2PC8A

E292q mutant of exo-b-(1,3)-glucanase from candida albicans in complex with two separately bound glucopyranoside units at 1.8 a
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGQWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Carbohydrate binding sites in Candida albicans exo-beta-1,3-glucanase and the role of the Phe-Phe 'clamp' at the active site entrance.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hypothetical protein XOG1
molecule tags Hydrolase
source organism Candida albicans
total genus 150
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2pc8A00
3CHDA 1IZKA 4CU8A 4CD5A 3VIJA 1V6UA 4D1JA 2XYLA 4J3XA 4MNMA 1KB3A 5I5RA 4J3SA 4BZYA 1UWQA 1KCKA 2WPGA 1VEOA 4P7QA 2YA2A 1J12A 3CIVA 5JBEA 4P8VA 1PEZA 3SURA 2XIBA 1IV8A 3W0KA 1EQPA 1W1VA 1YQ2A 3WQ6A 1UH4A 5ABHA 3WUEA 1W1TA 3AIUA 3KL3A 1V3MA 2W5FA 1E6PA 1CIUA 3HU7A 4J3VA 1MXDA 1GORA 3WDRA 1V6WA 4HPGA 1KR0A 5BXTA 3WEOA 4K68A 5DF0A 1US2A 3IJ7A 1TR1A 2GK1B 2YDRA 3W24A 5A6JA 1H41A 3UEQA 1LJYA 4W7VA 5A6BD 3GH7A 1E6SM 3W82A 1HJWA 1HL8A 1FH7A 4H8HA 1CECA 3AYSA 3WL1A 3SCWA 1WP6A 4JZ5A 1BPLB 3WF4A 1CEOA 4H7VA 4UQEA 2WVSA 4Q7NA 1E0VA 3RILA 4NSBA 2V5DA 2X09A 1J0HA 4JFVA 4Z2HA 3EDJA 3WUBA 2G8ZA 3IANA 2E40A 3AIBA 4JFWA 2XGBA 3MU7A 3NIYA 1QOXA 3OLEA 4PMQA 5M17A 2WHJA 1V3LA 3AMKA 2XVLA 4NRSA 2BXZA 4PMDA 2WCGA 2J7GA 3N1AA 4GZEA 4JFUA 5EFFA 4B9ZA 5D8WA 3FHQA 1VJSA 1RP8A 3L4WA 2OYMA 3W6MA 1W1YA 2PB1A 3MUAA 1XGZA 2GDUA 2NT0A 3KL5A 2BY3A 2VR4A 1MVYA 5A3HA 3EMQA 2CEQA 1V3KA 4AZCA 4D6JA 4W8BA 6TAAA 4L4OA 5HXMA 4DWSD 4MJ4A 4V27A 2NT1A 1TG7A 2VX6A 1K9TA 4M82A 1HJQA 1UWTA 2W67A 4PYSA 3F5KA 2YLAA 1GUVA 3WNKA 2VUYA 1XCXA 4CVWA 4WLCA 1W9PA 2VMFA 1H3GA 1UH3A 5GNYA 5D9PA 2YJQA 2C0HA 3VIOA 1BG9A 2VCCA 3CZGA 3VTRA 3VKKA 5CG0A 4M29A 2J77A 4GIAA 1MW0A 2BHYA 3BAYA 2YIHA 