2QAP | Genus

Total Genus 143

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	143
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDDD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Carboxy-Terminus Recruitment Induced by Substrate Binding in Eukaryotic Fructose Bis-phosphate Aldolases pubmed doi rcsb
molecule keywords	Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
molecule tags	Lyase
source organism	Leishmania mexicana
total genus	143
structure length	358
sequence length	358
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2007-06-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2qapA00

1ZENA 4NUWA 2GUUA 3W7RA 2B0MA 3MP3A 1SO4A 4OGZA 4UTUA 4XBSA 3FYPA 3C2VA 5G2WA 2CU0A 1W3TA 5KZEA 3QRHA 1SQ7A 4S2CA 3PG8A 1XM3A 4UTMA 2PURA 4UFKA 5HJLA 3NL3A 2JGQA 3G1DA 4Q4KA 4LUJA 2JKAA 1WOBA 7TIMA 1X1ZA 3VE9A 1QPOA 2HS6A 3NOEA 4ZL1A 4QM1A 3W7DA 3RNDA 2C3ZA 4JTLA 3TSMA 1XXXA 2CFFA 5LNSA 2R8WA 1BTMA 2OX1A 6TIMA 2CW6A 3HO8A 3QC3A 3LCLA 5HWMA 3I6RA 4HNUA 2OCZA 3LHWA 5F4XA 2FPTA 5EBUA 3OEXA 4GWEA 2E5DA 3GYEA 4R34A 4HN4A 4DEFA 4KFOA 1B4KA 3O05A 2NV2A 3WJSA 4LY8A 5DCDA 1UBSA 3TQ0A 2QAFA 2Z6JA 1FCQA 1R2TA 1TV7A 1J5TA 5FESA 6ALDA 1K7FA 2A85A 2H90A 3TC7A 4ADSA 1BWKA 4FX7A 3W7IA 4RZ6A 1W5NA 5A5WA 3THAA 2OJPA 3NQMA 3IGXA 4M5PA 1QO5A 4JEQA 2YCEA 1YYAA 5I3FA 3W7CA 1ALDA 1Q6QA 2NXHA 3KRUA 3ATYA 5D09A 1GOXA 3JR2A 4AHPA 3T44A 1NSJA 5LNRA 3UWQA 3G18A 3N9RA 3MW7A 1YADA 1LBFA 5FI8A 3NL5A 3M1ZA 1XUZA 4CNOA 1XI3A 5LKYA 1K8XA 3W1LA 4MZ8A 3GDLA 4DF2A 2V0TA 5HR7A 1B57A 3NEVA 1D9EA 1ME8A 1TYGA 4GNJA 4OU1A 4UNKA 2GJNA 1MO0A 4MPQA 5G4WA 5LNUA 1VC4A 4UFLA 1RR2A 5F2MA 1QWGA 3TMQA 3LCWA 3LRLA 5CPMA 2B7NA 3WFAA 4UFHA 5E93A 1EA0A 5C54A 1V7YA 2NUXA 1K02A 5SWUA 2C0AA 5H91A 1IXOA 4O17A 3TW6A 3CWNA 4QNWA 2NV1A 1EP1A 3NL2A 4FF7A 5BMXA 3MUXA 4FNSA 4RKAA 2EGZA 1CX9A 1OFPA 2ZFAA 1LOQA 1X8FA 4ONVA 2ZRVA 4M6VA 4NT0A 4AWSA 3L0GA 1ADOA 2NXGA 1UASA 1YPIA 1FWRA 1KM4A 1KW1A 4N2YA 2QCHA 3T55A 4N9BA 4WZHA 1NF0A 4O50A 3IIVA 