2QCEA

Crystal structure of the orotidine-5'-monophosphate decarboxylase domain of human ump synthase bound to sulfate, glycerol, and chloride
Total Genus 97

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
257
structure length
256
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
AH2 (238-250)S1 (254-257)EMPTYTI1 (233-236)AH1 (227-231)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Structures of the human orotidine-5'-monophosphate decarboxylase support a covalent mechanism and provide a framework for drug design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase (UMP synthase)
total genus 97
structure length 256
sequence length 257
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qceA00
4OWGA 1B3OA 4I7WA 1HFBA 3W2UA 4AHQA 3PSVA 3PR2A 4NJIA 1YTEA 1YPIA 3G1YA 3U2OA 3TW7A 1GOXA 1W5OA 3NXFA 2ZZ4A 5T26A 2NX1A 4LS2A 5LHFA 3IGXA 2PRHA 3LRMA 1QR7A 4K8EA 3WK2A 3MMTA 1B4EA 5HWNA 4A2SA 1VC4A 2JK2A 2YCEA 3W7JA 2J9XA 3PBUA 3BLIA 1GWJA 2RHGA 4N9EA 2PCQA 4JY9A 3LLFA 2YGYA 5AOUA 3LV6A 4UR8A 1R30A 2R91A 3NYZA 1ICQA 4MY8A 3B05A 3SR7A 4PH6A 2NX9A 1W56A 1F73A 2YPIA 3M5YA 3S5YA 4MZ8A 4Y9AA 1Z41A 4N9DA 3HG3A 3GDKA 2QCFA 1IXPA 4O57A 1LTDA 1LOQA 3SECA 2FB3A 1FDJA 3NZ1A 3PF3A 4X2RA 3M16A 2FB2A 2G95A 4L4MA 2GJLA 4BWLC 5KZDA 3P82A 1GTHA 1W3TA 3DH7A 4JTUA 1D3GA 1PVNA 4LUJA 3UXAA 4G1KA 4OV4A 3NA8A 4LS1A 1ZNNA 1FWNA 2H3BA 3I65A 3BARA 1I8JA 4EVZA 1KFJA 3B0VC 3B03A 1ML1A 5LNUA 1E51A 1GVFA 1XI3A 5LNSA 5EPDA 4XKYA 4ZQCA 3N3MA 4IMFA 3W2KA 1WBHA 4O1DA 4Z1CA 1FCUA 5FF3A 4K37A 1YXDA 3IVUA 3S8HA 4QNWA 3IRDA 2P10A 5F4XA 4NQ1A 2GVLA 5D33A 2ABAA 5FEPA 3HG4A 1OX4B 1RPXA 3W7QA 4PL1A 3FFSA 3TC7A 5K9DA 2BZNA 1H50A 1MSSA 3ANYA 1VJIA 1LORA 1NFBA 3NQ2A 1TV7A 4OT7A 1VHNA 2VOMA 2JKPA 1DVJA 1FWWA 2O7SA 3EWWA 2CZEA 2QCDA 2V5BA 3NZRA 4ORIA 1O4UA 3STGA 4HNVA 2E68A 3LCXA 3R2GA 1TJPA 2ALDA 4QM1A 4N6EA 3TXZA 3NM1A 2YSWA 1VHCA 4O11A 5D03A 2ZBTA 2WNNA 2RFGA 1XDLA 1OFEA 4JDYA 2JBMA 2GQ9A 1GEQA 1H7NA 1O5KA 3TSBA 4LV4A 4CQAA 3DFTA 3GXTA 2V2DA 3LCFA 1SFLA 