2PF0 | Genus

Total Genus 151

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	151
sequence length	394
structure length	394
Chain Sequence	AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVISGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Carbohydrate binding sites in Candida albicans exo-beta-1,3-glucanase and the role of the Phe-Phe 'clamp' at the active site entrance. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Hypothetical protein XOG1
molecule tags	Hydrolase
source organism	Candida albicans
total genus	151
structure length	394
sequence length	394
ec nomenclature	ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date	2007-04-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2pf0A00

2WAGA 3AXXA 5BXPA 2JF6A 1UWQA 4A4AA 4QP0A 1FH9A 2VNCA 2DSWA 4CGTA 4CN1A 1D2KA 1Y7VA 4M1RA 4AD5A 1IZKA 2Y4SA 3ECQA 1MXGA 3CUFA 2VZVA 1JI1A 1YQ2A 4S3JA 1A3HA 3AIEA 3W53A 5LA0A 1W1VA 5CLTA 1UWUA 1K9FA 3E1F1 4YHGA 3VX0A 4IPLA 1GJUA 4HU8A 2VX6A 4UQCA 3AIVA 4WLCA 4J3TA 4AD4A 1DWIM 2PF0A 1UZ1A 4TTUA 5E0CA 4P7OA 1G94A 3WEMA 2WHKA 2WMKA 3I3EA 1F4HA 4TOQA 1W3LA 4UOJA 1AQHA 1VEOA 3POHA 3K8LA 1MQQA 2VR5A 4AD1A 5DT7A 4U33A 1PIGA 1XRVA 1JD7A 2WC3A 2YA0A 3WFLA 1H4PA 3PZ9A 3WDIA 1H09A 2BXYA 4U3AA 1TFVA 3RM9A 4JFTA 5FCZA 2VZOA 5TD4A 2VR4A 3FXYA 4W84A 5CGTA 1VRXA 2IXVA 4GIAA 3ARSA 3AIRA 3HMCA 1GJWA 3L2LA 3SIMA 1EA9C 2W4XA 3VIJA 1K9DA 4ML4A 2YIHA 1IV8A 3IK2A 4M82A 1TE1A 2A3BA 4D6IA 1TG7A 5BROA 4OBRA 1XCXA 1B3ZA 3PZVA 5EMYA 2YLAA 1EOKA 1QOXA 3AZSA 3CBWA 3AS1A 1H2JA 1WPCA 1ZJBA 2YKKA 2X0HA 4GZIA 2J7GA 3OLDA 4D6CA 3KL0A 1FH7A 4UFHA 2WKGA 4D6DA 2JALA 3WNOA 4J3VA 1E6RA 3CUJA 1BVZA 1GOQA 2O9TA 2V5CA 1JYWA 3U5UA 1UKSA 1XHGA 1E3ZA 2BNJA 3MUY1 1DWAM 3EDFA 1J0JA 1QNSA 2PWFA 4L4PA 4W8LA 2E4TA 4KRTA 3DECA 1B31A 4HPHA 1KXQA 1ODZA 1TVPA 4TUFA 2RGLA 4NF7A 5I24A 