQA 3FNDA 1OCQA 2YA1A 1E40A 4E4PA 3ZIZA 1W2VA 2ZX5A 1FP9A 3L4UA 3OGVA 2J7HA 4HOZA 2VOTA 3FXYA 1GCYA 1KGXA 4AD0A 3W37A 2WKLA 2EJ1A 1TG7A 4PMYA 4OZOA 2VZSA 4GQQA 1H5VA 3TTOA 1O7AA 2GJPA 1W91A 1JDCA 4HMCA 4WKAA 2FGLA 2G3IA 3SIMA 3VNYA 3SUUA 3WKZA 3WQ5A 4XZBA 1B2YA 3HN3A 3K4DA 3BAKA 3AROA 4X9YA 3VDHA 3MSDA 3VIHA 1TUXA 2WYSA 4PCSA 3B9DA 3ZT6A 1JYVA 3MUZ1 3EDKA 2J74A 2XFYA 1XHGA 1CGUA 1OWQA 4JFWA 4A4AA 2EQDA 2JF6A 2VQUA 4LYPA 3PZTA 1EHNA 2YDRA 4EKJA 1CGXA 1DP0A 2A3AA 2WWCA 5A8PA 1AQHA 1A47A 1ODZA 4PSRA 4PMDA 5BXPA 3K8KA 4UQDA 1CECA 5KEZA 4WIWA 2J7DA 3FW6A 4KRUA 1V0MA 3VD4A 1JYNA 1R7AA 2D24A 3W4RA 1DHKA 2VX4A 2DT1A 3A4XA 1H09A 5BXRA 1WDRA 4QAWA 3CZJA 2VX6A 2NT0A 3AMKA 4ZEPA 4PMNA 3RO8A 3PZUA 1TVPA 1IZKA 2GSJA 4WJXA 4PMUA 4MNLA 4D72A 2VZTA 3POHA 2ZX8A 2DSZA 1W3JA 5I3DA 4AZHA 4C7FA 3N13A 2WC7A 1GQKA 1TMQA 1PZ3A 2WMKA 2WNWA 3I3BA 3WQ8A 4ML4A 3PN8A 5ABFB 1GOWA 1W32A 2E3ZA 4QCFA 5ABGA 4QFUA 3VMNA 3VGHA 1R87A 1XSIA 3WDHA 3T2OA 4PTXA 1QI0A 3WMSA 3AIWA 2FH6A 1KWGA 3CUFA 3W28A 3CMGA 3SUTA 3D3AA 1Y7VA 1EGZA 5A1AA 4N0RA 1B9ZA 2JFEX 2VL4A 4U33A 1FA2A 3SCQA 1GVIA 1FHLA 3MS8A 5IHRA 1B3ZA 1US2A 2QV4A 1VBUA 3B9AA 3IJ9A 4CN6A 3SUSA 1E15A 4LQ1A 1XSKA 3G6LA 3T2PA 2ZWZA 4Z2LA 3DC0A 3BSGA 3GBDA 1GQIA 4TVCA 1CPUA 1LG2A 5BWFA 1MW2A 4UQAA 1U33A 4P7OA 1J0JA 3CH9A 2AAAA 2O9PA 2E40A 3ZSSA 2XSBA 4QP0A 1E4NA 4UOQA 1V0NA 2FHFA 4GIAA 4B3LA 1OGSA 1YQ2A 4PEEA 3BAWA 1NP2A 5E9AA 1HKIA 1I1XA 4D6GA 1XGZA 3WH7A 3U5UA 3AQUA 3M7SA 2F61A 4RE3A 2GK1B 2CHNA 2YOCA 1H41A 4NRSA 3CUIA 1J0YA 2WMJA 4MNKA 1JXJA 5HDRA 4ATLA 1JZ4A 3UERA 1BVNP 2BY0A 3WDJA 4AISA 3A47A 3MANA 2D20A 1U2YA 3J7HA 3TTQA 4TXEA 4MPKA 1E3ZA 3SUVA 3O6AA 5D9OA 2HVMA 3VU2A 1DTUA 4XUYA 4YHEA 3RILA 2BXZA 1MWOA 1ISZA 4HTYA 2VT0A 5IFPA 5E0CA 4TVDA 1QI4A 3EYPA 1UKOA 1I1WA 4IM4A 5BYWA 4DWSC 2Y5EA 1CGWA 3SCPA 2WB5A 5GNXA 3WD1A 2JIWA 4Z2KA 3VGFA 1CNVA 1JD9A 1PIFA 1WZAA 4LYRA 4NI3A 3AIQA 4GQRA 3VIOA 3WDIA 4HPGA 1GORA 2D0GA 2Z1KA 3MMWA 5HBFA 3ARUA 1JZ6A 5ECUA 3ARQA 4HZ7A 1VAHA 4KGJA 2DPEA 6TAAA 1JFXA 3AIRA 5CPTA 5GNZA 2XVGA 3KL3A 4XX6A 2WKGA 3LMYA 6A3HA 1JZ7A 1BYDA 1LLOA 7A3HA 3UG3A 1EHAA 1H2JA 2OSWA 4WKHA 4FLOA 3ZM8A 4UFKA 4AEEA 3PHAA 2EPOA 1CGVA 3O2LA 4X0NA 