3C2FA 2W79A 3O6DA 2ISVA 5AHNA 2V2CA 3ABQA 4M6PA 3VCRA 2CLMA 5I3JA 3E9AA 1Q6RA 1EPXA 4KWWA 2CLHA 4JTHA 3R13A 4XUGA 2BLEA 1JCMP 1U83A 2BXVA 2FLIA 1PS9A 4ZQNA 3SIZA 5DN1A 2Y70A 1X1OA 1XBZA 5HUPA 4AHPA 3N73A 3LCWA 4BK9A 4X22A 4GFSA 5CZ0A 4ALDA 3HIJA 2NWSA 1F5ZA 3TMQA 4WY0F 5K3VA 1GTEA 4Z1BA 3M5XA 4UFIA 1S3HA 4P2VA 1VLIA 3ABOA 1M6JA 4NX5A 2NUXA 3EXSA 1DV7A 4YLWA 4MJZA 3G1AA 4FNPA 3PG8A 3IGUA 4PFMA 2QKFA 5G1TA 4GUGA 3IGSA 4JYEA 4PODA 4P61A 3UWZA 5HWJA 3PUDA 3BV4A 2W0UA 2QCHA 3Q37A 4KFPA 4NNCA 2PRLA 1OFBA 1P1XA 4O0KA 3CT7A 4FXRA 2PC4A 2QJHA 5F4SA 3W7RA 4BR1A 5D2TA 1QPOA 1PCWA 4TO8A 3MHFA 3NQ8A 3CIXA 1JUKA 2QJIA 2ZTKA 4JTEA 4JNMA 3YPIA 4GBUA 4QIUA 2HS8A 1X6UA 1KV5A 1ZAJA 5I3IA 2QDGA 3TU9A 1MEIA 3W87A 2A2IA 3DFPA 4D2JA 3NOEA 4AB4A 2C18A 3WJXA 1O5XA 4O4VA 5D05A 3G0SA 3NQ7A 3HF3A 3TDFA 3EX2A 4UTMA 1EEPA 4OE7A 4UCGA 3QMTA 4NJHA 4UMAA 4JX6A 2A1YA 4HNUA 5LZLA 1SU5A 4UMBA 5TIMA 4TR9A 3EWZA 1WXJA 4AF0B 2P1FA 3W7OA 3NQGA 1HO1A 3TFCA 2Z6IA 4HNTA 2QAPA 4N9BA 3NEVA 3G3DA 4MLRA 1LM1A 3PSWA 3CWNA 3W6YA 4FXSA 4NT0A 1G7UA 3W2NA 2Y89A 3A23A 2H8ZA 5J5DA 3N14A 5IBXC 2B0MA 1KTNA 2H3DA 2NUYA 4XWUA 1TV8A 3OVQA 4OV9A 1I4NA 4ML9A 1OYBA 4I7VA 1VQTA 1C9DA 4JYDA 3QMRA 3EEGA 5C5YA 5HR6A 2GQ8A 2FPVA 2BSLA 3V1PA 2YFOA 3GXNA 3FKRA 4FNSA 5KMYA 1ZENA 3LI1A 1G4EA 2AQWA 1TQXA 1MEHA 1VZWA 1W3IA 4UIOA 3W7IA 1WX0A 4UTHA 2VC6A 4MKNA 1KFCA 3NQEA 4MLJA 4M19A 4EOUA 2CW6A 4MZYA 4C1KA 3CLMA 4I9AA 1O95A 2EF9A 3QMSA 1QNVA 5E93A 4TMCA 3UY7A 3GK0A 1D9EA 3ZR4A 3LCIA 4XBKA 3L0NA 2DP3A 1H5YA 1O94A 1FX6A 3CHVA 3LHVA 4IXHA 4UTWA 2CLLA 4N4PA 1KFBA 1VS1A 3V75A 3LCHA 3W76A 3PBWA 1W54A 1FCVA 2CZ5A 4TIMA 1G6CA 4RK8A 5TBOA 1FUYA 4DPQA 1X1ZA 4MVAA 3KRUA 2E6YA 1GYLA 2WSRA 1N7KA 3M5ZA 1XCFA 4O14A 2CLKA 1H1ZA 3L5MA 4YXGA 4AVFA 4GUJA 4LOCA 2C15A 5K2ZA 5AHIA 3LX9A 3G22A 3TE9A 4UTIA 2NXHA 1D3HA 3TA6A 1TQJA 3W7LA 4JS3A 1RZMA 2GPTA 4FNTA 3LB0A 1TSIA 3UZ5A 1ALDA 4IXXA 4LV9A 4JTGA 5G4WA 2OZ0A 3P81A 3W1AA 3DFOA 3WJWA 2GQAA 1JCJA 3VI2A 4M7TA 3KFTA 5LSMA 2R8WA 1LDCA 4ADSA 1DORA 3B0UX 1SZGA 