1DORA 2A6NA 4WXZA 4WY0A 4UTTC 5K4ZA 3ATZA 1GVFA 3O16A 3BW2A 3QF0A 5D03A 3W1AA 5HUOA 2OT1A 3C4UA 5BW6A 2RKXA 4HSNA 5AC8A 3M16A 4MJMA 3DGRA 4I9AA 3GLCA 1H1YA 2G5WA 3L0KA 4FB7A 4K8HA 3UXDA 5FF7A 1KM6A 4Q33A 4CCDA 2FTPA 3ABRA 2FDSA 1EB3A 1KTNA 3S6DA 1Q6RA 2H8ZA 3MP4A 3W7EA 3W7QA 5TIMA 1G7VA 3CHVA 3EX6A 5HR6A 3G3DA 5D32A 2EHHA 3C6CA 3FJ6A 4POCA 2E6AA 1P0NA 4LVFA 2GVLA 2CLEA 1XUUA 4MLJA 5ABTA 1SO5A 3UWYA 3R8RA 4WY0B 1K8YA 1LM1A 1ML1A 1EP2A 2DZPA 3IIPA 4ICNA 1TTQA 1L6SA 5F1UA 3IVUA 1YTEA 3G22A 4MFDA 2V2CA 3W07A 4YLWA 3QH2A 2X1RA 1G69A 3IIZA 1F7BA 1T96A 3TW7A 4Z08A 1AW5A 3QFEA 1H7XA 2VKZG 3LI1A 2WNQA 2D73A 1B9BA 5FF4A 1VH7A 3G1XA 5K9CA 1MSSA 4GC4A 1FWNA 3OVQA 5HWJA 2Z6IA 2ZZ7A 3QQ1A 4X2RA 1W31A 1RZMA 3N19B 3LX9A 4JR5A 3W6YA 4OE7A 1SZFA 3UQNA 4PODA 4RXGA 2Q3RA 4OV9A 3EKZA 4FNRA 1T99A 3NQDA 4ORIA 2DZTA 1XBYA 1LOLA 2CLMA 1TMHA 3TX9A 1BWLA 1HO4A 3B03A 3PUEA 2FQIA 4JICA 4JS3A 5FF3A 2BXVA 3ELFA 2WSQA 4KKXA 1KM3A 3W1UA 4PL1A 1VCFA 3TIMA 5CKSA 1THFD 4QJ1A 4E38A 1JCNA 1R2SA 1KM2A 2WSRA 4JN6A 2WPBA 1Q3NA 3F4WA 2X2GA 4ADTA 2A0NA 1JUBA 1YLVA 3U8GA 4CCCA 1FX6A 5LGXA 3MYOA 1FDZA 1OFAA 2Z0IA 3V1PA 1UB3A 1PL9A 4Y9AA 3NQ6A 4DF0A 2J88A 2YW4A 5C6MA 2CZFA 3W2MA 1IXQA 4UTTA 3G8RA 1F6PA 3S5OA 1SW0A 3MJYA 2TSYA 3DAQA 3BV4A 2QDHA 2ABBA 4RXFA 1OJXA 1QR7A 2R94A 4JD4A 1JCJA 1W0MA 3HGRA 3MI6A 2E68A 1JCLA 2ZZ2A 3TH6A 3KHJA 3S9YA 5D04C 4JTIA 1DV7A 3F1QA 3HQ1A 4FX8A 3CC1A 3DBPA 5DXYA 3Q58A 1RVGA 3LXBA 2NWSA 1GZGA 1LDCA 2ZRWA 1FCBA 3DI1A 3VI2A 4JIQA 5LHEA 3UY8A 1DHPA 3C8FA 1SSGA 1OFRA 3B04A 3STFA 3RU6A 4JX4A 3BG9A 3PUOA 1U83A 1W5OA 2QJGA 4EIVA 3MBFA 1GTEA 4NZJA 1U5JA 2DU2A 4AEOA 5D02A 1JQXA 4FEZA 4UIOA 4Z1DA 2PRMA 2E6FA 2BLEA 3NQFA 5DBUA 1SFJA 2HTMA 1F2JA 1Y0EA 2ABAA 3NQ8A 3M47A 1TTJA 1HO1A 4LVAA 3I7RA 3I7SA 3YPIA 1QO2A 4XUGA 2VEIA 3E9AA 3PB0A 2ISWA 4Z1CA 4A21A 4MYXA 1JVNA 3EB2A 4WOZA 5IBXA 4MVAA 5J5RA 3P61A 5CSSA 1VCGA 5HMSA 1T0OA 3CB8A 5AYYA 2VFDA 3I65A 2P0OA 2RFGA 3FOKA 3NYZA 1CW2A 2Y61A 3DKJA 3S5NA 3TSDA 3LM7A 4XZ9A 1KFLA 1ZALA 