3VDBA 2FDMA 3WH9A 1NOUA 1S46A 4OBSA 1V02E 2GDUA 2WHJA 3SCOA 4ZFMA 4DM1A 3TP4A 5EMYA 1LWHA 2Z1SA 4AD2A 5HOSA 5CSYA 1K9FA 4W5ZA 1KQYA 1UR9A 1UWSA 1G0CA 1PPIA 1UUQA 1MYRA 5CSUA 1NWRA 3VINA 1E1EA 1FH9A 1Q4NX 3BCFA 3EMZA 3WMCA 1JL8A 3WIJA 5M03A 2W67A 2X09A 4HA4A 1BYCA 3EDEA 4AZIA 4Z2IA 1PX8A 3OZOA 2XM2A 1TVNA 4NSBA 3L4ZA 4K68A 3QOMA 2V3EA 2Y8KA 1OB0A 4LX4A 1XV8A 3ZJ8A 3AHXA 1QOXA 4B9YA 1HIZA 1O6IA 3WL1A 4PMVA 1V6UA 5A6AA 1MW1A 2XIIA 2QHAA 2XFFA 1KXHA 3VIPA 5I24A 1OIMA 1UD8A 1QHOA 3WDRA 1NQ6A 4QCEA 2D23A 1HKMA 5C71A 4UOJA 4TX6A 1EO5A 3CZGA 1FHDA 3A6OA 1WDPA 2VRQA 4JCLA 1KXQA 3B9EA 4TTGA 5CPSA 3GNPA 1JYWA 1E4MM 4J3TA 4CCDA 4Z2GA 4AD4A 2Y24A 1SMDA 2WLYA 3BAXA 5A6JA 4MB3A 1FFQA 9CGTA 5I0DA 1EDQA 1M01A 5D8ZA 1WCGA 3CPUA 3IAPA 3WBEA 1EIBA 4V27A 5A6BD 1V3JA 3F5LA 1UR4A 1DWJM 3PTQA 1TR1A 4WSKA 3VM5A 3RDKA 1GNXA 4W7VA 1H49A 3ZO9A 1HVQA 3WN6A 4HZ6A 3PTMA 1JZ2A 4D71A 3OIHA 4JL2A 2GUYA 2VCCA 2FGZA 2XVKA 1WZMA 1J0IA 2XWDA 3ARVA 2XVPA 2V5CA 5HXMA 3AIEA 1V6XA 3ARWA 1DWIM 1GHSA 1V3HA 3AXXA 2EXOA 3M07A 1H11A 4UFLA 1E9LA 3VIFA 2VVNA 1QW8A 4JKMA 2XSAA 4N42A 3M6DA 4BZYA 3BAJA 2J79A 4KGLA 4J3SA 5GQBA 2D2OA 4MB1A 3AXIA 2XTKA 1ODUA 4QLLA 4PMOA 1KFWA 3RCNA 4GKLA 2J7FA 4FLQA 1XRVA 3FY1A 3LPOA 3WEMA 4W5UA 2Q8XA 1BF2A 1A3HA 2F8QA 2VR5A 2WWDA 1EOMA 3AICA 3DYOA 1F4HA 4ACYA 2ZOXA 2ZUWA 1BYAA 1UH4A 5A3HA 1GVYA 1K9DA 3E1F1 2WM0A 5DF0A 1J10A 1XD0A 3W25A 1EH9A 3L4WA 4M1RA 1E4IA 2RGLA 4AMCA 2YLAA 2F2HA 1HL9A 4D6CA 1AQMA 1TE1A 1KB3A 1LL7A 3AS1A 1L0PA 4P7LA 4D1IA 2VZOA 5ABHA 1W3KA 2X8RA 2X0HA 4XV0A 3MUAA 2CETA 3LPFA 1W1VA 1IV8A 2CBJA 1VIWA 2W62A 3AHZA 3WDQA 2QPSA 1MW0A 1FH7A 3TTYA 3VILA 1B90A 2PF0A 4IISA 2BHYA 1X6LA 4UFMA 2YL5A 4FK9A 1B31A 3CZLA 2DH2A 1XYZA 2OLHA 5EFFA 1PAMA 3WEZA 3NYDA 3TONA 2YA2A 1JYXA 3L2LA 2BFGA 2WVSA 1C8QA 2G8ZA 2WCSA 1E70M 5A6BA 4ZE4A 3W82A 3AIVA 1NM9A 3GH7A 1X1NA 5FD0A 2D3NA 2PBOA 2W91A 1CXHA 5LA1A 3OB8A 1B30A 2AMGA 1EOKA 2V5DA 3GXIA 1US3A 4HA1A 2CYGA 3WF1A 1JXKA 2BS9A 1VENA 4F66A 4PN2A 3VNZA 1CXIA 2PWGA 5IHSA 4CD4A 1WDQA 4EANA 1R86A 3AISA 1ZS2A 2QPUA 2UY5A 4U31A 1BAGA 4AZCA 4GI6A 1OT1A 3O9NA 4MDOA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2VVS A;  3CHD A;  3F5J