2CBJA 3UETA 4OOZA 3VDHA 1GJWA 2E9MA 3FY1A 8A3HA 2YDSA 4UTFA 2EQDA 5IFTA 1GHRA 4P7LA 3SUUA 4AZGA 2BY1A 1SYTA 3L2MA 2XHYA 1Q6FA 3VIKA 5I0DA 2J7BA 1BLIA 2VX4A 1JIBA 1JXKA 1OD8A 3AFBA 4CN6A 4HU0A 1JDDA 4ML4A 2OWCA 4JL2A 1BVNP 3VIPA 5FOOA 4PMRA 1CXEA 2PWHA 2E4TA 5GNXA 4AISA 4ZE4A 4X0VA 1R7AA 4XZBA 4A4AA 7TAAA 4MNJA 2XFYA 5A95A 1ZL1A 4P8WA 2WVVB 5I3DA 4EANA 1B2YA 5CXPA 2DIEA 1ITCA 1JXJA 3ARRA 3WEZA 1PIGA 2D1ZA 1VBRA 3FW6A 4UNIA 4J28A 3CUFA 4MAZA 1BYAA 1QVBA 3ARWA 3SCVA 1W9BM 2WMIB 2D20A 3UG3A 1JI2A 4NF7A 4MPKA 4HP5A 1QBAA 3VIMA 3THDA 1DWFM 1QW9A 2EPKX 3SUTA 2XJ7A 1MW3A 4UFLA 3L2LA 5A8PA 5A8MA 3WD3A 1BGGA 3TA9A 5JBFA 1GZJA 1ZJBA 2V3FA 3MUZ1 2DT3A 3OIHA 4AW7A 1KBKA 4HA3A 1WZMA 1E6QM 1M01A 3BAJA 3W25A 4ACYA 3ZMRA 1WZAA 1CDGA 3AIRA 1CENA 1V0LA 4Z2JA 3WBAA 2F61A 5LA2A 2XIIA 4FMVA 5I2UA 4Z2GA 3CZLA 2BY0A 3NJ3A 4FK9A 3KZSA 3QHNA 2QMKA 2A3BA 1K9EA 1Q6DA 3ZJ8A 2O9TA 1JD9A 3B8SA 4KGLA 4U31A 3N9KA 1EHNA 5EBAA 1TVNA 1H49A 3GH4A 1HVXA 2WHKA 3AS0A 4W85A 1KGWA 1B90A 4FLOA 1PIFA 4PMYA 3OGSA 4AC1X 1BSIA 2YOCA 1G01A 1VFUA 4ZEPA 4QLKA 2WYSA 4W86A 2D0FA 1ITXA 1NOFA 3GM8A 4BS0A 1B3XA 4EAMA 1XSIA 2ZUVA 4PMVA 2WZIA 4DM1A 5FCZA 1OWQA 1FH9A 1IZJA 1HP5A 3MV01 4PCTA 5EFDA 1UH2A 5HNNA 3WD0A 4AZIA 1UR9A 3WN6A 4QCEA 3VGDA 4FLRA 3WF2A 1XD1A 3DHUA 3CH9A 1J10A 3POHA 1E3ZA 1XH0A 2FDMA 4UFIA 4MB5A 4RL3A 4PTMA 1OBAA 3A4WA 1Q6GA 4GQQA 4NI3A 1UWIA 1B1YA 2WMHA 5LA1A 1HJUA 3WQVA 2FHCA 3AICA 3WF1A 2V3GA 1J9YA 1KBBA 3GDBA 4UQCA 3KEHA 3T09A 4AD5A 4D6CA 1KXQA 5CQ1A 3ARZA 3KL0A 4H41A 3WUFA 2CITA 3T2PA 1BYCA 1UR1A 3N18A 1X6NA 2CERA 2WKGA 3HN3A 2YL6A 3ZSTA 4UCFA 1UZ1A 2CYGA 3GNOA 4R5EA 3LMYA 1NOWA 3IAQA 4WIWA 3RJYA 3GBEA 1KWGA 1JZ6A 1GVIA 3WBEA 1C8XA 2X0YA 1W9DM 2C7FA 5D4YA 1JFXA 3AXXA 1ISYA 3WH9A 2B31A 1V02E 4C7FA 2O92A 2WBKA 4H8UA 2ZICA 4JCMA 4ZFMA 3T0AA 1W3KA 4W87A 