2PF0 | Genus

Total Genus 151

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	151
sequence length	394
structure length	394
Chain Sequence	AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVISGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Candida albicans
publication title	Carbohydrate binding sites in Candida albicans exo-beta-1,3-glucanase and the role of the Phe-Phe 'clamp' at the active site entrance. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Hypothetical protein XOG1
total genus	151
structure length	394
sequence length	394
ec nomenclature	ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date	2007-04-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2pf0A00

1E0VA 1X6LA 2O9PA 4PUEA 1BYDA 4D6IA 4ZXOA 3EDJA 3F5KA 4KGJA 5AYBA 1BHGA 4AD1A 1C3FA 3WBAA 1Q6DA 5ABGA 3AIQA 1JNEA 1PIFA 4AD5A 3CHDA 4NZCA 3M7SA 2XGBA 1U33A 2NSXA 2GJPA 1QW9A 5CLWA 4CD6A 1OWQA 3CHFA 3EDKA 4P8UA 4LYPA 3WQ4A 4J7RA 4UQEA 3K1DA 4LXFA 4GZIA 3BGAA 2E40A 3F4VA 1V3LA 5ABEA 4IISA 3UG4A 5I0DA 3AYRA 2WZHA 4W5ZA 4JKLA 1V0NA 3VPLA 1X6NA 3ZR5A 4P7NA 2Y24A 5DO8A 3WNKA 3T0BA 3WD1A 3AIRA 4J3VA 4UFKA 3OIHA 3WDRA 4UQAA 3CUFA 3SCOA 1UD6A 1GPFA 4GPNA 3CHCA 1KBKA 1HL9A 1E6NA 1MW2A 4AZIA 1WZLA 1M04A 4IPLA 2WPGA 3CZJA 2GJXB 1JFXA 2C7FA 4HA4A 2WHJA 1E3XA 3AIBA 3CZKA 1U2YA 2QPUA 4MPKA 2ZUSA 2W63A 3OBAA 3PN8A 1PPIA 3ZSTA 1E4IA 4WSJA 2JF6A 4ZE4A 3GNRA 4PCTA 1UKTA 4UFHA 3W38A 3NCOA 1UYQA 4M1RA 2DIJA 4JAWA 4TVCA 1ISYA 1IZKA 1XH1A 4AW7A 1EXPA 1PAMA 4NF7A 2XSBA 2YL6A 1KXQA 3CZEA 2CETA 1QHZA 3A4WA 4AISA 5JUVA 1VFFA 1LL6A 4W8BA 3UCQA 2X1IA 1JYWA 3WY1A 1JL8A 2V5DA 1JZ5A 1V3KA 2NT0A 2VR4A 2ZX8A 2FGZA 4CU8A 1E4LA 2D23A 2Y8VA 1B0IA 4WKFA 2QV4A 1J01A 1D2KA 1G5AA 1V6WA 1QI5A 3SCWA 1WDRA 1KGXA 3WDIA 1QBBA 3VKKA 2J47A 3O9NA 4GZJA 4HA3A 5GPRA 3WD2A 1QHOA 2VZSA 2WC3A 3VGBA 4J3UA 3WENA 1HVXA 5BYWA 3ZQ9A 1LQ0A 4OUEA 4LYRA 4UCFA 1UG6A 3WNNA 1DEDA 4UFMA 3N11A 3PZQA 1BVZA 1E6RA 1C90A 2BHYA 3IAQA 3AI0A 3VNYA 2VI0A 3VTRA 1US3A 3AMKA 3UETA 4CUCA 1H0IA 2PC8A 