2PURA

Structure of dihydrodipicolinate synthase mutant thr44ser at 1.7 a.
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
292
structure length
291
Chain Sequence
MFTGSIVAIVTPMDEKGNVCRASLKKLIDYHVASGTSAIVSVGSTGESATLNHDEHADVVMMTLDLADGRIPVIAGTGANATAEAISLTQRFNDSGIVGCLTVTPYYNRPSQEGLYQHFKAIAEHTDLPQILYNVPSRTGCDLLPETVGRLAKVKNIIGIEATGNLTRVNQIKELVSDDFVLLSGDDASALDFMQLGGHGVISVTANVAARDMAQMCKLAAEGHFAEARVINQRLMPLHNKLFVEPNPIPVKWACKELGLVATDTLRLPMTPITDSGRETVRAALKHAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Specificity versus catalytic potency: The role of threonine 44 in Escherichia coli dihydrodipicolinate synthase mediated catalysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
total genus 110
structure length 291
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2007-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2purA00
2Q8LA 4XQ6A 4FNTA 3R2GA 2TYSA 3L65A 3MP3A 4AVFA 3QSRA 1NAL1 3FJ6A 1KM3A 2Y88A 3TJXA 2CZDA 4Y90A 2Y7DA 3PUDA 5D2TA 1N7KA 3ABSA 1R30A 2EAWA 5FESA 1O4UA 4RZ5A 3L0NA 4N6EA 1SW3A 4AF0A 4JTJA 3LXAA 5FEWA 1DQWA 4JICA 4N02A 1XL9A 2YW3A 2QJHA 3QMTA 1X7FA 5SWUA 4ZQOA 3LCGA 1F7BA 1M7PA 4UNKA 2JGQA 1UCWA 4DELA 4FNQA 3P82A 3CIWA 1ALDA 1RV8A 1F2JA 1S5VA 3UY7A 5D02A 2FPYA 2F7FA 2YR1A 1AW1A 2RDWA 3E02A 3QW4B 5F2MA 3SECA 2YX0A 4N9EA 1VLWA 2VOMA 2YDAA 3P81A 4JS3A 2B7PA 2R91A 1WOAA 2NUXA 2YPIA 2ISVA 2A2IA 1OX5A 4LUJA 4AHQA 3A23A 3TMLA 5FF2A 1BTMA 4WUIA 1TV8A 3IVSA 1TREA 1A5CA 2IQTA 1XUZA 5AN7A 3NL5A 1YTDA 3P8JA 3PBYA 1S5WA 4LS2A 3QSTA 3GKAA 5EPDA 4A2SA 4AWTA 4CNPA 3GNDA 1LDCA 4UC5A 1WAUA 3T4CA 1G67A 3TDFA 4CQAA 3WK2A 1RQHA 4HIBA 2WNQA 1GEQA 1F6PA 2JKAA 4IMGA 5AYXA 1GJPA 3EWWA 4LVAA 5TQLA 2I1OA 2NX9A 1K3UA 2ZBTA 3BPWA 1J2WA 3M41A 3G1SA 3W88A 5LNVA 5D32A 5MHBA 1ZALA 1RR2A 2A6NA 1HG3A 4AEOA 2J9XA 3O1NA 3TQKA 3PC0A 3L68A 1VYPX 2WOQA 3GXPA 1N55A 3P61A 1NVMA 2NXHA 3NPWA 4GUHA 3OG3A 1FY6A 4O16A 4CQ8A 1JCNA 1LRTA 1XBXA 2DZUA 1MEIA 1PS9A 4X3ZA 4S2CA 2VEPA 4UR8A 3HGSA 3TX9A 3W1XA 2BWGA 4O54A 1ZENA 3I68A 4NNAA 5D2WA 1BWLA 5D37A 5D03A 4JTGA 3DFQA 