2PC4A

Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase from plasmodium falciparum in complex with trap-tail determined at 2.4 angstrom resolution
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
364
structure length
359
Chain Sequence
HCTEYMNAPKKLPADVAEELATTAQKLVQAGKGILAADESTQTIKKRFDNIKLENTIENRASYRDLLFGTKGLGKFISGAILFEETLFQKNEAGVPMVNLLHNENIIPGIKVDKGLVNIPCTDEEKSTQGLDGLAERCKEYYKAGARFAKWRTVLVIDTAKGKPTDLSIHETAWGLARYASICQQNRLVPIVEPEILADGPHSIEVCAVVTQKVLSCVFKALQENGVLLEGALLKPNMVTAGYECTAKTTTQDVGFLTVRTLRRTVPPALPGVVFLSGGQSEEEASVNLNSINALGPHPWALTFSYGRALQASVLNTWQGKKENVAKAREVLLQRAEANSLATYGKYKGGAGASLYEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Aldolase provides an unusual binding site for thrombospondin-related anonymous protein in the invasion machinery of the malaria parasite.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 126
structure length 359
sequence length 364
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2pc4A00
4OE7A 3DHDA 3LGEA 4LV4A 3LX9A 2DORA 1M7OA 1S5TA 1KM6A 2I14A 4LVDA 3W7EA 4HNUA 1MO0A 4DPQA 4K37A 2ZZ1A 1WV2A 5D03A 1I2QA 3TK7A 4UTHA 3USBA 4Y90A 3TSMA 2DP3A 3ATZA 3O15A 3R13A 3N9SA 1XBZA 5LNUA 3G1DA 3NNTA 3W73A 3LCLA 3NPWA 4PL2A 5F2GA 4NJHA 1I2PA 4MPQA 3A5VA 2ZRVA 2I1OA 5CZ0A 1XDMA 1W8SA 4O52A 1KM4A 2ZDRA 3W7KA 3P81A 3GKFA 4XWUA 3TQ0A 1KV5A 5MHBA 2GQAA 2HTMA 1QWGA 4MVAA 1YTEA 2H3DA 3W7PA 3W3OA 2FDSA 1VR6A 3TXVA 3GDRA 3DFOA 2C0AA 5AC8A 4JYFA 5BW6A 3MO7A 1TPFA 3OIXA 1S5VA 3W7RA 3ZWSA 1YTKA 1UCWA 4R33A 3TDFA 3PC0A 3EEGA 2QCFA 4N6FA 4POCA 4ZQOA 2YFOA 3KVLA 3FKKA 3BPWA 3DFSA 3GZ3A 4LUIA 2V0TA 3LHUA 1WYIA 1MEHA 2HSAA 2CU0A 3MBDA 5AOUA 3KFTA 1H60A 4M6QA 3W84A 2ZBTA 4ADSA 1W5MA 4YXGA 2V9DA 4DEFA 4N2YA 2H8ZA 5LNWA 3BARA 1MZHA 3RMJA 2ZTKA 1XFBA 3H53A 5HULA 4NUWA 4PA8A 4IWWA 1WQ5A 3E0IA 1DBTA 1SO6A 1QCWA 3EKLA 1OG0A 1IXOA 4MJZA 4CQAA 1H7NA 2GVJA 5F1VA 4LV9A 1XI3A 1AMKA 4HT3A 3MW7A 1DOSA 4X22A 5I3IA 1IGSA 1WAUA 1QAPA 4WX2A 4CNNA 4DXVA 1LBMA 4OT7A 2YDAA 2C15A 4GE8A 3UD6A 4QNWA 3NDOA 1G67A 4WUIA 3SW6A 3M44A 5CZSA 5AYYA 1Z41A 2AAMA 1ADOA 1GVFA 5CSSA 