3W82A 2OSWA 4P7OA 1KCKA 3ARVA 2GFTA 2BY2A 2YJQA 4AD0A 5EB8A 1NWUA 2W61A 1W9VA 2YKKA 1V3MA 3U57A 3ARUA 1W9UA 6A3HA 4TTGA 2VZOA 3BAIA 1ZB5A 1GORA 3T09A 5CSUA 2V3DA 1UQYA 1UUQA 3SUVA 5CXPA 4AY1A 2PWHA 3THCA 1TR1A 1SMAA 1UD3A 3ZJ8A 5A2BA 1VENA 5D4YA 2E9LA 3WQVA 3ARYA 3WUFA 3LPGA 3MANA 1TG7A 3KZSA 2GVYA 3KL5A 2BXYA 3QOKA 1VEPA 2WBGA 2YLLA 3BLKA 2OYMA 1IV8A 4OBRA 2YDSA 2GK1A 4PTWA 2VMFA 3WDPP 1OINA 4PMDA 4W8AA 1H11A 4R27A 1XCXA 1C8XA 2W91A 2VO5A 1ISWA 3EMCA 5CSYA 1R85A 2G3IA 4FLOA 3MUZ1 3WD4A 4P8WA 2YDQA 1HJQA 2BHUA 1W3HA 2ZXQA 2UY3A 4CU7A 1HJVA 4JHZA 5BCAA 1E6PA 3JUGA 4U2ZA 4RE2A 4GI9A 3AOFA 5BXRA 2WK2A 3F5JA 2IXUA 2ZX7A 1UQZA 1OT2A 1UD4A 4PMOA 1W9XA 2DSWA 3F5LA 4MTVA 1SMDA 4HZ6A 4XX6A 4AD3A 3ZT6A 1KQYA 1O6IA 2D1ZA 1KBBA 4YHGA 3I3BA 6TAAA 3WSUA 2XM1A 5CPQA 3WELA 2G3MA 4KRTA 1VFOA 4W84A 1NARA 3BAYA 1ISXA 4GO8A 2WZIA 2EO7A 1CZ1A 3A47A 3WUGA 4JFVA 3U7BA 4D6DA 2DEPA 3VO0A 3W0KA 2IUZA 3OA5A 3PZVA 3DYMA 3IK2A 1UR4A 5AC4A 3VVGA 4OOZA 5A6SA 2ZWYA 4E4PA 1KGWA 5A2CA 5DT7A 5EFDA 1V6YA 1VIWA 3E1F1 1U30A 2QLYA 3FAWA 1ZJBA 5I24A 1KXHA 1WP6A 1HJWA 4OZOA 5ECUA 2GDUA 1DWHM 1WZKA 2YIHA 2GK1B 4UR9A 5E9AA 3EMZA 3AIUA 3VIFA 3FAXA 2WWCA 4HOWA 2EBNA 4D71A 4AZ5A 3AHVA 4TVDA 1XCWA 2CNCA 1WPCA 2OSXA 3BAKA 3CZLA 4Z2KA 5A6MA 3AROA 2XSAA 2AOSA 4JKMA 3B9AA 2A3AA 3CUIA 1JD7A 5E09A 1LG2A 3AFBA 2YA0A 4BS0A 2CBIA 3NDYA 1C7SA 2G4FA 5A1AA 2WCSA 2DT2A 2ZICA 2BHZA 2PBGA 1BGGA 5FIPA 3WDHA 4ATLA 4AZCA 1V02E 2RGMA 1PZ3A 2J74A 4P7RA 2XPKA 3KL3A 1V08A 3GBDA 1XV8A 3RPMA 1US2A 3AXIA 3A4AA 1I1XA 1MFUA 3CZ8A 5DF0A 2FHBA 1G0CA 3MV01 1B3ZA 3AMDA 5AYIA 5JIPA 5DMYA 2ZOXA 3M46A 1C8YA 1TFVA 5CPSA 3T2OA 2D22A 3GZAA 4CN1A 2CBJA 2W5FA 2CKRA 1BYAA 5ABHA 2FDMA 4WKAA 2E8ZA 3OGVA 5E6YA 2BXZA 2WSKA 5GQBA 4Z2LA 1DHKA 4TTUA 3BMWA 3VD3A 1CENA 1CXIA 1WE5A 1WZAA 1GJUA 1VJZA 1XSKA 2JIWA 3T08A 1UR9A 5IHSA 5AY7A 1HKJA 3MSDA 4W88A 5HBFA 2PI6A 4PMVA 4OJYA 4PBGA 4CD7A 3CBWA 1B30A 1MXGA 1EQCA 4F8XA 1G9HA 1H49A 2ZUWA 1E3ZA 2WHMA 4WF7A 3GH7A 3POHA 4GQQA 4MNKA 1K6AA 2XWDA 4LX4A 1QNSA 2NT1A 4UFJA 