2PURA

Structure of dihydrodipicolinate synthase mutant thr44ser at 1.7 a.
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
292
structure length
291
Chain Sequence
MFTGSIVAIVTPMDEKGNVCRASLKKLIDYHVASGTSAIVSVGSTGESATLNHDEHADVVMMTLDLADGRIPVIAGTGANATAEAISLTQRFNDSGIVGCLTVTPYYNRPSQEGLYQHFKAIAEHTDLPQILYNVPSRTGCDLLPETVGRLAKVKNIIGIEATGNLTRVNQIKELVSDDFVLLSGDDASALDFMQLGGHGVISVTANVAARDMAQMCKLAAEGHFAEARVINQRLMPLHNKLFVEPNPIPVKWACKELGLVATDTLRLPMTPITDSGRETVRAALKHAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Specificity versus catalytic potency: The role of threonine 44 in Escherichia coli dihydrodipicolinate synthase mediated catalysis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
total genus 110
structure length 291
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2007-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2purA00
1OK4A 3PBYA 3CQ0A 6ALDA 3OVRA 2GJNA 3HG3A 1TPUA 2R8WA 3JS3A 2ZZ7A 3NL6A 5I3HA 2DZPA 2W6RA 1G6CA 3BG5A 3UQNA 2A21A 2VEIA 3SFKA 3ABSA 4CCDA 3E02A 2JGYA 3QC3A 4MLRA 1PS9A 3L66A 4QIUA 3SI9A 1FX6A 1F74A 2IQTA 3ANYA 2ZZ6A 1P0KA 2X30A 5J5RA 3GVGA 1IXOA 1KM0A 1ALDA 2VFIA 2YXGA 3UWUA 5MHBA 5F4SA 4MZYA 2V5BA 2YZRA 3C52A 1DJQA 4MY9A 3G3MA 3DKLA 5K3VA 4E2BA 1PHWA 3PG9A 4DF1A 4Q32A 4K8EA 4JTTA 3KVJA 4FNTA 1O5XA 3HPZA 4IMDA 1IF2A 2A85A 3IVUA 1JJKA 2W0UA 2F84A 2CU0A 5FEXA 4ZQNA 4TU1A 1Q6LA 2V9DA 3O6CA 1YTDA 1F6KA 1GVSA 3I7RA 1TIMA 1P1XA 5G2WA 3H54A 5LNVA 2CLMA 4OBTA 4DPPA 1JCXA 1EUNA 1H7XA 5J5DA 1MO0A 3VFLA 1W5PA 4Y96A 4NJHA 3PWAA 3UXDA 4JYDA 1UASA 3STCA 3TMLA 1QPNA 3QYQA 2J88A 4MYXA 2C18A 4LVDA 1D3HA 4TMBA 2PRHA 3LHZA 4MFEA 3UY7A 4ML9A 3BG9A 3GYEA 3NPWA 1G7VA 4WD0A 1KTBA 3MI3A 3STGA 4S2CA 1VH7A 3R8RA 1YDVA 3FS2A 3PC0A 5IBXA 3NDOA 4O4VA 1LBMA 1Y0EA 3GX9A 3Q37A 3IVSA 3LV6A 3TAOA 3PY2A 3W6YA 3EX2A 3QW4B 3PR2A 5G2IA 4NNBA 2VENA 4FNQA 1FDYA 5F4XA 1FDZA 2VXNA 4RJEA 1OHLA 2YGYA 4WJEA 4QNWA 1SSDA 1SO4A 4AH7A 1QPQA 2OMAA 4HIBA 1RQEA 1WQ5A 1ZALA 4G1KA 3DFQA 3MBDA 1C9DA 3I68A 4JX6A 4YL2A 5AHFA 3S5ZA 1DOSA 1KV5A 3DKJA 1OF6A 3EWXA 2B7PA 5LGZA 