1JQVA 4EIVA 3IVUA 1RZMA 4JXCA 4Z0SA 3D0CA 4QISA 2FQIA 1SU5A 1UBSA 3DI0A 3W1TA 5C5YA 2FTPA 1JQXA 3L5AA 3QQ0A 1OFQA 4O8RA 3C8FA 3TC6A 4ZL1A 3C56A 1OFRA 4IGHA 5D09A 4JN6A 4O10A 3DFSA 4MFEA 3L2IA 3N2MA 5BNKA 1WDWA 3O8AA 1SPQA 3UWYA 5G4WA 4KFPA 1VCGA 4N9BA 3OVRA 4O11A 3FEMA 4JY9A 2CLIA 5D2XA 4OWGA 1VJIA 5KMYA 4HSNA 4GFSA 4NJHA 1O60A 3HGOA 5HMSA 1VLIA 1CX9A 1SZFA 1TQXA 3DZ1A 3G8EA 1W56A 3NYZA 4DPQA 3C52A 5ABTA 1QWGA 1FUYA 1QPNA 4OV4A 3EWYA 2RH9A 4LT9A 3A24A 3GVGA 3G3MA 2C19A 3MP5A 4GNJA 4WXYA 3PUOA 1LCOA 4FIRA 3VNDA 4LC8A 4RLIA 1SFLA 1FQ0A 2R94A 5DXYA 2QUUA 3TUUA 1R2SA 1OG0A 5AHLA 3RK8A 2H3DA 4FXSA 1OF6A 1G4SA 2ZRXA 2Q8ZA 3QMRA 4K6AA 3S1UA 3EXSA 1VGAA 5A5WA 2H8ZA 3N9RA 3HPXA 4O19A 2C13A 4TU1A 3NO5A 1YXCA 3UYCA 1FWWA 4BR1A 2NWRA 3GX9A 4X22A 1TPEA 2X1TA 2C6QA 4MIMA 4CLMA 1OFEA 1HO1A 3M5ZA 3MO7A 3W1RA 4BWLA 2ZZ5A 3LI1A 3TV8A 4ADSA 3A21A 3F1QA 3WJWA 3ELFA 4GUIA 1SZGA 1LBFA 1TTQA 1KV5A 1GYNA 2FPVA 2EPHA 4N4QA 5G4EA 4RX0A 5LGXA 3L0GA 3GYEA 4HKPA 4P2VA 1CI1A 4R53A 4K8EA 2WQPA 3FA5A 2Y89A 3GXNA 4QIUA 4L4LA 3S5YA 3QC3A 1ZAIA 2EHHA 1TPDA 1YADA 4E0CA 3IIVA 3LM7A 4O1CA 2DJXA 4GUGA 4MJZA 3UQNA 3W1QA 1VYSX 2YYUA 2LLEA 4RV8A 4K8HA 3WK3A 1TPH1 4DPPA 5AYYA 2QAPA 3OHIA 5AHMA 5BW6A 3ABRA 3PULA 4JY8A 4IUOA 4ALDA 1Q6LA 1BEUA 2VXNA 4GC4A 4GUJA 5HJLA 3IIZA 2TSYA 1TPB1 1S3HA 2WV8A 1GVFA 3M0ZA 4AWUA 1QPQA 1QO2A 2O7QA 4X2RA 1T96A 2VFHA 1NF0A 5F1VA 2O7SA 2Y7FA 1B57A 4IOTA 1OX6A 1K7EA 5D33A 4H6KA 3TU9A 3BLIA 3W73A 4L4MA 4UTTC 3DFTA 4JTFA 2QCDB 3W7RA 1KFCA 4P61A 1TMHA 4TX9A 4UTMA 1OABA 4FNPA 3LHVA 3HQ1A 2WNZA 4FF7A 3IIXA 2ATMA 3M47A 2ZTJA 5DCBA 2E6AA 3IGUA 4AHOA 4NJIA 1OJXA 4JX4A 2DORA 4UMCA 5DCDA 3VI2A 5G5IA 5HWMA 4UTHA 1SZEA 1WOBA 1L6SA 1VZWA 1Z42A 3T44A 1WA3A 3CU2A 5L6UA 3UPWA 3EX3A 1JCYA 5CPLA 3TCEA 4A3UA 3C3NA 3W2NA 3FJLA 3TA6A 3UZ5A 3UWZA 4YL2A 4NVTA 3QJAA 1H5YA 2A85A 3LHWA 2QEZA 4PL1A 1ADOA 5EKYA 2Y85A 4WOZA 4YCOA 1HFBA 3C0JA 3UWWA 4BI5A 2ZZ4A 3DAQA 3EX6A 3WJSA 5H91A 3CQ0A 5H2ZA 2GVLA 1XM3A 2RDUA 3B04A 2E6YA 2CLKA 1EP2A 4GUFA 1NFBA 3MBDA 1FWRA 2WO5A 4M7TA 2C0AA 2A0NA 3H53A 