4LTSA 2Z1BA 1G4PA 3HG5A 4AH7A 4IXXA 1MEIA 3FLUA 4OBTA 5IM51 4DELA 3ABSA 3W2KA 4RCXA 3CPRA 3GR7A 1AMKA 3P8IA 2YXGA 4ZQRA 1VZWA 5AHMA 1FDYA 2G96A 3STCA 4IMCA 2YZRA 4U4MA 3IIOA 3KVJA 3TXVA 2B4GA 2Y88A 3UPWA 1G4SA 2A6LA 4A2SA 1I2QA 1C29A 3W72A 5LHFA 1LRQA 2ZRXA 3M5XA 5TQLA 1OX6A 1ME9A 3N3MA 3R5EA 3GNNA 3HG2A 3LTYA 4OQVA 3N9SA 1AK5A 5AHEA 1SZNA 1Q45A 4O1CA 4ADUA 1R30A 3H55A 1JCYA 1TQJA 5EKYA 4JX6A 3IVTA 2LLEA 4MOZA 4IX2A 1P4CA 4AWUA 2ZA3A 3O63A 1VQTA 3SIZA 1RV8A 1I2NA 1YXDA 4H6KA 3NQCA 2J6XA 1FUYA 4O0ZA 3A24A 2Q8ZA 4A22A 1A5BA 1J2WA 4O15A 4UFIA 1KFEA 1SR9A 2ISVA 4BI5A 1W8SA 4GRSA 3G1VA 1R47A 3B0VC 3DU0A 1B4EA 3EWZA 4KWWA 4KWVA 2NUWA 4N02A 3BVJA 4H4IA 1H62A 4C1KA 3E12A 1WV2A 3IGSA 1EEPA 2C13A 2FPYA 2CLLA 1FCVA 2V5BA 4JTJA 4NNCA 4MZYA 3B0PA 1LLZA 4L4MA 4M6QA 3W85A 3IIXA 1PCKA 5KSWA 2I14A 2RDUA 3QYQA 3Q2DA 3CIWA 3TXZA 2YYTA 3DFPA 5F1VA 3QPZA 4FHAA 1OHLA 2A21A 1K8ZA 3L68A 4EWND 3CLMA 3V75A 4JYEA 3TDFA 3HJZA 5BRBA 2CLFA 1VCVA 3W86A 4MYAA 3E0IA 4FXSA 2CWNA 3SY5A 4Y96A 2YX0A 4CQAA 2ZA1A 4LUIA 3UWWA 3HPXA 1F74A 1TO3A 3S5ZA 4UXDA 1TV5A 1LLWA 1Q6OA 1TB3A 2QCNA 3S0CA 3EWUA 3ZFHA 2I9EA 2CZDA 5DY2A 3PS7A 1QNVA 5CZ0A 2VEPA 1OYAA 1SSDA 2FFCA 1A5CA 4Y6GA 4MJZA 4I7WA 4LWWA 1KTBA 2VXNA 3SR7A 4UCGA 3M9YA 1ZAJA 1O94A 5AHLA 1GYLA 1JULA 3QMRA 5AFDA 2ZYFA 3TROA 2A7RA 3CTLA 3FKRA 3W3OA 2V81A 4M6PA 3TMLA 5BOOA 4JGDA 4GUJA 3W2NA 3GXNA 1O5XA 1QPRA 3BLFA 3ABOA 4WD0A 4IXHA 1VYRA 1WBJA 3M5YA 4GXMA 5GVJA 3MP5A 3G1YA 4IMGA 3QJAA 4JTSA 4FNPA 3JS3A 1SPQA 3Q94A 4GFSA 2YYUA 3A9IA 1HFBA 2ZRUA 4OWGA 2Q3OA 4O10A 3OIXA 1GVRA 5T26A 1OF8A 2NXIA 1KV8A 1JCXA 2V82A 1C9DA 2QCCA 3KVLA 2YDAA 4WOQA 2FB2A 3C2OA 4JTTA 4QITA 1YTDA 3DFOA 4HNNA 3M5VA 3TAKA 3EX1A 4HNVA 5LNVA 2RH9A 3BO9A 3EEGA 1JRBA 3PBYA 2G97A 4UMCA 5HINA 1F76A 2W6RA 5EY5A 3C3NA 5FEXA 5G1YA 1W3NA 3W7NA 2VOMA 1G67A 2ISSA 1B3OA 3G1AA 3W7JA 3USBA 3C2EA 4QISA 3TK7A 1XDLA 2ZZ5A 2NX3A 3WJXA 1KBIA 4Y90A 2DZXA 3EWXA 1ICPA 1VYSX 4MKNA 1RQEA 2C18A 4R33A 1SZGA 3HMJG 3BG5A 1N7KA 2OMAA 2ZDRA 3KVMA 