2JE8A 1DWGM 2J4GA 1B3YA 1E4NA 1UWRA 1FH9A 1GCYA 3AICA 4AD2A 2XYLA 4UZSA 1UKSA 3PZ9A 2WCGA 4W89A 3RIKA 2J7FA 2J7HA 4UNIA 2DQXA 1E6QM 2X09A 2ZX9A 2BNJA 4PMUA 4B15A 3VUPA 5I79A 4S3JA 3OGRA 4B9ZA 1UR2A 3WFZA 4XZBA 4KMQA 1UD5A 3SCRA 1MW0A 3VGFA 4D6HA 2WVSA 1CXEA 3IJ7A 3WN6A 2DH2A 3QHMA 4MAZA 1HJXA 1KQZA 1G01A 1BG4A 1GW1A 1M7XA 1RPKA 5C8BB 2CITA 2O9OA 2YBTA 5I2UA 4CD4A 4CD5A 1YQ2A 2WXDM 2WMIA 4PMNA 1SFSA 2WLZA 1J18A 1OD8A 3VILA 3VD7A 3AMGA 2BFGA 2BVDA 4U3AA 3WEOA 2YDRA 1QNRA 2FHFA 3TONA 2WVVA 4AZCB 4B3KA 5I3DA 1CXLA 4WKHA 5D8WA 3CPUA 3APGA 1WCGA 1CGTA 2VZTA 3VIPA 3AHZA 1JNDA 4AZ6A 1E40A 3N1AA 4JFTA 1H5VA 1JZ8A 3SCTA 4J3XA 4R5EA 3N04A 2HVMA 3AIWA 2EPNA 4PRWA 3WH6A 2Z1KA 4A3YA 8A3HA 2WKGA 4J27A 4PMRA 4B9YA 3AYSA 3B9DA 3K8LA 5BRQA 4BQ2A 2AMGA 5CZKA 2VQUA 2A3HA 1E56A 2VX6A 2J77A 4CU6A 5HPCA 1GVIA 3AS3A 1H2JA 3T0DA 1GOQA 4W85A 4P8VA 1A3HA 1F4AA 1V0KA 1OGGA 3WNLA 4AXNA 4DWSB 3BAJA 4N42A 3ARZA 5CLTA 2PWDA 3GNOA 1R8LA 3RILA 1JAEA 5TD4A 1K9DA 4ZENA 2VOTA 3EMQA 4YPJA 5D9PA 1Q6EA 2JFEX 3NIYA 2CEQA 3VDBA 3ZO9A 4FF5A 1FP8A 3WQ8A 3W24A 1AQMA 1C7TA 1HP4A 3TTSA 4HU0A 3SIMA 1BTCA 2VZVA 4U3CA 1LL4A 4P8XA 3AZSA 1OIMA 2OYLA 1JZ7A 1MYRA 4AIEA 3OB8A 2J25A 4ACZA 1CDGA 3N12A 5ABFB 3WNMA 1RP9A 3WMCA 2E4TA 2CHNA 2TAAA 1RH9A 3GH4A 4W5UA 1M03A 1XYFA 1HKKA 3FW6A 1YHTA 5HXMA 1OIFA 4HPGA 2WMIB 1JZ4A 3WF3A 3WH5A 1LWHA 3ARQA 3NJ3A 1MVYA 3HMCA 3U5UA 1KXTA 1HKMA 3M6DA 2YA2A 1QBAA 1QHPA 2E8YA 3CHEA 4M56A 4CN6A 2WC4A 2WVVB 4D6CA 1ITXA 1ZBVA 1JZ2A 2QMKA 2VX4A 2C8NA 8CGTA 3VM7A 4K68A 3VGDA 3KE0A 2W66A 2VCCA 1TA3A 1NH6A 4OIFA 2EPMX 3ZSSA 1W2PA 1W1PA 2AAAA 4HPHA 3PZGA 1CGYA 4F9JA 4MB4A 1DWJM 3ARTA 3VDHA 4EANA 1E6ZA 3IJ9A 3UESA 3BXWA 1AQ0A 1PIGA 4MNMA 1AVAA 3TOPA 2WMKA 1FHLA 1UR8A 4H04A 3K8MA 3CO4A 2ESCA 4MDOA 2DDXA 2WZEA 4Z2GA 4H8VA 3NYDA 2CBUA 2XVGA 4HU8A 2Q8XA 4RE3A 1V3JA 1VBUA 3RM9A 4W7VA 1PJ9A 2EJ1A 5M03A 2VTFA 1RD6A 5FL0A 1HJUA 2CESA 4PSPA 1BYCA 2XUCA 3L4WA 4AC1X 2ZUVA 2CPUA 3MUY1 3WEZA 4YN5A 9CGTA 4NRRA 3CLWA 4JZ5A 4XV0A 5A69A 3DECA 2V3EA 4ACZB 5IDIA 2WWDA 