2XFWA 4ONVA 1KTBA 2W0UA 1OFOA 1EX5A 2B7NA 3CEUA 1LOSA 2Y70A 3C2EA 5HWNA 3C2RA 2G5WA 4FIQA 3NPUA 4EWND 3QH2A 4I7VA 1ME9A 2V2CA 1GZGA 1RD5A 3W7MA 5CZSA 1TB3A 4OQVA 3W7QA 4EVZA 3DHDA 3HF3A 5EBUA 5DBUA 1RQEA 4TIMA 4LOCA 4UIOA 5I3HA 4YCPA 4R34A 2HSAA 4LU0A 1U83A 3S5ZA 2X2GA 1ICQA 1U5JA 1FXPA 5AB3A 4PC8A 4KKXA 3TW7A 1D3HA 3EX2A 4GXMA 3AJXA 4BF9A 4ZMGA 1O94A 1W5NA 1GTHA 3NA8A 5G2HA 4HSOA 1MSSA 1EP1A 4NU7A 3NGJA 5BMXA 4WQ6A 4XKYB 3PWAA 3A5VA 3A9IA 3NM1A 3LB0A 1XI3A 5HR6A 3K30A 1QO5A 4QM1A 1VR6A 3MBFA 1FWSA 3E0IA 3W1LA 2V82A 3W07A 2VFFA 4LV4A 3LCLA 4HPXA 3IGXA 2C1HA 3V1PA 2AGKA 3PSWA 2E68A 2HS6A 2WJZA 5K4XA 5HUPA 5CG7A 1DQXA 2OX1A 4E38A 3UD6A 2Z1BA 3S1XA 2VENA 2A4AA 5F4SA 4DO6A 1SUXA 1W8SA 2GVJA 3NPVA 3U6WA 1I45A 3P67A 6TIMA 3W76A 3KVKA 4GBUA 1W5OA 3NQ6A 3FOKA 3P60A 1QPOA 4NQ1A 2PE4A 3KAOA 3DFPA 4JIPA 2CLHA 4POCA 4UFIA 3CIXA 5FEPA 2Y61A 1QMLA 2FFCA 1AW5A 2WPBA 3QQ1A 3SI9A 5LNRA 1OK6A 4UXDA 3NQVA 3LOTA 1EUNA 1TRDA 4H3DA 4D2JA 2CLOA 4S1FA 4U28A 4N2YA 3WK0A 4NUWA 4O53A 3MI2A 1JCLA 2GQAA 4PCFA 3QW3A 5T26A 3W3OA 3RU6A 1CW2A 5LHEA 4AXKA 1JRCA 1FCQA 1LLZA 1VC4A 4KWWA 3W9ZA 3GK0A 1ZFJA 3TSDA 1ME7A 3QFEA 3CT7A 4PH6A 2ZFAA 4O1DA 4JTHA 3YPIA 3TFXA 3KRZA 3Q58A 3LBCA 4CCEA 1O5XA 1WYIA 1SR9A 1Q6OA 1KFLA 4IMFA 1DOSA 3W1MA 3W7OA 1EWEA 5DLCA 3O06A 3UXDA 3ZWTA 1QAPA 3W2UA 2QUVA 1H1ZA 5LHFA 3T78A 1RVGA 1B4EA 5LGZA 3GAKA 3BW2A 1WBJA 4DF0A 3HGJA 3KRUA 2OT1A 3I65A 2CU0A 3Q37A 1MEWA 1X6UA 2A7NA 4KFOA 2YSWA 3STCA 1YDNA 1PE1A 2E5DA 5C2XA 4NZJA 4RR4A 2G96A 5BMWA 5AHFA 4NT0A 1TO3A 2VEIA 2V30A 4C1KA 3CEPA 4UNLA 4NXKA 3TAKA 3ZWSA 5K4ZA 3C4UA 3LTYA 3M43A 2WSQA 2BXVA 3P5YA 3TW6A 4JNMA 5EY5A 2QCHA 1TTPA 4DO4A 3GB6A 3RF9A 1B9BA 3LRKA 3HPZA 4WY0B 5CSRA 3MI3A 1UJPA 4LUIA 4PFMA 1UUOA 3OIXA 1C29A 1LOLA 1TYGA 3LX9A 4PL2A 1GVRA 3O05A 1HUVA 1OX4B 2A7PA 4LC6A 4FX6M 2ISWA 2NWSA 1GPWA 2VFGA 3IV3A 1KLZA 1JRBA 4ZQCA 3I7QA 2J27A 4AMAA 3UZJA 2YYTA 3LHUA 3GZ3A 2JBMA 3HJZA 1LM1A 1KFKA 1TPFA 1Y0EA 1DKWA 4JTIA 2A21A 5CSSA 5F2LA 4K7VA 2ZQ0A 2EGZA 4N9CA 3GNNA 5LNUA 3EKLA 1YYAA 4MOZA 4OGZA 1I2PA 3NQDA 4OT7A 