5CGMA 1R8LA 4N0RA 3SCUA 2BS9A 3WNLA 3EMZA 2XPKA 1AVAA 4HZ6A 1HNYA 2WWCA 4AY1A 1XD0A 3AMGA 1V3HA 1PZ2A 3CLWA 4F66A 2IXVA 5BRPA 1GNXA 1VB9A 3QGVA 3KE0A 1EO7A 4Z2IA 3EDEA 3WMSA 1E9LA 1W1PA 1JF6A 2FH6A 2WB5A 2VOTA 1GQKA 2A3EA 2WKLA 1E4NA 1GPFA 1HKMA 1QI0A 3HMCA 4B9YA 4LGXA 1QI4A 3DHPA 1CGWA 4M8UA 2DT1A 1OCQA 5AC4A 1HKJA 1GHSA 2VCAA 1VBUA 2PF0A 2NSXA 3UG4A 3D3AA 1ZJAA 1MQPA 7CGTA 3A4AA 3N11A 4ATDA 2CKSA 2CETA 4W84A 5GPRA 4MTVA 3CBWA 5A6LA 4TUFA 3VGGA 1V0NA 4TVUA 3CPUA 1QNSA 1E1FA 1UYQA 1E40A 1CBGA 3N04A 2ESCA 3II1A 3SCPA 5BXSA 1Q6EA 4HA1A 4X9YA 1EHAA 3VX0A 2WHLA 3CUGA 1XYFA 2BVTA 3VGHA 1ZBWA 3F5LA 2E8ZA 3UR7A 2BVDA 2VNCA 4UQDA 4W88A 3ZJ7A 3GYCA 2VO5A 1P6WA 1VEPA 1NOUA 2D0GA 4QDMA 4HOXA 3FAXA 3CHCA 5ECUA 3VM7A 3AROA 3CGTA 3AS2A 3MS8A 4GZJA 2EXOA 4HPHA 3AYRA 4D6EA 4GO8A 1KCLA 3G6LA 4D6HA 2GFTA 2F2HA 3SCTA 5FL1A 3WDJA 3W38A 2Y4SA 2XVPA 4C7DA 1BF2A 4UQBA 1JDCA 3W29A 4U3CA 3DECA 3AHYA 4UQ9A 1E6RA 1NQ6A 3N17A 1DWIM 1VRXA 3MUY1 1QNQA 2Y2WA 1CGUA 4JHOA 2UWFA 1OD0A 2QPUA 2X8RA 1OT2A 2DQXA 3OG2A 2FGZA 3SCOA 4KRTA 3AZSA 2CNCA 3NSXA 2QLYA 1TE1A 1CTNA 3RM8A 3VIGA 1W3LA 2UY3A 1C90A 4CN4A 4U2YA 2E3ZA 4U5IA 1BFNA 3ARQA 1C7TA 3OZOA 2V38A 3GTNA 3OLIA 4MB1A 3WH6A 4CCDA 1E6NA 1OB0A 1CGXA 4RE4A 1QHPA 2CPUA 4F9JA 2XVNA 4J3UA 2GJRA 1ISZA 3BMWA 4ZE5A 4KH2A 4QP0A 4W8LA 2VX7A 3AHVA 3VGEA 2ZX6A 1E5NA 1UUQA 3LPGA 1UD3A 4MNKA 1FP9A 5BWFA 3CZEA 5CLTA 4Q22A 3VD7A 2WMFA 1UWSA 1E73M 4CCEA 5JBDA 1H11A 1H0IA 2HISA 1E4IA 1A47A 2QV4A 4Y7EA 5CJ5A 1UQYA 3CMJA 4DUVA 4PMOA 1E6XM 1UD5A 2BHUA 1OSEA 3IK2A 4D1IA 5A6SA 1V6YA 2J7EA 4C7GA 3PZ9A 1NARA 2J7DA 3M46A 5CSYA 3MO4A 2WZHA 3K46A 1UKOA 2PC8A 2FH8A 5BCAA 2BVYA 2D0HA 1TFVA 3T0BA 1W9UA 3BMVA 1MFUA 1PJ9A 3DYPA 3CUJA 1G5AA 1EO5A 4CU7A 4KMQA 1XH1A 3NUKA 3RIKA 3OLGA 4LYQA 1RD6A 3MKKA 4TVCA 4GI9A 2VJXA 2W61A 4AD3A 5KZ6A 