A;  3IAQ A;  2CXG A;  3L4V A;  4U3A A;  1DWA M;  4CD6 A;  1G5A A;  4MNJ A;  4AEF A;  1PX3 A;  3VM7 A;  2WMH A;  1W1P A;  4W8A A;  3PZG A;  4UQB A;  1G1Y A;  4V28 A;  1KWK A;  3AS2 A;  3GNO A;  2B31 A;  1U30 A;  2XPK A;  1HKJ A;  1NP0 A;  4KRT A;  1GJW A;  3W24 A;  1EQP A;  5D9P A;  3VD3 A;  5GNY A;  1AQ0 A;  3RJX A;  3SCW A;  1V3L A;  1D3C A;  3AMC A;  2ZXQ A;  5JBE A;  2E8Z A;  2DSK A;  4AIU A;  3AMG A;  3OGR A;  2DT0 A;  2D0F A;  1JGI A;  1UA3 A;  3N1A A;  2DSU A;  4DWS A;  3VX1 A;  1CWY A;  3VD7 A;  4TUF A;  2J7G A;  1OIN A;  3VO0 A;  2VZU A;  2WHK A;  1UD6 A;  3N11 A;  3FAX A;  1HP5 A;  5A6L A;  4CKQ A;  3AIB A;  3MUY 1;  4JFU A;  4PTV A;  1JD7 A;  4PMR A;  2OWC A;  1W9V A;  1H0I A;  1UQZ A;  2XM1 A;  4E8C A;  4YPJ A;  1HN1 A;  2BVT A;  1BHG A;  1K9E A;  1H0G A;  3IK2 A;  3RPM A;  3GDB A;  3NSX A;  1LL4 A;  3AIU A;  3WUB A;  4WLC A;  5DMY A;  3KL0 A;  1W9P A;  2CNC A;  3HJE A;  4WK9 A;  2ZWY A;  3VD5 A;  3IJ8 A;  3ZJ7 A;  4E8D A;  2DDX A;  1MQQ A;  3WD3 A;  1B3V A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4C6B A;  1J2B A;  1YDO A;  1GZ1 A;  2ZID A;  1TPF A;  2R91 A;  4Q4M A;  4ERG A;  3O63 A;  4HOW A;  4K36 A;  3ARR A;  2PGW A;  1AJ2 A;  1T8X A;  1O4U A;  1Q6G A;  2C0H A;  2E67 A;  3IS4 A;  3OLD A;  4OIF A;  5DBT A;  1WV2 A;  2I57 A;  2WZE A;  3GNX A;  4RV3 A;  1GOI A;  3LCW A;  2F7F A;  3SRK A;  3VDG A;  2WCA A;  3V4B A;  1FKX A;  3AHT A;  3LYE A;  2P50 A;  2XHY A;  3LEN A;  3BLO A;  4DLF A;  1EP1 A;  1A53 A;  3ZOA A;  1K7X A;  1Q7Q A;  1DWH M;  1TX0 A;  3Q45 A;  1AL8 A;  4HN8 A;  3LG3 A;  4B3K A;  4MNM A;  1ZGD A;  2CLM A;  1PVN A;  1EQC A;  1BSI A;  3I10 A;  3U2Z A;  4LAN A;  1EYW A;  5C7H A;  3CMF A;  3KWS A;  2QUN A;  2AKZ A;  1AOD A;  4EAM A;  1ZJI A;  4NUW A;  4HYR A;  3NJ3 A;  4YTT A;  2E9L A;  5EBA A;  2IXU A;  4QQU A;  3CGT A;  1V6Y A;  1XCW A;  4CUC A;  1R6W A;  3IV8 A;  1LCO A;  3TR9 A;  1JCX A;  4PMQ A;  1Q7Z A;  3GVR A;  1GOM A;  4MJ2 A;  4O1C A;  2J8G A;  5K9D A;  4DO5 A;  5RUB A;  2X16 A;  1LRN A;  1SJB A;  1GK8 A;  2Q01 A;  1RBA A;  3DFT A;  1PHQ A;  1WQ5 A;  4Y9M A;  4R7J A; 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