5CPMA 3QPZA 2X1TA 3STCA 4IX2A 2CWNA 2RH9A 2Z2UA 2P1FA 3SECA 3W88A 1SQ7A 4I7VA 2Y62A 4OGZA 4UFHA 5LSMA 1OFBA 3G0XA 3S9YA 1FDJA 4E2DA 3W7DA 1HUVA 4QIUA 3OA3A 4R34A 1LOLA 3T78A 4O14A 1A5AA 1AL8A 1ALDA 3FOKA 4JYDA 1G7UA 1MXSA 3TU9A 4TMBA 1YPFA 2E77A 3TKFA 1VRDA 4TU1A 1GG1A 1GG0A 5K9CA 5DBUA 3W2MA 4M19A 1K03A 2G95A 3NOEA 3KXQA 1QOPA 3GDKA 3C56A 4HN4A 1Q6LA 3QMSA 4H3DA 5HWMA 4JX4A 1KLYA 3HIJA 1IIHA 3LCXA 1QR7A 3BW4A 3RLVA 3NA8A 3SI9A 1K8XA 1XM3A 2VFIA 3S5ZA 3NQDA 5IM51 1Q3NA 5AFDA 2H90A 1NF7A 4AB4A 3TW7A 4JTGA 5LKYA 4ZL1A 5F1UA 1MSSA 1VYSX 4OV4A 3O6CA 1Q6OA 3LHVA 4ORIA 1MEWA 4YLWA 3NL2A 4R7JA 3TROA 2BX7A 3I6RA 3QMTA 3TSBA 3LRMA 1LROA 4JEQA 4DF2A 2ZRZA 3SR7A 3EWWA 3T7VA 3W86A 5U4NA 4AWTA 2NWSA 4BR1A 3DI1A 3A9IA 4AXKA 3W2JA 1JCJA 3KX6A 1G7VA 4HNVA 1A50A 3GKAA 4A2RA 4RXGA 3KVJA 1SW0A 5FF0A 2TSYA 4QSHA 4ZZ9A 2PURA 1TJRA 5H2ZA 3T4CA 4C1LA 3GDTA 5E93A 3CC1A 3W1TA 1VHNA 1HG3A 4RKAA 1NFBA 1RQEA 4AMAA 4UMBA 2J9ZA 4EF8A 4Q32A 4TO8A 3W1NA 5HJLA 1K7FA 3GB6A 2NXIA 2B7PA 4EOUA 5EPDA 2CZ5A 4RXFA 4O17A 1H5YA 4IMGA 1AK5A 4NXKA 2OJPA 2PRMA 3P8JA 4JD4A 1PE1A 2VFFA 3PG9A 1RVGA 4E38A 2CFFA 1VZWA 3JS3A 1FX6A 1G6CA 3HG4A 3N2XA 4Z1DA 4JNMA 4NXSA 2G97A 1BEUA 4KWVA 4ZMGA 1ICSA 1ICPA 1F76A 5BNKA 1WOBA 1V5XA 4ZVJA 2C14A 3QW3A 4AHPA 3NYZA 3W1LA 4B5NA 4ADTA 5TQLA 3W1XA 3LXAA 3PR2A 3P8IA 3WJSA 4WY0F 3S6DA 3W70A 4XBSA 1SSDA 5FF4A 4FIQA 1FY6A 3QQ1A 1LCOA 3MHUA 3HPXA 3IV3A 3LRLA 4WD0A 3DFPA 1MEIA 4QISA 1OFDA 3NM3A 4W9TA 3SIZA 3P61A 2ZA3A 3LERA 3RFAA 2CZEA 4NJJA 4RZ4A 2VEMA 5KSWA 3KAOA 2TRSA 1BWKA 3RLUA 3B03A 2QCEA 2HS6A 3EX3A 3OHIA 4GWEA 6TIMA 5LNRA 4IOTA 1TO3A 1QPQA 3PG8A 3GDMA 5IBXC 1G69A 2DZWA 4RX0A 1K7XA 2Y6ZA 3CTLA 4FEZA 5DN1A 4MZ8A 3B0VC 1KFEA 3WK0A 4PTNA 2ZCGA 4QNEA 1HO1A 4QQ3A 4Z0SA 1L9WA 4FIRA 3OVRA 1JQVA 2V5LA 3CLMA 1W1ZA 4HSNA 3LTSA 6ALDA 3O63A 2X1RA 3ABSA 2QAPA 2J27A 3E9AA 4PC8A 2YXGA 3EXRA 2OCZA 3MI2A 1XCFA 1EP2A 3DFTA 4UCGA 2BTMA 4MFEA 4TX9A 1O60A 2CLKA 3AJXA 4XBKA 1TMHA 3QRHA 1EUNA 3M41A 2LLEA 2A21A 3U2OA 1EUAA 1OFEA 3F4NA 1KM0A 1W3NA 1JVNA 2EHHA 1KFKA 1YDOA 3HPSA 1DHPA 2Y70A 3VCRA 3M1ZA 4R53A 2BXVA 