5A8GA 5AC6A 1B9BA 1TMHA 3GDKA 4GUJA 3C61A 5C55A 1TTQA 3NL5A 2DP3A 3G8EA 1L9WA 1ZAJA 1FWRA 4N02A 3NNTA 1Q6RA 2NX3A 3MUXA 1XBXA 4QJ1A 1VQTA 5KZEA 3RF9A 3QFEA 3QEZA 1HFBA 3FYPA 5CPNA 3M47A 4M6VA 2R14A 1TTIA 4RZ5A 1H51A 5D33A 2C15A 5L6UA 1HO1A 1HG3A 1OFRA 1YADA 2BX7A 2FQIA 2JGQA 1LCOA 5C54A 1VLWA 5EYWA 1K8YA 4NZJA 5DXYA 3MP4A 3W70A 3R89A 2ZTKA 3M5XA 1B4EA 1TPH1 1KBJA 1NFBA 5G2HA 1LRNA 3DFOA 3D0CA 1DBTA 2A0NA 3C6CA 3TXVA 2Y63A 3SGZA 3W7PA 1VR6A 1WOBA 1HUVA 4ZQCA 5EPDA 3HGRA 3UXAA 1O4UA 5BW6A 2I1OA 4O10A 3LXBA 1NF7A 3GB6A 4FIQA 3S0CA 5LZLA 1TRDA 5KZDA 4K7YA 3TXZA 3EX6A 4UNLA 1SQ7A 1YXYA 2Y61A 1TREA 2QCDA 1W37A 2E6AA 1KW1A 1QPRA 2WKJA 1GQNA 4HNTA 3NQVA 4DF2A 3WJXA 4LU0A 4HKPA 3NQAA 3VE7A 5FEZA 3TUUA 1X8FA 3UWQA 1F05A 3DFTA 4O1BA 3NM3A 1UUMA 3GNNA 5D04C 1WA3A 3PG8A 2NUYA 5CSSA 1A5BA 3U8GA 1PV8A 2V2HA 1OFPA 4N2YA 4O17A 1F7BA 1LM1A 3V1PA 4Q4KA 3DFPA 5HWMA 3PUEA 2QCNA 5CPLA 1L6WA 1TPVA 2Y7DA 4NUWA 3TSBA 2GPTA 3W71A 2ZZ1A 4I7VA 4JY8A 3STFA 3PUOA 5L9FA 3LHYA 4DO5A 3HG5A 3W1UA 4OU1A 3QPZA 4XWUA 1OFAA 3T4CA 4CCCA 4GXMA 4QNEA 4ZQOA 1QNVA 4AWUA 4LRSA 3RLVA 1VYRA 1NSJA 4LS1A 1LLWA 1J4EA 3G8RA 1KV8A 2FDSA 3VI2A 2QDGA 3E9AA 5SWUA 2Z0IA 1RR2A 2WQPA 2GVGA 3LCIA 4HN4A 3M41A 3N73A 5CZ0A 5G5IA 4PH6A 3W2UA 1KTNA 3PULA 3B8DA 3EWBX 3R12A 2BLEA 3HGOA 1XI3A 3C2RA 4QM1A 5G1TA 3VKJA 3W7LA 1SW0A 3P5ZA 4IOTA 5HUPA 2NLIA 2QCLA 3W73A 3C2OA 1K8ZA 3LV5A 2C13A 2DU2A 4FXSA 2E5DA 2YCEA 3H53A 2VFDA 4AB4A 1OG0A 2CLKA 3STEA 4FIRA 2TRSA 3HJZA 4ZZ9A 1S5WA 2CLEA 3HO8A 4GRSA 1ICQA 3QZEA 3T55A 2I9EA 3NQMA 3T78A 4Z1DA 1OYAA 1RD5A 3NG3A 4HPJA 2ISSA 3FA5A 5C2XA 2FJKA 5DXXA 4JTKA 3W7OA 3NA8A 4GUHA 4LUIA 1GYNA 5CPOA 3FOKA 1SUXA 4UTKA 1WBJA 4O16A 5HULA 1GG1A 4O52A 4HNUA 2FB2A 1N8FA 1VHNA 1GOXA 2EPHA 2FLIA 2V0TA 5K9XA 4H3DA 1UJPA 3RNDA 4R33A 5AOUA 2ALDA 4Z0JA 1I4NA 1SZGA 3QJAA 5AYZA 3LTPA 1SZFA 1KLZA 1LROA 3LHTA 3P67A 4PTNA 3W7RA 3IIZA 2DZWA 4TMCA 4UR8A 4LV9A 3A24A 2HS8A 3W72A 1HO4A 2ZZ5A 4UTHA 2C0AA 1KTCA 3Q94A 1K03A 1TPWA 3BO9A 1FWSA 1X1OA 1OYCA 4NQ1A 4OV9A 1OF8A 1UUOA 4E0CA 1O95A 5CPMA 3GXPA 2H6RA 