2G41A 2E9LA 1EIBA 1QNPA 3NYDA 1WDPA 2WKLA 1SFSA 2E40A 1GQJA 2BY1A 3ARYA 3ZJKA 4V28A 1JI2A 3SCVA 3MV11 3WDRA 4Z2LA 2J77A 1UR9A 3PZUA 4RE2A 3ZR6A 3VX1A 1V0MA 4WIWA 3VDHA 4AD2A 2WMGA 1OWQA 4UFMA 3W27A 4CCDA 3AJ7A 3WQWA 1W3KA 4OKDA 3ARQA 1ISYA 4C7GA 1JFHA 2ZX9A 1B3WA 1J10A 1HJWA 3EBVA 3PTKA 1QPKA 5GPRA 1LG2A 5D9PA 4GO9A 4UFLA 3B9DA 1RP9A 1BAGA 4JIEA 3LMYA 3PZMA 1NOUA 2V3DA 4HTYA 1E9LA 3UETA 3B9AA 5I77A 4XV0A 1OGGA 4WSKA 2CBUA 4W7UA 3WD4A 4MB4A 3NUKA 2D3LA 4FLOA 3WDQA 2VQUA 4UQ9A 3T0AA 2WMIA 1GONA 4GI9A 4V27A 5A1AA 2ZUSA 2W5FA 1MW1A 1QW8A 3RCNA 1W9PA 3MU7A 5HPOA 2FGZA 2JEQA 4DUVA 1HJUA 1HJXA 1V6YA 2E8YA 4S3KA 2OLHA 3N18A 1NOWA 2A3HA 3BCFA 3KL5A 4D1IA 2D22A 4OJYA 4CU8A 1XSJA 1KB3A 4DM2A 2Q8XA 3M6DA 3TTSA 1XC6A 2VZSA 3DYPA 3EDEA 3VIFA 2AOSA 1PX3A 2XFFA 3CHDA 1HL8A 1QI0A 3VIOA 3VO0A 4AZ5A 3KZSA 2WLYA 3EYPA 1KR0A 4HZ8A 4HA4A 3VD4A 1XCWA 3SCRA 1HL9A 2OWXA 3ZR5A 3VGGA 3NSXA 5A6BA 2O92A 5CSUA 1CGTA 1EOMA 3KL3A 4AZGA 1HNYA 1EDGA 3ZT7A 1QW9A 4P8VA 2YDRA 2XSAA 2ZX6A 3L4XA 5I79A 2CPUA 2QPUA 1ITCA 1TR1A 4BCEA 1QHZA 5HBFA 4B16A 1UH3A 3L4TA 1WKYA 2WVVA 1PX8A 2DT1A 2NT1A 3VM7A 1WCGA 2AMGA 4U31A 3QHMA 2XFRA 1OB0A 2J4GA 3NDYA 2WANA 2J8FA 1CWYA 5D4YA 2WBKA 3ZJ8A 4B9ZA 1JIBA 4OOZA 1V3HA 3VVGA 3WFZA 1JF5A 3ARZA 4D6GA 4CD8A 1UKPA 4DM1A 4JAWA 2XWEA 2D3NA 5JBDA 2Y5EA 1CNVA 3VGDA 2XYLA 4ACYA 1BG4A 2W67A 1G0CA 3VD3A 3TA9A 3VILA 4LYRA 1E5NA 2NSXA 4GPNA 2PWHA 4F66A 2DH2A 2ESCA 1BQCA 1MW2A 2G3JA 1S46A 4UZUA 3GH7A 1E4MM 3SCQA 4EK7A 2XG9A 1UR0A 1US3A 2GFTA 1V3IA 2D23A 1C8XA 2DQXA 1Q6EA 3VIHA 1PIFA 5A6LA 4HZ7A 2JEPA 2YL9A 4ACZB 4PTXA 1UHVA 4WKHA 3GM8A 1G1YA 5FD0A 1HKMA 2GDUA 1AQ0A 3O2LA 2PWGA 1BG9A 2WC7A 3N9KA 1VB9A 3OBAA 1NWUA 1UD2A 4JL2A 1JZ3A 3A6OA 3SEPA 3AZTA 3OLGA 2BY0A 2W63A 4D6EA 2FH6A 1CXEA 2WMHA 5F7UA 2ZX7A 3VINA 1I75A 5E9AA 1C7TA 5BYWA 3DYMA 4ZE4A 1BFNA 4P8WA 3SCWA 1GZJA 