2C19A 1IXNA 4LS0A 3IIPA 2YW3A 2ISWA 2WNZA 5K9DA 2A7RA 1W5PA 3NXFA 1B4KA 3SGUA 2ABBA 2R94A 3R89A 3KRUA 3BVJA 4UTKA 1HTIA 4ALDA 4LVFA 3QMRA 1R46A 2NUWA 3LXBA 2XN1A 5FEPA 4JN6A 1FXPA 5DBTA 4FX7A 1GTEA 4XUGA 5G2WA 1OYCA 4LUJA 5FF7A 3W1UA 4GFSA 1RV8A 3E12A 4N9BA 1RQBA 1UB3A 4JDBA 2CLEA 4O4WA 3B0UX 1S3HA 3IRDA 3C3NA 2GQ8A 5I3JA 3LHYA 4UUIA 4UFJA 2E5DA 1JQXA 2YYTA 4NJIA 3STEA 3DKJA 3LCHA 4KWWA 4RV8A 2E5BA 4M6VA 3S42A 3W2NA 5BMXA 4CCDA 3TIMA 3CT7A 1B57A 1DJQA 4FB7A 3DGRA 5D2VA 4ADUA 5DY3A 2Q3OA 5F4XA 5D37A 2Q3RA 1DQWA 3PBWA 2PRLA 5F2MA 5CKSA 3WK1A 2C1HA 3KRSA 4Q33A 3YPIA 5AHFA 4IPIA 2CZFA 1FWSA 2VELA 4DELA 3AO0A 1OYBA 4GUGA 1JUBA 1YXCA 5FESA 5A5WA 4JTTA 4UMAA 3E49A 4JY9A 4P2VA 2NX1A 4GUHA 1UJPA 1VLIA 4YWIA 4UMCA 1GJPA 2A1YA 3BLFA 3P7YA 4ZQPA 1JR1A 3PUDA 3TJXA 4HSOA 2HS8A 2FQIA 5I3FA 4N4PA 1TPH1 3NVTA 2ALDA 2V8ZA 3IGXA 2XFWA 1JULA 4O1CA 2NUXA 4K7VA 1ZENA 3GIYA 1X6UA 1X1OA 1X1ZA 2KZHA 3P84A 1AW2A 1LYXA 2CLIA 1VHCA 2ZRWA 1BKSA 3W22A 5FF3A 1K3UA 4CNPA 1TB3A 1H50A 1XXXA 1DV7A 1UBSA 4NX0A 2RDWA 2V2CA 4JTIA 3W75A 3TSDA 1SPQA 5EY5A 2V2DA 1OHLA 3H54A 5TBOA 2CLLA 4MKNA 3NQ6A 1XC4A 1W3TA 3PULA 5AC7A 2EKCA 1H51A 3F03K 4ONVA 4O1AA 1QPOA 1EP1A 1IF2A 2YGYA 1GVSA 3W1MA 3CQ0A 5LHFA 2NXGA 3P5YA 3G3DA 4JIPA 4CNOA 1LBFA 1LLWA 1XBXA 4CCCA 3S1XA 3N2MA 3CIWA 3GVGA 3PUOA 4N9CA 3BGGA 3NQVA 3G1XA 2CZDA 3G18A 1KFLA 3UXDA 3HG5A 3U8GA 4TIMA 1TTPA 1H61A 4K6AA 4G1KA 4EIVA 4MUZA 1K8ZA 4RK8A 3BV4A 2FPVA 1WBHA 3EX2A 2NLIA 2HMCA 4CLMA 2V2HA 3HQ1A 4FNUA 2UV8G 5EKYA 3A21A 2E5CA 4TMCA 4IJBA 2C16A 1ZAJA 4JICA 2OT0A 3W7OA 4I7UA 1FCBA 1F05A 3A5FA 2VOMA 3DBPA 2WSQA 3L21A 4NX5A 3NQGA 2H6RA 2QCLA 3TFCA 1TPEA 2FB2A 3QEZA 5HNRA 1F6KA 1Y0EA 1SW3A 4KFNA 1VPXA 3M5ZA 3EB2A 5D2YA 2NZLA 4GC4A 3C8FA 3L67A 5GVJA 3HBLA 2RFGA 3OBKA 1R2RA 5LNSA 2TMDA 1YTDA 1WX0A 1PCKA 1DORA 1VC4A 3C4UA 4LY8A 3H55A 2D73A 2FB3A 3MHGA 4IMEA 4M7SA 4LRSA 1G4TA 2QDHA 5K4ZA 3GXPA 3HPZA 1O4UA 3S8HA 4MY1A 3P82A 2QCCA 3ABQA 5BMWA 3PSWA 4JTFA 4DF0A 1IIGA 1OABA 4BI5A 2WO5A 3RF9A 1B9BA 1O5KA 3IEBA 1GVQA 4ICNA 3S5NA 2B4GA 1QMLA 1HFBA 3S5YA 3C52A 4Y6GA 3SFKA 4S2CA 5KITA 