4GBUA 1DHPA 2VOMA 1JR1A 4M7SA 3I7QA 4BWLA 1KFLA 3F1QA 3A5VA 1FCQA 5D05A 5F2IA 3TW7A 3S1XA 1YDNA 2DJLA 2E6FA 4GUGA 4LTSA 4PFMA 3W7MA 2NUXA 3B05A 1OVDA 2C6QA 5DY2A 3L2IA 3CEUA 1H7PA 3FJ6A 3NL3A 1VYPX 4LT9A 3RLUA 4MIMA 1XL9A 1VCFA 1CI1A 3NQFA 1T99A 5I3JA 2DZVA 2Q3OA 1H60A 4EIVA 1H63A 1PIIA 4JD4A 4RXFA 4N4QA 2JBMA 4XBSA 3W22A 2GQ8A 3S5NA 3FEMA 3BV4A 4A22A 1UBSA 1XBYA 4FX6M 3BW3A 3NL2A 2A2IA 5CZSA 1W31A 4IXXA 1O5KA 2F7FA 2CLIA 3P81A 2R91A 3KFTA 4I7WA 3NZRA 4O50A 4POCA 3S6DA 3KVMA 2P0OA 2FFCA 4UFKA 3W7JA 2QCFA 3OEXA 1TYGA 4UR7A 2V30A 5D32A 1WYIA 3LCGA 1OX4B 4JEQA 3W1QA 1I2PA 4AEOA 2A7RA 5H2ZA 1JCNA 1FBAA 3MYOA 2Q8LA 2B4GA 3MJYA 1H7RA 3I6RA 4NJIA 4NZFA 4UFJA 4NNCA 3CTLA 1GVFA 1H7WA 1ADOA 1WOAA 2ZYFA 3QPYA 3IGSA 5FF7A 4FHAA 4LNYA 1PCKA 2HSAA 2E6YA 5AHNA 1FY6A 1VLIA 4FNSA 1K8XA 4LW7A 4GUIA 1DV7A 5LHEA 3EWUA 1SR9A 4Z0SA 2V81A 2WNQA 3TDFA 3TSMA 4O13A 1TV8A 5E1QA 1QFEA 3L5MA 4RR4A 4CQ9A 4GUFA 2AQWA 2W79A 4X22A 3NXFA 1EP3A 3NPXA 4O15A 5D2WA 3W1RA 3O06A 4FNPA 3MYPA 1C29A 1IIGA 3CWNA 1RV8A 4JS3A 2YSWA 1DQWA 1EP1A 4HT3A 3PB2A 4FEZA 4MVAA 1XKYA 1GEQA 1BWKA 1Q6OA 4NX5A 5KMYA 4ORMA 1K7XA 1ZCOA 3W2NA 4Z1BA 1G4TA 3W2LA 1H50A 3O07A 4N9EA 2C16A 1EEPA 4FXRA 4LS2A 2OJPA 4Y8FA 1CX9A 3KRZA 6TIMA 1QWGA 2QCMA 4HSNA 3NO5A 4WQ6A 3G0UA 4M6PA 3THAA 2ZFAA 3UYCA 4IGHA 4JX5A 5A5WA 3SIZA 2DZTA 3THQA 5FF4A 2CW6A 2ISVA 4BR1A 4M6QA 3C8FA 1JRBA 3FKKA 3KRSA 3KOFA 1QDSA 4MKNA 4AVFA 3HMJG 4LC6A 3WK2A 1Q6QA 3G0SA 3FLUA 2CLHA 2G97A 3OG3A 3JR2A 1VGAA 2XN1A 3W7EA 1I8JA 3W75A 3M1ZA 2ATMA 3B0UX 1KLYA 3SSJA 2CLLA 3BGGA 3VCRA 5AC8A 1K7EA 2EAWA 2ZZ4A 3ABQA 1JUBA 4DO4A 4XTIA 4N4PA 3M5ZA 4M7TA 1MSSA 3A23A 2Y70A 4TX9A 3LLFA 3WJSA 2NX1A 4S2BA 3SW6A 1DKWA 1RVGA 4AF0B 4LVFA 1TQXA 2E5CA 4XTDA 5FEPA 1OFOA 4UUIA 5LHFA 1X6UA 3HG4A 3S1UA 1XUZA 3TR2A 4K36A 1GG0A 4ADSA 2ZZ2A 4J9JA 3W2KA 3LHWA 5DLCA 2ZZ3A 5FF3A 1GJPA 1L6SA 3B0VC 3FYOA 1W8SA 4YLWA 4JIQA 3N9SA 1H62A 3KAOA 4X2RA 5HQEA 3B06A 1WV2A 4O1CA 3UWZA 5KSWA 3N2XA 1JCLA 1OK6A 4LC8A 3SECA 2VEMA 1LORA 3N19B 3OHIA 3LRMA 5CKSA 4UTUA 5AHMA 3C2FA 1LBLA 4UC5A 3GDRA 