1GVOA 3L5AA 2QR6A 1GQNA 3NQVA 4LVAA 3UZJA 3QW4B 3LHZA 3CQ0A 2DZVA 5CGQA 1WOBA 3AJXA 3C6CA 3K30A 4NJGA 4BFAA 3O6CA 1TPB1 3TR2A 4RCXA 5DXYA 4WXYA 4M6QA 2OJPA 3I7RA 4JR5A 3W23A 1SSDA 5AHMA 3I68A 2QAFA 4RZ6A 2OMAA 3FYPA 3CU2A 3SW6A 3T4CA 3MP3A 3T40A 4OGZA 3TXVA 2C6QA 3PULA 5FEWA 4GE8A 1X7FA 4TU1A 3HQ1A 5KZEA 3NAVA 5CZSA 3TC6A 3BLFA 4O12A 1WBJA 4I7UA 4JY8A 3H53A 4LTSA 2YFNA 3RMJA 1ONRA 3HG2A 4JTTA 2ZZ6A 3KRSA 5IM51 2V82A 1SW7A 3HO8A 2XFWA 3CTLA 4XQ6A 1IXNA 4ADTA 3PB2A 1WA3A 3DFNA 3W7EA 3FLUA 3S1VA 1R2SA 1R2TA 4HHPA 5FEZA 3MI2A 4FB7A 2J27A 1LRNA 1SPQA 2CZFA 3C52A 4K36A 2I9EA 4HKPA 1R2RA 5AC6A 1OX5A 3OG3A 2A6NA 1K7EA 5AN7A 4IMGA 4WY0A 1BWLA 1W3NA 5CPOA 3O16A 2Y7DA 4O0ZA 3TQ0A 4K38A 3DHFA 3QFEA 5G2WA 2E09A 1ZFJA 3KHJA 2A5HA 1XBXA 2ZDRA 4XKYB 2OT1A 2DZWA 2FIQA 2TPSA 2VENA 4UTLA 3N9RA 4FHAA 1H63A 4IMDA 2D73A 1QOPA 3F1QA 4C1LA 1OG0A 3SSJA 4NVTA 2VELA 1WQ5A 3S5ZA 4RR4A 1FCBA 2ZRYA 4YL2A 4XTDA 3QW3A 3HG5A 1F6KA 4PCFA 1F05A 1KM1A 2ZYFA 3DU0A 3P84A 3BW3A 2NLIA 1JRCA 4Y6GA 3M5VA 5FEXA 5BW6A 1IIHA 3NPVA 2ZRUA 5AHFA 2QEZA 3NQAA 4ZQPA 3Q2DA 3W2LA 1TO3A 3S1UA 2QCDB 2OX1A 4J9JA 1TPH1 3GLCA 3F03K 3HBLA 1NAL1 2ZRXA 2JKAA 2WV8A 1ZHAA 3GVGA 3QYQA 4UTJA 1Z42A 4L4LA 3IV3A 5C6MA 1FQ0A 4FNUA 3PBYA 3P7YA 3PM6A 3VE9A 3IIXA 4EIVA 4BI5A 1OYAA 2J24A 5D37A 4IMEA 3SZ8A 5LGXA 3P80A 1OFAA 4JTJA 5MHBA 1QPNA 1RVGA 3GYEA 3NO5A 2Y85A 1XM3A 3S5OA 1Z44A 2EGZA 3GAYA 4UFLA 5HQEA 2CU0A 4YWIA 1FBAA 3FEMA 1XBYA 1EWDA 1FWTA 1NF7A 2C16A 3GXPA 5D30A 2LLEA 2G97A 3TJLA 1JJKA 1QAPA 3QF0A 3VNDA 1K3UA 3C61A 1K7XA 3W72A 5K9XA 4NJKA 1BTMA 1KV8A 1QDSA 3GB6A 5BMWA 3C4UA 5CG7A 3NL6A 4MIMA 4PTNA 1S5VA 5KZMA 3PG9A 1YYAA 3TKFA 1A5BA 3W86A 3M7WA 1ZJIA 2PRMA 4Q32A 4LVFA 4Y90A 3U6WA 1TPWA 2GVGA 2RDUA 1ICSA 1K7FA 1TMHA 1OVDA 3IVSA 3W1UA 4FO4A 3SJ3A 3EWBX 4JTKA 1TCDA 4DO4A 2DJXA 1MXSA 1B57A 1PCKA 4BI6A 3FKKA 3UWQA 1VYSX 2RDTA 3PAJA 3CC1A 1YXCA 4FX7A 5DBTA 4LW7A 4KFOA 3M9YA 1W5QA 1KBIA 5HMSA 5AB3A 1KFEA 3RLUA 3HGSA 3GIYA 2E77A 1I2RA 3CWOX 5FF4A 4YCPA 1QO5A 1TTQA 4TMBA 3O6YX 4LC8A 2HTMA 