3CZ8A 1HT6A 1ESWA 5FD0A 4P7NA 4D71A 4EK7A 3AIVA 1TUXA 1D2KA 1DTUA 1U2YA 4QLJA 3U57A 1AQHA 4AYSA 2WCSA 3ARTA 2Z1SA 3JUGA 3AI0A 3PTMA 2RGMA 4D6DA 4TXEA 3GXFA 3WELA 2EPLX 3RJXA 3WH8A 4PSRA 3M7SA 1UWUA 2ZE0A 1QNPA 4HMDA 4CKQA 1WKYA 1LL7A 1MWOA 3OB8A 1C8YA 1B9ZA 3L4UA 1QHZA 5D9OA 3A47A 2EPNA 4CUCA 1B30A 5A2CA 3MMWA 3WY1A 3AS3A 1CLVA 1YHTA 4ZXLA 2WNWA 1R86A 2OLHA 2WC4A 4MNLA 3W28A 1JF5A 4BQ2A 1WZKA 5IFPA 5IDIA 3VMOA 4WSKA 1V3JA 1JNDA 1LL6A 1SMAA 3TONA 1Z32X 3CZJA 1OINA 7A3HA 5I77A 1Q6CA 3BGAA 1JZ8A 5I24A 2DSVA 1ZBKA 3ARPA 5C8BB 4PCSA 3PZQA 3I3EA 3VNZA 1GOWA 4GO9A 5E0CA 4H2CA 3O6AA 2DH3A 3POCA 4ATLA 4UFMA 3THCA 5ABFA 4GKLA 2WLYA 4MDPA 1JYVA 5HBFA 1UG6A 1V0MA 3RO8A 1UA7A 4U33A 4IISA 4XX6A 4AD0A 1W2PA 2OWWA 4OOUA 1M53A 2JEQA 1B3YA 2YL9A 5KEZA 3VMNA 3SCSA 1MYRA 2IUZA 1HKIA 3ZQ9A 4V2XA 1UD6A 3CO4A 2ZWYA 3BAKA 3M07A 1UKQA 3I3DA 1EA9C 5A2BA 1OM0A 1NWTA 3AXHA 1GOQA 1J0KA 4RE2A 5A69A 3VNYA 1ZBVA 1JG9A 2ZIDA 1W9XA 1VEMA 4OIFA 4CN1A 1CWYA 1K6AA 1LWJA 1BYDA 3MANA 1ZU8A 2Y24A 1HF6A 3S6TA 3AXIA 1O7AA 1EQCA 1PPIA 2CCRA 3SIMA 5A6MA 3F5JA 1UD8A 1V0KA 2VI0A 1HJSA 1EGZA 1MW2A 1O6IA 3N15A 2GJPA 1KQYA 1XCWA 2WK2A 4XUYA 1BYBA 4PTXA 2PWDA 3VVGA 1QI2A 2UY5A 1EH9A 3AIWA 3WH5A 4GXPA 4JAWA 4GPNA 3W53A 4U5KA 1J0ZA 2VRKA 3AIQA 4JCLA 2EEXA 5FL0A 2QMJA 3WMCA 2D22A 2FHFA 3VIIA 3WH7A 2OYKA 4J3WA 1UR2A 4AD4A 1PX8A 2VC9A 2WMJA 2ZX8A 2CESA 2EJ1A 4WK9A 5CLWA 1E72M 5DT5A 4D72A 4GQRA 1EDTA 3ZT6A 3M6DA 1RH9A 4YHEA 2CHOA 4UOZA 2NW0A 1BGAA 3QHMA 1JAKA 2O9RA 3GXMA 1SR0A 4PMZA 5I78A 2J62A 4IM4A 1A3HA 1UQZA 2FGLA 5FIPA 2WXDM 2C8NA 2GJXB 1JDAA 3PTKA 3GBDA 2WLZA 1W91A 3RDKA 4BQ3A 1UR8A 3WNOA 5EMYA 3WF3A 1DEDA 1LG1A 4LXFA 2V5CA 3L4YA 1W32A 1B3WA 1TA3A 1FHLA 3J7HA 3SCNA 4DUWA 2D3NA 4UQAA 5GQBA 1C93A 2J8FA 4HZ7A 2JALA 2WVTA 4QFUA 4MAVA 1XSJA 2PI6A 1NP0A 2F8QA 1ECEA 