1BPLB 1RH9A 1UR8A 1CLVA 2VOTA 5JIPA 2EQDA 2XVKA 5IFPA 1V02A 4X0NA 3SCUA 4CN4A 1RPKA 3VD9A 3MANA 3ARPA 5AYIA 1FA2A 3MMDA 2BXZA 3ZM8A 3MMWA 1UR1A 1C8QA 1US2A 1OD0A 2VQTA 2XGIA 2VO5A 3RIKA 1CGXA 1V0KA 1MW3A 2J7EA 1CGVA 2J25A 4MADA 3N04A 1JG9A 5GNZA 1HX0A 2CIPA 1NP2A 1B0IA 3UG4A 1R85A 3A4AA 2V3EA 2YBUA 3WH8A 1ZJAA 1DWJM 1XSKA 3AICA 4IPNB 3CGTA 3UG3A 4QFUA 1SR0A 3VDBA 1KXHA 2VT0A 1W1TA 3AHVA 5JBFA 4Z2GA 4Q7NA 4NSBA 1HVQA 3AS0A 5AYBA 2WHJA 2XIIA 4NRRA 1DTUA 3MV01 5E09A 4J27A 4OZOA 1A47A 1VBRA 1W3HA 4F9JA 1KQZA 3EDDA 8CGTA 4JKMA 3LPPA 4N42A 3AI0A 1FP8A 4J7RA 1H0GA 1LG1A 2XM2A 2GUYA 1E6QM 2EJ1A 1JDCA 3AISA 3I3DA 3BAXA 1CPUA 1P6WA 3CUIA 3QGVA 2J7DA 2ZIDA 1B3XA 4CN6A 1UZ4A 3AMKA 3D5HA 5AY7A 5A8PA 3BAYA 3L4VA 1FOBA 2PC8A 4AISA 4OUEA 3W82A 4M8UA 2VVNA 3ZSSA 1K9TA 1OCQA 1B2YA 1J0KA 5BRQA 4PMVA 3RMEA 3VUPA 3EDKA 4LX4A 4ZXOA 3BMWA 1KCKA 2WBGA 2BVDA 1H41A 3II1A 3L4UA 1KR1A 2YOCA 3QOMA 1QBAA 4JHOA 1VBUA 4D6FA 3AMDA 5A6MA 1JL8A 1BYBA 5A6KA 5BXSA 1HN1A 2WSPA 2JIWA 2YL5A 4E4PA 2DT3A 5D9MA 3RM4A 5JIWA 3GXMA 4DUXA 1BYAA 3BCDA 2J47A 3GNRA 4PMNA 1C3FA 2BV9A 1J0ZA 2WVSA 4W86A 3VOCA 1VFOA 3FN9A 1XGZA 2J75A 1KFWA 1E1FA 2CBVA 1G01A 4IM4A 3BAKA 1WNOA 8A3HA 1CTNA 1SMAA 1B1YA 1JGIA 4KWUA 4TTGA 3NIYA 5EFDA 5HOSA 1ZBVA 2VVSA 1D7FA 5A6AA 4ATDA 2Y8VA 1GPFA 3VU2A 4AZIA 1Q4NX 2G3MA 4C7DA 1ZB5A 3WNPA 1JZ5A 3RDKA 4U2YA 1QNQA 5A3HA 2D1ZA 1J01A 4JFUA 1PPIA 4U5IA 4CCEA 4HOXA 3L2MA 1U30A 1J12A 1WAWA 2GJPA 4BA0A 1WDRA 1X6NA 1E4LA 3VMOA 5M5DA 1GOOA 1ECEA 5D9NA 3SCNA 4LXFA 3SURA 4UQEA 3WD3A 3LPFA 3QOKA 2GJXA 3POCA 3MUZ1 2DEPA 4D72A 1HP4A 2WMIB 1OGBA 2VRQA 5A6SA 2QF8A 3DC0A 4X0VA 3WH5A 4AEEA 3N17A 3WELA 2EPNA 4CVWA 4PCTA 3PTMA 2V38A 4GKLA 4KH2A 5FL0A 2G4FA 1CECA 3OA5A 3AMGA 1QI4A 3NDZA 2CCRA 2CERA 1NARA 4W8BA 4JFWA 3B9EA 4R5EA 2CBIA 3A4WA 4BF7A 5A2BA 4LYPA 4W85A 1UD4A 3WMCA 1KGXA 4OBSA 4P8UA 