5CPMA 3CM4A 1FDJA 3USBA 1DHPA 1XDMA 2AQWA 2HTMA 2RKXA 1YXYA 4E2BA 4HNNA 3PBWA 4JEQA 4M19A 4UTUA 5C6MA 4UTJA 4IJBA 1YPFA 1VQTA 3NVTA 3ZR4A 1JUBA 2VFDA 3S6DA 3GIYA 4LVDA 2QF7A 2NV2A 2J9ZA 3STEA 5DY3A 3B8DA 5TIMA 2BZNA 4E2DA 2QCFA 3M5XA 2FIQA 4WOQA 1P4CA 3BLFA 3MHGA 4H4IA 3PG9A 2H90A 4O13A 1OYBA 1O5KA 3KHJA 2RHGA 5FF3A 5HWJA 4DQWA 1TJPA 3EWZA 1KA9F 1FCUA 4PODA 5EA9A 4N4PA 5CZJA 2OZ0A 5K9DA 3STGA 3TR2A 2CLMA 3M6YA 1GTEA 1WV2A 2GPTA 1PHQA 3GAYA 1Z41A 5D04C 4HNTA 1DJNA 4O0KA 1UASA 4FXRA 4Q32A 1IIGA 1FWTA 4Q33A 2H3BA 1Q3NA 2V2HA 2X30A 2QCGA 2E5BA 3HIJA 3LCWA 2DZWA 4Y9AA 1F73A 4UTTA 5TBOA 3W7KA 4CCDA 3Q2DA 4M5PA 2RFGA 3CTLA 4WJEA 3LHZA 4O52A 2P1FA 1W5QA 3EWBX 1DBTA 3ZS4A 3EEGA 4CQ9A 3STFA 1KFBA 5FI8A 1QDSA 2ZRYA 4CNNA 1THFD 3PAJA 4JYFA 3EWUA 4FNRA 1YDVA 4PTNA 3BK0A 2WKJA 2H6RA 4LTSA 4LVBA 3BLEA 4FO4A 3FFSA 3SGUA 4JDBA 5CZ0A 2ATSA 4ADTA 2VFIA 1IXPA 3EX1A 1P1XA 1PIIA 4LY8A 1LTDA 2ZZ3A 2X1SA 3P74A 3O6DA 3LCHA 3HG2A 3MHFA 3CWNA 3W84A 1W0MA 2R14A 3NQFA 4XBSA 4ORMA 1W3TA 3NQ2A 3W2JA 3U8GA 1ML1A 2ZZ1A 4MLJA 3PUEA 4Z1DA 3INPA 1H1YA 1SO6A 4JTUA 2UV8G 1M7OA 1ICSA 3W72A 1F5ZA 3PB0A 3MMTA 1TTJA 3NDOA 4UFMA 1MEHA 2NLIA 3NAVA 3DGRA 1L9WA 1QPRA 4UTWC 4JTKA 3MYPA 1DORA 1ME8A 2RDTA 1R2TA 5HR7A 4O1BA 4MKNA 4MJMA 3TJLA 1AK5A 3HGRA 1KLYA 2JKPA 4LNYA 3TROA 5FEZA 1GYLA 4FNUA 8TIMA 1VCFA 3H54A 4AB4A 3KFTA 3O15A 5CKSA 2B0MA 1KFJA 4RJEA 3M7WA 1X1ZA 2C18A 4ZQPA 1R2RA 4NJJA 3NL2A 1TTIA 1QCWA 1LBMA 4Q4KA 4IPIA 2B7OA 3KRSA 3NL3A 5EYWA 4LRTA 3LLDA 3VFLA 4EF9A 5I3JA 1XDLA 3DXIA 1SFJA 5DCEA 2ALDA 1GVOA 5DN1A 4GE8A 3W7HA 2OMAA 1H62A 4AWSA 2JKEA 3W83A 1C9DA 3PBVA 3S9YA 1K03A 1HO4A 2J6XA 5EL1A 3G1HA 3P62A 3ABQA 4A2RA 3QPZA 1LRNA 2C16A 5U4NA 5GVJA 2ZZ6A 3VE7A 3B0PA 1IF2A 3EXTA 3HMJG 4JTLA 3BW4A 3I6RA 3W1PA 3QEZA 5CZTA 4BI6A 4A22A 2V2DA 4BK9A 2A7RA 3ZFHA 3W1NA 4AH7A 3RLUA 1K8ZA 1WXJA 1H7NA 3LRLA 1VRDA 3NQ7A 1KM6A 5I3IA 3LTPA 4Z1CA 3NQAA 3EWXA 1MZHA 1SO4A 5FEXA 2Z6JA 2WNNA 4AAJA 4ICNA 1EUAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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