1PE1A 3R8RA 3GKFA 1LBFA 1LP6A 3BGJA 3KXQA 4KWVA 3GZ3A 2NZLA 2WQPA 4AEOA 5LGZA 4X3ZA 4ZQOA 1OF6A 2WOQA 1DQWA 3QQ1A 2X1SA 1XUUA 5TQLA 5AYYA 4DO5A 1LCOA 1A50A 1P5BA 1LROA 1QO2A 3HOJA 4R7JA 3MYOA 4A2RA 4HN4A 3W1RA 4Q4KA 1YADA 3T44A 3PB0A 4MJMA 3ELFA 1LYXA 3UXDA 5D2WA 2Z1BA 3NDOA 3W70A 1TIMA 3GX9A 1ZY9A 2VFHA 5D32A 2B4GA 2P0OA 1XBVA 4WUIA 1G67A 5K7JA 4DELA 1FDYA 1JQXA 4S1FA 1EP2A 2ZA1A 3ZWSA 2TSYA 5CPNA 3C2OA 1Q3NA 3W2JA 4Z0JA 2A85A 1UUMA 4HIBA 3LOTA 1J4EA 1H62A 2Y61A 2YYTA 1T8XA 2JKEA 1FDZA 1LOSA 4FEZA 1BEUA 1OJXA 1A5SA 5DLCA 2ZQ0A 3W71A 4DXVA 1GG1A 5AHLA 1SZEA 3E12A 2J9ZA 4KKXA 3GDMA 4MYAA 1IXOA 1H7OA 2B7NA 2C13A 3EKLA 5E1QA 5F4WA 3UPWA 1JCNA 1MZHA 2B7OA 2VFEA 5EBUA 3WK3A 4ZQMA 5CZJA 1KA9F 1VRDA 2ZZ1A 3C2RA 2ATSA 1HO4A 1ICPA 3R89A 3S1WA 3LTYA 3TCEA 4JXCA 1UASA 4RKAA 4FIQA 3M41A 1T99A 4GUHA 2ATMA 5HR7A 4A3UA 2DZSA 1TTJA 5DY2A 8TIMA 2Y7FA 1Z48A 3JR2A 4NXSA 3NPWA 3OBKA 1UUOA 4X9SA 3W1MA 1SR9A 4ORMA 4YCOA 1FWRA 3LBCA 5GVJA 3L21A 2ZZ7A 4UFKA 2DZTA 1WOAA 3NNTA 1G4SA 4NUWA 1AW5A 4JGDA 1QCWA 3PUOA 4Z08A 3ATYA 1L9WA 2FJKA 2E5CA 1AMKA 3TSDA 1KM2A 4N2YA 1EUAA 3THQA 4IJBA 7TIMA 3QZEA 1AL8A 2GUUA 5K4XA 1CW2A 1NF0A 1Q45A 4JICA 3DAQA 5F2IA 4DPPA 1SSGA 3L5LA 5I3HA 1JUEA 3R5EA 3HMJG 3EWYA 4O4WA 1DJQA 3CPRA 1XL9A 1EWEA 2Q8ZA 1IF2A 4RLIA 2QJGA 3TSMA 3AO0A 2Q3OA 2H6RA 2X16A 3DBPA 3EXTA 1J5TA 3THAA 3LHUA 5SWUA 1PHQA 1DBTA 3ZS4A 2YR1A 2DU2A 5KITA 1K8ZA 3RU6A 3TUUA 1ZCOA 3TK7A 1KTBA 1DKWA 3MWAA 3DFSA 4K6AA 4M7SA 4CQ8A 3INPA 3TIMA 2QUTA 3P74A 4H3DA 4WY0B 1IIGA 1FXQA 4MOZA 3G1VA 1TPFA 3E02A 1KM6A 3LTPA 1RQEA 3A5VA 3QQ0A 2J6XA 4E2BA 3L68A 2X1TA 4LNYA 2Y63A 4LVBA 1MEWA 3W7DA 4XBSA 1TRDA 1JVNA 4K7VA 3A22A 1P0KA 1W5NA 3SGZA 4IX2A 3PC0A 4FIRA 3W2MA 1YTDA 1OABA 1KLZA 2FFCA 3UWYA 3TX9A 4O50A 4E38A 4M5PA 5KTLA 1VCFA 5U7SA 4ADUA 4UFJA 5DBUA 5LHEA 1XC4A 4HPJA 5G2HA 2A7NA 2PURA 4UTTA 3A5FA 1LRQA 3PY2A 2Q8LA 3PWAA 1H61A 2QCEA 3LXBA 3DZ1A 3G1DA 3NPUA 1LRTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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