4URIA 4HMEA 4AZBA 1X1NA 1JZ4A 4GI6A 3DYOA 4HZ6A 2EO7A 1W9UA 3U7VA 2ZX5A 3VM5A 2CXGA 5CG0A 3WUBA 4HPGA 4L4OA 2ZUTA 3IJ7A 3EMQA 1K9EA 2VCAA 3RILA 3WF4A 1EHNA 1TMQA 4PN2A 5ABEA 1VFFA 1GOWA 2X0YA 3WD0A 1MFUA 2BFGA 3VNYA 2VC9A 3AS3A 1W91A 4M80A 4V2XA 3WY1A 7CGTA 2WVVB 2OSXA 1CBGA 3OGRA 3GNPA 4XUYA 4QLLA 1E0WA 1YHTA 2WVUA 3PTQA 4W88A 1C92A 4UZSA 1QI3A 4PTVA 1ZL1A 4CCCA 1HKJA 4HP5A 1E0XA 3WEOA 4PTWA 1MQRA 4XB3A 5LA1A 3SCPA 2UWFA 1W1YA 2ZWYA 5BXTA 1CENA 1O6IA 2W62A 1Q6CA 1OD8A 2HVMA 3A3HA 5A8QA 1V6VA 1H11A 1MQPA 3WF2A 4AZ7A 3WH6A 2J8GA 3ARRA 1MVYA 1VJZA 2X05A 1VEPA 3T08A 4EE9A 3ZJ6A 5I3DA 2WCGA 4UFKA 1B90A 1E1EA 1WDQA 3WQ6A 3WQ4A 2CEQA 2TAAA 3ALGA 3GH5A 1QVBA 1KQYA 2WMJA 3BSGA 2QPSA 4MDPA 4XZBA 1EO5A 3W0KA 1ZBWA 4AC1X 2X8RA 1DWFM 1NOFA 1UQZA 1E73M 4MNJA 1C7SA 1JYVA 1D3CA 5A8MA 4J28A 2F61A 3LPOA 4W7VA 4PUEA 1B30A 2JE8A 3WUFA 2XIBA 1HVXA 1ITXA 4HMCA 1GHRA 1PEZA 3UR7A 3MS8A 4B3LA 1QI5A 3SUTA 4PCSA 2VMFA 1XD1A 4JL1A 1VFUA 3DHUA 4A3YA 1CXLA 2ZUUA 3SCSA 1LL6A 3BH4A 5HNNA 2XJ7A 3CUHA 2XVGA 2EPOA 1RP8A 1Q6DA 2DSVA 4BQ3A 5C8BB 2ZOXA 1MYRA 5DMYA 2PBGA 4CVUA 2FHBA 1E43A 3FW6A 2CHOA 1CGUA 4UOQA 3M7SA 2XVPA 2C7FA 5DO8A 3FY1A 1NWRA 1O7AA 1OIMA 1EDQA 3UESA 1E56A 1HJSA 3CZKA 4OOUA 5A6JA 3WUEA 2ZXAA 2D0HA 4ATWA 3VGFA 2X2YA 1XV8A 3WEZA 2Y24A 3DHPA 4QCFA 4AD0A 1ISZA 3ARVA 1JXJA 3BXWA 1AQMA 1UD5A 3WMBA 4DWSA 1C91A 2QV4A 1DWHM 2DPEA 1ISXA 3W29A 5I5RA 1AVAA 2OYMA 1WB0A 3W37A 4EANA 1KWKA 2VCCA 4MNLA 3WL1A 1W32A 2BHZA 2WCSA 4BZYA 3GXFA 4BQ5A 1HIZA 3WSUA 2W66A 3APGA 1QNRA 1CIUA 4J3SA 3OLIA 1UD3A 4BS0A 1IZJA 2CYGA 4TVCA 2GK1A 4CU7A 6A3HA 5LYRA 3WF0A 3PN8A 3CUGA 3F5LA 4FLSA 3T09A 4PMRA 3ZOAA 4AZCA 1E0VA 3OZOA 4J3XA 4M81A 3NSMA 5I6SA 3ARXA 4JCMA 4P7NA 2FDMA 2DIJA 1RD6A 3TTQA 2XM1A 1GHSA 3WDHA 2W92A 5CGMA 1W2VA 3NCOA 4GQRA 4XZWA 1MW0A 2WM0A 1GVYA 1HJVA 4NRSA 1HT6A 3IJ8A 2OWWA 