1EB3A 3O1NA 4JYEA 2AAMA 3ZWSA 5LGXA 5HR7A 4L4LA 4IUOA 1KM5A 3O15A 4ZVJA 4AHOA 4FNUA 5U4NA 3TNOA 2V2DA 2CZEA 4JIPA 3B03A 3BLEA 2VKZG 3W7QA 5K2ZA 3NM1A 3GAYA 1ML1A 2NXIA 3OA3A 1A5SA 2H3BA 4NJJA 1P5BA 4KFOA 2CZFA 5HNRA 5DY3A 4FF7A 5AC7A 4IMFA 1J2WA 5AHLA 1NVMA 5FF0A 4JN6A 1QMLA 4UFIA 4M19A 3LDVA 3FJLA 1KFCA 2QUUA 5E0KA 2YYUA 4LVBA 4LS0A 3R5EA 2QDHA 3MW7A 1GTEA 1JCMP 3G22A 4Z08A 5HUOA 3W2JA 2RDUA 3W83A 1S5TA 3QSTA 5EY5A 2NX9A 3HOJA 3W7KA 5K4ZA 3L65A 4K7VA 3O8AA 4DELA 4WOZA 1EUAA 3TW6A 4UTWA 2RDTA 5K9CA 3UNDA 3N9RA 3K30A 3GLCA 3EX1A 5LSMA 2WSRA 4Y6GA 2NWSA 1Q3NA 4JTEA 4CQAA 3TFXA 8TIMA 1O94A 2H90A 3I65A 2NV1A 4EF9A 1TPB1 4IPIA 1PVNA 1QCWA 3LCLA 4UMCA 3NQ8A 4ADUA 1OX5A 2VELA 2Y62A 3EWWA 3OIXA 3NQ2A 1PCWA 1XXXA 3B4UA 1TPC1 5HMSA 3L0GA 1ICSA 1AG1O 1TV5A 2OT0A 2ZA3A 3ATYA 3LRLA 3FKRA 4GNJA 2ZTJA 3IIPA 3NZ1A 3QMSA 1SZEA 5D30A 2P10A 3G18A 5BMXA 2HMCA 5T26A 3TAKA 1JQXA 1VRDA 2YW4A 1A5CA 4UTWC 2PRMA 2QCHA 3W84A 3ELFA 4JTUA 3TU9A 3LHVA 3F4WA 2E09A 1EX5A 4ALDA 5CSRA 4IJBA 1Z41A 2VFEA 3NGJA 1XDLA 3MI2A 4AMAA 2NV2A 1V7YA 4MJZA 4JTHA 3VNDA 1P0NA 3G1DA 2B0MA 3P8IA 1RPXA 4DO6A 3INPA 3LM7A 4UFMA 2YR1A 1AW1A 1FWTA 3NQCA 4K39A 4UTMA 4ZMGA 3NAVA 5HJLA 3V75A 3DI1A 1TV7A 3HPXA 3G24A 3LI0A 3C2EA 3TA6A 2PE4A 2BZNA 3ZR4A 1ICPA 2GUUA 3C2VA 3NYZA 3G1XA 3EX3A 4A3UA 3LRKA 3LXAA 5LNUA 3MI6A 5D2VA 3HBLA 3UWVA 3WK1A 3CPRA 2OZ0A 4CQ8A 3BGJA 3NQDA 1PL9A 1TB3A 2Y88A 2Y7EA 1I2RA 2Y89A 3E0IA 2ZRZA 4XUGA 3NOEA 2RFGA 5TIMA 1XFBA 2ZRUA 3LBCA 1LOSA 4P61A 1W3NA 4PA8A 1AMKA 3TIMA 3G1FA 4QQ3A 2DZSA 1LBFA 1YPIA 3NR0A 3W9ZA 3W7IA 2YDAA 2RDWA 1TCDA 3LCFA 3LGEA 4AHPA 3TQ0A 4QITA 5EKYA 2QAFA 2A7PA 1RZMA 3L9CA 5AHIA 1NAL1 5LNRA 1AW2A 4LWWA 3SZ8A 2A5HA 3W1MA 5F2GA 2FPYA 5F1VA 3W87A 5F4WA 4CNNA 1TJPA 3BLIA 3IIOA 3W88A 5D2YA 1FCVA 1KFJA 4AXKA 1TQJA 4R53A 1SO6A 1XDMA 2O7QA 3O16A 2CLOA 3G0XA 1MEWA 1H61A 4O4WA 4PEKA 3C56A 3U6WA 2DJXA 2Y7GA 3W1TA 3LCXA 3PVFA 1ZAHA 3A21A 4GC4A 4OV4A 4WOQA 1TTJA 1SU5A 3BLFA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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