2WSKA 1CGVA 2VT0A 3BLKA 1GQIA 4ATWA 1H2JA 3A6OA 2VL4A 1VFMA 2JIWA 2X1IA 4QCFA 3MV11 3QHOA 3WF0A 2ZUMA 1V03A 1TVPA 4AZ5A 5A8QA 4UR9A 4XZWA 5GNZA 3PZMA 3BCFA 2BY2A 1BG4A 3AZRA 3AHXA 3GH5A 1E3XA 3ZSSA 1JZ4A 4XV0A 1GONA 2OSYA 2DPEA 2ZUTA 3APGA 4HOWA 2QF8A 4PMUA 4HU8A 3BXWA 4AZ6A 3AISA 4UFKA 3I3BA 1FH8A 1ZBCA 1U33A 1G0CA 4W89A 4WSJA 1BAGA 4CGTA 2J47A 1PAMA 1QNOA 1S46A 1X1NA 3PZVA 2DSKA 4JIEA 3VU2A 1QI5A 1J0YA 3VDAA 5CPTA 2WC3A 2EPOA 2XVGA 2MANA 5E6YA 3T0DA 1GQJA 1XH2A 2ZUSA 3ALFA 1MQQA 4TX6A 2E9BA 3U5YA 1QBBA 2VR5A 8CGTA 3VD4A 3SEPA 3RMEA 2DEPA 3O9NA 3DC0A 4J27A 6CGTA 1QHOA 2QHAA 4KGJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CHD A;  1IZK A;  4CU8 A;  4CD5 A;  3VIJ A;  1V6U A;  4D1J A;  2XYL A;  4J3X A;  4MNM A;  1KB3 A;  5I5R A;  4J3S A;  4BZY A;  1UWQ A;  1KCK A;  2WPG A;  1VEO A;  4P7Q A;  2YA2 A;  1J12 A;  3CIV A;  5JBE A;  4P8V A;  1PEZ A;  3SUR A;  2XIB A;  1IV8 A;  3W0K A;  1EQP A;  1W1V A;  1YQ2 A;  3WQ6 A;  1UH4 A;  5ABH A;  3WUE A;  1W1T A;  3AIU A;  3KL3 A;  1V3M A;  2W5F A;  1E6P A;  1CIU A;  3HU7 A;  4J3V A;  1MXD A;  1GOR A;  3WDR A;  1V6W A;  4HPG A;  1KR0 A;  5BXT A;  3WEO A;  4K68 A;  5DF0 A;  1US2 A;  3IJ7 A;  1TR1 A;  2GK1 B;  2YDR A;  3W24 A;  5A6J A;  1H41 A;  3UEQ A;  1LJY A;  4W7V A;  5A6B D;  3GH7 A;  1E6S M;  3W82 A;  1HJW A;  1HL8 A;  1FH7 A;  4H8H A;  1CEC A;  3AYS A;  3WL1 A;  3SCW A;  1WP6 A;  4JZ5 A;  1BPL B;  3WF4 A;  1CEO A;  4H7V A;  4UQE A;  2WVS A;  4Q7N A;  1E0V A;  3RIL A;  4NSB A;  2V5D A;  2X09 A;  1J0H A;  4JFV A;  4Z2H A;  3EDJ A;  3WUB A;  2G8Z A;  3IAN A;  2E40 A;  3AIB A;  4JFW A;  2XGB A;  3MU7 A;  3NIY A;  1QOX A;  3OLE A;  4PMQ A;  5M17 A;  2WHJ A;  1V3L A;  3AMK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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