4W8AA 1CXFA 4LQ1A 3WKZA 2EEXA 2XUCA 1V3KA 1E71M 5A95A 3ZO9A 3W25A 4P7QA 2WC4A 2DT0A 2WZEA 3VGBA 2QLYA 1ZBCA 1J9YA 2OYKA 3RJYA 1W1PA 1J18A 1GUVA 2VCBA 5JUVA 2PWDA 4AZ6A 4TX8A 1M53A 4DWSC 3L4WA 1CXIA 5FIPA 2FH8A 4BQ4A 1L0PA 4JFVA 4W87A 2EBNA 2EXOA 3VGHA 1OBAA 2VTFA 1E5JA 2O9RA 1NQ6A 4UFIA 4FMVA 5DFAA 4MTVA 3WNMA 4HA3A 4H7VA 3A47A 4UOZA 1KXTA 3AHXA 2DSZA 1W2PA 1PX4A 4AMCA 4UNIA 5D9OA 1KBKA 3N15A 4NI3A 4GQQA 4PMYA 2ZUWA 3BAIA 1K6AA 2ZWZA 3EMZA 4PTMA 3UG5A 6TAAA 2YA1A 3WQ5A 4CUCA 1V0LA 1UA3A 1JYXA 3S6TA 1E3XA 3VIPA 2OYLA 3IAPA 3GBDA 1H5VA 4TXEA 3W81A 4MJ4A 2WHMA 4B3KA 3CO4A 2VJXA 3L4ZA 3WQVA 1R7AA 3KWXA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4MB1 A;  2WW5 A;  1GOK A;  5IHR A;  1XH0 A;  4AEF A;  2XVN A;  1MWO A;  3PZO A;  4HU0 A;  2J62 A;  3MO4 A;  2J7H A;  4W5Z A;  4E8C A;  1NH6 A;  2YLL A;  2VX5 A;  3MUA A;  3PHA A;  2JF7 A;  1QBB A;  1LF1 A;  3CZJ A;  2DSK A;  3AXI A;  5CXP A;  4HA1 A;  6CGT A;  2GSJ A;  1DP0 A;  3NJ3 A;  1V03 A;  4MB5 A;  5CQ1 A;  3PZT A;  3N11 A;  1KBB A;  3CIV A;  2J7C A;  3O9N A;  4PYS A;  1GCY A;  3VIK A;  2WB5 A;  4GXP A;  2D0G A;  3MKK A;  2DT2 A;  4EAM A;  2ZIC A;  1KCL A;  2V5D A;  4D6H A;  3UEQ A;  3WQ8 A;  2ZUV A;  2V3G A;  1BF2 A;  4JKK A;  5ABG A;  1E55 A;  1NWT A;  4H8H A;  4YPJ A;  4H8U A;  1GVI A;  4GI8 A;  5JBE A;  1J0H A;  3K4D A;  1WE5 A;  2XFY A;  3NSN A;  3SCT A;  3W6L A;  1UYQ A;  3CMJ A;  2PBO A;  3IAN A;  1JD9 A;  3BMV A;  2QMK A;  4UR9 A;  4KGL A;  9CGT A;  1VFM A;  1WZM A;  2X1I A;  4FLR A;  1E70 M;  2EPK X;  1UD6 A;  5HPC A;  1GQI A;  3OGV A;  2WCA A;  3ARW A;  2D2O A;  1JFX A;  2YJQ A;  4CD4 A;  3WDJ A;  3M46 A;  5M17 A;  3WUG A;  3N13 A;  1UKT A;  1DWG M;  2BVY A;  2OWC A;  2JIE A;  3VGE A;  3VNZ A;  1UWI A;  3AOF A;  3WNL A;  1EQC A;  1B9Z A;  1ZU8 A;  1WZL A;  3AS2 A;  4ZE5 A;  1R86 A;  1OSE