1R87A 2CKSA 2WMFA 3OZOA 3FXYA 3BSHA 1XC6A 1BSIA 1MQRA 4JFUA 4UZUA 2ZUNA 1NWSA 2ZX6A 1BLIA 1GOWA 1R86A 3CTTA 3BLPX 1CXKA 1C91A 1MWOA 2XFRA 5C71A 4S3KA 4LQ1A 1R7OA 2VUYA 3W26A 1UWQA 5A6BA 1C92A 4GXPA 4Z2IA 3AQUA 3DYOA 3M07A 3PTKA 5A8PA 4HMDA 5HDRA 1GQLA 3K4AA 2JIEA 1VEMA 2WMHA 1TA3B 1JI1A 1ISVA 2WVTA 4W87A 3UR8A 2ZUUA 1HN1A 4QP0A 1GOIA 1AQHA 5A8QA 2ZUTA 2X0HA 1XGZA 1KB3A 1GUVA 2WMJA 3ALFA 4UQ9A 4MB1A 3VIMA 2CHOA 2OWWA 1XD0A 1W1VA 1BGAA 3ARRA 4J3WA 1PEZA 4BQ3A 4C7GA 3BCFA 4LYQA 1B31A 3MU7A 4WSKA 4M81A 3LPPA 2J62A 4MADA 2WVUA 3CZGA 5D9OA 3L2MA 3I3EA 4FK9A 5BWFA 1G94A 3WF1A 3QOMA 2G41A 3MMWA 4PMYA 3ARPA 5A8MA 2GJRA 2IXVA 4AIOA 3RM8A 1DWAM 3PZTA 5A8NA 5KEZA 1JG9A 5D9MA 3VMOA 3UR7A 4WK9A 4UQDA 4MNLA 4Z2HA 1UH3A 2D0GA 2VQTA 3L4TA 3TA9A 1VFMA 1GQKA 4HA1A 1MFVA 1H3GA 4MJ2A 4QCFA 5E70A 3L4ZA 2O92A 1VJSA 4DUVA 5JBFA 2EXOA 5HNNA 3NSMA 5A95A 1H09A 1V6UA 4HZ8A 4TX8A 4U31A 3WH7A 1V03A 1ODZA 3BCDA 3CH9A 3TP4A 1GZJA 1D7FA 2VL4A 1CBGA 2WC7A 2ZXBA 3A6OA 1JD9A 4AZGA 1HX0A 4H7VA 2B31A 1VFUA 1E9LA 3GDBA 1EDGA 4F66A 2NW0A 4BQ4A 1PBGA 1VAHA 1GVYA 4H8HA 5CJ5A 5FOOA 4N0RA 4PCSA 1IT0A 4AWEA 2XTKA 2DT3A 3N13A 4CGTA 3CUJA 3PZMA 1H4PA 1SYTA 2FH6A 5E0FA 1CNVA 1QI0A 3FN9A 4NSBA 1JYVA 1CWYA 4MNJA 5GNXA 4JFWA 1ZBKA 2W4XA 5I6SA 2XVPA 1CTNA 4OBSA 1J0YA 4X9YA 1HF6A 1HNYA 3T0AA 3AS2A 3AHXA 1LLOA 2BY0A 2F2HA 1UOKA 1W3JA 2YL8A 2W92A 2A3EA 1CLXA 1GQJA 3WH8A 1UH2A 1FA2A 1KWGA 3ZJKA 4V2XA 1XH0A 1EDQA 3DC0A 1OGSA 3U7VA 3WDQA 1J0ZA 2OWXA 3WKZA 4Z2JA 2JF7A 1B90A 3GXDA 1EA9C 3MS8A 3WF4A 1BFNA 2GSJA 5HOSA 3VINA 2DT0A 3AS0A 3FHQA 1W9DM 2MANA 4PTMA 2BY3A 3B8SA 2VR5A 2XVLA 5GNZA 1J0HA 3QHNA 5CGMA 5M3WA 1NWRA 5F7UA 3IANA 3ZMRA 1JZ3A 4D1JA 3VD4A 2DGAA 1D3CA 3K46A 3MMUA 4BCEA 3RO8A 1WO2A 4GI6A 4X0NA 1KFWA 1ZS2A 1VRXA 1V0MA 1W3LA 4JIEA 1NP0A 1J0IA 4ZXLA 1FHDA 1JXKA 2J78A 1E4MM 4H8UA 5A6AA 1IZJA 4UQCA 1JF5A 3ZOAA 3EDEA 1MQPA 1E70M 3AHYA 2VRKA 3ARSA 3B9EA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chord Diagram

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