4D2JA 1ZCOA 4LOCA 3UWVA 3MMTA 2ATMA 1SSGA 1EP3A 4QM1A 1JCYA 4NQ1A 2E09A 3G3MA 3NPUA 2EF9A 2BSLA 1PL9A 2ISVA 2I9EA 1P0KA 3MHFA 1THFD 5AHMA 3NL3A 1N55A 2NXHA 3LLFA 3VFLA 4UXDA 4HNNA 5K9XA 1QNVA 3PF3A 5EA9A 5J5RA 3KVMA 1A5CA 1ZFJA 1DL3A 1R47A 1DKWA 4GUJA 2Y7GA 5LNVA 3W1AA 4MFDA 3S0CA 1VH7A 1YYAA 4MY9A 3LBMA 4AWSA 3V1PA 2ZA1A 2JK2A 3JRKA 3C2VA 3W07A 4O8RA 2Z0IA 4S2BA 1Q45A 2P0OA 1ZY9A 3HGRA 3N73A 2QDGA 3UPWA 2X1SA 3STFA 3W7CA 3W76A 4U4MA 2E6AA 2VC6A 1L6YA 2DZPA 3UPBA 1TTJA 3WJYA 3LLDA 3WK3A 2WQPA 3P5ZA 1NF0A 4JIQA 4NJKA 3NM1A 1CX9A 3HB9A 4NVTA 4XTDA 4M5PA 3LXCA 1YDNA 3VI2A 3BO9A 2VFEA 4ZQRA 2QAFA 1KM5A 4MYAA 4UTWA 1LORA 4AEOA 2Z1BA 1KW1A 1O94A 4WY0A 2YCEA 2FPYA 1W37A 3TQKA 3CEUA 1B4EA 1K02A 3LCGA 4CCEA 3NQMA 3N19B 1VYPX 2NX9A 4OHQA 1H62A 1QDSA 4WY0B 3N3MA 2X1UA 3TAKA 3NZRA 4DO4A 2P10A 3CWOX 3ZWTA 2NV1A 3QM3A 5CPLA 1LOSA 4H4IA 4Z1BA 5E1QA 1GOXA 2H3BA 2BZNA 1RQHA 1H7RA 2PCQA 2WV8A 3UWWA 5EYWA 2YSWA 3DENA 1LLZA 2CW6A 2WOQA 5TIMA 1I45A 1OFAA 3STGA 3WFAA 5DELA 3P67A 5FEWA 3WK2A 2YPIA 3E96A 3TQVA 2G96A 1NSJA 4O15A 3PAJA 4O19A 4ZQNA 1GYLA 1SFLA 4MIMA 1Q6RA 1OFRA 5HR6A 3NQCA 3D0CA 1FWWA 4ZQMA 3G1SA 1D3HA 5T26A 2B7QA 2OZ0A 1J4EA 1WXJA 3INPA 1T96A 1KTNA 3S1UA 2Y7DA 2H8XA 3HO8A 1P1XA 4LU0A 1UUOA 3DH7A 1QPNA 4O13A 1KLZA 3P80A 3WJZA 1R2TA 1OJXA 4FO4A 4IGHA 3PS7A 5C55A 1J5TA 4OBTA 2WKJA 1LRTA 5AC6A 4BFAA 2W6RA 1OX5A 2FJKA 4AH7A 3DI0A 2B7NA 2VXNA 1M6JA 2Y61A 4K8EA 3PB2A 1F2JA 2CLHA 3S1WA 3DKLA 2CLFA 1W5QA 1TIMA 4AWUA 5KTLA 1L2UA 3LCIA 1KBIA 3L66A 4A29A 1LM1A 3C2EA 3SGZA 4MLJA 4EWND 1O95A 1VCFA 1QPRA 1TTQA 1TRDA 3E02A 2WSRA 4O53A 5CG7A 1FWTA 4N4QA 1Z48A 1OFQA 3TJLA 3LV6A 3DFQA 3CHVA 3NZ1A 1C29A 4LT9A 3DHFA 5L9FA 1I2RA 1TPVA 3WJWA 2OX1A 2FLIA 3I65A 1YXYA 2A7PA 4K38A 3O8AA 2TPSA 3B0PA 3LOTA 4O1DA 3EXTA 2A7NA 1W56A 2DZVA 1OX4A 3W7HA 4AVFA 1LDCA 4UNLA 3W2LA 4BWLA 1W31A 1OX4B 3QYQA 3SJ3A 1YXDA 4O57A 5KINA 4BWLC 3PY2A 1YLVA 3CPRA 3C6CA 1OX6A 3GK0A 4Z08A 3W7IA 1VCVA 3QZEA 1KFCA 3FYOA 3UZJA 4H6KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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