A;  2O9P A;  4W7W A;  1GNX A;  3WF3 A;  1W3J A;  4KRU A;  4P7L A;  3AZR A;  3T2P A;  3VIM A;  3WDP P;  4HMD A;  1H1N A;  4QDM A;  1JDA A;  3HN3 A;  3MMU A;  5HXM A;  3RM8 A;  3W38 A;  4MB3 A;  3SUV A;  4H04 A;  2WNW A;  4IIS A;  2VRJ A;  3CZL A;  4UQD A;  4WK9 A;  3WNK A;  1TA3 B;  7TAA A;  1JYN A;  4ACZ A;  3THD A;  5ABF A;  1Q6G A;  2NT0 A;  1FFR A;  3QHN A;  2PB1 A;  1LWH A;  2UY4 A;  1V6X A;  1JNE A;  2EPL X;  1BGG A;  4AIE A;  3AMC A;  2ZX8 A;  1QI2 A;  1TZ7 A;  1E6P A;  3AYR A;  4YHE A;  1TCM A;  1NM9 A;  2XWD A;  3VMP A;  2G8Z A;  4PSR A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2YOC A;  4JHO A;  3GHT A;  4KEV A;  4FNU A;  1BYB A;  1HN1 A;  4JTI A;  2HJP A;  1Q66 A;  1TQX A;  4DUX A;  1GVO A;  1GTH A;  3BGG A;  2WVS A;  4W86 A;  4Q8V A;  4OQV A;  1H1Z A;  1Z7A A;  1WNO A;  1CTN A;  3GG7 A;  1ZJH A;  4KWU A;  1W8G A;  3NIY A;  5EFD A;  3UYC A;  3MZN A;  2Z7K A;  1ZP4 A;  2G3M A;  4QTG A;  5HNR A;  2WV8 A;  1OC5 A;  3RDK A;  2WZM A;  4GYP A;  2V2H A;  4TIM A;  4HOX A;  1TPW A;  3EX1 A;  1WAW A;  2GJP A;  4HHH A;  4RZB A;  3P80 A;  4XKY A;  1E4L A;  3B0V C;  3IJL A;  3LPF A;  3BUV A;  2DEP A;  1HP4 A;  4GX9 A;  1JUK A;  3SFW A;  5A6S A;  4QX4 A;  4X0V A;  2FKP A;  4N9D A;  4TMC A;  3WEL A;  2V38 A;  1NDV A;  1UUM A;  3VNI A;  1W5P A;  2G50 A;  2CER A;  3N2O A;  4ZOB A;  4MGG A;  3A4W A;  4U4M A;  4BF7 A;  3AU2 A;  4NAE A;  5DLC A;  1Q6L A;  3NEV A;  3WMC A;  3QFW A;  1KGX A;  3RR4 A;  4HME A;  4AZB A;  1X1N A;  3GB6 A;  1PTD A;  4NNC A;  1W9U A;  1OFB A;  5IBX C;  2Z6I A;  4E6M A;  1EL3 A;  3KCL A;  1OCB A;  3IJ7 A;  5E5C A;  1HO1 A;  2VCA A;  3G3M A;  2QJH A;  5T8G A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2PF0A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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