5AHNA 4WY0F 3PBVA 3S1UA 4EOUA 2IQTA 1TPEA 3HGOA 1XFBA 2VENA 5KITA 1VR6A 4LU0A 4IQLA 4RV8A 2PRLA 2Y7DA 4UR8A 3LERA 1ICQA 4O16A 5K4XA 3QW4B 5F4SA 1ZY9A 4Z0SA 1A5AA 1GWJA 4BR1A 3TSBA 5G1TA 4R53A 3HGSA 1CI1A 3FIGA 5AYXA 4FIQA 1T8XA 1VLWA 3LTSA 1LRNA 2V2HA 4IWWA 1OF6A 4TMBA 2EAWA 4QSHA 3LHZA 2XN1A 1AL8A 5D2XA 1XBVA 3QSTA 4WUIA 1FQ0A 3TAOA 3MHUA 3EXRA 3NG3A 3IGUA 2E6YA 3P62A 1C8VA 1I4NA 4K39A 3P60A 1VGAA 3LHYA 4YMZA 2F84A 3L65A 3P74A 1KFBA 2J24A 2ZRZA 4TIMA 3M6YA 1TSIA 5G2HA 3NR0A 2CZ5A 1MXSA 1P5BA 5FF0A 5KMYA 2NWRA 3GXTA 3THQA 2BZNA 4UNLA 1VS1A 2YFOA 3GZ3A 4EVZA 3TKFA 1F73A 1F5ZA 3QPYA 5D05A 2QCLA 1S3HA 4EF9A 1EWDA 4IUOA 4BFAA 1O95A 3DH7A 3NPWA 3PB2A 4XTIA 4Z0JA 1OK4A 1W5PA 3H53A 1D3HA 5D33A 4BI6A 2G95A 4XWUA 2Y85A 1ZCOA 5HNRA 1OYCA 1XL9A 4HIBA 5K9DA 3M41A 1PHQA 4WJEA 2WSYA 1QPNA 3WK1A 4LV4A 4AHQA 4QIUA 4K7VA 2C15A 3G1SA 2BSLA 4N9CA 3PG9A 4HPXA 1ZJIA 4D2JA 1QAPA 1GYNA 3M7WA 2CZEA 3W7PA 2E1DA 3W2LA 4S1FA 3RMJA 1IXPA 4FO4A 1UUMA 3WJWA 1KLZA 1TPWA 1M5WA 3LV6A 2E09A 5HUPA 3EX4A 3MHFA 2WNZA 3OG3A 3M0ZA 4IMEA 1H63A 1LROA 4UMAA 4ALDA 4UTLA 4DPPA 1N55A 3PC0A 3HF3A 4TO8A 4IMDA 3STGA 2QAPA 2ZTKA 5I3GA 5EA9A 2W0UA 2Y6ZA 4JYFA 3PVFA 1ONRA 4FXRA 2V9DA 2A4AA 2J9XA 5AYZA 3O1NA 4QQ3A 4NXSA 2V8ZA 2VFIA 2OZ0A 2WQPA 4O8RA 3P81A 4TX9A 1TPUA 4XBKA 3T4CA 1KA9F 5CZSA 4MLRA 1QOQA 1RQHA 4O11A 1W5MA 1ME7A 1X7FA 3A23A 3DI0A 1GG1A 1LORA 1KFJA 3LHUA 3PUDA 1TPDA 3TA6A 1SW7A 3B4UA 1G7UA 1OFOA 1QDSA 3NM3A 4KFNA 3LV5A 2Y7FA 4K36A 3ZWSA 3FYOA 4PFMA 4P2VA 1EPXA 4BK9A 2EF9A 2JGYA 2ZBTA 1PHWA 4O1BA 2QUVA 3VFLA 3W2UA 3NZ1A 4G1KA 4LW7A 4I7VA 4PH6A 2QF7A 2B7QA 1NAL1 3INPA 2XFWA 2QDGA 1H7PA 5E1QA 5F4WA 3DHDA 3SSJA 2RDTA 3G1FA 4MZ1A 2ZRYA 1WAUA 4AF0A 4YWIA 4LVBA 4BI7A 5I3KA 1H7NA 3NXFA 2TYSA 4GUGA 4RZ4A 1Z41A 3PR2A 4JX5A 2B7OA 4PCFA 5FEWA 3LXCA 3MBDA 3QQ0A 2ALDA 1M7PA 2VFGA 4NZFA 3MWAA 4LV9A 3RLVA 3SECA 2CLIA 3W71A 4YCPA 3GDTA 1VHNA 3O6DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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